234LA

T4 lysozyme mutant m106l
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQLGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Context-dependent protein stabilization by methionine-to-leucine substitution shown in T4 lysozyme.
pubmed rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1997-10-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 234lA00
1L0JA 3C80A 1L55A 4EPFA 1QSQA 3HUKA 1L10A 236LA 3C7WA 1KY0A 3HH6A 178LA 1DYCA 1L79A 1L12A 192LA 122LA 1SX2A 1XEPA 1QT3A 129LA 1L23A 1CU6A 1G0LA 1TLAA 4LDEA 3GULA 2RH1A 3HDEA 1QUGA 3SBBC 3FADA 1C60A 1LW9A 137LA 1QT5A 1L73A 1KW7A 2RBSA 4I7PA 3QAKA 3FA0A 206LA 1PQJA 3CDTA 4ARQA 111LA 1L28A 3PBLA 1T8AA 3OE8A 143LA 1CUPA 2RB0X 1KY1A 1P46A 205LA 5LZMA 2OU8A 4W59A 4IAPA 4LZMA 186LA 4ARMB 2O7AA 232LA 216LA 1C6TA 1L24A 219LA 245LA 1L09A 252LA 1DYFA 3HUQA 1L08A 4ARJA 4DKLA 1L33A 2RBOA 1SX7A 1L66A 3SN6R 1L64A 3NY9A 1ZURA 3C8QA 144LA 1L86A 1L61A 184LA 1QUDA 1L20A 237LA 3L64A 3DN8A 1L77A 1L11A 1L25A 183LA 145LA 1CTWA 162LA 3CDVA 4ARQB 3K2RA 212LA 3HT9A 3HU9A 3HT7A 4EKQA 2RBNA 1CV1A 226LA 3C82A 113LA 1L06A 1QSBA 225LA 108LA 3UONA 1QTVA 1L16A 2L78A 187LA 1L31A 3NY8A 163LA 4I7RA 3SB8A 2RB2X 2B72A 1SWYA 1LYIA 125LA 1LGXA 1KS3A 1L52A 1P7SA 1L82A 1L39A 1LI6A 1JQUA 4W53A 1L03A 1L75A 1LYGA 1CU0A 2RAYX 2LCBA 1T8FA 1QUHA 6LZMA 209LA 3F9LA 2F47A 229LA 4I7LA 1L17A 4W56A 1P6YA 1L41A 239LA 211LA 3GUPA 4LDLA 1OVKA 257LA 1L40A 168LA 1L72A 1CV0A 1L04A 1L83A 1L85A 1LPYA 1OWZA 215LA 2B6ZA 4LDOA 1OV7A 1L27A 3F8VA 2RAZX 1L19A 1LYHA 1C6HA 1D3FA 4I7OA 3NYAA 1G06A 1L34A 240LA 1QT4A 1C69A 3G3WA 230LA 1EPYA 3DNAA 1C6EA 3D4SA 214LA 1G1WA 1C68A 188LA 1G0MA 200LA 4YXAC 170LA 1LGUA 1SSWA 1L98A 2OE4X 1SSYA 2ANVA 4K5YA 4EPIA 221LA 161LA 1L99A 104LA 250LA 1PQIA 175LA 3SBAA 1P5CA 1LYFA 248LA 201LA 235LA 2B74A 227LA 1NHBA 1C6AA 3C7ZA 1OVHA 4W54A 4ZPUA 2QARC 3GUKA 1C66A 3CDRA 1L71A 1L21A 1L90A 164LA 156LA 109LA 1CU2A 2LZMA 3DN2A 4W55A 4EKSA 1C67A 2OTYX 1CV5A 190LA 2CUUA 3SB5A 4AQNA 1L81A 233LA 3OE6A 1L63A 138LA 1CX7A 1L32A 176LA 3GUIA 2IGCA 3GUNA 1L37A 1P2LA 1C6BA 1L47A 1T97A 3DN1A 1C6LA 2Q9DA 3C8RA 139LA 166LA 1CX6A 2B6WA 4ARLA 1C6CA 2RBRA 3L2XA 2OEAX 174LA 3FI5A 2HUKA 148LE 5I14A 3EMLA 130LA 246LA 1LI2A 1QTDA 1QTZA 160LA 1L93A 4I7QA 1G1VA 181LA 2Q9EA 3HT8A 243LA 3C8SA 3HU8A 3GUMA 1L70A 1L42A 1L89A 4GRVA 1SWZA 2B70A 142LA 1L01A 259LA 3GUOA 3HUAA 1ZYTA 1D2WA 2F32A 4I7MA 4I7JA 120LA 1L87A 169LA 182LA 1C6IA 3RZEA 260LA 1KW5A 4DJHA 199LA 1L59A 3ODUA 3DMZA 1L74A 1L91A 1L18A 1QTCA 1LYEA 3LZMA 1L54A 123LA 2B6TA 3JR6A 1C63A 2NTHA 2B7XA 155LA 1LLHA 195LA 256LA 2B6YA 1PQKA 107LA 147LA 4ARPA 4EXMA 1OVJA 228LA 2A4TA 1CV6A 1L22A 1G07A 1C62A 1CVKA 2B6XA 1L05A 224LA 158LA 167LA 253LA 1C6PA 3DN6A 1CUQA 185LA 1G0JA 1C6FA 1T8GA 159LA 1CU5A 1WTHA 141LA 1L36A 1D2YA 1LGWA 210LA 4GBRB 262LA 1L97A 3HTDA 234LA 1G0GA 1L53A 1QTHA 4W51A 3C83A 197LA 3SB7A 3DN4A 1L84A 1L88A 1L38A 149LA 1L96A 242LA 3DN3A 1C6DA 2OU0X 3CDQA 7LZMA 1I6SA 1C6JA 119LA 1C6MA 3HT6A 4W58A 217LA 4E97A 1L95A 4ARMA 1L00A 238LA 4EJ4A 1L57A 3V2YA 126LA 4EKPA 4W52A 1D3MA 1D3NA 1C61A 3OE0A 1G0PA 1KNIA 4S0WA 3V2WA 2OE7X 173LA 1LWKA 114LA 2RB1X 3GUJA 1L13A 128LA 3HH3A 4PK0A 180LA 244LA 3HTFA 172LA 1L58A 1XJUA 218LA 2QB0B 213LA 2O4WA 3CDOA 249LA 2Z6BA 1OV5A 3SB9A 3RUNA 1OYUA 1QUOA 127LA 1L94A 1L67A 1LYJA 3OE9A 1L14A 1D9WA 103LA 1P37A 2OU9A 220LA 140LA 1JTNA 4YXCA 1PQOA 2LC9A 3SB6A 4I7TA 1PQMA 2RBPA 1L02A 1C6GA 177LA 1P36A 1ZWNA 1L07A 247LA 2HUMA 4I7SA 1L69A 4DAJA 198LA 4I7NA 112LA 2O79A 3HDFA 1L65A 1L49A 110LA 165LA 1QT6A 255LA 1CU3A 1C6NA 1L45A 1L62A 1L46A 1QT7A 3C81A 2OE9X 1L0KA 1CV3A 1L60A 261LA 1JTMA 1C64A 1T6HA 4PJZA 4YX7C 3C7YA 3DKEX 1B6IA 115LA 131LA 1L80A 3DMXA 3HH5A 3VW7A 1DYDA 1L68A 1C6QA 4EKRA 1DYAA 1XJTA 1L15A 4I7KA 1G0QA 189LA 3G3XA 3HWLA 222LA 1L43A 151LA 1LI3A 3DMVA 1L56A 157LA 1L51A 2HULA 4W57A 171LA 1DYGA 196LA 2ANXA 1LYDA 4OO9A 2F2QA 1DYBA 191LA 1OWYA 1QTBA 258LA 3DN0A 152LA 1QS5A 1PQDA 3PDSA 150LA 1C6KA 2NTGA 1L50A 1CV4A 223LA 241LA 3HH4A 3HTBA 102LA 1L44A 1L76A 3HTGA 1K28A 1LWGA 1P2RA 2OTZX 1P3NA 231LA 2B75A 118LA 1P56A 1QT8A 254LA 1L29A 146LA 1L92A 1DYEA 3G3VA 1L30A 251LA 2B73A 1L26A 1G0KA 1C65A 1D3JA 1L48A 2RBQA 1QS9A 1L35A 1P64A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5LYMA 3QY4A 1L55A 4J7VA 1QSQA 1GAZA 2Z12A 1KY0A 3HH6A 1IOCA 3LYTA 1L79A 1LSFA 4DQJA 1JPOA 1NKHA 1QTKA 1C7PA 2MECA 4I0CA 1LZRA 2NWDX 1KIPC 4ETCA 1UUZC 2Z2EA 3QAKA 3FA0A 1B0DA 3W6CA 4OW1A 4H8XA 4N8ZA 1NDGC 5LVHA 1L28A 2Z39A 2H9KA 2RB0X 208LA 3W6EA 4WM2A 3WW6A 5IHGA 1GF8A 3LYMA 4Z46A 4IAPA 1NDMC 1JHLA 1IR8A 2YDGA 3AW7A 3P68A 3TMXA 4WLXA 4BAPA 3SP3A 1LSEA 3HBHA 3J6KA 1DYFA 1IOQA 4H9CA 4DKLA 1VATA 1LJ3A 4HPIA 1SX7A 1L66A 1L64A 1FBIX 4GN3A 3LYZA 2LZ2A 1ZURA 1L86A 1YKXX 1PS5A 1QUDA 1GB2A 1VAUA 1GFTA 5D5FA 1HSXA 3WVXA 1CKGA 145LA 1CTWA 3CDVA 1FN5A 3K2RA 4EKQA 1JTTL 1IWXA 1JISA 3FI7A 1LJHA 113LA 4GLAA 3UONA 4WM5A 3ZVQA 4I7RA 3SB8A 3A8ZA 133LA 1L52A 1P7SA 1PZYA 4WLYA 5HNLA 1L39A 2FYDA 4Z3MA 1UIFA 2IHLA 4TUNA 1LYGA 4B4JA 4ET9A 6LZMA 229LA 1TDYA 1L17A 1D0KA 2ZWBA 2XTHA 4LDLA 1OVKA 4M4OA 1DPXA 1YANA 1L04A 1G7JC 1TCYA 4TSCA 4J0LA 4GCCA 3RW8A 1L27A 5B06A 1C6HA 1JITA 1G06A 1GFEA 1C69A 3WU7A 4WO9A 5K7OA 1EPYA 4IASA 2ZYCA 1HERA 2C8PA 1YKYX 3BKVA 1H6MA 5B07A 3D3DA 4DQ5A 1WQQA 5DL9A 4N1CC 4EPIA 221LA 1NMMA 1YAQA 2CDSA 104LA 4XJBA 4WMGA 5FSTA 1LMOA 4H93A 1C08C 1JKDA 2B74A 1HENA 3GUKA 1C66A 1HEOA 5LVKA 4NG1A 1F10A 3TXJA 3DN2A 1GB9A 4H90A 1LZTA 1CV5A 4NHQA 5KXLA 1VFBC 4MSTA 1LMQA 1B5VA 5LVJA 1CKFA 233LA 4GCFA 3OE6A 1CX7A 1L32A 1AZFA 5KXZA 5B59A 1CJ9A 1EQ4A 3GUIA 4NGKA 1LMPA 1E8LA 1T97A 1WQNA 3C8RA 139LA 166LA 2VB1A 1CX6A 2B6WA 1C6CA 4OOTA 3L2XA 4NSIA 1LZ1A 1LKRA 1YROA 3W3EA 5I14A 2MEEA 1LSYA 130LA 1LZ5A 4N0JA 160LA 4GLVA 1GHLA 1UIAA 3P64A 6LYTA 243LA 3GUMA 4GCBA 1JSFA 142LA 1L01A 3HUAA 1IC4Y 2Z2FA 3B72A 134LA 4I7JA 4ETDA 120LA 2BQHA 3W6BA 169LA 1C6IA 1GB7A 1L59A 1L18A 1LYEA 1GE4A 2NTHA 4H9HA 1LLHA 1LSMA 5I4YA 1PQKA 147LA 4ARPA 4J1BA 1G07A 1AKIA 4WOAA 1BB4A 1OUFA 1GDWA 1L05A 224LA 4A7DA 1QTEA 2LHMA 158LA 3DN6A 1CUQA 185LA 5LAGA 1NBZC 4RLNA 1CKDA 159LA 1D2YA 1LGWA 4GBRB 262LA 3HTDA 3A90A 1G0GA 3ATNA 1YKZX 3AW6A 1HEQA 3ZVQB 3ATOA 1RJCB 1IP4A 3DN4A 2D91A 1L38A 3CDQA 1I6SA 1C6MA 3HT6A 6LYZA 1LCNA 4LYMA 2DQDY 1BVKC 2YBNA 1D3NA 3A6BY 1LHIA 1LZNA 4S0WA 1KNIA 3T36A 114LA 3LZTA 2BQOA 1ZMYL 2CWIA 3HTFA 1BQLY 172LA 1L58A 218LA 1FLYA 4UWNA 1F6RA 2O4WA 5LAFA 4XJHA 1LJIA 4LYOA 1D9WA 1IP5A 4D9ZA 1XEJA 2RBPA 177LA 1ZWNA 1BWIA 2YBJA 1YAMA 2G4PA 3TXHA 4I7NA 1L65A 2DQHY 1QT6A 165LA 2BPUA 3HBDA 5J7CA 2OE9X 1REYA 1L60A 3P66A 261LA 5DLAA 1JTMA 4AXTA 1C64A 193LA 4YX7C 1BB3A 3DKEX 3HH5A 1B7QA 4NHPA 1JKBA 1LSCA 1W6ZA 1C6QA 1DYAA 1XJTA 5LA8A 2DQFC 1YIKA 3A67Y 1IWYA 3HWLA 4H8YA 4HJZA 2HU1A 1OUHA 1L51A 2ZNWY 196LA 1WQRA 1BVXA 1LYDA 4KL7A 1DYBA 191LA 2MEDA 4PJ2C 1OWYA 1RFPA 258LA 3B6LA 4W94A 1IY4A 152LA 3N9EA 3E3DA 4NSGA 150LA 1C6KA 1IC7Y 5LIOA 5IDDA 241LA 1B7MA 1UCOA 3AZ4A 102LA 1LPIA 1OUIA 1MLCE 1P3NA 1UIDA 3W6FA 1P56A 1QT8A 146LA 1LSPA 4NWEA 251LA 1KXWA 1Z55A 1C65A 1FDLY 1L0JA 4EPFA 4PRQA 1L10A 4NGIA 1DYCA 192LA 122LA 2EIZC 1XEPA 1TLAA 1JKCA 2RH1A 1W08A 1QUGA 3FADA 137LA 5C6IA 1EQ5A 1A2YC 206LA 3WU8A 3CDTA 1MELL 1EL1A 3PBLA 3OE8A 4M6DA 1LSBA 5KXKA 4IATA 216LA 3TMUA 1L24A 219LA 1RI8B 1L09A 1CJ7A 1B7OA 4GN4A 1L08A 5I5QA 1L33A 1IWTA 1IO5A 1VEDA 1B5YA 3CSRA 4WLTA 2H9JA 4NGOA 1FLWA 5L3IA 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4ZFPA 123LA 1DI3A 1I20A 1LMNA 2B7XA 195LA 1YAPA 4OOOA 2B6YA 107LA 2GV0A 228LA 2A4TA 4G49A 3A96A 3AZ5A 4RW2A 1BWJA 1C6PA 4N1EI 1GFKA 1G0JA 1C6FA 3TXEA 5A3EA 4TWSA 1L36A 4CGEA 1IWWA 1NF5A 1QSWA 3LHMA 1JTPL 3HBEX 4X3BA 1IP1A 234LA 1GFHA 1L53A 2B5ZA 2ZILA 3BKHA 1WQPA 3C83A 4WM6A 197LA 3SB7A 1L84A 3DN3A 1HF4A 4E97A 2BQGA 1IVMA 1DI4A 238LA 1EQEA 1L57A 1HHLA 1D3MA 4FJRA 1LMAA 1XSFA 1LHKA 1LWKA 2BQMA 3TXKA 4B4EA 1BB5A 244LA 1XJUA 2QB0B 213LA 2Z6BA 2BQNA 1OYUA 2BQAA 4LFXA 1VDSA 3CT1A 1LYJA 1F6SA 1L14A 4II8A 4ZIXA 1KXXA 140LA 1JTNA 4YXCA 4I7TA 9LYZA 4N5RA 4MCKA 198LA 3AGHA 112LA 1JKAA 110LA 2FBBA 1CU3A 1L45A 3IJVA 1L46A 1QT7A 1YILA 1T6HA 1KIQC 2HU3A 4PJZA 3OJPA 4H1PA 3M3UA 4B49A 131LA 4DD0A 1L80A 1IEEA 3VW7A 1LZ4A 1DYDA 2BLXA 4HTKA 4I7KA 3G3XA 1BB6A 1LYSA 3WXTA 3DMVA 3M18B 151LA 1L56A 2HULA 4HSFA 1DYGA 4LZTA 1GB8A 1HEPA 1T6VL 2XQOA 4OWAA 4YENA 3DN0A 1KXYA 1QS5A 4FDYA 1TEWA 1NWGA 1AT5A 1CV4A 223LA 3HTBA 3WL2A 1L44A 3TXDA 1P2RA 1IWUA 2B75A 4I8SA 254LA 2HECA 1L29A 3A91A 3G3VA 4H94A 3ZEKA 1D3JA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5LYM A;  3QY4 A;  1L55 A;  4J7V A;  1QSQ A;  1GAZ A;  2Z12 A;  1KY0 A;  3HH6 A;  1IOC A;  3LYT A;  1L79 A;  1LSF A;  4DQJ A;  1JPO A;  1NKH A;  1QTK A;  1C7P A;  2MEC A;  4I0C A;  1LZR A;  2NWD X;  1KIP C;  4ETC A;  1UUZ C;  2Z2E A;  3QAK A;  3FA0 A;  1B0D A;  3W6C A;  4OW1 A;  4H8X A;  4N8Z A;  1NDG C;  5LVH A;  1L28 A;  2Z39 A;  2H9K A;  2RB0 X;  208L A;  3W6E A;  4WM2 A;  3WW6 A;  5IHG A;  1GF8 A;  3LYM A;  4Z46 A;  4IAP A;  1NDM C;  1JHL A;  1IR8 A;  2YDG A;  3AW7 A;  3P68 A;  3TMX A;  4WLX A;  4BAP A;  3SP3 A;  1LSE A;  3HBH A;  3J6K A;  1DYF A;  1IOQ A;  4H9C A;  4DKL A;  1VAT A;  1LJ3 A;  4HPI A;  1SX7 A;  1L66 A;  1L64 A;  1FBI X;  4GN3 A;  3LYZ A;  2LZ2 A;  1ZUR A;  1L86 A;  1YKX X;  1PS5 A;  1QUD A;  1GB2 A;  1VAU A;  1GFT A;  5D5F A;  1HSX A;  3WVX A;  1CKG A;  145L A;  1CTW A;  3CDV A;  1FN5 A;  3K2R A;  4EKQ A;  1JTT L;  1IWX A;  1JIS A;  3FI7 A;  1LJH A;  113L A;  4GLA A;  3UON A;  4WM5 A;  3ZVQ A;  4I7R A;  3SB8 A;  3A8Z A;  133L A;  1L52 A;  1P7S A;  1PZY A;  4WLY A;  5HNL A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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