2B6TA

T4 lysozyme mutant l99a at 200 mpa
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAAAINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural rigidity of a large cavity-containing protein revealed by high-pressure crystallography.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2005-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2b6tA00
250LA 4I7MA 3SB7A 1K28A 1LYEA 1C6HA 1CX7A 3EMLA 2O4WA 4DJHA 2OU0X 143LA 1DYBA 158LA 1KW7A 2RB0X 4ZPUA 1G06A 2L78A 1L16A 4I7KA 1PQJA 1B6IA 109LA 1L26A 1NHBA 1C6CA 3C8RA 1JTMA 1QT4A 3DMXA 3DKEX 3HH5A 1C6IA 112LA 3CDRA 199LA 1QSQA 185LA 1T6HA 4LDLA 232LA 1L44A 1L0KA 192LA 1CUQA 4YXCA 1CTWA 1L83A 1C6QA 1LGUA 3NYAA 1OWZA 164LA 3NY8A 1L01A 249LA 196LA 3OE0A 1P2RA 1P36A 1L36A 1L46A 219LA 1CV0A 1C67A 3CDTA 1G0KA 4W59A 3PBLA 1CV5A 4W55A 139LA 127LA 1L96A 1L55A 173LA 206LA 125LA 251LA 148LE 1L68A 5LZMA 3RUNA 147LA 3FI5A 3DN0A 3VW7A 259LA 212LA 1PQMA 3HT6A 4EKQA 2B6ZA 3SB9A 1G1VA 1L88A 169LA 1L65A 130LA 1L03A 254LA 7LZMA 110LA 1LW9A 3D4SA 1T8GA 126LA 1L11A 128LA 1L70A 1KY0A 222LA 235LA 246LA 3HTGA 3GUKA 1I6SA 1C6TA 181LA 1PQDA 1D2YA 1CU0A 217LA 2F32A 182LA 1QT5A 1L90A 1L47A 129LA 2B74A 1CU2A 3HTFA 4W51A 2CUUA 1D3NA 262LA 256LA 3C82A 1C62A 257LA 3C8QA 241LA 238LA 1L86A 186LA 3GUMA 4GRVA 223LA 2B6YA 1D3MA 1G0QA 1L62A 1L74A 247LA 1L12A 115LA 3QAKA 1L91A 3PDSA 1TLAA 1L49A 1LYGA 113LA 1PQKA 3NY9A 1QTZA 216LA 3GUPA 2OU8A 3RZEA 187LA 3F9LA 1ZURA 4W54A 3SN6R 230LA 236LA 174LA 252LA 3HH6A 1P3NA 1L33A 171LA 1L35A 1QS5A 228LA 1DYEA 3V2WA 1C6PA 3HUKA 3C80A 1L30A 4W58A 2B6XA 3CDOA 2NTGA 3DMZA 195LA 1T8AA 180LA 4I7PA 4EKSA 1L21A 213LA 2OE9X 3FA0A 3GUNA 3HDFA 1L99A 1C6DA 4ARMB 3HTBA 205LA 214LA 1C6BA 1C69A 1L56A 1L87A 1L98A 191LA 1QTCA 108LA 200LA 258LA 1C6NA 4I7TA 201LA 4DAJA 1OYUA 1SX7A 1L34A 1DYGA 1P6YA 1CV1A 1EPYA 1L15A 1L07A 3HUAA 1L27A 1C61A 1L24A 4I7QA 1G0LA 1C6MA 3DN3A 107LA 1L39A 3DN1A 1OVJA 2RBOA 3SB6A 167LA 165LA 1L79A 1P7SA 137LA 1KY1A 1OVKA 229LA 1KS3A 1L76A 2B70A 1QUDA 1C6EA 1SSYA 6LZMA 1LYDA 1L04A 1CV3A 4LDOA 1G1WA 2O7AA 2OTZX 131LA 161LA 1CU6A 1C6GA 1C6JA 1L41A 1QT8A 2F2QA 1L40A 1DYAA 4I7JA 4EKRA 184LA 103LA 1XEPA 3SBBC 1LGXA 3LZMA 1D3FA 1L37A 4EPFA 2LC9A 1L00A 3OE9A 1L05A 2QARC 1KW5A 1QTBA 1P2LA 2IGCA 3HUQA 227LA 142LA 3GUOA 1LWGA 1L23A 166LA 1OVHA 1L06A 3F8VA 3SBAA 4IAPA 176LA 3HU8A 2RBPA 1OV5A 260LA 198LA 1LWKA 3SB5A 1WTHA 3HT7A 4ARMA 1L09A 3ODUA 4EPIA 118LA 2RBSA 1L59A 4I7RA 1G0JA 2A4TA 234LA 1OV7A 1SWZA 114LA 1P37A 178LA 1L17A 2Z6BA 2RAYX 1G0GA 4YXAC 2HUMA 1SWYA 1L89A 120LA 3L2XA 209LA 1D9WA 1D2WA 3HH4A 1G0PA 3HT9A 1XJTA 226LA 140LA 2OEAX 4I7SA 1LI3A 233LA 1L58A 255LA 3SB8A 242LA 3GULA 1QS9A 1C66A 2ANXA 1DYDA 2ANVA 146LA 3G3VA 1CU3A 1KNIA 138LA 111LA 1CVKA 1L92A 1L14A 104LA 1L97A 3K2RA 1L10A 152LA 248LA 3FADA 1L43A 1LLHA 1L53A 244LA 3GUIA 1SSWA 3DN6A 102LA 231LA 4I7LA 4ARPA 1LYJA 2RBNA 3CDQA 4OO9A 177LA 1LI6A 157LA 2RAZX 1L67A 163LA 1L54A 2OE4X 3C7WA 4ARJA 1L0JA 1ZYTA 168LA 1LYHA 3DNAA 2Q9EA 1L80A 239LA 1L94A 1CX6A 2RB1X 1QT3A 2LZMA 3DN4A 1L72A 1L29A 2OTYX 1LYIA 3HU9A 1P56A 159LA 2HULA 1C68A 4EJ4A 4W56A 240LA 1L28A 253LA 3HWLA 1ZWNA 188LA 2Q9DA 3DMVA 211LA 3G3XA 1DYFA 4I7OA 3HT8A 2B72A 215LA 4LZMA 245LA 4EXMA 1L73A 4ARQA 2RH1A 1C60A 1L95A 1QSBA 1DYCA 1P64A 1L81A 1C6AA 1QTVA 3CDVA 3DN2A 2RB2X 1C6FA 1LPYA 190LA 3L64A 150LA 175LA 1QT7A 2B6WA 1OWYA 145LA 3UONA 1L77A 1SX2A 4GBRB 2RBRA 1JQUA 156LA 1C64A 1CUPA 1QUHA 1XJUA 183LA 2NTHA 3C81A 162LA 5I14A 2HUKA 4I7NA 2F47A 2B75A 149LA 3OE6A 1L84A 2B73A 151LA 1L08A 1L19A 1L18A 3HDEA 3C7YA 1L66A 2B7XA 225LA 197LA 1C6LA 2LCBA 189LA 1LGWA 3G3WA 4S0WA 4W52A 218LA 1L38A 1L02A 1CV4A 1L64A 1QT6A 1PQOA 210LA 4ARQB 123LA 160LA 1L61A 4DKLA 3C8SA 1L63A 3V2YA 1C65A 4W53A 1QUGA 1QUOA 1T8FA 155LA 237LA 1L71A 1CU5A 1D3JA 172LA 1L50A 1L42A 1CV6A 1L57A 3JR6A 1T97A 3C83A 224LA 221LA 4ARLA 3HTDA 1JTNA 1L75A 170LA 122LA 2RBQA 4AQNA 243LA 3GUJA 1L69A 2OE7X 1L22A 1L51A 1L45A 1L25A 119LA 3OE8A 2O79A 1C63A 4YX7C 4PJZA 261LA 1C6KA 1PQIA 1L60A 4E97A 2OU9A 4PK0A 1L52A 1L48A 1L32A 4LDEA 220LA 1L93A 1LYFA 4K5YA 3DN8A 1G07A 1L85A 2QB0B 1L82A 1L13A 1QTDA 1P5CA 3HH3A 1LI2A 141LA 1L31A 144LA 3C7ZA 1G0MA 1L20A 1P46A 4EKPA 1QTHA 4W57A 2B6TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
250LA 1IWZA 5JENB 1LMQA 2Z2FA 3EMLA 1LZ9A 2OU0X 1DYBA 5K7OA 1KW7A 4H8XA 4NWEA 1LSZA 1L16A 1PQJA 3OJPA 1OUIA 3P64A 1BQLY 3C8RA 1JTMA 3B0IA 1JJ1A 3DMXA 4WG7A 3HH5A 4TSBA 193LA 4LDLA 1JKBA 2W1XA 4H8ZA 1KIQC 1CTWA 1OWZA 164LA 4H8YA 2HEFA 4H9EA 2CGIA 1L01A 3AYQA 153LA 1L36A 1JJ3A 1CKDA 1REMA 1IIZA 1HFXA 1G0KA 1IC7Y 4WOAA 1L96A 3WVYA 1WQPA 3TXJA 4XJFA 148LE 1L68A 3FI5A 1SLYA 259LA 212LA 1GBXA 1G7LC 4YF2A 1GE1A 4NHPA 1G1VA 7LZMA 4WLXA 1JTPL 1T8GA 1JPOA 1IR8A 4B0DA 4B49A 3WMKA 1LHMA 3GUKA 1IR9A 1DPWA 1D2YA 4B1AA 1LMCA 2CUUA 1LKRA 4IJ4A 3C8QA 1C62A 1D6QA 2YBLA 238LA 3CSQA 1L86A 4GRVA 2B6YA 1L62A 1L74A 247LA 1EL1A 3D3DA 4YEOA 3PDSA 4G4BA 1OUHA 1B5VA 3D9AC 3NY9A 216LA 3GUPA 3RZEA 3RW8A 4N1CC 1GB3A 171LA 1GB9A 5I54A 1C6PA 1IP6A 5LA8A 3DMZA 4NGYA 4I7PA 3FA0A 2OE9X 1B7LA 1C6DA 1QDRA 214LA 4TSCA 4GLAA 4WM4A 4CJ2A 4DAJA 1VFBC 1OUFA 3HUAA 4H9CA 1C6MA 2DQIY 1L39A 1F6SA 3DN1A 1HC0A 2MEGA 1OUAA 1QTEA 1L79A 4HTQA 1JKAA 133LA 1WVVA 1KY1A 2HEBA 1D0MA 3AW6A 1QUDA 2BPUA 1EQ5A 1SSYA 3ULRA 1LYDA 3CT0A 4NG8A 1LYOA 131LA 1L41A 1CU6A 1C6JA 1QT8A 1L40A 1HELA 1BB3A 3BKHA 2Z37A 103LA 1D9UA 4H9BA 1ZV5L 4DD2A 1LGXA 4NHIA 3LZMA 4WL6A 2LC9A 2LYOA 4A7DA 4HJZA 5HLLA 4WLTA 3HUQA 4WM2A 1LZ8A 3GUOA 4RLNA 5FDJA 2G4PA 4J7VA 1WTNA 4OWEA 4DC4A 1L06A 3F8VA 5F81A 1LJKA 4LFXA 5FELA 5M1YA 2I6ZA 1LZBA 1GBYA 2FYDA 4ARMA 1WQNA 4II8A 4I0CA 2YBIA 1L59A 2F30A 2F4AA 4NHQA 1IWVA 1SWZA 4G9SA 1P37A 178LA 2Z6BA 208LA 3RNXA 4EOFA 1G0GA 3TMVA 4YXAC 1B7QA 4N1EI 1L89A 2XBRA 1D2WA 1G0PA 3HT9A 5II3A 2OEAX 1LSDA 4I7SA 1LI3A 1LZCA 4WO9A 3SB8A 1GFUA 4W94A 1LPIA 4PHIA 2BAAA 1L92A 1GBOA 1LLHA 1L53A 3GUIA 3OK0A 1LSEA 1LHLA 3DN6A 1B0DA 4I7LA 1LYJA 4OO9A 2RAZX 3B0OA 1LSBA 163LA 4X3BA 5LVHA 4ET8A 1J1XY 1QUTA 1CX6A 1HEMA 2CJLA 2RB1X 1QT3A 2C8OA 2MEBA 1L29A 1LYIA 1IORA 3A6BY 1LZ5A 4EJ4A 3LHMA 4B4IA 4PJ2C 1IWUA 5FCPA 3HT8A 1YL1X 1JTTL 4Z3MA 1FN5A 2EKSC 2RH1A 4UWUA 3WVXA 1VDTA 4XENA 1C60A 1VDQA 1L95A 5HNCA 2ZILA 4NEBA 1FLYA 1C6AA 4LZTA 1IP3A 1TBYA 4IATA 1LZGA 162LA 2HUKA 1GBSA 2B75A 2XBSA 3GXRA 1UICA 1L84A 151LA 5C6JA 1L08A 4NSGA 1H6MA 1L66A 2B7XA 225LA 1WTMA 5LVIA 197LA 4ETEA 1C6LA 2LCBA 4S0WA 218LA 1NDMC 210LA 2XJWA 3N9EA 4HPIA 4NSIA 4GCDA 4NHSA 1GHLA 155LA 1CU5A 3A3RX 1GDXA 1L50A 3A96A 5F9XA 2Z38A 5C6IA 224LA 1DI5A 4ARLA 4H90A 1YKYX 1L75A 170LA 1IEEA 1OP9B 5I4YA 5B06A 1L69A 1JHLA 5KXSA 1HEOA 1GF8A 5L9JA 119LA 3OE8A 1LZDA 4AXTA 261LA 1G7JC 2OU9A 1L52A 1L48A 3IJVA 1L32A 220LA 1LYFA 2CWIA 4P2EA 4QDNA 1V7TA 1IOSA 1L85A 2DQHY 1QTDA 1JKCA 1P5CA 2EPEA 1XSFA 1L20A 2ZNWY 3W6FA 4W57A 2B6TA 5KJ9A 3A95A 1UIBA 1SQ2L 1LJGA 4N9RA 1LYEA 1UCOA 1KXWA 1C6HA 1GF7A 143LA 1V7SA 1GE4A 4ZPUA 1JEFA 109LA 1L26A 3WPJA 1NQIA 1C6CA 1YIKA 1QT4A 3DKEX 112LA 4NY5A 3WUAA 185LA 1QIOA 232LA 2FYCA 1IR7A 1B9OA 192LA 2I25L 3TXHA 3FE0A 3NYAA 4E3UA 2MEAA 1GE3A 1PZYA 1G7HC 219LA 1CV0A 1B5WA 1CV5A 139LA 3WU7A 1B7OA 5LAGA 2W1MA 1CNSA 1BWJA 251LA 4G4HA 3RUNA 3LYTA 1QDTA 3A6CY 3VW7A 1IWYA 1PQMA 4U3XB 3HT6A 5EBHA 1L88A 169LA 3WXUA 1I56A 1LW9A 2Q0MX 1O23A 126LA 4B4EA 1ALCA 5HMJA 1LSGA 1IP1A 1GF3A 2BQJA 1LJJA 2Z2EA 235LA 5T3FA 1I6SA 181LA 1PQDA 2HEAA 2F32A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 250L A;  1IWZ A;  5JEN B;  1LMQ A;  2Z2F A;  3EML A;  1LZ9 A;  2OU0 X;  1DYB A;  5K7O A;  1KW7 A;  4H8X A;  4NWE A;  1LSZ A;  1L16 A;  1PQJ A;  3OJP A;  1OUI A;  3P64 A;  1BQL Y;  3C8R A;  1JTM A;  3B0I A;  1JJ1 A;  3DMX A;  4WG7 A;  3HH5 A;  4TSB A;  193L A;  4LDL A;  1JKB A;  2W1X A;  4H8Z A;  1KIQ C;  1CTW A;  1OWZ A;  164L A;  4H8Y A;  2HEF A;  4H9E A;  2CGI A;  1L01 A;  3AYQ A;  153L A;  1L36 A;  1JJ3 A;  1CKD A;  1REM A;  1IIZ A;  1HFX A;  1G0K A;  1IC7 Y;  4WOA A;  1L96 A;  3WVY A;  1WQP A;  3TXJ A;  4XJF A;  148L E;  1L68 A;  3FI5 A;  1SLY A;  259L A;  212L A;  1GBX A;  1G7L C;  4YF2 A;  1GE1 A;  4NHP A;  1G1V A;  7LZM A;  4WLX A;  1JTP L;  1T8G A;  1JPO A;  1IR8 A;  4B0D A;  4B49 A;  3WMK A;  1LHM A;  3GUK A;  1IR9 A;  1DPW A;  1D2Y A;  4B1A A;  1LMC A;  2CUU A;  1LKR A;  4IJ4 A;  3C8Q A;  1C62 A;  1D6Q A;  2YBL A;  238L A;  3CSQ A;  1L86 A;  4GRV A;  2B6Y A;  1L62 A;  1L74 A;  247L A;  1EL1 A;  3D3D A;  4YEO A;  3PDS A;  4G4B A;  1OUH A;  1B5V A;  3D9A C;  3NY9 A;  216L A;  3GUP A; 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