255LA

Hydrolase
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKNTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title A relationship between protein stability and protein function.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
total genus 59
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1997-11-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 255lA00
126LA 246LA 1L49A 2OU9A 2ANVA 1L54A 138LA 1L60A 244LA 4ARLA 4YX7C 1L16A 3GUIA 262LA 2LCBA 151LA 1L17A 1G0QA 1P2RA 159LA 4W56A 2B6ZA 1L21A 3SBBC 249LA 2RAZX 173LA 1L22A 2B6YA 3DN6A 3NY8A 183LA 241LA 130LA 252LA 1ZURA 170LA 240LA 2RBQA 1L41A 206LA 3HTGA 1L34A 2LC9A 2A4TA 3DN8A 148LE 205LA 3NYAA 1L72A 3RUNA 1L39A 2RBPA 1JTMA 1JQUA 2NTHA 1L68A 2OTZX 1P36A 4IAPA 1CUPA 1OYUA 1P37A 3D4SA 228LA 1L77A 2QARC 1QUOA 1QT7A 180LA 1L76A 2L78A 3QAKA 143LA 3HU8A 187LA 3CDOA 111LA 167LA 1QSBA 1L19A 1CX6A 1G0PA 211LA 2HUKA 3FI5A 4EPIA 1L08A 1K28A 3OE9A 2B72A 1L73A 1DYCA 232LA 3F8VA 2QB0B 1L61A 174LA 4I7NA 1CV1A 1G1WA 1I6SA 1L30A 1OVJA 1L90A 1LYFA 3C8RA 1CU0A 1P2LA 1PQIA 4AQNA 1LW9A 1L15A 1L03A 4I7SA 182LA 107LA 3HH5A 4PK0A 3HTDA 3HT9A 1CV0A 1L96A 1L81A 7LZMA 2B7XA 144LA 4I7PA 1QT6A 1L46A 118LA 1CU5A 243LA 3HT8A 1C6PA 4ARMB 198LA 218LA 1QT8A 199LA 1L45A 1QT3A 233LA 1OV7A 115LA 1L09A 1L86A 2RBNA 1KNIA 110LA 1C6JA 1L92A 3HH3A 3HTBA 3HT6A 1LI3A 145LA 3K2RA 3C7WA 3DN1A 1QTBA 1L82A 3HDFA 4I7KA 1D3NA 1L63A 226LA 1PQDA 1L91A 1C6MA 120LA 221LA 3V2YA 1QTDA 261LA 1DYFA 3OE8A 3C7YA 3GUOA 231LA 146LA 1C6HA 4LDEA 113LA 227LA 1DYGA 1L88A 1JTNA 1T6HA 3JR6A 1C60A 3OE6A 3C82A 3C81A 1L06A 236LA 4W58A 1PQKA 1L69A 257LA 1QTZA 2OEAX 4DAJA 3C83A 3FA0A 4I7MA 156LA 1G0KA 1EPYA 3UONA 254LA 4GRVA 112LA 1C61A 3SB6A 1LYHA 1C63A 3HT7A 245LA 1QTHA 4ARQB 1LYIA 1G07A 1L97A 209LA 166LA 4EKRA 1B6IA 3FADA 1CV3A 250LA 247LA 3GUMA 201LA 3DN4A 248LA 1QS5A 259LA 3HUAA 137LA 1C64A 235LA 4ARPA 108LA 1L13A 1C6KA 1SX7A 4W52A 1L64A 168LA 1D2YA 1LYDA 230LA 1CTWA 3SBAA 1CU6A 162LA 1G0LA 1CU2A 2Q9DA 3GUNA 3DN2A 1L44A 1CV6A 1C6NA 1CUQA 1L00A 1G0MA 1PQMA 1L48A 2F32A 4YXCA 190LA 172LA 222LA 4W59A 1KW7A 4OO9A 3DMZA 1C6TA 3CDQA 3SB9A 4I7QA 1D3JA 185LA 192LA 157LA 128LA 1T8AA 1SSWA 4E97A 1LGWA 181LA 2RAYX 4YXAC 1P3NA 2OU0X 2CUUA 1C6AA 1L38A 1L75A 1L80A 1L57A 3PBLA 1QTCA 169LA 123LA 1C66A 3HU9A 4DKLA 3PDSA 1C62A 1LGXA 1SWYA 2B6TA 237LA 1L20A 1L11A 3SN6R 3NY9A 238LA 1L51A 3SB7A 1QUGA 4DJHA 3SB5A 2B73A 155LA 1L56A 4LDLA 1D3FA 129LA 1XEPA 3HUKA 3HWLA 1L07A 4W57A 197LA 2HULA 1NHBA 1SX2A 4I7TA 1DYAA 2ANXA 189LA 2F2QA 131LA 213LA 1CX7A 1L10A 3G3XA 1LYGA 1L74A 1PQOA 149LA 186LA 2RBOA 1L25A 3DKEX 4GBRB 4PJZA 1L66A 3ODUA 2OU8A 1L02A 3GULA 1L37A 1L93A 188LA 2Z6BA 4I7JA 165LA 1LYJA 1QSQA 1L52A 3GUJA 1OWYA 1L35A 191LA 1KY0A 3GUKA 127LA 2RH1A 1P56A 1L95A 2RB2X 1C6FA 4I7RA 229LA 4K5YA 1PQJA 3HUQA 4EXMA 1C6BA 3DMXA 1C6QA 1D3MA 1L62A 4ARJA 3C80A 4W51A 1L58A 1CV5A 1LWKA 1L26A 1P5CA 5I14A 225LA 2B75A 171LA 258LA 1P46A 1LI2A 1L33A 175LA 1QUHA 3DMVA 3HTFA 1KS3A 1P7SA 2RB0X 1C67A 3C8SA 224LA 1L04A 1C65A 1SSYA 158LA 210LA 1OVHA 239LA 1XJTA 1C6IA 4LDOA 1G1VA 1L65A 2B6XA 152LA 234LA 1C68A 1L12A 2O4WA 1LGUA 1G0GA 223LA 1L27A 4EKSA 160LA 3G3WA 1QUDA 177LA 242LA 1WTHA 140LA 1OWZA 6LZMA 1L94A 1L70A 1C6LA 1ZYTA 1T97A 1ZWNA 1OV5A 1D9WA 1KW5A 195LA 2OE7X 256LA 2B6WA 1C6CA 4EKPA 2O79A 1P6YA 217LA 4ARQA 1L85A 4W55A 4I7OA 2HUMA 3LZMA 147LA 4I7LA 1G06A 2RBSA 1L24A 1L18A 3CDTA 3HH4A 2B70A 1QTVA 1T8FA 4EKQA 102LA 1L89A 3F9LA 1L98A 196LA 1DYBA 142LA 3VW7A 3EMLA 3GUPA 2IGCA 1LI6A 260LA 1L50A 2RBRA 1L84A 2RB1X 3HDEA 1C6EA 4LZMA 1C6DA 4S0WA 3L2XA 1OVKA 3SB8A 3DN3A 1L14A 1C69A 1QT4A 1TLAA 1L71A 184LA 1KY1A 2O7AA 1L83A 3CDRA 214LA 1L47A 141LA 103LA 1L31A 1DYEA 3OE0A 164LA 1QT5A 2B74A 1LWGA 2Q9EA 1L0JA 4EPFA 251LA 4W53A 253LA 104LA 1D2WA 3DNAA 1SWZA 109LA 3CDVA 3L64A 1LYEA 176LA 150LA 2OE9X 1LPYA 219LA 3C7ZA 1L53A 1L23A 5LZMA 215LA 122LA 1L87A 3RZEA 1L59A 216LA 1L32A 2LZMA 3C8QA 125LA 1L42A 1XJUA 1L29A 1LLHA 1CVKA 1T8GA 4ZPUA 1L0KA 178LA 1L67A 1QS9A 1L28A 212LA 1CU3A 1L55A 114LA 1L43A 1L79A 1P64A 139LA 1C6GA 1L05A 4EJ4A 4ARMA 2OTYX 163LA 1L40A 1L36A 200LA 220LA 119LA 3V2WA 1DYDA 255LA 3HH6A 1CV4A 3DN0A 1G0JA 2F47A 1L99A 3G3VA 2OE4X 4W54A 161LA 1L01A 2NTGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
126LA 246LA 3N9EA 244LA 2IHLA 4ARLA 4YX7C 3GUIA 2YVBA 1G0QA 2BQKA 2G4PA 4KL7A 2W1MA 4IJ4A 2B6YA 3DN6A 241LA 130LA 4H9HA 1GXV2 170LA 1XGRC 3HTGA 5DM9A 2A4TA 1UBZA 5FHWA 3DN8A 4ET8A 1IWWA 4WLDA 1HEWA 4DD9A 4RLNA 4GCBA 1L68A 2OTZX 1P36A 3TMWA 2BLYA 4NSJA 228LA 1BB7A 4U3XB 2QARC 5T3FA 1GB8A 1GE3A 3WUAA 3TXFA 1LYOA 167LA 1CX6A 1G0PA 1LZRA 4NSHA 3FI5A 1K28A 3OE9A 1EQEA 2B72A 2Z38A 1L73A 3T6UA 1IOSA 1DYCA 4I7NA 4AGAA 174LA 1C45A 4YENA 5LAFA 1G1WA 1H6MA 5KKJA 2DQJY 3C8RA 3N9AA 1L03A 3WU8A 1HERA 1HNLA 4PK0A 1BB4A 4LFXA 1GAYA 5L3HA 2BQOA 4I7PA 1QT6A 1L46A 3HT8A 1C6PA 1C7PA 1RJCB 2G4NA 3A6CY 1ZMYL 198LA 218LA 4OWCA 199LA 2HEEA 1IP4A 1C08C 1DI3A 3AZ5A 2YBHA 1HC0A 3ZVQB 115LA 1NWGA 1HMKA 4DYGA 4OWBA 1B5VA 1KNIA 1C6JA 1WTNA 145LA 2F2NA 4HP0A 1F10A 1QTBA 3HDFA 1L63A 2IFFY 3WULA 261LA 3M18B 4LYBA 1N4FA 3C7YA 1XGUC 1NMMA 231LA 4TX7A 1GE1A 1DXJA 4LDEA 1OUIA 1DYGA 3TXHA 1JTNA 4P2EA 5B07A 3C81A 4IASA 1L06A 1YQVY 3EMSA 1PQKA 257LA 2YDGA 156LA 1RI8B 3P66A 1EPYA 1JJ1A 112LA 1C61A 4BADA 1GB9A 1C63A 3HT7A 5LYZA 1L97A 166LA 2AUBA 1GF4A 1GF3A 1YAQA 5KJ9A 3GUMA 2GV0A 4CHXA 1JKBA 5A3EA 137LA 1LZ1A 3MGWA 3HFMY 4OOOA 1C6KA 1D2YA 2HU1A 3AB6A 3WU9A 4TTDA 5A3ZA 4XJFA 1G0LA 1I1ZA 2HEBA 194LA 1GF7A 1QQYA 1KIQC 1L00A 3EXDA 1IWYA 4LZTA 4LYCA 5LVKA 222LA 4W59A 1KW7A 4OO9A 5J7CA 3DMZA 4GLAA 4QDNA 1D3JA 2DQDY 1HENA 192LA 1HSXA 1PS5A 2C8OA 128LA 1T8AA 1SSWA 4E97A 2B5ZA 1LSEA 1L75A 169LA 123LA 1UUZC 1ZVYB 2N5ZA 1WQPA 3CQLA 1LGXA 4WO6A 1GB2A 1FKVA 1SWYA 1VDSA 238LA 1L51A 3A6BY 1GWDA 1FLQA 3W3EA 1L56A 1B2KA 1LJHA 1BWIA 4X3BA 4PPOA 2ANXA 4HTQA 131LA 3G3XA 1CX7A 5EBHA 5KXSA 4G49A 3B72A 2RBOA 3HBHA 3GULA 5JENB 188LA 2DQCY 2YBIA 3TXEA 1QSQA 1L52A 4RW2A 1L35A 5DL9A 1L95A 1D9UA 2A7DA 4I7RA 229LA 2BQGA 1YL0X 4TUNA 5K7OA 3LYZA 3CT1A 4NGZA 1C6BA 3DMXA 1LSZA 3B0IA 1GFAA 1JISA 1LSAA 1YROA 3W6CA 5B1GA 4ANRA 1GB0A 1LWKA 1NDGC 1DKJA 3A93A 1AZFA 3DMVA 1KS3A 4J1AA 1C67A 4G4BA 3AGHA 1IEEA 1L04A 5DLAA 158LA 4NEBA 1OVHA 1LKRA 239LA 1G1VA 3AZ6A 4QGZA 1ALCA 3A91A 3RU5A 1GD6A 2BLXA 1JKAA 4O34A 1QUDA 3N9CA 6LZMA 1LSCA 1L94A 5ILCA 4WM3A 4OOTA 1ZYTA 3W6FA 1KW5A 2OE7X 5FEKA 4EKPA 4ARQA 1L85A 4I7OA 5C6LA 4DD2A 147LA 3AJNA 3K3TA 1L24A 2H5ZA 5B1FA 2B70A 1OUAA 4EKQA 1NBZC 142LA 4H9EA 3VW7A 1LJNA 2IGCA 5KY1A 1LZCA 2BPUA 1C6EA 1C6DA 3L2XA 2XBSA 1C69A 1QT4A 2BQEA 4ETBA 1KXXA 103LA 1L31A 4H9FA 1L0JA 2YBJA 4N9RA 5KXRA 1LSYA 109LA 3L64A 4N8ZA 4Z41A 9LYZA 3LZ2A 219LA 215LA 1JKDA 1L59A 1T6VL 1L42A 3FE0A 3QE8A 1T8GA 2A7FA 5E9RA 5KXWA 1L55A 1IORA 1P64A 2WARA 4G4HA 1VFBC 2DQGY 1GB3A 220LA 2H9KA 4HV2A 2XJWA 1VAUA 3CSQA 1C43A 1HF4A 5KXXA 1L99A 2OE4X 2D4KA 3QY4A 4W54A 1LYZA 5KXLA 1UICA 1L54A 138LA 1T3PA 4H9CA 1WVUA 159LA 4GCDA 3SBBC 1IP3A 173LA 3WUNA 1QDTA 2MEHA 1TAYA 1DI4A 5HMVA 1IOTA 1LCNA 1L34A 2DKVA 1UIDA 1L39A 2RBPA 1G7HC 2NTHA 3WU7A 4IAPA 3M3UA 1CUPA 2Z37A 1NQIA 2DBTA 4TSBA 1F6SA 1L76A 3ATNA 2L78A 143LA 187LA 4OWHA 4B4IA 1QUTA 3CDOA 1WTMA 1L19A 4H9AA 2HUKA 4EPIA 1L08A 1LKSA 1TCYA 4DD1A 1L61A 4DDCA 1LOZA 3W6BA 4HJYA 5APEA 1OVJA 1LYFA 1P2LA 1REZA 1GFTA 1LW9A 107LA 1GE4A 1GEVA 2XBRA 1BWJA 1L81A 7LZMA 1GBSA 3J4GA 2MECA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 126L A;  246L A;  3N9E A;  244L A;  2IHL A;  4ARL A;  4YX7 C;  3GUI A;  2YVB A;  1G0Q A;  2BQK A;  2G4P A;  4KL7 A;  2W1M A;  4IJ4 A;  2B6Y A;  3DN6 A;  241L A;  130L A;  4H9H A;  1GXV 2;  170L A;  1XGR C;  3HTG A;  5DM9 A;  2A4T A;  1UBZ A;  5FHW A;  3DN8 A;  4ET8 A;  1IWW A;  4WLD A;  1HEW A;  4DD9 A;  4RLN A;  4GCB A;  1L68 A;  2OTZ X;  1P36 A;  3TMW A;  2BLY A;  4NSJ A;  228L A;  1BB7 A;  4U3X B;  2QAR C;  5T3F A;  1GB8 A;  1GE3 A;  3WUA A;  3TXF A;  1LYO A;  167L A;  1CX6 A;  1G0P A;  1LZR A;  4NSH A;  3FI5 A;  1K28 A;  3OE9 A;  1EQE A;  2B72 A;  2Z38 A;  1L73 A;  3T6U A;  1IOS A;  1DYC A;  4I7N A;  4AGA A;  174L A;  1C45 A;  4YEN A;  5LAF A;  1G1W A;  1H6M A;  5KKJ A;  2DQJ Y;  3C8R A;  3N9A A;  1L03 A;  3WU8 A;  1HER A;  1HNL A;  4PK0 A;  1BB4 A;  4LFX A;  1GAY A;  5L3H A;  2BQO A;  4I7P A;  1QT6 A;  1L46 A;  3HT8 A;  1C6P A;  1C7P A;  1RJC B;  2G4N A;  3A6C Y;  1ZMY L;  198L A;  218L A;  4OWC A;  199L A;  2HEE A;  1IP4 A;  1C08 C;  1DI3 A;  3AZ5 A;  2YBH A;  1HC0 A;  3ZVQ B;  115L A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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