2HEEA

Contribution of water molecules in the interior of a protein to the conformational stability
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQGNSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Contribution of water molecules in the interior of a protein to the conformational stability.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 53
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1997-09-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2heeA00
3W6DA 2BQMA 1YL0X 1IC7Y 5DM9A 3LYMA 4G4HA 1LZ9A 5KXYA 3EO5A 1XGRC 1HEWA 2MEEA 4RW1A 5DLAA 2MEIA 1IC5Y 1IORA 1C08C 4WL7A 5B05A 3WU8A 4TTDA 4LYTA 5LA8A 3W6CA 2CWIA 4MR1A 3A94A 2HU3A 2DQGY 2H9KA 1DQJC 1F0WA 4BAPA 1TEWA 1FBIX 1GDWA 4N0JA 3TXHA 4B4EA 1HFYA 1BB3A 4WLYA 4I0CA 5LIOA 4M6DA 3CSZA 4OWBA 4EMNA 1IX0A 5L3HA 3WXTA 2FYDA 3AW7A 1GFUA 1IOQA 1IOTA 1LMOA 1KIRC 1OUHA 1LSYA 2FYCA 3AZ4A 3LHMA 1IOSA 3QE8A 1VDPA 4NSGA 5LXWA 1REXA 3K3TA 5KKJA 1REYA 1MLCE 3A91A 5HMVA 5B1GA 1XGPC 3QNGA 1OUFA 2AUBA 4WOAA 4Z46A 1LSEA 1KIPC 1GPQC 1GDXA 4HJYA 1IWVA 1JISA 1G7JC 1GFAA 1LJIA 3OK0A 1LZTA 1LZYA 1LZBA 2C8OA 3P4ZA 3TXFA 1Z55A 1PS5A 5LAGA 4DDCA 1LZDA 1J1PY 4HSFA 3WPJA 4FDYA 1GEZA 1VATA 5KXTA 4H9BA 3B72A 1LTMA 2G4PA 4TUNA 1OUDA 1VDQA 5LVHA 1JSFA 1JEFA 1QTEA 4C5FA 1IWXA 2XBSA 1LZSA 4LGKA 1HC0A 1BGIA 1HMKA 1J1XY 1UIHA 2Q0MX 2Z19A 5IELA 4PHIA 4B1AA 5KXXA 4LYZA 3A34A 1B5VA 1D0KA 1OUJA 3HFMY 4EOFA 5LYTA 3WW5A 1WQRA 2DQHY 5F9UA 1DI3A 3A6CY 4KPMA 1LZ8A 1HENA 5JENB 1B7OA 1KXWA 4NSHA 1GAYA 4OWAA 1DKJA 1JKCA 2YVBA 5F9XA 3WUMA 3P64A 2HTXA 2XJWA 3LYZA 4LFXA 4ETBA 2B5ZA 2ZIKA 4NFVA 5II3A 3ULRA 3ZVQA 3RW8A 1CJ7A 2Z2EA 2MECA 4H9HA 4N1CC 153LA 3W6EA 2D6BA 1HEOA 1GF9A 1GFRA 3F6ZA 4XJBA 1B7NA 5K7OA 5L9JA 1SLYA 1IWZA 1AM7A 4NGKA 3J4GA 4DC4A 5HLLA 1IWWA 4NG8A 2ZWBA 5D5CA 4CHXA 1XSFA 1B7RA 1IEEA 4I8SA 1LJHA 3QY4A 1LYSA 4A7DA 1H6MA 4OWCA 1LZ1A 1HFZA 1LJ4A 2BQAA 5B06A 1E8LA 1LZGA 1UIBA 1BWJA 1ZVHL 4DD9A 5F14A 4CGEA 2BQLA 1NMMA 4J1BA 1LMPA 4PPOA 1DKKA 1B7LA 4J0LA 3WU7A 3WPLA 1DPXA 1RI8B 4NGYA 1QQYA 2MEGA 3AZ5A 1LMTA 6LYTA 1SQ2L 1V7TA 2FBDA 4OWEA 5B59A 2H5ZA 3KAMA 1VAUA 5FELA 4N1EI 1WQQA 2BLXA 1LSDA 3AJNA 3J6KA 3G3BB 1IO5A 1UC0A 3MGWA 2A7FA 3RNXA 1C10A 2NWDX 1GAZA 1JPOA 1YL1X 2CJLA 3B0OA 1D9UA 1HEMA 4KXIA 2HEAA 1GFTA 4HTQA 4TSCA 2BQCA 4ETCA 1REZA 1IWUA 3AGIA 5FSTA 3RZ4A 3AGGG 4GLVA 4R6CA 2DQFC 1LHHA 2BAAA 1LJGA 4PGJB 4XYYA 1LCNA 1W08A 4WLXA 4NGZA 3AYQA 2YBHA 1GF8A 1OUIA 4NHPA 3A93A 4WM1A 1WTNA 4J7VA 1HF4A 3TXBA 1GB8A 1QUTA 5I5QA 1B7MA 4PRUA 4ET8A 2YSSC 4IASA 1GFHA 5KXRA 3TMVA 1YKZX 5I4YA 1B9OA 1F6SA 4W94A 1UA6Y 2A7DA 2W1LA 4GCEA 1IP1A 1FN5A 2Z2FA 4TSBA 1CJ9A 3RT5X 1UBZA 3WYHA 5A3EA 1XEKA 1OUCA 3WUNA 2CDSA 3B6LA 4HJZA 4BS7A 1EQ4A 3CSRA 1UICA 2PC2A 4MSTA 3A92A 1CKDA 3LZ2A 8LYZA 4ANRA 5FEKA 1LZ5A 1W6ZA 2DKVA 1J1OY 4II8A 2BLYA 4QY9A 5KXOA 2RSCA 4IATA 3WPKA 1NHEA 1GEVA 3TMXA 6LYZA 4NWEA 3TXDA 1FDLY 1A4VA 3IJUA 5C6IA 1OUGA 1RCMA 3M3UA 3TXEA 1LMNA 3WMKA 4HV2A 1HFXA 1LKRA 1KIQC 1NWGA 2F4GA 4CFOA 4H9AA 1B7SA 5FHWA 5I53A 2BPUA 2YBJA 1EQ5A 1XEJA 1CJ8A 3WVXA 1BWHA 3W6AA 1HEPA 3P66A 4QDNA 4WLDA 2D4JA 5FCPA 2ZQ3A 2ZQ4A 1VDSA 1YANA 4OW1A 5APDA 5KKIA 2CGIA 4DD2A 1LAAA 1JWRA 1GB3A 133LA 1IC4Y 194LA 5ILFA 1HNLA 1I56A 3RU5A 5KXZA 2ZNXY 3B0IA 3IJVA 1GB5A 1C43A 1GBOA 3A6BY 3GXRA 3TXJA 4NSJA 1GD6A 1HELA 1AZFA 1LJJA 5APEA 5A3ZA 3B0KA 1GBWA 1YQVY 4N5RA 4N9RA 3T36A 1V7SA 1XFPL 1G7MC 1AT6A 1YAPA 4ETDA 1G7HC 2Z37A 4Z41A 3A96A 4GN5C 3AZ7A 1JTTL 3EBAB 3WXUA 4NWHA 3SP3A 1IP2A 1B7PA 1LZ4A 4H8XA 4J1AA 5I4WA 1CKFA 4LYCA 207LA 4WG1A 2HEDA 4GCBA 4GN4A 1LSPA 1JKAA 5KXPA 1LZAA 4PRQA 3LYTA 1I1ZA 4ML7A 2Z18A 5LYZA 193LA 1IR8A 2DBTA 1GXXA 1QUSA 5D5FA 1LSCA 2D4KA 4H90A 2G4QA 3P68A 4NHSA 1UACY 4TX7A 1JHLA 2Z39A 4KL7A 2W1XA 4H93A 4WM5A 4G4BA 4LYMA 1XEIA 4NGIA 1LZEA 2EIZC 4WM4A 4ZEEA 4H9FA 5KJ9A 4CFPA 2LZTA 4RDSA 5DN4A 1IP4A 1CKGA 1AT5A 1LKSA 3FE0A 4FJRA 1OQMA 3CSQA 1IIZA 1LSGA 3E3DA 5IDDA 4DD7A 4NGLA 1RJCB 2D4IA 4RLMA 1B0DA 3TMUA 1IVMA 4L41A 2F4AA 1TBYA 2YBLA 1UIAA 1OUBA 4E3UA 2BQBA 4RW2A 1YIKA 1VEDA 1MELL 3A8ZA 1LYYA 1LSBA 1D0LA 2BQOA 3D9AC 5APCA 2ZIJA 5APFA 4ET9A 7LYZA 1GBZA 3AGHA 5E9RA 4M4OA 3WW6A 1KXXA 2DQEY 1NBZC 1GE4A 4ETEA 3M18B 3CT5A 5L3IA 4XJDA 3WU9A 4WM6A 2HU1A 5T3FA 4B4JA 1HERA 2HEFA 1NDGC 1WVVA 1ZV5L 4NY5A 208LA 4YOPA 2ZYPA 5AMYA 1D6QA 2N5ZA 1GF7A 2EKSC 4RLNA 1GF5A 1GF0A 1P2CC 1LJFA 5EBHA 1HEQA 1YAMA 4WO6A 1JKBA 1TCYA 2FBBA 2YBIA 5HMJA 1IP6A 1T3PA 2LYOA 3LN2A 4WM2A 1UCOA 1JTOL 1WQPA 1GBSA 4IJ4A 4W96A 5LVJA 2W1YA 4H1PA 3VWOA 1WTMA 3CT0A 2DQAA 1QSWA 1LZNA 3A67Y 5B1FA 4KT3A 1BB4A 4NG1A 4PJ2C 1UIFA 4LFPA 4LT0A 1G7LC 4YEMA 1JITA 2BQHA 1LZRA 1YAQA 1B5XA 1GBXA 4DD1A 1GB2A 1XGTC 2EQLA 4QGZA 2Y8PA 1IP3A 3W3EA 5F16A 1B5ZA 1QSAA 1BVXA 2BQEA 3CT1A 3LYOA 1DI4A 4GCCA 4XJIA 2I6ZA 2BQKA 3FI7A 3P65A 2WARA 1LHMA 4LT3A 5KXNA 3WULA 4WLTA 1C45A 1NKHA 2HECA 2YBNA 1UIEA 4DDAA 1IP7A 5IHGA 4U3XB 3EMSA 1FLUA 1GFGA 1INUA 4H9IA 1BWIA 1WVUA 3OJPA 1FLYA 1B7QA 2ZNWY 3TXKA 5LAFA 1BB7A 3ZEKA 1JUGA 1CNSA 2XTHA 1OUEA 1HSXA 1QDRA 1IOCA 1GB6A 1D6PA 4TWSA 1DPWA 1G7IC 1XGQC 1YILA 4G9SA 1GF4A 4NHTA 1JJ1A 2ZYCA 3N9AA 1CJ6A 1FLWA 3BKVA 2IFFY 1KXYA 2BQGA 5KXWA 2C8PA 5LVKA 1LZ6A 2I26L 1LYOA 1GE0A 3AW6A 2LHMA 5DN5A 1GB0A 4BADA 1I20A 4CJ2A 4NHIA 5KXMA 1OUAA 3WUAA 1YROA 1VDTA 1A2YC 1GFVA 2DQCY 1LHIA 4WM3A 5LVIA 3WVYA 4AXTA 4HPIA 1IWTA 2D91A 1YKYX 2MEHA 5KXKA 1BB6A 135LA 4ETAA 4HV1A 2W1MA 1LOZA 4H9EA 3GXKA 4HJVA 1UIDA 1T6VL 1GE1A 5B07A 4ZFPA 4B0DA 1GE3A 1LMAA 2MEDA 1LZCA 4HPEA 4HTKA 4YEOA 3T6UA 3D3DA 4G49A 1LSAA 134LA 4Z3MA 4XENA 1LMQA 3WL2A 1NDMC 1JKDA 1RE2A 5HNLA 1QTKA 2XBRA 3LZTA 3TXIA 1QDTA 5M1YA 1C7PA 1TAYA 2BQFA 3TXGA 1PZYA 1IR7A 1B5WA 1IWYA 1YKXX 1LJNA 4QEQA 4MCKA 1BVKC 1UUZC 1IP5A 1UIGA 5KXSA 3HBHA 2DQJY 5LYMA 4XJFA 1YAOA 1HSWA 3CB7A 4NHQA 4WL6A 3A95A 5E4PA 154LA 4NEBA 1QIOA 1DXJA 4HP0A 2LYMA 1GWDA 2BQDA 4NGVA 1ALCA 5C6LA 1REMA 4XADA 1LSZA 1FLQA 2HEEA 3EXDA 4LT2A 2ZILA 4OOTA 3A3RX 4UWUA 3TMWA 2IHLA 3AB6A 2F30A 4DDBA 4DD3A 4X3BA 4GCDA 4DT3A 5LVGA 5F81A 4R0FA 4BAFA 3AZ6A 4B49A 4NIJA 1ZMYL 9LYZA 5I4XA 4DWXA 1DI5A 3HBDA 1LSNA 1F10A 1GBYA 1LHJA 1IY4A 1NF5A 1LJKA 2F2NA 2VB1A 1GF3A 5ILCA 4H8ZA 1WQMA 2DQIY 132LA 2EPEA 1LPIA 2X0AA 1GFEA 3N9EA 1JTPL 2YDGA 4NGWA 1B2KA 4Z98A 2Z38A 1BB5A 2H9JA 3A3QA 1VFBC 4O34A 3CQLA 4LYOA 3BKHA 1OP9B 4H94A 4LT1A 2MEFA 2YBMA 1CKHA 1B5YA 2DQDY 4H91A 4GLAA 2Z12A 1HHLA 4XJHA 5KXLA 1O23A 2GV0A 1LHLA 3A90A 4G4CA 2BQJA 3ZVQB 1LSFA 4WG7A 1GB9A 3WH1A 2LZ2A 3N9CA 4YENA 4OOOA 2HEBA 2MEAA 5HQ1A 1IR9A 2LYZA 1LJEA 1GXV2 1JSEA 4H92A 5C6JA 3ATOA 4C3WA 1JIYA 1NQIA 4XJGA 5DL9A 4UWNA 1H87A 1LJ3A 3ATNA 1HMLA 5J7CA 1LMCA 1AKIA 1RFPA 1GF6A 4HTNA 4OWHA 4XN6A 1XGUC 1CKCA 1GFKA 1DZBX 5KY1A 1WQNA 4DYGA 5I54A 1GB7A 1F6RA 4B4IA 1N4FA 4ZIXA 4YM8A 5HNCA 1GE2A 2G4NA 4GCFA 2HUBA 1LSMA 4YF2A 1EQEA 1WQOA 4NGJA 1LHKA 4AGAA 3G3AB 4GN3A 4LYBA 1NBYC 2I25L 1BHZA 1IY3A 1JJ3A 2BQIA 1LYZA 4H8YA 1BQLY 1GFJA 4D9ZA 4H9CA 1TDYA 2MEBA 1EL1A 5LA5A 2BQNA 4DD0A 4N8ZA 3HBEX 1C46A 4P2EA 4WO9A 5FDJA 3W6FA 4NSIA 3W6BA 1D0MA 3IWRA 4LZTA 1ZVYB 1JJ0A 1FKQA 4UWVA 5LINA 4NGOA 4WMGA 1B5UA 1FKVA 1GHLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
185LA 172LA 1YL0X 5DM9A 3EO5A 1XGRC 4RW1A 4LDLA 4WL7A 5LA8A 1XJTA 3A94A 1L48A 1GDWA 1P64A 1HFYA 3G3XA 3DN3A 4OWBA 5L3HA 3WXTA 1IOQA 3VW7A 1OUHA 1L98A 1QSBA 229LA 5LXWA 1REYA 1CU6A 188LA 3QNGA 3G3VA 1LI2A 2OTZX 1KIPC 1GPQC 1L53A 1IWVA 1LJIA 1G7JC 217LA 1LZYA 1SX7A 251LA 1C67A 1VATA 2OE9X 2G4PA 5I14A 4C5FA 1IWXA 1LZSA 1HMKA 1J1XY 3CDTA 164LA 125LA 1QT7A 3HFMY 4EOFA 3A6CY 238LA 4KPMA 119LA 1GAYA 1DKJA 2YVBA 2XJWA 225LA 2B5ZA 253LA 3ZVQA 3RW8A 1QUGA 2Z2EA 153LA 252LA 1GF9A 1L01A 1T6HA 5L9JA 1SLYA 1IWZA 4NGKA 171LA 1IWWA 2ZWBA 1XSFA 1IEEA 1L13A 4OWCA 2BQAA 1E8LA 4E97A 112LA 1BWJA 1DKKA 3WU7A 2MEGA 3AZ5A 1V7TA 5B59A 2H5ZA 3KAMA 5FELA 192LA 4EXMA 247LA 3G3BB 1QTZA 2A7FA 1L66A 3RNXA 1GAZA 1QTVA 4KXIA 223LA 2LCBA 1L64A 2BQCA 205LA 4GLVA 1LHHA 1W08A 3AYQA 2YBHA 3C7YA 4NHPA 3A93A 1WTNA 1L56A 4PRUA 4ET8A 1GFHA 259LA 1YKZX 1QS9A 2RBNA 1F6SA 4W94A 1UA6Y 2W1LA 5A3EA 2Z2FA 2CDSA 1EQ4A 1LYEA 4MSTA 4EKSA 4IATA 4NWEA 1L26A 1FDLY 1L84A 1RCMA 3HDEA 3TXEA 3WMKA 1L0KA 3DN4A 3DKEX 126LA 5I53A 2HULA 2F2QA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3W6D A;  2BQM A;  1YL0 X;  1IC7 Y;  5DM9 A;  3LYM A;  4G4H A;  1LZ9 A;  5KXY A;  3EO5 A;  1XGR C;  1HEW A;  2MEE A;  4RW1 A;  5DLA A;  2MEI A;  1IC5 Y;  1IOR A;  1C08 C;  4WL7 A;  5B05 A;  3WU8 A;  4TTD A;  4LYT A;  5LA8 A;  3W6C A;  2CWI A;  4MR1 A;  3A94 A;  2HU3 A;  2DQG Y;  2H9K A;  1DQJ C;  1F0W A;  4BAP A;  1TEW A;  1FBI X;  1GDW A;  4N0J A;  3TXH A;  4B4E A;  1HFY A;  1BB3 A;  4WLY A;  4I0C A;  5LIO A;  4M6D A;  3CSZ A;  4OWB A;  4EMN A;  1IX0 A;  5L3H A;  3WXT A;  2FYD A;  3AW7 A;  1GFU A;  1IOQ A;  1IOT A;  1LMO A;  1KIR C;  1OUH A;  1LSY A;  2FYC A;  3AZ4 A;  3LHM A;  1IOS A;  3QE8 A;  1VDP A;  4NSG A;  5LXW A;  1REX A;  3K3T A;  5KKJ A;  1REY A;  1MLC E;  3A91 A;  5HMV A;  5B1G A;  1XGP C;  3QNG A;  1OUF A;  2AUB A;  4WOA A;  4Z46 A;  1LSE A;  1KIP C;  1GPQ C;  1GDX A;  4HJY A;  1IWV A;  1JIS A;  1G7J C;  1GFA A;  1LJI A;  3OK0 A;  1LZT A;  1LZY A;  1LZB A;  2C8O A;  3P4Z A;  3TXF A;  1Z55 A;  1PS5 A;  5LAG A;  4DDC A;  1LZD A;  1J1P Y;  4HSF A;  3WPJ A;  4FDY A;  1GEZ A;  1VAT A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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