233LA

T4 lysozyme mutant m120l
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRLLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Context-dependent protein stabilization by methionine-to-leucine substitution shown in T4 lysozyme.
pubmed rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 61
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1997-10-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 233lA00
1L73A 1CV6A 2OEAX 1L68A 1OVJA 1CX6A 1L59A 3SBBC 1C69A 4I7QA 1L54A 1CVKA 120LA 1P2LA 3FA0A 113LA 149LA 2OE7X 1B6IA 3HH3A 4I7LA 1L88A 227LA 3DKEX 1JTNA 177LA 237LA 191LA 1L65A 1T8AA 1L04A 217LA 196LA 1QT7A 4LDOA 1DYBA 1CV0A 2F2QA 1ZYTA 2CUUA 261LA 2OU0X 1C61A 232LA 1G06A 1L70A 161LA 1L50A 4W51A 164LA 3OE9A 1G0GA 1L05A 2B6YA 6LZMA 166LA 4DJHA 183LA 220LA 3C83A 1L96A 110LA 1PQIA 1CU0A 2O4WA 2RBQA 1DYDA 253LA 4I7KA 4LZMA 1L98A 210LA 1L48A 1L86A 4EKPA 2RB2X 1P37A 4E97A 1C6FA 1P64A 2OU9A 2HULA 109LA 1CV5A 103LA 215LA 2B6XA 1LYEA 4ARMB 5I14A 3SBAA 152LA 1XJUA 1G0QA 1L35A 163LA 262LA 1L37A 3HDEA 1L33A 2RH1A 1LGXA 254LA 192LA 236LA 4PJZA 3HH5A 2OTZX 1L08A 1L03A 1D9WA 1L51A 1L85A 1OVKA 2F32A 3CDOA 1P5CA 2HUMA 2RB1X 1C65A 4EKQA 3C82A 2HUKA 3HDFA 1LYGA 1ZWNA 1L34A 218LA 1LYDA 3NY8A 3V2YA 1L46A 3HTDA 4GBRB 1DYGA 1L91A 3CDTA 1C63A 7LZMA 1OV5A 2LC9A 144LA 222LA 1C67A 4YXCA 199LA 3DN6A 1L40A 1C6AA 246LA 234LA 1L71A 1L58A 1L61A 221LA 1L39A 238LA 1CU3A 167LA 226LA 2B7XA 4EKRA 1QUOA 2O79A 139LA 1L75A 1LGWA 4W58A 1OWZA 235LA 242LA 4I7RA 3G3XA 4W59A 231LA 1QS5A 1CUQA 151LA 3GULA 1QTDA 4I7JA 3GUPA 1L42A 3NYAA 224LA 1SWYA 2Q9EA 1L09A 4GRVA 4I7SA 162LA 4YX7C 1L47A 1LYIA 216LA 1L63A 3UONA 2RBNA 1C6IA 1L26A 245LA 1C6LA 2IGCA 201LA 111LA 176LA 1QSBA 4K5YA 114LA 1PQMA 3HT8A 1CV4A 1L36A 2Q9DA 3PDSA 1NHBA 146LA 1OWYA 1SWZA 150LA 1G0JA 1L41A 1L31A 1L18A 1CTWA 1QUGA 3HTBA 2QB0B 2QARC 125LA 1WTHA 2RBOA 3GUOA 3EMLA 157LA 1L57A 1L89A 1OYUA 3DN0A 1L72A 188LA 1L23A 4EPIA 1D3NA 1OV7A 3ODUA 2A4TA 4W53A 247LA 1G0MA 2RBPA 143LA 1L64A 3HT7A 1L44A 1T6HA 1L06A 1L11A 205LA 2RAZX 4I7OA 2LZMA 1LW9A 3HU9A 197LA 4W55A 1QTZA 211LA 1T97A 1XEPA 1LI6A 2RBRA 112LA 182LA 214LA 1L0JA 1P7SA 1L67A 1L83A 1LYJA 3LZMA 3SB9A 4ARQB 2LCBA 3GUNA 1QUHA 158LA 1QTVA 3HTGA 3DMZA 3SB7A 3C8RA 1C6NA 173LA 1L02A 1LI2A 2RBSA 2OE4X 1L28A 3GUJA 2OTYX 3DN4A 181LA 2O7AA 3HT6A 138LA 3DN8A 3JR6A 4W52A 1CU6A 256LA 1QT8A 3FI5A 4EKSA 233LA 1C6MA 1C6PA 1KW5A 1G1WA 1L92A 3DN2A 1T8FA 1P46A 4EPFA 1L93A 4LDEA 168LA 1L0KA 1L27A 1T8GA 3G3VA 102LA 1L00A 1QTHA 131LA 3L2XA 1L15A 3HUKA 229LA 187LA 169LA 1L14A 2B73A 195LA 3V2WA 1L99A 189LA 257LA 2B74A 108LA 128LA 198LA 1L17A 223LA 1L30A 4ZPUA 130LA 129LA 4ARMA 2RB0X 1P56A 122LA 180LA 1C6BA 3RZEA 4AQNA 240LA 1L90A 1SSWA 225LA 1P2RA 1C62A 1SSYA 2ANXA 3HTFA 1L32A 159LA 171LA 1KS3A 3HWLA 4I7MA 3VW7A 4I7TA 1QTBA 3CDQA 3HT9A 170LA 1L97A 4EJ4A 3G3WA 1D2WA 3NY9A 3DMXA 1L52A 200LA 250LA 3DN3A 241LA 4LDLA 1C68A 1L74A 3QAKA 2B72A 1L12A 107LA 1L60A 4ARPA 3D4SA 1L62A 1L55A 3L64A 147LA 1C6DA 1KY1A 3HUQA 1D3FA 137LA 1EPYA 1C6EA 118LA 1QT6A 3F9LA 1PQOA 4I7NA 4I7PA 209LA 1L81A 104LA 1C6JA 2Z6BA 156LA 190LA 4YXAC 1XJTA 3CDVA 127LA 115LA 1CV3A 1QUDA 1C6HA 140LA 1ZURA 1L79A 2ANVA 1L45A 3SB5A 174LA 4ARLA 155LA 2RAYX 2B70A 1LWKA 2B6TA 4W56A 3GUIA 213LA 1KY0A 1CX7A 212LA 184LA 3DN1A 148LE 3OE8A 3CDRA 1LPYA 3HH6A 185LA 4W57A 255LA 1LGUA 1D3JA 1PQDA 1L77A 2OE9X 1L43A 3HH4A 142LA 1TLAA 2L78A 3C7ZA 1KW7A 1L95A 1P36A 1L20A 258LA 1CU2A 1LWGA 4W54A 160LA 1CV1A 1G07A 3HU8A 1G0PA 2NTHA 4IAPA 1PQJA 1P3NA 3C81A 1G0KA 1L84A 239LA 3OE6A 4OO9A 1L38A 3C80A 1L24A 1C6QA 1L94A 260LA 186LA 2OU8A 3DMVA 4PK0A 1LYFA 1L16A 175LA 1QTCA 145LA 1D3MA 1L80A 1L76A 4ARJA 219LA 3GUKA 1P6YA 4EXMA 1L56A 119LA 228LA 1C64A 252LA 2NTGA 1QSQA 1L69A 3OE0A 3SN6R 123LA 1G1VA 1L13A 1QS9A 1QT4A 1C66A 1JQUA 1L22A 1C6KA 4ARQA 1L21A 3FADA 3SB6A 206LA 1L82A 1CU5A 3HUAA 172LA 1OVHA 1JTMA 2B6ZA 126LA 1D2YA 259LA 1DYCA 1LI3A 1LYHA 1L01A 1LLHA 1CUPA 1L07A 1DYEA 3DNAA 1DYAA 1L87A 1C6TA 2F47A 3PBLA 1SX7A 2B75A 3K2RA 2B6WA 1L25A 249LA 3C7WA 3C8SA 4S0WA 1C6GA 1DYFA 3C7YA 165LA 243LA 3SB8A 1PQKA 1K28A 1KNIA 1L10A 3C8QA 1C60A 1L19A 4DAJA 178LA 1QT5A 244LA 1L29A 230LA 248LA 3GUMA 5LZMA 251LA 3F8VA 1G0LA 1L49A 1L53A 4DKLA 3RUNA 1QT3A 1SX2A 1C6CA 141LA 1L66A 1I6SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L73A 1L68A 1OVJA 2G4NA 1CX6A 1C69A 3WVYA 1REYA 1YAMA 1LSDA 1B6IA 4I7LA 5L9JA 227LA 191LA 3TXEA 2Y8PA 1JTPL 1GB5A 2EKSC 4LDOA 4GCEA 1D0MA 5KY1A 1ZYTA 2CUUA 232LA 1C46A 4WOAA 1GF8A 1LJEA 3A90A 3OE9A 1G0GA 5APFA 5KXWA 1LSBA 6LZMA 1HMKA 166LA 4DJHA 183LA 2RBQA 4DYGA 1FBIX 1JKBA 4EKPA 1LSNA 2Z18A 1C6FA 1GFEA 2OU9A 1CV5A 103LA 215LA 4G4HA 4ARMB 2MECA 1F6SA 4W96A 1B5UA 1CKGA 3E3DA 1UUZC 163LA 1L37A 3HDEA 2Z19A 1L33A 1LGXA 7LYZA 3WH1A 192LA 236LA 3W6BA 1G7MC 1LZ6A 2OTZX 1CJ9A 1L08A 1L85A 1MLCE 3CDOA 4DD2A 4B1AA 5APDA 1C65A 3C82A 4CJ2A 4LT3A 2YBNA 1TEWA 1I20A 3TMWA 4G4CA 1LZGA 2LC9A 5KXMA 154LA 3G3BB 3DN6A 3A93A 5LYTA 1LZ9A 1JPOA 4WLXA 246LA 234LA 3SP3A 1EQ4A 1L39A 3IJUA 3IJVA 2MEFA 1QUOA 2C8OA 5L3IA 3AGIA 1GDWA 242LA 3G3XA 4B4EA 1BB3A 1LZ1A 3GULA 4RDSA 4I7JA 1L42A 5LVIA 1IIZA 4HV1A 2D4KA 4LT2A 4PHIA 1SWYA 1QSAA 4PPOA 1L09A 4I7SA 1QDTA 1GF3A 1C6LA 1QSBA 1LJNA 3RU5A 3AZ5A 1MELL 3RZ4A 2HTXA 1JJ0A 9LYZA 1G0JA 1L41A 1L31A 4EOFA 3GUOA 3EMLA 4N1EI 4R0FA 1VATA 1B7QA 1B5VA 2X0AA 4CFOA 1GEZA 2DQFC 3WPJA 2YBMA 3ODUA 4DDCA 1J1OY 2DQHY 1JTOL 143LA 1LCNA 1JIYA 4I7OA 4H8ZA 197LA 4W55A 211LA 1JKCA 1GFKA 2YSSC 3ATNA 1LJIA 1LYJA 2F4AA 2LHMA 3B0IA 4M6DA 1HHLA 4ARQB 4XJDA 3HTGA 3DMZA 1L02A 3B0KA 1I56A 1LZ5A 1QUTA 3DN4A 5LXWA 3DN8A 3JR6A 177LA 4EKSA 2AUBA 3DN2A 1C6MA 1C6PA 1KW5A 5IELA 1P46A 3QY4A 1L0KA 4NY5A 3G3VA 1L00A 1L15A 1LKRA 5KXOA 1FLWA 1WQOA 1LMAA 1LAAA 1L17A 1IC4Y 223LA 1DKKA 4HJVA 4KL7A 1QIOA 2RB0X 5C6LA 1LKSA 122LA 3RZEA 4AQNA 1B0DA 1VDPA 2ZNWY 1SSWA 1LJ4A 3VWOA 2ANXA 4BADA 1T6VL 1UCOA 2BQFA 171LA 2BQAA 1LMTA 3HWLA 1LTMA 1QTBA 3HT9A 4NGOA 170LA 4GLVA 3NY9A 1L52A 250LA 4ETEA 1L12A 107LA 2DQJY 5LAGA 4H93A 1YROA 1IC5Y 4ARPA 1L55A 1IP2A 4HJYA 1GFTA 4IASA 3WUNA 1C6EA 1LJHA 1B9OA 1IX0A 1HFXA 1C6JA 3AW6A 156LA 4YXAC 1XJTA 4DD0A 1CV3A 1RFPA 1WTMA 4DT3A 1ZURA 3A67Y 3LZTA 2ANVA 174LA 1D0LA 2RAYX 1LSYA 2XQOA 212LA 4KPMA 5APCA 3OE8A 1LYZA 4ET8A 4N1CC 1EQEA 1GHLA 1J1XY 1VAUA 3CB7A 1XGUC 1D0KA 2PC2A 2GV0A 5KXKA 1L20A 258LA 4UWUA 6LYTA 4HSFA 3HU8A 1NMMA 3MGWA 2ZQ3A 1G0KA 2DKVA 3C80A 3K3TA 1L24A 1C6QA 5LVJA 1O23A 1GE4A 1ZVYB 1CKHA 1QTCA 4HPIA 145LA 2HECA 1HMLA 4ARJA 1P6YA 5LA8A 2FBDA 1IO5A 228LA 1JWRA 3TMXA 1HNLA 1QS9A 1YIKA 4TWSA 2LZ2A 1LSPA 1UBZA 1GF5A 1GBYA 4L41A 1L82A 1LJJA 4N8ZA 1LZRA 1TBYA 5HNLA 2B6ZA 1D2YA 4LYZA 1VDTA 3LYMA 1IWZA 1GD6A 5LYZA 1DYCA 1L01A 1LLHA 1L07A 1DYAA 3A3QA 1C6TA 4OOTA 1IWYA 2BLYA 5A3EA 1GFVA 3K2RA 2B6WA 1LSAA 4BAFA 3BKVA 3P65A 1LZYA 2LYOA 3AZ4A 4W94A 4DDAA 3SB8A 1KNIA 4XJBA 1KXWA 1C60A 5FSTA 3ZVQB 4LYTA 3TXKA 3T36A 2A7DA 1L29A 248LA 1HEPA 1GWDA 5KXRA 3GUMA 1CJ7A 1IEEA 1B5YA 2MEAA 1C6CA 1LHKA 4NSGA 3TXDA 1L66A 4EKRA 1I6SA 2OEAX 1FKVA 4OWHA 5B06A 1GBZA 2F4GA 4I7QA 1CVKA 120LA 1LHHA 3FA0A 4MCKA 4WLDA 149LA 4ZFPA 3DKEX 1JTNA 237LA 1T8AA 3A91A 4LT1A 4N9RA 1GFJA 1W08A 2F2QA 1GF0A 2OU0X 1LYYA 1G06A 2BPUA 1DI3A 5DLAA 4W51A 3WW6A 164LA 3B6LA 1T3PA 1IR7A 1L05A 1AZFA 4TX7A 110LA 1PQIA 2ZQ4A 4I7KA 5KKIA 1JISA 210LA 4H92A 4HTKA 2RB2X 4LZTA 1P37A 4NFVA 4J7VA 1I1ZA 3AGHA 1DPXA 2I25L 2HULA 3P66A 3OJPA 3SBAA 1XJUA 3WPLA 1L35A 1IY3A 4I0CA 5LA5A 1IWTA 5M1YA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1L73 A;  1L68 A;  1OVJ A;  2G4N A;  1CX6 A;  1C69 A;  3WVY A;  1REY A;  1YAM A;  1LSD A;  1B6I A;  4I7L A;  5L9J A;  227L A;  191L A;  3TXE A;  2Y8P A;  1JTP L;  1GB5 A;  2EKS C;  4LDO A;  4GCE A;  1D0M A;  5KY1 A;  1ZYT A;  2CUU A;  232L A;  1C46 A;  4WOA A;  1GF8 A;  1LJE A;  3A90 A;  3OE9 A;  1G0G A;  5APF A;  5KXW A;  1LSB A;  6LZM A;  1HMK A;  166L A;  4DJH A;  183L A;  2RBQ A;  4DYG A;  1FBI X;  1JKB A;  4EKP A;  1LSN A;  2Z18 A;  1C6F A;  1GFE A;  2OU9 A;  1CV5 A;  103L A;  215L A;  4G4H A;  4ARM B;  2MEC A;  1F6S A;  4W96 A;  1B5U A;  1CKG A;  3E3D A;  1UUZ C;  163L A;  1L37 A;  3HDE A;  2Z19 A;  1L33 A;  1LGX A;  7LYZ A;  3WH1 A;  192L A;  236L A;  3W6B A;  1G7M C;  1LZ6 A;  2OTZ X;  1CJ9 A;  1L08 A;  1L85 A;  1MLC E;  3CDO A;  4DD2 A;  4B1A A;  5APD A;  1C65 A;  3C82 A;  4CJ2 A;  4LT3 A;  2YBN A;  1TEW A;  1I20 A;  3TMW A;  4G4C A;  1LZG A;  2LC9 A;  5KXM A;  154L A;  3G3B B;  3DN6 A;  3A93 A;  5LYT A;  1LZ9 A;  1JPO A;  4WLX A;  246L A;  234L A;  3SP3 A;  1EQ4 A;  1L39 A;  3IJU A; 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