255LA

Hydrolase
Total Genus 59
204060801001201401600102030405060
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKNTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
AH1 (3-11)AH5 (93-106)3H1 (159-161)EMPTYS1 (14-19)TI'1 (54-57)TI1 (20-23)AH9 (137-141)S2 (25-28)AH3 (60-80)S3 (31-34)AH2 (39-50)AH7 (115-123)AH8 (126-134)AH10 (143-155)AH4 (83-90)AH6 (108-113)O1 (134-136)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title A relationship between protein stability and protein function.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
total genus 59
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1997-11-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 255lA00
1L85A 4W59A 1L36A 1OWZA 1T8AA 167LA 1L07A 1L95A 1L50A 212LA 192LA 118LA 1C69A 1I6SA 1C6DA 3SB9A 2B70A 172LA 2RBPA 162LA 1DYFA 109LA 1L55A 254LA 1LYFA 1PQKA 248LA 3V2YA 1LI3A 1QTHA 1G1WA 2B7XA 1C6GA 3HTDA 2RB0X 3GUNA 1L54A 1OYUA 1XEPA 1DYDA 1SX2A 1OV5A 253LA 1C6NA 220LA 161LA 2LC9A 1L53A 206LA 1L20A 164LA 122LA 1L29A 1L89A 3HUAA 1XJTA 1SWYA 128LA 3HT7A 188LA 4LDLA 262LA 1D9WA 156LA 1P7SA 3L2XA 251LA 1LI2A 1CV6A 3C81A 1CU5A 1L10A 1QTVA 1P56A 1DYEA 1C62A 4I7TA 3HUQA 112LA 1L21A 119LA 4YXAC 4PJZA 1TLAA 1L19A 1C67A 2RBSA 1L98A 4EPFA 1P37A 2B75A 3C7YA 1L15A 1L45A 3PBLA 4EKRA 4EPIA 4LZMA 1L24A 1L59A 3GUIA 1LYDA 1P36A 1G0JA 3RUNA 1L44A 246LA 3UONA 1LWKA 1PQOA 247LA 1CUPA 209LA 4DKLA 1L87A 1CV3A 1C60A 1OV7A 1LGXA 3V2WA 1P5CA 1T8FA 1QT4A 1L64A 1G1VA 199LA 1L70A 184LA 3CDVA 1QT8A 147LA 1C66A 173LA 142LA 1L47A 3DMXA 141LA 1C6LA 3GUJA 1C61A 1L35A 3D4SA 1D2WA 3SB6A 1G06A 110LA 2O79A 1OVKA 1CTWA 1L62A 1T97A 2CUUA 4YX7C 1DYCA 3DNAA 1P3NA 155LA 3HT8A 4ARMA 1G07A 175LA 3NYAA 2F47A 217LA 3SBAA 120LA 3OE9A 1LYGA 146LA 3HH4A 4W53A 2QARC 2Q9EA 255LA 149LA 103LA 3C7WA 1C6IA 3HU9A 3G3VA 1P64A 2OTYX 131LA 1JTMA 6LZMA 177LA 1CVKA 1QT7A 3DMVA 3SB5A 1LLHA 218LA 4I7LA 3F8VA 4I7JA 2HULA 1QUOA 221LA 1L80A 1C6CA 3C8SA 4W55A 1P2LA 237LA 1C64A 1L14A 2RBQA 4W54A 3EMLA 1G0LA 4OO9A 1QSQA 2NTHA 3C8RA 1C63A 1OWYA 3HTFA 139LA 3FADA 1L69A 3CDTA 1QSBA 4I7MA 1L0JA 1L60A 3GUKA 1PQIA 1LYJA 126LA 1P2RA 1ZYTA 241LA 1EPYA 1L97A 4I7NA 1KY0A 3F9LA 1L38A 4ARQB 1G0KA 236LA 3CDQA 4W58A 148LE 249LA 3HDEA 1D3NA 3OE6A 257LA 1CX7A 1L76A 3DN6A 1L11A 4ARJA 1JQUA 1CU0A 1PQDA 4EKQA 3SB7A 2L78A 178LA 180LA 2O4WA 159LA 259LA 4ARQA 1L18A 1L86A 1KS3A 1C6QA 108LA 2RBRA 2F32A 2OEAX 1C6HA 1L34A 1ZWNA 1QT6A 239LA 1NHBA 1L84A 129LA 114LA 1L09A 3HH5A 145LA 1C6JA 1L43A 1L33A 2B72A 1QT5A 230LA 2Z6BA 3HWLA 2HUMA 1L66A 232LA 1T8GA 2ANXA 1L22A 150LA 1QTBA 3C7ZA 256LA 1L03A 242LA 2ANVA 1DYGA 1L67A 205LA 4GBRB 4IAPA 189LA 3NY8A 1KNIA 1B6IA 1JTNA 3LZMA 102LA 163LA 1QTCA 3L64A 4ARMB 2B74A 1LW9A 1SX7A 2OE7X 1L81A 2HUKA 115LA 3NY9A 1L30A 123LA 4W51A 3SB8A 1QTDA 3FI5A 1L27A 229LA 216LA 1LWGA 3HT6A 165LA 1C6PA 3DN2A 3HH6A 107LA 169LA 3G3XA 1L42A 1T6HA 4GRVA 197LA 1C6FA 1L01A 231LA 3G3WA 213LA 3HUKA 4K5YA 7LZMA 1G0QA 2RH1A 3PDSA 1L52A 250LA 3VW7A 1QTZA 1L74A 222LA 5I14A 4PK0A 1QS5A 2B73A 4S0WA 2NTGA 1LGWA 1L37A 170LA 3DN8A 1LYEA 1SSYA 1L0KA 2RB1X 1G0MA 1C65A 2B6WA 3DN1A 224LA 3GUPA 4EKPA 225LA 244LA 4ARLA 4YXCA 1ZURA 171LA 1L23A 1PQMA 3GUOA 1L56A 211LA 1L88A 4EJ4A 4ARPA 3C82A 2B6YA 1L83A 1L05A 158LA 1L68A 130LA 183LA 1L73A 2F2QA 190LA 3DN4A 1L99A 1CV1A 137LA 4I7OA 1L58A 1L48A 196LA 4LDOA 3DKEX 258LA 3DN3A 4DAJA 2LZMA 1L41A 4I7PA 2A4TA 3OE8A 1L31A 3HTGA 1QUGA 1D3MA 4I7KA 1L17A 2Q9DA 1CV0A 1LGUA 198LA 1CX6A 4ZPUA 3OE0A 104LA 3ODUA 3DMZA 174LA 125LA 1CV5A 160LA 1L57A 138LA 238LA 5LZMA 227LA 1OVHA 2OTZX 1LYIA 2OU8A 1C6MA 1WTHA 157LA 1DYBA 1L04A 185LA 1KW5A 181LA 1XJUA 1L46A 1P6YA 4E97A 1L79A 1L49A 1G0GA 3C8QA 4I7RA 1L61A 3QAKA 1QT3A 152LA 1L28A 3C83A 1LYHA 261LA 2OE9X 3SN6R 1L92A 200LA 1C6AA 1K28A 240LA 245LA 4I7QA 1L77A 1SSWA 1L82A 1CUQA 3CDRA 3RZEA 4DJHA 144LA 1CV4A 219LA 2OE4X 2QB0B 1L08A 1L93A 1L96A 2OU9A 140LA 2RB2X 2B6TA 1D3JA 1L06A 3DN0A 233LA 3HH3A 3HT9A 4W57A 2OU0X 4W56A 1L94A 2B6ZA 1L13A 1QUDA 226LA 234LA 2IGCA 143LA 3HU8A 1L00A 3GUMA 3K2RA 235LA 2RBOA 1L75A 1C6KA 215LA 2B6XA 214LA 2LCBA 1D2YA 1LPYA 186LA 1SWZA 3HTBA 3CDOA 4EKSA 1DYAA 210LA 223LA 1L63A 1L26A 2RBNA 176LA 1CU6A 1L40A 1L25A 182LA 1L12A 2O7AA 4EXMA 1G0PA 3GULA 166LA 3FA0A 151LA 1L51A 228LA 1OVJA 4LDEA 1C6EA 3SBBC 1L65A 1LI6A 1PQJA 1C6TA 191LA 168LA 1L90A 3JR6A 1CU3A 260LA 1CU2A 195LA 4I7SA 113LA 1C68A 2RAYX 1P46A 3HDFA 3C80A 1QS9A 2RAZX 111LA 1L72A 1C6BA 1L71A 243LA 1L91A 127LA 187LA 1L39A 201LA 4AQNA 1QUHA 252LA 4W52A 1KY1A 1L16A 1D3FA 1L02A 1KW7A 1L32A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L85A 1I56A 4DDBA 1L36A 1OWZA 1XSFA 1L07A 4G4CA 192LA 1C69A 3SB9A 172LA 2RBPA 162LA 5B06A 1DYFA 109LA 1GE2A 254LA 1WQOA 1QTHA 2RB0X 3GUNA 1OYUA 1XGQC 3A92A 1XEPA 1DYDA 5LVIA 4DC4A 2FBBA 1JTTL 220LA 1RI8B 4NGLA 122LA 4L41A 3OJPA 1GXV2 4DQ5A 5HNLA 4H9HA 2W1LA 4GCFA 4I0CA 1OUAA 3CSRA 3CSZA 2Z19A 5KXWA 4PPOA 5HMVA 1HF4A 1CV6A 1LJ4A 3W6DA 1GB9A 1FKVA 1LSCA 1L21A 3A95A 1LZGA 4EPIA 1L45A 4EKRA 3GUIA 1IWUA 1G0JA 4WM2A 4OWBA 4H8ZA 1L44A 246LA 247LA 209LA 4DKLA 1CV3A 1C60A 1LZYA 2BQGA 3HBHA 1QT4A 1DPWA 4DQ7A 1RFPA 3ATOA 1JPOA 1LHHA 1INUA 1EL1A 1IR8A 3CB7A 4HP0A 1LSGA 4TTDA 142LA 1HSXA 2DBTA 3AB6A 1IY3A 7LYZA 3T36A 3GUJA 1I1ZA 1CTWA 1DYCA 5M1YA 1EQ4A 3W6CA 3NYAA 1D6PA 5F16A 2NWDX 1OUBA 1GE4A 1OUEA 2Q9EA 255LA 4NG8A 1VAUA 3G3VA 1P64A 1C08C 1HSWA 4RLMA 3G3BB 1JTMA 1CVKA 1QT7A 1LLHA 218LA 4LYCA 3GXKA 1QUOA 221LA 1L80A 4DD0A 1FN5A 3AGHA 1IC7Y 4AGAA 1IWTA 1MELL 4B4JA 1OUIA 1C63A 1NDGC 1OWYA 3HTFA 5EBHA 4LGKA 3CDTA 3GUKA 1L60A 1PQIA 1LYJA 1RCMA 1L97A 1V7TA 1G0KA 1D3NA 4R6CA 3T6UA 2MEIA 1IX0A 1CX7A 1GBWA 1OUDA 1JQUA 5KXOA 1PQDA 1BQLY 4H90A 3D9AC 259LA 5J7CA 2LYZA 1L18A 3W6BA 1KS3A 108LA 4N1CC 1WQQA 1LYOA 239LA 5KXLA 1VEDA 129LA 1FDLY 1DI5A 145LA 4J0LA 1L43A 1UIBA 2Z12A 4WO9A 2BQJA 1YKXX 2Z6BA 4XJBA 4Z46A 3HWLA 5DN5A 5A3EA 1IP7A 1C7PA 1QTBA 2EPEA 4QY9A 1REMA 205LA 189LA 1CKFA 3NY8A 4PGJB 1QTCA 4ARMB 2B74A 4H8XA 2OE7X 1EQEA 1XEKA 1J1XY 4W51A 1QTDA 5K7OA 1QSAA 4WO6A 1HEWA 1OQMA 229LA 4CFOA 2DQGY 3HT6A 1QTEA 1F6SA 3G3XA 4RLNA 3TXFA 197LA 4K5YA 1IVMA 1LJNA 2ZIJA 1L52A 1IWWA 2IFFY 3VW7A 1QTZA 4XJHA 4QEQA 4NSIA 2DQAA 3WPJA 1C46A 3DN8A 2G4NA 1HENA 207LA 1LMOA 1F0WA 2B6WA 1YIKA 4ARLA 171LA 3B72A 2MEEA 183LA 3TXGA 1LZEA 1DI4A 137LA 196LA 3DKEX 1JSEA 4H1PA 2LZMA 2XJWA 4GCEA 1L31A 1LHIA 2BQFA 4N5RA 3HTGA 4DDCA 1XGTC 1D0MA 4BAFA 2F4AA 1LMNA 4DD9A 174LA 1LMAA 3MGWA 1YILA 2FYCA 4NG1A 1LZNA 1OVHA 2DQFC 2GV0A 1IIZA 3RZ4A 4WM5A 3A93A 181LA 2DQEY 4M4OA 5ILFA 3WW5A 5LA5A 1NWGA 1HFXA 1LZ4A 3C8QA 1QT3A 1A4VA 1L28A 1LYHA 2Z18A 261LA 1HELA 200LA 1LHMA 5KXPA 3LYTA 1LHKA 3A3RX 4DJHA 219LA 2OE4X 1GDWA 1LSMA 1L96A 1BWHA 2DQIY 4NFVA 2RB2X 3TXEA 3WUAA 233LA 3HT9A 1LHLA 1IOSA 4ML7A 143LA 1CJ7A 5I53A 1L00A 1DXJA 1XFPL 3WXTA 1JIYA 4OW1A 1SWZA 5KXNA 3CDOA 1W08A 1L26A 4KXIA 2RBNA 176LA 1HFYA 1WQNA 5KXXA 1LJJA 166LA 4WLYA 151LA 1B5WA 4LDEA 1IORA 3J6KA 1UIDA 1PQJA 2CDSA 1C6TA 168LA 1B2KA 1CU3A 3LYMA 4NGYA 3AZ6A 2HEAA 2RAYX 2BQBA 111LA 4XJIA 1L72A 243LA 2Z38A 1L39A 187LA 1B5VA 1YL0X 1QUHA 1GF7A 252LA 5FCPA 3EMSA 5LVKA 1L16A 4LYZA 1CKGA 2YBHA 2BLXA 4ETBA 3LHMA 1B7MA 1L95A 4CHXA 1GE3A 1TAYA 118LA 5D5CA 1C6DA 2B70A 3CT5A 2ZYCA 1UBZA 3A6CY 1G7JC 1C6GA 1IR7A 1JUGA 1SX2A 5D5FA 1C6NA 4WLDA 206LA 164LA 4UWUA 4WOAA 3HUAA 1LZRA 1XJTA 128LA 1QUTA 3WU7A 3C81A 1CU5A 4NSHA 1IOTA 1SLYA 112LA 3EXDA 1TLAA 1L19A 1CKDA 1QIOA 1P37A 1LYDA 1P36A 3UONA 1PQOA 1CUPA 1IC5Y 5LYTA 2X0AA 3AZ4A 1BB7A 2HU3A 4XENA 4DYGA 1T8FA 4BAPA 2W1XA 1VDSA 2W1MA 147LA 4NSGA 3CQLA 3AYQA 1L47A 1C61A 1D2WA 4WG1A 2O79A 1LSPA 155LA 5FELA 3WU9A 1DI3A 175LA 3G3AB 4GCCA 1UIFA 2F47A 3TMUA 1KIPC 120LA 3WPKA 1DZBX 1GB3A 2ZQ3A 3OE9A 3LYOA 2QARC 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1L85 A;  1I56 A;  4DDB A;  1L36 A;  1OWZ A;  1XSF A;  1L07 A;  4G4C A;  192L A;  1C69 A;  3SB9 A;  172L A;  2RBP A;  162L A;  5B06 A;  1DYF A;  109L A;  1GE2 A;  254L A;  1WQO A;  1QTH A;  2RB0 X;  3GUN A;  1OYU A;  1XGQ C;  3A92 A;  1XEP A;  1DYD A;  5LVI A;  4DC4 A;  2FBB A;  1JTT L;  220L A;  1RI8 B;  4NGL A;  122L A;  4L41 A;  3OJP A;  1GXV 2;  4DQ5 A;  5HNL A;  4H9H A;  2W1L A;  4GCF A;  4I0C A;  1OUA A;  3CSR A;  3CSZ A;  2Z19 A;  5KXW A;  4PPO A;  5HMV A;  1HF4 A;  1CV6 A;  1LJ4 A;  3W6D A;  1GB9 A;  1FKV A;  1LSC A;  1L21 A;  3A95 A;  1LZG A;  4EPI A;  1L45 A;  4EKR A;  3GUI A;  1IWU A;  1G0J A;  4WM2 A;  4OWB A;  4H8Z A;  1L44 A;  246L A;  247L A;  209L A;  4DKL A;  1CV3 A;  1C60 A;  1LZY A;  2BQG A;  3HBH A;  1QT4 A;  1DPW A;  4DQ7 A;  1RFP A;  3ATO A;  1JPO A;  1LHH A;  1INU A;  1EL1 A;  1IR8 A;  3CB7 A;  4HP0 A;  1LSG A;  4TTD A;  142L A;  1HSX A;  2DBT A;  3AB6 A;  1IY3 A;  7LYZ A;  3T36 A;  3GUJ A;  1I1Z A;  1CTW A;  1DYC A;  5M1Y A;  1EQ4 A;  3W6C A;  3NYA A;  1D6P A;  5F16 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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