2FBBA

Crystal structure analysis of hexagonal lysozyme
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The structure of the hexagonal crystal form of hen egg-white lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
molecule tags Hydrolase
total genus 46
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2005-12-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2fbbA00
5HNCA 3W6BA 3W6DA 1JTTL 4WG7A 5APFA 1TEWA 1OUDA 3WPLA 5I4XA 3WUNA 1PS5A 3ZEKA 4ANRA 1GE2A 4RW2A 1NHEA 5KXNA 1B7OA 2MEEA 4RLNA 4HPIA 3B0OA 5EBHA 2BQOA 1D0KA 1LMOA 1HMLA 3CSQA 1BHZA 1LYSA 5DN4A 1LYOA 4XJBA 4Z46A 1LKRA 1LZ6A 2FYCA 2Z19A 1BB7A 1IOQA 1GE1A 1JSFA 4KL7A 3BKHA 1JKAA 4DD3A 1XEIA 1GF0A 1GEZA 3AB6A 4J1BA 5I4WA 1BWJA 1XGTC 1HEWA 3A34A 1D6PA 1LMTA 4GN3A 1GB9A 3W6FA 4NG8A 4HJZA 5KY1A 4NGVA 3AYQA 2C8OA 4GCBA 3RW8A 3WVXA 5F81A 2YBMA 2LZ2A 3BKVA 3TMXA 1P2CC 1NDGC 153LA 4G9SA 3QY4A 1UBZA 1SLYA 4WLXA 3GXRA 3RZ4A 2ZWBA 2CWIA 3AGGG 1YKYX 3CT5A 5AMYA 5C6IA 1F6RA 1GBZA 1DI3A 4Z3MA 1I1ZA 1JSEA 4WM2A 4UWNA 1VDQA 1GBWA 1DZBX 1YQVY 1QSWA 4B0DA 4J7VA 2MEHA 3J4GA 4YEOA 3CT1A 1TBYA 1XFPL 2FYDA 1GFEA 2BQNA 3AZ4A 1NKHA 4J0LA 4NHTA 5B1FA 1D0LA 1RJCB 1JEFA 3AW6A 3A94A 1G7JC 1GF7A 4ETAA 9LYZA 1LMQA 1OUEA 1EQ5A 1YKXX 2HTXA 1GB8A 4N1CC 5HQ1A 1GEVA 1UIFA 1CKFA 3T6UA 1GB2A 3GXKA 5F14A 4NHPA 4H9HA 5IHGA 3WU8A 3K3TA 1GFTA 1XSFA 3AZ6A 3MGWA 5KXLA 3TXJA 1LZ8A 2HEDA 2GV0A 3A8ZA 1GBXA 3N9CA 1REMA 4WLDA 2NWDX 1IORA 3ZVQA 4B4IA 4NGOA 1IIZA 5KXYA 5HNLA 3WUAA 1WQPA 1LSFA 1ZMYL 1HNLA 2HU3A 5F9UA 3LZ2A 1HC0A 1IOTA 1B5WA 1DI5A 1JIYA 1FBIX 1OUIA 2ZYPA 5KXSA 3W6CA 2XBSA 1NWGA 5DL9A 1GDXA 2H9KA 1SQ2L 4L41A 132LA 4LFXA 4NWEA 2VB1A 4N9RA 1JISA 4D9ZA 1GHLA 1YILA 1IP2A 5ILCA 1QDTA 1C46A 2MEIA 4C3WA 1LMNA 1YANA 2BQKA 5ILFA 5HLLA 4WL6A 4WL7A 1QUSA 2F30A 1B2KA 2H9JA 4OWHA 4WLYA 207LA 1CNSA 3TXHA 2ZIKA 4YF2A 4PJ2C 3IJVA 1YL1X 4GN5C 1J1XY 1HEOA 1KXWA 1WVVA 1JUGA 3CQLA 193LA 3WVYA 2MEFA 1VEDA 4WO9A 4U3XB 2BQCA 2CDSA 1AM7A 4QDNA 2LHMA 3A95A 5IDDA 5I5QA 3KAMA 2DQIY 4WM3A 5F9XA 1IC4Y 4DWXA 1TDYA 1UACY 1WTNA 1LCNA 2YBNA 3IJUA 5A3ZA 3AGHA 4IASA 1DI4A 4LYMA 2AUBA 4ETEA 4WMGA 5LVHA 2YSSC 4OOOA 4NHSA 1GE4A 3A96A 3WPJA 4B49A 4Z41A 2BQDA 3B6LA 1CKHA 2DQCY 1AKIA 1QSAA 4NGJA 4BADA 1FLUA 1LMPA 5KXMA 1GFRA 4E3UA 2XBRA 4I8SA 4OW1A 1IR9A 1GPQC 3P4ZA 1AT6A 1GBSA 1GXV2 1FKVA 1Z55A 1A2YC 5D5CA 4IATA 5LIOA 4HJVA 5C6JA 4DC4A 1LZBA 2BQAA 1NDMC 1LZGA 4LYCA 3A90A 3RNXA 2I25L 1EQEA 1E8LA 4NFVA 4G49A 1LJKA 1KIRC 4GN4A 1BWIA 1F6SA 1LYZA 5LAFA 3FI7A 4XN6A 2BAAA 3TXBA 5HMVA 3LYOA 2BQBA 1NBYC 2BQFA 1ZVHL 1FLYA 2Z37A 6LYTA 4TSCA 1GFKA 2BQHA 2F2NA 2MEBA 1GFJA 1I56A 4LT2A 1GAZA 1B7MA 2ZQ3A 4XYYA 4NWHA 3TXDA 1VATA 3B0IA 4H94A 3G3AB 1IEEA 4H8YA 1LSEA 4Z98A 4ETDA 1IP3A 1B7LA 1GE0A 5E4PA 3TMWA 4LT0A 1AZFA 4TX7A 1CJ9A 1FN5A 1UICA 2EKSC 1B7NA 4FJRA 1ZV5L 2BQEA 4WM6A 5K7OA 1DKKA 4YOPA 1NF5A 1LHIA 4H9BA 1F10A 5FDJA 3IWRA 3AGIA 1XGPC 5J7CA 1LSZA 4CFOA 4HV1A 3A93A 1LSYA 2XTHA 4DDCA 2EIZC 1LKSA 4HTQA 1LZTA 5LXWA 2BLYA 1CJ6A 2ZILA 3TMUA 1WTMA 5LINA 3ATNA 5B06A 5B59A 3A3QA 3B72A 4GLVA 1B5XA 1UA6Y 1W6ZA 1IWWA 5KXZA 3HFMY 134LA 4PRQA 3LHMA 1LZCA 1V7SA 3E3DA 3TXKA 5B05A 2MECA 4WM5A 2BLXA 1JJ3A 4H8XA 1DPXA 1WQMA 1F0WA 1KIQC 2ZNWY 4XADA 4BAFA 4TWSA 2LYMA 4LYOA 4DYGA 3WW5A 194LA 1CJ7A 4H8ZA 4RLMA 1HSXA 2IHLA 1FKQA 1XGQC 3HBHA 3N9AA 4FDYA 4P2EA 4QEQA 1JKBA 4M6DA 2EPEA 5DN5A 1GFUA 1HFXA 2YBLA 2DQGY 4WM4A 1JHLA 4LGKA 1AT5A 2BPUA 5C6LA 1OUAA 2IFFY 1WVUA 1B7SA 1C43A 2MEGA 3CB7A 4NHQA 1MELL 1QQYA 2LZTA 2YDGA 1B5YA 1REYA 3WH1A 2DKVA 208LA 4PHIA 1LSCA 4DD1A 1GF6A 2YVBA 1OUHA 1VAUA 5FELA 1D0MA 4PPOA 3EBAB 1CKCA 3OK0A 1UUZC 1HMKA 1DPWA 2A7DA 3QE8A 1C08C 3A3RX 1GF3A 2ZNXY 1I20A 2H5ZA 4H9CA 4NGWA 1D9UA 4PRUA 5APDA 1C10A 4YEMA 3EO5A 1UIGA 1IP4A 2I6ZA 3WL2A 1GB6A 1IP6A 3FE0A 1GB0A 1GF8A 4W96A 2A7FA 3ZVQB 1GF5A 1BB4A 2DQJY 1W08A 1BB6A 1IY3A 2MEDA 1B5UA 1BVXA 1IWXA 2D4KA 2G4PA 1GXXA 2XJWA 4KXIA 4H1PA 1A4VA 1IP5A 1HEMA 3HBEX 1HEQA 1LYYA 5FSTA 4XJDA 1IY4A 1NQIA 1LZ9A 1G7HC 1LHHA 1INUA 2BQGA 3RT5X 2HEAA 3W6AA 4N1EI 3EMSA 2F4AA 3P64A 1XGUC 1UIHA 1B7QA 4NSHA 1VDTA 4OWBA 1LZEA 3WXUA 1JJ0A 1LZAA 1VFBC 3CSRA 2I26L 3M3UA 5KXXA 3OJPA 1IWTA 4QY9A 5KXOA 1BQLY 7LYZA 1LZ5A 4OWEA 1GB5A 4H9EA 1JJ1A 1HEPA 4LT1A 4C5FA 2HEEA 4H90A 4DT3A 4NGYA 2RSCA 1JWRA 3WPKA 1OUJA 2YBHA 1HF4A 2W1LA 5LAGA 1HERA 3ATOA 4PGJB 2BQIA 2BQLA 1LSDA 4EOFA 2ZIJA 1LHJA 3WU9A 4NSJA 3AZ7A 1DXJA 4MSTA 1G7LC 4M4OA 1LPIA 4LYBA 5LYTA 1RI8B 2HEBA 1EQ4A 4UWUA 5JENB 4LZTA 1WQOA 4B1AA 1FDLY 2YBIA 4G4BA 4G4HA 2BQJA 4X3BA 4GCCA 1OUGA 5F16A 5M1YA 4ET9A 4OWAA 1GDWA 4HTNA 4R6CA 5KKJA 2Z18A 5B07A 5FEKA 8LYZA 1BGIA 2Z12A 1O23A 3B0KA 4NG1A 5I53A 5A3EA 5IELA 2WARA 4MR1A 1QUTA 1GE3A 1HELA 4RW1A 4RDSA 2BQMA 1JTOL 1ZVYB 5APEA 1B9OA 2N5ZA 3A6CY 3A92A 3TMVA 2Z39A 1KIPC 2DQFC 1B5ZA 1CKGA 2LYOA 4G4CA 4NGIA 3T36A 4ZIXA 1KXXA 4CFPA 2HECA 5LA8A 2W1YA 4WO6A 3W6EA 1IX0A 1IC7Y 4ZFPA 1OUCA 2Z2EA 3AZ5A 5KXPA 2HU1A 2DQHY 1LJGA 1TCYA 3J6KA 2G4NA 135LA 1XEKA 1LMAA 2ZQ4A 1XEJA 1UIAA 2D6BA 4H9IA 1LJIA 1UIDA 1IR7A 3G3BB 1LZ4A 1B7RA 1RCMA 2Z2FA 4TUNA 5FHWA 1GBYA 1KXYA 5DLAA 5L3IA 2MEAA 2G4QA 2DBTA 4NHIA 3CSZA 1PZYA 5KXRA 4GCEA 1IP7A 1T6VL 3WW6A 4CGEA 1LJEA 1LZYA 2DQAA 1D6QA 1TAYA 5KXTA 4NEBA 1GD6A 1YAPA 4XJFA 3RU5A 1IWVA 4NY5A 2HEFA 1MLCE 2D4IA 6LYZA 1LSBA 4MCKA 4H91A 3P68A 1LJNA 1C7PA 1LOZA 4XENA 3TXIA 1GFVA 1UCOA 1YAOA 1IR8A 1GBOA 1LHMA 1OUFA 4LT3A 3A6BY 4HJYA 4IJ4A 3LYMA 4TSBA 1DQJC 3TXEA 1YAMA 4CJ2A 5L9JA 1JKCA 4BAPA 5LYMA 4B4EA 1IO5A 3SP3A 1OP9B 3WULA 3P66A 1B7PA 2F4GA 1WQRA 1LSGA 1OUBA 2CJLA 2DQDY 5E9RA 2D91A 4H92A 4DD0A 1LJJA 2C8PA 1LZ1A 1T3PA 1YIKA 3EXDA 1V7TA 3HBDA 5T3FA 1VDPA 2ZYCA 4GCDA 1JTPL 2Y8PA 1BB3A 3D3DA 1NMMA 4HV2A 4OWCA 4XJIA 1JPOA 5L3HA 4DDAA 3LZTA 4WG1A 5KXWA 154LA 5LVIA 4XJHA 1LZNA 4EMNA 4NIJA 1BB5A 1FLWA 4A7DA 4R0FA 5II3A 4HTKA 1QTKA 4QGZA 3TXFA 2W1MA 5KJ9A 3LYTA 4NSGA 1YROA 3WUMA 2CGIA 1LJFA 2PC2A 4N8ZA 3LYZA 4DD2A 1J1OY 3A91A 5LVJA 4ZEEA 1IWYA 1LSPA 1WQQA 1RFPA 1IWZA 4ETCA 1YL0X 1CKDA 1LAAA 1LHLA 1LZDA 4N0JA 5D5FA 3ULRA 4B4JA 1B5VA 3AW7A 4I0CA 1GAYA 3QNGA 1QTEA 1QDRA 1OQMA 1FLQA 1HHLA 1G7MC 1LJHA 1N4FA 4W94A 3M18B 4II8A 1GFGA 1LZRA 2B5ZA 4GCFA 5LA5A 3A67Y 3P65A 4HP0A 1B0DA 1GF9A 3W3EA 4KT3A 4LFPA 4UWVA 1LMCA 4N5RA 4NSIA 4CHXA 2DQEY 1LJ4A 1GB3A 4ML7A 3TXGA 1UC0A 5LVGA 1IWUA 4OOTA 5KKIA 1LSMA 2D4JA 1GB7A 1HFZA 1NBZC 1UIEA 4H9AA 1YAQA 4HSFA 3WYHA 1IVMA 2HUBA 1JKDA 1LJ3A 1LTMA 1WQNA 1ALCA 2W1XA 1RE2A 1REZA 4NGKA 1H87A 4NGZA 1C45A 1QIOA 2FBBA 4H93A 1JITA 1GFAA 2Q0MX 4J1AA 4LYTA 5LYZA 4ETBA 1HENA 1BVKC 4YENA 4BS7A 4DDBA 4LYZA 2Z38A 4WOAA 5LVKA 4ET8A 1LZSA 1GWDA 2X0AA 5I54A 1GFHA 4NGLA 1H6MA 4O34A 3AJNA 3F6ZA 4AXTA 1IOCA 4DD7A 4H9FA 4XJGA 133LA 1G7IC 1UIBA 1XGRC 2FBDA 3VWOA 5HMJA 5I4YA 4TTDA 3CT0A 1VDSA 1DKJA 5APCA 1IP1A 1BWHA 2EQLA 1HSWA 4HPEA 1HFYA 2LYZA 3WXTA 5B1GA 4DD9A 5FCPA 3N9EA 5KXKA 1EL1A 1LHKA 5DM9A 1LSAA 4KPMA 2YBJA 1J1PY 1LSNA 1YKZX 1REXA 4WLTA 1IC5Y 1IOSA 1CJ8A 3D9AC 3WMKA 4WM1A 4AGAA 3LN2A 4YM8A 3WU7A 4GLAA 1GF4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3W6DA 5APFA 1TEWA 1PS5A 1GE2A 4RW2A 2MEEA 1L41A 248LA 4ARQB 2BQOA 1LYSA 5DN4A 1LZ6A 1BB7A 1JSFA 1L28A 1JKAA 2O7AA 1XGTC 256LA 3NY8A 178LA 1D6PA 4GN3A 1GB9A 5KY1A 3WVXA 3GUMA 2LZ2A 1P2CC 1QS5A 4WLXA 3AGGG 1DI3A 3OE0A 4UWNA 1VDQA 245LA 1P2LA 244LA 3CT1A 1GFEA 4NHTA 5B1FA 2O4WA 4LDLA 1L17A 1GF7A 1LMQA 1OUEA 1EQ5A 5HQ1A 1GEVA 4H9HA 1XSFA 4EJ4A 3C8SA 237LA 1QSBA 1ZURA 2HEDA 3HUQA 1T8FA 2NTGA 2RBNA 3HDFA 1L38A 5KXYA 1WQPA 1LSFA 1HNLA 127LA 5F9UA 1QT5A 1IOTA 1L74A 218LA 1FBIX 2ZYPA 1L63A 4W55A 3JR6A 1GDXA 5ILCA 1QDTA 3C7ZA 1LMNA 4WL6A 4OWHA 1LI3A 1CNSA 3SB9A 4I7LA 1YL1X 4ARMB 1KXWA 4WO9A 1AM7A 3A95A 5IDDA 5I5QA 182LA 1LYGA 190LA 1IC4Y 4DWXA 1LCNA 1DI4A 2AUBA 5LVHA 3WPJA 1GE4A 3A96A 2RH1A 1QTHA 1CKHA 1C6HA 1AKIA 3GUKA 1FLUA 1GFRA 1L99A 3P4ZA 2OTZX 1Z55A 3HTGA 5LIOA 4HJVA 112LA 1L20A 5C6JA 247LA 3RNXA 238LA 1EQEA 1PQMA 3CDQA 1L87A 1KIRC 4XN6A 3LYOA 137LA 1NBYC 1FLYA 1L07A 6LYTA 4TSCA 1GFKA 1KNIA 1L98A 223LA 1L03A 4H94A 4Z98A 5E4PA 159LA 4TX7A 2EKSC 212LA 4WM6A 1DKKA 4YOPA 1L84A 1F10A 3IWRA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5HNC A;  3W6B A;  3W6D A;  1JTT L;  4WG7 A;  5APF A;  1TEW A;  1OUD A;  3WPL A;  5I4X A;  3WUN A;  1PS5 A;  3ZEK A;  4ANR A;  1GE2 A;  4RW2 A;  1NHE A;  5KXN A;  1B7O A;  2MEE A;  4RLN A;  4HPI A;  3B0O A;  5EBH A;  2BQO A;  1D0K A;  1LMO A;  1HML A;  3CSQ A;  1BHZ A;  1LYS A;  5DN4 A;  1LYO A;  4XJB A;  4Z46 A;  1LKR A;  1LZ6 A;  2FYC A;  2Z19 A;  1BB7 A;  1IOQ A;  1GE1 A;  1JSF A;  4KL7 A;  3BKH A;  1JKA A;  4DD3 A;  1XEI A;  1GF0 A;  1GEZ A;  3AB6 A;  4J1B A;  5I4W A;  1BWJ A;  1XGT C;  1HEW A;  3A34 A;  1D6P A;  1LMT A;  4GN3 A;  1GB9 A;  3W6F A;  4NG8 A;  4HJZ A;  5KY1 A;  4NGV A;  3AYQ A;  2C8O A;  4GCB A;  3RW8 A;  3WVX A;  5F81 A;  2YBM A;  2LZ2 A;  3BKV A;  3TMX A;  1P2C C;  1NDG C;  153L A;  4G9S A;  3QY4 A;  1UBZ A;  1SLY A;  4WLX A;  3GXR A;  3RZ4 A;  2ZWB A;  2CWI A;  3AGG G;  1YKY X;  3CT5 A;  5AMY A;  5C6I A;  1F6R A;  1GBZ A;  1DI3 A;  4Z3M A;  1I1Z A;  1JSE A;  4WM2 A;  4UWN A;  1VDQ A;  1GBW A;  1DZB X;  1YQV Y;  1QSW A;  4B0D A;  4J7V A;  2MEH A;  3J4G A;  4YEO A;  3CT1 A; 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 3QNG A;  1QTE A;  1QDR A;  1OQM A;  1FLQ A;  1HHL A;  1G7M C;  1LJH A;  1N4F A;  4W94 A;  3M18 B;  4II8 A;  1GFG A;  1LZR A;  2B5Z A;  4GCF A;  5LA5 A;  3A67 Y;  3P65 A;  4HP0 A;  1B0D A;  1GF9 A;  3W3E A;  4KT3 A;  4LFP A;  4UWV A;  1LMC A;  4N5R A;  4NSI A;  4CHX A;  2DQE Y;  1LJ4 A;  1GB3 A;  4ML7 A;  3TXG A;  1UC0 A;  5LVG A;  1IWU A;  4OOT A;  5KKI A;  1LSM A;  2D4J A;  1GB7 A;  1HFZ A;  1NBZ C;  1UIE A;  4H9A A;  1YAQ A;  4HSF A;  3WYH A;  1IVM A;  2HUB A;  1JKD A;  1LJ3 A;  1LTM A;  1WQN A;  1ALC A;  2W1X A;  1RE2 A;  1REZ A;  4NGK A;  1H87 A;  4NGZ A;  1C45 A;  1QIO A;  2FBB A;  4H93 A;  1JIT A;  1GFA A;  2Q0M X;  4J1A A;  4LYT A;  5LYZ A;  4ETB A;  1HEN A;  1BVK C;  4YEN A;  4BS7 A;  4DDB A;  4LYZ A;  2Z38 A;  4WOA A;  5LVK A;  4ET8 A;  1LZS A;  1GWD A;  2X0A A;  5I54 A;  1GFH A;  4NGL A;  1H6M A;  4O34 A;  3AJN A;  3F6Z A;  4AXT A;  1IOC A;  4DD7 A;  4H9F A;  4XJG A;  133L A;  1G7I C;  1UIB A;  1XGR C;  2FBD A;  3VWO A;  5HMJ A;  5I4Y A;  4TTD A;  3CT0 A;  1VDS A;  1DKJ A;  5APC A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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