2NTHA

Structure of spin-labeled t4 lysozyme mutant l118r1
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSCRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Structural determinants of nitroxide motion in spin-labeled proteins: Tertiary contact and solvent-inaccessible sites in helix G of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
total genus 56
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2006-11-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2nthA00
1L56A 168LA 2B75A 2B72A 1L57A 3HUQA 125LA 259LA 2HUKA 1L89A 213LA 4YXAC 4W59A 1KY1A 1L22A 1LYFA 1XEPA 223LA 138LA 1OV5A 1L73A 2RB2X 4DAJA 251LA 4ARPA 172LA 1D3JA 3HTFA 1QT3A 1C6LA 2RAYX 1QSBA 110LA 3CDVA 3CDOA 3FI5A 3GUMA 123LA 1CV3A 3PDSA 1L74A 1G0PA 3SB9A 1C6HA 1XJUA 3OE6A 1C6IA 4AQNA 1L54A 1P7SA 2RB0X 1TLAA 1CU6A 246LA 156LA 1C67A 2B6ZA 1LW9A 2L78A 1C6PA 4LDOA 4I7SA 1L50A 3DKEX 3FADA 1L27A 131LA 3K2RA 149LA 1QTCA 218LA 4I7MA 3OE8A 1C6FA 1LWGA 191LA 2QB0B 164LA 1L19A 214LA 3CDRA 1C60A 178LA 235LA 1QTVA 232LA 4ARQB 3HT8A 1LYDA 4EPIA 2RBSA 3C8SA 1L07A 1L60A 1QT7A 3DMXA 3GUNA 1KW5A 1DYAA 256LA 4ARMB 4I7LA 1L92A 1C6CA 1PQKA 186LA 3SBBC 1L85A 3SB5A 222LA 234LA 3C83A 6LZMA 143LA 2RH1A 1SWZA 227LA 1LI3A 249LA 3OE9A 1QT5A 3HDEA 1C6BA 113LA 159LA 198LA 102LA 1CTWA 1CV1A 137LA 4ARJA 1D2YA 4EKQA 109LA 1LYIA 1QUDA 3NY9A 192LA 245LA 258LA 211LA 2B7XA 3GULA 1QS5A 3HT9A 1L25A 1P37A 3UONA 1L13A 1L59A 1PQMA 3NYAA 1C6QA 3HH6A 1L00A 1L64A 2OU8A 3C8QA 4W54A 177LA 255LA 224LA 2F2QA 1C61A 3HU8A 4OO9A 260LA 1OVHA 182LA 1P46A 3C81A 4I7JA 1L32A 4DJHA 3EMLA 1G0GA 1D3MA 1L42A 1C62A 3CDQA 103LA 1L49A 163LA 129LA 4W58A 244LA 1L41A 3DN1A 1L69A 1QTHA 7LZMA 1LGXA 3C7ZA 1QTZA 1QUHA 3SBAA 1CV5A 1L93A 1QS9A 1CU0A 210LA 3DN8A 3HWLA 3PBLA 2F47A 3ODUA 217LA 3QAKA 187LA 4PK0A 181LA 1DYCA 2ANVA 4LDLA 1D2WA 1QUOA 3GUKA 1CV4A 1L96A 1C6MA 1L79A 1LYEA 2LZMA 1CX7A 1KS3A 146LA 2O7AA 1DYDA 4ARLA 201LA 160LA 200LA 112LA 1JTMA 4EKSA 1L29A 1P3NA 1L40A 3F8VA 1EPYA 1WTHA 1CUQA 4PJZA 3GUOA 1L98A 4S0WA 1KW7A 2Q9EA 118LA 1CU3A 162LA 1OYUA 3DN2A 2OU0X 4LDEA 1L55A 161LA 145LA 1P6YA 1L58A 120LA 1OV7A 219LA 1L66A 171LA 250LA 1L82A 167LA 4I7NA 1L38A 2OTZX 4I7KA 1L65A 1CVKA 197LA 114LA 1L0KA 1LYHA 3SN6R 2O4WA 3HT7A 1G0QA 1C64A 1L97A 3HDFA 1L02A 3HUAA 1C69A 176LA 4W53A 4DKLA 1JTNA 220LA 1QT4A 1L71A 3DN4A 2ANXA 3V2WA 1L61A 4EJ4A 1SX2A 1ZYTA 2B73A 3VW7A 1L43A 1P2LA 2RBRA 1L48A 1C6AA 1T97A 252LA 1LYJA 4LZMA 3CDTA 1C65A 2Z6BA 1C6TA 1LGUA 1L99A 225LA 3SB6A 3G3XA 4W55A 111LA 4EKRA 247LA 1L84A 1LGWA 4W57A 1OVKA 238LA 2NTGA 1L62A 1L75A 4GRVA 189LA 1G0LA 3G3WA 2RB1X 3HH3A 2OEAX 1OVJA 141LA 242LA 1QSQA 180LA 3GUIA 157LA 195LA 1XJTA 4EKPA 1ZWNA 3SB8A 237LA 1L15A 3HH4A 206LA 1L26A 139LA 1L90A 1C6GA 1P56A 229LA 2Q9DA 3DMZA 3HT6A 3V2YA 196LA 1C63A 122LA 239LA 4YXCA 5LZMA 1PQIA 2QARC 3LZMA 1ZURA 158LA 3DN0A 2RAZX 2OE7X 1L23A 215LA 1L16A 230LA 241LA 3SB7A 1L0JA 1LI2A 188LA 1D3NA 3RUNA 4W56A 1PQOA 1L45A 169LA 130LA 240LA 184LA 1L67A 4W52A 1L76A 1L88A 1NHBA 3HTGA 2LCBA 127LA 1L53A 262LA 3L64A 1G1WA 254LA 2CUUA 1CV0A 1L10A 1QTBA 1L21A 1DYBA 4YX7C 104LA 1LPYA 2HULA 1L03A 2O79A 3C80A 4I7PA 1L05A 1PQDA 1L04A 1L87A 144LA 1L86A 2RBPA 3HU9A 4I7OA 1L18A 3D4SA 119LA 190LA 166LA 1L52A 3DMVA 173LA 2IGCA 2RBQA 151LA 1C6EA 1L06A 1L11A 1L77A 2RBNA 1G07A 148LE 1QTDA 1G0JA 1L01A 1I6SA 1CU5A 1DYGA 1OWZA 1T6HA 231LA 1L39A 1P36A 1KY0A 4EXMA 1T8AA 2OE4X 1L14A 1LYGA 2NTHA 128LA 199LA 1D3FA 2OU9A 142LA 1OWYA 209LA 1L33A 1B6IA 1L24A 1QT6A 4ZPUA 3RZEA 3C7WA 5I14A 2F32A 1KNIA 4ARQA 4I7TA 1L09A 4W51A 1QUGA 1T8GA 1C6DA 1CX6A 3C82A 2OTYX 1L46A 3DN6A 3JR6A 155LA 1L37A 1P5CA 221LA 1L91A 4ARMA 226LA 3FA0A 1D9WA 1L47A 2LC9A 3HTDA 2B74A 1L36A 1DYFA 1DYEA 1SSYA 1L28A 3G3VA 1L68A 2B6WA 212LA 1LLHA 2B6XA 115LA 4IAPA 3C7YA 1CU2A 185LA 1G0MA 216LA 3F9LA 1SSWA 1G1VA 248LA 107LA 3HTBA 1LI6A 1L20A 257LA 1C6KA 1L44A 1C6NA 228LA 183LA 175LA 1K28A 1L80A 1L51A 3GUJA 174LA 4EPFA 1C6JA 1L34A 261LA 3C8RA 1CUPA 152LA 3HUKA 1T8FA 1L83A 165LA 1JQUA 2A4TA 1P2RA 1L72A 4I7QA 1CV6A 1L70A 108LA 1G06A 4GBRB 1C68A 1L17A 3DNAA 1SWYA 4K5YA 1L08A 2B70A 1L35A 243LA 170LA 205LA 2HUMA 1L95A 2B6TA 2OE9X 3L2XA 2RBOA 1L81A 1P64A 150LA 1L94A 4I7RA 1SX7A 140LA 1L30A 147LA 1PQJA 1G0KA 3OE0A 253LA 236LA 126LA 3HH5A 1LWKA 4E97A 2B6YA 1C66A 1QT8A 3GUPA 1L31A 3NY8A 1L12A 233LA 3DN3A 1L63A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L56A 1LKRA 1L57A 5L3IA 1OUAA 3A94A 259LA 4G4BA 1KY1A 4OW1A 223LA 1UIHA 1L73A 251LA 172LA 1JJ1A 2HEEA 5KXXA 4MR1A 2HU1A 4ETAA 4TUNA 3CDOA 2HECA 3PDSA 1HERA 2A7FA 3OE6A 4AQNA 1CNSA 1UIDA 1YROA 1JSFA 246LA 4LDOA 4I7SA 4W96A 4N8ZA 3FADA 1GF5A 1L27A 1CKHA 1B5ZA 164LA 1L19A 214LA 1G7HC 235LA 3A3RX 3ATNA 9LYZA 4ARQB 4TWSA 3AZ4A 3OK0A 2Z2FA 3WUAA 3BKHA 1GDXA 3TXGA 1RFPA 3E3DA 1XGQC 1C6CA 2H9JA 1L85A 1JKCA 1QQYA 4Z46A 143LA 2RH1A 1SWZA 2MEAA 3D9AC 4AGAA 249LA 3OE9A 4GCCA 3WPKA 1LTMA 2HU3A 1PS5A 1JKBA 1CTWA 1GF6A 137LA 2DKVA 1D2YA 4IJ4A 109LA 192LA 4H91A 2BQAA 2Z12A 1P37A 133LA 1LJFA 3SP3A 2HTXA 1IWZA 1L64A 1LZ1A 3C8QA 4W54A 4NHQA 4DQ5A 4UWVA 2F2QA 4H1PA 4ET9A 4PGJB 2EPEA 1IWXA 4I7JA 3C81A 4DJHA 1L42A 1D3MA 1C62A 1IORA 2G4PA 103LA 2BQFA 163LA 1SLYA 2W1MA 1L69A 2I6ZA 1OUHA 1HSWA 3A34A 4H8YA 4ANRA 1CU0A 1DKKA 1GBOA 4OWEA 4B4IA 1XGTC 3PBLA 3ODUA 217LA 1XEIA 4PK0A 3ULRA 1LZ6A 4DD3A 1GFGA 1YILA 4NG1A 1LMPA 3GUKA 1LZCA 2IFFY 1IR9A 1LYEA 2LZMA 1LHHA 1KS3A 1O23A 1WTMA 1DI4A 201LA 112LA 1L29A 5LIOA 1LHJA 1REZA 3RW8A 3GUOA 1L98A 1RI8B 2Q9EA 1LHKA 2XBRA 1CKGA 3LYZA 1OYUA 3DN2A 2BQIA 3TMVA 2D91A 1LJNA 4LFXA 4ETCA 4HV1A 120LA 219LA 1L66A 1IP1A 1BB3A 4FDYA 193LA 171LA 167LA 1VEDA 4I7KA 4KT3A 4H9EA 1HFYA 1L97A 1E8LA 176LA 2ZNXY 3TXDA 1T6VL 4HTNA 3N9AA 1L71A 2ANXA 3K3TA 4RDSA 5APDA 1P2LA 4OWCA 1L48A 1T97A 2DQHY 2AUBA 1RJCB 1GE1A 4XJFA 225LA 4RLMA 1FN5A 1GF8A 3AGGG 5HNCA 1LGWA 1OVKA 238LA 4NGZA 3ZVQA 1G0LA 1B7QA 2XQOA 4Z3MA 4XJHA 2OEAX 2D4JA 242LA 1IP5A 1QSQA 3B0OA 195LA 4LYZA 1UACY 1GBYA 4WM3A 1UIGA 1C6GA 5J7CA 3AJNA 5KXMA 4X3BA 2QARC 1ZURA 5DN4A 4H9AA 1L23A 1H6MA 1UIEA 1B5YA 230LA 3SB7A 4NGWA 3T36A 2BQJA 1L45A 240LA 4PHIA 1LKSA 4NHTA 2BLXA 1G1WA 254LA 3M18B 2HULA 3LHMA 4NSGA 3C80A 1L87A 144LA 1LHLA 2RBPA 3HU9A 3HBHA 119LA 1L52A 4NIJA 173LA 2IGCA 4WO9A 1C6EA 1L77A 3A90A 4NGKA 1G0JA 4OWBA 5LVGA 5LYTA 1L39A 4LYMA 1T8AA 1YQVY 1AKIA 4GLVA 3WPJA 1D3FA 3WMKA 1YIKA 1FLWA 1VAUA 3LZ2A 4J1BA 3C7WA 4GN3A 4H92A 4WM1A 2D4IA 1KNIA 3AYQA 1L09A 4W51A 1T8GA 5F9UA 1NWGA 1NKHA 2NWDX 3A6BY 3WU8A 1L37A 4UWUA 1D6QA 1OUIA 1P5CA 1FLYA 1ZVHL 1J1OY 4N5RA 1D9WA 2Q0MX 4DD1A 1L36A 1EQEA 1LMTA 1HFXA 1LJ3A 2CDSA 3TMXA 4IAPA 1G0MA 1GF3A 1SSWA 248LA 4LT2A 1LI6A 257LA 1KIPC 2YBIA 3TMWA 3W6AA 1L44A 3W6DA 228LA 183LA 175LA 2F4GA 1UIFA 1GB5A 4XJGA 4H9HA 1VATA 1L34A 3WUNA 1L83A 165LA 5I5QA 4LYTA 5B1FA 1P2RA 2C8PA 1IP4A 4U3XB 2FYDA 1CV6A 1JSEA 4L41A 1G06A 4GBRB 3TXIA 1C68A 1SWYA 1I20A 1L35A 243LA 2X0AA 1IC7Y 4YM8A 3L2XA 1BB7A 5E4PA 150LA 1L94A 3A92A 4QY9A 1LZ8A 1IIZA 5KJ9A 4DYGA 3WPLA 4R0FA 1IR8A 3HH5A 1LSPA 1F6RA 4RW1A 1GEVA 3CSQA 1GFAA 1LZBA 1C66A 1GBWA 3GUPA 4ETBA 1GBZA 3DN3A 233LA 3FI7A 168LA 1LSYA 5KXYA 1Z55A 1B7MA 4DT3A 1L89A 3A91A 4YXAC 4W59A 5IHGA 1L22A 3T6UA 4YEMA 2G4QA 1PZYA 4DD2A 1WQOA 2YBJA 135LA 4WLYA 1J1XY 3N9EA 1C6LA 2RAYX 1QSBA 3TMUA 3CDVA 3FI5A 123LA 4YENA 1L74A 4LT3A 1REXA 1G0PA 1C6HA 1C6IA 4DDBA 156LA 1C67A 1LW9A 1L50A 5A3ZA 1YL0X 2XJWA 4XENA 1QTCA 5LYZA 2QB0B 1DKJA 1EQ4A 3CDRA 2EQLA 4LZTA 2F4AA 2RSCA 4NWEA 4NFVA 3P66A 232LA 4EOFA 2W1XA 4M4OA 3HT8A 3C8SA 2DQAA 3P65A 1GE0A 2BQDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1L56 A;  1LKR A;  1L57 A;  5L3I A;  1OUA A;  3A94 A;  259L A;  4G4B A;  1KY1 A;  4OW1 A;  223L A;  1UIH A;  1L73 A;  251L A;  172L A;  1JJ1 A;  2HEE A;  5KXX A;  4MR1 A;  2HU1 A;  4ETA A;  4TUN A;  3CDO A;  2HEC A;  3PDS A;  1HER A;  2A7F A;  3OE6 A;  4AQN A;  1CNS A;  1UID A;  1YRO A;  1JSF A;  246L A;  4LDO A;  4I7S A;  4W96 A;  4N8Z A;  3FAD A;  1GF5 A;  1L27 A;  1CKH A;  1B5Z A;  164L A;  1L19 A;  214L A;  1G7H C;  235L A;  3A3R X;  3ATN A;  9LYZ A;  4ARQ B;  4TWS A;  3AZ4 A;  3OK0 A;  2Z2F A;  3WUA A;  3BKH A;  1GDX A;  3TXG A;  1RFP A;  3E3D A;  1XGQ C;  1C6C A;  2H9J A;  1L85 A;  1JKC A;  1QQY A;  4Z46 A;  143L A;  2RH1 A;  1SWZ A;  2MEA A;  3D9A C;  4AGA A;  249L A;  3OE9 A;  4GCC A;  3WPK A;  1LTM A;  2HU3 A;  1PS5 A;  1JKB A;  1CTW A;  1GF6 A;  137L A;  2DKV A;  1D2Y A;  4IJ4 A;  109L A;  192L A;  4H91 A;  2BQA A;  2Z12 A;  1P37 A;  133L A;  1LJF A;  3SP3 A;  2HTX A;  1IWZ A;  1L64 A;  1LZ1 A;  3C8Q A;  4W54 A;  4NHQ A;  4DQ5 A;  4UWV A;  2F2Q A;  4H1P A;  4ET9 A;  4PGJ B;  2EPE A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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