2LHMA

Crystal structures of the apo-and holomutant human lysozymes with an introduced ca2+ binding site
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLDDNIADDVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of the apo- and holomutant human lysozymes with an introduced Ca2+ binding site.
pubmed rcsb
molecule keywords HUMAN LYSOZYME
molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Homo sapiens
total genus 50
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1991-10-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2lhmA00
3FI7A 1GF5A 4HTKA 3A90A 2HEEA 1HFXA 1A4VA 5KXZA 1GE3A 3WYHA 4ZFPA 1YAOA 1LZEA 4TUNA 1H87A 1VEDA 3AYQA 1IP4A 1WQRA 4DT3A 4H93A 4I0CA 1IP3A 4QY9A 2Z37A 1QUTA 1LSMA 1HFZA 1UICA 3ZVQB 1DQJC 3TXEA 5I5QA 3P68A 4LT3A 4DD2A 5FSTA 2LZTA 1H6MA 2G4QA 3N9CA 2BQIA 1LMNA 5KXNA 4B4IA 4ZEEA 4WL7A 1BVXA 4EMNA 1GBZA 2D6BA 2LYMA 4XN6A 1FLQA 1OUEA 1GE4A 1EQ4A 2B5ZA 1KXXA 1LZ8A 1BGIA 1GFRA 3WW6A 4B49A 4PRQA 1BB4A 1LSCA 1MELL 4HSFA 4NHSA 4OOOA 4ETCA 3A3QA 9LYZA 4OOTA 5LXWA 1YKYX 4WM5A 5D5CA 3WW5A 3WL2A 4NHTA 3A96A 3LN2A 4HPEA 4H91A 4A7DA 4ET8A 2HECA 2GV0A 4W94A 1IORA 1MLCE 1UACY 4OWEA 2D4KA 5I4WA 2I25L 3GXRA 2DQHY 2H5ZA 3P4ZA 4RDSA 4NG1A 4WM6A 2BQCA 2FYCA 3G3AB 1LZAA 5HMJA 5FDJA 4NIJA 1UC0A 1CJ6A 2DQIY 4H92A 4WG1A 3LYZA 4NEBA 5DM9A 1LZDA 2ZWBA 4GCDA 3W6EA 1YL0X 3WU9A 4LYTA 1OUFA 1LHKA 1T6VL 1UCOA 1LHLA 1KIQC 3N9AA 4YF2A 2CGIA 2FBDA 3A6BY 4GCFA 1JPOA 1QTKA 1LMTA 5II3A 1JSFA 2BQJA 5B05A 3TMWA 4NHIA 1NMMA 1GWDA 2DQCY 1C10A 5KY1A 1B7LA 1JHLA 3N9EA 4GCEA 4YEMA 4NGZA 3LYTA 2DKVA 1UBZA 1LMPA 4B0DA 2G4PA 1JJ3A 2Z18A 3AZ7A 3W6AA 3A94A 3CB7A 2BQFA 1REZA 1GD6A 3D9AC 2FBBA 3RT5X 5E4PA 3W6BA 1GFKA 2MEFA 3T36A 4J0LA 3LYMA 2CJLA 1O23A 3E3DA 5L9JA 4LZTA 5LA8A 1HF4A 4G49A 4ET9A 1GB3A 1OUJA 1VATA 3LYOA 2DQEY 3LZ2A 1VFBC 4GN3A 1FLUA 133LA 1JKBA 3HBDA 1JJ1A 4H1PA 4U3XB 1F6RA 154LA 4WLTA 1REXA 1IC7Y 1OUHA 4B1AA 1DKJA 4WO6A 4C5FA 4DD9A 3B72A 3TXKA 1YIKA 1NHEA 2ZNXY 1C08C 1LZBA 1G7IC 3CSZA 1GB0A 4OW1A 3TMUA 5LAFA 1KXYA 1IP6A 2XTHA 1IIZA 2DQJY 2LYOA 4NHQA 1PZYA 2HUBA 1QSAA 4WMGA 1UIAA 1BVKC 1D0KA 3IJUA 3AJNA 4TTDA 4WO9A 2H9KA 3CT1A 1DI3A 4CFOA 5ILCA 1TEWA 4M6DA 5LVHA 2HEAA 1LAAA 1NWGA 4Z98A 4QEQA 4P2EA 1F0WA 1OQMA 1C7PA 1LZNA 1LMAA 4HPIA 4MCKA 3TMVA 4PPOA 1B7NA 3OJPA 2D4JA 3WUMA 1GB7A 1TDYA 4G4BA 4TSBA 6LYTA 2H9JA 2Y8PA 2N5ZA 1D0LA 3TXIA 1IP1A 1E8LA 1CKHA 3QE8A 4RLMA 2W1LA 1J1PY 1INUA 1B5WA 5B07A 1BB3A 2BQDA 1GAZA 1C46A 1GF7A 1OUCA 4NGWA 4XJIA 1RE2A 1YKXX 4TSCA 4D9ZA 3WPKA 2BPUA 194LA 1DI4A 1HMLA 4NSIA 1LZYA 1GB2A 2MEIA 1UIDA 4G9SA 4N1EI 1XGQC 1ZVYB 3TXJA 1LHIA 1B5UA 4HV1A 1LYZA 2BQBA 2BQKA 3SP3A 4NGKA 4ANRA 4LT2A 1XGRC 4YOPA 1YQVY 1I1ZA 3WXTA 5J7CA 7LYZA 2RSCA 1FKVA 2BQMA 4HJVA 1B7SA 1HEWA 4WM2A 2YBNA 1UIFA 2YDGA 5AMYA 1HSXA 1B2KA 4XYYA 5LINA 1FBIX 2Z2EA 1ZMYL 3AB6A 1XGPC 2DQFC 1FLYA 1F10A 4UWUA 1CJ9A 1CNSA 2A7FA 1LJFA 1B7OA 1OUAA 1G7JC 4KT3A 1HEMA 2YBHA 1IC5Y 2XBRA 3D3DA 4DDCA 1YKZX 1GEVA 1YANA 4WLDA 5HQ1A 3WULA 3CT0A 4GLVA 5I4XA 1LZSA 3ATNA 4WM1A 3AW6A 3AW7A 4H8YA 1LSNA 4XJGA 3QNGA 1LHMA 1REMA 1LHJA 5C6JA 1RI8B 1OUIA 1BB7A 2W1YA 4KL7A 1GB8A 2ZILA 1VDTA 5EBHA 1WQPA 3AGHA 2BQGA 2YSSC 1JJ0A 4MR1A 4AXTA 2DQDY 4DDBA 1GPQC 3B0OA 4HP0A 1IOTA 1IOSA 2WARA 1HENA 1XSFA 2XBSA 4BAPA 2I6ZA 3RZ4A 1EQEA 1D6PA 1UIBA 2HEBA 2YBLA 1HSWA 1LYSA 4TX7A 1GE1A 2C8OA 1WVVA 5HNCA 1LJ3A 2NWDX 3ATOA 4H9IA 4IATA 2LYZA 5FHWA 4XADA 1CJ7A 1SLYA 4KXIA 3A67Y 1OP9B 1LZCA 2IFFY 3WVXA 132LA 5L3HA 4NSGA 1GFGA 4RW1A 4NGVA 5HLLA 3LZTA 5IELA 4HJZA 1T3PA 5IHGA 1LTMA 4R0FA 4OWAA 4WOAA 4B4JA 1XEKA 5C6LA 4OWCA 1LZ1A 2Z38A 2EQLA 4ETEA 4XJDA 5LVJA 5I53A 3A8ZA 2W1XA 2ZIKA 3EXDA 3IWRA 2Z2FA 1HEQA 3J4GA 2HTXA 4XJBA 2BQNA 1EQ5A 1LJJA 1YROA 1FLWA 4NGLA 153LA 3RW8A 1GHLA 1A2YC 4X3BA 4LYBA 1LOZA 4WM4A 4NG8A 1IWVA 1XGTC 4XJHA 4IJ4A 3WU7A 4LT1A 4N8ZA 1WQOA 4H9BA 4RLNA 3ZEKA 1NF5A 1BWIA 4H94A 4AGAA 1IY3A 4NY5A 3TXDA 4DDAA 5KXTA 1YILA 2AUBA 4PGJB 3WU8A 1IWWA 1HFYA 3A6CY 5B06A 4DC4A 1YAQA 1GB5A 4QDNA 2ZQ3A 1RCMA 1PS5A 2BAAA 1HMKA 2MEHA 4GCCA 1WTNA 1JTOL 5HNLA 5LVIA 1OUDA 5KXRA 1YAMA 5KXXA 207LA 1LJNA 1VAUA 1LYOA 5KXWA 1JITA 1LSEA 3WMKA 5KXPA 1NDGC 4WLXA 1CKCA 2MEBA 4H9EA 1LHHA 4GN5C 1HERA 5C6IA 3WVYA 3WPJA 5E9RA 1GBSA 4DD0A 5F9XA 4H9AA 5F14A 3A34A 1LPIA 2DBTA 1JKAA 1NBZC 4OWBA 2LZ2A 1G7MC 4BAFA 1B7MA 1D0MA 2MEAA 4H9FA 5T3FA 4ETDA 1JEFA 3W6FA 4KPMA 5A3ZA 1SQ2L 1AT6A 2EIZC 2ZYCA 2BLXA 4FJRA 4I8SA 5LVKA 1JIYA 1REYA 1QSWA 3TMXA 1LSGA 2W1MA 4GN4A 5M1YA 2BQHA 1IP5A 1GFEA 4NWEA 4MSTA 1HEPA 4NGYA 4C3WA 2BQEA 2C8PA 5APEA 1GF8A 1QDRA 4CGEA 1IEEA 2F4GA 1LMOA 3P66A 1BB5A 1FKQA 1TAYA 2DQGY 3CT5A 3ULRA 4DD1A 1KIPC 1B5YA 4HJYA 1KXWA 1Z55A 2F2NA 4LFXA 1GF3A 3QY4A 4GCBA 1G7LC 4YM8A 3M18B 3HBEX 4Z46A 1I20A 2CWIA 4CHXA 1P2CC 1IY4A 3IJVA 134LA 3GXKA 4WM3A 5APFA 1GFJA 1NBYC 2ZIJA 4LYMA 1IVMA 4J7VA 1KIRC 5APCA 4ETAA 1LYYA 1CKFA 1VDSA 1BQLY 1B9OA 1LSDA 2IHLA 1AM7A 3AGIA 1ALCA 1LZ5A 2XJWA 1DI5A 1UUZC 5F81A 1J1XY 1HELA 5LIOA 2A7DA 1HC0A 3W3EA 5KXKA 1JWRA 1DKKA 4Z3MA 3B0KA 5KXOA 4J1BA 4RW2A 1JTTL 2PC2A 3OK0A 3AZ6A 4O34A 2MEGA 4WL6A 1B5ZA 1FDLY 1GFTA 4ML7A 1GE2A 1IO5A 3A93A 1XEIA 3HFMY 4ETBA 4J1AA 1GBYA 1GE0A 1IOQA 1DZBX 1VDPA 4G4CA 1BB6A 1D9UA 1WQQA 1GDXA 4NHPA 3AZ4A 3A95A 2BQAA 1JSEA 3B0IA 3CSRA 3P64A 1LSYA 3A91A 1GB6A 4H90A 4PHIA 5DN5A 3W6CA 1GFHA 1EL1A 1BWJA 1RJCB 1V7TA 3KAMA 4LYCA 5KXLA 3ZVQA 1IP2A 1LJGA 1IR8A 1UIEA 1TBYA 1IWXA 1IR9A 2LHMA 1GFVA 1BHZA 1GXXA 2BQOA 4NGIA 5F16A 2G4NA 5LYZA 1GF0A 4LFPA 1AT5A 5DN4A 135LA 4H9CA 3WUAA 3P65A 1LMQA 1QDTA 3VWOA 3W6DA 1I56A 1LJHA 4OWHA 3WUNA 5LA5A 4Z41A 4L41A 3T6UA 1CJ8A 1GFUA 5LYTA 1UA6Y 4NWHA 4WG7A 5FELA 1LZRA 2BLYA 1OUBA 1IR7A 4M4OA 1LSFA 3RU5A 1LZGA 1GBOA 4H8XA 1QTEA 4DD3A 3MGWA 4NFVA 1LSPA 5DL9A 1WQMA 1GBWA 4YEOA 1IX0A 1JKDA 1WTMA 4BS7A 4LGKA 2F30A 2ZNWY 2HEFA 1AKIA 1QUSA 4WLYA 1GXV2 1LSBA 1XFPL 5IDDA 3EBAB 1DPWA 2X0AA 1UIGA 3FE0A 4W96A 2EPEA 3A92A 5ILFA 4G4HA 3WPLA 2FYDA 1HNLA 4HV2A 1B5VA 3LHMA 1B7PA 4HTQA 3K3TA 4PJ2C 1FN5A 5KKIA 1C45A 5KJ9A 1HEOA 4II8A 4XJFA 1XEJA 1NQIA 1ZVHL 3EMSA 4DYGA 1LZ9A 1GF6A 1LKSA 1IWUA 1QIOA 1G7HC 4R6CA 5L3IA 1B7RA 1W08A 1W6ZA 1IP7A 1CKGA 5B1GA 4DD7A 5I4YA 1GF9A 5F9UA 2HU1A 4NSHA 2HEDA 4IASA 2I26L 1LJ4A 6LYZA 4B4EA 2YBMA 5KKJA 1YAPA 1AZFA 3BKVA 8LYZA 4HTNA 3HBHA 1B0DA 3G3BB 4N0JA 2MEEA 3TXGA 5KXMA 4UWNA 4CFPA 5JENB 1DPXA 3TXFA 1D6QA 3AZ5A 3F6ZA 2MECA 1B5XA 1XGUC 1WQNA 1BWHA 1F6SA 4H8ZA 2D4IA 3J6KA 4DWXA 1NDMC 2YBIA 3CQLA 4GLAA 1LKRA 4FDYA 1IWZA 1JISA 1HHLA 1J1OY 4LYOA 1C43A 1QQYA 1VDQA 1GBXA 4TWSA 5D5FA 3A3RX 5DLAA 5FEKA 3TXHA 3TXBA 2ZYPA 4YENA 4NSJA 2Z39A 5LYMA 5I54A 1GDWA 193LA 1RFPA 1LZTA 3EO5A 4BADA 5A3EA 1IOCA 1IWTA 2CDSA 208LA 3B6LA 5B1FA 2YBJA 4LT0A 1LCNA 2MEDA 3CSQA 1LJIA 1IWYA 4UWVA 1LJKA 1WVUA 2EKSC 4EOFA 1DXJA 3WXUA 4LYZA 1JTPL 1NKHA 5KXYA 1V7SA 2Z19A 1IC4Y 1LZ6A 1CKDA 3AGGG 4NGOA 1TCYA 1YL1X 1GB9A 3WH1A 2Q0MX 2BQLA 4XENA 1B7QA 1LZ4A 1OUGA 2DQAA 3BKHA 2Z12A 4N1CC 4N9RA 5APDA 3RNXA 1LSAA 1UIHA 1LSZA 2HU3A 5KXSA 5LAGA 1GEZA 5B59A 4PRUA 2D91A 1GFAA 1LMCA 5HMVA 5K7OA 1JKCA 4QGZA 2VB1A 1JUGA 5FCPA 1N4FA 3M3UA 4N5RA 2ZQ4A 4CJ2A 1LJEA 2YVBA 4H9HA 4ZIXA 4E3UA 1GAYA 2F4AA 5LVGA 1ZV5L 4NGJA 1GF4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3FI7A 229LA 5KXZA 3A90A 1LYFA 3WYHA 1YAOA 1L29A 4K5YA 1LSMA 3ZVQB 4DD2A 2G4QA 4GBRB 2RAYX 4B4IA 4ZEEA 1KY0A 1L46A 183LA 1GE4A 3PDSA 2RB1X 1LZ8A 1BGIA 1GFRA 3WW6A 1BB4A 4OOOA 5LXWA 1YKYX 2B7XA 3WW5A 3C7WA 3WL2A 4NHTA 4A7DA 1IORA 166LA 4RDSA 5HMJA 1UC0A 4WG1A 185LA 4NEBA 5DM9A 1L24A 1C6TA 3C80A 1OUFA 1CV4A 3G3XA 3TMWA 4NHIA 2O4WA 1NMMA 2DQCY 5KY1A 1B7LA 2F47A 2G4PA 123LA 1JJ3A 2Z18A 258LA 1T8AA 190LA 2BQFA 1REZA 3D9AC 4J0LA 3LYMA 240LA 226LA 3LYOA 1L67A 201LA 3LZ2A 1JKBA 3GUPA 1REXA 1L22A 1C6BA 1XEPA 1NHEA 3V2YA 1C08C 1LZBA 1GB0A 4OW1A 3TMUA 1KXYA 1IIZA 2LYOA 4TTDA 4CFOA 5ILCA 1TEWA 4M6DA 4I7OA 4EXMA 4I7PA 1OQMA 1LZNA 1LMAA 1L33A 1T8FA 6LYTA 111LA 2H9JA 3TXIA 4LDLA 4RLMA 1B5WA 1YKXX 1L93A 194LA 1HMLA 1LZYA 1L65A 4YXAC 3HTBA 4LT2A 1C6IA 3WXTA 2B6WA 1SWYA 1FKVA 4HJVA 1P56A 131LA 2YBNA 1LW9A 2YDGA 1FBIX 3AB6A 237LA 215LA 1CNSA 1LJFA 1PQIA 4E97A 4DDCA 1GEVA 1L25A 3CT0A 4GLVA 2HUKA 4WM1A 1LSNA 1LHMA 1REMA 1RI8B 1BB7A 1GB8A 1L41A 1VDTA 5EBHA 3DN2A 1P2RA 144LA 1GPQC 199LA 1IOTA 2WARA 1B6IA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3FI7 A;  1GF5 A;  4HTK A;  3A90 A;  2HEE A;  1HFX A;  1A4V A;  5KXZ A;  1GE3 A;  3WYH A;  4ZFP A;  1YAO A;  1LZE A;  4TUN A;  1H87 A;  1VED A;  3AYQ A;  1IP4 A;  1WQR A;  4DT3 A;  4H93 A;  4I0C A;  1IP3 A;  4QY9 A;  2Z37 A;  1QUT A;  1LSM A;  1HFZ A;  1UIC A;  3ZVQ B;  1DQJ C;  3TXE A;  5I5Q A;  3P68 A;  4LT3 A;  4DD2 A;  5FST A;  2LZT A;  1H6M A;  2G4Q A;  3N9C A;  2BQI A;  1LMN A;  5KXN A;  4B4I A;  4ZEE A;  4WL7 A;  1BVX A;  4EMN A;  1GBZ A;  2D6B A;  2LYM A;  4XN6 A;  1FLQ A;  1OUE A;  1GE4 A;  1EQ4 A;  2B5Z A;  1KXX A;  1LZ8 A;  1BGI A;  1GFR A;  3WW6 A;  4B49 A;  4PRQ A;  1BB4 A;  1LSC A;  1MEL L;  4HSF A;  4NHS A;  4OOO A;  4ETC A;  3A3Q A;  9LYZ A;  4OOT A;  5LXW A;  1YKY X;  4WM5 A;  5D5C A;  3WW5 A;  3WL2 A;  4NHT A;  3A96 A;  3LN2 A;  4HPE A;  4H91 A;  4A7D A;  4ET8 A;  2HEC A;  2GV0 A;  4W94 A;  1IOR A;  1MLC E;  1UAC Y;  4OWE A;  2D4K A;  5I4W A;  2I25 L;  3GXR A;  2DQH Y;  2H5Z A;  3P4Z A;  4RDS A;  4NG1 A;  4WM6 A;  2BQC A;  2FYC A;  3G3A B;  1LZA A;  5HMJ A;  5FDJ A;  4NIJ A; 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 1YAP A;  1AZF A;  3BKV A;  8LYZ A;  4HTN A;  3HBH A;  1B0D A;  3G3B B;  4N0J A;  2MEE A;  3TXG A;  5KXM A;  4UWN A;  4CFP A;  5JEN B;  1DPX A;  3TXF A;  1D6Q A;  3AZ5 A;  3F6Z A;  2MEC A;  1B5X A;  1XGU C;  1WQN A;  1BWH A;  1F6S A;  4H8Z A;  2D4I A;  3J6K A;  4DWX A;  1NDM C;  2YBI A;  3CQL A;  4GLA A;  1LKR A;  4FDY A;  1IWZ A;  1JIS A;  1HHL A;  1J1O Y;  4LYO A;  1C43 A;  1QQY A;  1VDQ A;  1GBX A;  4TWS A;  5D5F A;  3A3R X;  5DLA A;  5FEK A;  3TXH A;  3TXB A;  2ZYP A;  4YEN A;  4NSJ A;  2Z39 A;  5LYM A;  5I54 A;  1GDW A;  193L A;  1RFP A;  1LZT A;  3EO5 A;  4BAD A;  5A3E A;  1IOC A;  1IWT A;  2CDS A;  208L A;  3B6L A;  5B1F A;  2YBJ A;  4LT0 A;  1LCN A;  2MED A;  3CSQ A;  1LJI A;  1IWY A;  4UWV A;  1LJK A;  1WVU A;  2EKS C;  4EOF A;  1DXJ A;  3WXU A;  4LYZ A;  1JTP L;  1NKH A;  5KXY A;  1V7S A;  2Z19 A;  1IC4 Y;  1LZ6 A;  1CKD A;  3AGG G;  4NGO A;  1TCY A;  1YL1 X;  1GB9 A;  3WH1 A;  2Q0M X;  2BQL A;  4XEN A;  1B7Q A;  1LZ4 A;  1OUG A;  2DQA A;  3BKH A;  2Z12 A;  4N1C C;  4N9R A;  5APD A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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