2B75A

T4 lysozyme mutant l99a at 150 mpa
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAAAINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Cooperative water filling of a nonpolar protein cavity observed by high-pressure crystallography and simulation
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2005-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2b75A00
122LA 1L71A 1OYUA 220LA 4I7RA 187LA 1L98A 245LA 2O4WA 3V2WA 230LA 1L85A 177LA 1T8GA 212LA 1L32A 4W55A 228LA 246LA 1CVKA 1G06A 3GUOA 113LA 1OV5A 3FI5A 1C6FA 1P46A 1L63A 4ARQB 4W57A 232LA 3EMLA 4DJHA 3HT7A 3RUNA 199LA 219LA 2RAYX 4W54A 1C62A 226LA 1L86A 1LPYA 1C6IA 1ZWNA 259LA 1L57A 4ARJA 2LCBA 1LI2A 1KNIA 2B6ZA 209LA 242LA 1LGXA 1QUOA 3HH4A 1P3NA 1L13A 176LA 1QT8A 2B6WA 1SX2A 1L03A 2B6XA 2QARC 248LA 1L70A 1WTHA 1L09A 1PQJA 129LA 1L58A 1L92A 1L34A 1PQMA 164LA 1I6SA 1P36A 2RAZX 1L37A 4E97A 3DN4A 1CU0A 3C81A 1C63A 141LA 183LA 1L90A 1L62A 241LA 4W52A 1KY0A 3D4SA 1TLAA 3HU8A 3JR6A 1CU6A 144LA 1L36A 1L84A 1L12A 3SB9A 1CUPA 104LA 217LA 171LA 189LA 120LA 2RBRA 3DN8A 1QUDA 149LA 2RH1A 4I7JA 1P37A 1L53A 3SN6R 191LA 1D3JA 3C80A 1D3NA 2B70A 175LA 4W59A 3PBLA 196LA 3HH3A 1CV3A 1L55A 2NTHA 2RB1X 2IGCA 1L33A 178LA 163LA 240LA 1L96A 4I7QA 1D3MA 1L16A 1KW7A 3ODUA 3SB5A 3OE6A 2Z6BA 1KS3A 1G0JA 131LA 159LA 239LA 4EPIA 1LI3A 1QTVA 1ZYTA 1L93A 1QT3A 152LA 3HT9A 243LA 1C6JA 2B72A 107LA 1L0KA 3GUPA 1L06A 1LYHA 206LA 1CU5A 1LYGA 181LA 213LA 215LA 1L54A 2OE4X 1L28A 2Q9EA 1C6KA 2B6TA 2RBPA 1P64A 1EPYA 3CDVA 1C6TA 2B73A 4EKRA 1QTDA 145LA 3DN3A 216LA 260LA 3FA0A 4I7KA 1L45A 3DKEX 3NY9A 3GUJA 3SB8A 140LA 1L50A 1L07A 147LA 2Q9DA 3SB7A 185LA 182LA 190LA 3HUAA 3F9LA 1B6IA 3HH5A 1OVJA 1L38A 1JTMA 1PQDA 4PK0A 1P6YA 1L88A 1DYAA 1QT4A 3LZMA 4EPFA 1L94A 1JTNA 1L79A 214LA 3RZEA 3CDRA 2OE7X 1T6HA 1L40A 4I7LA 1NHBA 1CX7A 1LGUA 157LA 2F2QA 111LA 3UONA 2QB0B 231LA 4OO9A 4I7TA 1QTHA 4EXMA 1LI6A 2B74A 1L08A 253LA 1C64A 1L46A 1CV0A 128LA 1L39A 2OU9A 3DMXA 161LA 1C6EA 4AQNA 1CV6A 112LA 200LA 108LA 1QUHA 236LA 3SB6A 255LA 1OWYA 2HUMA 170LA 1OWZA 162LA 1DYEA 114LA 1KW5A 1QT5A 1C6CA 238LA 1XJTA 3V2YA 188LA 210LA 1L30A 197LA 1L11A 180LA 1XEPA 4ZPUA 1QTZA 1K28A 2B75A 3HWLA 6LZMA 2OTYX 4ARMA 1OVKA 2RBSA 1L82A 1L67A 4GBRB 2HUKA 3C8RA 1LYFA 1L95A 4DAJA 252LA 3DN0A 2RBQA 3C7YA 2OTZX 1C6DA 1G0LA 1CTWA 1L56A 3DN6A 2CUUA 151LA 1DYCA 184LA 1L24A 2F32A 237LA 1L04A 1L69A 2ANXA 4YXCA 1L25A 3HTDA 143LA 192LA 3HUQA 1C68A 3HDFA 4ARLA 1L02A 1L80A 2ANVA 1T8FA 3L64A 1C66A 1G1WA 1L65A 1LWKA 7LZMA 1L27A 125LA 1L64A 1QT7A 186LA 247LA 4LDOA 3HTBA 4K5YA 123LA 138LA 127LA 139LA 1L99A 1L14A 3GUKA 1LYJA 1C65A 4YXAC 1L21A 233LA 3SBAA 4IAPA 1C6QA 3HUKA 2F47A 1L15A 3PDSA 1L49A 250LA 4W53A 1L35A 1L48A 1QS5A 4W51A 1L44A 1L51A 1L60A 3CDOA 3OE0A 1T8AA 3CDQA 169LA 4I7NA 1SWYA 3SBBC 1L89A 130LA 1LW9A 1L77A 1P2LA 2OU0X 150LA 1L97A 1LLHA 1L18A 1P7SA 155LA 3OE8A 1L61A 1L68A 4I7SA 2RBOA 198LA 1CV4A 3GULA 3GUMA 1DYDA 1PQOA 1OVHA 1CV1A 1L23A 1SWZA 3HT8A 102LA 1C6LA 137LA 222LA 1L00A 1C6NA 3HT6A 1DYGA 126LA 1G0QA 3OE9A 4EKQA 1G0GA 244LA 1L17A 146LA 1XJUA 1PQKA 1G07A 158LA 1P56A 1L73A 1KY1A 142LA 1L74A 2RBNA 1G0PA 4LDEA 2L78A 3HDEA 4PJZA 4ARQA 1CU3A 156LA 1C67A 3DMVA 4I7OA 173LA 1SSWA 201LA 5I14A 1SSYA 174LA 2LZMA 166LA 4ARPA 254LA 1ZURA 1L81A 3G3XA 3G3WA 2OE9X 1L47A 1G1VA 1LYDA 4ARMB 1C6BA 4EKPA 3K2RA 1CX6A 234LA 1CU2A 1CV5A 1D2WA 3L2XA 3C8QA 1PQIA 1L31A 3C83A 172LA 1DYFA 1OV7A 110LA 1LYEA 249LA 227LA 1D9WA 2B7XA 3HTFA 1T97A 211LA 2A4TA 1C61A 1L42A 103LA 1L75A 4I7PA 3CDTA 4W58A 3C7WA 3DNAA 1L91A 261LA 2LC9A 2OU8A 258LA 1D3FA 3NYAA 1QSQA 3QAKA 1QSBA 2O79A 1QT6A 1QTCA 224LA 1G0MA 257LA 109LA 225LA 4I7MA 1L19A 1LGWA 2NTGA 1C6GA 3C8SA 2HULA 1L05A 229LA 3DN1A 1L66A 1L43A 2RB0X 3DN2A 115LA 1DYBA 4EKSA 1SX7A 1CUQA 4S0WA 160LA 2RB2X 1QUGA 3F8VA 1L76A 4YX7C 148LE 1QS9A 3HTGA 1L0JA 4GRVA 4EJ4A 118LA 1L10A 4LDLA 195LA 2O7AA 221LA 3HU9A 1L01A 1L26A 1C6HA 3NY8A 2B6YA 223LA 205LA 4LZMA 1L59A 1C60A 256LA 218LA 1L52A 1L87A 3DMZA 1C6AA 3GUIA 1L29A 3VW7A 1L22A 3HH6A 1C6MA 5LZMA 235LA 1D2YA 1L83A 1LWGA 1P2RA 3C82A 3FADA 119LA 1G0KA 1QTBA 1JQUA 3G3VA 262LA 1L20A 2OEAX 1LYIA 167LA 3GUNA 165LA 1P5CA 4W56A 1C69A 1C6PA 251LA 1L41A 1L72A 168LA 4DKLA 3C7ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2CJLA 1L71A 220LA 4I7RA 4NIJA 1B7LA 5D5FA 4B4EA 1B5UA 1L32A 1WQNA 4WM6A 2G4PA 4TTDA 1HEWA 1C6FA 5ILFA 4ARQB 232LA 2DQCY 3HT7A 6LYTA 5KXWA 199LA 2LZ2A 4W54A 1NQIA 226LA 5KXRA 1FLQA 1LPYA 2MEHA 4I8SA 1LHLA 2B6ZA 242LA 1GB5A 4J1BA 3SP3A 1LGXA 3HH4A 1P3NA 1L13A 1IC5Y 5APCA 1GHLA 193LA 1LMOA 1IP2A 2B6XA 3P64A 1L92A 5IHGA 4B0DA 3C81A 1LSFA 5C6LA 4IJ4A 1N4FA 3B72A 5LYMA 4W52A 4WL6A 2Z37A 1C46A 194LA 144LA 5DN5A 4M6DA 1FBIX 4WM1A 104LA 1HEOA 3DN8A 2Y8PA 2G4QA 2BQIA 3A8ZA 1JJ0A 1LZ8A 1BWIA 4KXIA 4I7JA 1L53A 4NG8A 1D6QA 3C80A 2B70A 175LA 1JTPL 3PBLA 196LA 3WXTA 1OP9B 4IATA 4W94A 2HEFA 1L33A 4AGAA 1OUHA 4I7QA 1GFHA 4DD1A 1D3MA 1L16A 1UUZC 1GFGA 2Z6BA 3TMWA 1XGUC 4EPIA 2W1LA 4LT1A 2YDGA 3HT9A 5B06A 1FN5A 1WQRA 243LA 2LYMA 1E8LA 1VATA 1HFYA 1A2YC 1V7TA 3GUPA 4G4BA 5LINA 215LA 181LA 1L54A 1OUFA 3QNGA 2XTHA 1C6KA 4XJHA 4RW2A 1ZMYL 5I53A 1GF5A 2Z38A 8LYZA 2MEGA 5KXKA 4EMNA 1QTDA 5LA8A 1JEFA 1DKKA 4Z98A 3NY9A 3LYZA 4M4OA 2ZIJA 140LA 4GLAA 2BQHA 1REXA 3HUAA 3F9LA 1EQ5A 3QE8A 3AGIA 1L38A 1JTMA 4PK0A 1P6YA 4ZIXA 4YEMA 4EPFA 214LA 1JTTL 4NWEA 4I7LA 5HNLA 4E3UA 1UIBA 1CX7A 1G7LC 1LGUA 157LA 4H9EA 3UONA 1YL1X 2QB0B 231LA 1IWXA 1UC0A 2Z39A 1OUEA 4HTKA 3DMXA 1C6EA 3LZTA 1IP5A 108LA 3A93A 1LMQA 1LJHA 4BAFA 3N9CA 238LA 3V2YA 197LA 1L11A 4NGKA 1VDPA 1XEPA 3HWLA 2B75A 3W6BA 2BPUA 3WVYA 6LZMA 1XGRC 4ARMA 3C8RA 1NBZC 4H94A 1L95A 4NGJA 5DL9A 1LJKA 4ETCA 2HU3A 1HEMA 2W1YA 5DLAA 3IJUA 1MLCE 1UACY 1CTWA 5LVKA 3DN6A 1GB3A 1CNSA 2MECA 4TWSA 3WXUA 3AW7A 1DYCA 1W6ZA 2HEAA 4NHSA 5HNCA 192LA 3HUQA 1C45A 4HJVA 3HDFA 1DKJA 4OWHA 1C66A 1EQEA 153LA 1LWKA 4HP0A 1L27A 3MGWA 1LZ5A 1QT7A 186LA 1IR8A 4WG1A 4K5YA 4ETEA 1L14A 4H9FA 4GLVA 3AGGG 3PDSA 1FLYA 4W53A 1QS5A 3EO5A 1LZTA 3CDQA 1SWYA 1LMTA 1QSAA 2OU0X 5KXOA 5F81A 4J7VA 1P7SA 155LA 1L61A 2BQBA 2RBOA 1NKHA 5FDJA 1GF8A 2BQNA 4NSHA 5T3FA 1FKVA 5FSTA 4NY5A 4HTNA 1JSEA 4GCBA 1C6NA 1LKSA 4LFPA 4OWEA 1HMLA 1G0QA 1OUCA 5D5CA 1F0WA 1GXXA 4YENA 1XJUA 1QUTA 1P56A 1GE0A 142LA 4LT3A 4LDEA 3W6FA 3HDEA 5B05A 1LJNA 1CU3A 1LZCA 1IP1A 2HU1A 174LA 1L81A 1OUBA 3G3WA 4NSJA 2OE9X 4ARMB 3E3DA 3WVXA 5KJ9A 3K2RA 234LA 1CU2A 1B0DA 2IFFY 1L31A 1EL1A 1D0KA 1IC7Y 1GF0A 1OV7A 249LA 3F6ZA 4YEOA 2A4TA 1C61A 1L75A 1LHMA 1JUGA 1LHHA 1GXV2 261LA 2LC9A 4WM5A 1UIAA 3M18B 1T6VL 1IWWA 5LVHA 2DQEY 4ML7A 4NGZA 2IHLA 3TXIA 5KY1A 1G0MA 257LA 4N0JA 5K7OA 2HUBA 3C8SA 2F4GA 2HULA 2N5ZA 1YKYX 3WUNA 134LA 1L05A 3HBHA 1FDLY 1YAQA 4EKSA 1IP3A 4XJFA 5JENB 1QUGA 1BVXA 1QS9A 3HTGA 1D6PA 5HMVA 118LA 1WTMA 3AW6A 221LA 3CT5A 3HU9A 1L26A 1LZ6A 3NY8A 2B6YA 4B4JA 223LA 1GF3A 256LA 1L87A 1C6AA 3GUIA 235LA 1RJCB 1XSFA 4DC4A 1RE2A 1L83A 4PPOA 5LVGA 3C82A 3FADA 1G0KA 3RNXA 3WU9A 4WM4A 1LYIA 1C69A 2A7DA 1L72A 3CQLA 4NHTA 1EQ4A 1L98A 2O4WA 1LSAA 1JSFA 230LA 177LA 1T8GA 1HEPA 1IP7A 3W6CA 4KPMA 246LA 3N9AA 1CVKA 1QDTA 4PRUA 113LA 1BWHA 3P68A 4W57A 1G7JC 3A94A 1LJIA 2AUBA 3HBDA 4H93A 3LYTA 1GBYA 1LYZA 2Z2EA 4ARJA 1RCMA 1CKFA 5FEKA 2B6WA 1L03A 248LA 2ZYCA 1L09A 3EBAB 1LZEA 1CJ8A 164LA 1I6SA 1LZ9A 2D91A 4U3XB 4CFOA 4OOOA 2RAZX 3TXGA 1FLUA 4E97A 3DN4A 1C63A 2D4KA 9LYZA 2ZIKA 1IOCA 4ET9A 3CSQA 5KKJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2CJL A;  1L71 A;  220L A;  4I7R A;  4NIJ A;  1B7L A;  5D5F A;  4B4E A;  1B5U A;  1L32 A;  1WQN A;  4WM6 A;  2G4P A;  4TTD A;  1HEW A;  1C6F A;  5ILF A;  4ARQ B;  232L A;  2DQC Y;  3HT7 A;  6LYT A;  5KXW A;  199L A;  2LZ2 A;  4W54 A;  1NQI A;  226L A;  5KXR A;  1FLQ A;  1LPY A;  2MEH A;  4I8S A;  1LHL A;  2B6Z A;  242L A;  1GB5 A;  4J1B A;  3SP3 A;  1LGX A;  3HH4 A;  1P3N A;  1L13 A;  1IC5 Y;  5APC A;  1GHL A;  193L A;  1LMO A;  1IP2 A;  2B6X A;  3P64 A;  1L92 A;  5IHG A;  4B0D A;  3C81 A;  1LSF A;  5C6L A;  4IJ4 A;  1N4F A;  3B72 A;  5LYM A;  4W52 A;  4WL6 A;  2Z37 A;  1C46 A;  194L A;  144L A;  5DN5 A;  4M6D A;  1FBI X;  4WM1 A;  104L A;  1HEO A;  3DN8 A;  2Y8P A;  2G4Q A;  2BQI A;  3A8Z A;  1JJ0 A;  1LZ8 A;  1BWI A;  4KXI A;  4I7J A;  1L53 A;  4NG8 A;  1D6Q A;  3C80 A;  2B70 A;  175L A;  1JTP L;  3PBL A;  196L A;  3WXT A;  1OP9 B;  4IAT A;  4W94 A;  2HEF A;  1L33 A;  4AGA A;  1OUH A;  4I7Q A;  1GFH A;  4DD1 A;  1D3M A;  1L16 A;  1UUZ C;  1GFG A;  2Z6B A;  3TMW A;  1XGU C;  4EPI A;  2W1L A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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