2WARA

Hen egg white lysozyme e35q chitopentaose complex
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFQSNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Chitopentaose Complex of a Mutant Hen Egg-White Lysozyme Displays No Distortion of the -1 Sugar Away from a 4C1 Chair Conformation
doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME C
molecule tags Hydrolase
source organism Gallus gallus
total genus 52
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2009-02-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2warA00
135LA 1HERA 3TMUA 4H9EA 2HEDA 2BPUA 2YVBA 4NG1A 1PZYA 1YROA 4E3UA 4LGKA 1OUAA 2BQIA 2LYMA 4HTNA 2ZNXY 2DQAA 3OK0A 4XJGA 1CJ9A 1GAYA 4W96A 3WYHA 2ZYPA 5I5QA 2HEEA 1LJKA 4H94A 1B7LA 3F6ZA 5FCPA 1NQIA 2YBLA 8LYZA 4CJ2A 5LVJA 2YBNA 3OJPA 1UIBA 4XJDA 1B2KA 4LYMA 1IWWA 1YKZX 1IP2A 2LZ2A 2ZQ4A 1IOTA 1LJEA 1FKQA 3P68A 3WULA 4LYOA 1LZNA 5F16A 1JWRA 5KJ9A 1QTKA 3A3RX 1JJ0A 1GDWA 1J1PY 5FEKA 1FBIX 3WW5A 4CGEA 1GB6A 5DLAA 1DPXA 1DZBX 1W6ZA 4NIJA 3W6EA 2Z12A 4YF2A 1LSDA 3A92A 5KXOA 2I6ZA 5JENB 2LYZA 1IP1A 4DD7A 1LJ4A 4NFVA 1LAAA 2VB1A 4H9CA 4OWCA 1IOQA 1FLUA 5HNLA 4BAPA 1CKHA 3TXKA 4N1CC 1DI4A 1GD6A 2BQMA 2CDSA 2W1LA 1XGPC 3GXKA 1EQ5A 1AT6A 4WL6A 1GB9A 1IWUA 4B4IA 4YOPA 2F2NA 4NSHA 1HF4A 2DQHY 4QY9A 4GN5C 1WVVA 1DPWA 2D6BA 4LYTA 5ILFA 1T3PA 4XN6A 4DD0A 1GFRA 2HEFA 2NWDX 3FE0A 4DT3A 4EMNA 3WL2A 1D6PA 1JKDA 2YDGA 5C6JA 2YBHA 5K7OA 5I53A 1LKSA 1IWYA 1UACY 3BKVA 3N9CA 4NGJA 5HMJA 2B5ZA 4PGJB 4AGAA 4DDCA 2CWIA 2DQGY 193LA 2G4QA 3WU8A 4KPMA 1J1OY 3QNGA 4N5RA 4NWEA 3MGWA 2MEHA 3WPJA 1BB3A 2BQCA 3WXTA 1YKYX 1T6VL 1YIKA 4GCDA 5KXZA 1YKXX 5LAFA 4G4BA 4NSIA 1GWDA 1GFGA 3VWOA 4WO9A 5KXMA 1F6SA 1AM7A 5KXLA 1LSGA 2ZWBA 1IR7A 3CSQA 1WQPA 1LSMA 3EMSA 2DQJY 1OP9B 5L3IA 1GF6A 4TSCA 1IP5A 4ETCA 2D91A 3A8ZA 1WQMA 1LJFA 1LZ9A 1TCYA 3A96A 4NWHA 3AZ5A 1DI5A 1JSFA 1VAUA 4EOFA 1P2CC 2IHLA 1BB5A 3ATNA 1BWJA 1GB2A 3B0KA 2W1MA 4WM5A 1LSBA 2FBBA 3A94A 1REXA 4U3XB 4WLXA 1PS5A 1E8LA 4NGKA 1LZ8A 3J6KA 4II8A 1KXXA 4H9BA 1HEOA 4LYZA 5F81A 1LZGA 1GBOA 2BQLA 2BQAA 1NMMA 1HEMA 3A34A 3W6BA 4NSGA 1DKJA 2Z39A 2D4IA 2MEGA 1EL1A 3J4GA 1IP7A 4I0CA 1IC5Y 1LHMA 5I54A 2MEEA 1B7QA 1LMAA 3N9AA 4WG1A 4LYCA 1MELL 4NGWA 4NSJA 3WUAA 4LT1A 2MEAA 1RCMA 1J1XY 4ZIXA 4O34A 1HELA 2H9JA 5DN4A 1QUSA 4H9AA 1UBZA 1RE2A 1GE0A 1OUIA 3CT1A 5B1GA 1CJ7A 3CT5A 3SP3A 1QTEA 1GFJA 2ZQ3A 1GB5A 2DQIY 1VDTA 1LSPA 153LA 4NG8A 1UUZC 1VFBC 2CJLA 3IJVA 4YEOA 1GXV2 5J7CA 1LZ5A 2GV0A 5LA8A 1GE4A 3TXIA 2Z2EA 3B0IA 4J1BA 1UIGA 1HNLA 3AYQA 2Z38A 1B5UA 1LTMA 4GCBA 4ET9A 3TXBA 4ZEEA 1IEEA 1LJHA 3LYMA 3RZ4A 4NGIA 4Z46A 9LYZA 1WQRA 3CQLA 3WXUA 4BAFA 1YANA 1OUGA 4H8XA 5HLLA 5B05A 5KKIA 4WG7A 1B5ZA 1FLWA 3P65A 2MEDA 4DYGA 1GF0A 3N9EA 5LIOA 1LPIA 2LHMA 3AB6A 4WOAA 3TXGA 1VATA 4ETEA 4HJVA 2Z2FA 5LYTA 2FYCA 1HC0A 3A91A 4OWAA 3T6UA 4UWUA 1IORA 1IOCA 3AGIA 3B0OA 1LZCA 3B72A 5KXYA 5A3EA 2EKSC 1GHLA 4NHIA 6LYTA 4KL7A 1SLYA 1RI8B 4MCKA 3TXEA 5D5FA 1D0LA 2DKVA 4LT3A 1B7RA 1KXYA 1TDYA 1V7TA 2F4AA 5LYZA 4GCFA 4DD3A 1MLCE 1C43A 1GF8A 2HECA 3CT0A 1HMKA 4OWBA 1C46A 1LMOA 4PPOA 5DL9A 1ZMYL 4W94A 1LZEA 3AGHA 4NGVA 5LXWA 1Z55A 1LJ3A 1NDGC 4XYYA 4NHTA 1GFKA 2C8OA 2ZYCA 5LYMA 3RNXA 1RFPA 3EO5A 2BQBA 1LYOA 4OOOA 1CJ8A 2XJWA 1AKIA 1LZYA 2EQLA 134LA 1JPOA 1OUBA 2DQEY 1BVKC 5B06A 4B4JA 207LA 1IC7Y 3D3DA 1OUFA 2F4GA 1JKCA 1QSWA 1UIDA 1XEIA 4N0JA 4L41A 1IWZA 1LSYA 1VDPA 1BHZA 5LAGA 5AMYA 5KXNA 2IFFY 1F0WA 5B59A 2BQNA 2D4KA 4N1EI 2LYOA 5L3HA 1B5YA 1UICA 3TXFA 4DWXA 3WUNA 1NBYC 1HHLA 4B49A 1LJGA 4OOTA 2I26L 5E9RA 1IWXA 4CFPA 1UIFA 2CGIA 4GN4A 1LZAA 4H91A 5LINA 1DI3A 3WMKA 1V7SA 4R6CA 5APFA 1LJJA 2HTXA 3P64A 4FDYA 5KXPA 3EXDA 1FKVA 4IATA 3WVYA 2BQJA 4HTKA 3A6BY 5EBHA 1C45A 1CKGA 5M1YA 3T36A 5LA5A 5FDJA 1ALCA 1XGQC 2BLYA 4H93A 3G3AB 3LYTA 3QY4A 4H1PA 1QDTA 2YBMA 5KXXA 1REMA 3TMWA 1LZBA 1NWGA 1BGIA 1NKHA 1WTNA 4LZTA 3P66A 3WPLA 5FHWA 4RLNA 4H8ZA 3TXDA 5II3A 5ILCA 4NGYA 3TMXA 1BQLY 3WU9A 1GDXA 4H92A 1GBWA 2DBTA 4GCCA 1LZ6A 4WMGA 3FI7A 3WW6A 4WL7A 1IR8A 1ZVHL 1B0DA 1GB3A 1IP6A 1LZ4A 5IELA 2G4NA 4GN3A 1OUDA 1WQOA 4G4HA 2MECA 4PHIA 2BAAA 4R0FA 1B5VA 1GB0A 1H87A 1WQNA 4A7DA 4KT3A 1GF7A 3ATOA 3HBHA 1LYZA 3A67Y 2Z18A 3IWRA 2ZIKA 4G49A 5DN5A 1F10A 1BB7A 3LN2A 3P4ZA 4TWSA 3QE8A 1D9UA 1BWIA 1YAQA 4CHXA 4FJRA 3ZVQA 3LYZA 1G7HC 1WTMA 4BS7A 3D9AC 1IR9A 3E3DA 1GBYA 2HU3A 6LYZA 1GFVA 2F30A 2BQEA 5B1FA 1ZVYB 4WLDA 4J1AA 1LSFA 4C3WA 1LSEA 1VEDA 3AZ4A 1LSCA 2EPEA 4GCEA 4IASA 5I4XA 1B5XA 1OUCA 1XGUC 4LYBA 4YEMA 1FLYA 3M18B 5LVHA 1FLQA 4XJHA 4XJBA 4OW1A 5LVKA 1LSNA 3AJNA 1NBZC 4WLYA 1JKAA 1H6MA 1WQQA 4H9HA 4LT0A 1GFAA 1LSAA 3B6LA 1UIHA 4MSTA 1UA6Y 3K3TA 1D0MA 1JISA 4G9SA 1LJNA 3TXJA 5APCA 1GF9A 3ZVQB 4M4OA 3CB7A 1LHJA 1YAPA 4NHSA 4AXTA 2DQCY 1I1ZA 2BQDA 5KKJA 1LMQA 1GXXA 3RW8A 1HEPA 1GAZA 1I20A 1UIEA 2HUBA 1KXWA 1GF5A 3M3UA 4BADA 5KY1A 1JSEA 1LHIA 3RT5X 1A4VA 7LYZA 1IP4A 5HMVA 4ETBA 2YBIA 1EQ4A 1LHKA 1LZSA 4IJ4A 5C6IA 2MEIA 132LA 1W08A 4WM4A 1B7SA 4Z41A 3AW6A 1IX0A 1B5WA 1JKBA 5F9UA 5E4PA 1KIQC 4OWEA 2PC2A 4WM6A 1N4FA 1QDRA 4UWNA 4ET8A 2D4JA 1IC4Y 1O23A 3W6CA 1HSWA 4WO6A 4N8ZA 2G4PA 1IY4A 4PRQA 4B0DA 1IVMA 1CJ6A 4MR1A 3W6AA 2H5ZA 1I56A 2HU1A 5T3FA 4NEBA 154LA 1DKKA 4HP0A 4GLAA 1HMLA 1TBYA 2RSCA 3A3QA 4G4CA 5KXRA 1GEVA 4Z3MA 1JEFA 4H9FA 4WM1A 1LCNA 1LZDA 3LYOA 4NGZA 1YQVY 2C8PA 3TMVA 5A3ZA 2X0AA 4H8YA 4QEQA 4M6DA 1KIRC 5F14A 1IIZA 1HENA 4WLTA 3AZ6A 2DQDY 4XADA 5FSTA 1GB8A 2AUBA 4GLVA 1B7OA 1LMTA 1HSXA 1OUJA 2BLXA 3HBDA 2YSSC 1DQJC 1JIYA 5KXTA 4N9RA 1INUA 1BB6A 1NDMC 2XBSA 2LZTA 3IJUA 3W6FA 4B4EA 5I4YA 4LFPA 1GBSA 1LMPA 1TEWA 1IOSA 1LJIA 3ZEKA 4HTQA 1VDSA 5KXWA 3A90A 1XSFA 4X3BA 4C5FA 1GEZA 1LHHA 3AGGG 5IDDA 4H90A 4DDBA 2N5ZA 1XEKA 4NGOA 1YAOA 4B1AA 3WVXA 3CSRA 1HEQA 1DXJA 1GE1A 1LYYA 1GE2A 3HFMY 4NHPA 2WARA 1LZRA 1JITA 1GPQC 2ZNWY 5APDA 5FELA 2Z37A 4DDAA 1A2YC 1IWVA 4PJ2C 1TAYA 4ETAA 1CKFA 5APEA 2BQFA 1XEJA 1BB4A 1G7LC 3AW7A 4J0LA 4CFOA 5I4WA 1JTPL 2FYDA 1C10A 1LMNA 1QIOA 4LT2A 2BQHA 4J7VA 3EBAB 3ULRA 1CNSA 4XENA 1JJ1A 4RW1A 4NGLA 1FDLY 1GFHA 2Y8PA 1ZV5L 2ZILA 1XGRC 2MEFA 1QSAA 3AZ7A 3LHMA 4HJYA 4Z98A 1JUGA 5D5CA 3WPKA 4DD9A 1BVXA 1LOZA 1C7PA 1UCOA 4XJIA 1JJ3A 1GB7A 2I25L 1JTOL 4RW2A 5F9XA 2FBDA 4P2EA 1IY3A 4WM2A 4HSFA 4H9IA 1JHLA 3W3EA 4HPEA 2H9KA 4TX7A 5HQ1A 2HEAA 1OUHA 4ETDA 1LYSA 1JTTL 3WUMA 4KXIA 1LSZA 4YM8A 1D6QA 1G7JC 1NF5A 4NY5A 5C6LA 208LA 2EIZC 1UC0A 4NHQA 3G3BB 4TUNA 1VDQA 3WU7A 4RLMA 1B7PA 2Z19A 2HEBA 3A95A 5B07A 4QDNA 3A6CY 2XBRA 3BKHA 1GF4A 1QUTA 1B9OA 1REYA 1UIAA 1LKRA 4TTDA 1IO5A 1IWTA 5HNCA 1B7MA 4PRUA 1RJCB 1YAMA 1B7NA 2Q0MX 3HBEX 1NHEA 1YL0X 4TSBA 4D9ZA 1EQEA 2A7FA 1YILA 4RDSA 5LVGA 1AZFA 133LA 3LZTA 2MEBA 4HPIA 1OUEA 2A7DA 1G7MC 2XTHA 4QGZA 3TXHA 1LZTA 1OQMA 1GF3A 1HEWA 1IP3A 1CKDA 1SQ2L 4I8SA 4OWHA 4DC4A 3W6DA 4ML7A 2BQOA 2W1XA 5IHGA 3WH1A 5KXKA 4UWVA 1LMCA 4DD1A 1AT5A 1BWHA 4HV1A 5KXSA 5LVIA 1XGTC 1GBXA 1LZ1A 3GXRA 3RU5A 1C08C 1KIPC 1YL1X 4LFXA 1G7IC 2YBJA 1XFPL 1WVUA 4DD2A 1CKCA 1GFUA 1LHLA 5L9JA 5DM9A 4ZFPA 1FN5A 1F6RA 4ANRA 3KAMA 4HV2A 3CSZA 2BQGA 1HFXA 1GE3A 1GFEA 3LZ2A 1GBZA 194LA 4HJZA 2ZIJA 2BQKA 2DQFC 1HFYA 1HFZA 4WM3A 4YENA 1QQYA 1REZA 1GFTA 3A93A 2W1YA 4XJFA 1D0KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L54A 1C6NA 142LA 2DQAA 4XJGA 4PK0A 4YXCA 2ZYPA 2RAYX 5LZMA 5LVJA 3OJPA 1UIBA 1P2RA 210LA 3LZMA 1IP2A 4I7KA 1KS3A 1FKQA 1CV0A 1L03A 4LYOA 5F16A 1C6HA 1JWRA 2RB0X 3W6EA 2Z12A 2LYZA 4H9CA 4OWCA 2B6YA 158LA 1GD6A 1AT6A 4B4IA 2F2NA 4NSHA 1HF4A 2DQHY 4GN5C 2D6BA 1T3PA 2HUKA 1LKSA 1UACY 1CV4A 2DQGY 2NTHA 1L55A 4N5RA 4NWEA 3WPJA 1YKYX 1YIKA 4GCDA 5KXZA 5LAFA 2Q9DA 5KXMA 1L80A 2O7AA 3EMSA 5L3IA 4ETCA 3A8ZA 1OV5A 1GB2A 4WM5A 1KW5A 3J6KA 4II8A 4DQ7A 3A34A 2D4IA 2MEGA 1WTHA 4I0CA 2MEEA 1B7QA 3N9AA 254LA 4NSJA 3WUAA 248LA 2RBPA 4O34A 1HELA 1DYGA 4H9AA 185LA 1UBZA 1GE0A 3HT6A 1QTEA 2DQIY 1VDTA 153LA 4NG8A 5J7CA 230LA 3B0IA 4J1BA 1T8FA 1UIGA 3AYQA 1B5UA 1L21A 3TXBA 1ZURA 2RBNA 3LYMA 1LWKA 247LA 9LYZA 3WXUA 1L84A 1L05A 1FLWA 3P65A 4ETEA 2Z2FA 2FYCA 1IOCA 5KXYA 1QSBA 4KL7A 1RI8B 1B7RA 218LA 1MLCE 4PPOA 1L58A 3QAKA 206LA 1LZEA 243LA 4NGVA 4NHTA 1GFKA 234LA 225LA 3K2RA 4OOOA 1OUBA 1JPOA 2DQEY 3HH3A 1IC7Y 1CU2A 3D3DA 4N0JA 3GUIA 1JKCA 1UIDA 3HU8A 4L41A 1IWZA 5LAGA 167LA 4LDEA 1F0WA 3RZEA 4N1EI 5L3HA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 135L A;  1HER A;  3TMU A;  4H9E A;  2HED A;  2BPU A;  2YVB A;  4NG1 A;  1PZY A;  1YRO A;  4E3U A;  4LGK A;  1OUA A;  2BQI A;  2LYM A;  4HTN A;  2ZNX Y;  2DQA A;  3OK0 A;  4XJG A;  1CJ9 A;  1GAY A;  4W96 A;  3WYH A;  2ZYP A;  5I5Q A;  2HEE A;  1LJK A;  4H94 A;  1B7L A;  3F6Z A;  5FCP A;  1NQI A;  2YBL A;  8LYZ A;  4CJ2 A;  5LVJ A;  2YBN A;  3OJP A;  1UIB A;  4XJD A;  1B2K A;  4LYM A;  1IWW A;  1YKZ X;  1IP2 A;  2LZ2 A;  2ZQ4 A;  1IOT A;  1LJE A;  1FKQ A;  3P68 A;  3WUL A;  4LYO A;  1LZN A;  5F16 A;  1JWR A;  5KJ9 A;  1QTK A;  3A3R X;  1JJ0 A;  1GDW A;  1J1P Y;  5FEK A;  1FBI X;  3WW5 A;  4CGE A;  1GB6 A;  5DLA A;  1DPX A;  1DZB X;  1W6Z A;  4NIJ A;  3W6E A;  2Z12 A;  4YF2 A;  1LSD A;  3A92 A;  5KXO A;  2I6Z A;  5JEN B;  2LYZ A;  1IP1 A;  4DD7 A;  1LJ4 A;  4NFV A;  1LAA A;  2VB1 A;  4H9C A;  4OWC A;  1IOQ A;  1FLU A;  5HNL A;  4BAP A;  1CKH A;  3TXK A;  4N1C C;  1DI4 A;  1GD6 A;  2BQM A;  2CDS A;  2W1L A;  1XGP C;  3GXK A;  1EQ5 A;  1AT6 A;  4WL6 A;  1GB9 A;  1IWU A;  4B4I A;  4YOP A;  2F2N A; 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 1JHL A;  3W3E A;  4HPE A;  2H9K A;  4TX7 A;  5HQ1 A;  2HEA A;  1OUH A;  4ETD A;  1LYS A;  1JTT L;  3WUM A;  4KXI A;  1LSZ A;  4YM8 A;  1D6Q A;  1G7J C;  1NF5 A;  4NY5 A;  5C6L A;  208L A;  2EIZ C;  1UC0 A;  4NHQ A;  3G3B B;  4TUN A;  1VDQ A;  3WU7 A;  4RLM A;  1B7P A;  2Z19 A;  2HEB A;  3A95 A;  5B07 A;  4QDN A;  3A6C Y;  2XBR A;  3BKH A;  1GF4 A;  1QUT A;  1B9O A;  1REY A;  1UIA A;  1LKR A;  4TTD A;  1IO5 A;  1IWT A;  5HNC A;  1B7M A;  4PRU A;  1RJC B;  1YAM A;  1B7N A;  2Q0M X;  3HBE X;  1NHE A;  1YL0 X;  4TSB A;  4D9Z A;  1EQE A;  2A7F A;  1YIL A;  4RDS A;  5LVG A;  1AZF A;  133L A;  3LZT A;  2MEB A;  4HPI A;  1OUE A;  2A7D A;  1G7M C;  2XTH A;  4QGZ A;  3TXH A;  1LZT A;  1OQM A;  1GF3 A;  1HEW A;  1IP3 A;  1CKD A;  1SQ2 L;  4I8S A;  4OWH A;  4DC4 A;  3W6D A;  4ML7 A;  2BQO A;  2W1X A;  5IHG A;  3WH1 A;  5KXK A;  4UWV A;  1LMC A;  4DD1 A;  1AT5 A;  1BWH A;  4HV1 A;  5KXS A;  5LVI A;  1XGT C;  1GBX A;  1LZ1 A;  3GXR A;  3RU5 A;  1C08 C;  1KIP C;  1YL1 X;  4LFX A;  1G7I C;  2YBJ A;  1XFP L; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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