2H5ZA

Crystallographic structure of digestive lysozyme 1 from musca domestica bound to chitotetraose at 1.92 a resolution
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
122
structure length
122
Chain Sequence
KTFTRCSLAREMYALGVPKSELPQWTCIAEHESSYRTNVVGPTNSNGSNDYGIFQINNYYWCQPSNGRFSYNECHLSCDALLTDNISNSVTCARKIKSQQGWTAWSTWKYCSGSLPSINDCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystallization, data collection and phasing of two digestive lysozymes from Musca domestica
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme 1
molecule tags Hydrolase
source organism Musca domestica
total genus 48
structure length 122
sequence length 122
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2006-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2h5zA00
2DBTA 5DLAA 2C8PA 1GFAA 5APFA 2DQAA 4N1EI 4J7VA 4NGYA 2CJLA 1GAYA 1QDRA 3TXKA 3A90A 4LZTA 1Z55A 5FCPA 5L9JA 3LN2A 2ZWBA 4XYYA 6LYZA 1F6RA 4WM4A 1GF7A 2BPUA 3WPJA 4Z46A 1GF4A 1LSFA 1INUA 4BADA 3B72A 1B7LA 2IFFY 2AUBA 4XJHA 5IELA 1IWYA 1PZYA 1LJGA 5FDJA 1GB2A 1JSFA 3EBAB 4HV1A 4TSCA 4ZIXA 3WW6A 1YQVY 1D6QA 4NEBA 1HF4A 3W6BA 4PHIA 1XEKA 3A96A 1HSXA 3F6ZA 4YEMA 5L3HA 1UIBA 1REZA 1RI8B 4WM3A 2XBRA 1QDTA 3AW6A 4H9AA 2WARA 4LYZA 3TXGA 1BB3A 4OWHA 4B1AA 4U3XB 1BB4A 5DM9A 1YL0X 3OJPA 2Z12A 4B0DA 4IASA 3G3BB 1P2CC 4DD7A 1RFPA 1G7MC 4Z41A 2BQLA 5LYTA 1REYA 4WLXA 1YAMA 1D0LA 1GB6A 2YBIA 3TXJA 5ILCA 2BQHA 2D4KA 4HTNA 5APDA 1OUBA 1OUJA 1E8LA 5K7OA 1NHEA 3IJUA 4GLVA 1IC7Y 1AT6A 4N5RA 4Z98A 2W1LA 3QNGA 1GFGA 2Z19A 2BQCA 4PRQA 1W08A 1TBYA 1GBWA 1IO5A 4G9SA 3GXRA 4TUNA 1FN5A 1LZ8A 5I5QA 3RZ4A 4GCEA 5E4PA 2ZNXY 2PC2A 3FE0A 3QY4A 4H92A 1NWGA 1OUAA 4FJRA 3W6DA 1C08C 2GV0A 2LHMA 1GXV2 4NHPA 3TXEA 2DQIY 1IIZA 2F2NA 4RW2A 1CNSA 2LYOA 1GF3A 4ETCA 2HEFA 2RSCA 3TMUA 1LZ6A 1YKXX 1BGIA 1F10A 2YSSC 1LZYA 3N9AA 4H8YA 4QGZA 4NSGA 1IOQA 1C46A 4KPMA 5D5FA 1HEQA 3P65A 3WU8A 1KXYA 1UIHA 2G4PA 4DWXA 4KXIA 1LZDA 1LZ9A 2FYCA 3CT1A 4DYGA 4A7DA 4R6CA 1QIOA 4DD1A 1GFUA 1J1XY 1B2KA 1EL1A 1GEZA 1WVVA 4BS7A 2H9JA 4WMGA 2FBBA 1GE4A 1MELL 3A95A 1IP7A 5A3ZA 1HMKA 5JENB 1W6ZA 4J0LA 1LZRA 4CGEA 5LYZA 1V7TA 5HNCA 2ZILA 2CDSA 3P66A 4WM1A 1YANA 4IATA 4HV2A 1NBZC 5B1GA 1LKRA 4PGJB 4GCDA 2HECA 1JKCA 1G7HC 5APEA 1YILA 1IY4A 1UCOA 1DI4A 2F4GA 4NGVA 4AGAA 1F6SA 1YKYX 1LZCA 3W3EA 4TSBA 4AXTA 2BQDA 2W1MA 1UACY 1OP9B 4G49A 1GF6A 4H9FA 1LSEA 4ETEA 1VEDA 4NGWA 1FBIX 4ET8A 5C6LA 3LZTA 1LSAA 1WQNA 1IORA 1JSEA 2YBHA 4MSTA 2BQEA 4XN6A 3ATOA 1O23A 4HTQA 1FKVA 3WVYA 1JPOA 5L3IA 1GFHA 3AGHA 1LHHA 3BKVA 1WQOA 2ZYCA 9LYZA 4H8ZA 1WQMA 5KY1A 153LA 4NWEA 1J1PY 5AMYA 5B05A 6LYTA 2BQOA 3K3TA 4NFVA 2D91A 194LA 3HBEX 1TEWA 1VFBC 4NGOA 1OUGA 1JKBA 1GBYA 4G4HA 1WQQA 2EQLA 4OOOA 4XJGA 4B4IA 1WQRA 2BQKA 2FYDA 4H93A 1G7LC 4HTKA 2BQGA 5KXOA 1QQYA 1JIYA 1FKQA 1HFYA 5ILFA 1LZEA 4ETDA 3ATNA 1GDWA 1CKGA 5B07A 2EKSC 1YAQA 1IY3A 2Z38A 3A6BY 1SLYA 1WVUA 4ANRA 1IR8A 4C5FA 4I8SA 4M4OA 2LYZA 1IWXA 1LZBA 1I56A 1EQ5A 2BQIA 1B7PA 2IHLA 1LHJA 1IWZA 4WG7A 1IOSA 5F14A 5KXZA 3W6AA 1GFRA 1QSWA 5I53A 1BVXA 1LJKA 4KL7A 4LT3A 2DQEY 4QEQA 4XADA 4CFPA 3WXTA 2Q0MX 1UIAA 5EBHA 1WQPA 1LHMA 4QY9A 1CJ6A 2YBNA 3EXDA 2BQNA 4WLDA 1QTEA 1B7NA 1JJ0A 4H91A 3TXDA 3ZVQB 2HEDA 1C7PA 1B7RA 1LZNA 3A3QA 4LYMA 1XEIA 3WPLA 3WUAA 3A67Y 4PRUA 5D5CA 1ZVHL 1HENA 2XBSA 1JTOL 4WM5A 4YENA 5I4WA 1ALCA 1TCYA 3RU5A 1JISA 4KT3A 1QSAA 5I54A 5C6IA 1LSGA 5LINA 4WO6A 5B1FA 4CFOA 1NMMA 3J6KA 1XFPL 4LT2A 3J4GA 3D3DA 2MEBA 1A4VA 3A6CY 2A7DA 1C45A 2LZ2A 5KXSA 1DI3A 1DZBX 1C43A 1GB0A 4NGLA 1GPQC 1GBZA 4OWBA 2DQJY 3FI7A 3M18B 1LJEA 1XGPC 1JJ1A 1IC5Y 5KXTA 4WOAA 1T6VL 3GXKA 4DD2A 1LZ4A 1B5ZA 1IP4A 1KXXA 2ZIJA 1LMCA 4NGKA 2HEBA 1YAPA 5IHGA 5KXKA 1VDTA 4OWCA 1LYOA 4UWNA 3WL2A 1DPXA 1GF8A 1LHKA 5HNLA 4WM6A 1REXA 2CWIA 4H90A 5T3FA 1VDPA 1UUZC 1B5WA 5I4YA 2A7FA 5DL9A 1CKFA 1HFZA 4LT1A 3A92A 3VWOA 4NY5A 4OWEA 2DQCY 1LSPA 2YBMA 3ZEKA 1N4FA 4DD3A 2XTHA 5KJ9A 1VDSA 2YBJA 2H9KA 2N5ZA 1TDYA 4II8A 5I4XA 1B7MA 1IEEA 1XGUC 1HHLA 1AM7A 2I26L 3WUMA 2MEHA 4EOFA 1G7JC 4NHQA 1CKDA 1IOTA 1XGTC 134LA 1FLUA 1LZTA 1LZ5A 3M3UA 4OOTA 5APCA 2MEAA 1BHZA 1JKAA 1J1OY 4O34A 1MLCE 3ULRA 2BQFA 2HEAA 154LA 1A2YC 4NHSA 4CHXA 4H8XA 5HLLA 5B06A 1WTNA 2W1YA 1TAYA 1NDMC 3B0OA 4HPEA 4XJDA 4GCBA 2DQHY 1DI5A 1KXWA 4FDYA 4TWSA 3A91A 3WW5A 3B0KA 4NGIA 1LSMA 2Z39A 5HMJA 3EO5A 3TMVA 2F4AA 1IP1A 1LSDA 1GXXA 1B5UA 2DQFC 4YOPA 4ZFPA 1LSZA 1YAOA 5LVGA 4EMNA 3P68A 1VATA 2G4NA 1JUGA 1LJ3A 1IC4Y 4IJ4A 3N9CA 4B4JA 1JJ3A 1GE2A 3W6EA 1DKKA 5FEKA 1UIFA 2EPEA 4DDAA 5LVHA 5KXPA 1GF0A 4RLMA 5F9UA 4QDNA 1HEWA 4E3UA 1GBOA 1GF9A 1V7SA 1BB6A 1LMNA 1DPWA 1ZV5L 2XJWA 3CQLA 1AKIA 4XJFA 1LJ4A 1LMQA 1I1ZA 1JTPL 2I6ZA 3A3RX 1GF5A 2NWDX 3KAMA 1EQEA 4PPOA 1LAAA 1XGRC 1JTTL 1ZMYL 1B5XA 1IWTA 1LJNA 3AZ7A 2HU1A 4GN4A 4BAFA 3QE8A 4NHIA 1HEPA 1RCMA 4NHTA 3WU7A 2MEDA 4LFPA 2CGIA 1GFEA 2ZIKA 4ML7A 5LAFA 1LOZA 5KXMA 5LA5A 3CSZA 1D0KA 4DDCA 1GFKA 1DKJA 1GWDA 4YM8A 1JKDA 1HEMA 2Z18A 1D6PA 1IP2A 3CT5A 4WLTA 1B9OA 4W94A 3WUNA 5C6JA 1H6MA 3WU9A 5II3A 2LZTA 5LAGA 3E3DA 2ZQ3A 4TX7A 3AW7A 3WH1A 4OWAA 4YEOA 1B0DA 3WMKA 4RLNA 5E9RA 1CKCA 1F0WA 1UIEA 2YBLA 3B0IA 3HBHA 1BB7A 1BQLY 1RJCB 1LYSA 2BLYA 4LYOA 3TMXA 4B4EA 4H1PA 3WYHA 4DD9A 1NKHA 1HC0A 2FBDA 1LJIA 1LCNA 1PS5A 1UC0A 3AGGG 1LPIA 2B5ZA 2DQGY 1KIRC 3LYOA 4OW1A 5LVIA 2F30A 3TXHA 207LA 1NDGC 4ET9A 4DT3A 4RDSA 4ETBA 135LA 4N9RA 5F16A 4I0CA 1IP6A 2W1XA 3AYQA 3CT0A 1DXJA 3G3AB 3LZ2A 4XJBA 4NSHA 4H9BA 1FDLY 1CJ8A 2D4JA 4GN3A 1CJ9A 1YL1X 1LMAA 3A8ZA 3LYZA 4N0JA 1FLYA 4J1BA 1H87A 4XENA 3EMSA 1IWUA 4HJYA 3AZ6A 4LYTA 1OUDA 3BKHA 1LMPA 1WTMA 3IWRA 4CJ2A 1B5YA 1LSCA 3P4ZA 3WPKA 2Z2FA 1IR7A 4GCCA 4LT0A 2EIZC 1GBSA 5KXXA 1HEOA 2LYMA 3IJVA 4WG1A 3LYMA 4LGKA 3T6UA 132LA 1CJ7A 1FLWA 1LSBA 1LSNA 3B6LA 1EQ4A 4XJIA 4N8ZA 3AGIA 1SQ2L 4G4BA 2DQDY 4NSIA 4W96A 3WXUA 2D6BA 1C10A 5LVJA 4C3WA 1JEFA 2MEGA 1CKHA 1GBXA 1QUTA 1IOCA 1HERA 1IWWA 1QUSA 2G4QA 1HMLA 4HJVA 1IX0A 4DC4A 3RT5X 1UA6Y 3OK0A 4BAPA 1GE0A 3A94A 3W6CA 3LHMA 1GFVA 1GFTA 1HFXA 2MEIA 3A93A 5IDDA 1D0MA 1JWRA 4NIJA 4GN5C 3AB6A 1GAZA 5KXYA 4Z3MA 1IP3A 4WM2A 1LZGA 5LYMA 1LMOA 133LA 2HTXA 1OUIA 2X0AA 5F9XA 1LMTA 4NGZA 4PJ2C 4R0FA 1LHLA 4H9EA 2BQMA 1GB7A 3W6FA 1B7SA 4NG8A 193LA 4WO9A 1GFJA 1OQMA 1YROA 1I20A 3WULA 1GD6A 1GHLA 4NSJA 4GCFA 1UBZA 1B7OA 4N1CC 5FELA 1VAUA 2Z2EA 2MECA 2D4IA 4UWUA 3RNXA 1AT5A 5KKJA 2Y8PA 5FSTA 1KIPC 1JITA 5HQ1A 4L41A 2Z37A 4G4CA 4TTDA 4HP0A 5FHWA 4WLYA 1IP5A 3P64A 3TMWA 5KXWA 2H5ZA 2ZNWY 1FLQA 1LYZA 1LSYA 3AZ4A 1OUEA 1OUFA 1GB5A 4NG1A 4ZEEA 2YDGA 3HFMY 5A3EA 8LYZA 1LZSA 1YIKA 1GB3A 3TXFA 5KXRA 4H9IA 1ZVYB 1GEVA 1LJFA 2HUBA 3N9EA 1NBYC 1UIGA 1XEJA 3AZ5A 1QTKA 3A34A 1GDXA 1OUHA 1NF5A 1D9UA 1XSFA 4H94A 4J1AA 4B49A 4WL7A 1T3PA 5DN5A 1DQJC 2C8OA 7LYZA 3TXBA 3D9AC 4YF2A 1BB5A 1LJJA 1REMA 1B5VA 5KXNA 5F81A 208LA 1AZFA 3CB7A 4DD0A 2BLXA 3MGWA 2BQAA 4HJZA 3AJNA 2BQJA 4NGJA 1GB9A 1GE1A 1HSWA 1KIQC 1BWIA 3LYTA 2HEEA 1UICA 4MCKA 1HELA 4D9ZA 1UIDA 4LFXA 2YVBA 4WL6A 1LJHA 4UWVA 3CSRA 3ZVQA 1BVKC 2ZQ4A 4HPIA 3WVXA 1LKSA 1G7IC 4DDBA 4X3BA 1BWHA 1GB8A 5J7CA 2I25L 5HMVA 1IWVA 5LVKA 1RE2A 1YKZX 2MEFA 4M6DA 1LYYA 2ZYPA 1OUCA 3T36A 1IR9A 4LYCA 1BWJA 4MR1A 3RW8A 1LHIA 5B59A 1GE3A 2VB1A 2BAAA 1JHLA 5LIOA 2DKVA 4RW1A 3TXIA 4GLAA 1HNLA 4LYBA 5M1YA 1LTMA 4P2EA 5LA8A 2HU3A 1LZAA 2BQBA 1VDQA 3CSQA 4H9CA 4H9HA 4HSFA 3SP3A 5KKIA 1B7QA 1LZ1A 1XGQC 3HBDA 4NWHA 5DN4A 1IVMA 4ETAA 5KXLA 1NQIA 2MEEA 5LXWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4N1EI 4NGYA 2CJLA 3A90A 1Z55A 148LE 2ZWBA 4XYYA 4I7SA 1GF7A 1LSFA 4BADA 3NY8A 2AUBA 4XJHA 1LJGA 131LA 147LA 1GB2A 5FDJA 1JSFA 1JTMA 1D6QA 1T8GA 1XEKA 3F6ZA 167LA 1REZA 5LZMA 1BB3A 4OWHA 4U3XB 3G3BB 1CUQA 4Z41A 4W53A 2YBIA 1L96A 5K7OA 1D9WA 1JQUA 192LA 4Z98A 2W1LA 1L88A 1GFGA 3HTBA 2BQCA 4W59A 1W08A 1TBYA 1IO5A 1G1WA 3RZ4A 4GCEA 3QY4A 1DYBA 1OUAA 1C08C 4NHPA 3TXEA 2F32A 1L05A 1LYEA 4ETCA 1LZ6A 4NSGA 191LA 3DKEX 3WU8A 1HEQA 3P65A 1QT7A 1KXYA 2G4PA 4KXIA 1LZDA 3CT1A 4DKLA 4BS7A 140LA 181LA 3A95A 1MELL 5JENB 2ZILA 250LA 5B1GA 4PGJB 2HECA 164LA 2F47A 5APEA 178LA 1YILA 123LA 4NGVA 1L01A 1YKYX 1SX2A 1UACY 1OP9B 4G49A 1FBIX 5C6LA 1L26A 1LSAA 3LZTA 1WQNA 1JSEA 1C6AA 1OWZA 119LA 1JPOA 1WQOA 2ZYCA 102LA 153LA 1CVKA 1J1PY 4NFVA 2D91A 2RB1X 3HBEX 1TEWA 1VFBC 3GUIA 1JKBA 4G4HA 2EQLA 1XJTA 4XJGA 1L19A 5KXOA 1QQYA 4ETDA 1L31A 1GDWA 1CKGA 5B07A 2EKSC 144LA 1L89A 182LA 4DAJA 141LA 3A6BY 4LZMA 4ANRA 4I8SA 241LA 1OWYA 1I56A 1EQ5A 171LA 1IWZA 4WG7A 1PQOA 3W6AA 1PQDA 1QSWA 2DQEY 1L14A 4CFPA 3HTFA 3WXTA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2DBT A;  5DLA A;  2C8P A;  1GFA A;  5APF A;  2DQA A;  4N1E I;  4J7V A;  4NGY A;  2CJL A;  1GAY A;  1QDR A;  3TXK A;  3A90 A;  4LZT A;  1Z55 A;  5FCP A;  5L9J A;  3LN2 A;  2ZWB A;  4XYY A;  6LYZ A;  1F6R A;  4WM4 A;  1GF7 A;  2BPU A;  3WPJ A;  4Z46 A;  1GF4 A;  1LSF A;  1INU A;  4BAD A;  3B72 A;  1B7L A;  2IFF Y;  2AUB A;  4XJH A;  5IEL A;  1IWY A;  1PZY A;  1LJG A;  5FDJ A;  1GB2 A;  1JSF A;  3EBA B;  4HV1 A;  4TSC A;  4ZIX A;  3WW6 A;  1YQV Y;  1D6Q A;  4NEB A;  1HF4 A;  3W6B A;  4PHI A;  1XEK A;  3A96 A;  1HSX A;  3F6Z A;  4YEM A;  5L3H A;  1UIB A;  1REZ A;  1RI8 B;  4WM3 A;  2XBR A;  1QDT A;  3AW6 A;  4H9A A;  2WAR A;  4LYZ A;  3TXG A;  1BB3 A;  4OWH A;  4B1A A;  4U3X B;  1BB4 A;  5DM9 A;  1YL0 X;  3OJP A;  2Z12 A;  4B0D A;  4IAS A;  3G3B B;  1P2C C;  4DD7 A;  1RFP A;  1G7M C;  4Z41 A;  2BQL A;  5LYT A;  1REY A;  4WLX A;  1YAM A;  1D0L A;  1GB6 A;  2YBI A;  3TXJ A;  5ILC A;  2BQH A;  2D4K A;  4HTN A;  5APD A;  1OUB A;  1OUJ A;  1E8L A;  5K7O A;  1NHE A;  3IJU A;  4GLV A;  1IC7 Y;  1AT6 A; 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 1LSY A;  3AZ4 A;  1OUE A;  1OUF A;  1GB5 A;  4NG1 A;  4ZEE A;  2YDG A;  3HFM Y;  5A3E A;  8LYZ A;  1LZS A;  1YIK A;  1GB3 A;  3TXF A;  5KXR A;  4H9I A;  1ZVY B;  1GEV A;  1LJF A;  2HUB A;  3N9E A;  1NBY C;  1UIG A;  1XEJ A;  3AZ5 A;  1QTK A;  3A34 A;  1GDX A;  1OUH A;  1NF5 A;  1D9U A;  1XSF A;  4H94 A;  4J1A A;  4B49 A;  4WL7 A;  1T3P A;  5DN5 A;  1DQJ C;  2C8O A;  7LYZ A;  3TXB A;  3D9A C;  4YF2 A;  1BB5 A;  1LJJ A;  1REM A;  1B5V A;  5KXN A;  5F81 A;  208L A;  1AZF A;  3CB7 A;  4DD0 A;  2BLX A;  3MGW A;  2BQA A;  4HJZ A;  3AJN A;  2BQJ A;  4NGJ A;  1GB9 A;  1GE1 A;  1HSW A;  1KIQ C;  1BWI A;  3LYT A;  2HEE A;  1UIC A;  4MCK A;  1HEL A;  4D9Z A;  1UID A;  4LFX A;  2YVB A;  4WL6 A;  1LJH A;  4UWV A;  3CSR A;  3ZVQ A;  1BVK C;  2ZQ4 A;  4HPI A;  3WVX A;  1LKS A;  1G7I C;  4DDB A;  4X3B A;  1BWH A;  1GB8 A;  5J7C A;  2I25 L;  5HMV A;  1IWV A;  5LVK A;  1RE2 A;  1YKZ X;  2MEF A;  4M6D A;  1LYY A;  2ZYP A;  1OUC A;  3T36 A;  1IR9 A;  4LYC A;  1BWJ A;  4MR1 A;  3RW8 A;  1LHI A;  5B59 A;  1GE3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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