2A4TA

Crystal structure of spin labeled t4 lysozyme (v131r7)
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAACNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of spin labeled T4 Lysozyme (V131R7
rcsb
molecule keywords Lysozyme
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 60
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2005-06-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2a4tA00
115LA 1L37A 247LA 3HH3A 4ARLA 3HUAA 1LYEA 1G0QA 1L52A 3QAKA 4I7PA 4YX7C 163LA 3DN1A 201LA 241LA 1NHBA 1C64A 1L56A 2B7XA 1CU2A 1QT5A 3NYAA 3DN2A 1LI3A 2RBSA 1L33A 3HH6A 1L64A 213LA 127LA 258LA 3HT8A 172LA 1D3JA 1L63A 1L42A 3PDSA 3SB6A 4DKLA 3C81A 251LA 1PQOA 3F9LA 1L94A 1QTCA 3HU8A 1QUOA 3HDFA 1L17A 1C6FA 2B72A 249LA 3DN8A 192LA 262LA 3DN3A 1G06A 3GUKA 3C8RA 3FADA 3HU9A 1QUGA 166LA 3VW7A 1LGWA 4YXAC 221LA 1LWKA 1L50A 3SB7A 3RZEA 1QTHA 1CUPA 1L23A 2B70A 4EPFA 1PQDA 1CV1A 1C6KA 1G1VA 1L32A 1SSWA 1C66A 177LA 1L35A 188LA 1C6PA 3RUNA 1L93A 1CVKA 1PQIA 1G0JA 2CUUA 1XJUA 1KY0A 1L81A 1LYDA 200LA 1SWYA 1L43A 4LDEA 3SBBC 1C6TA 3DN4A 206LA 118LA 1SX7A 3FA0A 2O7AA 1P3NA 1CV6A 1D2WA 1D2YA 1L26A 130LA 3GUPA 1OVJA 1EPYA 2B6ZA 1L45A 4W58A 1C6DA 209LA 1PQMA 3HH5A 1L11A 1G1WA 3L64A 114LA 1L38A 2NTGA 199LA 181LA 3HWLA 3GUIA 3DMVA 237LA 3PBLA 1KNIA 1L59A 3C8SA 167LA 128LA 1L84A 250LA 1D3NA 223LA 1DYCA 3HUQA 3ODUA 3D4SA 1C6CA 3FI5A 5LZMA 1LYFA 1C6LA 1P7SA 1L71A 3K2RA 217LA 1G0MA 1C62A 1LPYA 2OE4X 4ARQA 1L97A 2F32A 1L00A 1DYEA 3EMLA 169LA 1CU0A 235LA 1P56A 1L01A 1L16A 162LA 144LA 1DYFA 1C6GA 1L0JA 2OU8A 2RH1A 248LA 3GUOA 3CDTA 3OE6A 1CV5A 1L85A 176LA 4GBRB 4LDLA 4EKPA 3SN6R 1L53A 1P37A 156LA 232LA 1QSQA 3HT7A 1C69A 1SX2A 3NY9A 1L57A 113LA 1C67A 4K5YA 1KW5A 1L44A 2F47A 157LA 155LA 1L74A 3C7YA 1L91A 4I7QA 197LA 1LLHA 3HTBA 191LA 1L72A 2OU9A 1L80A 189LA 1LWGA 5I14A 196LA 170LA 1C6JA 1L76A 1L69A 4W56A 4EXMA 165LA 1C6AA 148LE 1G07A 1L10A 178LA 2RBPA 4DJHA 1L08A 2RBOA 1L65A 3GUMA 152LA 126LA 261LA 4GRVA 2B6XA 1L06A 1C6BA 2Q9DA 103LA 1P46A 147LA 211LA 160LA 3GULA 184LA 1G0PA 4ARMA 1L21A 233LA 1L58A 1P6YA 1L73A 3L2XA 4YXCA 1TLAA 238LA 110LA 1L09A 1L79A 1WTHA 3G3VA 187LA 1L07A 4LZMA 4W52A 4EKQA 245LA 3HTFA 1C6NA 210LA 234LA 3CDQA 231LA 1B6IA 4W51A 1L60A 2OE9X 1CX6A 3C7ZA 173LA 4W55A 4LDOA 4PJZA 1T97A 1QT8A 3C80A 3GUJA 195LA 180LA 1L77A 2OE7X 185LA 1OYUA 3CDOA 1L18A 205LA 4AQNA 1L34A 226LA 2IGCA 1ZYTA 1L98A 2B75A 2Q9EA 1SWZA 1G0LA 1L04A 3DN0A 4W53A 1CV0A 3LZMA 122LA 222LA 1L87A 3DKEX 186LA 4EKSA 1KW7A 1L92A 4ARPA 1P2RA 2LC9A 1L66A 1C68A 257LA 1KS3A 1DYGA 2RAYX 1JTNA 216LA 6LZMA 1K28A 120LA 1L15A 109LA 7LZMA 1T8FA 2B73A 2OTYX 4EKRA 1C6HA 1CV3A 3DMZA 104LA 4PK0A 2B6TA 1C6IA 3SB8A 1DYDA 1ZWNA 3C8QA 1D3FA 1C60A 1C63A 1CU5A 1QT3A 1L99A 1L90A 1L86A 2RBNA 1CX7A 3HTDA 1L51A 1L22A 1QTVA 254LA 242LA 1P36A 1QTDA 4I7MA 1L0KA 1JTMA 107LA 3DN6A 3V2YA 1PQKA 1L39A 1L49A 1L82A 4I7JA 142LA 2B6WA 1L02A 1LYHA 1G0GA 3SBAA 2A4TA 198LA 183LA 111LA 259LA 123LA 3HT6A 131LA 1OVHA 244LA 4E97A 3NY8A 150LA 1LI2A 1OVKA 1QUDA 1T8GA 1QUHA 3V2WA 1JQUA 1L41A 236LA 1C6MA 1XJTA 239LA 1QS5A 1DYBA 1L47A 146LA 212LA 4W59A 3DMXA 1LGXA 1QSBA 2O4WA 1LGUA 1XEPA 4I7NA 2RBRA 174LA 3HUKA 4S0WA 1L29A 218LA 2OU0X 1I6SA 4OO9A 1L88A 1KY1A 168LA 3C83A 149LA 1L05A 171LA 151LA 4I7KA 1L70A 2RB1X 1L55A 256LA 4EPIA 2Z6BA 159LA 228LA 1ZURA 1C6EA 255LA 1L67A 3HDEA 4I7LA 2HULA 4I7RA 2QB0B 3GUNA 1QT7A 1L62A 227LA 252LA 1L12A 4ARQB 229LA 1LYGA 1SSYA 1C61A 1L24A 1P2LA 2B74A 4EJ4A 1L46A 1L68A 2OEAX 1C65A 1CV4A 1L30A 1L13A 2RBQA 3OE9A 3OE8A 1LYJA 3OE0A 1L27A 3G3XA 1T6HA 145LA 1L61A 2OTZX 1D3MA 1CU3A 161LA 141LA 2HUMA 1CUQA 1G0KA 175LA 2RB0X 4I7OA 1L75A 1D9WA 137LA 1QT6A 3SB5A 4I7SA 1PQJA 4IAPA 1L95A 102LA 243LA 1L31A 1LW9A 3G3WA 1CTWA 3C7WA 1L14A 246LA 158LA 164LA 1L36A 2ANVA 1QTBA 108LA 4W57A 1T8AA 225LA 3CDVA 125LA 224LA 140LA 1L40A 215LA 3F8VA 1LYIA 219LA 2HUKA 1L96A 1OV7A 190LA 1L25A 2LCBA 4W54A 1OWYA 1LI6A 2B6YA 3UONA 4ARJA 1L20A 1DYAA 3C82A 3CDRA 1P64A 143LA 3HT9A 139LA 4DAJA 1QT4A 4ZPUA 1OV5A 1L48A 2F2QA 2RB2X 4ARMB 3DNAA 112LA 138LA 253LA 260LA 2NTHA 1QS9A 2O79A 3SB9A 1L83A 1L54A 2QARC 2ANXA 3HTGA 214LA 3JR6A 1QTZA 1L28A 2LZMA 2RAZX 182LA 129LA 1CU6A 1L89A 1OWZA 1P5CA 240LA 1L03A 1L19A 220LA 3HH4A 4I7TA 1C6QA 2L78A 119LA 230LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1GB6A 3QNGA 4YF2A 1QSWA 1LYEA 5T3FA 1D6PA 1GB5A 1LZNA 3QAKA 4I7PA 1LSAA 3LZ2A 5I4XA 1GB3A 3NYAA 4WO6A 3RU5A 1YANA 3ATNA 1LYYA 213LA 127LA 1GF7A 1L42A 3PDSA 2PC2A 1JWRA 251LA 4LFXA 132LA 3WXTA 1UIGA 1LZEA 1GXXA 1IC5Y 4ZFPA 3HDFA 1GF9A 2B72A 2LYMA 2DQJY 1TDYA 1LGWA 3G3AB 4KT3A 1WTNA 2HEDA 5LINA 1CKDA 1GXV2 2BQLA 1QTHA 4IJ4A 4N5RA 4ETDA 4TTDA 1PQDA 1REMA 3MGWA 1IEEA 1L32A 1SSWA 1JTPL 1FBIX 4H9HA 4NWHA 1BVKC 1GB9A 2CDSA 1RFPA 4B0DA 1CVKA 1PQIA 1AM7A 4C5FA 3WVYA 1G0JA 1VEDA 2Q0MX 1L81A 3ULRA 1BWIA 3A90A 206LA 118LA 1SX7A 135LA 2O7AA 1GAZA 1P3NA 1CV6A 1F6SA 2CWIA 1L26A 3WPKA 1XSFA 3AZ4A 2B6ZA 209LA 1JISA 1L11A 1HF4A 1OUHA 1B7NA 2F4AA 4NGZA 199LA 1YKXX 1L84A 4ML7A 1WQNA 1C6CA 217LA 1G0MA 4BADA 1DYEA 1D0KA 1GF8A 3EMLA 169LA 4NHSA 5KXYA 1L16A 3HFMY 1DYFA 1C6GA 1L0JA 1T3PA 1UIDA 176LA 9LYZA 2YBJA 156LA 4PRUA 1IP4A 232LA 3WH1A 1HMKA 1IWTA 1C43A 1GE3A 1L44A 5J7CA 1LZ6A 4NSHA 155LA 5LYZA 1JHLA 1L91A 3TMVA 3W6DA 2N5ZA 196LA 170LA 5LAFA 2IHLA 4UWUA 3WU9A 3D9AC 1IR8A 4XJGA 5B59A 1YKZX 4HP0A 1DI4A 1UACY 4GCEA 3WYHA 1CJ9A 1B9OA 1JKDA 5IDDA 103LA 5HNCA 2BQBA 3LYTA 233LA 3VWOA 4NG8A 238LA 3WU8A 110LA 1IWWA 1L09A 187LA 5LA8A 3HTFA 5C6IA 210LA 234LA 5LVKA 3P68A 3LN2A 1L60A 2OE9X 1LZBA 4W55A 4NEBA 4N1CC 1QT8A 195LA 3IWRA 1GF6A 1L77A 1SLYA 205LA 4AQNA 1L34A 2IGCA 1HFXA 2B5ZA 5DL9A 2Z2FA 4ANRA 1CV0A 3TXDA 4GCDA 208LA 2ZIKA 2HUBA 2BPUA 1LSCA 3DKEX 1P2RA 1C68A 4RLMA 4I0CA 4H1PA 1TAYA 216LA 6LZMA 4WL6A 5E4PA 5LXWA 109LA 5KXKA 1GEVA 3CSRA 4RLNA 4DD1A 5I5QA 1B0DA 1EL1A 1C63A 5FELA 6LYTA 1QT3A 1OUJA 1L90A 4MSTA 1B5UA 1CX7A 4YEOA 4DQJA 1QTVA 254LA 3AGIA 1INUA 1P36A 4B49A 5II3A 1QTDA 1I1ZA 3OK0A 2IFFY 1IO5A 4CGEA 5D5CA 4HJYA 194LA 1G0GA 5LYMA 1JJ1A 1AT5A 1LZ8A 1OQMA 5DLAA 131LA 4DDAA 244LA 1YILA 5KXTA 3M18B 1QUDA 6LYZA 1JQUA 1L41A 236LA 1UA6Y 1NF5A 1QS5A 1DYBA 212LA 1LZTA 1JTOL 2O4WA 2FBDA 4I7NA 174LA 1GBOA 4S0WA 2OU0X 1LPIA 2RB1X 5ILCA 1BQLY 1CKGA 4I7LA 2HULA 1BB6A 3TMXA 1WQOA 5KXNA 1L62A 4H8ZA 1SSYA 1C61A 1P2LA 2Z2EA 5LVIA 1C08C 3OE9A 4PJ2C 3OE0A 1L27A 1T6HA 1D3MA 1GAYA 4WO9A 4Z41A 3SB5A 8LYZA 1O23A 246LA 3CSZA 1B5VA 1LZ4A 108LA 1GB0A 225LA 4X3BA 3CDVA 1C7PA 5LVJA 1EQ5A 3HBEX 1L40A 215LA 1LKSA 219LA 4KL7A 2XBSA 190LA 4HSFA 1L25A 2BQAA 4ARJA 5KXPA 4DC4A 1A4VA 3M3UA 1JKCA 1P64A 1C10A 4Z98A 1G7IC 3A94A 1VDQA 4ZPUA 4ETEA 2G4PA 2RB2X 4NGYA 3B6LA 3T36A 2D6BA 1QS9A 3SB9A 1LCNA 1L54A 2F4GA 1Z55A 4AXTA 1GHLA 2ANXA 4NGJA 1BHZA 214LA 3LYOA 3P66A 4TSCA 2LZMA 4ZIXA 1L89A 3P4ZA 1UIHA 1LSNA 230LA 1JJ3A 115LA 4NGOA 1HFYA 247LA 3HH3A 3LYZA 1D0LA 1FLYA 1MLCE 3HUAA 3TXKA 1L52A 2BLYA 4HJZA 1GB7A 4ETBA 3DN1A 1B7OA 201LA 1IWXA 1C64A 2H5ZA 4HTKA 4E3UA 3DN2A 3OJPA 1ZV5L 1LI3A 1QSAA 3A3QA 2RBSA 1IP5A 3HH6A 1G7HC 1LJGA 1D3JA 4J1BA 1PQOA 1BGIA 4Z46A 133LA 1QUOA 1L17A 4J1AA 4TX7A 1FLQA 1CNSA 2DQEY 262LA 3DN3A 1QUSA 1G06A 3FADA 1QUGA 3VW7A 221LA 1JTTL 5HQ1A 4G9SA 4CFOA 2W1XA 3RZEA 5FSTA 2YSSC 4LT0A 4G4HA 3EXDA 1JSFA 2BQEA 1BWHA 1IP7A 4NGKA 4DD9A 1C66A 3KAMA 2DKVA 1B5XA 1LJ3A 4ET9A 2MEFA 1IVMA 4NSGA 2CUUA 3A95A 1XJUA 3BKVA 4WM1A 1LYDA 1L43A 5I53A 3WPLA 1WQQA 3HBDA 4GLAA 3P64A 1D2WA 2DQCY 130LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1GB6 A;  3QNG A;  4YF2 A;  1QSW A;  1LYE A;  5T3F A;  1D6P A;  1GB5 A;  1LZN A;  3QAK A;  4I7P A;  1LSA A;  3LZ2 A;  5I4X A;  1GB3 A;  3NYA A;  4WO6 A;  3RU5 A;  1YAN A;  3ATN A;  1LYY A;  213L A;  127L A;  1GF7 A;  1L42 A;  3PDS A;  2PC2 A;  1JWR A;  251L A;  4LFX A;  132L A;  3WXT A;  1UIG A;  1LZE A;  1GXX A;  1IC5 Y;  4ZFP A;  3HDF A;  1GF9 A;  2B72 A;  2LYM A;  2DQJ Y;  1TDY A;  1LGW A;  3G3A B;  4KT3 A;  1WTN A;  2HED A;  5LIN A;  1CKD A;  1GXV 2;  2BQL A;  1QTH A;  4IJ4 A;  4N5R A;  4ETD A;  4TTD A;  1PQD A;  1REM A;  3MGW A;  1IEE A;  1L32 A;  1SSW A;  1JTP L;  1FBI X;  4H9H A;  4NWH A;  1BVK C;  1GB9 A;  2CDS A;  1RFP A;  4B0D A;  1CVK A;  1PQI A;  1AM7 A;  4C5F A;  3WVY A;  1G0J A;  1VED A;  2Q0M X;  1L81 A;  3ULR A;  1BWI A;  3A90 A;  206L A;  118L A;  1SX7 A;  135L A;  2O7A A;  1GAZ A;  1P3N A;  1CV6 A;  1F6S A;  2CWI A;  1L26 A;  3WPK A;  1XSF A;  3AZ4 A;  2B6Z A;  209L A;  1JIS A;  1L11 A;  1HF4 A;  1OUH A;  1B7N A;  2F4A A;  4NGZ A;  199L A;  1YKX X;  1L84 A;  4ML7 A;  1WQN A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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