2CWIA

X-ray crystal structure analysis of recombinant wild-type canine milk lysozyme (apo-type)
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KIFSKCELARKLKSMGMDGFHGYSLANWVCMAEYESNFNTQAFNGRNSNGSSDYGIFQLNSKWWCKSNSHSSANACNIMCSKFLDDNIDDDIACAKRVVKDPNGMSAWVAWVKHCKGKDLSKYLASCNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Construction of an expression system of canine milk lysozyme in the methylotrophic yeast Pichia pastoris
rcsb
molecule keywords Lysozyme C, milk isozyme
molecule tags Hydrolase
source organism Canis lupus familiaris
total genus 47
structure length 129
sequence length 129
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2005-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2cwiA00
2Z12A 2LZTA 2YDGA 3K3TA 4WO9A 2IFFY 4N1CC 1IP4A 1WQNA 4WG7A 2HEAA 1GBXA 3P66A 4OWEA 4R0FA 1B7MA 5T3FA 2ZQ3A 3AZ4A 5I4WA 4ZIXA 1IC4Y 1UIFA 5L3IA 2H9KA 4NWHA 5B06A 3BKVA 2DQEY 4DWXA 4M4OA 1VATA 4N0JA 1C10A 1A4VA 1UIDA 2MEHA 3AZ6A 5KXNA 3WPKA 5LA5A 4RW2A 4TSCA 3A93A 2I25L 1YROA 2X0AA 4NHSA 1LMCA 1IWYA 1GB8A 2MEEA 4B4JA 1IX0A 2LZ2A 2ZYCA 3EXDA 3FE0A 3M3UA 4WM4A 5DN5A 2ZIJA 4II8A 4C5FA 3WH1A 1UC0A 1HEOA 1ZMYL 4NGYA 2F4AA 1UIBA 1CKGA 3A95A 1UBZA 1LSZA 5M1YA 3G3BB 4HTKA 1LKSA 1AT6A 1T3PA 1VDPA 4Z46A 1FKVA 2Z19A 2HECA 4B0DA 4WM3A 4XJBA 1LSBA 4BS7A 4AXTA 5FCPA 1O23A 2ZNXY 1JHLA 1LSFA 5LAGA 1IOTA 1LZSA 2BQEA 3AB6A 3WUAA 1DPXA 3WUNA 5IELA 2YVBA 1NWGA 1F6RA 1LTMA 4DD0A 1CNSA 1FLQA 1YKYX 1HC0A 1GHLA 1JEFA 1GPQC 4OWHA 1B5UA 4OW1A 3GXKA 5APFA 1JTTL 4YF2A 2HU1A 4NGZA 1GE3A 1LMTA 1PZYA 2BQHA 4XADA 4B4IA 4QY9A 5KXOA 1JSFA 4QGZA 5D5FA 1UUZC 2F4GA 2W1LA 5L9JA 4U3XB 2BQJA 3HFMY 1IR8A 5KKIA 2XJWA 3CT1A 1HFZA 1WQQA 1LMAA 4DT3A 1IWZA 2LYZA 1WVVA 1GFHA 1LMOA 1W08A 1GFJA 2D6BA 1SLYA 3A96A 1LZGA 4IASA 5DM9A 4GLVA 1UIHA 4GN4A 4EMNA 4BADA 4NIJA 2Z2EA 1YANA 1CKHA 1YKZX 2Z18A 4I0CA 1LHKA 1LZRA 1LZYA 4OWBA 2BQLA 1FLWA 4NSIA 1YL0X 1HELA 3B6LA 2LYOA 1VEDA 1GF5A 8LYZA 4ANRA 9LYZA 4DD9A 3W3EA 1YAQA 3AGHA 3D9AC 1HNLA 4LYMA 3RT5X 2VB1A 1XGUC 3IWRA 2HEFA 2BQGA 2DQCY 2MEBA 3A8ZA 1IP6A 1VAUA 4HTQA 1CJ9A 4ETEA 1VFBC 1LZ5A 3A6BY 207LA 2FBDA 5KY1A 1LZDA 2MEFA 3OJPA 4LYBA 1NBYC 1LZBA 5II3A 4LYTA 1G7MC 1KXWA 1LYOA 2AUBA 4W94A 1IWTA 4N9RA 1GF8A 1LCNA 1QUTA 1RE2A 2BQMA 2Q0MX 1B7RA 1IEEA 1B7QA 1SQ2L 2XBRA 1LZ8A 3CT0A 3P68A 1CJ8A 1UIAA 133LA 3WL2A 5I5QA 4DD2A 4B1AA 5C6JA 4WLDA 4GLAA 3AJNA 1LZNA 1B5YA 4LGKA 1J1OY 1V7TA 2PC2A 1LZCA 1IP3A 4ZFPA 1QQYA 4LT3A 4XN6A 4WG1A 4ET8A 5LVKA 3TXHA 1G7JC 4WO6A 1F10A 3M18B 2DQFC 3OK0A 3AZ7A 1GFKA 1TEWA 4YOPA 1IP1A 5APEA 2BQNA 4CGEA 3A92A 3T6UA 5E4PA 5LAFA 1GBYA 2YBHA 2ZWBA 4NHTA 5LVHA 2YBLA 1KIRC 3D3DA 1IWVA 5FHWA 1RCMA 4TSBA 3B0IA 1FLYA 1QTKA 1B7PA 1LJNA 1GF7A 3RNXA 4WM5A 4LT0A 4DDAA 1GFRA 1GB0A 3CSZA 1C7PA 1LZEA 2HUBA 5FSTA 3QE8A 2DQGY 2A7DA 1HSXA 1LYZA 2BQAA 3A3QA 1YILA 1LSMA 4WM6A 4XENA 5DN4A 4NGLA 2MECA 4YEMA 2YSSC 3IJVA 3CT5A 1GB5A 1D0KA 1LAAA 4MSTA 2BLXA 1TDYA 1E8LA 5C6IA 5A3EA 1C46A 1B5WA 5FEKA 4A7DA 1ZV5L 4NGIA 3TXJA 2YBNA 1LYYA 2ZQ4A 3W6EA 1NHEA 1G7LC 3QY4A 5KXXA 1WQRA 3WULA 2Z2FA 1LMPA 4PJ2C 4XJHA 1QDTA 5LA8A 4OWAA 1KXXA 2G4PA 3CSRA 4WLXA 5LVJA 2HU3A 4J0LA 3B72A 3E3DA 4NSJA 3KAMA 1LYSA 3ULRA 1BQLY 1I20A 2CJLA 4QDNA 2BQIA 153LA 5B07A 1IVMA 1GF6A 4HPEA 5C6LA 1ZVYB 1LHIA 4RW1A 1NKHA 5FELA 1TAYA 1LHJA 4NG1A 3N9EA 2MEIA 1GB6A 3W6AA 3ATNA 4NG8A 4W96A 2MEAA 1JKCA 5I4XA 1CKCA 1LOZA 4H91A 1GAYA 3TXGA 6LYTA 2BAAA 4NGKA 2CDSA 1UIGA 1LSYA 2IHLA 4NSGA 4XJFA 4H9EA 4LYCA 4UWVA 3LZTA 1OUIA 5LVGA 4OWCA 5LYMA 3A6CY 5DL9A 2FYCA 3TXIA 1LZ1A 1LZAA 2DQDY 5F16A 3WU8A 4BAFA 2MEGA 2Z37A 5LXWA 1XEJA 4CFOA 4CFPA 1WTMA 1IWUA 4WMGA 5I4YA 1W6ZA 1DPWA 1F0WA 1MLCE 4OOOA 2BLYA 4HTNA 4J1BA 3TMUA 2CGIA 3N9AA 2DBTA 1EQ4A 3WW6A 208LA 5D5CA 1HEPA 4LZTA 3W6DA 1FDLY 4P2EA 3TXKA 1HEMA 4CJ2A 1LZTA 1JWRA 1NBZC 1IORA 1A2YC 3CQLA 2BQOA 1XGPC 4QEQA 1IR9A 4H9IA 1GE2A 1QIOA 4NSHA 4BAPA 4CHXA 3LYTA 3LYZA 3WU7A 5KXWA 1UCOA 1LHMA 4EOFA 3W6CA 4H93A 1LZ6A 5JENB 194LA 1JSEA 1IOQA 4GCBA 4IATA 1QTEA 1GBOA 1B2KA 1B0DA 1GFAA 4G4HA 4B49A 1GEZA 1GDXA 4N5RA 3N9CA 5IDDA 5LYTA 134LA 1WTNA 4H90A 1GFVA 1GDWA 1OUAA 1PS5A 1B9OA 1HEWA 1YIKA 4H94A 4XJDA 1GBWA 3CB7A 1G7IC 2YBJA 4TX7A 1HF4A 1CKDA 1GWDA 1BWHA 4H9BA 1YAOA 2EPEA 1I1ZA 3HBEX 1BB7A 4HPIA 1LKRA 4ML7A 1LHLA 4PGJB 1RI8B 2EIZC 4GCEA 1HMKA 5KXZA 1YL1X 4KXIA 1BWJA 1OUHA 1GE4A 4G4BA 1REMA 2HEEA 1MELL 2ZNWY 193LA 1XGTC 1JJ1A 2GV0A 3WPJA 1XSFA 1J1XY 1B7OA 1VDTA 3A90A 5J7CA 5EBHA 4WM2A 1WQMA 1B5XA 1BB5A 1IWXA 3B0KA 3GXRA 5B1FA 3RU5A 3SP3A 3WW5A 1B5ZA 2LYMA 4H1PA 5HQ1A 1GXV2 1D0MA 4DD7A 2XTHA 1OQMA 1RFPA 1CJ6A 3FI7A 3HBDA 3P4ZA 1KIPC 1LMNA 2A7FA 3LYOA 5B05A 2C8OA 4DD3A 5KXPA 3HBHA 4LFPA 1KIQC 4J7VA 3TXFA 2I6ZA 4PHIA 4UWUA 3WYHA 4NEBA 3LYMA 2ZYPA 2W1XA 5B1GA 1F6SA 1BHZA 1H6MA 1UICA 3AGIA 5F9XA 4TWSA 1NDMC 2DQIY 1GF9A 4TUNA 5KXLA 1J1PY 2HEDA 1OP9B 5APDA 1GB2A 3AW6A 1IO5A 3A3RX 4L41A 3CSQA 1NQIA 4H8YA 1EQ5A 3EBAB 5KJ9A 4MCKA 1Z55A 1OUEA 1GEVA 1KXYA 2BQBA 5KKJA 3A94A 1HMLA 1HENA 4RLMA 1CKFA 1OUJA 2D91A 1YAPA 1LJFA 1GB3A 3WU9A 1BVKC 5KXTA 4WLTA 4M6DA 1GE1A 1V7SA 1ZVHL 1ALCA 1D9UA 1P2CC 2DKVA 2LHMA 4H9CA 5KXMA 3AZ5A 4H9FA 3WVYA 1DI3A 1JISA 4G49A 3WXTA 3WXUA 4LT2A 4NGJA 4ETDA 1INUA 2EKSC 3B0OA 2W1YA 5AMYA 1LZ4A 1FN5A 1XEIA 2WARA 4X3BA 5DLAA 1TBYA 1JKAA 5HNCA 1GE0A 1BB6A 2FBBA 2ZILA 1OUDA 1VDSA 3A91A 1IP5A 3J6KA 5L3HA 4NWEA 2W1MA 4J1AA 1G7HC 1LSAA 4RLNA 4AGAA 1LSGA 4NGWA 4C3WA 1GBSA 4O34A 1IOSA 3VWOA 2Y8PA 2DQAA 3ATOA 3WPLA 3ZEKA 3ZVQA 5HLLA 3TMXA 1OUBA 4WM1A 5KXRA 4WOAA 5ILFA 1XGRC 1LPIA 1GFEA 3TMWA 4GCDA 4HJYA 4RDSA 1C45A 1B5VA 1BWIA 1NMMA 4NHPA 4YEOA 4Z3MA 4ET9A 4DD1A 4KL7A 1UACY 1JITA 4LYZA 4XJIA 4HV1A 1LJEA 1QSAA 3P65A 3WUMA 1FLUA 1XEKA 1GF4A 4Z41A 1XFPL 1WQOA 4GCFA 1LJKA 4KT3A 4PRQA 1B7NA 2NWDX 4YENA 1JKDA 4NGVA 4FDYA 4DC4A 1FKQA 3TXDA 6LYZA 1LSCA 1REXA 1DI4A 2BQDA 2BQCA 5FDJA 3TMVA 4ETBA 4WLYA 1EQEA 1LZ9A 2EQLA 2D4JA 3T36A 5IHGA 1JTPL 3RZ4A 1D6QA 1IY3A 1HEQA 4DDCA 4OOTA 2DQHY 4TTDA 1JJ0A 5LYZA 1GB7A 4LYOA 1YAMA 1IP2A 1GFGA 1GBZA 2BPUA 1LSNA 5I53A 3BKHA 1GFTA 1B7SA 3LZ2A 1GXXA 1D0LA 3A67Y 132LA 1AT5A 3W6FA 1TCYA 3QNGA 5HMJA 5HNLA 1GFUA 1JTOL 2H9JA 4Z98A 1OUGA 4NY5A 1IIZA 4YM8A 3P64A 4UWNA 4XYYA 4NGOA 1HFXA 2C8PA 4XJGA 5LIOA 2XBSA 3WVXA 1JJ3A 1GD6A 1N4FA 2FYDA 2YBIA 3AYQA 2N5ZA 1BB3A 4WL6A 5F14A 1DKKA 7LYZA 4E3UA 3LN2A 2F30A 2HTXA 4PPOA 1LHHA 4NFVA 1LSEA 1LSDA 1QDRA 3TXBA 5LINA 5ILCA 2Z38A 5B59A 2I26L 2H5ZA 4GN3A 1C08C 4HJZA 5KXYA 4NHQA 1HFYA 2BQFA 1DZBX 4PRUA 4R6CA 154LA 3TXEA 1IY4A 4N1EI 4B4EA 4MR1A 1WQPA 3EMSA 4WL7A 3AGGG 1BVXA 1FBIX 1QUSA 1WVUA 1LJ4A 2D4IA 4FJRA 2G4QA 1IP7A 1YKXX 3LHMA 4D9ZA 1OUFA 1BB4A 2DQJY 1HHLA 1LSPA 1NDGC 1JUGA 4H9AA 2ZIKA 1DQJC 4ZEEA 3RW8A 4H8ZA 3AW7A 4G9SA 2BQKA 1C43A 4HSFA 3WMKA 5KXKA 3IJUA 1GF3A 1BGIA 1LMQA 1IWWA 3G3AB 5K7OA 4KPMA 1JIYA 2RSCA 1H87A 4GCCA 4ETAA 1VDQA 1REZA 1JKBA 4NHIA 5F9UA 1GF0A 4LT1A 1IOCA 1HERA 3A34A 1LJJA 3ZVQB 4LFXA 1LJHA 5A3ZA 1UA6Y 4DDBA 4DYGA 2YBMA 1IR7A 1DXJA 1EL1A 5LVIA 1I56A 1NF5A 5I54A 1LJIA 4G4CA 1YQVY 1REYA 1LJ3A 2Z39A 4H8XA 1AZFA 2MEDA 4N8ZA 4HV2A 5E9RA 1RJCB 4IJ4A 2G4NA 1IC5Y 2CWIA 1LJGA 1OUCA 1B7LA 4HJVA 1AKIA 135LA 1DKJA 1JPOA 1AM7A 3F6ZA 4ETCA 5HMVA 2D4KA 4H9HA 1HSWA 4I8SA 1CJ7A 1QSWA 1DI5A 5APCA 5F81A 1UIEA 3W6BA 2B5ZA 3EO5A 1XGQC 4HP0A 1T6VL 3MGWA 1GAZA 5KXSA 1GB9A 1IC7Y 2F2NA 1D6PA 4H92A 4GN5C 2HEBA 3J4GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L12A 2RBQA 1G06A 2YDGA 2LZMA 170LA 229LA 1WQNA 2HEAA 1C6IA 1B7MA 237LA 3HUKA 1UIFA 5L3IA 4M4OA 5LA5A 1UIDA 3AZ6A 3WPKA 4TSCA 3A93A 1YROA 1IWYA 1L76A 2ZYCA 2HUKA 1HEOA 4ARQB 2F4AA 1UIBA 1UBZA 4I7QA 104LA 4EPIA 1AT6A 1L22A 2Z19A 3SBAA 4AXTA 5FCPA 1C60A 1LSFA 1C64A 3OE8A 1G0MA 196LA 1HC0A 1P5CA 3VW7A 4YF2A 1L85A 1LMTA 1PZYA 4QY9A 5D5FA 1UUZC 3DMVA 2W1LA 3HFMY 2OU9A 1WVVA 2D6BA 1L41A 4GLVA 1L35A 125LA 2Z2EA 2Z18A 1C6NA 1LZRA 4NSIA 161LA 1HELA 3B6LA 1GF5A 8LYZA 9LYZA 1L17A 3W3EA 2VB1A 1IP6A 1CJ9A 4ETEA 1VFBC 189LA 1LZBA 4LYTA 1G7MC 1KXWA 1LYOA 2AUBA 3HTFA 1GF8A 1LCNA 2Q0MX 1RE2A 2XBRA 1CJ8A 133LA 5I5QA 3HH4A 1B5YA 4ZFPA 4XN6A 1L77A 1C6KA 1G7JC 1CU2A 3AZ7A 1GFKA 4CGEA 5E4PA 1LPYA 2ZWBA 2YBLA 1KIRC 1DYFA 1IWVA 4ARPA 128LA 1GF7A 2RAZX 4WM5A 1GB0A 251LA 1C7PA 1L11A 2BQAA 247LA 4YEMA 3IJVA 178LA 219LA 3CT5A 2BLXA 1C46A 5FEKA 4A7DA 131LA 2YBNA 214LA 1G7LC 1L58A 3WULA 1OVHA 1P7SA 2G4PA 1L36A 155LA 4WLXA 3UONA 3KAMA 3OE0A 137LA 2CJLA 4HPEA 1ZVYB 1LHIA 1NKHA 2L78A 1LOZA 1GAYA 2BAAA 1LSYA 1C6QA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2Z12 A;  2LZT A;  2YDG A;  3K3T A;  4WO9 A;  2IFF Y;  4N1C C;  1IP4 A;  1WQN A;  4WG7 A;  2HEA A;  1GBX A;  3P66 A;  4OWE A;  4R0F A;  1B7M A;  5T3F A;  2ZQ3 A;  3AZ4 A;  5I4W A;  4ZIX A;  1IC4 Y;  1UIF A;  5L3I A;  2H9K A;  4NWH A;  5B06 A;  3BKV A;  2DQE Y;  4DWX A;  4M4O A;  1VAT A;  4N0J A;  1C10 A;  1A4V A;  1UID A;  2MEH A;  3AZ6 A;  5KXN A;  3WPK A;  5LA5 A;  4RW2 A;  4TSC A;  3A93 A;  2I25 L;  1YRO A;  2X0A A;  4NHS A;  1LMC A;  1IWY A;  1GB8 A;  2MEE A;  4B4J A;  1IX0 A;  2LZ2 A;  2ZYC A;  3EXD A;  3FE0 A;  3M3U A;  4WM4 A;  5DN5 A;  2ZIJ A;  4II8 A;  4C5F A;  3WH1 A;  1UC0 A;  1HEO A;  1ZMY L;  4NGY A;  2F4A A;  1UIB A;  1CKG A;  3A95 A;  1UBZ A;  1LSZ A;  5M1Y A;  3G3B B;  4HTK A;  1LKS A;  1AT6 A;  1T3P A;  1VDP A;  4Z46 A;  1FKV A;  2Z19 A;  2HEC A;  4B0D A;  4WM3 A;  4XJB A;  1LSB A;  4BS7 A;  4AXT A;  5FCP A;  1O23 A;  2ZNX Y;  1JHL A;  1LSF A;  5LAG A;  1IOT A;  1LZS A;  2BQE A;  3AB6 A;  3WUA A;  1DPX A;  3WUN A;  5IEL A;  2YVB A;  1NWG A;  1F6R A;  1LTM A;  4DD0 A;  1CNS A; 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 2H5Z A;  4GN3 A;  1C08 C;  4HJZ A;  5KXY A;  4NHQ A;  1HFY A;  2BQF A;  1DZB X;  4PRU A;  4R6C A;  154L A;  3TXE A;  1IY4 A;  4N1E I;  4B4E A;  4MR1 A;  1WQP A;  3EMS A;  4WL7 A;  3AGG G;  1BVX A;  1FBI X;  1QUS A;  1WVU A;  1LJ4 A;  2D4I A;  4FJR A;  2G4Q A;  1IP7 A;  1YKX X;  3LHM A;  4D9Z A;  1OUF A;  1BB4 A;  2DQJ Y;  1HHL A;  1LSP A;  1NDG C;  1JUG A;  4H9A A;  2ZIK A;  1DQJ C;  4ZEE A;  3RW8 A;  4H8Z A;  3AW7 A;  4G9S A;  2BQK A;  1C43 A;  4HSF A;  3WMK A;  5KXK A;  3IJU A;  1GF3 A;  1BGI A;  1LMQ A;  1IWW A;  3G3A B;  5K7O A;  4KPM A;  1JIY A;  2RSC A;  1H87 A;  4GCC A;  4ETA A;  1VDQ A;  1REZ A;  1JKB A;  4NHI A;  5F9U A;  1GF0 A;  4LT1 A;  1IOC A;  1HER A;  3A34 A;  1LJJ A;  3ZVQ B;  4LFX A;  1LJH A;  5A3Z A;  1UA6 Y;  4DDB A;  4DYG A;  2YBM A;  1IR7 A;  1DXJ A;  1EL1 A;  5LVI A;  1I56 A;  1NF5 A;  5I54 A;  1LJI A;  4G4C A;  1YQV Y;  1REY A;  1LJ3 A;  2Z39 A;  4H8X A;  1AZF A;  2MED A;  4N8Z A;  4HV2 A;  5E9R A;  1RJC B;  4IJ4 A;  2G4N A;  1IC5 Y;  2CWI A;  1LJG A;  1OUC A;  1B7L A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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