232LA

T4 lysozyme mutant m120k
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRKLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Context-dependent protein stabilization by methionine-to-leucine substitution shown in T4 lysozyme.
pubmed rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1997-10-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 232lA00
3DKEX 3SBBC 1KY1A 176LA 219LA 2LC9A 3DN6A 1CTWA 1L60A 1QUOA 3OE8A 229LA 2OE9X 1L53A 3HT7A 4K5YA 1L15A 1L80A 3DNAA 3HTDA 1L0JA 228LA 4ARMB 3DN4A 2B73A 3HT6A 1L34A 1L12A 1C67A 258LA 1C6KA 1L91A 1L17A 260LA 183LA 217LA 1L49A 1G0JA 4ARJA 3OE6A 4EJ4A 1PQOA 1L73A 3C82A 2RAZX 249LA 2O7AA 3CDRA 1QSQA 4ARQA 1P3NA 1L19A 1C66A 1LGXA 3UONA 3L2XA 1C6CA 137LA 1QT7A 3SB6A 4LDEA 107LA 1L37A 1C6IA 241LA 2RBRA 1L50A 119LA 1L10A 3ODUA 1G07A 1C6DA 226LA 162LA 2HUMA 3GUJA 1L06A 200LA 3GUMA 1KW5A 1L83A 1L97A 3HH4A 2NTHA 114LA 3DN0A 3NY8A 3OE9A 120LA 2OE4X 1P56A 125LA 1CV4A 4I7RA 206LA 1OWYA 1L24A 254LA 222LA 3HTFA 3C83A 1L16A 1LYHA 1L09A 4I7TA 1L44A 1C61A 255LA 155LA 1CV1A 1QUGA 4LZMA 126LA 2RBQA 245LA 4EKPA 3RZEA 156LA 1CVKA 2B6TA 2A4TA 1C6MA 2OU8A 237LA 3HWLA 103LA 4YXAC 173LA 1G0PA 3GUOA 234LA 1CU6A 1SX2A 1G06A 1L69A 2OTZX 1L01A 2IGCA 1L61A 4LDLA 3HUKA 1DYAA 3C8SA 3FI5A 143LA 4W51A 1L46A 1LLHA 1L33A 3PBLA 1CU3A 259LA 3GUNA 1L57A 3OE0A 1QTDA 112LA 1JTMA 1L05A 1G0MA 224LA 3HU9A 261LA 1G0KA 4DAJA 4YX7C 1C6QA 1CV3A 1QT3A 1P5CA 4I7JA 4EKQA 1C6AA 2RB0X 3CDQA 1L42A 1QTHA 1L08A 1QUDA 211LA 252LA 160LA 1I6SA 1L45A 2CUUA 1L18A 4W56A 1P37A 2RBPA 152LA 1L86A 2B74A 2L78A 2O79A 150LA 3SB8A 1L85A 1C6LA 247LA 3DN8A 4PJZA 187LA 1QTVA 1L54A 1DYFA 184LA 1L55A 1L26A 4W52A 1L70A 1XEPA 3F9LA 131LA 2F47A 4LDOA 2B75A 1G1VA 1CU0A 1L65A 3G3VA 1L28A 3HT9A 139LA 1KNIA 161LA 3GUPA 142LA 1D9WA 3HUAA 4EPIA 1L66A 4W57A 171LA 1P64A 199LA 3FA0A 2RB2X 1L30A 1LGWA 1QS5A 3GULA 2B6XA 1L99A 6LZMA 4I7OA 1QSBA 1QUHA 1C6GA 5LZMA 2OU9A 127LA 4ARLA 1C62A 1L90A 4EKSA 146LA 1L68A 1L03A 1L04A 192LA 109LA 1QT5A 205LA 1L64A 113LA 3G3XA 3QAKA 1L81A 3PDSA 2O4WA 3NYAA 1C68A 3DN3A 1TLAA 1XJUA 253LA 1L21A 1LI6A 244LA 2B72A 242LA 3V2WA 2B7XA 4GBRB 1L02A 1D3MA 1L56A 1L72A 4ARMA 3D4SA 3DMXA 1P7SA 4OO9A 1CV5A 1C6BA 1C69A 1PQKA 157LA 1L27A 1QT4A 1P36A 3DMVA 1L40A 220LA 1CUQA 1LYDA 2F2QA 2RBNA 1L20A 196LA 1XJTA 3HH6A 4PK0A 4EXMA 1L58A 128LA 214LA 1L59A 1LYGA 1L75A 2HULA 1T6HA 1PQDA 1L92A 1C6EA 3C7ZA 1L76A 1L11A 2B6ZA 2Q9EA 1LYIA 1CX7A 4I7KA 1C6PA 3CDVA 1L41A 1SSWA 3C8QA 1G0GA 2RB1X 1L74A 1LPYA 3HUQA 186LA 2F32A 2QARC 1L87A 1P2RA 1L94A 2ANVA 3HU8A 158LA 2NTGA 4DJHA 1L14A 216LA 262LA 144LA 4IAPA 4S0WA 4W54A 4EPFA 108LA 190LA 2HUKA 3JR6A 1C60A 189LA 1L22A 1PQIA 1L79A 3G3WA 168LA 1D2WA 1OVJA 236LA 4E97A 1D3NA 4W53A 1D3FA 1OV5A 4ARPA 1NHBA 170LA 201LA 1K28A 1LI3A 1QT6A 3GUKA 2B6YA 1L39A 1LGUA 3C80A 225LA 1B6IA 4I7PA 1LWKA 2Z6BA 1OV7A 1ZWNA 140LA 111LA 4DKLA 3HTBA 1C6TA 209LA 3C8RA 4ARQB 185LA 1SWZA 1DYDA 198LA 2LCBA 3SB7A 240LA 1LW9A 1KS3A 1ZURA 180LA 2OEAX 1L67A 223LA 1L31A 1DYBA 115LA 149LA 172LA 257LA 4AQNA 243LA 163LA 1CU2A 2B6WA 129LA 1SX7A 1SSYA 1L07A 2B70A 4W59A 2OE7X 151LA 1L13A 2ANXA 175LA 130LA 1L62A 3SB5A 251LA 1L89A 1L95A 1L82A 138LA 1QS9A 232LA 3C7WA 1P6YA 1G1WA 197LA 256LA 1CV6A 1L96A 1L36A 3K2RA 2RBSA 4W58A 1L84A 248LA 230LA 118LA 1G0LA 5I14A 2OTYX 1L0KA 1QT8A 250LA 104LA 1L47A 1L29A 7LZMA 1DYCA 1L00A 233LA 1T8FA 4I7QA 2RH1A 182LA 1SWYA 1KY0A 1JQUA 4GRVA 3C7YA 221LA 1L98A 1LWGA 1WTHA 3SBAA 3L64A 3GUIA 1C6NA 1KW7A 3CDTA 246LA 147LA 1C6FA 1ZYTA 3V2YA 1L25A 1LYFA 239LA 178LA 166LA 1L48A 159LA 1L93A 1C6HA 231LA 1P46A 1CV0A 1L88A 3CDOA 4ZPUA 227LA 123LA 148LE 1CUPA 195LA 145LA 1OVKA 3SN6R 110LA 3HTGA 1P2LA 1L63A 1L38A 1L71A 1L43A 210LA 164LA 102LA 177LA 4I7LA 235LA 1T8AA 1L77A 1L35A 2QB0B 3LZMA 3C81A 2Q9DA 1L51A 1CU5A 3DN1A 3DMZA 212LA 1DYGA 167LA 1OWZA 188LA 1L52A 215LA 1EPYA 3HT8A 1T97A 1C6JA 4I7SA 1PQMA 1QTZA 3HDEA 3RUNA 1OYUA 1C64A 191LA 141LA 169LA 181LA 3EMLA 3SB9A 2RAYX 4EKRA 1LYEA 218LA 3DN2A 4I7NA 1LI2A 1PQJA 2LZMA 3VW7A 1D3JA 122LA 3HH3A 1CX6A 1L32A 1LYJA 174LA 238LA 4YXCA 1C63A 3HDFA 1T8GA 165LA 213LA 4W55A 1OVHA 1D2YA 1JTNA 1L23A 1DYEA 3FADA 2RBOA 1C65A 3NY9A 3F8VA 2OU0X 4I7MA 1QTBA 3HH5A 1QTCA 1G0QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NGYA 6LYZA 3SBBC 3P4ZA 1OUAA 1JUGA 1RFPA 1C43A 1L53A 4K5YA 1L15A 5FHWA 4DWXA 2DQCY 3HTDA 1OUHA 1LAAA 258LA 3QY4A 5M1YA 1IOSA 183LA 1UIBA 3M18B 1L49A 3WUAA 4EJ4A 1NHEA 2RAZX 4RDSA 2O7AA 1GBYA 4ARQA 1WQMA 1L19A 1C66A 1B7OA 137LA 4NHTA 1UIGA 4NGIA 2W1YA 1IR7A 5KXZA 1WTNA 1C6IA 1DPXA 3A34A 1L50A 5KXRA 1IR9A 2ZIKA 3ATOA 3GUJA 3W3EA 1L06A 1L83A 1L97A 2NTHA 3MGWA 3WH1A 4DDBA 1OUJA 2F4GA 1CV4A 3W6AA 1LYHA 1BVKC 255LA 155LA 2RBQA 1B7MA 245LA 1WTMA 4NY5A 156LA 4H9HA 3LN2A 2B6TA 2A4TA 1NDGC 103LA 1LZSA 2CWIA 1CU6A 1B5ZA 1L69A 2OTZX 1CKGA 1L01A 1GF3A 4WOAA 5APDA 4DDCA 2MEAA 2XBSA 1DYAA 4NSJA 4WG7A 1L46A 2ZYCA 4RLNA 2XTHA 1H6MA 2GV0A 1LYYA 3HU9A 4NGZA 5J7CA 5HNLA 1LYOA 1G0KA 4DAJA 4YX7C 1T3PA 4I7JA 1P5CA 1LJGA 4EKQA 3TXFA 2Z2EA 5APCA 2BQKA 1QTHA 1QUDA 211LA 252LA 5KXYA 1L45A 3N9AA 1XSFA 3WPJA 1P37A 4YOPA 2DQGY 1JTPL 5F9XA 1JSEA 2L78A 3A96A 1LSYA 3SB8A 1HHLA 2LHMA 3DN8A 4B1AA 1UIDA 1LZBA 1GB8A 1DYFA 4ETBA 1HMLA 5I4XA 4NHQA 4GCDA 1OUDA 2ZILA 2HEEA 4LDOA 1WQRA 1G1VA 1L65A 3CSZA 1L28A 3HT9A 4HV1A 161LA 3GUPA 1D9WA 3LYOA 1LJIA 1P64A 199LA 3FA0A 2RB2X 1OUFA 4OW1A 2D4IA 4HJVA 2BQNA 4RW1A 4G4HA 2OU9A 3W6CA 146LA 109LA 5I5QA 1LSNA 3TXJA 1IORA 3G3XA 4WLDA 3NYAA 1C68A 4Z46A 242LA 1AZFA 3V2WA 2ZIJA 4GBRB 4LYZA 4ARMA 3DMXA 1GFGA 1CV5A 4ANRA 1C6BA 1JJ0A 4H1PA 1LSAA 1PQKA 1ZVHL 4GLAA 1P2CC 1C45A 2HU1A 1LYDA 1REXA 9LYZA 2CGIA 2B5ZA 4HPIA 3P68A 1BHZA 4PK0A 1XGTC 5FDJA 1LYGA 1T6HA 1L92A 1C6EA 3WMKA 3C7ZA 1L76A 8LYZA 4PHIA 1QUTA 5HQ1A 1IP4A 4BAFA 1DKJA 5HMVA 4H9BA 1G0GA 1HMKA 5LINA 1L74A 186LA 1I1ZA 4IASA 1P2RA 2ANVA 158LA 1L14A 216LA 3RT5X 1BWJA 5C6LA 1C60A 1PQIA 1DI3A 3TXDA 1L79A 1GFJA 3W6EA 1LZ1A 1OVJA 5APFA 3AZ6A 1LOZA 1JPOA 2Q0MX 1NHBA 201LA 1HFZA 1FLWA 3CT5A 4ZEEA 1QT6A 3GUKA 2B6YA 1L39A 1LGUA 2ZYPA 1B6IA 4I7PA 1HSXA 1XGUC 185LA 2MEIA 5KXMA 2BQCA 4PRUA 5IDDA 1KS3A 4H92A 1L31A 1WQQA 5KXOA 4AQNA 4U3XB 2B6WA 129LA 1IWWA 1AT6A 1SX7A 1UCOA 1LSDA 2ANXA 4G4BA 5KY1A 1IC7Y 1YKXX 175LA 130LA 1LMTA 3SB5A 251LA 1L95A 1L82A 4TSCA 232LA 1GE4A 197LA 1GB9A 1CV6A 2D91A 1L36A 3K2RA 4II8A 1L84A 1YAPA 248LA 3TXEA 1HFXA 1G0LA 4HJZA 7LZMA 1YAOA 1L00A 233LA 1UA6Y 4I7QA 4YF2A 1KY0A 2BQJA 221LA 1WTHA 2ZWBA 3L64A 1KW7A 5D5CA 4UWUA 1OUGA 1LYFA 1BB4A 3ULRA 3CDOA 4ZPUA 193LA 195LA 145LA 2F2NA 2HEDA 3AW6A 1I20A 1L63A 4LT2A 4TX7A 4C5FA 102LA 2VB1A 1QSAA 4H9CA 3C81A 1QIOA 2Q9DA 1L51A 1CU5A 1LSFA 2BQMA 3WUNA 1IY3A 167LA 1OWZA 4DT3A 4GN5C 1QTEA 3D9AC 5FSTA 1C6JA 2YBHA 5LA5A 1PQMA 1QTZA 2FBDA 2DKVA 1GE2A 2PC2A 3SB9A 1LSMA 1XEIA 1LYEA 1PS5A 1IO5A 4H8ZA 1LI2A 1IY4A 2LZMA 3VW7A 3OJPA 1QDTA 1LMNA 4DD7A 174LA 1BB5A 4YXCA 1RCMA 5I4WA 213LA 1VDTA 4W55A 1B5XA 1RI8B 1JTNA 2ZNXY 2CDSA 2BAAA 1D0MA 4WM2A 1OUEA 4UWVA 2HTXA 3HH5A 1QTCA 4NIJA 4B0DA 2IHLA 1HEMA 1L60A 4XJHA 1TDYA 2DQHY 3AW7A 3GXRA 3HT7A 5KXKA 4NGLA 1L0JA 1LKSA 4RW2A 1L34A 1LMCA 1L12A 5LVGA 1GBZA 1DI4A 1C6KA 1L17A 4TTDA 2Z38A 2HEAA 2A7FA 4ARJA 3OE6A 1GWDA 249LA 1QSQA 1I56A 1YILA 3L2XA 4LGKA 3SB6A 3A67Y 4G9SA 1IWTA 1LMQA 119LA 3WU8A 2MEEA 4GCFA 5D5FA 4BAPA 2HUMA 3GUMA 4DD1A 1KW5A 2OE4X 206LA 1OWYA 3TMUA 2RSCA 3C83A 1UC0A 1L09A 1L44A 3RZ4A 126LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4NGY A;  6LYZ A;  3SBB C;  3P4Z A;  1OUA A;  1JUG A;  1RFP A;  1C43 A;  1L53 A;  4K5Y A;  1L15 A;  5FHW A;  4DWX A;  2DQC Y;  3HTD A;  1OUH A;  1LAA A;  258L A;  3QY4 A;  5M1Y A;  1IOS A;  183L A;  1UIB A;  3M18 B;  1L49 A;  3WUA A;  4EJ4 A;  1NHE A;  2RAZ X;  4RDS A;  2O7A A;  1GBY A;  4ARQ A;  1WQM A;  1L19 A;  1C66 A;  1B7O A;  137L A;  4NHT A;  1UIG A;  4NGI A;  2W1Y A;  1IR7 A;  5KXZ A;  1WTN A;  1C6I A;  1DPX A;  3A34 A;  1L50 A;  5KXR A;  1IR9 A;  2ZIK A;  3ATO A;  3GUJ A;  3W3E A;  1L06 A;  1L83 A;  1L97 A;  2NTH A;  3MGW A;  3WH1 A;  4DDB A;  1OUJ A;  2F4G A;  1CV4 A;  3W6A A;  1LYH A;  1BVK C;  255L A;  155L A;  2RBQ A;  1B7M A;  245L A;  1WTM A;  4NY5 A;  156L A;  4H9H A;  3LN2 A;  2B6T A;  2A4T A;  1NDG C;  103L A;  1LZS A;  2CWI A;  1CU6 A;  1B5Z A;  1L69 A;  2OTZ X;  1CKG A;  1L01 A;  1GF3 A;  4WOA A;  5APD A;  4DDC A;  2MEA A;  2XBS A;  1DYA A;  4NSJ A;  4WG7 A;  1L46 A;  2ZYC A;  4RLN A;  2XTH A;  1H6M A;  2GV0 A;  1LYY A;  3HU9 A;  4NGZ A;  5J7C A;  5HNL A;  1LYO A;  1G0K A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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