2BAAA

The refined crystal structure of an endochitinase from hordeum vulgare l. seeds to 1.8 angstroms resolution
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
243
structure length
243
Chain Sequence
SVSSIVSRAQFDRMLLHRNDGACQAKGFYTYDAFVAAAAAFPGFGTTGSADAQKREVAAFLAQTSHETTGGWATAPDGAFAWGYCFKQERGASSDYCTPSAQWPCAPGKRYYGRGPIQLSHNYNYGPAGRAIGVDLLANPDLVATDATVGFKTAIWFWMTAQPPKPSSHAVIAGQWSPSGADRAAGRVPGFGVITNIINGGIECGHGQDSRVADRIGFYKRYCDILGVGYGNNLDCYSQRPFA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The refined crystal structure of an endochitinase from Hordeum vulgare L. seeds at 1.8 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDOCHITINASE (26 KD)
molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
total genus 87
structure length 243
sequence length 243
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 1995-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00182 Glyco_hydro_19 Chitinase class I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2baaA01
3.30.20.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Endochitinase; domain 2 Endochitinase, domain 2 2baaA02
3E3DA 1HHLA 4GLAA 4NHTA 4G4BA 1HEWA 4CFPA 2DQCY 1GE3A 2C8OA 4DD9A 3LYZA 5LXWA 1V7TA 1GHLA 1LZTA 2FBDA 1OP9B 5APFA 1O23A 1LTMA 1YILA 3WU7A 1F0WA 2HU1A 2WARA 5B1FA 5ILCA 1B9OA 1B2KA 3AZ4A 4GLVA 4I0CA 3EMSA 2C8PA 5KXNA 3ATOA 1RCMA 2LHMA 3TXJA 2MECA 4LFXA 6LYZA 4QEQA 1B0DA 1LZGA 2W1MA 1FBIX 1ZV5L 4OWCA 4XADA 4NEBA 1ZMYL 4DDBA 4J7VA 4GCEA 4BAPA 1XGUC 1D0MA 1TDYA 1YL1X 4LZTA 4WG1A 1IOSA 2YVBA 2IHLA 1QTKA 1XGQC 1AKIA 1GF7A 4H9AA 1VEDA 2X0AA 4G49A 4IJ4A 1GB2A 1XEJA 4NSIA 1GPQC 5AMYA 2NWDX 5D5FA 1LSFA 2Z19A 4RW1A 1LZBA 5T3FA 3AW7A 5F16A 1IR8A 1LJEA 5FCPA 1B5ZA 4DD0A 1NF5A 5D5CA 1DXJA 1GAZA 2BQGA 2EQLA 3WYHA 1BVKC 1JSFA 194LA 3TXBA 2BQIA 5B05A 5DN5A 1RI8B 5KXTA 1LMQA 2Y8PA 4WM2A 1OUAA 4XJBA 1LSGA 4ZIXA 4OWAA 4YENA 1QTEA 5KKJA 4TSCA 4NSHA 1XGRC 4MCKA 3AYQA 3TXIA 2XBSA 3ULRA 3QY4A 1LMTA 1HNLA 4GCCA 1F6SA 1LJIA 2F30A 3A96A 1GFUA 1LSPA 4DD1A 1Z55A 3A90A 1NMMA 1OUBA 2F2NA 1UIDA 2W1YA 5L3IA 134LA 1HENA 1LHJA 4NGWA 4W96A 1JKDA 3EO5A 2ZILA 4ETCA 1B7MA 2Z2FA 2BQAA 1JTPL 1MLCE 2CDSA 5KXRA 3TXEA 1A2YC 4NSJA 4N0JA 2Z18A 4HV2A 4TSBA 1DZBX 1B7QA 1JJ3A 1HELA 3A6CY 5LVJA 1VDTA 1YANA 1N4FA 1B5WA 1BB6A 3ATNA 4OWHA 4DDAA 4ZFPA 1JTOL 4UWNA 3P64A 4BS7A 1XFPL 5LVIA 5HLLA 5J7CA 1LZ9A 1OUGA 2EIZC 2XTHA 1VDSA 1KXYA 1H6MA 2HEEA 1KIQC 4H9IA 1NQIA 3N9AA 5FSTA 5A3EA 1LSCA 1H87A 2MEEA 1GBZA 4IATA 2CGIA 2BQMA 3A91A 1JIYA 1ZVYB 3WW6A 1IWZA 4B4IA 1YKZX 4P2EA 2Z37A 4R0FA 5APEA 5KXPA 3CT5A 4NG1A 3LN2A 4N5RA 3BKHA 5C6LA 1FDLY 1J1OY 1VDPA 1RJCB 6LYTA 1OUCA 1B7NA 4N9RA 1KXXA 2G4NA 5I4WA 3EXDA 1AT5A 3N9CA 1LSNA 1TEWA 1UIGA 4NHQA 3AZ7A 2DKVA 5I54A 1GF9A 1LSDA 1LMAA 3CB7A 1XEIA 1QSWA 4UWUA 3B0KA 5B06A 2W1LA 3B0OA 3W6CA 1LZRA 5DM9A 1YL0X 1GFHA 3RW8A 1WQPA 4DC4A 5ILFA 1CNSA 4G4CA 4CFOA 1YIKA 4J0LA 5KXYA 3J6KA 1LSYA 1KIPC 5LA5A 3ZVQA 4DD2A 2Z12A 2YBMA 3G3AB 1G7HC 2XBRA 4ETBA 4B4EA 8LYZA 4H94A 2YBIA 5B1GA 4U3XB 1HC0A 3A95A 1BB4A 3IWRA 1NWGA 4E3UA 1C45A 1YAMA 5F14A 2W1XA 5KXOA 1DI5A 1FLYA 1LMCA 3AGHA 4NGKA 1IP5A 5IDDA 5FELA 4XENA 5KY1A 2F4GA 3CSQA 4W94A 1FLUA 5KXZA 3MGWA 3AGGG 5KXMA 3RZ4A 1J1XY 2Z2EA 5LINA 5LVHA 1IOTA 1OUDA 3B72A 3FE0A 4RLNA 3TMVA 4WM3A 3WMKA 1HERA 1GB8A 1PZYA 3GXKA 4YEOA 4O34A 1VATA 2XJWA 2LYZA 1BHZA 4X3BA 3WUMA 1BB3A 2BQDA 1LKSA 2ZIKA 3D3DA 1GF3A 2DQHY 153LA 1GXV2 1IX0A 4WOAA 2Z39A 1BWIA 1EQ5A 1I1ZA 1C7PA 2AUBA 3ZVQB 5LYMA 3A3RX 2I6ZA 1GB7A 1JSEA 2DQGY 4H93A 1BWJA 1EQ4A 1IWUA 2ZNXY 1QIOA 4HTNA 4XYYA 3TMWA 2HEFA 1B7LA 1LCNA 1IR9A 1LYYA 1IP4A 4LGKA 3W6AA 3WXUA 4A7DA 1LMNA 4YOPA 4J1AA 2Z38A 4D9ZA 1NDMC 2ZQ3A 193LA 1MELL 1GBXA 1NDGC 1UCOA 3HBHA 4OOTA 4YM8A 5EBHA 1IOCA 1GFVA 1IP2A 2BQKA 1LYSA 1DPWA 3A93A 3CSZA 1JEFA 3ZEKA 3J4GA 4WLDA 1JJ1A 2VB1A 1GF0A 3LYOA 1B7RA 1LZNA 4TTDA 4H9FA 1GE2A 2LZ2A 1C10A 3KAMA 1GF6A 1REXA 1CKHA 3CT0A 4L41A 2ZYPA 1GB5A 1P2CC 1QUSA 2D91A 4WM5A 5HNLA 3WU8A 1LHHA 1LHLA 1GFAA 4G9SA 4QGZA 1CJ6A 5I4YA 1LJHA 1DKJA 1LHMA 4TWSA 1UIBA 5E4PA 1PS5A 1B7OA 1LMPA 2ZYCA 3AB6A 1LYZA 1WTNA 1GF5A 1YKYX 3A94A 3B6LA 4I8SA 4J1BA 4LT1A 5C6IA 5B59A 4KPMA 1SLYA 2MEGA 4Z46A 1OUIA 1BB7A 3RT5X 1IOQA 1GBSA 1UBZA 1AZFA 2MEIA 1JWRA 2GV0A 4H1PA 1OQMA 1IC4Y 5LAGA 1TCYA 1KIRC 1LSEA 3LYMA 4H9BA 4ET9A 3A67Y 4XJHA 4RLMA 3TMXA 4NWEA 1IWTA 4NGOA 4WO9A 5B07A 3GXRA 1EQEA 1OUEA 3AZ5A 1IC7Y 1JUGA 4MSTA 1LZCA 7LYZA 1LJ4A 1UC0A 4NIJA 2ZQ4A 3HFMY 3AZ6A 3LZ2A 2D4JA 2LYMA 2BPUA 5KXSA 4LYCA 4G4HA 1JTTL 4C3WA 2LYOA 1LSZA 4HPIA 1LKRA 4ML7A 2G4QA 1W08A 1XSFA 5KXLA 1CJ9A 3TXHA 1J1PY 5FEKA 5L9JA 3CSRA 1GFKA 1GDWA 4NHIA 1REZA 4WLYA 3TXDA 4Z98A 4GN3A 1GFRA 1NBYC 4Z41A 1LJ3A 5KXXA 1LZ1A 5LYZA 4NHSA 1LHIA 1YAOA 1BB5A 3A6BY 4GN5C 4PRQA 1TBYA 1GFJA 5HMJA 3AW6A 3CT1A 1JJ0A 4HJVA 5DLAA 1HMLA 5L3HA 4DYGA 4HJZA 2IFFY 3WU9A 1D9UA 1JISA 1OUJA 1IIZA 1LZ4A 2I25L 2YSSC 4LYOA 4LT0A 4RDSA 1QDTA 3TXGA 1VDQA 3CQLA 1T6VL 1WTMA 2BQCA 1E8LA 1LSAA 1HSWA 1B5XA 1JKAA 2HECA 5I4XA 3F6ZA 5LYTA 1LOZA 5HMVA 4H90A 1V7SA 1W6ZA 3TXKA 4OWEA 1GF8A 1LZ5A 1REYA 1I56A 208LA 2BQNA 2HU3A 4B49A 2FYDA 1BQLY 3WH1A 4CGEA 1IR7A 4DDCA 1QDRA 1NKHA 1WQNA 1WQQA 3W6EA 1G7JC 5LVGA 4H91A 1LZ8A 1INUA 2A7FA 4PHIA 2FBBA 3RU5A 1GXXA 4DD7A 5C6JA 1WVUA 2BLYA 4PJ2C 4PPOA 5F81A 4H9EA 1OUHA 4NHPA 4CHXA 5II3A 1LAAA 1UIFA 4NGIA 2MEHA 1HFZA 1D6PA 4KXIA 3LZTA 4KL7A 4HTQA 1HEPA 4HJYA 1F6RA 1CJ8A 1FLWA 3M3UA 2FYCA 4M4OA 5KXWA 1ZVHL 2RSCA 5HQ1A 4QDNA 1VFBC 2CWIA 1LSBA 4XJGA 4RW2A 1XEKA 4H9HA 1KXWA 1WQMA 1AT6A 2DQIY 3A92A 1GB0A 4B0DA 2ZWBA 4M6DA 4ETEA 3WXTA 1CKDA 1FLQA 2I26L 1LSMA 3BKVA 1CKCA 4QY9A 1DPXA 1BVXA 1GAYA 2BAAA 2YBJA 1UA6Y 1UICA 4WM1A 1GB9A 4WL6A 4XJIA 4HP0A 4B4JA 1HFXA 4WM6A 1IORA 1G7IC 4GCDA 1LZ6A 1B5UA 4II8A 1JHLA 1JKCA 1GE1A 1LJGA 2A7DA 1HF4A 4NGYA 3OJPA 2HEAA 1UIAA 1B5YA 5DN4A 4FJRA 1UUZC 3SP3A 1AM7A 1IWVA 135LA 1T3PA 4TUNA 1OUFA 2H9JA 4FDYA 4DT3A 5FDJA 1GEZA 5APCA 1SQ2L 4WM4A 4XJDA 1B7SA 4NGZA 2YBNA 4ETAA 3RNXA 207LA 1D0KA 1RFPA 3G3BB 5FHWA 1GFTA 2HUBA 5LVKA 1UIEA 1IP7A 2DQJY 4ETDA 4HTKA 1RE2A 4HV1A 3WPJA 4NG8A 1IY4A 3LYTA 4GN4A 4WG7A 2H9KA 2DBTA 4PGJB 4XJFA 3WPKA 4WLTA 5A3ZA 2BQJA 4WL7A 1DQJC 2HTXA 1FKQA 2D6BA 4MR1A 2F4AA 4HPEA 2MEBA 1IO5A 1LZYA 1BGIA 1WQRA 3HBDA 1JPOA 1WVVA 2DQDY 4LYTA 4GCFA 4WMGA 2MEAA 3W6DA 2PC2A 5DL9A 2MEFA 3M18B 3OK0A 4B1AA 5JENB 4KT3A 4R6CA 1IVMA 2ZIJA 5IHGA 4LYMA 1GBWA 1CKFA 4NGJA 1LZDA 1DKKA 3AJNA 1LJKA 1JKBA 2BQHA 1YAQA 3VWOA 1LYOA 1IWYA 5IELA 4UWVA 1GWDA 1C08C 1GE0A 3WVYA 4NY5A 1HEOA 1G7MC 154LA 4DWXA 1JITA 3WVXA 1GE4A 4N1CC 2BQLA 4NGVA 5LA8A 1GF4A 1B7PA 1C43A 3K3TA 3TMUA 4AXTA 1NBZC 4YEMA 1F10A 1QSAA 2H5ZA 3WW5A 1LPIA 3A8ZA 3B0IA 3IJUA 1LJJA 1D0LA 1TAYA 5F9XA 3T36A 1LHKA 2G4PA 2MEDA 4C5FA 4LT3A 2BQOA 3QE8A 3QNGA 2BQEA 2D4KA 3W6BA 1QUTA 1GBYA 4OOOA 4LYZA 1VAUA 1IP6A 1GEVA 2D4IA 1HSXA 1UIHA 4ET8A 4LFPA 1LZAA 1LMOA 4TX7A 1G7LC 1I20A 1A4VA 5F9UA 2EKSC 1HEMA 4EMNA 3P65A 2YBLA 4PRUA 4H8ZA 2HEDA 5I53A 1YROA 3WUAA 9LYZA 5KKIA 4AGAA 2YBHA 4CJ2A 1CKGA 5HNCA 4NGLA 1IWXA 2DQFC 2DQAA 3W6FA 1YKXX 2BQBA 1GD6A 4NWHA 1LJNA 5M1YA 3WL2A 4ANRA 1YQVY 3D9AC 1HEQA 1EL1A 4N1EI 5LAFA 4H9CA 4WO6A 1B5VA 1XGTC 2HEBA 5KXKA 3WPLA 1HMKA 5I5QA 4BAFA 1REMA 4EOFA 1UACY 4ZEEA 4DD3A 2BLXA 1C46A 3EBAB 4LYBA 2B5ZA 1LZSA 3T6UA 4YF2A 4H92A 1LJFA 4NFVA 1IEEA 132LA 1ALCA 4H8XA 3W3EA 4IASA 4OWBA 2ZNWY 1D6QA 5K7OA 5E9RA 1GFEA 1IP3A 1XGPC 1LZEA 3LHMA 1IC5Y 1YAPA 3A3QA 2CJLA 2N5ZA 3AGIA 3N9EA 1FKVA 2YDGA 3P4ZA 4N8ZA 1GB3A 4Z3MA 3P66A 3HBEX 5KJ9A 1GFGA 1QQYA 1GBOA 2LZTA 4GCBA 1IWWA 4OW1A 4WLXA 1DI3A 1GB6A 3FI7A 1WQOA 5LIOA 2EPEA 2BQFA 3IJVA 4NSGA 4H8YA 5APDA 1CJ7A 3WULA 1IY3A 4LT2A 3TXFA 1IP1A 1BWHA 1FN5A 2DQEY 1GDXA 4HSFA 4XN6A 2Q0MX 3WUNA 1NHEA 3P68A 1HFYA 4BADA 133LA 1DI4A 3A34A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HEWA 4CFPA 3DN3A 3LYZA 1V7TA 3NYAA 5B1FA 1L18A 4GLVA 1TLAA 4LFXA 4QEQA 1G1VA 2W1MA 1CU2A 4OWCA 4NEBA 4J7VA 4BAPA 1KW7A 1XGUC 4LZTA 1IOSA 4H9AA 1AKIA 1VEDA 4G49A 1XEJA 1GPQC 4W59A 3SB7A 2NWDX 2Z19A 3HDEA 1L37A 5D5CA 107LA 1QUGA 1GAZA 2BQGA 3WYHA 1BVKC 1L10A 194LA 3DN6A 1LMQA 2Y8PA 1OUAA 4XJBA 102LA 128LA 3HT9A 5KKJA 1LGWA 1L81A 1LMTA 4GCCA 1F6SA 1L52A 3A96A 1Z55A 2ANVA 1OUBA 1CV4A 2W1YA 2Z2FA 1XJTA 4HV2A 5LVJA 1DZBX 1B7QA 110LA 1N4FA 1LLHA 4DAJA 158LA 5I14A 1OUGA 3HTFA 1KXYA 2MEEA 4IATA 1ZVYB 4P2EA 2Z37A 1L77A 1LWKA 2RB1X 1T8AA 3BKHA 5C6LA 1FDLY 1C66A 4W55A 4EPIA 1RJCB 6LYTA 1B7NA 4N9RA 220LA 1AT5A 147LA 1C6AA 216LA 3GUIA 1JTNA 3CB7A 1LMAA 1QSWA 161LA 5B06A 2Q9EA 125LA 4DC4A 1CNSA 1L35A 4CFOA 191LA 1KIPC 2LCBA 3ZVQA 1DYCA 2Z12A 189LA 1L94A 4H94A 2YBIA 1L19A 1HC0A 1L29A 1DI5A 226LA 205LA 1LMCA 2OEAX 3AGHA 1IP5A 3C83A 1OVKA 5KXMA 1J1XY 1OUDA 3QAKA 3WMKA 1HERA 1D2WA 4YEOA 1VATA 1BHZA 1L75A 2BQDA 153LA 1L15A 4WOAA 199LA 2AUBA 1I1ZA 1C7PA 3ZVQB 3A3RX 2I6ZA 1JSEA 3HTGA 1DYEA 4H93A 1CUQA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3E3D A;  1HHL A;  4GLA A;  4NHT A;  4G4B A;  1HEW A;  4CFP A;  2DQC Y;  1GE3 A;  2C8O A;  4DD9 A;  3LYZ A;  5LXW A;  1V7T A;  1GHL A;  1LZT A;  2FBD A;  1OP9 B;  5APF A;  1O23 A;  1LTM A;  1YIL A;  3WU7 A;  1F0W A;  2HU1 A;  2WAR A;  5B1F A;  5ILC A;  1B9O A;  1B2K A;  3AZ4 A;  4GLV A;  4I0C A;  3EMS A;  2C8P A;  5KXN A;  3ATO A;  1RCM A;  2LHM A;  3TXJ A;  2MEC A;  4LFX A;  6LYZ A;  4QEQ A;  1B0D A;  1LZG A;  2W1M A;  1FBI X;  1ZV5 L;  4OWC A;  4XAD A;  4NEB A;  1ZMY L;  4DDB A;  4J7V A;  4GCE A;  4BAP A;  1XGU C;  1D0M A;  1TDY A;  1YL1 X;  4LZT A;  4WG1 A;  1IOS A;  2YVB A;  2IHL A;  1QTK A;  1XGQ C;  1AKI A;  1GF7 A;  4H9A A;  1VED A;  2X0A A;  4G49 A;  4IJ4 A;  1GB2 A;  1XEJ A;  4NSI A;  1GPQ C;  5AMY A;  2NWD X;  5D5F A;  1LSF A;  2Z19 A;  4RW1 A;  1LZB A;  5T3F A;  3AW7 A;  5F16 A;  1IR8 A;  1LJE A;  5FCP A;  1B5Z A;  4DD0 A;  1NF5 A;  5D5C A;  1DXJ A;  1GAZ A;  2BQG A;  2EQL A;  3WYH A;  1BVK C;  1JSF A;  194L A;  3TXB A;  2BQI A;  5B05 A;  5DN5 A;  1RI8 B;  5KXT A;  1LMQ A;  2Y8P A; 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 1GEV A;  2D4I A;  1HSX A;  1UIH A;  4ET8 A;  4LFP A;  1LZA A;  1LMO A;  4TX7 A;  1G7L C;  1I20 A;  1A4V A;  5F9U A;  2EKS C;  1HEM A;  4EMN A;  3P65 A;  2YBL A;  4PRU A;  4H8Z A;  2HED A;  5I53 A;  1YRO A;  3WUA A;  9LYZ A;  5KKI A;  4AGA A;  2YBH A;  4CJ2 A;  1CKG A;  5HNC A;  4NGL A;  1IWX A;  2DQF C;  2DQA A;  3W6F A;  1YKX X;  2BQB A;  1GD6 A;  4NWH A;  1LJN A;  5M1Y A;  3WL2 A;  4ANR A;  1YQV Y;  3D9A C;  1HEQ A;  1EL1 A;  4N1E I;  5LAF A;  4H9C A;  4WO6 A;  1B5V A;  1XGT C;  2HEB A;  5KXK A;  3WPL A;  1HMK A;  5I5Q A;  4BAF A;  1REM A;  4EOF A;  1UAC Y;  4ZEE A;  4DD3 A;  2BLX A;  1C46 A;  3EBA B;  4LYB A;  2B5Z A;  1LZS A;  3T6U A;  4YF2 A;  4H92 A;  1LJF A;  4NFV A;  1IEE A;  132L A;  1ALC A;  4H8X A;  3W3E A;  4IAS A;  4OWB A;  2ZNW Y;  1D6Q A;  5K7O A;  5E9R A;  1GFE A;  1IP3 A;  1XGP C;  1LZE A;  3LHM A;  1IC5 Y;  1YAP A;  3A3Q A;  2CJL A;  2N5Z A;  3AGI A;  3N9E A;  1FKV A;  2YDG A;  3P4Z A;  4N8Z A;  1GB3 A;  4Z3M A;  3P66 A;  3HBE X;  5KJ9 A;  1GFG A;  1QQY A;  1GBO A;  2LZT A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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