2OE4X

High pressure psuedo wild type t4 lysozyme
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Cooperative water filling of a non-polar protein cavity observed by high-pressure crystallography and simulation
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2006-12-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2oe4X00
3RZEA 1CU0A 1C6NA 123LA 210LA 1L81A 2RBOA 1L50A 1P56A 3C83A 144LA 3HWLA 1L28A 1PQOA 1L53A 4EXMA 1P36A 3DKEX 1L55A 3L64A 177LA 170LA 162LA 1L71A 2ANXA 4YXAC 1CU5A 1G0GA 1CX7A 1LWKA 1QT3A 1QUOA 214LA 261LA 3ODUA 1L00A 3F8VA 1L37A 1C68A 1QSQA 1G1VA 1D3FA 1QTHA 1LPYA 3V2WA 1L34A 166LA 1C6MA 1L63A 1CU6A 141LA 1LYIA 1L89A 115LA 1DYAA 1OWZA 262LA 4W57A 1LI6A 189LA 1C6FA 1ZURA 3CDVA 156LA 1L17A 140LA 3C80A 1L68A 3L2XA 3DN2A 2OU9A 3C8QA 198LA 168LA 2HUMA 190LA 1CV1A 1OYUA 1L39A 3SB6A 1L95A 188LA 150LA 1K28A 2OU0X 2RBRA 182LA 4ARMB 1C6BA 1L88A 232LA 3HH3A 1C69A 185LA 3HH5A 1L82A 1LLHA 1L49A 1CV0A 230LA 2O7AA 1G0QA 1D3JA 211LA 1C6DA 3F9LA 4OO9A 3HUQA 1L31A 1KW7A 1SSYA 1C6HA 1P5CA 1C64A 1OVHA 1SSWA 4IAPA 1DYDA 4GRVA 102LA 1L86A 1L42A 2QARC 2LC9A 2B74A 1D2YA 145LA 1CX6A 1SWZA 4S0WA 1QTDA 222LA 227LA 2HULA 2Q9DA 1OVJA 3CDTA 1P6YA 242LA 1CU2A 1L51A 1QT8A 3DMXA 256LA 4ARJA 2RBSA 1JTMA 1L38A 4W56A 246LA 1P64A 4ARQA 4EKSA 1L77A 1QSBA 1KW5A 1C6IA 1P2LA 1L07A 1QS9A 2RBQA 4I7NA 2O4WA 1L90A 2RB2X 3CDOA 1CV3A 1L92A 3DN3A 1OV7A 1OWYA 1PQJA 213LA 1PQDA 1L15A 1G0JA 1L64A 111LA 1L19A 3JR6A 2B6ZA 2B6XA 1ZYTA 174LA 3OE0A 3D4SA 209LA 3SN6R 259LA 181LA 1C6LA 1G0KA 228LA 2B7XA 1CUQA 3OE8A 138LA 3HT7A 1CV4A 1L76A 1P2RA 163LA 2ANVA 2OE7X 3V2YA 2Z6BA 155LA 3DMVA 3NY8A 245LA 1QTCA 3PBLA 1L20A 1C63A 4K5YA 1TLAA 1P7SA 1L06A 113LA 1L66A 4I7JA 2RH1A 149LA 218LA 167LA 3HTFA 3GULA 1C62A 1C6AA 4W53A 1QTZA 258LA 1L79A 234LA 2NTHA 126LA 1L41A 2NTGA 197LA 3C82A 125LA 4EPIA 4ZPUA 1QTBA 3GUOA 1LGWA 165LA 178LA 212LA 4YX7C 129LA 1L45A 224LA 4W54A 176LA 1T8FA 2OE9X 137LA 257LA 1L69A 3HTDA 1L05A 160LA 2OE4X 4I7MA 1L59A 215LA 3NYAA 4I7OA 225LA 3HU9A 1LGXA 1L98A 120LA 1DYBA 4I7LA 221LA 1T8GA 103LA 4I7PA 4ARPA 243LA 4LZMA 3HT8A 4W58A 4EKQA 161LA 1ZWNA 1I6SA 4PJZA 3C8RA 1L27A 3FI5A 2OEAX 3C7ZA 3C7YA 3CDRA 1L67A 1OVKA 1LW9A 3HUAA 1L97A 1QT7A 254LA 1P3NA 148LE 1L60A 1L44A 112LA 3DNAA 1LYFA 2RAZX 1KS3A 2F32A 1L0KA 1L30A 1L14A 147LA 239LA 1L61A 1L10A 1C61A 1L75A 1L35A 3G3XA 3G3VA 1L58A 3PDSA 2Q9EA 1QT6A 1QT4A 2B72A 183LA 3HT9A 2IGCA 4E97A 3HDFA 3NY9A 1NHBA 187LA 175LA 3VW7A 3GUJA 196LA 107LA 1L09A 3UONA 2QB0B 1D9WA 3FA0A 255LA 4I7TA 4W52A 4ARQB 1L83A 1L33A 3HTBA 4I7SA 1L32A 1L47A 1C6GA 1T8AA 1L80A 3SB7A 1LYDA 143LA 1L94A 1L56A 1DYGA 3CDQA 1L03A 4DKLA 3HU8A 4I7RA 3HT6A 1CVKA 1QTVA 151LA 231LA 1EPYA 4LDOA 4AQNA 4DAJA 1G06A 3HDEA 108LA 1L40A 1L48A 200LA 250LA 1SX7A 4EJ4A 184LA 1G1WA 201LA 139LA 3G3WA 3HH4A 1L43A 3K2RA 4I7QA 1CV5A 4GBRB 2B6WA 1LYHA 1L52A 7LZMA 169LA 1C6PA 1C66A 1L16A 127LA 1L29A 2O79A 1G0PA 2A4TA 146LA 236LA 1L57A 240LA 1C6EA 2HUKA 1L54A 1L85A 1L87A 3SB9A 1XEPA 1QT5A 3HUKA 4LDEA 3DN1A 2RB1X 1OV5A 3HTGA 152LA 1T6HA 104LA 1D2WA 1L93A 1PQIA 235LA 244LA 171LA 1L02A 1CU3A 1D3MA 158LA 1SWYA 1L01A 1L70A 1L21A 1C67A 1T97A 122LA 260LA 2F2QA 1L46A 4W55A 3DN8A 199LA 1G07A 2B6YA 3HH6A 1CTWA 1L13A 1L74A 1L08A 217LA 1JTNA 1DYEA 109LA 1L99A 2LCBA 173LA 251LA 1G0LA 118LA 1L11A 3DN0A 191LA 1L25A 1L36A 1LI2A 3DMZA 220LA 4W51A 4DJHA 1JQUA 1P46A 3GUKA 2RBPA 1G0MA 4W59A 1DYFA 4YXCA 3LZMA 1C6JA 2OU8A 195LA 1B6IA 253LA 2RAYX 2CUUA 233LA 3DN4A 5I14A 3C7WA 2B73A 1C6KA 2L78A 1QUGA 4ARMA 1L24A 3SB8A 216LA 2RBNA 1L23A 206LA 172LA 3RUNA 3SB5A 1LYGA 248LA 1L04A 4PK0A 3FADA 1CV6A 3C81A 1L18A 1C6TA 1LYEA 1PQMA 1L72A 5LZMA 1L0JA 131LA 1D3NA 1L22A 1QUHA 237LA 128LA 180LA 3GUIA 1XJUA 1CUPA 1LYJA 142LA 1C6CA 3OE6A 226LA 110LA 4ARLA 4EKRA 1L96A 1LGUA 130LA 3GUMA 1LI3A 229LA 3OE9A 2B70A 2OTZX 1C60A 1L26A 164LA 3EMLA 1P37A 1QUDA 3C8SA 223LA 205LA 6LZMA 1LWGA 238LA 1KNIA 1L91A 4I7KA 157LA 252LA 3QAKA 1XJTA 114LA 1L84A 3GUPA 1C6QA 1SX2A 2B75A 219LA 3GUNA 1L62A 186LA 2RB0X 2OTYX 249LA 1L73A 2LZMA 1DYCA 241LA 1L65A 1QS5A 3SBAA 1L12A 4EKPA 1C65A 1KY0A 1KY1A 247LA 2F47A 192LA 2B6TA 3SBBC 159LA 3DN6A 119LA 1WTHA 1PQKA 4LDLA 4EPFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H9AA 1C6NA 123LA 3D9AC 1BWHA 1P56A 1YANA 1DPWA 1HF4A 1I20A 1NF5A 1L53A 4LYOA 3DKEX 177LA 1L71A 4YXAC 1CX7A 1QUOA 1LZYA 1L00A 1C68A 3LYZA 4NHPA 1QTHA 1L34A 1B7RA 1LSCA 1CU6A 141LA 1L89A 115LA 1GF4A 4MR1A 3CSZA 5B1GA 2G4NA 4OW1A 3A94A 1C6FA 3CDVA 1L17A 2CWIA 4ZEEA 4G49A 4NG1A 1GE3A 1G7JC 1LZDA 1REXA 3W6CA 4GLAA 4YEMA 3SB6A 1VEDA 1YKYX 3OJPA 150LA 2YBMA 1WQMA 4B1AA 4XN6A 4ETCA 5HNLA 3RT5X 2BQBA 2DQDY 4WO6A 1WVUA 1IWUA 3LN2A 1GF9A 1LKSA 1BB4A 4D9ZA 1KW7A 2I25L 1C6HA 3TMUA 1OVHA 2A7DA 4WM3A 4NFVA 2LC9A 2B74A 1LYYA 1SWZA 4DDAA 2G4QA 3A95A 1VAUA 5FHWA 4ARJA 1IWVA 1LHJA 1JTMA 1L38A 1IO5A 3ULRA 1JITA 4I7NA 2O4WA 1TBYA 4HJYA 1IY3A 3RZ4A 1XGTC 1L90A 5FCPA 1CV3A 1H6MA 4TSCA 2MEEA 3DN3A 1IWXA 3RU5A 4II8A 1IVMA 4CJ2A 1LJFA 3D3DA 1L19A 2B6ZA 4J1BA 4GN3A 1ZYTA 1LZGA 1IY4A 4LYBA 138LA 134LA 1P2RA 2OE7X 2Z6BA 3NY8A 4IJ4A 245LA 3ZVQA 2IFFY 1NWGA 4K5YA 154LA 4OOTA 5A3EA 4EMNA 1N4FA 1B5UA 149LA 3AZ4A 4IASA 1T3PA 1C62A 1PZYA 1QTZA 1L79A 2NTHA 1IOCA 4G9SA 1L41A 1GB7A 5FEKA 4EPIA 1LJHA 1QTBA 1LPIA 1YIKA 4LT1A 165LA 4YX7C 1CNSA 1NKHA 3N9CA 257LA 4C5FA 1L05A 2OE4X 215LA 1YKZX 4NGOA 4I7OA 225LA 3HU9A 2W1XA 5LYMA 1B7MA 4I7PA 4NGKA 1HFXA 4EKQA 161LA 2I26L 1GB2A 2OEAX 3C7YA 3CDRA 1L67A 3HUAA 1LYSA 4LFPA 2FYDA 4QY9A 1F6SA 1L60A 2DQJY 3DNAA 1LYFA 2RAZX 2BAAA 5M1YA 2ZQ3A 4B0DA 147LA 1CKHA 1L14A 1B5YA 1LJKA 3PDSA 2ZWBA 4FJRA 2MEBA 3WUMA 1AT5A 1HELA 1GFRA 2BLXA 3CSQA 1KXYA 5LVGA 3GUJA 5HMJA 4XJIA 1LOZA 1B5WA 1L09A 4CGEA 1D9WA 135LA 1L83A 4I7SA 4H93A 2YBIA 1C6GA 1IOSA 1DYGA 2F4GA 3CDQA 3AB6A 1LMQA 4HP0A 1J1PY 2DQGY 3W6BA 4I7RA 3HT6A 4NEBA 231LA 1EPYA 4LDOA 3CB7A 4E3UA 4DAJA 2ZIJA 3HDEA 1GFHA 4ETBA 1GPQC 184LA 1NQIA 4WOAA 1L43A 3ZVQB 3K2RA 5DM9A 2B6WA 1LYHA 2XTHA 1A4VA 1C6PA 2DQHY 127LA 1L29A 1LSMA 236LA 1L57A 1XGQC 1L85A 5F9UA 1QT5A 1GHLA 2RB1X 4QGZA 2HTXA 2HU3A 244LA 1CU3A 2BQDA 1SWYA 1L01A 3AGIA 4GN4A 4HTKA 1L21A 1C67A 5KXOA 1UIEA 3AZ5A 1UIFA 1NMMA 4WL7A 4TWSA 3DN8A 4LYMA 3HH6A 1F0WA 2G4PA 1ZV5L 1GF0A 3A6BY 1DYEA 109LA 3SP3A 1L11A 2HUBA 1MLCE 1YAMA 4W51A 4H1PA 1JQUA 1P46A 3TXKA 6LYZA 1LSDA 1AT6A 4OWHA 3DN4A 5I14A 1GEVA 2B73A 4NWHA 1GAZA 5I54A 206LA 1IIZA 1UIDA 1C46A 1L18A 5IDDA 4H9BA 4CHXA 5HNCA 131LA 1L22A 1LJ3A 128LA 1XJUA 226LA 4ARLA 1WTNA 130LA 1YQVY 1LI3A 4UWVA 2B70A 1GFEA 1C60A 4HV2A 1QUDA 1LZEA 3WW6A 1QQYA 3W3EA 4LYZA 252LA 5C6LA 1CJ6A 1C6QA 1LJEA 4H9HA 4NY5A 2RB0X 1DYCA 4WLYA 4Z3MA 241LA 1QS5A 4B4JA 3J4GA 3WPJA 1KY1A 1FBIX 1BHZA 2B6TA 1GE4A 3WW5A 3A3RX 2BQMA 4Z41A 4QDNA 4LZTA 1DI3A 2DBTA 3LYOA 3TXDA 5KXMA 2VB1A 1L50A 4ET9A 144LA 2Z19A 4EXMA 2BQCA 2F4AA 1L55A 3L64A 162LA 1GEZA 1G0GA 1LWKA 214LA 1GFAA 2B5ZA 1JWRA 1RE2A 5DN5A 1QSQA 3V2WA 2Q0MX 166LA 3A34A 1GB9A 5L9JA 1G7LC 1VDTA 1DYAA 4GCEA 1OWZA 262LA 1IP3A 4XJGA 156LA 4YM8A 4PRUA 140LA 1QUSA 3L2XA 2OU9A 3WPLA 198LA 3EXDA 2YSSC 1JTOL 1L95A 3FI7A 5DLAA 1K28A 1C6BA 1RCMA 1L88A 1IWZA 1L82A 1LLHA 3LHMA 1L49A 1CV0A 2BQHA 2O7AA 1HEOA 1CKCA 1C6DA 1WQQA 4DQJA 2CJLA 1L31A 1SSYA 2Z38A 1HC0A 4NGZA 1IWWA 4LT3A 4H8ZA 1RFPA 3QNGA 2X0AA 3LYTA 2ZIKA 222LA 1AKIA 227LA 3AGHA 2Q9DA 1JJ1A 8LYZA 1V7TA 208LA 3QY4A 1BWIA 1KW5A 1OQMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4H9A A;  1C6N A;  123L A;  3D9A C;  1BWH A;  1P56 A;  1YAN A;  1DPW A;  1HF4 A;  1I20 A;  1NF5 A;  1L53 A;  4LYO A;  3DKE X;  177L A;  1L71 A;  4YXA C;  1CX7 A;  1QUO A;  1LZY A;  1L00 A;  1C68 A;  3LYZ A;  4NHP A;  1QTH A;  1L34 A;  1B7R A;  1LSC A;  1CU6 A;  141L A;  1L89 A;  115L A;  1GF4 A;  4MR1 A;  3CSZ A;  5B1G A;  2G4N A;  4OW1 A;  3A94 A;  1C6F A;  3CDV A;  1L17 A;  2CWI A;  4ZEE A;  4G49 A;  4NG1 A;  1GE3 A;  1G7J C;  1LZD A;  1REX A;  3W6C A;  4GLA A;  4YEM A;  3SB6 A;  1VED A;  1YKY X;  3OJP A;  150L A;  2YBM A;  1WQM A;  4B1A A;  4XN6 A;  4ETC A;  5HNL A;  3RT5 X;  2BQB A;  2DQD Y;  4WO6 A;  1WVU A;  1IWU A;  3LN2 A;  1GF9 A;  1LKS A;  1BB4 A;  4D9Z A;  1KW7 A;  2I25 L;  1C6H A;  3TMU A;  1OVH A;  2A7D A;  4WM3 A;  4NFV A;  2LC9 A;  2B74 A;  1LYY A;  1SWZ A;  4DDA A;  2G4Q A;  3A95 A;  1VAU A;  5FHW A;  4ARJ A;  1IWV A;  1LHJ A;  1JTM A;  1L38 A;  1IO5 A;  3ULR A;  1JIT A;  4I7N A;  2O4W A;  1TBY A;  4HJY A;  1IY3 A;  3RZ4 A;  1XGT C;  1L90 A;  5FCP A;  1CV3 A;  1H6M A;  4TSC A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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