234LA

T4 lysozyme mutant m106l
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQLGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Context-dependent protein stabilization by methionine-to-leucine substitution shown in T4 lysozyme.
pubmed rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
molecule keywords T4 LYSOZYME
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1997-10-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 234lA00
3NY8A 2F2QA 3PBLA 1XJUA 1OVKA 1OVJA 2F32A 3DNAA 2Q9EA 1CVKA 4I7JA 1L40A 3GUMA 4ARPA 4W56A 1C6FA 1PQJA 223LA 3SB5A 2O79A 2OE4X 3DN8A 130LA 4YXCA 1L90A 255LA 1XEPA 2RBRA 2OEAX 110LA 1QT3A 4PJZA 186LA 1L37A 3C82A 183LA 226LA 229LA 4I7TA 1L15A 1L16A 1L61A 1LGUA 1L14A 4I7RA 174LA 1L68A 1LI6A 1L53A 169LA 172LA 3F9LA 3SN6R 1L97A 3FA0A 1C6HA 211LA 1L86A 1P5CA 243LA 3C83A 4I7OA 1L21A 1L99A 1L66A 3UONA 1L22A 1L08A 216LA 156LA 252LA 258LA 2RAZX 3C7ZA 128LA 218LA 149LA 1KY0A 3LZMA 140LA 1OV5A 4W59A 1L71A 3OE9A 4W55A 3K2RA 3GUIA 1L80A 3RUNA 123LA 131LA 1C68A 6LZMA 210LA 1DYFA 212LA 1L44A 3HWLA 205LA 4LZMA 1T8GA 1L24A 3C8RA 1L63A 4I7PA 1CU5A 4EXMA 168LA 3V2YA 1QT8A 4LDLA 1P7SA 215LA 3GUKA 1CV6A 4I7NA 3F8VA 2HUMA 195LA 4GBRB 1LWKA 201LA 230LA 3DMVA 1L29A 1CV3A 3DN6A 3HH3A 1L00A 2L78A 1L11A 180LA 176LA 187LA 1LYEA 1C6MA 1L51A 1L87A 1CV4A 3SB9A 164LA 2B70A 3OE6A 5I14A 1C6LA 4W51A 1LLHA 1CU3A 1C62A 1D2WA 196LA 1KW5A 2RB1X 1D2YA 1L56A 3GUNA 238LA 253LA 3HTGA 1LYHA 1L04A 1B6IA 1C67A 1OYUA 2OU0X 4I7LA 1JTMA 1L91A 246LA 127LA 2B72A 3CDVA 1C66A 225LA 4W54A 1L26A 2B73A 2QARC 4W52A 2RBPA 3SB6A 4EKQA 3DN4A 2RAYX 1C6QA 1L59A 189LA 162LA 151LA 1QTVA 3L2XA 231LA 1SWYA 122LA 1LGXA 3HUAA 1P37A 1L18A 1P64A 1L92A 4AQNA 1C6NA 1D3NA 1L32A 1QTBA 1L79A 261LA 1CUQA 2OU8A 1P36A 2LCBA 3V2WA 245LA 3HUKA 2RH1A 1L06A 1L0JA 1KY1A 4YXAC 2RBSA 3EMLA 1L55A 1L85A 1SSYA 3G3VA 3FI5A 234LA 4E97A 159LA 1DYEA 1L10A 3C7WA 1L20A 1C6AA 1L03A 1C6JA 1L36A 1QSBA 1L47A 2OE7X 1L96A 1G06A 1L39A 111LA 206LA 1JQUA 4W58A 5LZMA 2RBNA 1QT5A 3ODUA 1PQOA 2CUUA 2OTYX 107LA 1QUDA 254LA 3SB8A 1D3JA 1L76A 2HUKA 3DMZA 4K5YA 113LA 4PK0A 1NHBA 3VW7A 192LA 1L12A 2Q9DA 1LPYA 4EJ4A 1L45A 1C6IA 2B74A 147LA 1LYGA 4EPIA 3GULA 3OE0A 1QT6A 1D3MA 163LA 1CU2A 1C6PA 2HULA 1QTHA 4ARLA 104LA 1CV5A 232LA 248LA 143LA 2O4WA 142LA 1L50A 3FADA 1G1WA 146LA 4ARMB 3SBAA 3HT6A 1C69A 1C6EA 141LA 1CTWA 1L30A 191LA 1G0QA 3SBBC 1G0LA 184LA 152LA 1C63A 239LA 3GUPA 1L58A 165LA 4S0WA 1QTDA 1L35A 3HTDA 1L73A 171LA 209LA 4EKRA 1QS5A 3HT8A 108LA 1C6TA 2NTGA 260LA 137LA 1SX2A 3DN3A 167LA 4I7KA 1G0KA 3D4SA 1K28A 2IGCA 1LWGA 4LDOA 109LA 1L01A 1LGWA 1G1VA 1KS3A 161LA 221LA 1L25A 1XJTA 240LA 3C7YA 1LI3A 115LA 1KNIA 2RB0X 257LA 3L64A 119LA 1C6CA 3C81A 118LA 1PQDA 1G07A 1L09A 3G3XA 1SX7A 200LA 1L72A 120LA 160LA 197LA 1DYCA 4DJHA 3HUQA 1P2LA 1QUGA 3C8QA 125LA 1G0PA 249LA 1ZWNA 1LYJA 1C6GA 1DYDA 103LA 1QT4A 3DKEX 4YX7C 166LA 1D3FA 1QTZA 4I7SA 3GUOA 4ARMA 199LA 1L02A 3RZEA 1OVHA 1L64A 1L70A 4GRVA 1L38A 4ARQB 1OWZA 1I6SA 1T8FA 2OU9A 2OTZX 3PDSA 2B6XA 2RBQA 1LW9A 1L41A 2QB0B 3DN2A 1L89A 3NYAA 1C64A 181LA 1TLAA 155LA 1L05A 1CUPA 3CDRA 217LA 4DKLA 157LA 1L82A 1DYGA 1ZYTA 3GUJA 175LA 1L62A 1L43A 244LA 3HTBA 233LA 3SB7A 4I7MA 3HH4A 150LA 1CU6A 1LI2A 4IAPA 114LA 4OO9A 247LA 112LA 3NY9A 144LA 224LA 1L57A 1D9WA 3HT9A 1P56A 1LYDA 4W57A 1L93A 2B6WA 2F47A 1C6KA 2Z6BA 4I7QA 4W53A 3DN1A 102LA 182LA 1JTNA 1EPYA 1L49A 2ANXA 4DAJA 1P46A 1C6DA 190LA 1L19A 1P2RA 178LA 3G3WA 3C8SA 237LA 3HH5A 4LDEA 1T8AA 2B75A 1P3NA 1L81A 2RBOA 3CDOA 1CV1A 145LA 1QS9A 1G0MA 2LC9A 177LA 2O7AA 129LA 4EKPA 2B6TA 4ARQA 1QUHA 2OE9X 198LA 2ANVA 235LA 3HT7A 3HDEA 1L28A 1L34A 222LA 1L46A 1L48A 1PQKA 1QUOA 1C60A 1QSQA 139LA 1L95A 1L94A 1L77A 1CV0A 185LA 250LA 1L75A 3DMXA 3OE8A 2NTHA 1SSWA 2A4TA 1WTHA 3HU9A 1G0JA 1C65A 1L84A 1L0KA 1LYIA 3CDTA 219LA 1DYAA 1L88A 1L67A 1OV7A 1P6YA 241LA 2LZMA 1L65A 1T6HA 1L13A 1L98A 1L27A 1DYBA 213LA 2B6ZA 1L54A 7LZMA 262LA 1KW7A 1C6BA 220LA 1L42A 1L60A 1L31A 4ZPUA 1CU0A 3JR6A 4EPFA 1C61A 4EKSA 3CDQA 1T97A 3HU8A 1L69A 188LA 214LA 3DN0A 236LA 1G0GA 1L23A 1OWYA 2RB2X 3C80A 227LA 1QTCA 1L17A 228LA 1L52A 138LA 1CX6A 173LA 251LA 1L07A 170LA 256LA 3QAKA 1CX7A 1ZURA 126LA 1QT7A 3HTFA 2B6YA 1LYFA 3HH6A 4ARJA 1PQIA 1L33A 2B7XA 1PQMA 1L74A 148LE 242LA 1L83A 259LA 3HDFA 1SWZA 158LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2F2QA 1OVJA 1VDSA 2MEBA 2MEEA 4E3UA 1FN5A 4O34A 223LA 3SB5A 3WVXA 4M6DA 2OEAX 4HTKA 1LJFA 4XJIA 1D0KA 1QSAA 1BHZA 1GE3A 4I7TA 1HC0A 1L61A 4J0LA 1YQVY 174LA 1L53A 2LYOA 3CSQA 1LZYA 3SN6R 1EQ5A 3FA0A 4W94A 3C83A 1INUA 1L21A 4LFXA 1GFKA 1L22A 156LA 2RAZX 2BQCA 4GCBA 1UIDA 2BQBA 3WUNA 1P2CC 1WVUA 5F9UA 5LA8A 1D0LA 3OE9A 2HU3A 4W55A 4ZIXA 1B9OA 123LA 6LZMA 3P68A 3HWLA 1DI3A 4H1PA 3ATNA 4H92A 4LZMA 5APEA 4NHIA 5DN4A 168LA 5B59A 1YANA 3AGIA 1IORA 1QTKA 2X0AA 4GBRB 4ETEA 1UCOA 1GF9A 1LWKA 1XEIA 3CSZA 5LVIA 1TBYA 2VB1A 5LVJA 4PJ2C 4LYOA 1EL1A 1XEKA 5IDDA 133LA 4LT0A 3DN6A 2Z38A 1L00A 2D4JA 1NDMC 1YAPA 1L51A 1LZ9A 164LA 2ZNXY 3OE6A 4TWSA 3TXEA 4W51A 1LZ4A 1C62A 1L56A 4RW2A 1IWZA 253LA 2YBNA 4DT3A 4N1EI 1GE1A 246LA 225LA 4NGJA 4H9BA 3LYOA 1YKZX 2B73A 2QARC 2ZIJA 151LA 1QTVA 1SWYA 3TXBA 1L18A 1QUSA 3BKHA 4LYBA 2MECA 1QTBA 4I8SA 3EO5A 3WU7A 1LZ8A 4Z46A 3J6KA 3QE8A 2MEAA 2RH1A 2XQOA 2LZ2A 4XYYA 3G3VA 4OWAA 2FYDA 3C7WA 1L10A 2Z2EA 3ZEKA 2OE7X 1JHLA 1L96A 1B7QA 206LA 4H94A 1JKCA 107LA 5F14A 1GF6A 1JTPL 4N1CC 1L12A 5M1YA 1UC0A 2B74A 1ALCA 1LYGA 4EPIA 3OE0A 163LA 1OUEA 1VEDA 1CV5A 248LA 154LA 1NBYC 2ZWBA 1L50A 4DDAA 5I4XA 1FBIX 1IOSA 5KXLA 3T36A 5A3EA 3TXDA 5I54A 1C69A 141LA 1GB2A 3TXIA 4B4IA 3HTDA 2FBBA 171LA 5E9RA 2NTGA 137LA 1SX2A 167LA 3WH1A 5C6LA 1IIZA 2BQGA 5KXYA 1LSDA 1CKHA 2DQEY 1HFXA 1LGWA 3A90A 4DDCA 1KIQC 1WQOA 118LA 1B7NA 4G4BA 4MR1A 4WG7A 200LA 5HMVA 1YAOA 1P2LA 2D4KA 4NG8A 4EMNA 4NSJA 5APCA 1LSGA 3B0OA 1G0PA 1ZWNA 1LHIA 1QT4A 4YX7C 166LA 1D3FA 1QTZA 199LA 4GN5C 1L64A 4UWVA 1L70A 1OWZA 4HV1A 5DL9A 1DKJA 2OTZX 4WM5A 1UIHA 1LW9A 2QB0B 4X3BA 3NYAA 1C64A 3RT5X 1L05A 1LYZA 1YIKA 1GF8A 217LA 1BB7A 4DKLA 157LA 4NGKA 1HFYA 1L82A 1GFRA 1HMKA 1ZYTA 3GUJA 1L62A 244LA 3HTBA 3SB7A 2WARA 4B0DA 150LA 4B1AA 3TXGA 247LA 2DBTA 1LYYA 5FSTA 224LA 2B5ZA 1BB3A 1JJ3A 4GCFA 1L93A 2B6WA 2F47A 2Z6BA 2LYZA 3DN1A 1JSEA 3AW6A 182LA 1JTNA 1EPYA 1ZVYB 2ANXA 1C6DA 1L19A 1ZV5L 178LA 3G3WA 4ET9A 1G7JC 1P3NA 1T3PA 1L81A 1G0MA 177LA 2O7AA 2YBIA 3LN2A 4EKPA 2B6TA 198LA 2ANVA 3HDEA 222LA 4YEMA 1QUOA 1LSYA 1HEOA 3CSRA 1L95A 1CV0A 5LVKA 3WXTA 1JSFA 1L75A 4HJVA 1IP3A 4DD7A 4DD2A 1G0JA 1L84A 1L0KA 1LYIA 3P65A 1OV7A 1IX0A 2BLXA 1EQEA 1L98A 1L27A 4HJYA 1DYBA 213LA 4H90A 4BAFA 1UIAA 1IC5Y 4R0FA 1L54A 3LHMA 1DI5A 262LA 4LYZA 1C10A 1L42A 1L60A 3JR6A 5LYTA 2EIZC 1EQ4A 4H8YA 3HU8A 1L69A 1FDLY 4HTQA 3AZ7A 5F16A 1C08C 1QTCA 3A3RX 1CX6A 170LA 1IP1A 1ZURA 2YSSC 1BVXA 3WVYA 2NWDX 2B6YA 4P2EA 1BWJA 1PQIA 2B7XA 1GFHA 5HMJA 4CHXA 2BPUA 5KXXA 1B5YA 2Z19A 1UIFA 3TMXA 3PBLA 1IVMA 2Z37A 1B2KA 2DQDY 1L40A 3GUMA 1PQJA 3DN8A 4WLYA 255LA 1DXJA 3B72A 1QT3A 1L37A 4AGAA 1LJIA 5EBHA 229LA 5K7OA 1LSNA 4I7RA 4RDSA 169LA 4GCDA 3F9LA 4NHQA 3M3UA 243LA 4XJGA 1XGQC 1IP2A 4I7OA 208LA 3AW7A 1L66A 1C43A 5KXOA 216LA 1L08A 1LHLA 4ZFPA 252LA 1LZCA 4PRQA 218LA 3MGWA 4Z3MA 149LA 1GF0A 1GBOA 2DQGY 1AKIA 5T3FA 1OV5A 4A7DA 5KXPA 4MSTA 1L71A 3A95A 1WQMA 1LHJA 2BQJA 5KKJA 131LA 1C68A 1GFTA 4B49A 212LA 4KXIA 5LIOA 4LYCA 4CFPA 1T8GA 1UIEA 1LHMA 3V2YA 1QT8A 5KXNA 1UIGA 1P7SA 1UIBA 1JJ1A 5AMYA 3F8VA 3A91A 1GBZA 1OUJA 4WG1A 4XJFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2F2Q A;  1OVJ A;  1VDS A;  2MEB A;  2MEE A;  4E3U A;  1FN5 A;  4O34 A;  223L A;  3SB5 A;  3WVX A;  4M6D A;  2OEA X;  4HTK A;  1LJF A;  4XJI A;  1D0K A;  1QSA A;  1BHZ A;  1GE3 A;  4I7T A;  1HC0 A;  1L61 A;  4J0L A;  1YQV Y;  174L A;  1L53 A;  2LYO A;  3CSQ A;  1LZY A;  3SN6 R;  1EQ5 A;  3FA0 A;  4W94 A;  3C83 A;  1INU A;  1L21 A;  4LFX A;  1GFK A;  1L22 A;  156L A;  2RAZ X;  2BQC A;  4GCB A;  1UID A;  2BQB A;  3WUN A;  1P2C C;  1WVU A;  5F9U A;  5LA8 A;  1D0L A;  3OE9 A;  2HU3 A;  4W55 A;  4ZIX A;  1B9O A;  123L A;  6LZM A;  3P68 A;  3HWL A;  1DI3 A;  4H1P A;  3ATN A;  4H92 A;  4LZM A;  5APE A;  4NHI A;  5DN4 A;  168L A;  5B59 A;  1YAN A;  3AGI A;  1IOR A;  1QTK A;  2X0A A;  4GBR B;  4ETE A;  1UCO A;  1GF9 A;  1LWK A;  1XEI A;  3CSZ A;  5LVI A;  1TBY A;  2VB1 A;  5LVJ A;  4PJ2 C;  4LYO A;  1EL1 A;  1XEK A;  5IDD A;  133L A;  4LT0 A;  3DN6 A;  2Z38 A;  1L00 A;  2D4J A;  1NDM C;  1YAP A;  1L51 A;  1LZ9 A;  164L A;  2ZNX Y;  3OE6 A;  4TWS A;  3TXE A;  4W51 A;  1LZ4 A;  1C62 A;  1L56 A;  4RW2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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