2RBSA

(r)(+)-3-chloro-1-phenyl-1-propanol in complex with t4 lysozyme l99a/m102q
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCAAINQVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Rescoring docking hit lists for model cavity sites: predictions and experimental testing.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
total genus 56
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2007-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2rbsA00
1L77A 3L2XA 1K28A 259LA 158LA 2B6ZA 1C69A 238LA 1OWZA 1L42A 3OE6A 3GUNA 257LA 258LA 4ARJA 4S0WA 4EKQA 1XJUA 3DMZA 1L41A 1L49A 3HUQA 3D4SA 159LA 176LA 119LA 1L07A 1L30A 2OE9X 1QSQA 1L81A 1LYDA 1CU2A 2HUKA 4W54A 2CUUA 4EKRA 1L84A 1ZURA 3DN6A 1LW9A 115LA 182LA 1L20A 201LA 3DN8A 1L19A 129LA 1QT5A 4PJZA 1L01A 2OU9A 197LA 1QUGA 4EXMA 3NY8A 1P46A 3DKEX 3HH5A 1QSBA 1SWZA 1C63A 1DYCA 1L86A 3HH6A 1T8AA 178LA 3C80A 3HTFA 1C6EA 4W59A 242LA 2RBPA 4E97A 1C6MA 1P5CA 1SX2A 1G07A 143LA 1P2LA 170LA 1L98A 1CV5A 1L12A 2B6XA 1P56A 1L92A 2QARC 3F8VA 107LA 1L88A 3DN1A 1TLAA 1L32A 2RBRA 1L80A 114LA 4PK0A 147LA 1T8GA 2HULA 1C66A 230LA 3SB5A 118LA 1L03A 1L24A 211LA 2RAYX 3DMXA 1KW5A 1L45A 244LA 3SB6A 108LA 1KS3A 102LA 1QUDA 1C61A 1C6FA 3GUIA 233LA 2RBSA 1KY1A 1L23A 1CUQA 1L17A 3ODUA 4GRVA 1L34A 3OE9A 3C82A 2B75A 146LA 1CX6A 218LA 1D3NA 166LA 1L93A 169LA 1QT3A 1QS5A 3SB7A 1P3NA 3HU8A 1L00A 4AQNA 123LA 140LA 1L56A 3HT7A 3V2WA 2A4TA 1P37A 190LA 1L64A 1G0KA 1D3JA 127LA 2B74A 187LA 1CV3A 240LA 1C6GA 3GUMA 1L47A 1G0LA 1P64A 3DMVA 4DJHA 3DN4A 1T8FA 1QT7A 4I7QA 2RH1A 4I7PA 3CDRA 2ANXA 3SB9A 1P2RA 168LA 1LWGA 4W55A 1EPYA 137LA 1ZWNA 2B7XA 1L90A 112LA 2OE4X 1D3FA 138LA 3FA0A 4I7SA 2F47A 2RB1X 3PDSA 1XEPA 120LA 4ARQA 152LA 1L0KA 196LA 3OE0A 1QTBA 260LA 221LA 1PQMA 1SWYA 4DAJA 1C6KA 173LA 200LA 1CUPA 1XJTA 1G0PA 198LA 3NY9A 4YXAC 3EMLA 192LA 1LYFA 3DN3A 3JR6A 1L14A 3FADA 4OO9A 4ARQB 1QTCA 1L43A 1L95A 7LZMA 212LA 226LA 4I7KA 1L0JA 1I6SA 4EPIA 1LGXA 2OEAX 1G0JA 1D9WA 167LA 220LA 3HUAA 163LA 1L27A 3F9LA 195LA 2F32A 1L04A 1CV4A 1QT4A 2OU8A 1CTWA 1L52A 241LA 1L79A 2HUMA 4LZMA 2Q9DA 1LI3A 1L74A 177LA 2NTGA 1L35A 1L54A 1CX7A 3SBBC 1L85A 1CU5A 171LA 1JTMA 1L61A 3LZMA 3HTBA 3V2YA 1L48A 3HTDA 1PQOA 126LA 1L40A 4EKPA 237LA 172LA 1L28A 4EKSA 4EJ4A 2O79A 191LA 249LA 3SBAA 3C7ZA 1KY0A 4W56A 1QTDA 1DYDA 2RB2X 188LA 3GULA 145LA 3HH3A 1L50A 4I7RA 1SSYA 1LYIA 3HT6A 2ANVA 1LYGA 3HH4A 3HUKA 1L57A 1LGWA 2NTHA 3CDQA 1JTNA 4ARPA 111LA 227LA 4EPFA 185LA 3HDEA 1L72A 1L46A 261LA 2F2QA 219LA 1G0GA 199LA 4LDLA 189LA 1C6NA 161LA 1C6HA 1CU3A 3HWLA 1L55A 1PQKA 2O7AA 113LA 1C6PA 1L60A 3HDFA 1PQIA 125LA 210LA 3DN0A 1L26A 1L97A 1LI2A 1L38A 213LA 184LA 2LZMA 156LA 1L09A 234LA 1SX7A 3C81A 229LA 1WTHA 1C6BA 1L99A 2LC9A 1G1VA 1OV7A 253LA 236LA 1L39A 5I14A 1DYGA 150LA 1LPYA 1L44A 2QB0B 2RBOA 3CDTA 4LDEA 246LA 4DKLA 3G3WA 110LA 151LA 1C64A 1QUOA 3NYAA 1C6CA 2IGCA 1C62A 1L87A 1OVJA 1CV6A 1PQJA 1DYFA 1LGUA 1L08A 3C8QA 2OTZX 1DYAA 4ARLA 1DYBA 1L66A 252LA 2B73A 239LA 109LA 1C6AA 1OVHA 2LCBA 3C8SA 1G0QA 3CDVA 3GUOA 3VW7A 1L76A 2B6WA 1LI6A 3CDOA 1NHBA 1L13A 1C6JA 1L68A 223LA 3GUJA 1G06A 215LA 1OV5A 1L25A 175LA 232LA 4W58A 1QS9A 3HU9A 164LA 1L70A 4W51A 262LA 1CV1A 3SB8A 1LYEA 3C8RA 3K2RA 2OU0X 2RAZX 1L96A 1L37A 4LDOA 4W52A 1KW7A 1L10A 1C68A 1CU0A 3GUKA 3HTGA 217LA 1C6QA 1L18A 1LYJA 148LE 1QT6A 1OVKA 3L64A 4I7TA 250LA 1C6DA 2RBQA 181LA 1L89A 1P6YA 1L91A 174LA 222LA 235LA 104LA 3RUNA 1B6IA 1D3MA 2B70A 3QAKA 245LA 2O4WA 130LA 4ARMA 1G0MA 1L51A 4YX7C 1L75A 1PQDA 3DNAA 1C65A 1L62A 3SN6R 141LA 4I7OA 256LA 155LA 1CV0A 3RZEA 1LYHA 1L06A 2B6YA 1G1WA 3G3XA 5LZMA 1L11A 122LA 4I7MA 247LA 251LA 6LZMA 157LA 4GBRB 1SSWA 103LA 3C83A 131LA 1C6TA 3GUPA 1L67A 1D2WA 1L82A 4I7JA 1KNIA 231LA 4ARMB 254LA 3UONA 248LA 1L59A 1L22A 162LA 214LA 1QTHA 1QTVA 2B72A 2RB0X 180LA 1D2YA 205LA 2Q9EA 1LWKA 149LA 1L53A 1L94A 3PBLA 3HT8A 225LA 4ZPUA 1OYUA 3HT9A 4I7NA 183LA 4K5YA 1QUHA 1L33A 1JQUA 1L31A 1L71A 139LA 2RBNA 1C67A 1L16A 216LA 1L73A 1L36A 128LA 1L65A 2B6TA 1QT8A 165LA 1L05A 1C60A 1L29A 142LA 1ZYTA 4W53A 209LA 144LA 1L69A 224LA 1L02A 3FI5A 1DYEA 1L15A 3C7WA 1QTZA 3G3VA 2OE7X 1C6IA 2L78A 4IAPA 1LLHA 2OTYX 228LA 1L58A 4W57A 1L63A 160LA 3C7YA 2Z6BA 3OE8A 206LA 255LA 1CVKA 3DN2A 4I7LA 1CU6A 1P7SA 1C6LA 1T97A 243LA 1OWYA 4YXCA 1T6HA 1L21A 1L83A 1P36A 186LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1BB5A 2XTHA 3B0KA 4ML7A 1OUGA 4DYGA 4NSJA 258LA 4OWBA 4G4BA 1LZAA 1XJUA 1GDWA 1UACY 3HUQA 4H8XA 176LA 4J1AA 1XGUC 1LYDA 2YSSC 1JHLA 4IJ4A 1AT6A 3DN8A 129LA 197LA 1QUGA 4EXMA 3OJPA 3NY8A 3QE8A 4H1PA 3DKEX 1SWZA 4HPEA 1IORA 1DYCA 1F10A 1MELL 3HH6A 1F6SA 1T8AA 3C80A 1I1ZA 5I4XA 1LHLA 2RBPA 4EMNA 1C6MA 1G07A 1P2LA 1CV5A 1WVVA 1P56A 1PZYA 3F8VA 107LA 5DN5A 2BQOA 4DD1A 3TXIA 3SB5A 5B1GA 3DMXA 5LVJA 1KXXA 1KS3A 1VAUA 1C61A 1GE3A 1LMQA 2RBSA 1G7MC 2D4KA 1L17A 1L34A 1LZ5A 1WQOA 1B7MA 3C82A 1QDTA 2B75A 146LA 5B05A 218LA 1XGRC 1G7LC 3B72A 1L93A 3SB7A 5KXSA 2HUBA 4XJBA 1IC7Y 4ETDA 1B5UA 1L64A 1G0KA 1D3JA 2I26L 187LA 1CV3A 240LA 3GUMA 1P64A 3DMVA 4DJHA 1C45A 1B7SA 4WL6A 4I7PA 1HF4A 5FELA 3WMKA 154LA 1REZA 4M6DA 1B5VA 1OUHA 2MEBA 1EPYA 1UCOA 4GN5C 2OE4X 1LZ4A 4DQ5A 1GF0A 1AZFA 4HTNA 1GB9A 3TXHA 1DZBX 1XEPA 120LA 4OW1A 5C6JA 1IP4A 4PRUA 2BQFA 4NGKA 3LYMA 4UWUA 1GWDA 3OE0A 1LZBA 260LA 4Z46A 2Q0MX 1GFTA 221LA 1GPQC 4DAJA 3LYTA 2BQIA 1N4FA 1HFXA 2MECA 3A3QA 198LA 3LZ2A 1BB3A 3FADA 2HEBA 2F4AA 212LA 1SLYA 1GB3A 2YBIA 1LHIA 5HNCA 3WVXA 4HV2A 4EPIA 2OEAX 1WVUA 3WW5A 2A7FA 163LA 1L27A 3F9LA 1IIZA 1HHLA 3B0IA 4BAPA 1GFKA 2HTXA 3FE0A 2ZWBA 4LZMA 2Q9DA 177LA 2EIZC 1YAQA 1CX7A 5KXPA 4ETBA 5I4YA 1JTMA 3HTDA 4AXTA 1NWGA 172LA 4FJRA 1HERA 4B0DA 4EKSA 1KXWA 4WM2A 3TMUA 4EJ4A 1IWUA 1KY0A 4W56A 1ZV5L 1QTDA 188LA 3HT6A 1LCNA 1XGQC 1XEKA 3HUKA 5F81A 4ZEEA 1LGWA 4WMGA 4ARPA 1LZYA 185LA 3HDEA 3AZ4A 4WO9A 1NDGC 1C46A 2XJWA 4G4HA 161LA 1VATA 153LA 5LINA 1OUJA 1PQKA 2H9KA 2O7AA 5I4WA 1C6PA 1ZMYL 1LI2A 1L38A 1Z55A 4TSBA 3N9CA 1HSXA 5KXZA 156LA 1L09A 3C81A 4HJZA 4CJ2A 1JWRA 1C6BA 1WTHA 1L99A 4H9BA 1JKBA 1C10A 4DD2A 1LPYA 4NEBA 1JKCA 1LHJA 4LDEA 3WU8A 3G3BB 2FYCA 4DKLA 2W1LA 4ET8A 1DI4A 1YROA 2IGCA 1CV6A 1L08A 4DD7A 2OTZX 3T36A 4QDNA 5KXOA 3A91A 3WU7A 1DYBA 2DQFC 4DD0A 252LA 2B73A 2H9JA 1OVHA 1PS5A 2HEEA 5A3ZA 2W1XA 3CDOA 1JITA 1LZCA 3J6KA 1L13A 1A4VA 3FI7A 4W58A 1L70A 1QQYA 3C8RA 3E3DA 3K2RA 2RAZX 1KW7A 1C68A 1CU0A 1HFZA 2Z39A 4GLVA 1NF5A 1QT6A 1NQIA 5C6LA 4NGWA 3TMVA 5DL9A 3A95A 4DQJA 3WULA 4WLTA 3AW7A 1L91A 3EMSA 1YAMA 5F9XA 1BWIA 2B70A 4H91A 2YDGA 2Z2FA 1FDLY 3TXFA 1GF3A 4B1AA 1C65A 1JTPL 3W6CA 155LA 2CJLA 3RZEA 2B6YA 1EQ4A 122LA 4WM3A 2IHLA 1IR8A 3CT1A 2DQIY 1JTOL 4YEOA 1XEIA 1C6TA 1D2WA 3CSQA 4HV1A 1WQMA 4H93A 4XN6A 1LZ8A 1WQNA 1QTHA 1QSWA 180LA 1G7IC 207LA 1AT5A 2I25L 1LOZA 225LA 3HT8A 1OYUA 4I7NA 1EQ5A 3WXUA 4K5YA 1IY4A 4DD3A 1L71A 4N5RA 3RZ4A 2I6ZA 1C67A 1L16A 4QY9A 216LA 1L36A 1C60A 142LA 3BKVA 1GXV2 1L02A 1LKRA 3C7WA 1QTZA 1WTMA 1LJGA 1D6PA 1QUSA 2B5ZA 1LLHA 1IVMA 1L58A 1IOSA 206LA 4I7LA 2DQDY 5A3EA 1C6LA 1LSZA 1P2CC 7LYZA 1LZ9A 4OOTA 3GUNA 1P36A 186LA 1K28A 1BQLY 2B6ZA 1C69A 238LA 2A7DA 3HBDA 1L42A 5F16A 4ARJA 193LA 4H9IA 3WPLA 4NGVA 4EKQA 1L49A 3ZEKA 159LA 4NGYA 1RJCB 1L30A 4YENA 1CU2A 2HUKA 1LZNA 5KXWA 2G4NA 1DI5A 3CT0A 1LYOA 2YVBA 2BLXA 4RW2A 1L01A 5KXNA 2DKVA 1P46A 1LTMA 5J7CA 1GB8A 1C63A 1L86A 1TEWA 242LA 3W6BA 1GHLA 4CHXA 2G4QA 1P5CA 5FCPA 3BKHA 1IOTA 1L12A 3EBAB 1L88A 1CJ7A 4HTQA 3DN1A 4C3WA 1AKIA 1OUEA 114LA 4G9SA 147LA 2G4PA 1T8GA 2HULA 1FLWA 230LA 118LA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1BB5 A;  2XTH A;  3B0K A;  4ML7 A;  1OUG A;  4DYG A;  4NSJ A;  258L A;  4OWB A;  4G4B A;  1LZA A;  1XJU A;  1GDW A;  1UAC Y;  3HUQ A;  4H8X A;  176L A;  4J1A A;  1XGU C;  1LYD A;  2YSS C;  1JHL A;  4IJ4 A;  1AT6 A;  3DN8 A;  129L A;  197L A;  1QUG A;  4EXM A;  3OJP A;  3NY8 A;  3QE8 A;  4H1P A;  3DKE X;  1SWZ A;  4HPE A;  1IOR A;  1DYC A;  1F10 A;  1MEL L;  3HH6 A;  1F6S A;  1T8A A;  3C80 A;  1I1Z A;  5I4X A;  1LHL A;  2RBP A;  4EMN A;  1C6M A;  1G07 A;  1P2L A;  1CV5 A;  1WVV A;  1P56 A;  1PZY A;  3F8V A;  107L A;  5DN5 A;  2BQO A;  4DD1 A;  3TXI A;  3SB5 A;  5B1G A;  3DMX A;  5LVJ A;  1KXX A;  1KS3 A;  1VAU A;  1C61 A;  1GE3 A;  1LMQ A;  2RBS A;  1G7M C;  2D4K A;  1L17 A;  1L34 A;  1LZ5 A;  1WQO A;  1B7M A;  3C82 A;  1QDT A;  2B75 A;  146L A;  5B05 A;  218L A;  1XGR C;  1G7L C;  3B72 A;  1L93 A;  3SB7 A;  5KXS A;  2HUB A;  4XJB A;  1IC7 Y;  4ETD A;  1B5U A;  1L64 A;  1G0K A;  1D3J A;  2I26 L;  187L A;  1CV3 A;  240L A;  3GUM A;  1P64 A;  3DMV A;  4DJH A;  1C45 A;  1B7S A;  4WL6 A;  4I7P A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
 1BB5 A;  2XTH A;  3B0K A;  4ML7 A;  1OUG A;  4DYG A;  4NSJ A;  258L A;  4OWB A;  4G4B A;  1LZA A;  1XJU A;  1GDW A;  1UAC Y;  3HUQ A;  4H8X A;  176L A;  4J1A A;  1XGU C;  1LYD A;  2YSS C;  1JHL A;  4IJ4 A;  1AT6 A;  3DN8 A;  129L A;  197L A;  1QUG A;  4EXM A;  3OJP A;  3NY8 A;  3QE8 A;  4H1P A;  3DKE X;  1SWZ A;  4HPE A;  1IOR A;  1DYC A;  1F10 A;  1MEL L;  3HH6 A;  1F6S A;  1T8A A;  3C80 A;  1I1Z A;  5I4X A;  1LHL A;  2RBP A;  4EMN A;  1C6M A;  1G07 A;  1P2L A;  1CV5 A;  1WVV A;  1P56 A;  1PZY A;  3F8V A;  107L A;  5DN5 A;  2BQO A;  4DD1 A;  3TXI A;  3SB5 A;  5B1G A;  3DMX A;  5LVJ A;  1KXX A;  1KS3 A;  1VAU A;  1C61 A;  1GE3 A;  1LMQ A;  2RBS A;  1G7M C;  2D4K A;  1L17 A;  1L34 A;  1LZ5 A;  1WQO A;  1B7M A;  3C82 A;  1QDT A;  2B75 A;  146L A;  5B05 A;  218L A;  1XGR C;  1G7L C;  3B72 A;  1L93 A;  3SB7 A;  5KXS A;  2HUB A;  4XJB A;  1IC7 Y;  4ETD A;  1B5U A;  1L64 A;  1G0K A;  1D3J A;  2I26 L;  187L A;  1CV3 A;  240L A;  3GUM A;  1P64 A;  3DMV A;  4DJH A;  1C45 A;  1B7S A;  4WL6 A;  4I7P A; 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