2BLXA

Hewl before a high dose x-ray "burn"
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Improving Radiation-Damage Substructures for Rip.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME C
molecule tags Hydrolase
total genus 46
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2005-03-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2blxA00
4M6DA 1GAZA 1MELL 1BHZA 1IP4A 1D0KA 1N4FA 5I54A 4IATA 4XJBA 4Z41A 4DDBA 2B5ZA 4UWNA 1FLYA 4ZEEA 1A2YC 4UWUA 1D0LA 1NKHA 4OOTA 4G4CA 5LXWA 4TWSA 3AW7A 1FKVA 1GBWA 1G7JC 5A3EA 5II3A 2MEAA 1LMPA 5KY1A 1ZVHL 4KXIA 1UIDA 4DD3A 2X0AA 4YENA 3WUMA 1XGTC 1D6QA 1OUIA 194LA 3AJNA 1GFJA 4IJ4A 4U3XB 4CHXA 5LYMA 2BAAA 2LYZA 1GF9A 1IX0A 3AZ5A 1JJ0A 2HUBA 4R0FA 4AGAA 4NHQA 1QDTA 4LT0A 4LYCA 2A7FA 5AMYA 3J6KA 1XFPL 1AM7A 1F10A 5KXRA 1B9OA 3HBDA 2Z2FA 2F4GA 1B7NA 1LJ4A 4NGYA 1GDXA 1DI3A 2G4QA 1HMLA 4OWHA 1LJHA 1CJ6A 3WVYA 3WVXA 1CJ9A 3CT5A 5EBHA 1UBZA 3T6UA 1GFAA 1NQIA 4PRUA 1YROA 3B72A 2Z18A 1IORA 4H8YA 2LYMA 4HTQA 5ILFA 5HNCA 1LZNA 1IC5Y 2CWIA 4DD0A 1LMCA 1BWIA 4DDCA 1P2CC 1RJCB 3B6LA 4HTKA 1VEDA 3ZEKA 2W1MA 1TEWA 3K3TA 4N8ZA 1FDLY 1ALCA 4XJHA 1CKFA 1IWYA 1AKIA 1D0MA 4XN6A 4LT3A 1IP5A 2D4JA 1WTMA 1BB4A 5LYTA 1LSFA 1INUA 1GF8A 1GE0A 3AB6A 3OK0A 5KXPA 1VDQA 2HU1A 1JHLA 2PC2A 3WU9A 1RE2A 4MR1A 1UACY 8LYZA 4QDNA 2MEBA 1DZBX 3CSRA 4WL6A 4XADA 2HEDA 2LZTA 1GBYA 1C7PA 3CSQA 1LSNA 4H93A 5APEA 1GFKA 1REMA 1B7OA 4WLDA 4KL7A 5B1GA 4TSCA 4NHTA 4WM3A 132LA 3RZ4A 4I0CA 2DQFC 2VB1A 4HPIA 1GFHA 4BAPA 1BB7A 1LZYA 2HECA 4OW1A 4GLAA 1GFTA 4NSHA 3W6DA 2MEGA 1WQNA 4XJIA 1YKYX 3P68A 3AYQA 4B49A 3AZ7A 4NHSA 3TXEA 1JKAA 1LJ3A 4ETBA 3QE8A 4H9EA 4NIJA 3ULRA 2FYCA 3N9CA 1GFRA 4YOPA 1I56A 2DQEY 1QUTA 1LZGA 3A90A 1GDWA 5KXSA 1LJIA 4LYOA 1LZ8A 1Z55A 1JKDA 1GEVA 3A94A 3ZVQA 2F30A 1JISA 1J1XY 4HJYA 1LJJA 4NFVA 1GF7A 1RI8B 4J0LA 4R6CA 1B7LA 2ZNXY 5C6IA 3VWOA 2BPUA 4LGKA 6LYZA 2MEFA 1GB0A 1DKKA 4HP0A 2BLXA 2I6ZA 1GXV2 4OWCA 1LZ6A 1CKCA 3TXGA 3RU5A 4NHIA 5I4WA 1DKJA 1JKCA 4DD9A 1G7MC 4N9RA 1B5VA 4FDYA 4LT1A 1GAYA 5T3FA 4ZFPA 4DD1A 5LVJA 3WL2A 2DQGY 1EQEA 3LN2A 1GD6A 1IWUA 2YBNA 4H9AA 4WM4A 2YSSC 1OUBA 1IVMA 1C43A 1UIAA 4DT3A 1JWRA 4TSBA 4DD2A 3W6AA 4EOFA 1IIZA 1CNSA 2D6BA 2LYOA 1B7SA 1FLWA 1J1PY 4I8SA 3A8ZA 1CKDA 2WARA 1LJEA 1TCYA 4DYGA 1LJGA 2DQHY 4BADA 5LA5A 2BQFA 4BS7A 1WVVA 2W1LA 3A67Y 1VATA 1VAUA 4H9FA 3RW8A 1VDPA 3A34A 4ETCA 1GE4A 3AGGG 1W6ZA 5F9XA 1REXA 1YAOA 1KXYA 3WPJA 1TAYA 4NSJA 2BQAA 3G3BB 5LVHA 4HJVA 5DLAA 1GF5A 4NGKA 2HEAA 1QSAA 5L9JA 1NMMA 1TBYA 3MGWA 1LMQA 4HJZA 1B7RA 1RFPA 2ZQ3A 4H92A 1NWGA 5KXYA 3WXTA 5B06A 4RLMA 4WG7A 4G4BA 1IOCA 2EKSC 2ZYPA 153LA 4HSFA 1F0WA 1VFBC 1LKRA 2BQGA 4NG8A 5FSTA 3TMXA 2ZIJA 5LAGA 1LYOA 2C8PA 3AGHA 1XEIA 3ATNA 4O34A 4ETDA 3WPKA 4Z46A 5APCA 4PGJB 5B1FA 193LA 1IR9A 4TX7A 4H94A 2IFFY 1DI4A 1JKBA 5APDA 4LYMA 1IWTA 2MECA 1HF4A 3KAMA 3LZ2A 4GCFA 4QEQA 3TXDA 4CFPA 5DN4A 2BQKA 3WUNA 1DXJA 5D5CA 5E9RA 2G4NA 2YDGA 1BVXA 1BB6A 4GCDA 4DWXA 208LA 1CKGA 1C46A 3A91A 3QY4A 1IR8A 1WQOA 4GN4A 5I5QA 1WQMA 1WTNA 2ZWBA 4WL7A 1HERA 3A3RX 5KXXA 1UIGA 4NGVA 4H9CA 2CGIA 4YM8A 1GE1A 3A92A 4RW2A 1HEWA 1BWHA 2EQLA 2H9JA 2I26L 1I20A 4HPEA 2HEBA 1IY4A 1QDRA 2ZILA 4P2EA 2HTXA 5B59A 1F6RA 4NGOA 1LZRA 1DI5A 2Z37A 1JTPL 1JJ3A 4H8ZA 1LHLA 2IHLA 1LZ1A 3E3DA 1B5UA 5DM9A 4PJ2C 2DKVA 4H9BA 4H90A 2G4PA 5HMJA 1GB6A 1V7TA 3A3QA 3HBHA 4H8XA 4G9SA 4W96A 5KKIA 1HSXA 2XJWA 3IWRA 1IO5A 1C10A 4H9HA 1FLUA 4PRQA 4NGJA 3AZ4A 4XENA 3W6CA 5C6LA 1B5XA 3WMKA 1UIBA 4GCEA 3WW5A 1F6SA 1UIEA 4H9IA 1ZV5L 4D9ZA 1IP3A 5FEKA 3W6EA 1LZ4A 1WQQA 2YBLA 1HEOA 1GPQC 4XJFA 5KXMA 1JTOL 1QSWA 3AW6A 1GHLA 4N0JA 2CJLA 3EMSA 4DC4A 5LVGA 1OUAA 2YVBA 1MLCE 5LIOA 1IC7Y 3F6ZA 5J7CA 1IR7A 1B5YA 1YL0X 3A93A 1LAAA 1LZEA 3P64A 1OQMA 3WW6A 1NBYC 1GFVA 1YAPA 4NSIA 2N5ZA 1LMTA 1LHHA 1REYA 4NGZA 1BB3A 5KXOA 4WM1A 1FN5A 2C8OA 4XYYA 2BQHA 4XJDA 3WXUA 1NDMC 1YILA 2AUBA 4G49A 2CDSA 1LYZA 3IJUA 4LZTA 4N5RA 2LHMA 4N1CC 3W3EA 1IP7A 4WLYA 3A6BY 3BKHA 1IWVA 3FE0A 1BGIA 3GXKA 4GN5C 4B4IA 1LHKA 2BQJA 2YBIA 4PHIA 1AT6A 1J1OY 1GB3A 1T6VL 3ATOA 1OUDA 1SLYA 1JSEA 3AGIA 3WUAA 1LZBA 1UIFA 3J4GA 1HMKA 1HNLA 3A95A 4WMGA 5DN5A 3TXHA 1V7SA 1GF4A 3TXKA 1LZAA 1OUCA 1FBIX 1IEEA 3IJVA 1B2KA 1GEZA 4MCKA 3WU7A 3EXDA 3TXJA 3W6BA 1C08C 1NHEA 4OWAA 134LA 1GWDA 2EPEA 3RNXA 1JITA 3FI7A 5LVIA 3SP3A 3WULA 1G7IC 1LSDA 3LZTA 3LYZA 1LYYA 2BQDA 4II8A 1LZCA 1LSPA 4NSGA 4J7VA 3LYTA 2DQJY 1CKHA 1DQJC 1GFEA 1HELA 1QUSA 1UICA 3P65A 5IDDA 2ZIKA 1IOTA 5FDJA 3G3AB 4IASA 5KKJA 1GB7A 1GFUA 1YQVY 2FBDA 2I25L 3AZ6A 1IOSA 2MEEA 3D9AC 5A3ZA 5FCPA 1XSFA 1ZMYL 3HFMY 5IELA 2Z39A 1LSBA 2W1XA 1RCMA 1LHMA 4OWEA 2XTHA 2MEHA 2DQIY 1GF3A 4ETEA 3A6CY 4WLXA 1ZVYB 4WOAA 1SQ2L 5LYZA 4AXTA 5KJ9A 3WU8A 1GXXA 1G7LC 3B0IA 1IY3A 1REZA 1E8LA 3N9AA 1BVKC 1YIKA 4W94A 5HMVA 3TXBA 1CJ8A 3M3UA 5I4YA 3N9EA 5F16A 1B7QA 5KXLA 1WVUA 5LINA 3LHMA 1UA6Y 2D4IA 1HFZA 1WQPA 1HEQA 2MEIA 4CGEA 1LMAA 1QQYA 3T36A 1YAMA 5ILCA 4LYBA 5KXZA 1JTTL 1KIRC 135LA 4H91A 1OUEA 7LYZA 1IP1A 1LZ5A 4QGZA 2BQLA 4EMNA 3CT0A 5LA8A 1LZTA 4Z3MA 1IWXA 3EO5A 1YANA 1OUJA 2DQAA 1LTMA 3CQLA 1LJFA 4GCCA 4PPOA 1CJ7A 2EIZC 1XGRC 2YBJA 4J1AA 4LYTA 1OUGA 5APFA 4C5FA 1IP2A 3TXFA 1HEPA 1D6PA 5KXTA 2W1YA 5HQ1A 1EQ5A 1LOZA 3A96A 4NWHA 1QIOA 2BQIA 2HU3A 3B0OA 4N1EI 4B0DA 2NWDX 3GXRA 1AT5A 2FYDA 1XGQC 2YBMA 3CSZA 4OWBA 4RLNA 4TTDA 1UC0A 4RDSA 1NDGC 5E4PA 1JEFA 2BLYA 1LPIA 4UWVA 2HEFA 1LZSA 4LT2A 1HEMA 1JSFA 3OJPA 5B05A 1KIQC 2Z38A 4ML7A 1AZFA 3WPLA 1EQ4A 1JIYA 1UCOA 2DQCY 2Z12A 4NEBA 5HLLA 2F4AA 5KXKA 1UIHA 5L3HA 2DQDY 1IWZA 4L41A 4CFOA 4ET9A 2Y8PA 1TDYA 4NGWA 1LSEA 1GB5A 1T3PA 2Q0MX 1I1ZA 1B0DA 5K7OA 3TMVA 5M1YA 4MSTA 1WQRA 1XEJA 4RW1A 4WLTA 3LYOA 1LSCA 4NG1A 4G4HA 1DPXA 4BAFA 4ZIXA 4ETAA 1GF0A 4B4JA 5B07A 4B1AA 2XBRA 3HBEX 1FKQA 3M18B 5D5FA 4ANRA 1LZDA 1JPOA 1LMNA 1IP6A 1LKSA 2YBHA 1GBSA 154LA 4HV2A 5LAFA 1LMOA 2F2NA 5JENB 2FBBA 3W6FA 1UUZC 5LVKA 1LSZA 1XEKA 5F9UA 5DL9A 1KXWA 3WYHA 4HTNA 4A7DA 1OUFA 2HEEA 4J1BA 1GBOA 2BQEA 3QNGA 1HC0A 1QTKA 4TUNA 4Z98A 1YL1X 1JJ1A 1KIPC 1O23A 1LJKA 2A7DA 5I53A 5F14A 1LZ9A 4KPMA 2BQCA 9LYZA 4NWEA 1D9UA 1EL1A 1BQLY 1YAQA 207LA 2H5ZA 1A4VA 3LYMA 4KT3A 4WM5A 3RT5X 1W08A 5KXNA 3TXIA 4DDAA 1LHJA 1YKXX 3D3DA 1C45A 5L3IA 4WO6A 1LSMA 5FELA 4E3UA 4C3WA 2XBSA 2Z2EA 1XGUC 2D91A 1LSYA 4XJGA 133LA 1VDTA 1KXXA 2LZ2A 1IOQA 5C6JA 1BB5A 1DPWA 2DBTA 4WO9A 1GB2A 4WM2A 1B7MA 2BQNA 5KXWA 4M4OA 2ZQ4A 4X3BA 1B5WA 5IHGA 1OUHA 1B5ZA 1LYSA 2BQMA 3BKVA 4OOOA 1OP9B 2ZYCA 4NY5A 5HNLA 1GBZA 4GCBA 4NHPA 1GFGA 2H9KA 5F81A 1LSGA 3P66A 3EBAB 3P4ZA 4HV1A 1GF6A 1YKZX 4GN3A 3TMUA 1G7HC 4H1PA 4B4EA 1GE2A 4YEMA 4ET8A 1FLQA 1IC4Y 4YEOA 3B0KA 1GB8A 1BWJA 3CB7A 4NGLA 3TMWA 4QY9A 1QTEA 5I4XA 1GBXA 1HSWA 4GLVA 3ZVQB 4LFXA 2RSCA 2GV0A 2D4KA 1PZYA 4WM6A 1GB9A 2BQBA 1B7PA 3CT1A 1JUGA 5FHWA 1NBZC 3WH1A 1H87A 4LYZA 1HHLA 1H6MA 2MEDA 1HENA 1LHIA 1LJNA 4FJRA 6LYTA 4LFPA 1NF5A 1HFYA 4YF2A 1IWWA 4DD7A 1HFXA 1VDSA 4WG1A 1LSAA 4CJ2A 1XGPC 2ZNWY 2Z19A 1LCNA 1PS5A 2BQOA 4NGIA 1GE3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1GAZA 4W55A 215LA 1G0MA 5LXWA 4TWSA 1FKVA 1GBWA 5II3A 1UIDA 206LA 2X0AA 3WUMA 1OUIA 194LA 4U3XB 4CHXA 2LYZA 3AZ5A 2HUBA 4NHQA 3HDFA 1F10A 1L38A 1B9OA 4NGYA 1LJ4A 2G4QA 1C68A 4IAPA 3GUPA 3WVXA 1L07A 1L13A 4HTQA 2LYMA 219LA 3CDRA 1OWYA 1LZNA 251LA 1LMCA 1BWIA 1RJCB 2ANVA 1AKIA 1SWYA 3GUIA 1GF8A 1VDQA 4MR1A 1L58A 1C64A 115LA 4XADA 1C6TA 2HEDA 1C7PA 1REMA 4NHTA 132LA 1LW9A 1LZYA 4GLAA 1L14A 2MEGA 4XJIA 159LA 1L00A 1P2LA 1L27A 1G0KA 1C67A 2DQEY 103LA 127LA 1GDWA 1L51A 5KXSA 1C63A 5LZMA 1L39A 1Z55A 1JKDA 1L65A 1L37A 4NFVA 1GF7A 1RI8B 4LGKA 6LYZA 4YXCA 3DN4A 1DKKA 1GXV2 1L87A 2OEAX 4OWCA 3TXGA 1L17A 3RU5A 5I4WA 152LA 1C6EA 3OE6A 4LT1A 5T3FA 3SB6A 4WM4A 1GD6A 2YBNA 1K28A 1C43A 1UIAA 1JWRA 1QUHA 3W6AA 1IIZA 3HT6A 2D6BA 1J1PY 4I8SA 1LJEA 5LA5A 1WVVA 3A67Y 1GE4A 1OVKA 217LA 3K2RA 1REXA 1KXYA 1TAYA 158LA 5LVHA 1GF5A 1TBYA 1LMQA 1RFPA 4H92A 1NWGA 130LA 4G4BA 1IOCA 2BQGA 2RBRA 3WPKA 193LA 1CVKA 2IFFY 1JKBA 2MECA 3LZ2A 3TXDA 2BQKA 5E9RA 4I7OA 1PQIA 1BVXA 187LA 242LA 208LA 1C46A 4WL7A 5KXXA 4NGVA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4M6D A;  1GAZ A;  1MEL L;  1BHZ A;  1IP4 A;  1D0K A;  1N4F A;  5I54 A;  4IAT A;  4XJB A;  4Z41 A;  4DDB A;  2B5Z A;  4UWN A;  1FLY A;  4ZEE A;  1A2Y C;  4UWU A;  1D0L A;  1NKH A;  4OOT A;  4G4C A;  5LXW A;  4TWS A;  3AW7 A;  1FKV A;  1GBW A;  1G7J C;  5A3E A;  5II3 A;  2MEA A;  1LMP A;  5KY1 A;  1ZVH L;  4KXI A;  1UID A;  4DD3 A;  2X0A A;  4YEN A;  3WUM A;  1XGT C;  1D6Q A;  1OUI A;  194L A;  3AJN A;  1GFJ A;  4IJ4 A;  4U3X B;  4CHX A;  5LYM A;  2BAA A;  2LYZ A;  1GF9 A;  1IX0 A;  3AZ5 A;  1JJ0 A;  2HUB A;  4R0F A;  4AGA A;  4NHQ A;  1QDT A;  4LT0 A;  4LYC A;  2A7F A;  5AMY A;  3J6K A;  1XFP L;  1AM7 A;  1F10 A;  5KXR A;  1B9O A;  3HBD A;  2Z2F A;  2F4G A;  1B7N A;  1LJ4 A;  4NGY A;  1GDX A;  1DI3 A;  2G4Q A;  1HML A;  4OWH A;  1LJH A;  1CJ6 A;  3WVY A;  3WVX A;  1CJ9 A;  3CT5 A;  5EBH A;  1UBZ A;  3T6U A;  1GFA A;  1NQI A;  4PRU A;  1YRO A;  3B72 A;  2Z18 A;  1IOR A;  4H8Y A;  2LYM A;  4HTQ A;  5ILF A;  5HNC A;  1LZN A;  1IC5 Y;  2CWI A;  4DD0 A;  1LMC A;  1BWI A;  4DDC A;  1P2C C;  1RJC B; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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