2G4NA

Anomalous substructure of alpha-lactalbumin
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
122
structure length
122
Chain Sequence
EQLTKCEVFRELKDLKGYGGVSLPEWVCTTFHTSGYDTQAIVQNNDSTEYGLFQINNKIWCKDDQNPHSSNICNISCDKFLDDDLTDDIMCVKKILDKVGINYWLAHKALCSEKLDQWLCEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title On the routine use of soft X-rays in macromolecular crystallography. Part IV. Efficient determination of anomalous substructures in biomacromolecules using longer X-ray wavelengths.
pubmed doi rcsb
molecule tags Allergen
molecule keywords Alpha-lactalbumin
total genus 41
structure length 122
sequence length 122
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-02-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2g4nA00
1GE1A 1A4VA 2LYMA 5APCA 3TXHA 2H5ZA 3AW7A 2F30A 5F14A 5LINA 3GXRA 1GD6A 1G7IC 1I20A 4MR1A 1REZA 3WYHA 3RZ4A 1CKHA 1LKRA 1RFPA 1DI3A 1JKCA 4WOAA 1HERA 1JSEA 2I26L 5KKIA 5I4WA 4DDCA 5LYTA 4WO6A 1ALCA 1JSFA 4B1AA 3VWOA 1GDXA 1IC7Y 5FHWA 3LYOA 1BB6A 1LZ8A 1OUFA 1C43A 2YVBA 5F9XA 1IP3A 1YKXX 4IATA 4B4EA 2BLXA 5LIOA 4ANRA 1IO5A 2XBRA 3A3QA 1T6VL 3HBDA 1YL0X 1QDTA 1C46A 1VFBC 1LZAA 2G4QA 3RU5A 1GB5A 2IHLA 2DQFC 4HSFA 1LZTA 1XGUC 1DI5A 3P65A 1GAZA 1ZVYB 1YL1X 1XGRC 1KXYA 4NHPA 5KKJA 1IP7A 3TMUA 4DWXA 2FYDA 1HEMA 2YSSC 4WM5A 2LYOA 2HU3A 4GN5C 1JJ3A 5DN5A 4GCDA 1HFZA 3A95A 4G4CA 3EO5A 1LSNA 2XTHA 1YAPA 4NWEA 1RI8B 4H9AA 4NGVA 5L3IA 4KT3A 2YBNA 1LZSA 2BQFA 3AZ7A 4NGLA 1QSWA 3TMVA 2D4IA 4ML7A 4M6DA 3A34A 2ZQ3A 3AW6A 1JHLA 3D3DA 2HEDA 1IOQA 1JKDA 1LZ1A 153LA 2YBLA 4B49A 2FBDA 4WM2A 1D6QA 1GAYA 2PC2A 3A92A 1LJHA 1XEKA 2CWIA 3J4GA 2Z37A 1OUGA 5K7OA 1CJ9A 3ATOA 5I53A 1GFGA 4R0FA 1NWGA 5LA8A 4NHSA 3A6BY 5KXNA 5LVHA 1EQ4A 1GBWA 1GE0A 3LYMA 1DI4A 2ZYPA 2Z39A 1GBOA 1F10A 4G49A 1IC4Y 4LT0A 4WL6A 3T6UA 2BQMA 3WU7A 4II8A 193LA 2BQIA 5FELA 1LHHA 1LSAA 1D0KA 3LYZA 3MGWA 4J7VA 4AGAA 5DN4A 5LXWA 1GF5A 1KIQC 3QE8A 1LZ6A 1LSEA 3OJPA 4H92A 3FI7A 1GB3A 1HELA 1O23A 4XENA 5KXZA 1LMQA 1OUAA 2I25L 4E3UA 4LT1A 2MEHA 1AT6A 3CT5A 1JEFA 1LKSA 2D6BA 1NQIA 4PRQA 1JITA 3TXJA 1LHJA 5KXPA 3W6EA 2DQEY 1QIOA 1IWWA 4YEOA 1UIEA 1HNLA 2ZNXY 4NSGA 1BB7A 1GFEA 1CNSA 5B1GA 4O34A 3TXEA 3G3AB 1GEVA 4H9CA 4HV2A 3WVXA 3QY4A 3IWRA 1YROA 4J1BA 1WQNA 4UWVA 5EBHA 1UC0A 5B06A 5B59A 1LZBA 2DQHY 4CJ2A 4KPMA 1LJNA 4J0LA 2LYZA 3LN2A 4IJ4A 1VAUA 3CSZA 2N5ZA 1TCYA 4LYZA 2HU1A 5E9RA 3TMXA 1C08C 1AZFA 1GB6A 5C6IA 1LZDA 3ZVQB 4ETAA 1UICA 3B0KA 1LJIA 4U3XB 3N9AA 1IOTA 3CSQA 1WQPA 2AUBA 5I4XA 5ILFA 3AGHA 4XJGA 1BWIA 1IR8A 3ATNA 4NWHA 3P66A 3B72A 1MELL 1LJJA 4WM4A 2G4NA 2MEFA 7LYZA 5B1FA 2EIZC 2ZNWY 3AGIA 1JKAA 1YKZX 1LJKA 1BGIA 1GF9A 1XGPC 3EBAB 4PHIA 4RW1A 1B7OA 1B5UA 1WQQA 3EMSA 1WQMA 1LZEA 1GB8A 1YAOA 1XSFA 4DDAA 4H8XA 2ZIKA 4LT3A 134LA 5HNLA 1UCOA 1IWUA 4XJIA 1CKFA 4HTNA 2BQBA 4GN4A 2MEIA 5KXTA 1UBZA 4DD2A 2MEEA 207LA 1BB4A 1IR9A 4L41A 3WPLA 4I8SA 4QGZA 3N9CA 1OUDA 2YBHA 1D0MA 1LSMA 1TBYA 2DQJY 5LVIA 4ET9A 4X3BA 1FDLY 1IC5Y 4OWHA 5KJ9A 3W6BA 5HMVA 1DQJC 1JISA 4G9SA 1P2CC 1CKGA 1DKKA 4HP0A 135LA 1C7PA 1XEJA 2G4PA 3WXUA 4CFPA 5II3A 1LMTA 1NF5A 4GCFA 1B5ZA 1HHLA 1QSAA 4HTQA 3WPJA 1IP2A 1YQVY 5KXWA 2YBIA 3SP3A 1LMAA 3EXDA 4TUNA 2C8PA 1IR7A 3D9AC 2VB1A 2X0AA 3E3DA 3WUAA 5KXKA 2LZTA 9LYZA 1FN5A 2Z19A 1OUJA 3OK0A 1YAMA 3CT0A 5LYZA 1GFUA 3A91A 3F6ZA 1JPOA 1W08A 3LZTA 5IELA 1DKJA 4WLXA 1AT5A 2BQDA 3WUMA 1KIPC 2HEBA 2DQGY 2A7FA 1DPWA 4HJZA 4N1EI 4XADA 1YILA 1OUHA 1HEQA 3WH1A 1OP9B 4C5FA 1HEPA 3AZ5A 4I0CA 1FLYA 4RDSA 1GBZA 1B0DA 1KXXA 1ZV5L 3A3RX 4GCEA 4WLYA 1XEIA 4NSIA 2BQEA 4WM1A 1BWJA 1QUTA 4RLMA 4YEMA 1WTNA 1LZGA 2BQAA 2Z18A 4PJ2C 5HMJA 4ETEA 1GHLA 3J6KA 4GCBA 4ZEEA 4BS7A 1CJ7A 1IWZA 1VDSA 2BQLA 1F6RA 1UIGA 4LYBA 1LJEA 1WQOA 4WLTA 4NIJA 5A3ZA 4PRUA 1GFJA 1PS5A 3WU9A 1I1ZA 1NDMC 1W6ZA 2MEBA 4NFVA 1NBYC 4LYCA 2DQDY 1DZBX 2XBSA 4H9HA 1B7LA 1GE2A 1QTEA 4OW1A 4XJFA 5A3EA 4OOOA 4YOPA 1B5VA 5T3FA 1IX0A 4NGKA 2H9KA 1HFXA 5I4YA 1GBYA 1F6SA 2HUBA 1HEWA 1JWRA 5KXSA 2D91A 2BLYA 1JTOL 1FKVA 1VDTA 1HC0A 2I6ZA 1TAYA 2DBTA 4XJBA 5M1YA 1NMMA 4QEQA 1A2YC 1VEDA 1XGQC 4HTKA 4W94A 4BAFA 4Z98A 4H9IA 1IY4A 1G7MC 4DDBA 3A6CY 1GB2A 3N9EA 4WG7A 133LA 8LYZA 1WVUA 1GB0A 1VDPA 2BQNA 3WW5A 1HFYA 1LYZA 4ETDA 1LMPA 5JENB 1GB9A 4J1AA 1D9UA 1GF8A 2HEEA 2FBBA 4MCKA 1LSFA 4XJHA 1ZVHL 4WLDA 3ULRA 1GDWA 2GV0A 1IP6A 5LAFA 5LVKA 3FE0A 4CGEA 1IP4A 2MEAA 1T3PA 1LMOA 1HENA 1LMNA 3QNGA 4WM3A 5C6LA 1LHMA 1J1XY 4IASA 2Z12A 3P68A 4W96A 5B07A 1BB5A 1UIBA 1UIAA 1D6PA 1LSGA 4OWAA 1H87A 1OQMA 1WQRA 2MEGA 1LSBA 2NWDX 2BQJA 2Z38A 2LZ2A 1BQLY 1KXWA 4G4HA 4B0DA 4M4OA 1HSWA 1LHLA 1B5WA 1LZCA 1IORA 1N4FA 5F16A 2HEFA 4H9FA 4G4BA 5HQ1A 1AM7A 5HLLA 1PZYA 2BPUA 1EQ5A 1LSPA 4QDNA 5D5FA 1Z55A 132LA 3HBEX 5I5QA 4GLVA 2FYCA 5KXLA 2F4AA 4NSJA 2F2NA 1RE2A 1GFKA 1GF3A 4NGYA 4UWUA 1IOCA 1GE3A 2W1MA 4HPIA 1RJCB 5KXRA 1DPXA 1YANA 3CB7A 5DLAA 2ZWBA 1IEEA 1B5YA 3P64A 2MECA 2W1LA 2ZILA 5E4PA 4DD3A 4CHXA 1JKBA 1D0LA 5IHGA 4H8ZA 3TMWA 1REYA 4TTDA 1FKQA 4YM8A 1XGTC 4KXIA 1BWHA 4HJYA 4ETBA 1NDGC 2ZYCA 1G7HC 1LTMA 4LFPA 1HF4A 1IWYA 3AZ4A 3WPKA 2CDSA 3ZVQA 1IP5A 4BAPA 4NHIA 2C8OA 4RLNA 1B7PA 1GFHA 4NHQA 1OUIA 4TX7A 4BADA 2H9JA 1GB7A 4GN3A 1UUZC 1H6MA 1JIYA 1ZMYL 3M18B 2F4GA 1OUBA 4ZFPA 3CQLA 4LZTA 1GXXA 5LA5A 3B6LA 3KAMA 1LSDA 1JJ0A 4A7DA 1JUGA 1LZ4A 4GCCA 1GFTA 3BKHA 3LZ2A 5DL9A 1LMCA 1C45A 4HV1A 4XYYA 1B2KA 2YDGA 3RNXA 3WU8A 5KXXA 4AXTA 1GBXA 3AGGG 1B7QA 4NGOA 1IWVA 5KXOA 1B7RA 4FJRA 5IDDA 4Z41A 4TSCA 3WVYA 5B05A 1J1OY 3LHMA 3TXKA 3W6AA 2BAAA 5LVGA 2YBMA 4OWCA 4EMNA 4WL7A 1MLCE 1LYOA 4UWNA 4N1CC 2CJLA 4WM6A 1GFRA 1JTPL 1JJ1A 3P4ZA 1LHKA 2EKSC 1LYYA 5AMYA 1HSXA 1IWXA 5FDJA 4NGZA 4H9EA 4DT3A 3AJNA 1GF6A 4Z3MA 3TXBA 1KIRC 4NSHA 4PPOA 1GF7A 3IJUA 1LZYA 1V7SA 3AYQA 1UA6Y 1WVVA 2Q0MX 5KXYA 3AB6A 3W6FA 3A93A 4CFOA 4H91A 1GF0A 2WARA 194LA 1J1PY 2B5ZA 2YBJA 2BQOA 4Z46A 4HJVA 1DXJA 4OOTA 4PGJB 3B0IA 5LVJA 1LZ9A 1VATA 2EPEA 2A7DA 3K3TA 4FDYA 4WG1A 1GWDA 4N0JA 3RW8A 3TXGA 1JTTL 4LYMA 4DC4A 3A67Y 4DD9A 2ZIJA 2W1XA 4NGIA 1CJ8A 1HMKA 2DQCY 1TDYA 4YF2A 6LYTA 6LYZA 5KY1A 4WMGA 1V7TA 1UACY 1GE4A 3B0OA 5FCPA 1LYSA 4LGKA 1HEOA 1TEWA 4N9RA 4LYOA 3WUNA 1BVXA 1VDQA 4GLAA 1E8LA 5LAGA 5LYMA 4R6CA 1SLYA 1LAAA 1OUEA 4XN6A 4OWEA 2BQKA 5C6JA 3HFMY 3M3UA 2CGIA 1EL1A 5D5CA 2LHMA 3W3EA 1AKIA 1FLWA 2D4JA 3W6CA 3WULA 1GBSA 5L9JA 5APDA 5KXMA 3A90A 2HTXA 1B9OA 2HEAA 1LHIA 3RT5X 4H1PA 4D9ZA 1LJ3A 1XFPL 3A8ZA 3GXKA 5HNCA 1GXV2 1GEZA 4ETCA 1QQYA 4LYTA 4YENA 4DD1A 3IJVA 5L3HA 4ET8A 1RCMA 1B7SA 5FSTA 4QY9A 4H93A 1INUA 3A96A 1LZ5A 5I54A 3TXDA 2HECA 5ILCA 1B7MA 4H94A 1LSZA 2DQIY 3WW6A 4DYGA 3WMKA 3G3BB 4DD7A 4C3WA 1REMA 3CSRA 4HPEA 2XJWA 1SQ2L 4B4IA 4RW2A 1YAQA 3WL2A 2Z2EA 3CT1A 4NG1A 4WO9A 1LZRA 1REXA 1BHZA 1IWTA 2W1YA 1QTKA 4EOFA 1GPQC 2IFFY 3AZ6A 4N5RA 2ZQ4A 4H8YA 1FLQA 1G7LC 1IIZA 1QDRA 2MEDA 1UIHA 1NBZC 1WTMA 1FLUA 3BKVA 4LT2A 4N8ZA 4KL7A 1LJ4A 1GFVA 5DM9A 3W6DA 3WXTA 3A94A 1QUSA 4NY5A 2RSCA 3LYTA 1LCNA 1YIKA 5J7CA 4TSBA 2BQHA 4NHTA 5F81A 3T36A 3ZEKA 1CKDA 4OWBA 1LPIA 4B4JA 2EQLA 4NGJA 1OUCA 4H9BA 1LZNA 1EQEA 1UIDA 1LSYA 1LOZA 4NEBA 1HMLA 4NGWA 1NKHA 1BVKC 208LA 1G7JC 2Y8PA 4TWSA 5F9UA 3TXIA 1IOSA 4DD0A 1CJ6A 1B5XA 2DKVA 1GFAA 4H90A 5APFA 1I56A 4ZIXA 1CKCA 4NG8A 1NHEA 4LFXA 1BB3A 2D4KA 154LA 2BQCA 1UIFA 3TXFA 3HBHA 4XJDA 1F0WA 1B7NA 2DQAA 1FBIX 1GF4A 1YKYX 1LSCA 2BQGA 4P2EA 1IP1A 1C10A 5FEKA 1IVMA 5APEA 2Z2FA 4MSTA 1LJGA 1LJFA 1IY3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1PQJA 4ARJA 2LYMA 3GXRA 1GD6A 149LA 1JKCA 1HERA 2I26L 5KKIA 5LYTA 4DDCA 1SSWA 182LA 4B1AA 4K5YA 1LZ8A 1OUFA 2Q9EA 4IATA 4ANRA 5LIOA 3A3QA 2XBRA 1LW9A 1QTCA 1VFBC 3CDTA 3RU5A 2IHLA 1XGUC 216LA 3P65A 1KXYA 1QTVA 2YSSC 4GN5C 4DJHA 4G4CA 1T8GA 1P2RA 2BQFA 2ZQ3A 1JHLA 206LA 2HEDA 2PC2A 1LJHA 2OE9X 3HTBA 1OVKA 181LA 5I53A 4R0FA 1QT5A 138LA 4NHSA 4PK0A 3GUIA 1GE0A 1DI4A 1CX6A 4WL6A 193LA 1LSAA 245LA 2B73A 1KIQC 1KW7A 3OJPA 4H92A 1GB3A 3G3VA 4XENA 1OUAA 2I25L 3DN1A 4E3UA 2CUUA 3CT5A 131LA 1LKSA 168LA 4DKLA 1QIOA 1HNLA 1LYJA 244LA 1L56A 3WVXA 1L92A 1YROA 3DN0A 4W59A 1TLAA 4KPMA 186LA 1CTWA 2LYZA 4LYZA 3TMXA 1AZFA 3B0KA 1IOTA 1P36A 3AGHA 1BWIA 3B72A 144LA 1LJJA 7LYZA 5KKJA 3EBAB 1LJKA 1L06A 1QS5A 3EMSA 1GB8A 1QTDA 222LA 3DMXA 1UCOA 148LE 1CKFA 4I7PA 1C69A 1L99A 3UONA 4I8SA 3N9CA 1LSMA 4ET9A 1TBYA 2DQJY 1OVJA 1IC5Y 4ZPUA 1DQJC 3QAKA 1YQVY 2YBIA 3EXDA 3D9AC 2X0AA 1CV0A 1G1VA 1D2YA 1FN5A 3CT0A 5LYZA 3F6ZA 3LZTA 5IELA 1KIPC 4N1EI 1YILA 1OP9B 1GBZA 3NYAA 1L39A 1L94A 2QARC 1XEIA 4NSIA 2BQEA 4WM1A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1GE1 A;  1A4V A;  2LYM A;  5APC A;  3TXH A;  2H5Z A;  3AW7 A;  2F30 A;  5F14 A;  5LIN A;  3GXR A;  1GD6 A;  1G7I C;  1I20 A;  4MR1 A;  1REZ A;  3WYH A;  3RZ4 A;  1CKH A;  1LKR A;  1RFP A;  1DI3 A;  1JKC A;  4WOA A;  1HER A;  1JSE A;  2I26 L;  5KKI A;  5I4W A;  4DDC A;  5LYT A;  4WO6 A;  1ALC A;  1JSF A;  4B1A A;  3VWO A;  1GDX A;  1IC7 Y;  5FHW A;  3LYO A;  1BB6 A;  1LZ8 A;  1OUF A;  1C43 A;  2YVB A;  5F9X A;  1IP3 A;  1YKX X;  4IAT A;  4B4E A;  2BLX A;  5LIO A;  4ANR A;  1IO5 A;  2XBR A;  3A3Q A;  1T6V L;  3HBD A;  1YL0 X;  1QDT A;  1C46 A;  1VFB C;  1LZA A;  2G4Q A;  3RU5 A;  1GB5 A;  2IHL A;  2DQF C;  4HSF A;  1LZT A;  1XGU C;  1DI5 A;  3P65 A;  1GAZ A;  1ZVY B;  1YL1 X;  1XGR C;  1KXY A;  4NHP A;  5KKJ A;  1IP7 A;  3TMU A;  4DWX A;  2FYD A;  1HEM A;  2YSS C;  4WM5 A;  2LYO A;  2HU3 A;  4GN5 C;  1JJ3 A;  5DN5 A;  4GCD A;  1HFZ A;  3A95 A;  4G4C A;  3EO5 A;  1LSN A;  2XTH A;  1YAP A;  4NWE A;  1RI8 B;  4H9A A;  4NGV A;  5L3I A;  4KT3 A;  2YBN A;  1LZS A;  2BQF A;  3AZ7 A;  4NGL A;  1QSW A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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