2IHLA

Lysozyme (e.c.3.2.1.17) (japanese quail)
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVYGRCELAAAMKRHGLDKYQGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDVHGMNAWVAWRNRCKGTDVNAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Three-dimensional structure of a heteroclitic antigen-antibody cross-reaction complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords JAPANESE QUAIL EGG WHITE LYSOZYME
molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
source organism Coturnix japonica
total genus 46
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1993-06-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2ihlA00
3AW7A 4GCEA 1N4FA 4NSIA 1LHJA 1UIDA 1UIGA 4H9FA 4LYTA 1IP2A 1O23A 3G3AB 4UWUA 1AM7A 5KXKA 1GB9A 1XGTC 1OUDA 2BQCA 4KPMA 4M6DA 4I0CA 3RU5A 5B06A 1PS5A 1JKBA 3M18B 3GXRA 1IX0A 1IY4A 4XYYA 2YSSC 4WM6A 3WXUA 1B7PA 1VDTA 5KKJA 193LA 1HSXA 4DDCA 1LOZA 1B5WA 3WU8A 1BQLY 4GLAA 4BS7A 4GCFA 2MEBA 1LZ1A 1WVVA 4NG8A 4DDBA 4NGVA 5KXYA 2YBJA 3TMUA 1G7LC 134LA 1TEWA 1IP7A 1DI4A 1FLUA 2BLYA 3GXKA 4XJFA 4LT3A 4TUNA 4LFXA 4HV2A 3A91A 2WARA 3W3EA 4DYGA 4IASA 4TWSA 4PPOA 1LSDA 2A7FA 1XGQC 5B05A 2ZYCA 4GN5C 1OQMA 2FYCA 3WW6A 1NDGC 1NHEA 5I4WA 3B0KA 1XEJA 1AKIA 2N5ZA 4WLDA 1LJNA 2DQAA 5HNCA 1UACY 4KL7A 3SP3A 5D5FA 1LKRA 4YM8A 4CGEA 1IC4Y 4O34A 4BAPA 4NG1A 1G7HC 2LZTA 1BHZA 4H9EA 4FJRA 2ZNXY 1WQQA 1HFZA 2HU1A 4NGKA 5KXXA 1RJCB 4H92A 4H91A 1GF5A 1CKGA 1LMCA 4X3BA 1LJKA 4MSTA 4EOFA 4LT2A 1J1OY 1IWYA 3ATOA 5L3IA 2YBNA 3A96A 4NHTA 1WQNA 1EQEA 1GFEA 4ETAA 2DQJY 1B7MA 3AGIA 1JWRA 4RW2A 1LZCA 1G7MC 1GB0A 3B6LA 4HSFA 5I54A 2Y8PA 5KY1A 1GB7A 2BLXA 5F81A 3AZ7A 2FYDA 1XEIA 1SQ2L 2C8PA 133LA 1IR7A 3A93A 1LYSA 2F4AA 4KT3A 1QUTA 1B7OA 4LGKA 5FCPA 1A2YC 3LYMA 1GXV2 1F10A 1I56A 4LYCA 3EMSA 4ZEEA 5L3HA 132LA 1FLYA 2DQDY 1JJ1A 1PZYA 2G4QA 1G7JC 4NGOA 4J1BA 4LYOA 2BQIA 3K3TA 1RI8B 1BB5A 4D9ZA 1XGUC 1GF4A 3MGWA 5F9XA 2W1MA 2C8OA 154LA 1IOCA 2HUBA 1W08A 1LZEA 1YAPA 4RW1A 3WPJA 1TAYA 2B5ZA 2Z18A 1JISA 1F6SA 5AMYA 4G4CA 3WU7A 1HENA 5F14A 1UIEA 1UCOA 3W6FA 1IIZA 1HNLA 2BQLA 1NF5A 1B7RA 2ZIJA 3CT0A 4MCKA 3LZTA 3VWOA 1I1ZA 2HECA 3ZEKA 2Z38A 3A8ZA 4H9CA 4HTKA 1WQMA 1LZNA 1UIHA 2MECA 3CB7A 3LN2A 2LZ2A 3B0OA 4GCCA 1GBYA 4ET9A 3HBDA 1LZTA 1HEMA 1W6ZA 4OW1A 1SLYA 4H8ZA 9LYZA 1C46A 1V7SA 1LZ8A 5ILCA 4B4IA 2RSCA 3IJVA 1IC7Y 4CFPA 1DQJC 4TSCA 1GF0A 3WPKA 1LJHA 1LSCA 5KXRA 1GF3A 1OUHA 2HTXA 1IORA 1CJ6A 4NHPA 4N8ZA 3TMXA 1GB6A 1REYA 3ZVQB 2HEFA 4ETDA 3WW5A 4B4JA 1GAYA 4YEOA 1DPWA 1ZMYL 3AYQA 1HEWA 3WMKA 3LYZA 4I8SA 3HBHA 3AW6A 1GE2A 1LZYA 1B7SA 1GFTA 1OUCA 4NGJA 4NFVA 4NGZA 1LSFA 4QEQA 1UIFA 4DD0A 1JKCA 5LXWA 1LYZA 5I53A 5LA5A 4CJ2A 5LVKA 1UICA 3WPLA 1HFXA 1CJ7A 4WG7A 4EMNA 3A94A 1GE0A 1FKVA 1HEQA 1ZV5L 5APFA 5FELA 1RE2A 4H9IA 4NGIA 1LYYA 1GF8A 1KIRC 2XTHA 2I26L 1HEOA 1JPOA 2BQMA 3BKHA 4N9RA 1B7NA 3OK0A 1JUGA 4Z98A 4WG1A 2DQFC 1IP5A 4W96A 2DBTA 2W1YA 1HMKA 2ZIKA 1I20A 4GN3A 2BQFA 4HPIA 1LJJA 4NGLA 5APDA 3J6KA 1BB6A 1NBZC 1VAUA 5APEA 2EIZC 2YBHA 5J7CA 2HEDA 1RCMA 4BADA 1GF9A 1GE4A 1NMMA 2XJWA 2H9JA 1T6VL 4OOTA 4G4HA 2MEFA 5T3FA 1IP3A 1LJFA 3RW8A 4LT1A 1YL1X 3A6CY 2D91A 3A67Y 6LYZA 3RT5X 2ZYPA 2DQIY 2HEAA 1KXWA 1XSFA 3RNXA 1REZA 3HFMY 4ANRA 4G4BA 1BGIA 1CJ9A 1GFAA 1HSWA 1VEDA 2MEAA 1B5YA 3D3DA 5KXSA 1IWWA 1LZSA 1IEEA 3WYHA 1LSEA 4NSJA 4PGJB 3N9AA 1ZVHL 1WTNA 4TTDA 1GEZA 3A34A 1GFJA 5KXZA 1BWIA 4LYBA 4OOOA 1WQRA 3TXKA 1HMLA 2LYOA 4W94A 1XEKA 1REXA 2DQHY 4LYZA 1LJEA 1EQ4A 1LSMA 3FE0A 4QY9A 5LAFA 4NHQA 2F4GA 4Z3MA 1KIPC 2D4JA 3T6UA 1FDLY 1J1PY 3J4GA 4DD9A 3B72A 1GBOA 1UA6Y 2Z37A 1DI5A 2BQGA 2XBRA 1YKZX 3P68A 1NKHA 4PHIA 1GBWA 4NHIA 5HMJA 5KXPA 1GE3A 1WVUA 3LHMA 1GXXA 1LMTA 5B07A 4DDAA 2BQJA 1VDSA 4H9BA 5K7OA 2CDSA 2PC2A 1LMQA 4WO9A 1LJ3A 1QQYA 4DD3A 3QY4A 2DKVA 3CSQA 1XGPC 4DWXA 1B9OA 1AZFA 1YAMA 1HFYA 1IO5A 1HELA 1C43A 1LHKA 4LFPA 1GFHA 1J1XY 4HJZA 1B7QA 3WULA 2CGIA 3W6CA 1LTMA 1NDMC 1VATA 1IOQA 1QTEA 4AGAA 4ZFPA 3CSZA 1D6QA 1HF4A 207LA 3A3RX 3W6EA 4Z46A 3WH1A 3HBEX 1ALCA 4NGYA 4OWAA 2BQBA 2XBSA 5KXTA 1IWZA 1UIBA 1D6PA 135LA 2BPUA 1GF6A 4FDYA 4WO6A 4N1CC 4RDSA 3TMVA 3WL2A 1E8LA 3WU9A 1V7TA 4WM4A 1EQ5A 1JTOL 4TX7A 1IOSA 3WVYA 1GWDA 2DQEY 2LYZA 1GD6A 1LHHA 1LZDA 1GDWA 1B0DA 3TXBA 1GB3A 3TMWA 4ETBA 1GFKA 1NBYC 1YAQA 2EPEA 4NWHA 3RZ4A 1TBYA 1LSBA 1LZAA 5LYZA 2BQKA 3CQLA 1LZ4A 4OWEA 4DD7A 2I25L 3P66A 4WL6A 1JHLA 1LHMA 1LJGA 5B1GA 4B0DA 5KXLA 3TXEA 2HU3A 1IWTA 4QGZA 2H9KA 3TXHA 5C6JA 1NWGA 1VDPA 3LZ2A 2A7DA 4HJVA 1JJ0A 1KXYA 3EO5A 4L41A 1OUBA 4WM2A 5II3A 2Z2FA 2ZNWY 2DQCY 1OUEA 5FSTA 4A7DA 4UWVA 2ZWBA 5E4PA 3WVXA 4H8YA 3B0IA 1XGRC 1JITA 2GV0A 5B1FA 4DD1A 4AXTA 5KXWA 4M4OA 4HPEA 3TXIA 5C6LA 3D9AC 1OUAA 5LVGA 2D6BA 4ET8A 1HC0A 5DM9A 1H6MA 4NY5A 1CKHA 1QSAA 1UIAA 2Z39A 4NGWA 4WM5A 4PRQA 4H1PA 1AT6A 3KAMA 1TDYA 1D9UA 3A92A 3AGHA 5A3ZA 4DC4A 4II8A 1CNSA 2MEEA 5LVJA 4UWNA 3EBAB 2HEEA 5LYTA 3IWRA 4KXIA 3A6BY 3TXGA 5A3EA 1JTPL 2YBLA 4IJ4A 1FLWA 1JKAA 5KXNA 1JSFA 1HERA 4HTNA 5KXOA 1LZBA 2MEDA 3LYTA 2I6ZA 2YBMA 1OP9B 1QSWA 4H9HA 4YENA 2W1XA 5APCA 4ETEA 1GBSA 1LSZA 5HLLA 5EBHA 3AGGG 4H90A 4N5RA 1GBXA 2CWIA 4HJYA 1EL1A 1TCYA 2BQEA 2YVBA 4N0JA 1JEFA 1YL0X 4OWCA 1UC0A 1IR8A 3QNGA 5ILFA 4YEMA 1YROA 1C10A 4WLXA 4G9SA 5DL9A 3AB6A 5HNLA 1BB3A 1JIYA 1GHLA 1D0KA 1OUIA 1OUGA 2AUBA 2F30A 1GB5A 1T3PA 1IVMA 2Z19A 4HP0A 1YIKA 1LMOA 1LZ9A 2IHLA 2LYMA 4YF2A 4C3WA 1C7PA 1LSPA 2DQGY 2LHMA 3ATNA 1HHLA 1FBIX 1ZVYB 2Z2EA 4XJHA 194LA 3LYOA 1GFUA 2BQNA 3OJPA 1LJ4A 1GFVA 1LJIA 3ZVQA 3TXJA 5KXMA 1LMPA 4H9AA 4OWBA 1IWUA 1GAZA 5FHWA 4MR1A 4XJDA 7LYZA 1LSGA 1GBZA 4ETCA 3T36A 1GB8A 4LYMA 4TSBA 2MEGA 5DN5A 8LYZA 1C08C 5KJ9A 5LVIA 5E9RA 1LZRA 1CKFA 4H93A 2G4PA 5IDDA 5LINA 1GDXA 4NSGA 1IC5Y 1YILA 4NEBA 4XJIA 2Z12A 4J0LA 1IP6A 4GCBA 4PJ2C 4IATA 5F16A 5LVHA 1FN5A 4NWEA 4E3UA 1LZ5A 2BQAA 1H87A 4HTQA 4WL7A 2VB1A 4B1AA 1YAOA 1DKJA 4BAFA 1QDRA 2X0AA 4GCDA 4OWHA 1LMNA 1B5VA 4DT3A 4XJBA 5I4YA 3IJUA 2IFFY 4H8XA 3CSRA 4WM1A 1DZBX 5IELA 2ZQ3A 3BKVA 3W6DA 1LCNA 4LZTA 4B49A 5HQ1A 1MLCE 1CJ8A 4WLYA 4HV1A 1YKYX 1GB2A 2BQHA 1DXJA 1B2KA 2D4IA 5KKIA 1WTMA 1F0WA 1Z55A 3AJNA 3FI7A 1KIQC 4CFOA 1REMA 3A95A 1DKKA 4XN6A 1G7IC 1WQOA 1BB7A 1NQIA 3TXDA 1QUSA 4GN4A 4R0FA 5FDJA 5F9UA 4B4EA 4R6CA 1VFBC 2BAAA 1JJ3A 3A3QA 1JSEA 1LYOA 2YBIA 1IR9A 2MEIA 2FBDA 2NWDX 1GE1A 4NIJA 5I5QA 5DLAA 2EQLA 4N1EI 1LSAA 1LAAA 4WMGA 3A90A 1LPIA 1QIOA 1D0MA 1VDQA 4J7VA 2ZILA 4H94A 1BB4A 1D0LA 1LZ6A 3N9EA 2BQOA 4XADA 2Q0MX 1IY3A 4WLTA 1B5UA 1BVXA 2HEBA 2G4NA 208LA 5FEKA 1OUFA 1RFPA 2H5ZA 4NSHA 4YOPA 1B5ZA 4P2EA 1B5XA 1C45A 5D5CA 4ZIXA 1GF7A 1LSNA 1IP4A 3P65A 3WUNA 1CKCA 3N9CA 5I4XA 1IOTA 4RLNA 1MELL 3QE8A 1OUJA 1GEVA 3WUMA 1INUA 1YKXX 3TXFA 3ULRA 2F2NA 5L9JA 2D4KA 4GLVA 1DI3A 4NHSA 5HMVA 4WOAA 153LA 3AZ4A 1GFRA 1CKDA 4XENA 1LMAA 4XJGA 4C5FA 1IWXA 1FKQA 1LZGA 3M3UA 4QDNA 5M1YA 1P2CC 1LHLA 4PRUA 3WXTA 6LYTA 1UUZC 4G49A 1JTTL 1LHIA 1DPXA 3CT5A 4DD2A 1B7LA 4RLMA 3CT1A 4LT0A 1LSYA 3E3DA 2W1LA 1F6RA 3WUAA 1YQVY 1XFPL 4ML7A 3AZ5A 1YANA 2YDGA 5LA8A 1AT5A 3W6BA 5JENB 1HEPA 1IP1A 2EKSC 1GFGA 3EXDA 2CJLA 5DN4A 4CHXA 1UBZA 2FBBA 1BWHA 1GPQC 5LIOA 5B59A 1BVKC 1IWVA 2ZQ4A 3W6AA 1QTKA 1WQPA 4Z41A 1KXXA 5LAGA 1QDTA 1JKDA 3F6ZA 2MEHA 5C6IA 5IHGA 5LYMA 2BQDA 3AZ6A 3P64A 1FLQA 3P4ZA 3G3BB 4U3XB 4WM3A 1A4VA 1LKSA 4J1AA 1BWJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LHJA 1L98A 4UWUA 4KPMA 4I0CA 4XYYA 255LA 201LA 1CU2A 4WM6A 3WXUA 193LA 236LA 4DDCA 4I7NA 1B5WA 3RUNA 1C6BA 4BS7A 4DAJA 4NGVA 5KXYA 3DN3A 2YBJA 1G7LC 1TEWA 1L19A 1C6EA 3W3EA 4DYGA 128LA 260LA 3GUOA 1NDGC 5I4WA 3C7ZA 2N5ZA 4WLDA 1L49A 178LA 1LGXA 5D5FA 4O34A 4BAPA 2LZTA 3HT9A 2ZNXY 2HU1A 5KXXA 4YXAC 4H91A 1LMCA 4E97A 1J1OY 1IWYA 3A96A 1WQNA 1EQEA 231LA 176LA 1C6IA 3GUPA 1L72A 1G7MC 4HSFA 2B75A 1ZWNA 5KY1A 1IR7A 1LYSA 1A2YC 2O4WA 1GXV2 3LYMA 4ZEEA 5L3HA 132LA 1JJ1A 1PZYA 1LYIA 4NGOA 1L85A 140LA 4LYOA 2BQIA 3DN0A 4DJHA 2A4TA 4I7TA 3MGWA 113LA 2C8OA 1L68A 253LA 1IOCA 154LA 1LZEA 5AMYA 4EKSA 3W6FA 1PQKA 4YEMA 3LZTA 2Z38A 3A8ZA 3HTBA 4HTKA 3OE8A 1LZNA 2MECA 1L96A 2O7AA 3B0OA 1L88A 4GCCA 2RBSA 1LZTA 2HUKA 3C80A 1LYJA 1L73A 1QTCA 2RSCA 1DQJC 3FA0A 3DNAA 1GB6A 1L48A 1L95A 3AYQA 3LYZA 234LA 4NFVA 4DD0A 5LXWA 227LA 2RBQA 1G1VA 4CJ2A 2O79A 3PDSA 2BQMA 3OK0A 1JUGA 2DQFC 4W96A 2W1YA 1I20A 258LA 4HPIA 2BQFA 3J6KA 197LA 226LA 4G4HA 3RW8A 1G1WA 1KXWA 3RNXA 1L42A 1CV4A 3HFMY 143LA 1C6JA 4ANRA 1HSWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3AW7 A;  4GCE A;  1N4F A;  4NSI A;  1LHJ A;  1UID A;  1UIG A;  4H9F A;  4LYT A;  1IP2 A;  1O23 A;  3G3A B;  4UWU A;  1AM7 A;  5KXK A;  1GB9 A;  1XGT C;  1OUD A;  2BQC A;  4KPM A;  4M6D A;  4I0C A;  3RU5 A;  5B06 A;  1PS5 A;  1JKB A;  3M18 B;  3GXR A;  1IX0 A;  1IY4 A;  4XYY A;  2YSS C;  4WM6 A;  3WXU A;  1B7P A;  1VDT A;  5KKJ A;  193L A;  1HSX A;  4DDC A;  1LOZ A;  1B5W A;  3WU8 A;  1BQL Y;  4GLA A;  4BS7 A;  4GCF A;  2MEB A;  1LZ1 A;  1WVV A;  4NG8 A;  4DDB A;  4NGV A;  5KXY A;  2YBJ A;  3TMU A;  1G7L C;  134L A;  1TEW A;  1IP7 A;  1DI4 A;  1FLU A;  2BLY A;  3GXK A;  4XJF A;  4LT3 A;  4TUN A;  4LFX A;  4HV2 A;  3A91 A;  2WAR A;  3W3E A;  4DYG A;  4IAS A;  4TWS A;  4PPO A;  1LSD A;  2A7F A;  1XGQ C;  5B05 A;  2ZYC A;  4GN5 C;  1OQM A;  2FYC A;  3WW6 A;  1NDG C;  1NHE A;  5I4W A;  3B0K A;  1XEJ A;  1AKI A;  2N5Z A;  4WLD A;  1LJN A;  2DQA A;  5HNC A;  1UAC Y;  4KL7 A;  3SP3 A;  5D5F A;  1LKR A;  4YM8 A;  4CGE A;  1IC4 Y;  4O34 A;  4BAP A;  4NG1 A;  1G7H C;  2LZT A;  1BHZ A;  4H9E A;  4FJR A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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