2H5ZA

Crystallographic structure of digestive lysozyme 1 from musca domestica bound to chitotetraose at 1.92 a resolution
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
122
structure length
122
Chain Sequence
KTFTRCSLAREMYALGVPKSELPQWTCIAEHESSYRTNVVGPTNSNGSNDYGIFQINNYYWCQPSNGRFSYNECHLSCDALLTDNISNSVTCARKIKSQQGWTAWSTWKYCSGSLPSINDCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystallization, data collection and phasing of two digestive lysozymes from Musca domestica
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme 1
molecule tags Hydrolase
source organism Musca domestica
total genus 48
structure length 122
sequence length 122
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2006-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2h5zA00
1G7IC 2IFFY 1LMQA 5JENB 1IP1A 1RFPA 1QQYA 4G4BA 4J1BA 153LA 2DKVA 1JTTL 2LYMA 4H9HA 1UBZA 4DD2A 5F14A 3AZ7A 4QY9A 1GB0A 1IY4A 1OP9B 1LSEA 1YAPA 2FBDA 1CKCA 2FBBA 2LZ2A 2MEDA 2YBIA 4YEMA 5HLLA 4H93A 1UIAA 2DBTA 2HEBA 2HU3A 4OW1A 2YVBA 1JWRA 1XGRC 2CGIA 4LYBA 3KAMA 5T3FA 5J7CA 3QE8A 5L3IA 4PHIA 3W6BA 2XJWA 4BS7A 133LA 4C5FA 1B7LA 1NQIA 1WVVA 2LYZA 4FDYA 1N4FA 1DI3A 4HTKA 1AT5A 3A93A 3WXTA 4XN6A 9LYZA 1HF4A 1LJ3A 1G7HC 4LYZA 1BB3A 3TXGA 4ETEA 1CJ7A 5HQ1A 1T6VL 4DC4A 1GEVA 1EQ4A 2Z18A 3ATNA 5HMJA 4RLMA 1RE2A 4NHPA 3WUAA 5I4WA 4OOTA 3W6DA 3HFMY 4NG8A 1IOTA 1SLYA 5HMVA 4J7VA 2HEEA 3G3BB 1HEOA 4G4HA 5EBHA 2VB1A 3AGIA 4HTNA 1IR9A 4DD3A 1LSBA 1CKHA 6LYTA 3D9AC 5LAFA 4PRUA 3LZTA 3CT0A 4NHQA 1HSWA 1VAUA 5KXLA 1BB7A 4N0JA 4D9ZA 1YQVY 5LVKA 1WQNA 4NGWA 1RCMA 4XENA 1GB8A 2F2NA 5B1FA 1HC0A 2BQCA 1FDLY 4GLAA 4TSCA 1GFEA 5F81A 1O23A 1KIQC 1OUBA 1LZEA 4NGJA 1B5ZA 3A67Y 1HELA 1LMPA 1LSNA 4YEOA 5KXTA 3M18B 154LA 1XEJA 3WL2A 4DWXA 1D0MA 2DQFC 5KXPA 1GF9A 2GV0A 2FYDA 1LZ4A 5KXSA 4X3BA 5LA5A 1XFPL 4HJYA 4J0LA 4MCKA 1UIBA 1OUIA 4N5RA 7LYZA 5F16A 4TSBA 1XGPC 4NWHA 1EQEA 1HMLA 1WQOA 4H9FA 5L9JA 1DXJA 3A95A 1WQQA 1FN5A 3AGHA 1GHLA 1GF5A 1LZTA 3TXHA 3OJPA 1IP3A 1LSCA 1IWVA 1GEZA 1LMTA 2Z37A 1LZSA 3GXRA 4QEQA 1FLUA 3B0KA 1CKGA 1G7MC 4DD1A 4KXIA 1WTNA 5FCPA 1QIOA 4WM1A 3CSQA 3TMUA 1GAYA 3B0IA 5ILFA 1IP5A 1DKJA 1GDWA 3BKHA 5A3ZA 1IIZA 4NSJA 1D6PA 4B4EA 1LJHA 4XJFA 1A2YC 4LFPA 3A34A 1MELL 1LKSA 2DQDY 4HV2A 1W08A 1LMOA 4N8ZA 1IWXA 2C8OA 1XGUC 2CWIA 1JKAA 2DQAA 4H9IA 5APDA 5KY1A 2LHMA 4CFOA 4OWBA 1JEFA 3AW6A 4DT3A 4EOFA 1LZCA 4LYOA 1GFKA 4TWSA 134LA 4IJ4A 4PPOA 4HPEA 1BVKC 3AZ5A 1WQRA 4NGOA 4CHXA 4EMNA 1E8LA 4NG1A 5KXKA 4NGIA 3P66A 4OWCA 1GE1A 1VDTA 3QNGA 4G49A 1NDGC 1YAMA 4GN3A 1I20A 2HUBA 3CSZA 4XJBA 3A6CY 4QGZA 3CSRA 2YSSC 3J6KA 5B06A 4OWEA 1JUGA 1YANA 1PZYA 3LYOA 4UWVA 3AJNA 1C46A 3CT5A 2ZQ4A 4WO6A 1CJ9A 1OUHA 1REZA 4I8SA 3W6FA 5II3A 2ZWBA 1LZ9A 1QTEA 1LZAA 2ZQ3A 4LFXA 3WPLA 3W6EA 4DD7A 3EXDA 1LSGA 1JJ1A 1LZ1A 4H8ZA 1GBWA 1LSDA 1NKHA 1EL1A 1CJ8A 5DM9A 1DQJC 1UCOA 3A92A 1Z55A 1LSAA 1D6QA 1FKVA 3WU8A 1I56A 4XJHA 4C3WA 1LSMA 2B5ZA 1YKXX 2ZNWY 5IHGA 1TBYA 4NGLA 1GB2A 1BB5A 5APCA 2CDSA 1LHLA 1UIEA 1IO5A 2MEGA 4BADA 1LYSA 1P2CC 2BQGA 3AZ4A 3M3UA 4H91A 2X0AA 1LPIA 5E9RA 5A3EA 1RI8B 2LZTA 4KPMA 4KL7A 2DQHY 5IDDA 3AGGG 1IR8A 2IHLA 4WL7A 1B0DA 1GFRA 4H90A 2H9KA 3ZEKA 3WVXA 3B0OA 4H92A 1V7TA 1QSWA 1B9OA 1HENA 1B5YA 2EIZC 4WG1A 2Z39A 5LVIA 3ZVQB 4ANRA 1GB6A 1IY3A 1GFVA 3AW7A 1KIPC 5KJ9A 1CNSA 1LJGA 3T36A 1HEPA 1KXWA 4Z46A 1GB7A 1IOQA 1REXA 1GB3A 3K3TA 1TDYA 4WG7A 1QTKA 1DPWA 1LYZA 1IP6A 2D4JA 2N5ZA 1AT6A 1GB5A 2ZYCA 3WH1A 5E4PA 1B7NA 1HNLA 3RZ4A 5KXWA 4H9BA 3LYZA 4ET9A 2Y8PA 4GCDA 2BQDA 4GLVA 2HTXA 1GFUA 2CJLA 1H87A 1F6RA 1YIKA 3D3DA 1UUZC 1WTMA 2Z38A 4AGAA 3TXBA 1VFBC 1B5XA 2ZYPA 3IWRA 3W6CA 4DDAA 1GBOA 4GCFA 4LT0A 5KXNA 4N1CC 1LHKA 4LT2A 1OUJA 1LOZA 2LYOA 1QDRA 2MEBA 1GF7A 3LN2A 3TXFA 4TX7A 1BB4A 1LZ8A 2D91A 3A90A 3WPJA 4ETCA 5LVHA 4B1AA 5L3HA 1GFGA 5FELA 1VATA 4ET8A 3TMXA 3TXEA 3MGWA 4ZFPA 1B7PA 1LZ5A 1JITA 1XEKA 2Z19A 1W6ZA 3B72A 2BQHA 1GBXA 1LJIA 3A6BY 1ALCA 2BQJA 4Z41A 4B49A 1JIYA 3TMWA 2BQNA 1NMMA 3P65A 2EPEA 1OQMA 4LT1A 1DZBX 1IWUA 4R6CA 3FE0A 2Z2FA 2MEHA 1HERA 1UIDA 4O34A 4W94A 4WMGA 4XJDA 1A4VA 3TXDA 4LYCA 1LTMA 1LZGA 2F4GA 4WM2A 4P2EA 1NWGA 4NGVA 4NFVA 1JKCA 1JPOA 4CFPA 5KXOA 1NBYC 2XBRA 3OK0A 1LHJA 1KXYA 2MECA 4IATA 3WYHA 3SP3A 4NGYA 1FKQA 1QUSA 2C8PA 1LZRA 1GFTA 2WARA 2Z12A 1IOCA 5B1GA 3ATOA 2HU1A 2YDGA 3EBAB 1OUCA 1PS5A 1UACY 3TMVA 4GCCA 1B7RA 2W1LA 4BAPA 1LHHA 1GAZA 2XBSA 1JJ3A 2ZIKA 4DDCA 1BWJA 4A7DA 1LZNA 2Z2EA 3WPKA 2HEDA 1B7QA 1YKYX 4NSIA 5I4XA 4DD9A 3EO5A 1HFZA 2HEAA 1BQLY 2H9JA 1JTPL 4PGJB 1HFYA 1LSPA 1FLYA 1I1ZA 1UA6Y 3WW5A 2ZIJA 1J1XY 5LA8A 3TXIA 1GWDA 4II8A 4LYMA 1KIRC 1YKZX 1TCYA 5B05A 4WM5A 3RT5X 1IOSA 1VDQA 4FJRA 5ILCA 1LJKA 4B4JA 4U3XB 1UIHA 1XGQC 4WLDA 2W1MA 1YL0X 2W1XA 4HV1A 4WL6A 4M6DA 3WMKA 1GE0A 3N9CA 1LJ4A 1GF3A 4XYYA 4NEBA 3WW6A 1B7SA 1J1OY 4NSGA 1WQMA 2HECA 5KXXA 4OWAA 1HEMA 2BQAA 3ZVQA 4HSFA 1IP4A 1LHIA 1IWWA 1T3PA 4ZIXA 3TXJA 4PJ2C 1VDSA 2D4KA 3BKVA 1TAYA 4YF2A 1HEWA 3RNXA 1LSYA 2W1YA 4NY5A 4GN5C 1UICA 2ZNXY 5KKJA 2A7DA 1GFHA 5F9UA 4M4OA 1B7MA 1INUA 5HNLA 1B5WA 1F0WA 3E3DA 3B6LA 4NHIA 1YILA 3WVYA 1QUTA 3N9EA 1GDXA 2EKSC 4RLNA 5D5CA 5B07A 4ETAA 1HHLA 2DQEY 5D5FA 5LXWA 1LZ6A 2ZILA 1DKKA 1HEQA 1LMCA 1FLWA 4TTDA 1DI4A 135LA 1LJJA 1LMNA 1REYA 2I6ZA 1BB6A 5DL9A 1V7SA 5I4YA 1OUGA 5KXRA 1B5VA 1IC4Y 1LZBA 3ULRA 1GFAA 3IJUA 4ML7A 4DYGA 3QY4A 1GBZA 5DN5A 5I54A 5K7OA 2Q0MX 3AYQA 4ETBA 3CQLA 2HEFA 1BGIA 4GCEA 3HBHA 3LYMA 3WUNA 8LYZA 2XTHA 1JHLA 4N9RA 2BPUA 2F30A 4GCBA 4XJIA 4WM4A 208LA 2PC2A 1IWZA 2BQMA 2MEEA 1IWTA 4KT3A 3WULA 3LYTA 4DD0A 4H9AA 1FBIX 1IEEA 1BWHA 1TEWA 2BQBA 1GD6A 4LGKA 4WLTA 1OUAA 4CGEA 5APFA 5DN4A 2DQGY 3P4ZA 4LZTA 1IC7Y 1B7OA 1DPXA 1IP7A 5FDJA 4YM8A 4WLYA 3WU9A 5LINA 4HJZA 4W96A 1NDMC 4AXTA 1CKFA 4NIJA 1GFJA 6LYZA 3A91A 1LZDA 2YBMA 1NF5A 4HP0A 4PRQA 5FHWA 3TXKA 1ZV5L 3CB7A 4LT3A 5KKIA 3CT1A 1OUFA 2AUBA 2BQEA 1YAQA 2BQFA 2G4QA 1IORA 1UIFA 1LJEA 4RDSA 1VEDA 2BAAA 5AMYA 5LVGA 1SQ2L 5I5QA 2MEIA 4H9EA 1UC0A 1JKBA 2F4AA 4LYTA 5FSTA 3GXKA 5LYTA 3AB6A 207LA 1GBSA 1OUDA 2I26L 1BHZA 1GF0A 3LZ2A 5LAGA 3W6AA 5FEKA 1JSFA 4YOPA 1ZVYB 3A94A 1H6MA 1LCNA 2MEAA 1REMA 4OWHA 1LJNA 1VDPA 1GF6A 1IP2A 2I25L 4G9SA 4HPIA 1QSAA 1F10A 1HFXA 1KXXA 1C43A 4NHTA 2H5ZA 1OUEA 1LJFA 1QDTA 4H8YA 1AZFA 3J4GA 1IR7A 1IWYA 5LYZA 193LA 1EQ5A 1IC5Y 1CJ6A 5C6IA 4Z98A 4H94A 5I53A 4HTQA 5C6JA 3WXUA 1YL1X 2BQKA 1BVXA 5C6LA 5LYMA 1GPQC 5APEA 5DLAA 1GE3A 4RW1A 1D9UA 2YBJA 1G7LC 4Z3MA 2DQCY 1GBYA 2BQIA 1LYYA 3F6ZA 1B2KA 1F6SA 1LMAA 1LAAA 3W3EA 4XADA 1BWIA 4E3UA 1IVMA 1YROA 1IX0A 3N9AA 4UWNA 3AZ6A 1ZMYL 1G7JC 2G4NA 4H9CA 4IASA 4N1EI 3HBDA 2YBNA 4TUNA 1JTOL 1LYOA 3RW8A 3VWOA 5KXMA 2G4PA 5HNCA 4NGKA 4NGZA 1HSXA 5B59A 3G3AB 4NSHA 2DQJY 5M1YA 4WM6A 1XEIA 4YENA 1D0KA 4ZEEA 1C08C 1C7PA 4NHSA 1C10A 1FLQA 4B0DA 3EMSA 4WM3A 3P68A 1J1PY 4MSTA 3WUMA 1JSEA 1C45A 2YBLA 2D6BA 1D0LA 5LVJA 1LHMA 1AKIA 2BQLA 3WU7A 5IELA 2MEFA 3A3QA 1GF8A 4WLXA 1GE4A 4BAFA 132LA 2BLXA 1JISA 4MR1A 3RU5A 4I0CA 1GE2A 1GF4A 1MLCE 4WO9A 4CJ2A 4ETDA 4HJVA 1YAOA 1JJ0A 4DDBA 1LSZA 1GB9A 2NWDX 1NBZC 4UWUA 4GN4A 1WVUA 4J1AA 1ZVHL 3HBEX 3A3RX 3A8ZA 1DI5A 3T6UA 4L41A 4OOOA 5KXZA 1XSFA 2FYCA 2BLYA 5KXYA 2BQOA 1HMKA 4RW2A 3IJVA 1NHEA 1LSFA 2RSCA 4H1PA 4QDNA 2YBHA 3A96A 3FI7A 4XJGA 4H8XA 1CKDA 2A7FA 4NWEA 1RJCB 2D4IA 2DQIY 1LKRA 4R0FA 2EQLA 1B5UA 1LZYA 1AM7A 3P64A 4B4IA 4G4CA 1GXXA 1WQPA 1XGTC 3LHMA 4WOAA 1GXV2 5F9XA 194LA 5LIOA 1UIGA 1JKDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RFPA 1LYGA 1L67A 1DYAA 158LA 5F14A 256LA 118LA 1CKCA 1UIAA 1JWRA 2CGIA 5T3FA 2B72A 3QE8A 1CU3A 1P2RA 1B7LA 1L57A 6LZMA 215LA 1DI3A 3SBAA 1LWGA 1D3FA 3L64A 1L29A 3ODUA 1LJ3A 1G7HC 4ETEA 1CTWA 3ATNA 5HMJA 1RE2A 4OO9A 4OOTA 3W6DA 2RB1X 4J7VA 1HEOA 5EBHA 1LSBA 6LYTA 5LAFA 3C82A 1L40A 4PRUA 3CT0A 1VAUA 4N0JA 4ARMA 1YQVY 5LVKA 1C64A 1GB8A 1XJUA 1HC0A 4GLAA 3HT7A 1L08A 5F81A 4DQ7A 1OUBA 2QB0B 1B5ZA 3SB7A 2O4WA 3M18B 154LA 1D0MA 1GF9A 4MCKA 1OUIA 130LA 1G1WA 4TSBA 1XGPC 3QAKA 4EKQA 1KW5A 1WQOA 1L47A 1LGXA 1DXJA 3A95A 1LZTA 1LSCA 1L60A 1LMTA 3SB6A 3B0KA 1G7MC 1L06A 4KXIA 1QIOA 4WM1A 1C67A 1JQUA 1P46A 3GULA 1L36A 120LA 1IIZA 1D6PA 1LJHA 3A34A 2DQDY 2CWIA 4H9IA 2B6WA 1L91A 1SX7A 240LA 4DT3A 4LYOA 4TWSA 1QT5A 4NGOA 4CHXA 139LA 1GE1A 1YANA 4UWVA 2ZQ4A 2RH1A 223LA 4LFXA 2ZQ3A 1L79A 4DD7A 3EXDA 1LZ1A 1NKHA 1DQJC 1Z55A 3WU8A 1QTCA 3HH5A 1LSMA 2B5ZA 1YKXX 1BB5A 220LA 1P2CC 5A3EA 5E9RA 3M3UA 2X0AA 1RI8B 1IR8A 4EPIA 4H90A 3ZEKA 3WVXA 4ANRA 1GB6A 1GFVA 1KIPC 212LA 147LA 3T36A 1HEPA 1L19A 4W59A 3K3TA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1G7I C;  2IFF Y;  1LMQ A;  5JEN B;  1IP1 A;  1RFP A;  1QQY A;  4G4B A;  4J1B A;  153L A;  2DKV A;  1JTT L;  2LYM A;  4H9H A;  1UBZ A;  4DD2 A;  5F14 A;  3AZ7 A;  4QY9 A;  1GB0 A;  1IY4 A;  1OP9 B;  1LSE A;  1YAP A;  2FBD A;  1CKC A;  2FBB A;  2LZ2 A;  2MED A;  2YBI A;  4YEM A;  5HLL A;  4H93 A;  1UIA A;  2DBT A;  2HEB A;  2HU3 A;  4OW1 A;  2YVB A;  1JWR A;  1XGR C;  2CGI A;  4LYB A;  3KAM A;  5T3F A;  5J7C A;  3QE8 A;  5L3I A;  4PHI A;  3W6B A;  2XJW A;  4BS7 A;  133L A;  4C5F A;  1B7L A;  1NQI A;  1WVV A;  2LYZ A;  4FDY A;  1N4F A;  1DI3 A;  4HTK A;  1AT5 A;  3A93 A;  3WXT A;  4XN6 A;  9LYZ A;  1HF4 A;  1LJ3 A;  1G7H C;  4LYZ A;  1BB3 A;  3TXG A;  4ETE A;  1CJ7 A;  5HQ1 A;  1T6V L;  4DC4 A;  1GEV A;  1EQ4 A;  2Z18 A;  3ATN A;  5HMJ A;  4RLM A;  1RE2 A;  4NHP A;  3WUA A;  5I4W A;  4OOT A;  3W6D A;  3HFM Y;  4NG8 A;  1IOT A;  1SLY A;  5HMV A;  4J7V A;  2HEE A;  3G3B B;  1HEO A;  4G4H A;  5EBH A;  2VB1 A;  3AGI A;  4HTN A;  1IR9 A;  4DD3 A;  1LSB A;  1CKH A;  6LYT A;  3D9A C;  5LAF A;  4PRU A; 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 1F6S A;  1LMA A;  1LAA A;  3W3E A;  4XAD A;  1BWI A;  4E3U A;  1IVM A;  1YRO A;  1IX0 A;  3N9A A;  4UWN A;  3AZ6 A;  1ZMY L;  1G7J C;  2G4N A;  4H9C A;  4IAS A;  4N1E I;  3HBD A;  2YBN A;  4TUN A;  1JTO L;  1LYO A;  3RW8 A;  3VWO A;  5KXM A;  2G4P A;  5HNC A;  4NGK A;  4NGZ A;  1HSX A;  5B59 A;  3G3A B;  4NSH A;  2DQJ Y;  5M1Y A;  4WM6 A;  1XEI A;  4YEN A;  1D0K A;  4ZEE A;  1C08 C;  1C7P A;  4NHS A;  1C10 A;  1FLQ A;  4B0D A;  3EMS A;  4WM3 A;  3P68 A;  1J1P Y;  4MST A;  3WUM A;  1JSE A;  1C45 A;  2YBL A;  2D6B A;  1D0L A;  5LVJ A;  1LHM A;  1AKI A;  2BQL A;  3WU7 A;  5IEL A;  2MEF A;  3A3Q A;  1GF8 A;  4WLX A;  1GE4 A;  4BAF A;  132L A;  2BLX A;  1JIS A;  4MR1 A;  3RU5 A;  4I0C A;  1GE2 A;  1GF4 A;  1MLC E;  4WO9 A;  4CJ2 A;  4ETD A;  4HJV A;  1YAO A;  1JJ0 A;  4DDB A;  1LSZ A;  1GB9 A;  2NWD X;  1NBZ C;  4UWU A;  4GN4 A;  1WVU A;  4J1A A;  1ZVH L;  3HBE X;  3A3R X;  3A8Z A;  1DI5 A;  3T6U A;  4L41 A;  4OOO A;  5KXZ A;  1XSF A;  2FYC A;  2BLY A;  5KXY A;  2BQO A;  1HMK A;  4RW2 A;  3IJV A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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