257LA

An adaptable metal-binding site engineered into t4 lysozyme
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDHEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQHPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Use of a non-rigid region in T4 lysozyme to design an adaptable metal-binding site.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
molecule keywords PROTEIN (LYSOZYME)
total genus 59
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-01-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 257lA00
4EKPA 3C81A 196LA 1L72A 1QT4A 1QT5A 256LA 1L96A 3HTFA 1L71A 1QUHA 1CV0A 2NTGA 248LA 1DYEA 3HDFA 2RAZX 1DYAA 3GUMA 2B6WA 3RUNA 1LPYA 3DN6A 2B6ZA 1L04A 255LA 199LA 151LA 1G1WA 178LA 2RBSA 1C66A 125LA 103LA 3CDVA 3L64A 1CU5A 150LA 173LA 219LA 4W55A 213LA 1C6MA 1CV5A 4OO9A 1D2WA 1L10A 1KW7A 187LA 4LDOA 123LA 1L79A 2RB1X 201LA 3PBLA 233LA 172LA 2OE7X 1CV1A 127LA 157LA 1L84A 1WTHA 1QS9A 2B6XA 4I7OA 1QTVA 4W52A 1C6GA 1P6YA 3D4SA 4EKRA 112LA 1T8FA 2OEAX 3JR6A 2O4WA 1CUQA 1L69A 1LWGA 1L17A 1LW9A 1L65A 119LA 2B73A 1L91A 2OE9X 142LA 1L89A 109LA 163LA 3OE8A 1G0LA 1L37A 1OV5A 3HT6A 252LA 1C6HA 1SX7A 1C6TA 3C82A 218LA 4AQNA 1L64A 1LYGA 3CDQA 1P2RA 4I7LA 1L41A 3G3VA 1L59A 1T6HA 1L25A 231LA 3DN4A 1L53A 1L86A 4E97A 2IGCA 1SWYA 138LA 3GUNA 1L33A 1L15A 3C7ZA 3DN3A 3DN0A 1QSQA 1L27A 2ANXA 155LA 1P37A 1DYCA 2O79A 249LA 4YXCA 3C80A 1JQUA 2RBRA 4ZPUA 2F47A 184LA 3OE9A 3L2XA 3C8QA 230LA 1T8GA 1L19A 4PJZA 1D3FA 1QTCA 3SB7A 2Q9EA 108LA 166LA 1C63A 1SSYA 3HH3A 2B72A 4I7MA 2B70A 1D3NA 3HT9A 3CDTA 1SX2A 161LA 2CUUA 1CU0A 1D2YA 1C6DA 2B6YA 162LA 4GRVA 1L44A 1PQDA 3HTDA 3OE0A 185LA 1D3JA 3NY8A 1G07A 6LZMA 245LA 1L94A 1CU6A 1L46A 1G0KA 3CDOA 251LA 3HWLA 168LA 4W58A 4I7NA 3QAKA 4DAJA 3HUAA 1CU3A 257LA 110LA 120LA 1NHBA 4ARMB 1LWKA 3GUPA 1CV4A 2Z6BA 145LA 1L75A 2L78A 195LA 1G0MA 118LA 1L93A 259LA 1L47A 1L77A 3GUIA 5I14A 1G0QA 209LA 1QTBA 2ANVA 1C65A 3NYAA 1D9WA 1C6FA 1C6NA 181LA 3UONA 1P2LA 215LA 1ZWNA 1ZYTA 1P3NA 1L49A 1L16A 3C7WA 226LA 1L80A 1DYGA 4ARPA 3HTGA 210LA 197LA 1L76A 1C6BA 1SWZA 3HTBA 242LA 3HUQA 129LA 1LI6A 1CUPA 1OVKA 1KY0A 1TLAA 190LA 126LA 130LA 1QS5A 1T8AA 3GUOA 113LA 1DYBA 3FA0A 156LA 1L50A 1CX6A 1L02A 234LA 1L85A 1OWZA 241LA 4W51A 3K2RA 2B7XA 3PDSA 4K5YA 3SBBC 192LA 1L24A 3HH4A 258LA 4EPFA 3DN1A 3OE6A 1L92A 1L0JA 1PQKA 1P36A 254LA 131LA 1L23A 1LGWA 1L20A 3DMVA 141LA 4I7TA 188LA 217LA 4ARLA 2OTZX 104LA 4PK0A 232LA 1L07A 1C60A 1LGXA 3DN2A 4DJHA 1G1VA 2RBOA 1QUGA 1B6IA 3RZEA 2RAYX 3HT7A 2F2QA 4W59A 1L88A 4I7QA 3SB6A 4LDEA 1L42A 128LA 1L12A 2OU9A 159LA 1LGUA 1L63A 1L48A 1L61A 1PQIA 160LA 1C6PA 1C6IA 139LA 243LA 1OWYA 167LA 229LA 1D3MA 1C69A 1C67A 260LA 1SSWA 158LA 191LA 152LA 3HT8A 183LA 1C61A 1L43A 1C64A 1QTZA 1DYDA 4ARJA 1QT3A 237LA 1L58A 1OYUA 4S0WA 4EXMA 3DNAA 235LA 1L0KA 4IAPA 1L74A 3C8RA 1L35A 1QTDA 1L90A 1QT7A 1CU2A 3HH6A 3FADA 227LA 102LA 1L22A 1L73A 1LYFA 3GUKA 5LZMA 236LA 4YX7C 3HDEA 1KW5A 3SB9A 1L29A 1C6AA 1XJUA 1G0PA 4ARQA 4EKQA 111LA 2RBNA 3V2WA 1OVJA 1L98A 1QSBA 3DMZA 1L21A 2RH1A 214LA 247LA 148LE 253LA 2LCBA 3C83A 2RB2X 2OU8A 224LA 1LI2A 1P56A 2B75A 4I7JA 1L52A 2RB0X 250LA 1L55A 3HU8A 240LA 175LA 1L01A 1L08A 4YXAC 3C7YA 1C6KA 1C62A 1LLHA 200LA 1T97A 1QT6A 1CX7A 2OTYX 2RBPA 1L40A 1JTMA 2OU0X 2F32A 144LA 122LA 1OV7A 1JTNA 1XJTA 1L45A 4W54A 1KNIA 1P46A 4W57A 2HULA 3LZMA 1P5CA 1CV3A 1L83A 182LA 3NY9A 3ODUA 1L36A 2LC9A 1L09A 1QTHA 1LI3A 1L03A 3SB5A 3VW7A 3HH5A 1L34A 206LA 3G3WA 3SN6R 1L81A 1C6EA 2B6TA 176LA 4DKLA 2QARC 1L99A 216LA 1L57A 3GULA 2HUKA 4EKSA 212LA 3DN8A 1QUOA 2O7AA 2B74A 1CV6A 3SB8A 1L00A 2HUMA 1L60A 1L82A 189LA 1EPYA 1L95A 1L18A 1L32A 4I7PA 4LZMA 4LDLA 1LYHA 1L38A 3C8SA 1L28A 4ARQB 1L54A 1L66A 114LA 1L31A 174LA 1CTWA 211LA 2A4TA 1G0GA 1L05A 2RBQA 4EPIA 170LA 4I7KA 220LA 1L67A 221LA 1L26A 1P7SA 1C68A 4I7RA 4EJ4A 146LA 1L56A 4ARMA 3DKEX 1C6QA 140LA 137LA 4W56A 3F8VA 222LA 1L62A 1CVKA 3DMXA 1L87A 171LA 205LA 238LA 2OE4X 1L51A 1LYEA 1QUDA 1G06A 1XEPA 2Q9DA 1L39A 1LYDA 1C6CA 228LA 1KY1A 1PQMA 177LA 1KS3A 1L13A 1P64A 1QT8A 3G3XA 4I7SA 186LA 239LA 169LA 3CDRA 2LZMA 1L14A 246LA 3SBAA 1L06A 244LA 2QB0B 165LA 1LYJA 3EMLA 1PQJA 143LA 223LA 3GUJA 1DYFA 1C6JA 1OVHA 1LYIA 7LZMA 2NTHA 3FI5A 3F9LA 1I6SA 164LA 180LA 262LA 147LA 1C6LA 3HU9A 1ZURA 1K28A 1PQOA 149LA 1L70A 225LA 115LA 4W53A 1L11A 1L68A 1L30A 4GBRB 3HUKA 3V2YA 198LA 1L97A 107LA 1G0JA 261LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2D4JA 4H8YA 2D4KA 1L72A 2ZQ4A 4NGZA 256LA 1OQMA 3HTFA 2DQCY 4NHQA 1KIPC 1DYEA 4H9HA 1B7SA 1UA6Y 1LZNA 1OUFA 2Q0MX 3DN6A 2B6ZA 207LA 4DDCA 3CDVA 3L64A 2MEGA 219LA 4DWXA 187LA 4WL7A 2RB1X 4RLMA 1GFKA 1JSFA 1GBXA 1B5VA 1REXA 4OOTA 1QS9A 2B6XA 1UICA 1QTVA 1GHLA 3IJUA 2LZ2A 1T8FA 1CUQA 3AW7A 1B5XA 1L17A 1LWGA 1LW9A 1LZ5A 5II3A 1J1XY 3B6LA 3A67Y 1LZDA 1L89A 109LA 4KPMA 1OV5A 3HT6A 252LA 1C7PA 218LA 4GCBA 1LYGA 1L41A 1L59A 1T6HA 1L25A 4GLAA 1L53A 1D0MA 2DQDY 3A94A 2CJLA 9LYZA 1L15A 3DN3A 3DN0A 4H8XA 1B5YA 1B7OA 1DYCA 1GB7A 1ZV5L 3C80A 4GN4A 1Z55A 2RBRA 1HSWA 4X3BA 230LA 2YBMA 1VAUA 1D3FA 1OUIA 5IELA 4GCFA 2Z38A 3LHMA 3CDTA 1JKCA 4A7DA 1MELL 5L3IA 1F6RA 4GRVA 3AJNA 1L44A 3OE0A 4ZIXA 1D3JA 4WLXA 1IC5Y 1G07A 6LZMA 245LA 4AXTA 1L94A 1DXJA 1G7LC 1L46A 3W3EA 1LMNA 4C5FA 110LA 4DD7A 5KY1A 120LA 1NDGC 4MSTA 1EQ4A 1LWKA 4PJ2C 1FLWA 4NG1A 1LZBA 4HV1A 5M1YA 1OUJA 259LA 1D6PA 1D9UA 5JENB 4YEMA 1QTBA 1C6FA 1IR9A 4HTNA 5LVHA 1B5UA 2G4PA 215LA 1P3NA 1VDQA 2HEAA 226LA 1OUEA 4R6CA 3IWRA 1C6BA 1SWZA 3HTBA 242LA 1KY0A 190LA 126LA 5KXYA 4W94A 2MECA 113LA 4ML7A 1L50A 4QEQA 3WU8A 1L85A 1LZCA 4B4IA 3SP3A 241LA 4FJRA 4W51A 4K5YA 4N5RA 4XJIA 192LA 1L24A 3TMVA 258LA 1IWXA 1L0JA 2F4GA 5KXSA 1YAMA 1LGWA 4H91A 4HTQA 3M3UA 141LA 3LYTA 4OWCA 2EIZC 4CFOA 1LGXA 3LZTA 3A3RX 1JTOL 2RBOA 1B6IA 1G7HC 1SQ2L 2RAYX 4TSCA 2F2QA 4W59A 4ETEA 1CKDA 128LA 3A91A 3AYQA 2D6BA 1LAAA 139LA 2HEEA 2XBRA 3QY4A 3EO5A 229LA 1VATA 158LA 1HEWA 3HT8A 183LA 1IX0A 1C61A 1C64A 3WYHA 1JIYA 4FDYA 1GAYA 1LZ6A 4LFPA 5B05A 3DNAA 235LA 4IAPA 1L74A 1LKRA 3CQLA 1LJ4A 1GB0A 1LYFA 3AB6A 5LZMA 4QDNA 1KIRC 2AUBA 1REZA 3SB9A 1L29A 1DZBX 3LYMA 1UIEA 111LA 2FBDA 2N5ZA 4WG7A 2RH1A 3TXKA 3WW6A 2LCBA 2OU8A 1LI2A 1LJFA 3TMWA 1VDSA 1IY4A 1L08A 4YXAC 5KXPA 5KXMA 5F14A 2B5ZA 2Z12A 5KXOA 2I26L 2RBPA 2DKVA 4P2EA 1LHKA 1XJTA 5IDDA 4LYOA 1QDRA 1F0WA 4W54A 4EOFA 2HULA 3LZMA 2ZNXY 1L83A 182LA 1GF3A 1LSFA 3ODUA 1LJ3A 2LC9A 1GXXA 1L09A 1QTHA 5HQ1A 1CKGA 1LYOA 1JJ1A 3SN6R 1C6EA 4GCCA 176LA 1KIQC 1L99A 4LT1A 3GULA 2HUKA 2YBHA 2O7AA 2B74A 3SB8A 1WTMA 189LA 4GN5C 3W6DA 5ILCA 4ETCA 4XJGA 4I7PA 4LZMA 2ZWBA 2FYDA 1UC0A 3OK0A 1XEIA 1L66A 1UCOA 1G7IC 1L31A 1DKKA 5C6JA 1LJHA 220LA 4I7RA 2CDSA 2ZYPA 1HMLA 140LA 137LA 4W56A 1L62A 3DMXA 2H9JA 1L87A 2OE4X 1LYEA 1QUDA 3A92A 2MEIA 4RLNA 4H9AA 228LA 2IHLA 1GFUA 1QT8A 3G3XA 186LA 1RCMA 3RU5A 2XBSA 2MEEA 2A7DA 2Z39A 1L06A 4B4EA 3B72A 2A7FA 3RNXA 1GFVA 1LYJA 4GCDA 1PQJA 223LA 3GUJA 1C6JA 2NTHA 1OUHA 1I6SA 2MEBA 3ATOA 262LA 1ZVYB 1K28A 1V7TA 1PQOA 1I56A 4W53A 4UWNA 2XJWA 5HNCA 4GBRB 2D91A 107LA 4WO6A 1LMCA 4WM4A 1QQYA 1HC0A 5F9XA 1LSMA 1QUHA 248LA 2CWIA 3HDFA 4AGAA 4PRQA 2B6WA 5LYMA 1BVKC 1G1WA 1C66A 1CU5A 4KL7A 4W55A 213LA 1CV5A 1KXXA 4LDOA 123LA 1VDTA 201LA 2H5ZA 172LA 1CV1A 4LGKA 1L84A 2BQLA 3FE0A 3WU9A 4W52A 1IP6A 1GBZA 3D3DA 5KXWA 5FELA 3JR6A 1L69A 1NMMA 119LA 1IP1A 142LA 2ZIKA 4PRUA 1G0LA 1L37A 1C6HA 1SX7A 1C6TA 4WM2A 3C82A 3G3AB 3A8ZA 5LINA 4NIJA 4AQNA 4I7LA 4ANRA 2BQIA 5C6IA 1GBYA 1BHZA 3DN4A 2BQHA 3CT1A 1L86A 4Z41A 1SWYA 2HU3A 3GUNA 4NHIA 2ZYCA 1GB6A 2YDGA 5L3HA 2ANXA 1VEDA 1YL1X 3AZ7A 4XN6A 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152LA 1L43A 1LSCA 1HHLA 1QTZA 1HEQA 2BAAA 1GB9A 1TDYA 1QT3A 237LA 1OYUA 4NG8A 1GFRA 1QT7A 1CU2A 3HH6A 1IOSA 1CJ9A 1GXV2 227LA 1IVMA 2Y8PA 4YX7C 4H92A 3HDEA 1KW5A 1XJUA 1C6AA 1C10A 4ARQA 1NHEA 5L9JA 5D5CA 3WMKA 1OVJA 3E3DA 3HFMY 247LA 148LE 3AGHA 1A2YC 1P56A 2B75A 4DQ5A 4DQ7A 1J1PY 1LJIA 1BB5A 250LA 1L55A 3HU8A 240LA 1L01A 1GFTA 2X0AA 1C62A 1LJEA 2BLXA 1T97A 1WTNA 2LYOA 2BQGA 1LSZA 1CX7A 144LA 122LA 1UIAA 4XJDA 4NGWA 1P46A 4I0CA 2VB1A 4DD9A 5LVJA 3HBHA 1CV3A 1GDWA 4OOOA 3AGIA 3HH5A 1LTMA 3G3WA 5DM9A 2DQAA 4H94A 4Z46A 2QARC 1IOQA 1L57A 212LA 1B5ZA 4H9CA 4WG1A 1CV6A 1G7MC 1L00A 2HUMA 5FHWA 3ZEKA 1L38A 1L54A 3QE8A 3HBDA 5B06A 4MR1A 2Z2FA 3WXTA 1P7SA 4DD1A 4EJ4A 6LYTA 1C6QA 1JITA 1FLQA 222LA 153LA 1JEFA 205LA 1BVXA 1QDTA 1KXYA 1LYDA 4G4CA 1C6CA 1PQMA 2DQHY 1P64A 4WO9A 2ZIJA 169LA 2XQOA 4O34A 1IR8A 1UIFA 244LA 3QNGA 4G4HA 4WM6A 165LA 2LZTA 4II8A 4XENA 5B59A 5B1GA 8LYZA 1GF6A 4BS7A 1LHJA 4G49A 3LZ2A 7LZMA 1WQOA 3FI5A 4IASA 164LA 4NGIA 3B0OA 180LA 5F16A 1C6LA 194LA 1NDMC 1L68A 4OW1A 1L97A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2D4J A;  4H8Y A;  2D4K A;  1L72 A;  2ZQ4 A;  4NGZ A;  256L A;  1OQM A;  3HTF A;  2DQC Y;  4NHQ A;  1KIP C;  1DYE A;  4H9H A;  1B7S A;  1UA6 Y;  1LZN A;  1OUF A;  2Q0M X;  3DN6 A;  2B6Z A;  207L A;  4DDC A;  3CDV A;  3L64 A;  2MEG A;  219L A;  4DWX A;  187L A;  4WL7 A;  2RB1 X;  4RLM A;  1GFK A;  1JSF A;  1GBX A;  1B5V A;  1REX A;  4OOT A;  1QS9 A;  2B6X A;  1UIC A;  1QTV A;  1GHL A;  3IJU A;  2LZ2 A;  1T8F A;  1CUQ A;  3AW7 A;  1B5X A;  1L17 A;  1LWG A;  1LW9 A;  1LZ5 A;  5II3 A;  1J1X Y;  3B6L A;  3A67 Y;  1LZD A;  1L89 A;  109L A;  4KPM A;  1OV5 A;  3HT6 A;  252L A;  1C7P A;  218L A;  4GCB A;  1LYG A;  1L41 A;  1L59 A;  1T6H A;  1L25 A;  4GLA A;  1L53 A;  1D0M A;  2DQD Y;  3A94 A;  2CJL A;  9LYZ A;  1L15 A;  3DN3 A;  3DN0 A;  4H8X A;  1B5Y A;  1B7O A;  1DYC A;  1GB7 A;  1ZV5 L;  3C80 A;  4GN4 A;  1Z55 A;  2RBR A;  1HSW A;  4X3B A;  230L A;  2YBM A;  1VAU A;  1D3F A;  1OUI A;  5IEL A;  4GCF A;  2Z38 A;  3LHM A;  3CDT A;  1JKC A;  4A7D A;  1MEL L;  5L3I A;  1F6R A;  4GRV A;  3AJN A;  1L44 A; 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