2DBTA

Crystal structure of chitinase c from streptomyces griseus hut6037
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
205
structure length
205
Chain Sequence
GFVVSEAQFNQMFPNRNAFYTYKGLTDALSAYPAFAKTGSDEVKKREAAAFLANVSHETGGLFYIKEVNEANYPHYCDTTQSYGCPAGQAAYYGRGPIQLSWNFNYKAAGDALGINLLANPYLVEQDPAVAWKTGLWYWNSQNGPGTMTPHNAIVNNAGFGETIRSINGALECNGGNPAQVQSRINKFTQFTQILGTTTGPNLSC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural Studies of a Two-domain Chitinase from Streptomyces griseus HUT6037
pubmed doi rcsb
molecule keywords chitinase C
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces griseus
total genus 71
structure length 205
sequence length 205
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2005-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00182 Glyco_hydro_19 Chitinase class I
A PF02839 CBM_5_12 Carbohydrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2dbtA01
3.30.20.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Endochitinase; domain 2 Endochitinase, domain 2 2dbtA02
1IP1A 1CJ7A 1LJFA 1GBYA 3CSRA 1RCMA 2YBIA 4GCEA 153LA 4TSCA 2EQLA 4NSJA 5C6IA 4M6DA 3LZTA 3MGWA 1IR8A 1KIPC 3A3QA 4H9EA 4WG1A 3TXKA 5HNCA 1REYA 4H9CA 1GFVA 4CHXA 1IWYA 2FYDA 4G49A 1LZDA 1IOCA 2W1MA 4HJVA 3RT5X 1GFHA 4TWSA 2F4AA 1LKSA 4HPEA 4MCKA 1XEJA 1KIQC 1LJ3A 4NHQA 2BQGA 3TMUA 5E9RA 3WPLA 4KPMA 1B5UA 1GAZA 3ATOA 4H8YA 4LFXA 1CKDA 1JKDA 1OUEA 1YROA 2DQGY 5I4YA 2D4IA 1GB7A 1VEDA 4R0FA 1SLYA 3RU5A 4DWXA 5L9JA 1LJEA 1LSMA 3A94A 1HFXA 4NHSA 1QUTA 2HUBA 2LYOA 1IP4A 3AZ7A 4NSIA 5K7OA 4HV2A 4QDNA 4KL7A 4TSBA 1IR9A 2XBRA 3B0KA 3W6BA 154LA 2F4GA 5KXMA 1J1XY 3WL2A 5LVIA 1LZNA 2ZNXY 2X0AA 4RLMA 2FBDA 1NDMC 1LZ5A 5KXSA 4B0DA 1HMKA 2CDSA 1YIKA 1ZMYL 1A2YC 1LHHA 1O23A 1VAUA 2BQJA 1FDLY 2VB1A 4NWHA 4WM3A 4P2EA 2IFFY 1LJIA 3A3RX 1LSZA 1UIAA 1XEKA 2HECA 3ZVQA 1LJJA 4H93A 4YM8A 2AUBA 4BADA 1W08A 1TEWA 3VWOA 4N1CC 4WG7A 2YBMA 1WTMA 4G4CA 3CT0A 1CKCA 3A90A 1VFBC 4J1AA 4DD0A 1KXXA 1IWVA 5KKIA 3D3DA 2DQIY 2H5ZA 1GHLA 1LZSA 4NGZA 5M1YA 194LA 1C10A 4J0LA 4B1AA 1IO5A 3WULA 1C45A 1HMLA 2G4PA 2N5ZA 1B5VA 2C8PA 3HBEX 1GBZA 3W6AA 1GEZA 4YOPA 5HNLA 3CT1A 4GCCA 1HSXA 3CB7A 1GBOA 3EO5A 4QEQA 5DM9A 1REXA 5F16A 5I53A 4ETAA 5JENB 1JUGA 4XYYA 3FE0A 3ZVQB 1NBYC 1V7TA 1YKYX 2XBSA 4NGKA 1UIGA 1UUZC 2EPEA 2YVBA 4R6CA 2D91A 4Z41A 2XTHA 2BQBA 1DQJC 1BB3A 4J7VA 5B06A 3BKVA 2BQHA 2Y8PA 1YILA 4DD2A 3CT5A 1GPQC 1OUHA 4XJFA 1B9OA 1LMCA 4GLAA 1BWJA 4GLVA 1AT6A 1PS5A 1DPXA 4GN3A 1JTOL 1JJ0A 3GXRA 3TXIA 2DQCY 1CJ9A 1HEOA 4C3WA 2MEEA 4BS7A 2Z37A 1UIBA 4I8SA 1YKXX 1GB5A 1ZVYB 4HV1A 4GCBA 4WM1A 4WO9A 4H9IA 1HSWA 1IOTA 2H9JA 3WYHA 4GN4A 4ET9A 3EXDA 5HMVA 2BQCA 1LOZA 2W1YA 2WARA 1D6PA 1AZFA 3WVXA 1EQEA 3G3AB 3WVYA 1UIEA 3A34A 4AXTA 1D6QA 1GE0A 5ILFA 1G7IC 2Q0MX 4NGYA 3D9AC 1XFPL 1GB0A 3AYQA 1GWDA 2ZILA 5E4PA 4C5FA 4XN6A 1JKBA 1OUFA 3AW6A 4NGLA 3P4ZA 4L41A 1IWTA 1LHKA 1BB6A 5FDJA 5DN4A 1DI4A 5FHWA 1REMA 3TMVA 1B7NA 2B5ZA 1DZBX 1YAOA 4LYBA 4NGWA 4NHPA 4GCFA 4RW1A 3TMXA 4WLTA 1LJNA 3W6DA 5A3EA 4CJ2A 1NKHA 1LCNA 1GBXA 1LZEA 3W6FA 2D4KA 3IJUA 5LAGA 4ZEEA 4LT0A 4LT3A 134LA 1GB3A 5F9XA 1IVMA 1KIRC 1QDTA 1LYYA 1WQQA 1XGTC 1SQ2L 5B59A 1GBWA 5EBHA 1H87A 5KXOA 3CQLA 2FYCA 5L3HA 1F6RA 1WQMA 5IELA 1TBYA 3W3EA 4FJRA 3TXEA 1IC4Y 4N1EI 4U3XB 3TXDA 5B05A 3QY4A 4H91A 4PPOA 2BQAA 4ET8A 1HEQA 4FDYA 133LA 1XSFA 4ZIXA 2RSCA 1YAPA 1DKKA 4WM4A 3WU9A 3LN2A 5C6JA 3WW6A 5ILCA 1FLUA 1XGPC 1D0LA 1DI3A 1W6ZA 2HEAA 2LYMA 3LYMA 5DN5A 3WUMA 1B2KA 1WQPA 3J4GA 1GF9A 4H94A 2DQEY 5D5FA 2BQEA 1REZA 5KY1A 1UIDA 4H9HA 4H9BA 4LYZA 1LSGA 4WL7A 1GB2A 2HU1A 4XENA 4OOOA 1EL1A 1TDYA 4PGJB 1GB8A 3TXFA 1UA6Y 1D0KA 2BLXA 1LAAA 2DKVA 2HEFA 3AJNA 4A7DA 4WM6A 2CWIA 3TMWA 1IR7A 1GXXA 2LHMA 2ZQ4A 4NGJA 1C08C 3P68A 1IP3A 2MEAA 3B0OA 4EMNA 2HEBA 2Z2EA 1BB5A 3P65A 4IATA 1PZYA 4H8ZA 4WMGA 2G4NA 2A7FA 1LJHA 1BB7A 2Z38A 1MLCE 2BQNA 4WO6A 4XADA 3AGGG 1F10A 1B7RA 4YENA 2YBHA 1QTKA 4ETCA 1LHLA 2BQOA 4DT3A 1JWRA 1LZ9A 4WLDA 4YEMA 1DKJA 3HBDA 3IJVA 3LZ2A 3WU7A 4M4OA 4XJBA 3A8ZA 4DYGA 2HEEA 1IWWA 1JIYA 1RI8B 2DQAA 3F6ZA 3W6EA 4II8A 4DD3A 3A92A 1OUCA 1RJCB 2BQMA 2MEBA 1RFPA 1LZTA 135LA 1IP5A 2MECA 3EMSA 5I5QA 5J7CA 5C6LA 1LMNA 1QQYA 4NEBA 1GF8A 1F0WA 1IY3A 1WVUA 4OWEA 5II3A 1HNLA 1DPWA 1FLYA 1GFTA 1LSPA 3AGHA 1JSFA 1FBIX 1YAQA 4N8ZA 4HJYA 4HTNA 4O34A 1VDPA 4OOTA 3B0IA 1LZ4A 3N9CA 2I6ZA 4LFPA 4RLNA 4WM2A 5KXRA 4LYMA 1CKFA 3N9EA 3RW8A 3WPKA 1BWIA 1G7MC 1NBZC 1I20A 4YEOA 2ZWBA 1YQVY 3T36A 4KT3A 4NGVA 1GF6A 2CJLA 2CGIA 1GE2A 1HEPA 5DLAA 5LA5A 2G4QA 2C8OA 5APCA 1BHZA 1LZYA 1IORA 2DQHY 4D9ZA 1IWXA 5LIOA 3A67Y 1LYSA 1WQNA 2H9KA 3WUAA 5FELA 3P66A 2EKSC 5KXYA 1D9UA 1FLQA 2W1XA 5KXZA 1RE2A 1LYZA 4DDAA 3TXHA 5APFA 1IWUA 1IC7Y 1DI5A 1NWGA 1UCOA 1XGUC 3CSQA 1AM7A 1GE1A 1UBZA 1IEEA 5KXWA 3LYZA 1HEMA 2Z12A 1CKGA 2BQIA 1JEFA 4UWUA 1IOSA 1HFYA 3WU8A 4IJ4A 1E8LA 1LJ4A 3G3BB 1OUIA 1IP6A 1LSDA 1C46A 3M3UA 4EOFA 1J1PY 2D6BA 2LYZA 193LA 1JITA 1FLWA 2Z39A 4ETEA 3TXGA 1LMQA 2BQKA 3AB6A 1WQOA 4HPIA 4CFPA 3WXTA 3AW7A 5APDA 3WPJA 1GD6A 3RZ4A 1LTMA 3A93A 4H8XA 1LZBA 1XGQC 1LZRA 1CNSA 1UIHA 1LHMA 1VDSA 2XJWA 1INUA 4OWCA 1T6VL 4LT2A 4BAFA 4HSFA 5B07A 4B4JA 1B7QA 1B5YA 1OUAA 3B6LA 3OK0A 5FSTA 5LVKA 4DDBA 4PRUA 3WUNA 1LSNA 4ETDA 1NDGC 1LJGA 1EQ5A 1JTTL 2DQJY 5IHGA 2DQDY 5HQ1A 1GE4A 1GF0A 3GXKA 4XJHA 1B7MA 3HBHA 1DXJA 4QGZA 1HERA 1JKCA 1JHLA 1WQRA 2BPUA 1JKAA 3EBAB 4DDCA 4LZTA 1BB4A 2PC2A 1UICA 1LZAA 1KXWA 1HF4A 1JTPL 1LZCA 1IP7A 5D5CA 1ZVHL 2YBLA 1B5ZA 5APEA 3T6UA 5F81A 1GAYA 4H1PA 4H90A 4MR1A 2BQDA 4CFOA 1NQIA 4GCDA 1Z55A 3A91A 3LYOA 4OWHA 1FKVA 1J1OY 1V7SA 4HJZA 5HMJA 4Z46A 1BWHA 1GFUA 1LPIA 1OUDA 1XEIA 5KXPA 4QY9A 4MSTA 4DD9A 1LHJA 5KJ9A 1GDXA 4H92A 4ML7A 1IWZA 1HEWA 5KKJA 1LMOA 1GFAA 1GB9A 1LSEA 3HFMY 4G4BA 2BQLA 4J1BA 4KXIA 4W94A 1IC5Y 1XGRC 1B7LA 1UACY 4B4EA 4PJ2C 2LZTA 1OP9B 1G7JC 1YKZX 2W1LA 1ALCA 3A96A 3WH1A 1GF3A 1VDTA 4UWNA 1G7LC 1GFJA 2I25L 2YBJA 1YL0X 1GFEA 2YDGA 4WLYA 1GFRA 4NGIA 4XJGA 2GV0A 3ZEKA 1IOQA 4HTQA 1HENA 1WVVA 4NY5A 5LINA 3AZ5A 1G7HC 1BGIA 4G4HA 4I0CA 3WW5A 1LSBA 3WMKA 1QSWA 1KXYA 1TCYA 3LYTA 4N5RA 9LYZA 1LSAA 1JSEA 1LZ8A 1GB6A 4TX7A 4N9RA 4WM5A 4OW1A 4W96A 3AZ4A 3AGIA 3KAMA 5LYZA 4HTKA 2HEDA 4NSGA 1CJ6A 3P64A 3WXUA 3QNGA 1VDQA 1B7SA 1LZ6A 4WL6A 1YL1X 8LYZA 2F2NA 1LZGA 2HU3A 5A3ZA 4NWEA 1IY4A 1LMTA 2YSSC 4OWBA 1IX0A 5LYTA 4PHIA 3J6KA 4TTDA 4NIJA 2ZIJA 1JJ3A 5LA8A 1HFZA 4NHIA 5KXTA 5KXXA 2MEDA 5I4WA 3A6BY 5F14A 1BQLY 2MEHA 1FKQA 1GBSA 1B7PA 2D4JA 1QIOA 2DBTA 2Z19A 2MEIA 2YBNA 5LAFA 1GFGA 1LYOA 1AKIA 5HLLA 1NMMA 5LVHA 4PRQA 1GEVA 1LMPA 3TXJA 2NWDX 1I56A 1LSYA 1H6MA 1JJ1A 2I26L 2LZ2A 3AZ6A 4ZFPA 1EQ4A 1UC0A 7LYZA 5I54A 1JISA 2BQFA 1GF7A 1B5WA 4B49A 1LKRA 3K3TA 3M18B 4H9FA 1C7PA 4XJDA 2BLYA 4IASA 4LYCA 1MELL 1A4VA 1HELA 4NGOA 4DC4A 5KXNA 1LSCA 4H9AA 4HP0A 1WTNA 4WLXA 1GF4A 4Z98A 4TUNA 1GXV2 4DD7A 1B5XA 5DL9A 1T3PA 3TXBA 4AGAA 1BVXA 1F6SA 2A7DA 5KXLA 4B4IA 3IWRA 5L3IA 2EIZC 4GN5C 4NHTA 1B7OA 1OUJA 1GFKA 4E3UA 2MEGA 132LA 1NHEA 5IDDA 4BAPA 1OUGA 3BKHA 5B1FA 5LXWA 1OQMA 5LVGA 2ZYCA 2Z2FA 1LZ1A 3A6CY 5AMYA 3RNXA 1OUBA 4DD1A 4WOAA 6LYTA 1JPOA 1HHLA 1I1ZA 2F30A 3B72A 4LGKA 5LVJA 4UWVA 1VATA 4LYOA 1CJ8A 1TAYA 4NSHA 3A95A 3CSZA 2MEFA 1BVKC 2FBBA 4LT1A 1YANA 4XJIA 4NFVA 1QSAA 208LA 3OJPA 4G9SA 1D0MA 4N0JA 4NG1A 3N9AA 1LMAA 1QDRA 5B1GA 4ANRA 5T3FA 4ETBA 1FN5A 1LSFA 1IIZA 2Z18A 3FI7A 1QTEA 1ZV5L 4LYTA 2BAAA 2ZNWY 2DQFC 1IP2A 2ZQ3A 2ZIKA 4NG8A 3ATNA 3W6CA 4RW2A 1C43A 1P2CC 3E3DA 3QE8A 3ULRA 2ZYPA 1HC0A 1N4FA 5F9UA 5KXKA 1GE3A 1QUSA 1LJKA 1UIFA 5FEKA 3SP3A 1CKHA 1GF5A 5FCPA 1AT5A 6LYZA 1GDWA 4X3BA 4CGEA 2IHLA 1B0DA 1LHIA 1NF5A 2HTXA 4Z3MA 4YF2A 5I4XA 5LYMA 4RDSA 3LHMA 4OWAA 1YAMA 207LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LJFA 1GBYA 3CSRA 1T8GA 2EQLA 4NSJA 5C6IA 1KIPC 1DYEA 1GFVA 1IWYA 3V2YA 2W1MA 176LA 1GFHA 1XEJA 4NHQA 1C6DA 1B5UA 1GAZA 1JQUA 2DQGY 5I4YA 4W56A 3RU5A 4R0FA 1LJEA 5K7OA 1QUTA 4HV2A 3W6BA 2XBRA 4ARPA 2F4GA 1J1XY 3G3XA 2FBDA 1L40A 1T8FA 4B0DA 108LA 248LA 4P2EA 1LSZA 1L14A 4YM8A 1KW7A 2AUBA 1L00A 1W08A 200LA 3VWOA 4N1CC 198LA 1CKCA 1C6CA 5KKIA 1P5CA 2H5ZA 2B74A 2B6XA 181LA 1C10A 1CV6A 225LA 1IO5A 1C45A 2G4PA 1B5VA 3HBEX 5F16A 3OE0A 2BQBA 1BB3A 3BKVA 4I7LA 2Y8PA 1YILA 4GLAA 1BWJA 1DPXA 1ZURA 1JJ0A 1L06A 3GXRA 148LE 1L01A 2MEEA 2Z37A 1UIBA 114LA 1ZVYB 4HV1A 4GCBA 4WM1A 4WO9A 1L90A 3WYHA 1CTWA 2A4TA 1LOZA 164LA 2W1YA 2WARA 3C7WA 1AZFA 1EQEA 3G3AB 3A34A 1D6QA 1GE0A 5ILFA 1G7IC 1L10A 1XFPL 1GB0A 1L93A 1GWDA 242LA 3HTDA 2QB0B 144LA 1P46A 1SSWA 128LA 4NGLA 4L41A 125LA 1BB6A 5FHWA 1L56A 2B5ZA 1GBXA 1QT8A 1L19A 3IJUA 5LAGA 4ZEEA 1DYFA 4LT0A 187LA 1QDTA 5B59A 5KXOA 3W3EA 4FJRA 2RBOA 4H91A 4PPOA 199LA 170LA 2F2QA 1XSFA 1YAPA 1DKKA 4WM4A 5ILCA 137LA 3LYMA 3WUMA 1WQPA 1L47A 4H94A 2BQEA 1REZA 259LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1IP1 A;  1CJ7 A;  1LJF A;  1GBY A;  3CSR A;  1RCM A;  2YBI A;  4GCE A;  153L A;  4TSC A;  2EQL A;  4NSJ A;  5C6I A;  4M6D A;  3LZT A;  3MGW A;  1IR8 A;  1KIP C;  3A3Q A;  4H9E A;  4WG1 A;  3TXK A;  5HNC A;  1REY A;  4H9C A;  1GFV A;  4CHX A;  1IWY A;  2FYD A;  4G49 A;  1LZD A;  1IOC A;  2W1M A;  4HJV A;  3RT5 X;  1GFH A;  4TWS A;  2F4A A;  1LKS A;  4HPE A;  4MCK A;  1XEJ A;  1KIQ C;  1LJ3 A;  4NHQ A;  2BQG A;  3TMU A;  5E9R A;  3WPL A;  4KPM A;  1B5U A;  1GAZ A;  3ATO A;  4H8Y A;  4LFX A;  1CKD A;  1JKD A;  1OUE A;  1YRO A;  2DQG Y;  5I4Y A;  2D4I A;  1GB7 A;  1VED A;  4R0F A;  1SLY A;  3RU5 A;  4DWX A;  5L9J A;  1LJE A;  1LSM A;  3A94 A;  1HFX A;  4NHS A;  1QUT A;  2HUB A;  2LYO A;  1IP4 A;  3AZ7 A;  4NSI A;  5K7O A;  4HV2 A;  4QDN A;  4KL7 A;  4TSB A;  1IR9 A;  2XBR A;  3B0K A;  3W6B A;  154L A;  2F4G A;  5KXM A;  1J1X Y;  3WL2 A;  5LVI A;  1LZN A;  2ZNX Y;  2X0A A;  4RLM A;  2FBD A;  1NDM C;  1LZ5 A;  5KXS A;  4B0D A;  1HMK A;  2CDS A;  1YIK A;  1ZMY L;  1A2Y C;  1LHH A;  1O23 A;  1VAU A; 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 1MEL L;  1A4V A;  1HEL A;  4NGO A;  4DC4 A;  5KXN A;  1LSC A;  4H9A A;  4HP0 A;  1WTN A;  4WLX A;  1GF4 A;  4Z98 A;  4TUN A;  1GXV 2;  4DD7 A;  1B5X A;  5DL9 A;  1T3P A;  3TXB A;  4AGA A;  1BVX A;  1F6S A;  2A7D A;  5KXL A;  4B4I A;  3IWR A;  5L3I A;  2EIZ C;  4GN5 C;  4NHT A;  1B7O A;  1OUJ A;  1GFK A;  4E3U A;  2MEG A;  132L A;  1NHE A;  5IDD A;  4BAP A;  1OUG A;  3BKH A;  5B1F A;  5LXW A;  1OQM A;  5LVG A;  2ZYC A;  2Z2F A;  1LZ1 A;  3A6C Y;  5AMY A;  3RNX A;  1OUB A;  4DD1 A;  4WOA A;  6LYT A;  1JPO A;  1HHL A;  1I1Z A;  2F30 A;  3B72 A;  4LGK A;  5LVJ A;  4UWV A;  1VAT A;  4LYO A;  1CJ8 A;  1TAY A;  4NSH A;  3A95 A;  3CSZ A;  2MEF A;  1BVK C;  2FBB A;  4LT1 A;  1YAN A;  4XJI A;  4NFV A;  1QSA A;  208L A;  3OJP A;  4G9S A;  1D0M A;  4N0J A;  4NG1 A;  3N9A A;  1LMA A;  1QDR A;  5B1G A;  4ANR A;  5T3F A;  4ETB A;  1FN5 A;  1LSF A;  1IIZ A;  2Z18 A;  3FI7 A;  1QTE A;  1ZV5 L;  4LYT A;  2BAA A;  2ZNW Y;  2DQF C;  1IP2 A;  2ZQ3 A;  2ZIK A;  4NG8 A;  3ATN A;  3W6C A;  4RW2 A;  1C43 A;  1P2C C; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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