2HEAA

Contribution of water molecules in the interior of a protein to the conformational stability
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGARAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Contribution of water molecules in the interior of a protein to the conformational stability.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 52
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1997-09-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2heaA00
1DI3A 5F9XA 1FN5A 1XEJA 1YL1X 2YBNA 4NGOA 4TTDA 1CJ7A 1LKSA 4RLNA 5IHGA 1D0LA 1GE0A 1ZMYL 4J1BA 2AUBA 4NGVA 1NWGA 1CKFA 2Z38A 5I4XA 5KXKA 4GCEA 5KXRA 4H9CA 3ZVQB 2LYOA 4W96A 3WPJA 4WO6A 2MEAA 4KXIA 2Z39A 2W1YA 1LSFA 1LSPA 1IO5A 3TXBA 1GWDA 4XN6A 1H6MA 4H8ZA 1IWTA 5B06A 4LYZA 3WXTA 1CJ9A 5E4PA 5KXPA 3IJVA 3TXDA 3TXFA 3TXGA 4NFVA 1REMA 5KXMA 1IOTA 3A6BY 4N0JA 4YENA 3T36A 4DD3A 1G7LC 1IP7A 1KXYA 4OWAA 1MLCE 4HJVA 4LYTA 3IWRA 1OUDA 4YEOA 1I20A 5LA5A 1HSXA 2XBSA 4HP0A 4ET9A 1CKGA 4PRUA 1NDMC 1C10A 3IJUA 5DN5A 1KXXA 1LJGA 4H91A 1YAQA 3W3EA 4ET8A 1LZTA 4CFOA 4CGEA 1LJIA 4NY5A 1CJ8A 1B7RA 2XTHA 5DN4A 5I53A 3TXEA 2EPEA 1LSYA 3WUAA 1VDSA 1ZVHL 1GF5A 3A34A 4ML7A 1VFBC 3P64A 1OUCA 3W6FA 5FSTA 1IOCA 5KXXA 1LZ4A 1IOQA 3D9AC 3TMVA 1C08C 1D9UA 1J1PY 4G4CA 1A2YC 1QTEA 4NHSA 4B49A 1YKXX 1N4FA 1WTMA 3AB6A 2CGIA 2YVBA 5LVGA 4NG1A 2EIZC 4E3UA 4NIJA 1QSWA 3EO5A 3CT0A 6LYTA 1UIFA 1BWHA 1LMTA 3B0OA 4OWCA 4ANRA 2D4JA 3GXKA 4M4OA 1LMPA 3CSRA 3LZTA 5II3A 5L3HA 1FLUA 1SQ2L 2HU3A 4XJHA 1GBOA 4AGAA 1AZFA 5T3FA 5KXTA 4TSBA 3RZ4A 1OUAA 1QUTA 4BS7A 1D6QA 1JKDA 2IFFY 1GAZA 1IWZA 3WH1A 2MEBA 3TXHA 1GBSA 4Z46A 4UWUA 3WVXA 5IELA 3WYHA 4G4HA 1BWJA 1TEWA 2D4IA 2WARA 2BQEA 3KAMA 4TWSA 1IWYA 1HNLA 5FHWA 1OUHA 1HFXA 3CB7A 2HEFA 4HSFA 1NBYC 3OJPA 5J7CA 154LA 1IC5Y 4YF2A 4OWHA 193LA 2Z2FA 1GFGA 1FBIX 5D5FA 1GBZA 1LMCA 3P65A 5E9RA 4X3BA 5C6LA 4J0LA 1VDQA 2CDSA 3P4ZA 5KXZA 1LZ6A 2CJLA 4L41A 1BB5A 2HEDA 1RI8B 3A94A 4HV1A 4H9IA 2VB1A 4XJIA 5APFA 1OUBA 1WQQA 1YAPA 2Z18A 2DBTA 1DPWA 3J6KA 2LZ2A 4WG7A 1LAAA 1LMAA 3LYZA 1JHLA 1G7HC 1NKHA 3ATNA 4H90A 4NWHA 4ETDA 1GB3A 1FKVA 2H5ZA 1EQ4A 1GF3A 1B5VA 1QQYA 4MR1A 5HNCA 1FLYA 1HENA 2B5ZA 1BQLY 2H9KA 5AMYA 3LZ2A 1LZCA 1JTTL 5F16A 1G7JC 4NHIA 5M1YA 1HEOA 3B0KA 1BB6A 1CJ6A 4N8ZA 2BPUA 1LMQA 1TAYA 9LYZA 4FDYA 1GF0A 2N5ZA 5FDJA 1IP4A 1UICA 2Q0MX 1DXJA 1GB5A 4KT3A 4LT1A 5DLAA 5LYZA 4CJ2A 5I4WA 1WQRA 4C3WA 2YBLA 1QDRA 133LA 4ZIXA 1LZ1A 2FYDA 1JWRA 1YKZX 5F9UA 1REXA 1HC0A 4N5RA 1W6ZA 1MELL 3W6EA 1HMLA 1J1OY 2HTXA 3RT5X 4NSIA 5I4YA 1F10A 3WPKA 3T6UA 4H94A 4Z41A 1JJ0A 1GBXA 1NBZC 1LZ8A 1LYYA 3N9CA 1GFEA 194LA 2DQDY 1OUEA 5LVIA 1GFAA 1LCNA 1LZ5A 1RE2A 1WQMA 3AZ4A 1JIYA 1BB3A 1IWWA 1ALCA 1GE4A 1GPQC 3AZ5A 4IATA 4TX7A 1VDPA 3HBHA 1LOZA 4WMGA 2DQHY 4WM6A 4CHXA 1XGPC 1BVXA 3A92A 5LYTA 1HMKA 4GN5C 5APDA 4HTQA 1ZVYB 2Z37A 1W08A 3HBDA 3A6CY 1IWVA 4LT0A 4ETAA 153LA 1LSDA 1HEMA 2EQLA 1FDLY 7LYZA 134LA 1B9OA 1JSEA 4J1AA 1TDYA 1LJNA 5ILFA 5DL9A 1KIPC 2FYCA 3WMKA 2YBHA 2RSCA 1LSMA 3B0IA 4LT2A 1VATA 2FBBA 3GXRA 1LZAA 4QDNA 5KKIA 4YOPA 2YSSC 1G7IC 2F4GA 4RDSA 4OW1A 3WXUA 1GF9A 4WLXA 2HEEA 2G4QA 4BADA 2BQHA 3E3DA 4NSGA 4Z3MA 2BQOA 4HPIA 3QNGA 4ZFPA 1HEPA 1LZGA 5KXLA 1LYOA 4H8YA 2Z2EA 1IWXA 4YEMA 1LSZA 4MSTA 4NGJA 4DDAA 1JJ3A 2BQDA 1CKHA 1GHLA 208LA 1WVUA 4AXTA 2ZYPA 4PGJB 1GFKA 1OP9B 1YIKA 2DQCY 3AGIA 2D6BA 1IP6A 2W1LA 4XENA 1AKIA 4H9HA 3QE8A 3G3BB 1DKKA 1IC4Y 3EBAB 4H9BA 1GE2A 1Z55A 5LIOA 4WG1A 4OWEA 1OUGA 1OUIA 1B0DA 4G4BA 2MECA 4PHIA 4ETEA 1LYZA 4LYCA 4J7VA 2BQLA 3CT1A 4B1AA 1LZ9A 3AZ6A 1IP1A 4N1CC 3CSQA 1UIDA 1INUA 1I56A 1IR9A 1GF8A 5LVKA 2H9JA 4HJYA 3A95A 3EXDA 1JEFA 1KIQC 1LJ3A 1LZEA 1RFPA 2BLYA 4H9FA 4WM2A 3WUNA 1I1ZA 4DD0A 1LSAA 4UWNA 3M3UA 2LHMA 4GCFA 4R0FA 1C45A 4B0DA 1GB8A 4HV2A 2GV0A 2MEGA 4GN4A 1IP5A 4GCBA 5D5CA 2BQFA 2NWDX 1GB7A 3AW7A 4LYBA 5C6IA 2HU1A 5LVHA 1J1XY 4PPOA 4KL7A 4R6CA 5DM9A 4PJ2C 1IWUA 1UA6Y 1JUGA 2HUBA 4DYGA 3QY4A 1B5YA 3AGHA 1GFHA 1IP2A 1REZA 1IY3A 1VEDA 3B72A 2LZTA 5B05A 3TMXA 1LHKA 5JENB 4WLYA 2ZQ4A 3A8ZA 2ZWBA 3BKVA 2MEFA 4IASA 3RW8A 4O34A 3ULRA 1SLYA 1GF6A 1HELA 2D91A 3CSZA 5LAFA 1EQ5A 5IDDA 3RU5A 5B59A 2BQIA 4G9SA 2ZILA 4ETCA 1GEZA 3BKHA 4B4EA 1EQEA 4DT3A 5FCPA 1B7SA 4NWEA 1LJFA 3VWOA 1D0KA 2A7FA 1GFVA 1H87A 4NG8A 1PZYA 4M6DA 2ZQ3A 3TMWA 8LYZA 5B1GA 1GE1A 5LINA 2BQKA 3W6AA 1XEIA 2MEIA 4ZEEA 5L3IA 1F0WA 2Z19A 3A3RX 3TXIA 4OOOA 3A96A 4DC4A 4LYMA 2C8PA 1IVMA 1OQMA 1LZDA 4NGIA 3N9EA 5KXNA 4QY9A 1F6RA 3WPLA 1B5ZA 1HERA 1LJEA 1DZBX 2CWIA 135LA 4H9AA 4RLMA 4XJFA 1YL0X 1G7MC 1JISA 2G4NA 4D9ZA 2BAAA 2YBIA 4LZTA 1IP3A 3P68A 4NGWA 4B4IA 1C46A 3OK0A 1OUFA 2MEDA 4GLAA 4DD2A 5FEKA 4B4JA 5K7OA 3FE0A 4WO9A 2YDGA 2XJWA 2I6ZA 1LHJA 4GN3A 1UIEA 1VAUA 2Y8PA 4GCDA 5FELA 1IEEA 3HFMY 4GLVA 5A3ZA 2DKVA 5KXWA 1TCYA 2BQMA 4UWVA 1GE3A 3LYTA 1REYA 1RJCB 3EMSA 1LPIA 3TXJA 4DD1A 4U3XB 2ZNWY 3AJNA 2G4PA 1VDTA 4NEBA 1IOSA 1GFRA 1DPXA 1LJ4A 3HBEX 2F4AA 3ATOA 3WW5A 4MCKA 5A3EA 2BQGA 1D6PA 1LYSA 1P2CC 1CNSA 1UIAA 1GFJA 3TXKA 4ETBA 1E8LA 4NGYA 4NHTA 3TMUA 4H93A 4RW1A 1T6VL 5HNLA 5LAGA 3AW6A 2W1XA 2MEHA 4NGKA 1XGRC 2LYMA 1LHMA 1UACY 2I25L 1PS5A 1T3PA 1GFTA 1C43A 2BQAA 1LJHA 2DQFC 2Z12A 1HSWA 1YROA 5LYMA 1GBYA 4DDCA 4P2EA 1C7PA 1LSCA 4GCCA 4Z98A 3ZVQA 5HMJA 1BWIA 4XADA 2MEEA 4WL6A 4WM3A 4OOTA 1JJ1A 3J4GA 5I54A 2W1MA 4NHQA 4BAPA 1LJKA 1O23A 5KXYA 1XGQC 1IORA 3A93A 5KY1A 1HF4A 5LXWA 4CFPA 1B5UA 3AZ7A 4WOAA 1DKJA 1QDTA 4EMNA 5KXOA 3W6DA 1LMOA 1LHIA 1YANA 1LMNA 1LHLA 1GDXA 2BLXA 2DQEY 3F6ZA 1YAMA 1WQOA 1IY4A 4I8SA 5HLLA 1YILA 4NHPA 4LYOA 1GXXA 1A4VA 1BVKC 1LSEA 1DI5A 2F30A 4OWBA 1LSNA 1QUSA 2DQIY 3M18B 4XJBA 1LTMA 3G3AB 1HHLA 1LZBA 2XBRA 1EL1A 3FI7A 1WQNA 4NGZA 5I5QA 1UC0A 1QTKA 1XEKA 5LA8A 1JKBA 1BB4A 1B5XA 1GF4A 4WM5A 1JPOA 1B7PA 132LA 1JTOL 2YBJA 1GAYA 2C8OA 5B07A 1FLWA 1LHHA 2BQNA 1AT5A 4DWXA 4EOFA 2LYZA 1GB2A 1GDWA 4QGZA 4N1EI 1IX0A 3A67Y 1JSFA 1KXWA 1TBYA 1YKYX 2ZYCA 4WLTA 1IC7Y 1OUJA 2X0AA 2ZIJA 3AYQA 4NSHA 5KJ9A 3B6LA 1BHZA 3LHMA 1B5WA 4A7DA 2ZNXY 5B1FA 4H92A 1IR7A 1B7OA 1V7SA 1AT6A 1XGUC 4KPMA 1DQJC 4WM1A 3WL2A 2BQJA 4DD9A 2BQBA 4IJ4A 4TSCA 207LA 6LYZA 1D0MA 4G49A 3CT5A 1BGIA 5F81A 1LZNA 1NQIA 1LJJA 1V7TA 3RNXA 3W6BA 4DDBA 2PC2A 2F2NA 3LYOA 1IIZA 1JITA 4NSJA 3WVYA 4XYYA 1F6SA 4WM4A 3A91A 1ZV5L 4TUNA 4W94A 1GB0A 3WU9A 1GD6A 4NGLA 3WUMA 1JTPL 2EKSC 1UIGA 5ILCA 1HEQA 3P66A 1NHEA 4C5FA 3WW6A 1LSGA 1CKCA 1LKRA 2YBMA 3D3DA 5APEA 5KKJA 1WVVA 4HJZA 4HTNA 4PRQA 1KIRC 2HEAA 4H8XA 4N9RA 5APCA 1GEVA 4HTKA 1UCOA 5HQ1A 1B7NA 1B7LA 2I26L 4H1PA 4LT3A 1UUZC 5C6JA 2DQJY 1LZYA 4LGKA 1NMMA 1XFPL 1NDGC 1GFUA 1JKAA 1WTNA 1XSFA 2BQCA 1QSAA 2DQAA 2HECA 1QIOA 4I0CA 4LFXA 3WULA 4DD7A 1DI4A 1HFYA 1XGTC 5F14A 1FKQA 5KXSA 1AM7A 2D4KA 1GB9A 1HFZA 3WU8A 1RCMA 4BAFA 4XJDA 2HEBA 2DQGY 1GBWA 1YAOA 4YM8A 3N9AA 4QEQA 3LN2A 1IR8A 1BB7A 1UBZA 1WQPA 3WU7A 4FJRA 1GF7A 1GXV2 1UIBA 1UIHA 1LZSA 3CQLA 3ZEKA 1CKDA 1B7QA 1JKCA 2FBDA 3A90A 4H9EA 4LFPA 4WL7A 5L9JA 4XJGA 1HEWA 2IHLA 5LVJA 3W6CA 1B7MA 1B2KA 1LSBA 3AGGG 3K3TA 3LYMA 4RW2A 5HMVA 1YQVY 2A7DA 4HPEA 3A3QA 2ZIKA 4II8A 4WLDA 5EBHA 1LZRA 1GB6A 3SP3A 3MGWA 1FLQA 1NF5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1FN5A 1XEJA 1YL1X 242LA 3DN1A 1D0LA 199LA 2AUBA 1L66A 4WO6A 2Z39A 3TXBA 1GWDA 4H8ZA 3WXTA 3TXDA 1L64A 5KXMA 1IOTA 3JR6A 1G7LC 3OE9A 4HJVA 1L80A 4YEOA 1I20A 1CU2A 1HSXA 1CKGA 4PRUA 1C62A 4H91A 4CFOA 4NY5A 5DN4A 206LA 3TXEA 1SX7A 1QTVA 3OE6A 231LA 1ZVHL 3W6FA 5FSTA 1IOCA 198LA 1L68A 1C08C 1D9UA 1J1PY 1L03A 1LYFA 1PQMA 4G4CA 4B49A 2HUMA 1N4FA 1WTMA 245LA 4E3UA 1L91A 4M4OA 4AGAA 2HU3A 5KXTA 1L82A 3RZ4A 220LA 197LA 1JKDA 1L0KA 3WVXA 1L17A 3KAMA 4TWSA 1IWYA 5FHWA 4HSFA 3OJPA 1L30A 4YF2A 1GFGA 1FBIX 5D5FA 1LMCA 5E9RA 4J0LA 2HEDA 3DN3A 4H9IA 4XJIA 5APFA 1L07A 1L45A 1OUBA 1WQQA 125LA 2Z18A 2LZ2A 1LAAA 1SWYA 1L90A 148LE 1PQKA 1FLYA 5F16A 1LZCA 4NHIA 1HEOA 4ARMA 1NHBA 3DMXA 188LA 4KT3A 1GB5A 1L69A 4LT1A 4C3WA 133LA 3V2YA 228LA 4ZIXA 2FYDA 1REXA 3W6EA 1C61A 5I4YA 1L44A 2B70A 1LZ8A 3AZ4A 239LA 3OE8A 3HBHA 1LYDA 2LZMA 4CHXA 1C6AA 4GN5C 4EPFA 1L60A 4LT0A 4ETAA 3L64A 2EQLA 134LA 3C8RA 1C6NA 1KIPC 3WMKA 3B0IA 4QDNA 3CDTA 2YSSC 3HTDA 4NSGA 4Z3MA 1P7SA 4HPIA 1LYOA 145LA 4DDAA 1CKHA 4DQJA 2HUKA 1OP9B 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1DI3 A;  5F9X A;  1FN5 A;  1XEJ A;  1YL1 X;  2YBN A;  4NGO A;  4TTD A;  1CJ7 A;  1LKS A;  4RLN A;  5IHG A;  1D0L A;  1GE0 A;  1ZMY L;  4J1B A;  2AUB A;  4NGV A;  1NWG A;  1CKF A;  2Z38 A;  5I4X A;  5KXK A;  4GCE A;  5KXR A;  4H9C A;  3ZVQ B;  2LYO A;  4W96 A;  3WPJ A;  4WO6 A;  2MEA A;  4KXI A;  2Z39 A;  2W1Y A;  1LSF A;  1LSP A;  1IO5 A;  3TXB A;  1GWD A;  4XN6 A;  1H6M A;  4H8Z A;  1IWT A;  5B06 A;  4LYZ A;  3WXT A;  1CJ9 A;  5E4P A;  5KXP A;  3IJV A;  3TXD A;  3TXF A;  3TXG A;  4NFV A;  1REM A;  5KXM A;  1IOT A;  3A6B Y;  4N0J A;  4YEN A;  3T36 A;  4DD3 A;  1G7L C;  1IP7 A;  1KXY A;  4OWA A;  1MLC E;  4HJV A;  4LYT A;  3IWR A;  1OUD A;  4YEO A;  1I20 A;  5LA5 A;  1HSX A;  2XBS A;  4HP0 A;  4ET9 A;  1CKG A;  4PRU A;  1NDM C;  1C10 A;  3IJU A;  5DN5 A;  1KXX A;  1LJG A;  4H91 A;  1YAQ A;  3W3E A;  4ET8 A;  1LZT A;  4CFO A;  4CGE A;  1LJI A;  4NY5 A;  1CJ8 A;  1B7R A;  2XTH A;  5DN4 A;  5I53 A;  3TXE A;  2EPE A;  1LSY A;  3WUA A;  1VDS A;  1ZVH L;  1GF5 A;  3A34 A;  4ML7 A;  1VFB C;  3P64 A; 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 1LMN A;  1LHL A;  1GDX A;  2BLX A;  2DQE Y;  3F6Z A;  1YAM A;  1WQO A;  1IY4 A;  4I8S A;  5HLL A;  1YIL A;  4NHP A;  4LYO A;  1GXX A;  1A4V A;  1BVK C;  1LSE A;  1DI5 A;  2F30 A;  4OWB A;  1LSN A;  1QUS A;  2DQI Y;  3M18 B;  4XJB A;  1LTM A;  3G3A B;  1HHL A;  1LZB A;  2XBR A;  1EL1 A;  3FI7 A;  1WQN A;  4NGZ A;  5I5Q A;  1UC0 A;  1QTK A;  1XEK A;  5LA8 A;  1JKB A;  1BB4 A;  1B5X A;  1GF4 A;  4WM5 A;  1JPO A;  1B7P A;  132L A;  1JTO L;  2YBJ A;  1GAY A;  2C8O A;  5B07 A;  1FLW A;  1LHH A;  2BQN A;  1AT5 A;  4DWX A;  4EOF A;  2LYZ A;  1GB2 A;  1GDW A;  4QGZ A;  4N1E I;  1IX0 A;  3A67 Y;  1JSF A;  1KXW A;  1TBY A;  1YKY X;  2ZYC A;  4WLT A;  1IC7 Y;  1OUJ A;  2X0A A;  2ZIJ A;  3AYQ A;  4NSH A;  5KJ9 A;  3B6L A;  1BHZ A;  3LHM A;  1B5W A;  4A7D A;  2ZNX Y;  5B1F A;  4H92 A;  1IR7 A;  1B7O A;  1V7S A;  1AT6 A;  1XGU C;  4KPM A;  1DQJ C;  4WM1 A;  3WL2 A;  2BQJ A;  4DD9 A;  2BQB A;  4IJ4 A;  4TSC A;  207L A;  6LYZ A;  1D0M A;  4G49 A;  3CT5 A;  1BGI A;  5F81 A;  1LZN A;  1NQI A;  1LJJ A;  1V7T A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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