2F32A

Xray crystal structure of lysozyme mutant l20/r63a liganded to ethylguanidinium
Total Genus 64
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
64
sequence length
175
structure length
175
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSINAAKSELDKAINAAKSELDKAIGANTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Guanidinium derivatives bind preferentially and trigger long-distance conformational changes in an engineered T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 64
structure length 175
sequence length 175
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2005-11-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2f32A00
3CDVA 1D3FA 3FADA 1L39A 1JTMA 1L18A 2F2QA 2NTHA 3L2XA 4I7NA 4EKRA 1L73A 178LA 4PJZA 3DN8A 4YXCA 4ARQB 231LA 2O4WA 2RB0X 1OV5A 1SWYA 139LA 1LYIA 1CTWA 1ZWNA 174LA 1D9WA 1P56A 1DYFA 2OE9X 3HUQA 170LA 1L38A 1CU6A 3DN6A 240LA 2RB2X 1DYCA 137LA 1G0JA 4S0WA 3CDOA 3VW7A 142LA 118LA 1QUOA 3K2RA 4W52A 129LA 1LPYA 3GUOA 245LA 144LA 2LZMA 5LZMA 1QS5A 1L79A 1KY0A 1L26A 1CU2A 252LA 2B6TA 3DNAA 2B6XA 1LGXA 163LA 1C68A 211LA 226LA 3GUJA 1SX2A 1G07A 3JR6A 1L17A 1L70A 7LZMA 2RH1A 3HT6A 3LZMA 1KW7A 1OVHA 220LA 1L57A 216LA 1QUDA 1L35A 1L53A 1LYDA 248LA 217LA 1PQKA 2Z6BA 4IAPA 1L97A 1QSBA 230LA 253LA 1D2WA 212LA 180LA 3HH5A 156LA 3GUIA 243LA 1PQMA 2B6WA 3HWLA 4EPIA 3DN2A 168LA 225LA 4I7RA 2B7XA 1P36A 1LI2A 4I7OA 1C6IA 3HU8A 3EMLA 4W53A 1ZURA 1P2RA 1KS3A 1PQJA 1L51A 1KY1A 3DMZA 3GUNA 1LLHA 166LA 189LA 1C6AA 108LA 1L65A 2QARC 3OE0A 1D3JA 1L22A 1C62A 1DYAA 200LA 227LA 2LCBA 3V2YA 1SX7A 1QUHA 2RAYX 152LA 1L99A 1CV0A 1XJTA 127LA 3SBAA 1L90A 183LA 4EPFA 2OE4X 251LA 1L98A 262LA 1L76A 1D3NA 1WTHA 3HUAA 3SBBC 1D2YA 3G3VA 3OE9A 103LA 4W55A 157LA 184LA 1PQIA 115LA 1C63A 1L69A 3V2WA 1TLAA 4I7KA 1DYDA 1P3NA 3DKEX 1OVJA 3FA0A 1L0JA 1L96A 1CV5A 3RZEA 1T6HA 2O7AA 1G0MA 1C67A 3C80A 3C8QA 120LA 1C6PA 1XJUA 2B75A 229LA 3GUKA 5I14A 2RBOA 4W57A 1QT5A 1P37A 1CU3A 3G3XA 1L32A 1L82A 1OWYA 2ANXA 1L49A 1P2LA 1LW9A 160LA 215LA 4W54A 196LA 1D3MA 119LA 1EPYA 150LA 1L36A 1T8GA 176LA 1OV7A 1QTDA 4W51A 244LA 111LA 3C82A 3DMVA 1L23A 1L00A 1L43A 185LA 223LA 1OWZA 1LYGA 1L89A 172LA 2Q9EA 2O79A 3C8RA 1CUQA 235LA 1PQDA 158LA 6LZMA 234LA 4ARMB 1C6QA 2B70A 2NTGA 242LA 239LA 4ZPUA 1L05A 149LA 255LA 155LA 4DAJA 1L52A 3SB8A 3GULA 3L64A 1L59A 4W56A 1L14A 3FI5A 1L77A 256LA 122LA 219LA 1L01A 1L04A 3C81A 3PDSA 1L91A 241LA 3CDTA 1L40A 1LWKA 197LA 110LA 4ARLA 1L93A 2ANVA 1C69A 3CDQA 199LA 2L78A 107LA 1L62A 1L94A 1QT8A 2RBPA 181LA 112LA 4I7MA 164LA 4ARQA 1LGUA 1SSYA 3NYAA 1L67A 2B6ZA 1L0KA 2QB0B 1B6IA 2OU8A 2OTYX 1L55A 238LA 4EKQA 1L56A 210LA 159LA 3DN1A 3C7YA 1JTNA 1QSQA 161LA 2A4TA 171LA 1LYFA 1G0KA 3C7ZA 3HTFA 249LA 1L92A 125LA 188LA 1P7SA 1L33A 260LA 2B6YA 3C8SA 1P6YA 1CV3A 259LA 3UONA 1L60A 1G0PA 131LA 1L15A 1G1VA 3DN0A 1L30A 3NY8A 1L86A 3SB7A 2RBNA 3CDRA 1QTBA 228LA 123LA 2RB1X 3ODUA 4DJHA 4K5YA 165LA 1JQUA 4PK0A 1L85A 1L72A 1L27A 232LA 224LA 1LYHA 1L06A 254LA 4I7JA 1C64A 192LA 4LDEA 1C6TA 3SN6R 1L29A 1L10A 247LA 3RUNA 1KNIA 3F9LA 1LYEA 2IGCA 1L24A 4W58A 3HU9A 3HTGA 1L63A 3DN3A 3HT9A 148LE 2OE7X 4I7QA 3F8VA 4OO9A 198LA 261LA 3HUKA 258LA 173LA 1L13A 187LA 1L25A 2CUUA 233LA 1QTZA 182LA 1L71A 1G0QA 1L11A 1P64A 3G3WA 1G0LA 138LA 1LWGA 3C83A 1CV6A 1CU0A 1C66A 4I7PA 1CX6A 1L88A 206LA 4EKSA 1L08A 1NHBA 1L03A 1P46A 1L61A 126LA 1K28A 1CV4A 1L37A 3D4SA 1L02A 3HTBA 2HUMA 1L48A 1QT7A 2OU0X 222LA 1DYGA 218LA 177LA 2RAZX 4YXAC 1L83A 130LA 1C6BA 250LA 1L07A 1C6CA 1SSWA 2RBQA 237LA 236LA 3OE8A 104LA 201LA 3QAKA 4LZMA 205LA 3GUPA 4EXMA 2HULA 1L09A 4AQNA 4EKPA 2B72A 143LA 1L19A 4GRVA 113LA 1T97A 1C6KA 1G0GA 221LA 1L84A 1L16A 3GUMA 1L95A 1T8AA 4I7TA 151LA 1L75A 190LA 3HT8A 1I6SA 1G1WA 1QTHA 1CUPA 213LA 3DN4A 246LA 3NY9A 1C6HA 1KW5A 2F32A 1QS9A 146LA 214LA 1LI3A 114LA 1CU5A 1C61A 1PQOA 3HH3A 4I7LA 140LA 1L47A 1L66A 2HUKA 1QUGA 1L28A 1L44A 1SWZA 1ZYTA 141LA 1L42A 4ARMA 4E97A 1DYEA 2Q9DA 162LA 1C6MA 1L50A 2OEAX 3HDFA 1C6FA 3HT7A 3PBLA 1QT3A 1L12A 1LI6A 145LA 1C60A 1L41A 1OYUA 1L80A 4W59A 191LA 1L45A 175LA 1L34A 3SB5A 1C6DA 1OVKA 1QTCA 4LDLA 4ARPA 3DMXA 1CVKA 1G06A 2B74A 2RBRA 4I7SA 169LA 1C6JA 147LA 1QTVA 1L81A 1DYBA 1L46A 1L54A 3C7WA 1L64A 1L20A 2OU9A 186LA 1L31A 1LYJA 2F47A 3HH4A 128LA 3HH6A 1C6LA 4YX7C 1QT6A 4EJ4A 1L68A 209LA 2RBSA 109LA 1L74A 2LC9A 1CV1A 1L21A 195LA 3OE6A 102LA 1L87A 1T8FA 3SB6A 1C65A 1CX7A 4DKLA 1QT4A 257LA 167LA 4ARJA 1L58A 4GBRB 1C6GA 1C6EA 3SB9A 1LGWA 4LDOA 2B73A 1C6NA 1XEPA 3HDEA 3HTDA 2OTZX 1P5CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1FLWA 1D3FA 1JKCA 1L39A 4NHTA 1HELA 5A3EA 1JTMA 207LA 2Z37A 178LA 1LZYA 4YXCA 3TXFA 4WO6A 1CTWA 1ZWNA 208LA 2BAAA 4G49A 1P56A 1OUAA 2OE9X 2HEFA 1NHEA 3DN6A 240LA 2RB2X 4AXTA 1GFGA 1DYCA 1YAQA 2W1MA 5T3FA 144LA 1JUGA 1LZDA 1L79A 1KY0A 2BQGA 1CU2A 5LAFA 2Z12A 252LA 3DNAA 5KJ9A 3WU9A 4ML7A 1L17A 7LZMA 1V7TA 4ETDA 1KW7A 2BQOA 216LA 3A92A 2LYZA 5D5CA 5F9XA 1GBYA 5J7CA 1PQKA 2ZNWY 1F0WA 1VDSA 1QSBA 2MEHA 4WMGA 1GF5A 180LA 3GXKA 4C5FA 1AT6A 1GHLA 1BVKC 3HWLA 1GFVA 153LA 4NY5A 5KXOA 1CJ7A 4W53A 4GN3A 1ZURA 1GB2A 3DMZA 1LLHA 1C6AA 2ZQ4A 5LINA 3OE0A 1C62A 3V2YA 1QUHA 5LVJA 3TXKA 1RCMA 1L90A 4EPFA 5KXSA 5FELA 1UIHA 4LYTA 1GE2A 1L98A 4DQ7A 3OE9A 4WL7A 103LA 1LSEA 1B5WA 4LT0A 3TMUA 2F4GA 4WLXA 3QE8A 133LA 1MLCE 1TLAA 1QDRA 1G7IC 1DYDA 2BQHA 3DKEX 1GEZA 1OVJA 3FA0A 1L0JA 1C43A 2O7AA 3A93A 1C67A 1GF3A 3GUKA 9LYZA 1P37A 1OWYA 2BQLA 1P2LA 1LJ3A 3LZ2A 8LYZA 119LA 3WU7A 1I1ZA 5I54A 1QTDA 4WM6A 3C82A 1L23A 1VDPA 1CKFA 4N9RA 1L00A 4TSBA 5C6LA 4QDNA 4XADA 172LA 2Q9EA 3C8RA 2YBJA 5FSTA 1C7PA 235LA 6LZMA 234LA 3WPLA 4ARMB 1C6QA 1LJJA 4J0LA 3B6LA 239LA 5K7OA 4WOAA 155LA 4RW2A 3RZ4A 4DAJA 1BB4A 1D6PA 3GULA 5KKJA 2ZNXY 1DXJA 1GB9A 5IELA 1OUCA 256LA 1E8LA 1GB6A 1IWXA 3P68A 4H8XA 4XJBA 1UUZC 4OWAA 1HMLA 3ATOA 2Z2FA 2Y8PA 3CB7A 5B06A 197LA 3TXIA 3CDQA 2L78A 4H9BA 1GFEA 2LYOA 4LFXA 3B0IA 1B7NA 1IOQA 1JTPL 4I7MA 1JPOA 1SSYA 2BQFA 1L67A 3NYAA 1IWZA 1CKDA 2QB0B 3WVYA 1L55A 1QSAA 1ALCA 1OUFA 2CJLA 2A4TA 2DQEY 2CGIA 1FLYA 1G0KA 3C7ZA 1GBSA 5B07A 3TXJA 3A90A 3C8SA 1OUJA 1VEDA 1CV3A 2N5ZA 5FCPA 3UONA 1GFUA 1L60A 2A7DA 131LA 3DN0A 1UACY 2FBDA 2RBNA 1JEFA 1QTBA 123LA 4DDCA 3ODUA 4DJHA 4K5YA 2WARA 4PK0A 4ZFPA 2YBLA 1VAUA 254LA 2XBSA 4OWBA 4I0CA 4LDEA 3BKVA 4WM1A 4H9FA 1TCYA 4HTKA 5L9JA 3AYQA 1GDWA 4XN6A 247LA 2HU3A 1KNIA 4XJGA 3WYHA 1LYEA 3EXDA 1YROA 3HU9A 5HMJA 1XGQC 1N4FA 3DN3A 2OE7X 1IWUA 4MCKA 4I7QA 3TXEA 1F10A 1OUBA 1AKIA 1WQNA 1GF4A 1QTZA 1L71A 4XJDA 4DWXA 1QTKA 1HEMA 1L11A 138LA 1YQVY 1WQQA 1L08A 4H9EA 2DKVA 1HMKA 1P46A 4NGOA 1HFYA 4PPOA 1QT7A 194LA 1DYGA 218LA 177LA 2DQAA 2I26L 2RAZX 1L83A 1SSWA 2AUBA 3QAKA 1HC0A 1BWIA 4LZMA 4YOPA 1HHLA 4A7DA 2B72A 5FHWA 4WG1A 4OW1A 221LA 4WL6A 1IP7A 3OJPA 1L75A 3HT8A 1G1WA 1CUPA 1C6HA 3A8ZA 214LA 1B7SA 4H9AA 1C45A 1C61A 4I7LA 140LA 4L41A 3T6UA 1GB5A 2ZQ3A 4ARMA 5II3A 2Q9DA 2OEAX 3HDFA 3HT7A 4B0DA 1LSGA 3A3RX 1C60A 1L41A 1JTTL 7LYZA 1EQ5A 1L45A 1LZ9A 1L34A 4M4OA 3DMXA 1LZEA 4GCDA 1G06A 3G3AB 4I7SA 4NEBA 3F6ZA 1C6JA 147LA 4PGJB 2YDGA 3QY4A 1WVUA 4HV2A 186LA 4YX7C 1LYJA 1C6LA 1L68A 209LA 1YKYX 1L74A 2Z19A 3AGIA 4WLYA 1T8FA 1ZV5L 4HV1A 1B5UA 3CT0A 1C6GA 3D9AC 1C6NA 1YKXX 1P5CA 3WW6A 4BAFA 1GXXA 3FADA 4HSFA 3WL2A 2F2QA 4EKRA 1ZVHL 4ARQB 2HEDA 1LHLA 4J7VA 2O4WA 4TWSA 3P66A 4NHQA 1OV5A 1H6MA 139LA 2XJWA 4GCCA 1LJIA 4OWHA 1D9WA 1DYFA 1QQYA 3HUQA 1KIRC 1WQRA 1L38A 4XENA 4M6DA 3TXGA 1CU6A 4OWCA 2W1YA 3WUAA 4ET9A 1YILA 1G0JA 4HJYA 4S0WA 3CDOA 1LZAA 4W52A 2YBHA 5B1GA 1YL0X 1J1OY 1QS5A 1IY4A 4NHIA 4G4BA 5D5FA 2B6TA 163LA 1HENA 1C68A 1B5XA 1G07A 3JR6A 3HBEX 1L70A 4H93A 4IJ4A 1GWDA 2NWDX 3B0KA 1L57A 4KL7A 3W6EA 4TUNA 5I5QA 1O23A 1TDYA 1L53A 4OWEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1FLW A;  1D3F A;  1JKC A;  1L39 A;  4NHT A;  1HEL A;  5A3E A;  1JTM A;  207L A;  2Z37 A;  178L A;  1LZY A;  4YXC A;  3TXF A;  4WO6 A;  1CTW A;  1ZWN A;  208L A;  2BAA A;  4G49 A;  1P56 A;  1OUA A;  2OE9 X;  2HEF A;  1NHE A;  3DN6 A;  240L A;  2RB2 X;  4AXT A;  1GFG A;  1DYC A;  1YAQ A;  2W1M A;  5T3F A;  144L A;  1JUG A;  1LZD A;  1L79 A;  1KY0 A;  2BQG A;  1CU2 A;  5LAF A;  2Z12 A;  252L A;  3DNA A;  5KJ9 A;  3WU9 A;  4ML7 A;  1L17 A;  7LZM A;  1V7T A;  4ETD A;  1KW7 A;  2BQO A;  216L A;  3A92 A;  2LYZ A;  5D5C A;  5F9X A;  1GBY A;  5J7C A;  1PQK A;  2ZNW Y;  1F0W A;  1VDS A;  1QSB A;  2MEH A;  4WMG A;  1GF5 A;  180L A;  3GXK A;  4C5F A;  1AT6 A;  1GHL A;  1BVK C;  3HWL A;  1GFV A;  153L A;  4NY5 A;  5KXO A;  1CJ7 A;  4W53 A;  4GN3 A;  1ZUR A;  1GB2 A;  3DMZ A;  1LLH A;  1C6A A;  2ZQ4 A;  5LIN A;  3OE0 A;  1C62 A;  3V2Y A;  1QUH A;  5LVJ A;  3TXK A;  1RCM A;  1L90 A;  4EPF A;  5KXS A;  5FEL A;  1UIH A;  4LYT A;  1GE2 A;  1L98 A;  4DQ7 A;  3OE9 A;  4WL7 A;  103L A;  1LSE A;  1B5W A;  4LT0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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