2W1LA

The interdependence of wavelength, redundancy and dose in sulfur sad experiments: 0.979 a wavelength 991 images data
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Interdependence of Wavelength, Redundancy and Dose in Sulfur Sad Experiments.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME C
molecule tags Hydrolase
total genus 46
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2008-10-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2w1lA00
5DN4A 4PJ2C 1XSFA 1AKIA 1NF5A 4LT1A 2YBHA 4R0FA 4WM6A 4Z46A 1QTEA 1LJ4A 1W08A 4CHXA 2CGIA 4XJHA 1T3PA 3P65A 1GF9A 1XEJA 4U3XB 2DQAA 4DD1A 1JTTL 5KY1A 154LA 1C45A 1REYA 3ATNA 1FLUA 4GCEA 2LYZA 4WG7A 1JISA 4ZIXA 4XJGA 5HMVA 4HJZA 5A3ZA 4ET8A 2DQEY 2HUBA 1XGTC 1HFYA 4TWSA 4I0CA 4C3WA 2YBLA 2BQNA 3KAMA 5JENB 5ILCA 1IWWA 4HTKA 4OOTA 1MLCE 1OUHA 1YL0X 2MEBA 3A94A 2ZQ3A 4OWCA 5ILFA 1LMCA 3N9EA 4ETDA 4HPEA 2BQGA 1V7SA 1REXA 1YANA 1YROA 2HEAA 3B0OA 2MEHA 4XJDA 3A3QA 2BLYA 1LSPA 4I8SA 1IWVA 3AZ4A 1IR7A 4C5FA 1GDWA 4HP0A 1N4FA 1TAYA 3P4ZA 5LVKA 2MEEA 5DL9A 1LJGA 4M4OA 4IATA 5IDDA 1WQQA 1B7LA 4KL7A 1JIYA 3WXTA 1GBOA 3J6KA 1GB9A 1H6MA 4LGKA 2RSCA 3IJVA 3P66A 1RE2A 1ZV5L 4ZFPA 4EOFA 5J7CA 1GBXA 1GF4A 2CWIA 6LYTA 3T6UA 1LCNA 1HSWA 2Q0MX 5B1FA 4Z41A 1LZCA 2DBTA 2MEIA 4ET9A 4XADA 2EIZC 4YF2A 1YAPA 4NIJA 4J0LA 4N1EI 2G4NA 1UIFA 4H9EA 1RJCB 1GHLA 3TXEA 1LHJA 4WLDA 2ZIKA 2HEDA 1KIQC 4BAPA 4PHIA 5KXLA 2Y8PA 4LFPA 4MCKA 1PZYA 2A7DA 4XJIA 5LAFA 3TXJA 3WVXA 4H92A 1LJ3A 1CJ6A 1OUGA 4HSFA 1QIOA 1BGIA 3LYMA 5I4XA 4GCCA 1GE4A 1NBZC 4PGJB 3ZEKA 2BQFA 1B7RA 1JWRA 3AJNA 1GE0A 1HEPA 2LHMA 2IFFY 5I4YA 5L9JA 1B7MA 3AGGG 3CSZA 4H9FA 1XGUC 4H9AA 5F16A 3TMWA 1KIPC 2WARA 3G3AB 4H93A 3WW6A 1GB0A 1GFVA 5IELA 1INUA 4G4BA 1IWYA 2YBMA 1LZTA 4NFVA 4RW1A 4H9BA 3W6AA 1UUZC 1GFHA 4CJ2A 3AW7A 1YQVY 3AZ6A 5B1GA 4H8YA 3EMSA 4WLYA 1LOZA 1WQNA 2H9KA 1YIKA 1UIBA 2BLXA 1KXWA 1FLQA 4H9IA 2ZQ4A 1VATA 1XFPL 2DQIY 1GBSA 2DQCY 1HFXA 1HERA 1BHZA 4J7VA 1WTMA 5AMYA 2CJLA 4GCDA 4WMGA 4H8ZA 4AXTA 1DI4A 2MEGA 2BQKA 3GXRA 2HEFA 3A34A 5FDJA 2NWDX 1CKGA 4NGVA 2BQEA 4WO9A 3RNXA 2DQFC 3N9AA 3HBEX 3QY4A 4UWVA 2ZYCA 1B5ZA 1JKCA 4X3BA 1YAQA 1LZEA 1YILA 4GCBA 5HQ1A 3ZVQB 2YSSC 1GB5A 2BPUA 1HSXA 2BAAA 1JSFA 4LYCA 3M18B 1LSNA 3WU9A 5LIOA 1IP4A 5II3A 4PRUA 3QNGA 5KXWA 1UCOA 4YENA 1LJFA 1UIEA 1LJNA 5FHWA 5DM9A 3W6BA 2XBRA 1JPOA 5APFA 5KXXA 1LYOA 1GF8A 1B7OA 1LYSA 1OUEA 2BQMA 2FBDA 3AZ7A 1JJ1A 3TXKA 4GN3A 2F4AA 1FBIX 1CKHA 3B72A 5T3FA 5A3EA 1ZVYB 1OUAA 3TMUA 4R6CA 3FE0A 5E4PA 5FELA 2B5ZA 4G4CA 1GE1A 3D3DA 3IJUA 1QSWA 4NEBA 4OW1A 4NGKA 4WO6A 1DPXA 4MSTA 3LZTA 4GCFA 2BQAA 1GFJA 5FEKA 4EMNA 2ZYPA 4DD2A 1CJ7A 1GBYA 4YOPA 1WQOA 1IOTA 2HEBA 2Z39A 2BQDA 1LZ9A 4O34A 1LKRA 4BADA 4NSIA 1IOCA 1A4VA 4QY9A 1NDMC 3TXGA 1I1ZA 1LZ1A 4DWXA 2Z12A 1GF3A 1JHLA 2GV0A 1EQ5A 1UBZA 1LKSA 1LHIA 3TXFA 4H1PA 1D6PA 1G7LC 2W1YA 4WM1A 5F9XA 1QDTA 2N5ZA 1HFZA 1JSEA 4N9RA 4GN5C 3WYHA 2DQJY 2ZNWY 4NHQA 4ETCA 1IWXA 1OUFA 5I5QA 1HEOA 1B2KA 1F10A 3ULRA 1LJHA 1JKAA 4ANRA 1GB2A 1MELL 2AUBA 2XBSA 3E3DA 4D9ZA 5KXMA 1LJIA 132LA 1C43A 1HEQA 1LSDA 1HNLA 4OWEA 3OK0A 1LSCA 4LYTA 3CSQA 1LMAA 3HBHA 5KXTA 1TCYA 1Z55A 5LA8A 2DQDY 1HMKA 1W6ZA 4ETEA 4GLVA 4NGZA 1JKDA 3LN2A 3F6ZA 1QTKA 2MEFA 2YBJA 4XN6A 5KXNA 4N8ZA 4AGAA 4WL7A 1LZRA 2I25L 1NQIA 5B59A 2LYMA 1QQYA 1WQRA 5KXSA 5APDA 1IO5A 1LSFA 1OUCA 2F30A 2LZTA 3CT0A 2HTXA 3AYQA 1GFAA 2D6BA 2BQJA 1B7NA 1LSMA 2D4KA 4FDYA 3LHMA 2ZNXY 4G4HA 1LZBA 1IP7A 1QUSA 1FDLY 1GF5A 5FSTA 1RCMA 1LJJA 1QUTA 2G4QA 5D5FA 2BQBA 3HFMY 3RW8A 1GFTA 2DQHY 1IWZA 5I53A 3TXIA 4G9SA 4KPMA 1D0KA 2ZILA 1F6SA 4YM8A 2LYOA 3A3RX 1LJEA 3WXUA 2HECA 2PC2A 1OUDA 1LSAA 4II8A 1XGRC 1AT5A 1DKKA 1LZDA 4NSHA 2CDSA 3A92A 4OWAA 1VDSA 2D4JA 1REMA 1J1XY 1UICA 2W1XA 4TSCA 3HBDA 4TUNA 1IOSA 5EBHA 5B05A 1LMTA 4ETBA 3W6DA 4NG1A 1CKDA 2F2NA 194LA 3D9AC 4ETAA 4WM4A 1B5XA 1IC7Y 2MEDA 8LYZA 133LA 4QEQA 4HTQA 1LZGA 2HU3A 4H94A 1TBYA 4NHIA 4IJ4A 4NWEA 4DC4A 5KXOA 1O23A 4LT2A 5KKIA 1KXYA 3P68A 3W6EA 1GF6A 1LTMA 4OOOA 1LZ6A 3TXDA 1UIGA 1GFGA 1KIRC 4RLNA 1GF7A 5L3HA 4NHSA 2HEEA 4BS7A 153LA 4WOAA 3IWRA 1B5VA 1BWHA 1LYZA 3WPJA 1LPIA 1OUBA 1WVUA 4QDNA 4CFPA 4RW2A 4LYOA 1LZAA 3W3EA 2IHLA 2A7FA 3TXHA 1JUGA 5LYZA 3K3TA 4HV2A 4J1BA 4WLTA 1GBWA 1IY4A 1UIDA 1WVVA 3WULA 3RT5X 2H9JA 4XJFA 1YKYX 1GFUA 1FLYA 5HNLA 4A7DA 3WU7A 7LYZA 5B07A 1LMOA 1LZ8A 4NSGA 4W94A 4DDAA 4CGEA 5LVGA 208LA 1D9UA 2BQCA 3WUAA 1HENA 3FI7A 1IX0A 1IP5A 1UC0A 4B4IA 3WU8A 4H9CA 5D5CA 1CJ8A 1LMNA 1ZMYL 4N5RA 4XYYA 4M6DA 4B4EA 5LXWA 4RDSA 1DQJC 3CT1A 1GE3A 4LT3A 5DLAA 5I4WA 1OUJA 1VAUA 1GFKA 4OWBA 5APEA 5KKJA 1HF4A 1JITA 1FN5A 1LHLA 1VEDA 2MECA 3AB6A 5L3IA 3ATOA 1IR9A 1HEWA 135LA 2BQLA 1UIHA 2I26L 4WM2A 1OP9B 3T36A 3WW5A 6LYZA 1B9OA 4H90A 1GXXA 1VDPA 1GB6A 1LMQA 1IWUA 1BWIA 2YVBA 3AGHA 4TX7A 3N9CA 3W6FA 5LVHA 1AT6A 1YL1X 3AGIA 4J1AA 4DYGA 2FBBA 1B5UA 2Z19A 1I20A 4L41A 1IP1A 2YDGA 1SQ2L 1VDQA 2G4PA 3B6LA 2VB1A 1B7SA 4HV1A 1IEEA 2H5ZA 1NBYC 2Z18A 4IASA 4NGWA 3AZ5A 3BKVA 1CNSA 3VWOA 3A93A 1G7JC 4DDBA 1IP3A 4BAFA 4DD9A 1EL1A 1GB8A 1D0LA 4WM3A 1WQPA 1OQMA 2LZ2A 4GLAA 1LHHA 4B1AA 3ZVQA 5HNCA 1IIZA 4FJRA 4NHPA 2W1LA 3A96A 1LHKA 3TMXA 207LA 1LMPA 4W96A 4Z3MA 1HEMA 1YKZX 1NDGC 4PPOA 5C6IA 3GXKA 4B49A 1ALCA 1UACY 4HPIA 1GE2A 5FCPA 2EQLA 4LFXA 1RI8B 1VDTA 3A8ZA 4NGLA 1C46A 2BQHA 5DN5A 1GDXA 4UWNA 1IORA 1IWTA 4WG1A 5B06A 4G49A 2C8OA 2MEAA 4GN4A 1FKVA 2D91A 5KXPA 1DI3A 1NHEA 3EBAB 1LAAA 2Z2FA 1XGPC 2YBNA 4NGYA 5LYTA 5C6JA 1IP2A 1H87A 1LYYA 3WUMA 1FLWA 5LA5A 2Z2EA 5HLLA 1GXV2 1B5WA 5APCA 4KT3A 1NWGA 1IC4Y 4NWHA 1HC0A 5E9RA 2Z38A 4XJBA 1WQMA 1G7HC 4LT0A 1LSEA 1LHMA 1NKHA 3BKHA 1TEWA 4H9HA 1YAOA 3A91A 2FYDA 4B0DA 4LYMA 4NGOA 4NSJA 1DKJA 1GBZA 3J4GA 4HJYA 4CFOA 1GFEA 1J1PY 1ZVHL 1HHLA 2DKVA 1BWJA 1GAYA 1GPQC 4QGZA 4Z98A 4DDCA 4LYBA 1GF0A 3WPKA 4E3UA 4NY5A 4HTNA 1DZBX 3TXBA 3WVYA 1C10A 4YEOA 1BB5A 1XEKA 3LYTA 3LYZA 2C8PA 1GB7A 4B4JA 1E8LA 1IR8A 2XTHA 4OWHA 1C08C 5LVJA 1EQ4A 1I56A 3SP3A 2W1MA 3G3BB 1IY3A 3A95A 4P2EA 3WL2A 1LJKA 2D4IA 4YEMA 1LZNA 2I6ZA 4NG8A 1XGQC 1REZA 5K7OA 3EO5A 1DI5A 5HMJA 2Z37A 1JJ0A 1F0WA 1RFPA 2ZWBA 4UWUA 3A6BY 3CB7A 1GEZA 1YKXX 1CKCA 4WLXA 4DD3A 4DD0A 3AW6A 4NHTA 3B0KA 3A6CY 4H91A 1DXJA 1WTNA 1YAMA 2HU1A 5LVIA 4ML7A 3WMKA 1GAZA 1JTOL 4WM5A 2X0AA 2XJWA 3M3UA 1BB3A 5KXRA 1LZYA 1V7TA 5LYMA 1UA6Y 3WUNA 3CQLA 1BQLY 1JKBA 3RU5A 1FKQA 1QDRA 3CT5A 3MGWA 4N0JA 4RLMA 3LYOA 1CKFA 1IC5Y 2DQGY 1JEFA 1UIAA 2F4GA 4KXIA 1LSYA 1NMMA 4PRQA 5KXYA 5C6LA 1B7PA 1BVKC 1GFRA 4ZEEA 3WH1A 3TMVA 1CJ9A 1LZ4A 4TSBA 1OUIA 1IP6A 1A2YC 1C7PA 1LSGA 5KXKA 1LSZA 5F9UA 4N1CC 1GWDA 5I54A 5IHGA 1XEIA 1LSBA 1HELA 5F14A 3OJPA 1EQEA 5F81A 5KJ9A 1B0DA 3W6CA 1F6RA 2YBIA 1BB4A 3EXDA 4LYZA 1DPWA 4NGIA 1IOQA 1AM7A 4TTDA 3WPLA 1G7MC 4DD7A 3LZ2A 3CSRA 1T6VL 1AZFA 1IVMA 4LZTA 4WL6A 1LZ5A 2FYCA 5KXZA 1BVXA 4MR1A 1BB7A 4HJVA 1GB3A 3A90A 1D0MA 4NGJA 4XENA 134LA 1JTPL 1BB6A 1GD6A 1QSAA 3A67Y 5LINA 3QE8A 1B7QA 1J1OY 193LA 4H8XA 3RZ4A 1GEVA 1VFBC 2ZIJA 9LYZA 1PS5A 2EPEA 5LAGA 1HMLA 1TDYA 1LZSA 1P2CC 5M1YA 1B5YA 1JJ3A 2BQOA 2EKSC 3P64A 1D6QA 4DT3A 2BQIA 1G7IC 3B0IA 1SLYA 1KXXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5DN4A 1C6GA 2OU8A 4WM6A 1LJ4A 4XJHA 1L90A 1JTTL 5KY1A 1KW7A 1QUGA 4GCEA 2LYZA 4ZIXA 4XJGA 5A3ZA 2DQEY 1L86A 1HFYA 5ILCA 3KAMA 141LA 2MEBA 4OWCA 3N9EA 249LA 2BQGA 1V7SA 1L12A 4XJDA 1SX2A 259LA 2BLYA 3HUKA 2LCBA 4LZMA 1KNIA 5DL9A 1LJGA 4EKSA 1GBOA 3J6KA 1GB9A 4LGKA 4ZFPA 1RE2A 6LYTA 1LCNA 1L70A 1LZCA 2MEIA 2EIZC 4NIJA 4J0LA 125LA 2G4NA 4BAPA 3C82A 1QTDA 2Y8PA 4MCKA 256LA 3TXJA 3WVXA 4H92A 1LJ3A 1CJ6A 1OUGA 3DMZA 1BGIA 5I4XA 4GCCA 3HUAA 1QTBA 3ZEKA 3DMXA 4ARQB 1B7RA 1JWRA 1GE0A 223LA 2LHMA 2IFFY 1KIPC 1L60A 4YXCA 1L58A 1LYGA 3WW6A 2HUMA 4DKLA 3GUJA 1GFHA 1LOZA 2BLXA 1KXWA 5AMYA 1HFXA 4J7VA 1OYUA 1WTMA 2CJLA 3DKEX 192LA 4WMGA 4AXTA 1DI4A 2MEGA 3GXRA 199LA 3RNXA 4UWVA 1YILA 1L79A 3ZVQB 2BPUA 4DQ5A 170LA 5II3A 6LZMA 4W57A 5KXWA 1LJNA 1JPOA 5APFA 1GF8A 1JJ1A 1DYDA 2F4AA 1CKHA 3K2RA 4R6CA 1DYEA 3D3DA 1L16A 4WO6A 3LZTA 222LA 1GFJA 1CJ7A 1WQOA 1IOTA 2BQDA 2L78A 1LZ9A 1LKRA 3DN4A 166LA 1A4VA 2Z12A 2GV0A 1JHLA 1EQ5A 149LA 162LA 130LA 5F9XA 2ANVA 161LA 4GN5C 2DQJY 2ZNWY 1OUFA 1LJHA 1JKAA 1MELL 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5DN4 A;  4PJ2 C;  1XSF A;  1AKI A;  1NF5 A;  4LT1 A;  2YBH A;  4R0F A;  4WM6 A;  4Z46 A;  1QTE A;  1LJ4 A;  1W08 A;  4CHX A;  2CGI A;  4XJH A;  1T3P A;  3P65 A;  1GF9 A;  1XEJ A;  4U3X B;  2DQA A;  4DD1 A;  1JTT L;  5KY1 A;  154L A;  1C45 A;  1REY A;  3ATN A;  1FLU A;  4GCE A;  2LYZ A;  4WG7 A;  1JIS A;  4ZIX A;  4XJG A;  5HMV A;  4HJZ A;  5A3Z A;  4ET8 A;  2DQE Y;  2HUB A;  1XGT C;  1HFY A;  4TWS A;  4I0C A;  4C3W A;  2YBL A;  2BQN A;  3KAM A;  5JEN B;  5ILC A;  1IWW A;  4HTK A;  4OOT A;  1MLC E;  1OUH A;  1YL0 X;  2MEB A;  3A94 A;  2ZQ3 A;  4OWC A;  5ILF A;  1LMC A;  3N9E A;  4ETD A;  4HPE A;  2BQG A;  1V7S A;  1REX A;  1YAN A;  1YRO A;  2HEA A;  3B0O A;  2MEH A;  4XJD A;  3A3Q A;  2BLY A;  1LSP A;  4I8S A;  1IWV A;  3AZ4 A;  1IR7 A;  4C5F A;  1GDW A;  4HP0 A;  1N4F A;  1TAY A;  3P4Z A;  5LVK A;  2MEE A;  5DL9 A;  1LJG A;  4M4O A;  4IAT A;  5IDD A;  1WQQ A;  1B7L A;  4KL7 A;  1JIY A;  3WXT A;  1GBO A;  3J6K A;  1GB9 A;  1H6M A;  4LGK A;  2RSC A;  3IJV A;  3P66 A;  1RE2 A;  1ZV5 L;  4ZFP A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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