2B73A

T4 lysozyme mutant l99a at 100 mpa
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAAAINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Cooperative water filling of a nonpolar protein cavity observed by high-pressure crystallography and simulation
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 61
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2005-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2b73A00
1WTHA 1C64A 1LGUA 1L58A 3SBAA 1CU6A 236LA 214LA 2OE7X 4LZMA 1SSWA 1LYGA 1LYHA 2B75A 1L11A 1L41A 1PQIA 2B72A 195LA 4I7LA 1L93A 1QTHA 2RAZX 189LA 1L48A 126LA 3RUNA 2B6YA 1L84A 3HWLA 1L91A 246LA 235LA 3L2XA 2LC9A 1G1WA 161LA 3G3WA 220LA 1QT8A 3SBBC 1G06A 1L50A 2RBSA 1L83A 1C6KA 256LA 1L35A 211LA 175LA 109LA 200LA 1L87A 1QTZA 3OE6A 3C80A 1L33A 1JQUA 3DN4A 1LWGA 3DN0A 3HT6A 1ZYTA 1C6CA 1C6IA 1L53A 1C6NA 2B6XA 4ARLA 1LYDA 258LA 4ZPUA 1P56A 243LA 2OTZX 4I7SA 1B6IA 3F8VA 1QT7A 1CV6A 218LA 2RH1A 1L12A 1QT6A 1G0MA 199LA 1CTWA 3PDSA 1L47A 169LA 4EJ4A 3DNAA 1D9WA 3JR6A 3GUIA 4I7MA 2B7XA 3SB5A 118LA 3V2WA 4EPFA 2RBRA 3DN6A 2A4TA 181LA 253LA 156LA 3FA0A 1CX7A 7LZMA 4K5YA 1L95A 229LA 1PQKA 201LA 2RB2X 3NY9A 192LA 2OU9A 1C66A 3HT7A 254LA 242LA 112LA 1L75A 2OEAX 1L37A 188LA 1L0KA 1L43A 1TLAA 3UONA 4AQNA 1C62A 3C8QA 162LA 1PQJA 3HU9A 1L82A 1CU2A 150LA 1L24A 108LA 1L85A 1CV4A 1KW5A 4PJZA 1L81A 1QUGA 1OYUA 1SX7A 3CDTA 3C82A 255LA 2Q9EA 158LA 1P3NA 2QB0B 1C65A 1L74A 1L15A 4W53A 113LA 1P64A 1CV1A 138LA 1L14A 1PQMA 1L0JA 2B70A 1OV5A 2OU8A 2B74A 3NYAA 1G0GA 3GUKA 115LA 1L10A 2LZMA 3HH5A 213LA 4EKQA 227LA 2F47A 1LYJA 3DMZA 1L69A 1C6JA 1L07A 1OVJA 210LA 1L73A 1D2YA 3HTDA 1L34A 2B6TA 1L23A 4ARPA 3NY8A 1C6LA 1L54A 1JTMA 4PK0A 1L39A 4W52A 1PQDA 2B73A 172LA 3DMVA 209LA 1L17A 1L79A 1C6QA 1QS5A 4I7PA 1QUOA 1CV5A 245LA 1CVKA 4GBRB 1KY0A 260LA 225LA 217LA 163LA 1DYDA 4EKRA 1OVKA 1CU3A 4W55A 1DYFA 165LA 167LA 1T6HA 184LA 1L25A 1CU0A 141LA 3GUNA 4W59A 155LA 1XJUA 3HDFA 1L56A 119LA 182LA 1L27A 187LA 1KW7A 1L88A 1L51A 1LYFA 2RBPA 174LA 3SB8A 1LYIA 3DN2A 1P6YA 4W58A 1DYBA 1L20A 1L38A 1C6FA 1P37A 1KNIA 191LA 183LA 215LA 1LGWA 139LA 1SX2A 2RBNA 2CUUA 3C8SA 3HUQA 1G0QA 1L21A 3HH3A 3HH6A 4I7TA 1CX6A 1C6GA 1L89A 1L19A 1OV7A 3GUJA 1QSBA 1LYEA 206LA 2OE9X 107LA 1LLHA 1C69A 168LA 3DKEX 1JTNA 1QTBA 197LA 1L96A 1L94A 1L30A 3DN8A 4W57A 129LA 1DYAA 3G3XA 1QUDA 190LA 2OU0X 198LA 3K2RA 232LA 3HH4A 3RZEA 1PQOA 1L65A 4EKSA 2O79A 1D3FA 252LA 3C7ZA 145LA 230LA 3DN3A 3HTFA 1L03A 1L70A 1KS3A 1C6HA 1C6EA 1OVHA 3VW7A 2ANXA 259LA 2HUKA 1D3JA 1G0PA 4W56A 3F9LA 1L86A 239LA 2L78A 3SB9A 1SSYA 140LA 2LCBA 1QTDA 4EXMA 2F32A 251LA 2HUMA 1L05A 1L62A 131LA 2OE4X 5I14A 241LA 3C7WA 114LA 1LWKA 1T8FA 147LA 152LA 2OTYX 1L90A 4W51A 1L04A 1L09A 146LA 1L64A 216LA 1DYCA 1C6BA 164LA 1P46A 249LA 4EPIA 3DN1A 1T97A 125LA 1C6MA 177LA 1L18A 212LA 1C6TA 1L00A 231LA 127LA 222LA 1L16A 3FADA 1SWZA 261LA 262LA 1DYEA 1SWYA 1QS9A 1T8GA 1L29A 1NHBA 1L40A 1CUPA 1C63A 3L64A 1LPYA 171LA 4I7JA 1LI2A 1P2RA 1G1VA 2QARC 1L02A 1C6AA 2RBOA 238LA 1XJTA 1L45A 1D2WA 1C61A 1QT4A 1C68A 1QT3A 143LA 4ARMA 1L76A 2NTGA 2Z6BA 1QSQA 1L49A 1L42A 151LA 1P2LA 1L97A 1L52A 4YXAC 1L80A 1L98A 1L63A 250LA 1T8AA 1CV3A 4ARQB 257LA 3HTBA 1XEPA 224LA 173LA 1CU5A 3SB7A 4I7NA 1L13A 2NTHA 3GUMA 4DKLA 176LA 219LA 3FI5A 1L44A 137LA 3HUKA 3SB6A 4YX7C 2RBQA 1L66A 157LA 1QTCA 3C81A 1L46A 1L67A 4DJHA 4LDLA 3D4SA 3HUAA 1I6SA 1G07A 244LA 1L08A 128LA 1EPYA 233LA 1C60A 2RB0X 1L57A 3OE0A 1L72A 1L68A 1P7SA 120LA 3GUPA 3G3VA 3C83A 1QTVA 1L71A 2ANVA 1P5CA 3HTGA 123LA 4W54A 1C6PA 4LDOA 1L32A 196LA 1L77A 1G0LA 3GUOA 1L92A 1OWYA 248LA 2B6ZA 1L01A 130LA 4ARMB 4I7KA 237LA 159LA 2Q9DA 3OE8A 1L55A 6LZMA 1P36A 1L61A 2B6WA 3V2YA 149LA 3CDOA 1DYGA 4E97A 1L59A 160LA 240LA 2O7AA 228LA 4IAPA 4I7QA 3CDRA 1LGXA 3DMXA 3HT8A 234LA 148LE 1OWZA 4LDEA 3HDEA 3LZMA 4ARQA 103LA 4S0WA 3GULA 4I7OA 1ZURA 104LA 1L60A 3C8RA 1QUHA 1C67A 186LA 1KY1A 185LA 1ZWNA 170LA 166LA 1L31A 142LA 3ODUA 110LA 1L26A 2IGCA 3QAKA 111LA 1D3NA 3CDVA 4DAJA 3HU8A 1L06A 4YXCA 180LA 1G0JA 4OO9A 226LA 3CDQA 4EKPA 1D3MA 1QT5A 1LW9A 178LA 102LA 205LA 2HULA 1C6DA 1LI6A 3EMLA 1L28A 247LA 3C7YA 144LA 221LA 3PBLA 1L36A 2F2QA 1CUQA 4I7RA 122LA 1K28A 4ARJA 1CV0A 3SN6R 1L99A 2RB1X 223LA 2RAYX 4GRVA 1LI3A 2O4WA 1L22A 3OE9A 5LZMA 3HT9A 1G0KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1OUCA 2Z39A 2Z2EA 4B4JA 4NFVA 4DQ7A 1CU6A 1IY4A 2OE7X 3WXTA 1SSWA 1LYHA 2BQLA 2LYZA 4NGYA 4NIJA 2B72A 4I7LA 1GFJA 2Z12A 4N0JA 1GE1A 1L48A 4TX7A 3RUNA 1IC4Y 3HWLA 246LA 1IOQA 1F6RA 1LSBA 3G3WA 5KXSA 2F4AA 1B7LA 1QT8A 5FDJA 4TWSA 1WQRA 256LA 109LA 1GB5A 200LA 3A8ZA 1L87A 1QDTA 5LINA 4MR1A 2YDGA 1LJNA 4ETDA 4GN5C 1GFRA 4ARLA 258LA 1P56A 243LA 208LA 2BQFA 1B6IA 218LA 1L12A 1G0MA 1HERA 3EBAB 169LA 1JJ0A 3DNAA 2BQHA 1GEZA 1HFZA 118LA 4RW1A 5C6LA 3V2WA 3TXIA 4FJRA 4TTDA 181LA 253LA 2DQDY 4H9CA 156LA 1HSWA 5F9UA 2B5ZA 2D6BA 2DQHY 2OU9A 3HT7A 4MCKA 5ILFA 242LA 3P64A 2LHMA 2OEAX 3OJPA 188LA 1L0KA 2BQNA 3N9CA 4YOPA 2CJLA 1PQJA 4B49A 3HU9A 1UIDA 2YBMA 2XQOA 4ETEA 1L24A 1L85A 1YAQA 1LSZA 2HEAA 4Z3MA 3CDTA 3C82A 255LA 158LA 1IP4A 1C65A 2FYCA 2LZTA 1IY3A 1PQMA 1L0JA 2ZYPA 3GUKA 1EQ5A 5APFA 1L10A 4EKQA 4H8ZA 4B4IA 1GF5A 2F47A 1LYJA 1GFKA 1GF3A 1YKXX 3DMZA 154LA 2DQGY 1OVJA 2BQDA 1L73A 4WLXA 2B6TA 2ZNXY 4PK0A 4WO6A 1F6SA 1LSNA 1OUJA 2EIZC 3D9AC 2X0AA 1LJ4A 2GV0A 1L79A 1QS5A 4ANRA 2YBJA 4I7PA 1QUOA 2DQEY 3LYMA 4DC4A 1BHZA 4GBRB 1GB2A 1LZBA 1GF8A 1OVKA 4BS7A 165LA 3GUNA 1IORA 1JWRA 5B1FA 1BB3A 155LA 4NGWA 182LA 3G3BB 1L27A 187LA 2RBPA 1L51A 1LYFA 4QGZA 1XFPL 3A67Y 1P6YA 4GCBA 1DYBA 1L38A 2LZ2A 1LJEA 4J0LA 1LGWA 3C8SA 2CUUA 1YIKA 3HH6A 3GUJA 206LA 1LYEA 1C69A 168LA 1BWIA 3DKEX 1WVUA 4XN6A 193LA 4WM5A 1L96A 4LT0A 5I4YA 1LSPA 3K2RA 1GF4A 1IC7Y 5KXPA 2O79A 1YQVY 252LA 1PS5A 145LA 3HTFA 1LYSA 4XJDA 1C6EA 3VW7A 2F30A 3CB7A 259LA 1VDQA 1G0PA 5HMJA 1L86A 3LYTA 2L78A 1GF7A 1GD6A 1QTDA 1UUZC 2HUMA 5L3IA 3WPLA 1LWKA 147LA 2NWDX 4W51A 1B9OA 5D5FA 1OUIA 1DYCA 249LA 2C8PA 125LA 4KT3A 2PC2A 5LA8A 1UIBA 1C6TA 4DQ5A 5I5QA 1HFXA 3FADA 1SWZA 1CNSA 1LZSA 1YILA 1T8GA 4GCDA 3BKHA 4FDYA 1QSAA 1ZMYL 1UIFA 2QARC 1L02A 3M18B 1D2WA 1LJHA 1LKSA 1LMNA 2BQIA 5FHWA 4G4HA 4Z46A 1GF9A 1C68A 2DKVA 4HJZA 2EPEA 2NTGA 207LA 1WQMA 1G7LC 1P2LA 4WM3A 1QDRA 3AB6A 4RLNA 1CV3A 4ARQB 2IHLA 1CU5A 4GN3A 3GUMA 4UWNA 3FI5A 5E9RA 3RNXA 4H9FA 4HJVA 4YX7C 157LA 4H9IA 3D4SA 3HUAA 1DXJA 244LA 1HENA 4BAPA 2H9KA 233LA 1F0WA 1KIQC 1NDMC 1L72A 5FEKA 4HV2A 4C5FA 3G3VA 3AGIA 1AKIA 2MEHA 133LA 1YKZX 4LDOA 1I1ZA 196LA 1LZGA 1GE0A 3ATOA 5KXTA 1IR7A 1L01A 4GLVA 3OE8A 1ZVHL 4NEBA 1GHLA 4HPEA 3V2YA 1B5YA 3CDOA 3WL2A 4E97A 1IC5Y 4H92A 2MEFA 228LA 3WUNA 1GFVA 3HT8A 1B5WA 1OWZA 1LCNA 4LDEA 3A96A 4S0WA 4QY9A 1JJ3A 4D9ZA 4DWXA 4I8SA 4YENA 1GFTA 2Z38A 166LA 142LA 1L26A 2IGCA 3AGHA 3CDVA 1NBYC 4DAJA 2A7FA 4DD7A 4NG8A 1BVXA 4OWHA 5KXKA 1G0JA 4XADA 4DD2A 3W6DA 4WO9A 1D3MA 5B06A 4OWBA 3QY4A 3EMLA 1LZDA 3TXFA 144LA 3CQLA 1SLYA 3IJVA 4O34A 1K28A 1B5UA 2D91A 2RAYX 1CJ6A 3B0IA 1OUAA 4UWVA 3OE9A 5LXWA 4NSGA 1WTHA 5DN5A 1C64A 5A3ZA 3A3QA 3B0KA 236LA 214LA 4LZMA 2BPUA 3A6CY 1LYGA 2B75A 4LFXA 1IP3A 1OUBA 4LT1A 1L93A 3TMXA 2RAZX 189LA 2W1XA 4NGKA 5IHGA 3L2XA 2BQMA 2F4GA 2LC9A 1IOTA 1G1WA 161LA 1LZCA 2CDSA 1LJJA 1JJ1A 2MEDA 4J7VA 1REMA 3FI7A 175LA 3VWOA 1IP2A 1QTZA 3OE6A 1L33A 2YSSC 3DN0A 1JSFA 5I53A 1L53A 5LVKA 3OK0A 1LZEA 1I56A 2OTZX 1LHHA 4AXTA 3LYZA 5I4WA 1CV6A 1CTWA 1L47A 1JKCA 1HHLA 2HEFA 3TXGA 5B05A 1D9WA 1XSFA 3GUIA 3JR6A 4I7MA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1OUC A;  2Z39 A;  2Z2E A;  4B4J A;  4NFV A;  4DQ7 A;  1CU6 A;  1IY4 A;  2OE7 X;  3WXT A;  1SSW A;  1LYH A;  2BQL A;  2LYZ A;  4NGY A;  4NIJ A;  2B72 A;  4I7L A;  1GFJ A;  2Z12 A;  4N0J A;  1GE1 A;  1L48 A;  4TX7 A;  3RUN A;  1IC4 Y;  3HWL A;  246L A;  1IOQ A;  1F6R A;  1LSB A;  3G3W A;  5KXS A;  2F4A A;  1B7L A;  1QT8 A;  5FDJ A;  4TWS A;  1WQR A;  256L A;  109L A;  1GB5 A;  200L A;  3A8Z A;  1L87 A;  1QDT A;  5LIN A;  4MR1 A;  2YDG A;  1LJN A;  4ETD A;  4GN5 C;  1GFR A;  4ARL A;  258L A;  1P56 A;  243L A;  208L A;  2BQF A;  1B6I A;  218L A;  1L12 A;  1G0M A;  1HER A;  3EBA B;  169L A;  1JJ0 A;  3DNA A;  2BQH A;  1GEZ A;  1HFZ A;  118L A;  4RW1 A;  5C6L A;  3V2W A;  3TXI A;  4FJR A;  4TTD A;  181L A;  253L A;  2DQD Y;  4H9C A;  156L A;  1HSW A;  5F9U A;  2B5Z A;  2D6B A;  2DQH Y;  2OU9 A;  3HT7 A;  4MCK A;  5ILF A;  242L A;  3P64 A;  2LHM A;  2OEA X;  3OJP A;  188L A;  1L0K A;  2BQN A;  3N9C A;  4YOP A;  2CJL A;  1PQJ A;  4B49 A;  3HU9 A;  1UID A;  2YBM A;  2XQO A;  4ETE A;  1L24 A;  1L85 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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