2OU9A

Structure of spin-labeled t4 lysozyme mutant t115r1/r119a
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFCNSLAMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural determinants of nitroxide motion in spin-labeled proteins: Tertiary contact and solvent-inaccessible sites in helix G of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 61
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2007-02-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2ou9A00
1G0LA 111LA 1L73A 1L27A 119LA 248LA 1CV0A 2B70A 1LYHA 1P36A 3HU8A 3HTFA 1CUQA 1LYGA 1QT8A 3SB9A 2F47A 209LA 2ANVA 1L03A 229LA 1L85A 188LA 126LA 3QAKA 4W51A 3GUIA 189LA 262LA 3HT8A 1L05A 3DNAA 3GUOA 2B75A 3L2XA 3FADA 1L92A 2B74A 184LA 115LA 1CV4A 2B73A 261LA 2O79A 4I7PA 170LA 1L14A 1QT3A 171LA 2Q9EA 1QT5A 1QT6A 3C8SA 4I7SA 1L24A 1L49A 225LA 1L02A 1PQDA 2OE7X 206LA 177LA 221LA 1JTMA 174LA 259LA 3JR6A 1LI2A 173LA 1CU6A 1D3NA 1LGWA 1C6JA 1LWKA 141LA 1LPYA 222LA 1G0JA 1L76A 1D2YA 163LA 1L97A 1L80A 1L88A 1L15A 220LA 234LA 1ZYTA 1QTHA 2OE9X 2OE4X 4W57A 4LZMA 3HU9A 1D3JA 3DN3A 129LA 200LA 2RH1A 1KY0A 1L82A 1C66A 1OV5A 1OV7A 2RBOA 250LA 1C6EA 3FA0A 138LA 1L23A 1L86A 1LI6A 226LA 3HWLA 1P56A 1G06A 1L53A 3DN2A 4LDOA 175LA 1L20A 1JQUA 1QTZA 187LA 1L45A 2Q9DA 1C6TA 3RZEA 1C64A 217LA 4K5YA 1KW5A 1QTBA 1L37A 1T6HA 2B6ZA 3HUQA 4S0WA 1C61A 237LA 1L94A 1DYBA 1L25A 1LGXA 1LW9A 122LA 233LA 1L54A 4OO9A 3OE6A 1QSQA 182LA 2B6WA 1P46A 148LE 1KNIA 1L90A 228LA 1L75A 1G0GA 156LA 1PQOA 3CDTA 2O7AA 3V2YA 4LDLA 252LA 4DKLA 1L35A 4EKRA 104LA 1LYJA 1L11A 3C7YA 4W59A 1QUDA 218LA 1C60A 1LI3A 2O4WA 1P7SA 1L40A 1L62A 247LA 1XEPA 1C6PA 3C83A 1L69A 244LA 1G1WA 1L12A 1C69A 1CTWA 3GUNA 1QUGA 3DMZA 164LA 1L72A 3OE9A 165LA 2QB0B 1C6FA 4I7MA 1L99A 139LA 1L10A 2Z6BA 1LYDA 1L67A 1L95A 260LA 1L56A 1L68A 3SBBC 1QSBA 3DN0A 4I7OA 3CDQA 4W52A 3C8QA 1LYEA 240LA 1PQMA 4EKQA 1CV5A 1CX6A 172LA 127LA 3L64A 1L21A 3DN8A 5LZMA 1CUPA 4ARLA 161LA 1L83A 1L79A 1K28A 3SB6A 1PQJA 1SX7A 219LA 3HT9A 1G0KA 1L22A 1P37A 3SN6R 1CVKA 4ARPA 108LA 3HDFA 2OEAX 3HH3A 2B7XA 1T8AA 1KS3A 2RAZX 245LA 3HT7A 1L00A 227LA 1T8GA 1L64A 1QS5A 242LA 4I7NA 196LA 151LA 176LA 1C6QA 146LA 1L77A 3K2RA 1L60A 1C6HA 102LA 1XJUA 4W54A 1L13A 1L32A 2RBNA 4W58A 1EPYA 1L57A 1L96A 195LA 253LA 1C6DA 1CX7A 181LA 1L65A 1T8FA 1G0QA 2LC9A 1C6KA 1LYFA 197LA 2NTHA 3C81A 3G3WA 1CV3A 109LA 160LA 1OVHA 1OYUA 1SWZA 2RBSA 110LA 3D4SA 1NHBA 112LA 191LA 2CUUA 4W56A 3F9LA 2RB2X 199LA 254LA 1D9WA 1L98A 3ODUA 4YX7C 1CV1A 1G0PA 3RUNA 3HH4A 3HH5A 243LA 2OTYX 1CU0A 4E97A 3LZMA 1L52A 4I7JA 3C8RA 1L29A 159LA 5I14A 213LA 3VW7A 2RB0X 1ZURA 3OE8A 147LA 1XJTA 162LA 4I7TA 2L78A 1L42A 235LA 1OWYA 1DYDA 1L28A 1L0JA 1SX2A 4YXCA 1P2LA 1OVJA 1LLHA 3HDEA 1C67A 2LZMA 3HTDA 3SB8A 212LA 4EPFA 7LZMA 246LA 1QTVA 1SWYA 3V2WA 2NTGA 1L38A 1L51A 3G3VA 4AQNA 150LA 2B6XA 1L33A 1C6BA 1OWZA 3C7ZA 1L01A 1C63A 6LZMA 1L0KA 2QARC 1KW7A 1TLAA 118LA 1D2WA 3PDSA 3SBAA 4IAPA 1ZWNA 2HUKA 1CU5A 1G1VA 1DYCA 215LA 3HH6A 1CV6A 1L08A 249LA 3DKEX 157LA 1L48A 4ARMA 4ARQA 1L46A 1QTCA 178LA 223LA 2OTZX 214LA 1C6AA 1L36A 3HTGA 144LA 1CU3A 3DN6A 4PK0A 3UONA 3GUMA 1L19A 1L58A 190LA 152LA 2OU9A 1SSWA 1KY1A 2OU8A 4I7KA 3DMVA 4DJHA 130LA 2RBQA 2B6TA 3HT6A 183LA 2ANXA 3SB7A 1L81A 3HUAA 1WTHA 3GULA 143LA 168LA 186LA 231LA 258LA 3F8VA 4EKSA 3CDRA 1L09A 1L66A 1QT7A 4EJ4A 1P2RA 3C7WA 2LCBA 4LDEA 1L07A 1L63A 1L91A 128LA 4PJZA 1C6MA 3GUJA 1L47A 2RAYX 4ARMB 158LA 4ARQB 1L30A 113LA 1L34A 103LA 155LA 3CDOA 1LWGA 4EPIA 1P6YA 1L06A 230LA 3G3XA 123LA 1D3MA 1L43A 1L84A 205LA 1C62A 185LA 201LA 3C80A 1OVKA 1DYFA 120LA 3GUPA 1T97A 4I7QA 1PQKA 1C6LA 2B6YA 2RB1X 125LA 256LA 4W55A 3NYAA 4EXMA 1QUHA 3C82A 192LA 3SB5A 2RBPA 1L93A 1C6NA 2RBRA 211LA 255LA 3NY8A 1L59A 1C65A 1QTDA 1QUOA 4EKPA 114LA 1L41A 1P64A 1L87A 3GUKA 1L04A 1L71A 1B6IA 1L61A 1L89A 2F32A 1L44A 2F2QA 4GRVA 238LA 1G07A 241LA 1DYAA 1P3NA 166LA 1L18A 4ZPUA 1L74A 251LA 1C6CA 145LA 1SSYA 239LA 107LA 2B72A 1QS9A 232LA 4I7RA 140LA 1LGUA 142LA 4ARJA 1L50A 2HULA 1L70A 3HTBA 1C6GA 1CU2A 1L55A 1L17A 1PQIA 1QT4A 2IGCA 3CDVA 224LA 167LA 216LA 2HUMA 4I7LA 3NY9A 169LA 1I6SA 137LA 3FI5A 1LYIA 3DMXA 149LA 257LA 1DYEA 1P5CA 210LA 1L16A 4YXAC 180LA 3DN1A 3EMLA 1C68A 3HUKA 3OE0A 1C6IA 1DYGA 1L31A 2A4TA 2OU0X 3PBLA 236LA 131LA 198LA 1L26A 1JTNA 4GBRB 4W53A 4DAJA 1L39A 3DN4A 1D3FA 1G0MA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1G0LA 3A3RX 4X3BA 119LA 1H6MA 3EO5A 3KAMA 4NGZA 4UWVA 4KPMA 1LZEA 4ML7A 153LA 3TMXA 1IWZA 3TXIA 1GD6A 1L03A 3RW8A 1WTMA 188LA 126LA 2MEBA 1HFYA 3QAKA 1HMKA 4H8XA 1L05A 1GE4A 3A92A 1IP5A 5LVGA 2B74A 1CV4A 261LA 2O79A 4I7PA 1VATA 171LA 5KXTA 2XBSA 1L24A 3LZ2A 1LYSA 2D6BA 206LA 4MCKA 1GFEA 1D3NA 1GE1A 1KXYA 1YKYX 1L97A 2DQEY 1YL1X 4DYGA 1QTHA 4II8A 4W57A 4WM2A 2YBIA 129LA 2RH1A 3W3EA 1C66A 3FA0A 3TMUA 1L23A 1AKIA 1YAQA 1P56A 1L53A 3IJVA 4WLXA 7LYZA 1B2KA 1QTZA 4W96A 1E8LA 2Q9DA 1NWGA 4K5YA 1KW5A 4B1AA 2BQHA 1QTBA 1L37A 5E4PA 2CWIA 4S0WA 3FI7A 1LJJA 4LYTA 1QQYA 3WULA 1LW9A 1YL0X 1EQEA 1B5YA 1L54A 2YBJA 3SP3A 3CQLA 1P46A 148LE 4U3XB 1OUBA 2EKSC 2HEBA 1IR7A 4ZEEA 4NGLA 4YEMA 1L35A 4IATA 4W59A 2MEIA 4NGIA 1LI3A 2HTXA 4B49A 3C83A 4A7DA 1EQ5A 1LSFA 2HECA 1UIBA 4I7MA 1CJ6A 2B5ZA 4H9FA 3WXTA 1LMQA 4WLDA 1WQRA 5I5QA 4HV1A 1LYDA 2EIZC 4H8ZA 1LAAA 3LN2A 260LA 1IWVA 3F6ZA 3TXGA 3C8QA 1F6SA 1PQMA 2MECA 4FJRA 2C8PA 1L21A 2XBRA 5LZMA 1L83A 4GCFA 4GN5C 1SX7A 3HT9A 1G0KA 3WW6A 5D5FA 3W6BA 1GFKA 4WM6A 5LA8A 2A7FA 3WXUA 2D4IA 4MSTA 1VDSA 245LA 4EOFA 6LYTA 1QS5A 242LA 5T3FA 2AUBA 176LA 3WVYA 3K2RA 1L60A 2DQIY 4Z3MA 2DQCY 1HHLA 1IORA 1GFTA 1LJFA 2LC9A 1CKDA 1GB9A 1LOZA 1LHLA 160LA 1GBOA 4LYZA 1I56A 1OYUA 2RBSA 1LSMA 3P4ZA 4H93A 6LYZA 4W56A 1HSXA 1GAZA 1GE3A 3OJPA 1D9WA 4YX7C 4G4CA 1G0PA 4LGKA 3W6CA 3HH5A 1DKJA 194LA 1DPWA 1LZDA 4KT3A 1CU0A 4TX7A 4ZIXA 3LZMA 4H9HA 4WLYA 1L52A 3AGIA 4DDCA 4XJGA 1ZURA 147LA 3AJNA 4WG1A 3K3TA 1ZVYB 4I7TA 2G4QA 1GB2A 1C7PA 4D9ZA 4Z98A 1L28A 4YXCA 2Z37A 1C67A 7LZMA 4YENA 3A94A 5FDJA 2YSSC 3E3DA 1FLQA 150LA 2MEHA 1LZSA 4XJFA 2YBNA 2QARC 5M1YA 3SBAA 5I54A 1DKKA 1IO5A 1BWHA 3G3BB 4ET9A 1GFHA 1L08A 3AGHA 4ZFPA 5B1GA 4WO6A 2BQCA 4Z41A 178LA 223LA 1YQVY 2OTZX 214LA 2ZIKA 5LA5A 1CU3A 1UICA 5KXKA 3GUMA 4PGJB 4BADA 1L58A 2D4JA 152LA 1JHLA 1RE2A 2LYZA 2H9KA 2OU8A 2MEAA 2BQOA 1NMMA 1L81A 1WTHA 3GULA 1LJNA 168LA 1IR8A 1L09A 2BAAA 2LCBA 3AW7A 1L91A 2XQOA 1C6MA 4LFXA 4DD2A 103LA 155LA 1LSCA 1P6YA 230LA 4GN4A 2XTHA 1GBZA 1IP3A 3C80A 4I7QA 3GUPA 3HFMY 1HFZA 4RDSA 4EXMA 1QUHA 3C82A 1IC5Y 3SB5A 2RBPA 1OUFA 1F0WA 5L9JA 3NY8A 1C65A 1QTDA 1IC7Y 4EKPA 4WG7A 1P64A 4B4EA 1B6IA 2F32A 1GEVA 238LA 5I4WA 2DQAA 4B4JA 2DBTA 1REXA 2GV0A 3N9EA 4N9RA 1L18A 2I26L 1OUJA 251LA 1C6CA 1NBYC 4QDNA 1SSYA 3P65A 4GLVA 1LGUA 1C08C 4OWBA 1UIGA 1JKAA 2ZIJA 1J1XY 2FBDA 1L17A 1IWYA 1TDYA 2HUMA 4WL7A 1HNLA 4YEOA 1RFPA 1HEOA 1HMLA 1Z55A 1LZYA 3DN1A 1C68A 2Z2FA 3OE0A 1L31A 2A4TA 2OU0X 5B05A 1GWDA 131LA 1L26A 5LYTA 1GFRA 4DAJA 5FHWA 1G0MA 1DZBX 4BS7A 111LA 3GXRA 1L73A 1G7HC 1CV0A 2BQIA 3HU8A 2F47A 1L85A 1A2YC 4L41A 4H9EA 1C10A 1D0MA 1GF6A 3GUIA 262LA 1WQMA 2B75A 3L2XA 1IVMA 3FADA 4N1EI 1LHKA 184LA 1J1OY 4E3UA 5C6JA 3HBDA 1L14A 5ILFA 1YKXX 2Q9EA 1BB5A 1QIOA 1QT6A 3C8SA 4Z46A 1L49A 1L02A 1PQDA 1DQJC 5LYMA 2LZ2A 2OE7X 1KXXA 1JTMA 1LI2A 1BB4A 1YAMA 2BQJA 1LGWA 1C6JA 141LA 1GFAA 3WPLA 3QY4A 1G0JA 1L76A 1L80A 1ZYTA 4GLAA 4LZMA 1WQOA 3HU9A 1CKFA 4YOPA 2ZNXY 1F6RA 2MEDA 3WPJA 1HSWA 1OV5A 4IASA 1FKVA 4M6DA 3T36A 1JITA 1F10A 1WQQA 4W94A 2ZNWY 1L20A 4DQJA 1GBXA 5KY1A 1HC0A 1UIHA 4H8YA 2YDGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1G0L A;  3A3R X;  4X3B A;  119L A;  1H6M A;  3EO5 A;  3KAM A;  4NGZ A;  4UWV A;  4KPM A;  1LZE A;  4ML7 A;  153L A;  3TMX A;  1IWZ A;  3TXI A;  1GD6 A;  1L03 A;  3RW8 A;  1WTM A;  188L A;  126L A;  2MEB A;  1HFY A;  3QAK A;  1HMK A;  4H8X A;  1L05 A;  1GE4 A;  3A92 A;  1IP5 A;  5LVG A;  2B74 A;  1CV4 A;  261L A;  2O79 A;  4I7P A;  1VAT A;  171L A;  5KXT A;  2XBS A;  1L24 A;  3LZ2 A;  1LYS A;  2D6B A;  206L A;  4MCK A;  1GFE A;  1D3N A;  1GE1 A;  1KXY A;  1YKY X;  1L97 A;  2DQE Y;  1YL1 X;  4DYG A;  1QTH A;  4II8 A;  4W57 A;  4WM2 A;  2YBI A;  129L A;  2RH1 A;  3W3E A;  1C66 A;  3FA0 A;  3TMU A;  1L23 A;  1AKI A;  1YAQ A;  1P56 A;  1L53 A;  3IJV A;  4WLX A;  7LYZ A;  1B2K A;  1QTZ A;  4W96 A;  1E8L A;  2Q9D A;  1NWG A;  4K5Y A;  1KW5 A;  4B1A A;  2BQH A;  1QTB A;  1L37 A;  5E4P A;  2CWI A;  4S0W A;  3FI7 A;  1LJJ A;  4LYT A;  1QQY A;  3WUL A;  1LW9 A;  1YL0 X;  1EQE A;  1B5Y A;  1L54 A;  2YBJ A;  3SP3 A;  3CQL A;  1P46 A;  148L E;  4U3X B;  1OUB A;  2EKS C;  2HEB A;  1IR7 A;  4ZEE A;  4NGL A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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