2IHLA

Lysozyme (e.c.3.2.1.17) (japanese quail)
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVYGRCELAAAMKRHGLDKYQGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDVHGMNAWVAWRNRCKGTDVNAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
molecule keywords JAPANESE QUAIL EGG WHITE LYSOZYME
publication title Three-dimensional structure of a heteroclitic antigen-antibody cross-reaction complex.
pubmed doi rcsb
source organism Coturnix japonica
total genus 46
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1993-06-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2ihlA00
1JPOA 1LZDA 4OW1A 3TMXA 1LZRA 1NDMC 5HQ1A 3P65A 1JUGA 1IWYA 2BLYA 2HEDA 4H9BA 1INUA 1FLYA 1IO5A 1GB7A 3FI7A 5KJ9A 4YM8A 133LA 1LSFA 1WQQA 1LHJA 1GBXA 1BHZA 5IELA 1GEZA 1A4VA 4CFOA 1KXXA 3BKHA 1RE2A 4NWHA 4NSJA 1UIFA 5AMYA 2CJLA 4WMGA 1LJEA 5I4WA 4NGKA 1B7LA 1GE0A 1I56A 1FKQA 3B0KA 4L41A 1IVMA 1XGPC 2F4AA 4EMNA 1CJ8A 5LVKA 1XEKA 3AW7A 1RFPA 3WXUA 1DXJA 5KXXA 2HEBA 1G7LC 1GF4A 2EPEA 2EIZC 5E9RA 4GCEA 1IP4A 1LHKA 4H8YA 1XGTC 2F2NA 1UIEA 4NGLA 4ML7A 1LKSA 1FN5A 4ETCA 1LMPA 1IY4A 2BQCA 2D4IA 3LZ2A 1YROA 4RW2A 5I53A 5T3FA 3WH1A 1YILA 1IP1A 1IY3A 4DYGA 2DQGY 2X0AA 1LHHA 5KY1A 3WU8A 4OOOA 1DPWA 1JKCA 2DQEY 4XYYA 2D6BA 3G3BB 2D91A 2GV0A 4BAPA 1GXXA 3IWRA 1KIRC 1RCMA 4PPOA 2B5ZA 4H91A 4LYMA 4TUNA 1WQOA 2DQFC 2NWDX 1TCYA 4KT3A 5C6IA 5LVGA 3CB7A 1IWVA 2H9JA 4OWCA 3WUAA 4B49A 3ATOA 4GCDA 4DD1A 2BQOA 4N0JA 3ZVQB 1UIBA 2W1XA 4HTNA 1NQIA 5FELA 1OUDA 1BWJA 1GHLA 207LA 4KPMA 4GN4A 4NY5A 1SLYA 1IWUA 1B5VA 2MECA 4LGKA 4HJZA 2Z19A 3HFMY 4DDBA 2ZNXY 5HLLA 1JIYA 4ETEA 4H90A 7LYZA 1LMNA 5LVHA 2BQBA 3QY4A 5A3ZA 4DWXA 1HC0A 1J1OY 2BAAA 1UIDA 1FLQA 4H94A 3WW5A 4QDNA 4W94A 2CWIA 1IWWA 4R6CA 4I0CA 4OWHA 1EQ5A 1QSAA 1GF0A 1C10A 4HPEA 4TTDA 5L3IA 5M1YA 1IP5A 1HSXA 4NHSA 1A2YC 1BWHA 2W1LA 4AXTA 5APFA 1CKFA 1GWDA 1GFEA 2G4PA 2YBNA 3N9EA 3LYOA 2VB1A 4MCKA 1JJ0A 4NIJA 4NHIA 4ETBA 1WVUA 2Z2EA 3LHMA 4RLMA 1DKKA 3RT5X 4G4CA 1WQMA 2ZYPA 4YEOA 1IWXA 1H87A 1N4FA 1JITA 1IX0A 2IFFY 4G4HA 2RSCA 1BB5A 5KXWA 1ZVHL 4UWUA 1P2CC 1XFPL 2YBLA 4NSGA 5EBHA 1WQRA 1XEJA 4H9FA 2HUBA 5FHWA 4WL6A 1IP7A 3D3DA 2IHLA 1YAQA 3AZ7A 1ZVYB 3WU7A 1KXWA 4WOAA 1OUCA 1GXV2 4XN6A 1B5XA 1F0WA 2BQLA 2Z38A 4DDAA 1IOCA 3BKVA 1J1XY 4TSCA 4FDYA 2Z39A 1OUEA 2FBBA 4CHXA 3FE0A 3TXGA 4NHQA 5IDDA 1BVKC 1LSPA 3TMUA 1LMAA 2A7DA 1HFZA 3WPLA 4C3WA 5K7OA 1GD6A 1W6ZA 4WLTA 1HF4A 1HEOA 3WPJA 4ETAA 4HJYA 4G49A 3A3RX 5B06A 1YAOA 4PJ2C 1YANA 3RZ4A 1NWGA 1UIAA 4HPIA 3GXKA 4XJHA 2A7FA 4OWBA 4IJ4A 4IATA 5APEA 4WO6A 4CFPA 1DI5A 2BQJA 5KKIA 4XJBA 1AT6A 1AKIA 4DD7A 1YAPA 1LMTA 1GEVA 1LZ1A 4ANRA 1GF7A 2DQHY 5DL9A 3WVXA 4YEMA 5KXRA 1GF3A 5KXMA 3A93A 5ILCA 1LJHA 3D9AC 1LZEA 2Z12A 4G9SA 2N5ZA 3WPKA 1XGQC 4UWNA 4WLXA 5I5QA 3WW6A 5B59A 5F14A 1LSDA 4Z41A 3EXDA 1ZMYL 1AT5A 1YAMA 5HNLA 1B7RA 1GAZA 1LJNA 2F4GA 4ZIXA 1D0LA 1NF5A 1TAYA 2DQAA 1GFRA 1QDTA 1OUHA 1GBOA 3A96A 2ZQ3A 5B1FA 1F6RA 2XBRA 4NGVA 3W6CA 1QUTA 2LZ2A 2HEAA 2LZTA 2Q0MX 1JTOL 4P2EA 5LA5A 1IC5Y 3EBAB 4LYCA 2DBTA 4H9IA 1I20A 1IP2A 5FCPA 1HNLA 1JKBA 1QDRA 1JHLA 1VAUA 5F16A 4HTQA 4NGWA 4NG1A 3AZ4A 4NWEA 1GB6A 4XJIA 1LSEA 1HFXA 1LSCA 2DKVA 3CT0A 4XJFA 4J1BA 2MEDA 3CSRA 3EO5A 1XEIA 3CT5A 5ILFA 3LYTA 5FDJA 5DM9A 4OOTA 1XGUC 1JKDA 1DPXA 1JJ3A 1VATA 2MEAA 4H8ZA 9LYZA 1GBZA 4UWVA 4E3UA 1YL0X 5D5FA 1LZ4A 1JJ1A 1LZNA 1LOZA 208LA 1CNSA 4J1AA 3A6CY 3MGWA 1IWZA 1LPIA 1EL1A 1UC0A 4ETDA 2Z2FA 1DI4A 1GFGA 3B72A 5F81A 3WU9A 1B7NA 4U3XB 3E3DA 3WL2A 1LSYA 2G4NA 2LYOA 4DDCA 1B5ZA 1LZYA 1CJ9A 4GCCA 4N5RA 1UACY 3B6LA 4H1PA 1LMQA 2BQIA 2I6ZA 1IR7A 2DQDY 2ZYCA 4NGZA 2D4JA 5KXNA 5LIOA 4HV2A 1RI8B 3N9CA 194LA 2LYZA 2HU3A 2BQDA 2HEEA 3HBHA 1LZTA 1LZAA 1NBZC 1DQJC 3AZ5A 1MLCE 3LZTA 1TBYA 1BB4A 2W1YA 4I8SA 4NGYA 4RW1A 4WM1A 5DN5A 4AGAA 4DD3A 1HMKA 1IIZA 1GF9A 2FYCA 1UIGA 3AB6A 5LVIA 4TSBA 2EKSC 1LZ5A 1JSFA 3A34A 1B5UA 3AJNA 4LT1A 3A92A 2ZNWY 4B0DA 1OUAA 1C45A 1FKVA 1GF6A 3WVYA 4EOFA 1B7SA 1GB0A 1XSFA 4DT3A 4BS7A 1OUBA 2HECA 5C6LA 1B2KA 3RU5A 4LYOA 3CSZA 4DD0A 2H9KA 1IR9A 4NG8A 3P64A 4NHTA 1IP6A 1GE4A 4H9HA 4CJ2A 5L9JA 1YIKA 4RLNA 4YENA 153LA 1GF5A 4II8A 4XJDA 3LN2A 1FDLY 5KXYA 1CKGA 1LZSA 4TWSA 8LYZA 4YF2A 5HMVA 1CJ7A 4PGJB 4DC4A 1OUFA 5F9UA 1RJCB 5LYZA 1WQNA 4NEBA 1NKHA 4LYBA 4WLYA 3K3TA 5L3HA 2YBMA 3RNXA 1OUGA 4ZEEA 1BB3A 2I25L 3J4GA 1LJIA 1CKDA 3A95A 3AGHA 3P68A 4LT0A 4WM2A 1LJGA 3ATNA 4J0LA 1LMCA 2BQHA 1GE3A 3W6FA 1BQLY 4ET9A 5A3EA 1AZFA 2XBSA 2LYMA 4BADA 5B07A 4WO9A 1QSWA 2BQAA 5LA8A 1EQ4A 5HMJA 5J7CA 3WUNA 2F30A 4Z98A 5KXLA 1W08A 3IJVA 1PZYA 1QUSA 1LJ3A 4H9EA 1B0DA 1B7OA 1UCOA 2I26L 1WQPA 4WG7A 4QY9A 4A7DA 1GFVA 1REMA 3M3UA 2DQJY 3HBEX 1D6PA 1TDYA 3A91A 5LAGA 2LHMA 5JENB 1LSAA 1NDGC 1F6SA 1NBYC 3W6AA 2FBDA 2DQIY 4WL7A 5KXOA 1C08C 4HV1A 4HJVA 4DD2A 5I4XA 3W3EA 1TEWA 1D6QA 4H8XA 2G4QA 1V7SA 5II3A 4WM5A 6LYZA 3TMWA 3G3AB 3W6DA 4NHPA 1LSNA 1GE1A 1LYYA 3OK0A 5DLAA 1AM7A 2ZILA 2HEFA 1KXYA 1JWRA 3AW6A 4QEQA 3WMKA 5KXPA 1GFKA 4XJGA 4M6DA 3TXDA 3WXTA 4B4EA 1GDWA 1C46A 2XJWA 2W1MA 3AYQA 4BAFA 4NSHA 3CT1A 4TX7A 3QE8A 1C43A 3TXHA 4X3BA 4HTKA 4N1CC 1EQEA 1JSEA 1PS5A 3A3QA 3M18B 4WG1A 1LYOA 2C8PA 4GN3A 1VFBC 5FEKA 1J1PY 1LYSA 5IHGA 2YVBA 3HBDA 1OUJA 3ZEKA 1GPQC 1IEEA 3A67Y 1IORA 1VDTA 4H92A 4W96A 1NHEA 5B05A 5HNCA 1HEPA 1GFJA 1JTTL 4R0FA 1HFYA 2BQKA 1LZ6A 1C7PA 1QIOA 3A94A 5APDA 3SP3A 1IOSA 1G7HC 1REZA 4H9AA 1QTEA 5F9XA 2MEIA 4DD9A 5E4PA 1JTPL 3P4ZA 1GB3A 3OJPA 3W6EA 5I4YA 1ZV5L 2D4KA 4YOPA 4HSFA 3TXKA 4Z3MA 1YQVY 1KIPC 1FBIX 3VWOA 4ZFPA 2CDSA 4NGOA 1BB6A 3AZ6A 1LJFA 1LAAA 1OUIA 5B1GA 1LZCA 134LA 2C8OA 1CKCA 1HSWA 3ZVQA 4C5FA 4D9ZA 2BQGA 1GFUA 1I1ZA 2YSSC 1B5YA 1MELL 1JKAA 1WVVA 2Z37A 4GCBA 2MEFA 4H9CA 1B9OA 1D0KA 1CJ6A 1D9UA 1GB5A 1UA6Y 4PRUA 4PRQA 132LA 1T3PA 4B4JA 1BVXA 5KXZA 3WYHA 4ET8A 1CKHA 1LZGA 1LHLA 1UUZC 2MEEA 1UICA 3T36A 3TXFA 4CGEA 1ALCA 5KXTA 5KXSA 154LA 2ZQ4A 1IC7Y 3EMSA 5FSTA 2WARA 1HHLA 1GDXA 3A90A 1LCNA 1GE2A 1HEMA 4OWAA 1HERA 3TXEA 3TMVA 1D0MA 2BQMA 1LZ8A 4OWEA 2PC2A 4IASA 4J7VA 4XENA 2EQLA 4GCFA 4NGJA 3F6ZA 5KKJA 4RDSA 1QQYA 2HTXA 3KAMA 1UIHA 1VEDA 1YL1X 4O34A 1LHMA 1OP9B 1LSBA 3AGIA 5D5CA 1DI3A 1GBWA 4XADA 1JEFA 1JISA 1LKRA 1YKXX 3RW8A 1UBZA 4H93A 4KXIA 1LZ9A 5DN4A 1HEWA 1T6VL 1QTKA 1V7TA 2Z18A 5LYMA 1REYA 2MEHA 4N9RA 1O23A 1LJJA 5I54A 1B5WA 1G7JC 2XTHA 1GFHA 1BB7A 1BWIA 1YKZX 2YDGA 1LZBA 4FJRA 4N8ZA 1Z55A 1G7IC 193LA 2YBHA 4NGIA 2ZWBA 4HP0A 4KL7A 4LZTA 1LSGA 4WM6A 3TXJA 1GB9A 4Z46A 1FLWA 1HENA 2MEBA 3LYMA 2ZIJA 3IJUA 2YBJA 1G7MC 1LJ4A 4LT3A 2BQFA 4LYTA 5KXKA 4GLAA 1B7MA 4LFPA 1BGIA 1NMMA 1IP3A 1XGRC 3LYZA 4GN5C 3B0OA 3T6UA 1IOQA 1GFTA 1GF8A 2YBIA 1LJKA 3J6KA 4LYZA 2BLXA 3N9AA 4MR1A 1VDPA 1YKYX 1LSZA 2BQNA 1IOTA 2ZIKA 3ULRA 3WULA 5LVJA 2DQCY 1SQ2L 4MSTA 1B7QA 2FYDA 2HU1A 5C6JA 4NSIA 2AUBA 5LYTA 1VDQA 1DZBX 5APCA 4WM3A 1H6MA 3QNGA 1GFAA 2MEGA 4LT2A 2BPUA 4NFVA 3CSQA 2CGIA 4QGZA 135LA 4WLDA 5LXWA 1LSMA 1OQMA 1HEQA 6LYTA 3B0IA 3A8ZA 4B1AA 1B7PA 3TXIA 1VDSA 3P66A 3W6BA 3TXBA 2H5ZA 3CQLA 1GBSA 1LYZA 3GXRA 1HMLA 1E8LA 1WTMA 4B4IA 3AGGG 1GB2A 1IC4Y 1IWTA 4M4OA 4LFXA 3A6BY 1REXA 1F10A 4WM4A 1LHIA 1LMOA 3WUMA 1GBYA 2BQEA 1HELA 1FLUA 1LTMA 1GAYA 1DKJA 4GLVA 4PHIA 2Y8PA 1IR8A 5LAFA 1KIQC 4G4BA 1WTNA 5LINA 1GB8A 4N1EI
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LYGA 4OW1A 4W53A 3P65A 1IWYA 1L40A 1BHZA 1KXXA 244LA 257LA 3BKHA 159LA 5AMYA 127LA 4NGKA 1GE0A 1I56A 3B0KA 1L33A 1L63A 1QUOA 1L16A 1NHBA 1D3MA 1G7LC 1GF4A 2EPEA 1P7SA 4H8YA 3DN1A 2F2NA 1UIEA 4ML7A 3C7ZA 2BQCA 2OTZX 4RW2A 1T97A 5T3FA 1IY3A 172LA 2B75A 1QTHA 1LHHA 3SB9A 1JKCA 148LE 2D91A 1L80A 1KY1A 1L57A 4KT3A 232LA 3CB7A 1L94A 3WUAA 4DD1A 1UIBA 2W1XA 2RBQA 1OUDA 1GHLA 4KPMA 1P3NA 1IWUA 4LGKA 3GUPA 3HFMY 4DDBA 151LA 2OEAX 2ZNXY 237LA 7LYZA 1LMNA 2BQBA 1J1OY 2BAAA 206LA 3JR6A 2CWIA 163LA 2QARC 1EQ5A 1GF0A 1C10A 1L62A 1PQIA 5M1YA 1L05A 2YBNA 2G4PA 3N9EA 1JJ0A 2A4TA 1G1VA 1WVUA 3RT5X 4G4CA 1IWXA 3G3VA 1JITA 248LA 4NSGA 3C8RA 1WQRA 1KXWA 2Z38A 162LA 4FDYA 2Z39A 5IDDA 246LA 1L0KA 4C3WA 1HFZA 3WPLA 1ZURA 1W6ZA 4WLTA 255LA 4HJYA 5B06A 3A3RX 253LA 1C6NA 1YAOA 4PJ2C 1L58A 3RZ4A 4HPIA 1C6BA 3GXKA 4IATA 241LA 1LZ1A 2ANXA 1GF3A 5KXMA 3A93A 5ILCA 2Z12A 4OO9A 1LPYA 1L07A 3WPKA 1D2YA 5I5QA 214LA 1L79A 1LJNA 1C63A 261LA 3A96A 2ZQ3A 2LZ2A 256LA 2HEAA 1JTOL 4LYCA 1I20A 1HNLA 1JHLA 4NG1A 213LA 1GB6A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1JPO A;  1LZD A;  4OW1 A;  3TMX A;  1LZR A;  1NDM C;  5HQ1 A;  3P65 A;  1JUG A;  1IWY A;  2BLY A;  2HED A;  4H9B A;  1INU A;  1FLY A;  1IO5 A;  1GB7 A;  3FI7 A;  5KJ9 A;  4YM8 A;  133L A;  1LSF A;  1WQQ A;  1LHJ A;  1GBX A;  1BHZ A;  5IEL A;  1GEZ A;  1A4V A;  4CFO A;  1KXX A;  3BKH A;  1RE2 A;  4NWH A;  4NSJ A;  1UIF A;  5AMY A;  2CJL A;  4WMG A;  1LJE A;  5I4W A;  4NGK A;  1B7L A;  1GE0 A;  1I56 A;  1FKQ A;  3B0K A;  4L41 A;  1IVM A;  1XGP C;  2F4A A;  4EMN A;  1CJ8 A;  5LVK A;  1XEK A;  3AW7 A;  1RFP A;  3WXU A;  1DXJ A;  5KXX A;  2HEB A;  1G7L C;  1GF4 A;  2EPE A;  2EIZ C;  5E9R A;  4GCE A;  1IP4 A;  1LHK A;  4H8Y A;  1XGT C;  2F2N A;  1UIE A;  4NGL A;  4ML7 A;  1LKS A;  1FN5 A;  4ETC A;  1LMP A;  1IY4 A;  2BQC A;  2D4I A;  3LZ2 A;  1YRO A;  4RW2 A;  5I53 A;  5T3F A;  3WH1 A;  1YIL A;  1IP1 A;  1IY3 A;  4DYG A;  2DQG Y;  2X0A A;  1LHH A;  5KY1 A;  3WU8 A;  4OOO A;  1DPW A;  1JKC A;  2DQE Y;  4XYY A;  2D6B A;  3G3B B;  2D91 A;  2GV0 A;  4BAP A;  1GXX A;  3IWR A;  1KIR C;  1RCM A;  4PPO A; 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 1B5W A;  1G7J C;  2XTH A;  1GFH A;  1BB7 A;  1BWI A;  1YKZ X;  2YDG A;  1LZB A;  4FJR A;  4N8Z A;  1Z55 A;  1G7I C;  193L A;  2YBH A;  4NGI A;  2ZWB A;  4HP0 A;  4KL7 A;  4LZT A;  1LSG A;  4WM6 A;  3TXJ A;  1GB9 A;  4Z46 A;  1FLW A;  1HEN A;  2MEB A;  3LYM A;  2ZIJ A;  3IJU A;  2YBJ A;  1G7M C;  1LJ4 A;  4LT3 A;  2BQF A;  4LYT A;  5KXK A;  4GLA A;  1B7M A;  4LFP A;  1BGI A;  1NMM A;  1IP3 A;  1XGR C;  3LYZ A;  4GN5 C;  3B0O A;  3T6U A;  1IOQ A;  1GFT A;  1GF8 A;  2YBI A;  1LJK A;  3J6K A;  4LYZ A;  2BLX A;  3N9A A;  4MR1 A;  1VDP A;  1YKY X;  1LSZ A;  2BQN A;  1IOT A;  2ZIK A;  3ULR A;  3WUL A;  5LVJ A;  2DQC Y;  1SQ2 L;  4MST A;  1B7Q A;  2FYD A;  2HU1 A;  5C6J A;  4NSI A;  2AUB A;  5LYT A;  1VDQ A;  1DZB X;  5APC A;  4WM3 A;  1H6M A;  3QNG A;  1GFA A;  2MEG A;  4LT2 A;  2BPU A;  4NFV A;  3CSQ A;  2CGI A;  4QGZ A;  135L A;  4WLD A;  5LXW A;  1LSM A;  1OQM A;  1HEQ A;  6LYT A;  3B0I A;  3A8Z A;  4B1A A;  1B7P A;  3TXI A;  1VDS A;  3P66 A;  3W6B A;  3TXB A;  2H5Z A;  3CQL A;  1GBS A;  1LYZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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