234LA

T4 lysozyme mutant m106l
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQLGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Context-dependent protein stabilization by methionine-to-leucine substitution shown in T4 lysozyme.
pubmed rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1997-10-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 234lA00
3F9LA 186LA 1T8FA 5LZMA 1L32A 1L06A 1QSBA 3GUOA 3ODUA 187LA 258LA 2RBSA 1JTNA 182LA 1G0GA 3HH6A 247LA 227LA 237LA 1SX2A 2B74A 257LA 1CU0A 1L56A 234LA 2OTZX 1C65A 109LA 217LA 2RAZX 249LA 1L38A 1K28A 188LA 4YX7C 1DYFA 192LA 2B7XA 3DN3A 2IGCA 3JR6A 1C6CA 145LA 149LA 1L90A 245LA 2QARC 1G06A 215LA 2RBQA 1L83A 1LYGA 1CUQA 1QUGA 1LYDA 3OE9A 1C63A 1C6GA 1QTZA 1QUHA 3HH5A 128LA 4PJZA 3D4SA 1KS3A 7LZMA 183LA 2B73A 1L13A 2O4WA 1B6IA 130LA 1OVJA 1P2LA 165LA 1L20A 1L48A 102LA 1L51A 3DN6A 3HTBA 4EKPA 1G0QA 4ARQB 171LA 2HUMA 3DMXA 1PQJA 206LA 1L76A 3NYAA 1L85A 3DN4A 1C6QA 223LA 4DJHA 127LA 158LA 4I7JA 1G1WA 1TLAA 1C6MA 1XJTA 3HT6A 3OE8A 1LGWA 1OV5A 229LA 3HUQA 2HULA 139LA 1LW9A 4AQNA 3DN1A 181LA 1JQUA 3GUPA 4DKLA 1C64A 1C68A 4EXMA 1DYBA 3HTDA 184LA 3HTGA 1SSYA 1SX7A 1L72A 1L55A 197LA 1L57A 1PQDA 1DYEA 2LC9A 4E97A 175LA 236LA 2B75A 1XEPA 1D3NA 1LLHA 1L42A 3SB8A 2L78A 1L84A 4I7PA 221LA 1L24A 3QAKA 1CV6A 3GUNA 1LWGA 1L81A 1LWKA 1P7SA 2OE7X 3DNAA 1P46A 1CV1A 2Q9DA 1G0KA 241LA 3FI5A 1C6JA 1P5CA 3C8SA 4K5YA 1P36A 119LA 3L64A 1L52A 4ARMA 3C7WA 1C6BA 3HU8A 1P2RA 3HT9A 1ZYTA 4W57A 148LE 3HT7A 1L58A 1D3JA 4PK0A 4W56A 1C6DA 2B6XA 3PBLA 164LA 198LA 167LA 1CU3A 3C7ZA 3HWLA 1LGXA 170LA 3SB5A 240LA 3VW7A 2RB0X 2F32A 172LA 225LA 143LA 3C82A 1LI2A 129LA 259LA 226LA 216LA 4EKRA 142LA 1L89A 1L07A 1T97A 3SB9A 2O79A 1ZURA 1CUPA 1L75A 3HUAA 176LA 1CU5A 1D9WA 3SB6A 230LA 4EKSA 2LZMA 159LA 1L54A 1OWYA 3CDRA 3C83A 2RBPA 3HDFA 1L93A 180LA 4EPIA 3CDVA 4I7SA 2NTGA 199LA 3NY8A 1KW5A 231LA 111LA 219LA 3F8VA 1L64A 3PDSA 1L34A 137LA 1C66A 1LI6A 3L2XA 250LA 1G0PA 210LA 1CU6A 2B6YA 222LA 1L65A 1QTCA 1QTHA 1DYGA 4W51A 220LA 1OVHA 4I7TA 1L88A 1CTWA 2B72A 3C8RA 3SBBC 1L00A 115LA 1L0JA 4YXCA 1L29A 1DYCA 1L16A 2F47A 3C8QA 1T8AA 1L28A 3HH3A 3GULA 1CU2A 256LA 214LA 1CV5A 253LA 1L97A 1KW7A 2ANVA 1KY0A 2OTYX 140LA 1L12A 2RB1X 150LA 200LA 4S0WA 243LA 1QTDA 1QS9A 4W54A 1L04A 1L71A 155LA 1G07A 1L91A 162LA 1T8GA 1OYUA 4I7RA 2Z6BA 1L68A 2RBOA 1EPYA 125LA 3G3WA 1L02A 2LCBA 1P37A 1L80A 1D2YA 1P56A 3K2RA 1L14A 1L25A 4EJ4A 1QUOA 3DKEX 4EKQA 1L41A 1L22A 1JTMA 1C62A 239LA 157LA 1C6FA 4LZMA 1QT6A 260LA 4I7LA 1P3NA 4LDLA 4W59A 1L53A 1P6YA 2OEAX 1P64A 2QB0B 1LYEA 3UONA 4I7MA 1LYJA 1C6NA 2HUKA 1T6HA 4I7OA 4W55A 3NY9A 1ZWNA 212LA 1C6AA 4I7QA 1LYFA 1OV7A 1D3FA 2O7AA 4GRVA 3CDTA 1C6HA 1SWYA 1C67A 1L74A 1L77A 1L30A 3EMLA 131LA 3SBAA 2CUUA 1CVKA 195LA 1PQIA 1QSQA 108LA 1LYHA 3HDEA 1QTVA 1C6TA 1SSWA 1LYIA 1QT3A 238LA 196LA 3DN0A 1G0LA 160LA 1CV0A 1PQOA 4IAPA 1NHBA 3GUIA 248LA 1L66A 168LA 4I7NA 218LA 1OVKA 1L09A 4DAJA 3C81A 3CDOA 1L01A 3LZMA 120LA 1L03A 3SB7A 1G1VA 1QTBA 233LA 262LA 2B6TA 3C7YA 118LA 123LA 1L15A 213LA 3RZEA 242LA 4W58A 1L27A 107LA 1QS5A 1LPYA 178LA 1DYAA 166LA 1C60A 2OU0X 3OE0A 4ARJA 1LGUA 1L0KA 4EPFA 1G0MA 244LA 1L08A 2OE4X 147LA 169LA 1D2WA 138LA 255LA 3FADA 1I6SA 4LDOA 2B6ZA 2A4TA 1QT4A 103LA 2OE9X 2ANXA 1L35A 1L05A 3GUKA 1QUDA 151LA 177LA 1L44A 1L98A 112LA 156LA 3HTFA 1PQMA 232LA 3G3XA 1L18A 3DMZA 1LI3A 122LA 1L70A 1QT7A 2OU8A 2B6WA 1OWZA 163LA 4I7KA 6LZMA 3HT8A 1L26A 1L17A 1L86A 1L23A 1L33A 1L67A 4YXAC 114LA 1L47A 1L45A 1L94A 235LA 146LA 3RUNA 1L62A 110LA 1L31A 1L50A 209LA 3OE6A 173LA 228LA 1C6PA 254LA 1C69A 1DYDA 2RB2X 4ARQA 1L19A 224LA 1WTHA 2Q9EA 1L40A 246LA 1C6KA 161LA 1L49A 3GUJA 1PQKA 1G0JA 5I14A 1L99A 1L10A 1L21A 1L73A 1L79A 126LA 1C6EA 2RH1A 3CDQA 1L63A 1L37A 1L59A 1XJUA 4W53A 3HUKA 1SWZA 2NTHA 211LA 1L87A 3GUMA 1L36A 3C80A 4LDEA 1L69A 185LA 174LA 2B70A 1KNIA 4ARMB 2OU9A 1L92A 3FA0A 189LA 3HH4A 1L60A 4ARPA 1L95A 4OO9A 152LA 1L82A 1C6IA 1QT8A 1CX7A 2RBNA 4W52A 1CX6A 1D3MA 1L96A 261LA 3DN2A 201LA 2RBRA 205LA 3HU9A 2F2QA 144LA 1QT5A 190LA 141LA 4GBRB 3DN8A 1C61A 104LA 1KY1A 1L11A 3G3VA 1CV4A 1L61A 3V2WA 1C6LA 3DMVA 2RAYX 1CV3A 251LA 1L43A 4ZPUA 1L46A 1L39A 4ARLA 3V2YA 113LA 252LA 3SN6R 191LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2H9KA 4H8YA 3AB6A 1G0GA 5I4XA 1IEEA 247LA 1B7MA 237LA 4ETDA 5HLLA 1BB5A 4P2EA 2IGCA 3JR6A 245LA 2QARC 2ZQ3A 1GAYA 1C46A 1G06A 1LYGA 2CWIA 1EQ4A 2A7FA 4C3WA 2C8OA 4B49A 4L41A 1JJ3A 4XJIA 3LN2A 1IORA 4WM6A 4N9RA 3OE9A 1QTZA 3HH5A 1J1XY 4UWNA 2B73A 1L13A 1L20A 5FHWA 4DQ5A 1GBZA 1GFKA 2YVBA 4ET9A 1KIPC 3D9AC 1BVKC 1PQJA 4NHTA 3EMSA 2LYOA 223LA 4I7JA 1G1WA 1GF9A 1GD6A 153LA 3P64A 4WLDA 1GB6A 3OE8A 229LA 2HULA 1JKBA 4CFPA 1XEKA 2BQJA 3GUPA 2ZQ4A 4HTNA 1DYBA 4Z41A 1SSYA 4RLNA 3A3RX 1DYEA 2LC9A 175LA 1VFBC 3WVYA 4ZEEA 2L78A 2NWDX 1L84A 4I7PA 4B4IA 1LJFA 4LYBA 3D3DA 3GUNA 1LWGA 1L81A 2G4QA 4U3XB 1GE3A 1G0KA 241LA 4LYMA 1GDXA 1P36A 4ARMA 1LZGA 3CSRA 1P2RA 3HT9A 5I4YA 3HT7A 1L58A 1C6DA 3PBLA 164LA 5KKIA 1LSAA 1HEWA 2EQLA 4FJRA 4WO9A 4QGZA 3WVXA 2GV0A 4B1AA 1GF6A 225LA 6LYZA 1LI2A 1LZ6A 216LA 1L89A 4TTDA 1A2YC 1L07A 1T97A 1BHZA 5F14A 5HNCA 2I6ZA 1VDQA 1CU5A 1NBZC 3TXEA 4LFXA 1LJEA 3QE8A 1L93A 180LA 3VWOA 3N9AA 3LYTA 199LA 3AGHA 231LA 4GLVA 219LA 2DQHY 4NFVA 1LYSA 137LA 1C66A 1G0PA 1QTCA 1CJ6A 4W51A 1LZ9A 1BGIA 220LA 1L00A 5II3A 1L0JA 1L29A 1SLYA 3C8QA 1L28A 5B1FA 3RZ4A 1GXXA 3GULA 1CU2A 256LA 4TSCA 1GHLA 2OTYX 5LVIA 5J7CA 1L12A 4YF2A 3A91A 150LA 2BQEA 3W6AA 1QS9A 1L71A 1HSWA 155LA 3SP3A 1T8GA 4KT3A 1KIQC 1L68A 1P56A 4H9FA 1HHLA 4CGEA 1L25A 1QUOA 1LSBA 1IP2A 3DKEX 1QUSA 1JTMA 2F4AA 3T6UA 260LA 4W59A 1LZ4A 2BQGA 1YL0X 1LYJA 4TSBA 1T6HA 4I7OA 1WQRA 1ZWNA 4GRVA 1C67A 1L74A 1BQLY 2IHLA 5APEA 1L77A 3WU9A 5FCPA 3W3EA 3ATNA 5K7OA 1QSQA 4MR1A 1LYOA 238LA 5E4PA 3WUMA 1PQOA 4RDSA 248LA 168LA 1GB9A 1LSPA 3GXKA 4Z3MA 1LSMA 1J1PY 4LYTA 1L01A 3LZMA 1L03A 4BAPA 1G1VA 4OOOA 4N5RA 1LHMA 1G7JC 4XJBA 213LA 3EBAB 3LZ2A 5KY1A 242LA 3WPJA 7LYZA 107LA 1QS5A 178LA 2OU0X 3OE0A 4ET8A 1L0KA 1GB3A 2OE4X 4UWVA 1HEQA 4KPMA 255LA 1LSNA 5T3FA 2BQOA 1QT4A 2ANXA 2DQDY 4XENA 1LJKA 177LA 4NGJA 1LJNA 3ZEKA 156LA 4DD3A 1GPQC 4J7VA 1OUEA 2FYCA 5HMJA 1OWZA 4I7KA 4LYZA 3W6FA 1L26A 3RU5A 1L86A 1L33A 1L67A 1NMMA 3HBDA 4YEOA 1BB6A 3RUNA 228LA 5D5CA 1B7RA 1C69A 4GCDA 3J6KA 1C6KA 1WQNA 1L49A 1LZAA 1IR9A 2BQCA 1L10A 126LA 5KXZA 1C6EA 4OOTA 2RH1A 1VEDA 1L37A 1D9UA 1B7LA 1SWZA 1GE4A 1XGUC 4WO6A 3A6CY 5LA5A 1WQPA 1PS5A 174LA 2B70A 2ZIJA 4AGAA 1GE1A 5KKJA 1L60A 5LIOA 1DZBX 3QY4A 4II8A 1L82A 4IJ4A 1RE2A 4H8ZA 193LA 1AM7A 2RBNA 4WG1A 3DN2A 1LHHA 1UUZC 3HU9A 1B5WA 5APFA 2F2QA 4G9SA 4IATA 5LVHA 1LZDA 2ZNXY 2YSSC 1IWUA 3DMVA 2RAYX 3TMWA 1CV3A 251LA 1GF5A 4ZPUA 4UWUA 4ARLA 113LA 4W94A 3SN6R 191LA 135LA 2XQOA 1L32A 2RBSA 4MCKA 1JJ0A 1JTNA 1IY4A 3TXGA 4X3BA 1SX2A 1CU0A 1L56A 234LA 109LA 217LA 188LA 4NSJA 1DYFA 1C6CA 1RFPA 149LA 3T36A 1L90A 1UC0A 1QQYA 1JPOA 3TXFA 194LA 1CUQA 2HEFA 1GB2A 2H5ZA 1HEPA 4PRUA 1CJ7A 3WU8A 1GBXA 128LA 3TMUA 1KS3A 1IWTA 2EPEA 1IWXA 5ILCA 1B6IA 130LA 1ZMYL 4J1BA 1P2LA 1L48A 3HTBA 4EKPA 4ARQB 1UIHA 4XJHA 1LOZA 2MECA 5KXNA 2D4IA 1GE2A 1L76A 1L85A 4DQ7A 5KXOA 4WM1A 4NG8A 1TLAA 3B6LA 1C6MA 4W96A 4CFOA 1LGWA 1LSZA 1PZYA 1A4VA 1F6SA 1LSFA 3TXDA 4DDBA 1T6VL 4DKLA 4EXMA 1LMPA 1GBYA 5FELA 1TCYA 197LA 1YIKA 1L57A 2HTXA 1IC4Y 1LSEA 1G7HC 236LA 2B75A 3HBHA 5C6IA 1L42A 2ZYCA 1LCNA 1LMTA 1DQJC 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2H9K A;  4H8Y A;  3AB6 A;  1G0G A;  5I4X A;  1IEE A;  247L A;  1B7M A;  237L A;  4ETD A;  5HLL A;  1BB5 A;  4P2E A;  2IGC A;  3JR6 A;  245L A;  2QAR C;  2ZQ3 A;  1GAY A;  1C46 A;  1G06 A;  1LYG A;  2CWI A;  1EQ4 A;  2A7F A;  4C3W A;  2C8O A;  4B49 A;  4L41 A;  1JJ3 A;  4XJI A;  3LN2 A;  1IOR A;  4WM6 A;  4N9R A;  3OE9 A;  1QTZ A;  3HH5 A;  1J1X Y;  4UWN A;  2B73 A;  1L13 A;  1L20 A;  5FHW A;  4DQ5 A;  1GBZ A;  1GFK A;  2YVB A;  4ET9 A;  1KIP C;  3D9A C;  1BVK C;  1PQJ A;  4NHT A;  3EMS A;  2LYO A;  223L A;  4I7J A;  1G1W A;  1GF9 A;  1GD6 A;  153L A;  3P64 A;  4WLD A;  1GB6 A;  3OE8 A;  229L A;  2HUL A;  1JKB A;  4CFP A;  1XEK A;  2BQJ A;  3GUP A;  2ZQ4 A;  4HTN A;  1DYB A;  4Z41 A;  1SSY A;  4RLN A;  3A3R X;  1DYE A;  2LC9 A;  175L A;  1VFB C;  3WVY A;  4ZEE A;  2L78 A;  2NWD X;  1L84 A;  4I7P A;  4B4I A;  1LJF A;  4LYB A;  3D3D A;  3GUN A;  1LWG A;  1L81 A;  2G4Q A;  4U3X B;  1GE3 A;  1G0K A;  241L A;  4LYM A;  1GDX A;  1P36 A;  4ARM A;  1LZG A;  3CSR A;  1P2R A;  3HT9 A;  5I4Y A;  3HT7 A; 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