2ANXA

Crystal structure of bacteriophage p22 lysozyme mutant l87m
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
146
structure length
146
Chain Sequence
MMQISSNGITRLKREEGERLKAYSDSRGIPTIGVGHTGKVDGNSVASGMTITAEKSSELLKEDLQWVEDAISSLVRVPLNQNQYDAMCSLIFNIGKSAFAGSTVLRQLNLKNYQAAADAFLLWKKAGKDPDILLPRRRRERALFLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Extension to 2268 atoms of direct methods in the ab initio determination of the unknown structure of bacteriophage P22 lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage p22
molecule keywords Lysozyme
total genus 47
structure length 146
sequence length 146
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2005-08-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2anxA00
1P46A 1C67A 1CV6A 1C6JA 3GUNA 1QT4A 1KW5A 245LA 3CDRA 1L57A 3HT8A 2OTYX 197LA 258LA 1C62A 131LA 231LA 1C6QA 1L97A 1G0PA 223LA 4I7PA 2RBPA 1L52A 1C6CA 206LA 183LA 2RB0X 158LA 141LA 1L30A 255LA 1L15A 4E97A 1DYEA 3OE0A 3F8VA 2CUUA 1D3JA 3SB6A 238LA 3L2XA 1G07A 2B7XA 1QTVA 1L64A 1G0LA 2OEAX 1L93A 147LA 3GUKA 2OE9X 129LA 1WTHA 1SWZA 5I14A 159LA 1L25A 248LA 4EKPA 3DN4A 1OV5A 142LA 1L40A 218LA 259LA 1T97A 166LA 1C6KA 1ZWNA 3GUJA 2F2QA 120LA 1QT3A 2O7AA 3HT6A 4AQNA 3V2WA 2HUMA 3C8SA 4GBRB 1L88A 1PQOA 3LZMA 252LA 3DMVA 4K5YA 3HTGA 1L65A 3CDTA 219LA 1L07A 1ZYTA 1L43A 4PK0A 1LYIA 3GUIA 3GUMA 4W56A 2LZMA 200LA 1LYJA 3PDSA 3C83A 1QS9A 143LA 176LA 237LA 3HUKA 1L72A 2OU8A 3DN3A 2RBRA 1G0JA 210LA 1D3FA 1XEPA 3C80A 4OO9A 1L71A 1L66A 1L84A 2Q9DA 138LA 1NHBA 155LA 1CV1A 4W53A 1QUHA 1L01A 4EPIA 2RAYX 2A4TA 5LZMA 3HUAA 123LA 1T8AA 209LA 139LA 247LA 2B73A 1C6EA 3G3XA 1CV5A 242LA 256LA 228LA 1LLHA 2OU0X 261LA 1I6SA 1L10A 4I7MA 1L53A 214LA 2RBNA 1QSBA 1L50A 1KY1A 3HDFA 1L35A 3D4SA 1OWZA 3G3WA 1L89A 4DAJA 1DYGA 3F9LA 232LA 130LA 1CV4A 201LA 1CX7A 144LA 157LA 163LA 1OV7A 1T6HA 1L02A 1QTHA 3JR6A 1L26A 3SB8A 2IGCA 3FA0A 2B6XA 251LA 1L39A 175LA 1L83A 241LA 3HUQA 181LA 3HWLA 220LA 2HULA 4S0WA 1L96A 217LA 6LZMA 224LA 1LI6A 1L76A 1L20A 1L16A 2RBQA 126LA 4DJHA 1OYUA 1L61A 4ARQB 1L62A 1G0KA 226LA 1L22A 1L08A 1SSYA 1T8FA 2B6TA 3QAKA 2B75A 127LA 222LA 168LA 3HT9A 2B70A 1L44A 1CUQA 1C6PA 4DKLA 156LA 198LA 1D2WA 1CV0A 1QT6A 3V2YA 1LYDA 192LA 1JTMA 1L99A 2RAZX 167LA 1LYEA 240LA 4W52A 1PQMA 122LA 177LA 1LGUA 3C81A 1QT5A 1L31A 125LA 249LA 239LA 4ARMA 115LA 3FI5A 170LA 1QTZA 1L34A 1D2YA 3K2RA 4LDOA 1QTDA 1L27A 1L48A 1C68A 3NY8A 2Q9EA 215LA 1DYAA 1L54A 1PQDA 1C69A 3C8RA 1C6LA 2B6ZA 1SSWA 3EMLA 2QARC 4EKRA 164LA 2B6YA 1L03A 1OWYA 236LA 1C66A 233LA 1L68A 174LA 4EKQA 1C65A 4I7LA 1C60A 3NYAA 3HH5A 4EKSA 3DN1A 3GUPA 4I7NA 1XJUA 4I7QA 4I7KA 165LA 4YXCA 1L86A 149LA 2OE4X 1QT8A 199LA 2RBSA 1C6NA 1QT7A 4EPFA 1L49A 1LYGA 3HTFA 1P3NA 1L90A 1D9WA 1LWKA 1K28A 250LA 244LA 195LA 2ANXA 1EPYA 1L55A 1L67A 1P64A 2OTZX 1L32A 1L28A 1L00A 2OE7X 111LA 1C61A 1G0GA 1QUGA 213LA 182LA 4W54A 1C6BA 3G3VA 1CU5A 1PQJA 3SB7A 190LA 3DN2A 4IAPA 1QTCA 2QB0B 3C7WA 1C6TA 1L81A 257LA 229LA 212LA 1L33A 246LA 109LA 3HH4A 1QUOA 186LA 4W55A 225LA 4LZMA 1L06A 1L74A 253LA 1L45A 160LA 1G0QA 4W58A 1PQKA 1DYDA 3HU8A 151LA 113LA 3CDOA 1CVKA 1G1VA 3GUOA 3PBLA 4ARPA 1DYFA 1L95A 2OU9A 196LA 2NTGA 1L87A 4I7RA 1D3NA 3C7ZA 1G06A 114LA 3HDEA 1QUDA 137LA 161LA 191LA 1G1WA 3FADA 171LA 3SBAA 108LA 1T8GA 1L73A 1P56A 184LA 4W57A 3HT7A 3UONA 2RBOA 1KNIA 1L85A 7LZMA 4ARMB 3C7YA 1LYFA 3DN0A 1L41A 1L69A 1LI3A 173LA 4ARQA 1L0JA 2F47A 1CUPA 1L19A 180LA 1P7SA 3SN6R 2B72A 2L78A 1L21A 3RZEA 1LGXA 1LWGA 1L56A 1LI2A 187LA 3ODUA 1ZURA 1LGWA 3GULA 1C6GA 1L11A 3RUNA 1G0MA 1L59A 1SWYA 2F32A 3SBBC 1CU3A 1L91A 1L92A 1L38A 1TLAA 1KS3A 4I7OA 119LA 2O79A 3OE9A 3L64A 102LA 3DNAA 188LA 3HTBA 1L05A 227LA 3VW7A 3HU9A 146LA 1L58A 3NY9A 3SB9A 1L80A 2O4WA 3DN6A 1L13A 2Z6BA 1CU2A 216LA 1L14A 1OVKA 128LA 3DMXA 1OVJA 1P2LA 162LA 1L24A 3OE8A 1LPYA 4W51A 1L18A 1CV3A 1OVHA 1C6AA 1L36A 260LA 1QSQA 1L60A 2RH1A 4ARLA 4EXMA 178LA 262LA 1L82A 1C6IA 1KW7A 1P37A 3DKEX 205LA 1L79A 4GRVA 1C6FA 3HH6A 1KY0A 1P5CA 4I7JA 1L09A 1P36A 1L77A 1L29A 118LA 243LA 1PQIA 254LA 1L51A 1L63A 2RB2X 3CDQA 1LW9A 3OE6A 3SB5A 2B6WA 1C6MA 4ARJA 4EJ4A 172LA 3C8QA 145LA 1QS5A 1B6IA 1C63A 1XJTA 1L75A 1QTBA 1C6DA 1L0KA 1CU0A 1L23A 1SX7A 235LA 1P2RA 107LA 140LA 3HH3A 2LCBA 169LA 189LA 148LE 1CX6A 4I7TA 103LA 2RB1X 1CU6A 1L98A 4YXAC 1L47A 1CTWA 4I7SA 2LC9A 3C82A 1L37A 1L42A 1P6YA 1L17A 1L94A 1LYHA 1L70A 230LA 1SX2A 221LA 4LDLA 4LDEA 3HTDA 152LA 3DMZA 1L12A 1L46A 4W59A 2ANVA 1C6HA 2HUKA 2NTHA 4YX7C 234LA 211LA 1DYBA 112LA 1C64A 3DN8A 185LA 4ZPUA 2B74A 104LA 1DYCA 1JTNA 1JQUA 3CDVA 1D3MA 4PJZA 1L04A 110LA 150LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1P46A 3AB6A 3ATNA 5LYTA 1LZCA 4HJZA 245LA 1L57A 3WUNA 1IWVA 4O34A 5DN5A 2F4AA 131LA 1LSDA 1L97A 4CFOA 223LA 3AJNA 4I7PA 3W6CA 1YL1X 206LA 183LA 3W6DA 1L30A 1IOQA 4E97A 2A7FA 3F8VA 1G7MC 7LYZA 4ANRA 1L93A 1B5UA 3GUKA 5HNCA 4ET8A 2Z18A 159LA 1LHHA 1LHJA 1UIAA 1OV5A 1G7JC 1KIQC 2HUBA 4YF2A 5HMVA 1C6KA 1ZWNA 5B59A 2F2QA 2W1YA 3DMVA 4WL7A 1JSEA 1L65A 2EQLA 4DWXA 1GDXA 1BGIA 3G3BB 3PDSA 2ZNWY 5C6LA 143LA 4WLYA 5FCPA 3HUKA 5KXNA 1C46A 3DN3A 1IC4Y 1HEPA 1D3FA 1WTMA 4OO9A 4LFXA 1L71A 1L84A 1HHLA 2Q9DA 1OUIA 1CV1A 2ZWBA 4LT1A 4W53A 2BQCA 4G4CA 4EPIA 1UCOA 1DI5A 1LMCA 1CV5A 256LA 2MEIA 3WULA 1L53A 1D6QA 1QSBA 1E8LA 1KY1A 1L35A 1OWZA 3G3WA 1L89A 5KXSA 3F9LA 4QDNA 1OUJA 2DQHY 1QTHA 1UIHA 4W96A 3SB8A 1UIGA 4DDBA 1L83A 4UWUA 3HUQA 220LA 2BQIA 2HULA 1BVKC 1B5ZA 224LA 1LI6A 5I4YA 4DJHA 3A34A 1L62A 1C45A 226LA 1L22A 1QUTA 1CKHA 1GE0A 1JHLA 3QAKA 5DM9A 222LA 1BB7A 1UICA 1CUQA 1IOCA 1YILA 1D2WA 1CV0A 1QT6A 3WU7A 1BB4A 4C3WA 1BQLY 167LA 4RW2A 122LA 177LA 5APFA 1J1PY 1HEMA 2YBMA 1OUDA 170LA 4ETEA 2BLYA 1XGQC 5C6IA 215LA 1AT5A 4FJRA 1C6LA 164LA 3TXDA 1GE2A 5LVJA 4OW1A 3HBHA 4LYMA 4EKQA 1C60A 1DZBX 3NYAA 4EKSA 3DN1A 2YBNA 1ZVHL 5KXTA 4YXCA 1QT8A 5B07A 1LWKA 250LA 244LA 4H93A 2XBRA 1EPYA 1L55A 1P64A 1YKXX 1L32A 3EBAB 1L28A 1V7SA 4TWSA 5L3IA 1KXXA 1HNLA 4AXTA 3B6LA 5HMJA 1F10A 4DD3A 3WU9A 1CU5A 3AZ6A 4BAFA 190LA 2ZYPA 4IAPA 2QB0B 4IATA 1YQVY 1L33A 2PC2A 4H8ZA 1QUOA 1VFBC 3N9AA 4LZMA 1GF6A 1L45A 4CFPA 1C7PA 4E3UA 4W58A 5LYMA 1PQKA 3HU8A 151LA 113LA 1LZDA 1D0MA 5KY1A 4WM4A 5F81A 3WXUA 4ZFPA 1LZSA 2ZIKA 1LHLA 1NMMA 4WM6A 1LZ8A 3WPKA 114LA 1LJ4A 3HDEA 5DLAA 1QUDA 4P2EA 3A96A 4MCKA 1T8GA 4GLVA 1L41A 1LI3A 4ARQA 4H9IA 5LAFA 4DD9A 1GXXA 1P7SA 1A4VA 4XADA 4LFPA 1UC0A 1L56A 2G4PA 2EKSC 4HV2A 3GXKA 3GULA 3RUNA 193LA 1G0MA 1SWYA 1VEDA 1CU3A 4ETAA 1G7IC 1TLAA 1KS3A 119LA 2O79A 1BB5A 3TMVA 3DNAA 1L05A 3VW7A 4J0LA 3RT5X 3NY9A 1BB6A 1CKFA 2Z6BA 3DMXA 1OVJA 3CQLA 1B0DA 1LJKA 1G7LC 1KXYA 1LMNA 1QSQA 4LYOA 1IP2A 2RH1A 1NKHA 1LHIA 1QTKA 2FYCA 2H9JA 1CKGA 1C6IA 4TSCA 1P5CA 4LT3A 1L09A 1P36A 118LA 4R6CA 1PQIA 1B7OA 1L51A 3AZ7A 1OUBA 3OE6A 1D6PA 1C6MA 4HSFA 3WYHA 4ARJA 4I0CA 4EJ4A 4RDSA 1VDQA 4WM3A 1L75A 1QTBA 2C8OA 3G3AB 2MEGA 1DXJA 4YEOA 4NSIA 140LA 3WUMA 1GWDA 4Z41A 1IY4A 2Z2FA 4XJDA 1L98A 1CTWA 2LC9A 4H9AA 135LA 4OOTA 1IX0A 4H91A 2Z2EA 4LDEA 1T6VL 1L46A 1C6HA 1REZA 2NTHA 4YX7C 2Q0MX 3DN8A 112LA 4ZPUA 185LA 1CKDA 1JWRA 1JEFA 4RLMA 1D3MA 1LSFA 1IR9A 1C67A 1C6JA 2XQOA 5IHGA 3GUNA 1QT4A 3CDRA 197LA 1IC5Y 1HENA 1C62A 1YROA 2DQFC 1C6QA 1G0PA 1XGUC 1YAPA 1L52A 2RB0X 141LA 255LA 3WU8A 4N5RA 3LYMA 1D3JA 3J6KA 3L2XA 1G07A 2B7XA 4DD7A 1L64A 4EOFA 1J1OY 3AGIA 2OE9X 5C6JA 1WTHA 1SWZA 5I14A 5LA5A 4H9FA 248LA 8LYZA 2LZ2A 3DN4A 142LA 3TXEA 4YENA 166LA 3GUJA 1XFPL 120LA 3HT6A 3V2WA 3QNGA 4GBRB 1L88A 3LZMA 252LA 1IP7A 1N4FA 4CHXA 3RU5A 5ILCA 1GFUA 1YIKA 1L07A 1LSPA 1LYIA 5APDA 1I20A 3GUIA 4TUNA 4ET9A 5KKIA 5I5QA 3J4GA 2G4NA 4H1PA 4YOPA 176LA 4QY9A 4NHTA 237LA 2OU8A 2DQGY 1FLWA 4EMNA 1XEPA 3C80A 2XTHA 5A3ZA 2HU3A 5J7CA 3HBEX 138LA 3WL2A 1NHBA 1GB0A 2LYMA 4NHSA 4OWHA 1TCYA 1QUHA 1GFVA 2RAYX 1NDMC 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1P46 A;  3AB6 A;  3ATN A;  5LYT A;  1LZC A;  4HJZ A;  245L A;  1L57 A;  3WUN A;  1IWV A;  4O34 A;  5DN5 A;  2F4A A;  131L A;  1LSD A;  1L97 A;  4CFO A;  223L A;  3AJN A;  4I7P A;  3W6C A;  1YL1 X;  206L A;  183L A;  3W6D A;  1L30 A;  1IOQ A;  4E97 A;  2A7F A;  3F8V A;  1G7M C;  7LYZ A;  4ANR A;  1L93 A;  1B5U A;  3GUK A;  5HNC A;  4ET8 A;  2Z18 A;  159L A;  1LHH A;  1LHJ A;  1UIA A;  1OV5 A;  1G7J C;  1KIQ C;  2HUB A;  4YF2 A;  5HMV A;  1C6K A;  1ZWN A;  5B59 A;  2F2Q A;  2W1Y A;  3DMV A;  4WL7 A;  1JSE A;  1L65 A;  2EQL A;  4DWX A;  1GDX A;  1BGI A;  3G3B B;  3PDS A;  2ZNW Y;  5C6L A;  143L A;  4WLY A;  5FCP A;  3HUK A;  5KXN A;  1C46 A;  3DN3 A;  1IC4 Y;  1HEP A;  1D3F A;  1WTM A;  4OO9 A;  4LFX A;  1L71 A;  1L84 A;  1HHL A;  2Q9D A;  1OUI A;  1CV1 A;  2ZWB A;  4LT1 A;  4W53 A;  2BQC A;  4G4C A;  4EPI A;  1UCO A;  1DI5 A;  1LMC A;  1CV5 A;  256L A;  2MEI A;  3WUL A;  1L53 A;  1D6Q A;  1QSB A;  1E8L A;  1KY1 A;  1L35 A;  1OWZ A;  3G3W A;  1L89 A;  5KXS A;  3F9L A;  4QDN A;  1OUJ A;  2DQH Y; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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