2EIZC

Crystal structure of humanized hyhel-10 fv mutant(hw47y)-hen lysozyme complex
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Immune system/hydrolase
source organism Homo sapiens
publication title Critical contribution of VH-VL interaction to reshaping of an antibody: the case of humanization of anti-lysozyme antibody, HyHEL-10
pubmed doi rcsb
molecule keywords ANTI-LYSOZYME ANTIBODY FV REGION
total genus 47
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2007-03-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2eizC00
4GCDA 2MEEA 4DD0A 2DQHY 2G4PA 4WG1A 4WL7A 1CJ7A 3P66A 2MEAA 1NMMA 4PPOA 1JUGA 4NGKA 4YEMA 1IWWA 5AMYA 1YAPA 2EIZC 4FDYA 1I20A 154LA 2HU1A 4XJIA 2BQHA 2BQLA 2FYCA 2MECA 1EQ5A 3CB7A 1DPXA 4HTQA 3AGIA 4LT1A 4H9AA 5D5CA 3A91A 2LYMA 3CSZA 1IWTA 5C6IA 3WUAA 2BQBA 1GF8A 4MR1A 4N1CC 2Z2EA 4KXIA 1CJ8A 1LZ9A 1LMOA 1N4FA 1MLCE 1UCOA 1JTOL 1HF4A 2BQCA 1RE2A 5F81A 2D91A 2FBDA 4HPIA 2YBMA 1IO5A 3B0OA 3HBHA 2W1MA 5LYMA 1B5VA 4J7VA 5KXSA 3QNGA 4NSHA 8LYZA 5FHWA 1LZGA 133LA 4KL7A 2LZ2A 1IR8A 1GAYA 3TXFA 1IORA 1DI4A 1UA6Y 4B0DA 4LT0A 1RJCB 3F6ZA 3B72A 2ZILA 5LVGA 2HU3A 3TMUA 4P2EA 3WUMA 4H1PA 1TCYA 1IWUA 1BB7A 1XGTC 4OW1A 4R6CA 5KXYA 4YF2A 1IC4Y 2LYZA 3WPJA 4D9ZA 4MCKA 1OUEA 2N5ZA 5B1GA 2HEBA 2DQJY 2GV0A 1ALCA 4NGIA 1IOTA 2LHMA 4OOTA 4NGOA 1LZCA 5LYZA 9LYZA 1ZMYL 2D6BA 1IOSA 3WU9A 3AGGG 4OWCA 5A3EA 2Z18A 1HELA 5KXRA 5LYTA 1UIGA 1LHMA 5HQ1A 1NWGA 1YIKA 2HTXA 1GBOA 1VFBC 3LN2A 1LMTA 4A7DA 1GBXA 4LGKA 1JKAA 1HSWA 1LJGA 1B5ZA 1C7PA 1G7LC 1GFVA 1OUIA 4GN3A 4LYCA 4WM2A 1OUDA 4BS7A 2FYDA 4GLAA 4ZIXA 4H8ZA 1DKKA 5LVJA 1LOZA 1AKIA 4N8ZA 5KXLA 1LMNA 4L41A 1LYYA 1JSFA 3FE0A 3LYOA 4HP0A 4NHQA 3N9EA 3TXIA 4MSTA 4J0LA 6LYTA 5KXZA 4Z98A 3ULRA 2BLYA 1VDTA 1DKJA 3WH1A 4E3UA 5EBHA 5ILFA 1HMLA 4LYBA 1T3PA 4M6DA 4RLNA 3N9CA 4DD2A 4DWXA 2CDSA 3A67Y 2NWDX 4AGAA 1TEWA 1J1PY 3A3RX 1REYA 4HJZA 1FKQA 4H91A 2XTHA 1C43A 1YKZX 4HJVA 4PRQA 1AT6A 2DQDY 4ANRA 3B6LA 5C6LA 5LA5A 1IP7A 1FN5A 4LT2A 5APFA 2I26L 1GF6A 1LHIA 1GFUA 1C45A 1LZNA 1GHLA 1QTEA 4NGZA 2HECA 1HEQA 1LHJA 1G7MC 4GCBA 5B06A 1D6PA 3W6FA 1YILA 1G7IC 2F4AA 4XJHA 1HFYA 5ILCA 4ETAA 1AM7A 1IP6A 3TMWA 1INUA 5F9XA 1BQLY 1KXWA 1GF0A 1GXXA 1NHEA 2BQAA 1AZFA 1REXA 3AZ5A 4B4JA 1H6MA 1SLYA 1D0KA 3WMKA 4WM1A 1O23A 3RW8A 3EO5A 2EKSC 1JSEA 3LHMA 1B7RA 4HPEA 3TMXA 1P2CC 3B0IA 1GFJA 1KXYA 4NG1A 4OWBA 5LAFA 1JITA 4DD1A 2MEFA 1GEZA 1LSYA 1IWVA 1GFKA 1JWRA 1LMCA 2DQIY 2W1LA 1NF5A 4KPMA 4DD7A 3EMSA 3MGWA 4WO9A 4EMNA 1WVUA 1GBSA 5DN5A 1Z55A 2XJWA 1B7OA 4KT3A 3K3TA 5LAGA 5JENB 1OUGA 2H9JA 4XYYA 4Z46A 4H92A 1B7MA 1XGRC 4XJGA 1PZYA 2DQGY 3WU7A 1JJ0A 4H9HA 4QDNA 1EQ4A 2DQAA 4WLYA 2LYOA 1WTMA 1UIHA 2ZYCA 5HNCA 1VDQA 3P64A 1GDXA 5APDA 1E8LA 3QE8A 4G4HA 2W1XA 1HEOA 1GE2A 2D4IA 3BKHA 1LZAA 2BQJA 3TXGA 3P68A 1LKSA 2CGIA 1IOCA 4QY9A 1LZ6A 1A4VA 2CJLA 1VDPA 1XEKA 1GPQC 2MEBA 4NG8A 1YROA 4YENA 3WPKA 3WU8A 1W08A 2BQOA 4FJRA 4WM5A 4I0CA 3ATNA 5L3IA 1NBZC 2HEDA 4OWEA 1IY3A 1CKFA 1GFRA 1NDMC 4G9SA 5APEA 2H5ZA 2BQNA 4PGJB 4Z3MA 5KXXA 4ZEEA 1HNLA 2F4GA 5II3A 1LHKA 1UICA 1IP5A 3B0KA 1LJNA 4RW2A 3A8ZA 3GXKA 1FLYA 5B07A 1UIDA 4RLMA 1GB7A 4YOPA 1OUJA 3RT5X 1LZDA 4WM3A 1HFZA 4TX7A 1FBIX 4GN4A 1H87A 2HEFA 1B5YA 2LZTA 1KIQC 5I54A 1QIOA 1DI3A 1QUTA 1HEWA 2YBLA 1LSNA 4G49A 1LKRA 3AGHA 3ATOA 5KXWA 4C5FA 1XGPC 3IJVA 4TUNA 4WL6A 2YDGA 1HHLA 5FDJA 6LYZA 3A6BY 1LMPA 2EPEA 1WQRA 2AUBA 4NHSA 5KXNA 1LJFA 1D0MA 1NQIA 2DKVA 3EBAB 3TXBA 5KXOA 3P4ZA 2ZQ3A 1LZ1A 3AZ7A 4NGJA 5L9JA 2W1YA 4N9RA 1WQPA 2HEAA 1LZYA 1IP3A 2ZWBA 4YEOA 3W3EA 1F6SA 1LZ8A 1IOQA 4DYGA 4NEBA 5KXPA 1YANA 2MEGA 4NGWA 1JJ1A 1MELL 1CKDA 3WXUA 1BWJA 3LYTA 1F0WA 1LSAA 1VATA 2FBBA 1OQMA 4I8SA 2ZIKA 1YKYX 1ZV5L 1QDRA 1WTNA 1LZ5A 1GEVA 1SQ2L 1JKCA 4TSCA 1LSPA 1GE1A 5FEKA 1LSDA 3WW6A 1JIYA 1GFTA 1D6QA 2PC2A 1GF5A 1OUHA 2C8OA 2ZNXY 1BB3A 3M3UA 4LYZA 1B9OA 2BQGA 5I53A 1BVXA 4HV2A 1WQQA 1ZVYB 5I4XA 3AZ4A 2F30A 4GCFA 4XJFA 1D0LA 1GFAA 1HEMA 1DXJA 4N1EI 1LJEA 1XSFA 4NHIA 5F9UA 1WVVA 5I5QA 3TXDA 4AXTA 4CGEA 4ETBA 2YSSC 207LA 3WVYA 2Q0MX 1IVMA 1B7NA 2BQIA 1LCNA 2G4QA 4H8YA 1T6VL 4IATA 4NY5A 1F6RA 3CT1A 4ML7A 208LA 2DBTA 3M18B 4Z41A 5LXWA 1IC5Y 4W94A 153LA 4X3BA 1IR9A 2Z39A 2HUBA 1LZSA 3A94A 1HMKA 134LA 2BQEA 3WUNA 135LA 4H9IA 3W6EA 1C10A 4DD3A 1B7LA 5F16A 4ETEA 4LT3A 3A3QA 3WYHA 1B7SA 4LFPA 4O34A 3RZ4A 4H93A 2XBSA 3AB6A 1BGIA 1WQMA 4WOAA 3J4GA 4PJ2C 5KKJA 1BWHA 1V7TA 3D3DA 1LSZA 3BKVA 1C08C 1XGQC 3LYMA 4H9BA 3A96A 2ZNWY 194LA 1IWZA 3AYQA 4PHIA 5D5FA 1VDSA 5FELA 4H90A 5T3FA 5IELA 1JTTL 3LZTA 5E9RA 1LZTA 1LJIA 1QSAA 2ZYPA 4RW1A 1REZA 2YBIA 1VAUA 2YBJA 2Z19A 1LZEA 1XEIA 1J1XY 1W6ZA 1IP2A 1BHZA 2BQFA 2A7DA 3J6KA 1XFPL 4IASA 1TDYA 5A3ZA 4DT3A 1LAAA 1B5WA 4HTKA 1B5XA 3T6UA 1GFHA 2BQMA 1DPWA 1HEPA 1IR7A 4CJ2A 1QDTA 3E3DA 1FLUA 1NKHA 4NHPA 1JKDA 4CFPA 1B0DA 1NBYC 4TTDA 1IIZA 1BVKC 2G4NA 1IWXA 5DL9A 4XADA 3W6AA 1BB6A 2CWIA 3RU5A 4DDAA 5FCPA 1LJHA 2A7FA 3IJUA 1GD6A 4DC4A 1QUSA 1LYZA 2I6ZA 1GB8A 1YKXX 4NSGA 5HMVA 4NGLA 1IP1A 1WQNA 1NDGC 1ZVHL 1G7HC 3EXDA 4OOOA 3QY4A 1JISA 5B1FA 1J1OY 1YL0X 2YBNA 3CT0A 4DD9A 1GXV2 1LPIA 3AW6A 2Z12A 4RDSA 3WULA 1LMAA 2MEHA 4LYMA 4M4OA 4R0FA 3TXHA 1BB5A 1LJKA 5F14A 4BADA 1GBZA 4ET9A 1LJ3A 5I4WA 1UBZA 4NGVA 4WLDA 5B05A 1GB0A 5KXKA 4CHXA 4H8XA 2IHLA 5LVKA 1OUCA 2ZQ4A 1PS5A 2YBHA 1CKCA 3OK0A 4GLVA 4TWSA 4WO6A 2BAAA 3A92A 3HBDA 5DM9A 1GWDA 5KXMA 4NHTA 5DLAA 1LZBA 1LJJA 1IWYA 1LJ4A 1HSXA 1IEEA 1FLQA 2Z38A 4HTNA 4NSIA 1I1ZA 3W6CA 4WLXA 2DQFC 5LIOA 3WPLA 4N0JA 2D4KA 1UACY 1HFXA 1GBYA 1KIRC 3VWOA 4ZFPA 1JHLA 3T36A 2I25L 3D9AC 3AJNA 1F10A 1LSBA 1TBYA 5J7CA 3IWRA 1OUBA 1BB4A 4H9FA 3HBEX 1GE3A 1LSFA 2IFFY 1D9UA 193LA 1LTMA 3A90A 3A95A 4B4IA 4PRUA 4ETDA 4QGZA 2YVBA 1QSWA 5HNLA 5FSTA 5HMJA 1IY4A 4NFVA 3TXKA 4HV1A 4ETCA 4W96A 3AW7A 2Z37A 1JEFA 3CSQA 3CQLA 7LYZA 3RNXA 1C46A 1UIFA 4H94A 5LVIA 4DDBA 2C8PA 1RFPA 4LZTA 1YL1X 2BLXA 1UC0A 2X0AA 2F2NA 3ZVQB 4BAPA 1XGUC 3GXRA 2ZIJA 4CFOA 5LA8A 1QQYA 3W6DA 5B59A 5I4YA 4B1AA 1G7JC 3TXJA 4XJBA 1V7SA 4J1AA 4C3WA 4UWVA 2Z2FA 4WM4A 1HENA 4UWUA 5LVHA 132LA 1FKVA 3HFMY 2EQLA 1VEDA 1GF3A 4EOFA 4HJYA 4NSJA 1OUAA 1EL1A 5IDDA 1A2YC 2BQDA 4ET8A 1GE0A 1GFEA 1JTPL 1CNSA 2Y8PA 4NGYA 5L3HA 1YAOA 5KXTA 2H9KA 3WW5A 1BWIA 5IHGA 3A6CY 4WMGA 4B49A 3ZVQA 1RCMA 1CJ6A 3W6BA 3WXTA 1LZ4A 1CKGA 4GN5C 4OWAA 2HEEA 3G3AB 4NWEA 4WM6A 5M1YA 1B7QA 4G4CA 4UWNA 1LHLA 4NIJA 4WG7A 5DN4A 3TMVA 1YAQA 3P65A 1B2KA 1GB5A 4GCEA 1OUFA 1I56A 5KY1A 4NWHA 5LINA 1UUZC 2BPUA 4DDCA 4H9EA 4LYOA 4QEQA 3WL2A 1LYOA 4GCCA 1EQEA 1GF4A 1CKHA 4LFXA 4LYTA 1WQOA 3A34A 4H9CA 3LZ2A 2MEIA 1DI5A 1B7PA 3KAMA 4WLTA 3TXEA 1TAYA 3FI7A 2B5ZA 1UIAA 4U3XB 1LHHA 5K7OA 4IJ4A 1OP9B 1LSEA 1GB6A 1GB9A 1GAZA 1LMQA 1XEJA 2DQEY 4HSFA 4II8A 1JPOA 1REMA 1FLWA 1DZBX 1UIBA 2BQKA 3CT5A 3OJPA 4BAFA 1YQVY 3A93A 3AZ6A 5APCA 3ZEKA 1YAMA 2D4JA 2RSCA 1LSMA 4OWHA 4XN6A 2VB1A 5E4PA 1LSCA 1RI8B 2DQCY 4N5RA 1GF9A 4G4BA 1UIEA 4TSBA 2XBRA 1GF7A 1GBWA 1LSGA 1JKBA 1FDLY 5C6JA 1KIPC 2WARA 3SP3A 5HLLA 2MEDA 1LYSA 4J1BA 1HERA 5KJ9A 3CSRA 3G3BB 5KKIA 1GFGA 4XENA 1B5UA 4XJDA 1CJ9A 1GB2A 1HC0A 3LYZA 1JJ3A 1KXXA 1IC7Y 3WVXA 1DQJC 4B4EA 1GDWA 1IP4A 1QTKA 1AT5A 3N9AA 1LZRA 1GB3A 1IX0A 4YM8A 1GE4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2OU8A 4WG1A 4PPOA 4NGKA 1IWWA 1I20A 1K28A 2BQLA 1L47A 2MECA 4LT1A 3A91A 3CSZA 1IWTA 5C6IA 3WUAA 1GF8A 4N1CC 1LZ9A 5F81A 1L19A 4HPIA 1QTZA 120LA 2W1MA 3HBHA 1B5VA 5KXSA 133LA 4KL7A 3TXFA 1C6PA 1L98A 4PK0A 3F6ZA 3B72A 1EPYA 2ZILA 150LA 3RUNA 128LA 1L82A 2GV0A 4OOTA 1L79A 236LA 1QT5A 1LZCA 5LYTA 1NWGA 2HTXA 1L02A 1OVKA 3SB7A 3LN2A 4A7DA 1QT8A 183LA 1B5ZA 1C7PA 1OUIA 1PQDA 1L41A 108LA 1L59A 5KXLA 1JSFA 3FE0A 147LA 3DMXA 4J0LA 152LA 237LA 5KXZA 169LA 4Z98A 3ULRA 4YXAC 4E3UA 1G0PA 4M6DA 4DD2A 4DWXA 260LA 1CU2A 3A3RX 4HJZA 4HJVA 174LA 1P36A 1P56A 1L71A 2HECA 1QS9A 1CX6A 4GCBA 3W6FA 1L91A 2F4AA 4XJHA 1HFYA 4ETAA 1IP6A 3HTDA 5F9XA 1OVHA 3HH4A 4EXMA 168LA 3HH5A 2F32A 3B0IA 4OWBA 1JITA 4DD1A 1NF5A 1C6JA 3EMSA 2XJWA 1B7OA 5LAGA 1OUGA 1CV6A 4XJGA 1PZYA 2DQGY 2XQOA 1L65A 5HNCA 1GDXA 1E8LA 1C6BA 3QE8A 2W1XA 1GE2A 1LZAA 3TXGA 3P68A 1LYGA 3C7ZA 4QY9A 1W08A 5APEA 4G9SA 4PGJB 1HNLA 1LHKA 1UICA 5B07A 1UIDA 3NY8A 4YOPA 3CDOA 1HFZA 4TX7A 2O4WA 1FBIX 1C65A 4GN4A 1H87A 171LA 4EKRA 1KIQC 5I54A 112LA 1L11A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4GCD A;  2MEE A;  4DD0 A;  2DQH Y;  2G4P A;  4WG1 A;  4WL7 A;  1CJ7 A;  3P66 A;  2MEA A;  1NMM A;  4PPO A;  1JUG A;  4NGK A;  4YEM A;  1IWW A;  5AMY A;  1YAP A;  2EIZ C;  4FDY A;  1I20 A;  154L A;  2HU1 A;  4XJI A;  2BQH A;  2BQL A;  2FYC A;  2MEC A;  1EQ5 A;  3CB7 A;  1DPX A;  4HTQ A;  3AGI A;  4LT1 A;  4H9A A;  5D5C A;  3A91 A;  2LYM A;  3CSZ A;  1IWT A;  5C6I A;  3WUA A;  2BQB A;  1GF8 A;  4MR1 A;  4N1C C;  2Z2E A;  4KXI A;  1CJ8 A;  1LZ9 A;  1LMO A;  1N4F A;  1MLC E;  1UCO A;  1JTO L;  1HF4 A;  2BQC A;  1RE2 A;  5F81 A;  2D91 A;  2FBD A;  4HPI A;  2YBM A;  1IO5 A;  3B0O A;  3HBH A;  2W1M A;  5LYM A;  1B5V A;  4J7V A;  5KXS A;  3QNG A;  4NSH A;  8LYZ A;  5FHW A;  1LZG A;  133L A;  4KL7 A;  2LZ2 A;  1IR8 A;  1GAY A;  3TXF A;  1IOR A;  1DI4 A;  1UA6 Y;  4B0D A;  4LT0 A;  1RJC B;  3F6Z A;  3B72 A;  2ZIL A;  5LVG A;  2HU3 A;  3TMU A;  4P2E A;  3WUM A;  4H1P A;  1TCY A;  1IWU A;  1BB7 A;  1XGT C;  4OW1 A;  4R6C A;  5KXY A;  4YF2 A;  1IC4 Y;  2LYZ A;  3WPJ A;  4D9Z A;  4MCK A;  1OUE A;  2N5Z A; 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 4B49 A;  3ZVQ A;  1RCM A;  1CJ6 A;  3W6B A;  3WXT A;  1LZ4 A;  1CKG A;  4GN5 C;  4OWA A;  2HEE A;  3G3A B;  4NWE A;  4WM6 A;  5M1Y A;  1B7Q A;  4G4C A;  4UWN A;  1LHL A;  4NIJ A;  4WG7 A;  5DN4 A;  3TMV A;  1YAQ A;  3P65 A;  1B2K A;  1GB5 A;  4GCE A;  1OUF A;  1I56 A;  5KY1 A;  4NWH A;  5LIN A;  1UUZ C;  2BPU A;  4DDC A;  4H9E A;  4LYO A;  4QEQ A;  3WL2 A;  1LYO A;  4GCC A;  1EQE A;  1GF4 A;  1CKH A;  4LFX A;  4LYT A;  1WQO A;  3A34 A;  4H9C A;  3LZ2 A;  2MEI A;  1DI5 A;  1B7P A;  3KAM A;  4WLT A;  3TXE A;  1TAY A;  3FI7 A;  2B5Z A;  1UIA A;  4U3X B;  1LHH A;  5K7O A;  4IJ4 A;  1OP9 B;  1LSE A;  1GB6 A;  1GB9 A;  1GAZ A;  1LMQ A;  1XEJ A;  2DQE Y;  4HSF A;  4II8 A;  1JPO A;  1REM A;  1FLW A;  1DZB X;  1UIB A;  2BQK A;  3CT5 A;  3OJP A;  4BAF A;  1YQV Y;  3A93 A;  3AZ6 A;  5APC A;  3ZEK A;  1YAM A;  2D4J A;  2RSC A;  1LSM A;  4OWH A;  4XN6 A;  2VB1 A;  5E4P A;  1LSC A;  1RI8 B;  2DQC Y;  4N5R A;  1GF9 A;  4G4B A;  1UIE A;  4TSB A;  2XBR A;  1GF7 A;  1GBW A;  1LSG A;  1JKB A;  1FDL Y;  5C6J A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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