2LZ2A

The three dimensional structure of turkey egg white lysozyme at 2.2 angstroms resolution
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVYGRCELAAAMKRLGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTHATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSKNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIASGGNGMNAWVAWRNRCKGTDVHAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Three Dimensional Structure of Turkey Egg White Lysozyme at 2.2 Angstroms Resolution
rcsb
molecule keywords TURKEY EGG WHITE LYSOZYME
molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Meleagris gallopavo
total genus 38
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1988-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2lz2A00
3TXGA 1WQMA 1LCNA 1LYZA 2HTXA 2HUBA 3RU5A 1B5UA 1UIEA 4HJVA 3CT0A 5KXNA 1MELL 1F6SA 2DQGY 4RLMA 5M1YA 153LA 1ZVYB 1D0LA 3GXRA 3W6DA 3WUNA 1VDPA 5KXYA 3WVYA 4H9CA 4A7DA 1XGPC 1LZCA 1AM7A 1LZNA 4BS7A 194LA 2MEFA 1HEWA 5L3HA 5DLAA 2YBJA 5AMYA 133LA 4CFPA 1C45A 3P65A 4NFVA 3CSQA 4GCCA 1CJ9A 4NSJA 4XYYA 1IIZA 1XEKA 4H1PA 3AGGG 2CDSA 1HFYA 1RI8B 2DQIY 1IP5A 1LJEA 1G7JC 3A90A 5LIOA 5B1FA 2DQHY 2Y8PA 1BWJA 5KXKA 5DM9A 1LZ8A 4UWNA 2BQHA 5APEA 3AZ4A 4YF2A 5JENB 4RLNA 5KJ9A 1JEFA 3WU7A 4QY9A 1BWHA 1HSWA 3N9AA 5F16A 3AGIA 3QNGA 1YKZX 4GLVA 4W96A 5FEKA 3VWOA 1J1PY 1LHMA 4AGAA 2Z12A 1LMNA 1XGUC 3MGWA 4ETBA 1HF4A 4ZFPA 1C08C 2W1LA 4NWHA 4H90A 1JJ3A 5LYTA 1C46A 4DD0A 2MEGA 5EBHA 3WL2A 1UA6Y 4C3WA 2Z2FA 3W6FA 1ZVHL 3A3RX 1RCMA 3ZEKA 1GB0A 2HU3A 2HEFA 1WQNA 1XGRC 2W1MA 4GLAA 5KY1A 3CSRA 4BAFA 1GE0A 1V7TA 1AT6A 3WU9A 1CKDA 1YANA 3LZ2A 4NEBA 2MEDA 2LYMA 3WUMA 3HBHA 1T3PA 1WTNA 5LA5A 3CQLA 1B5ZA 1JKBA 1HEQA 2MECA 4BADA 2YBLA 5I53A 1WVVA 1LHKA 5IELA 3J6KA 1FLQA 5FELA 1GFEA 4NGYA 5B59A 1GAZA 1DPWA 3B6LA 3WW6A 2DBTA 4MCKA 1LYYA 1LHLA 1KXWA 4NGIA 1C7PA 1RJCB 1XEJA 2IFFY 1IOTA 4WM2A 1JTPL 3A34A 2BQGA 1LHJA 4GCDA 4HV1A 4X3BA 3TXIA 4B4JA 4H94A 3AZ7A 4RW2A 2A7DA 4NGLA 4GN5C 3A92A 1IR8A 2Z39A 1FN5A 1EL1A 4H9IA 2XJWA 1LJGA 4PRQA 3IWRA 1IP1A 4CGEA 1IWTA 1VFBC 2N5ZA 2D6BA 3EO5A 4LGKA 1BVXA 1GE4A 1V7SA 1VDSA 1GFHA 2FBDA 3A3QA 3N9CA 4WM4A 4YEMA 1NDGC 4ET8A 2Z19A 1DKKA 4NG1A 1GEVA 1DQJC 1JJ1A 3OK0A 4WM3A 4QEQA 2EKSC 1OUJA 1FBIX 4LT2A 5I4XA 1B7NA 4H91A 1GPQC 4OOOA 2HEEA 5KXXA 4ANRA 4II8A 5HMVA 1QDTA 2EIZC 4Z41A 1UCOA 1QSAA 2HEDA 4G4BA 4WLDA 4ETCA 4WO9A 1LJFA 1AT5A 2H9KA 1SLYA 2XTHA 2BQLA 4QGZA 1GF7A 1C10A 1REMA 1I1ZA 1IWUA 1CNSA 1GFRA 3A6CY 1LHHA 1XEIA 4FJRA 3A93A 154LA 1LMCA 2DQDY 3BKVA 1TEWA 4H8ZA 1LSCA 3A91A 1IY3A 1GFVA 4PJ2C 4G4HA 1JIYA 1WQQA 1LSFA 1G7MC 2YBIA 1CKFA 4XJDA 1KIRC 1KXXA 1LSZA 1BHZA 1AZFA 3AW6A 1GFTA 4DDCA 1GB7A 1LYOA 3G3BB 4LYZA 4LYBA 5ILCA 1D6QA 3A94A 1HERA 4Z46A 1NMMA 4FDYA 4WM5A 2CGIA 4TSBA 1GBWA 4DD7A 4LFPA 4WL6A 1VAUA 1GHLA 1LJNA 5DN4A 5DN5A 5KXPA 2HEAA 1NF5A 3P66A 5IHGA 3P64A 2ZIKA 5HNCA 4NGZA 1D0MA 4TSCA 1INUA 1EQEA 3A67Y 1WQPA 5F81A 1GFAA 5LVKA 1NKHA 1LZSA 1BB7A 1IWZA 3AJNA 1IR7A 2YSSC 1YL0X 1E8LA 4NGKA 3W6BA 1TCYA 2FBBA 4GCFA 1B7OA 1IWYA 1QSWA 4L41A 4IATA 4LYCA 5K7OA 4J7VA 1GF8A 4H9EA 5KXRA 2XBSA 2GV0A 1UIFA 3B0IA 1HHLA 3CSZA 3LYMA 5A3EA 1OUGA 1WTMA 1LJKA 2BQFA 1UIBA 2I25L 1IOQA 2Z2EA 1IP4A 1T6VL 1KIPC 3A8ZA 4H92A 1GBSA 3IJVA 3WH1A 1YL1X 5B1GA 2EQLA 4N9RA 5LVHA 1H87A 4HP0A 3WPLA 1LHIA 1IP2A 4HPIA 1GAYA 1CKGA 2ZNXY 4CFOA 1IO5A 2IHLA 3P4ZA 5KXMA 1A2YC 5C6JA 4WG7A 1B5WA 1VATA 4DC4A 208LA 1JKDA 4ETAA 3B72A 2F2NA 1F10A 2YDGA 1JKCA 4NHTA 1LZDA 3WW5A 4NHSA 2BQAA 4CJ2A 1JUGA 1FKVA 2BQKA 3F6ZA 3HFMY 1LSNA 1GB3A 1EQ5A 3LYZA 4OOTA 4PPOA 5J7CA 1HNLA 4N1CC 1G7HC 1FKQA 1IOCA 1GBYA 4HPEA 4B0DA 4M4OA 5LYMA 1DI3A 4TX7A 1UACY 5C6IA 1YAOA 5APCA 4B49A 1IORA 2C8OA 3QY4A 4DWXA 2RSCA 4N1EI 5KXWA 2FYDA 5KXZA 3RT5X 1UIDA 4GCEA 1GB2A 1IWVA 1LZBA 1UIAA 3TXFA 1B7PA 2BQOA 1G7LC 4H8YA 3EXDA 1VDTA 3LYOA 5HQ1A 4GCBA 1B5XA 2BQNA 1JISA 4LT3A 4NWEA 1BB4A 5B07A 5I4WA 1D9UA 1LJIA 1B7MA 4YENA 2DKVA 1LMAA 2D4KA 4NY5A 4TWSA 2Q0MX 4CHXA 4YM8A 1LYSA 4RW1A 1YAQA 1B9OA 4WLXA 1LZ5A 1JTTL 1MLCE 5I4YA 4XADA 2Z38A 132LA 4HSFA 1F6RA 3LN2A 1JITA 1TAYA 2DQJY 4DD3A 4P2EA 1HEPA 1GD6A 1GF3A 4OWBA 1W08A 1LJJA 1B7SA 1B7LA 2I6ZA 1GF9A 2X0AA 3D3DA 4HTKA 4TUNA 1IP7A 4WOAA 3B0OA 5APFA 1IX0A 2FYCA 4RDSA 4XJIA 5KKJA 4B4EA 3OJPA 1ZMYL 1GBXA 3GXKA 1LJ3A 1HC0A 3TXHA 1LSEA 1BGIA 1OP9B 1QTKA 2ZNWY 3EMSA 1LOZA 1N4FA 5LVGA 2ZQ3A 3A95A 1Z55A 4KXIA 3HBDA 1IVMA 4TTDA 4H8XA 1W6ZA 1JWRA 3T36A 1DZBX 2H5ZA 4U3XB 3W6EA 2D91A 5KKIA 1GB6A 1DKJA 1FLYA 2BQJA 4N5RA 2HECA 2YBMA 1HMKA 1OUDA 4B1AA 9LYZA 5D5FA 3WYHA 1GWDA 1XGQC 4G4CA 5FDJA 1IY4A 1LSDA 5KXSA 4MSTA 1FDLY 1UICA 1JTOL 4LYTA 4H9FA 1GDXA 2F4GA 4J0LA 4DT3A 1TDYA 4ZEEA 4I0CA 3WPKA 2ZILA 1LAAA 1YQVY 4XJBA 1LSMA 1LTMA 1EQ4A 2G4PA 4NHQA 5F9XA 1TBYA 3TMVA 1FLUA 4ETEA 1B2KA 3TMWA 1REXA 1WQRA 2D4JA 4QDNA 4KL7A 2MEBA 4LYOA 4WLTA 4J1BA 1BQLY 3EBAB 4WLYA 3RW8A 2ZYCA 1UC0A 1IC5Y 5B05A 5LINA 4YEOA 1OUAA 2G4QA 1GFKA 1NBYC 1LKSA 4LYMA 2F30A 4NGWA 5HNLA 5I5QA 3RNXA 6LYTA 5LVJA 4LT1A 134LA 4H93A 4C5FA 2VB1A 1D6PA 1NWGA 2BAAA 2Z18A 3AB6A 3AYQA 2A7FA 3BKHA 3HBEX 1GB8A 4NSHA 5LAGA 1YKYX 3AZ6A 3A6BY 4DD2A 5II3A 1LZ1A 1LZTA 5KXLA 4OWEA 1HEMA 2C8PA 1BWIA 1QTEA 5L3IA 2AUBA 1LSPA 1DPXA 4I8SA 4WM6A 3TXEA 1BB5A 1LMTA 1GFJA 4LT0A 3M3UA 1GFGA 1NDMC 3W6AA 4H9HA 1JPOA 4OWAA 2I26L 3CB7A 3ZVQB 5KXTA 5LA8A 4NGVA 1LZEA 4E3UA 4EMNA 1WVUA 1QDRA 4NHPA 4WMGA 1JJ0A 4HJZA 1IP6A 1GXXA 1PS5A 1REYA 3T6UA 2YBHA 1G7IC 4W94A 2ZWBA 1ALCA 1UIGA 4OWHA 4WM1A 2LYOA 2MEAA 3AGHA 4KPMA 4LFXA 5FHWA 2LZ2A 3B0KA 5IDDA 1JHLA 1GBZA 1LJ4A 4MR1A 3WXUA 1IWWA 2LYZA 3G3AB 3WUAA 3WVXA 3FE0A 1XFPL 4N8ZA 2CWIA 1YIKA 5HMJA 1UUZC 207LA 5HLLA 1BB6A 5KXOA 1LMOA 2DQAA 1KXYA 4OW1A 1DI5A 1GDWA 1GFUA 3CT1A 1GEZA 3FI7A 3J4GA 1GE2A 4DD1A 1IOSA 1QUTA 3TXKA 1HMLA 3M18B 3TMXA 3LZTA 2Z37A 4J1AA 5T3FA 2W1XA 4XJFA 4G49A 4PGJB 2G4NA 2LZTA 1B5YA 4R6CA 1H6MA 1JSEA 1LZRA 1UBZA 5L9JA 4HTQA 4GN4A 193LA 2ZYPA 4PHIA 4ETDA 3W6CA 1BVKC 3WU8A 1LKRA 1VDQA 2DQCY 5E9RA 3WULA 2BQDA 1GE1A 2B5ZA 3KAMA 1HSXA 1CKCA 3ATNA 3IJUA 4OWCA 3AZ5A 4NSIA 2MEHA 7LYZA 1OUIA 5E4PA 1NBZC 4AXTA 5A3ZA 3N9EA 1QUSA 1VEDA 2BQMA 1IWXA 1OUFA 1XGTC 4KT3A 4XENA 3TXBA 3AW7A 6LYZA 1LZ9A 5LYZA 2EPEA 3LHMA 4BAPA 1IR9A 1LSGA 4HTNA 3ZVQA 5F14A 4NHIA 2LHMA 1GF0A 3D9AC 1DI4A 1ZV5L 1B5VA 2HU1A 3ULRA 4PRUA 4DDAA 1LZ4A 1HFXA 2XBRA 4WG1A 1OUBA 1IP3A 1YAMA 3WMKA 4B4IA 1IC4Y 2PC2A 4DYGA 1YKXX 1J1OY 1B0DA 1P2CC 1YILA 2W1YA 3A96A 1OQMA 4O34A 1LZAA 5ILFA 1F0WA 2YBNA 4DD9A 8LYZA 1LMPA 5C6LA 1A4VA 4UWUA 1LZYA 1I56A 4UWVA 1OUEA 2BQBA 1YROA 3LYTA 4LZTA 4ML7A 4YOPA 2BQIA 1GF6A 1J1XY 1JSFA 1FLWA 1IEEA 2ZQ4A 135LA 1CKHA 1NHEA 4ET9A 5D5CA 1HENA 1SQ2L 4IJ4A 4NG8A 4XJHA 2CJLA 1RE2A 1B7RA 1D0KA 5I54A 1DXJA 4NIJA 1JKAA 4HJYA 1OUHA 2BPUA 2F4AA 4XJGA 1LZGA 1HELA 5LAFA 5LXWA 1KIQC 1GF5A 1LMQA 1GB9A 5LVIA 1GBOA 2DQFC 1REZA 4R0FA 2YVBA 5DL9A 3W3EA 5B06A 4D9ZA 2BLYA 5APDA 1WQOA 3ATOA 3P68A 4NGJA 3WPJA 2D4IA 1CJ8A 4H9AA 3TXJA 3CT5A 4G9SA 1QIOA 2BLXA 1UIHA 4XN6A 3TMUA 2ZIJA 4WO6A 1B7QA 1C43A 1O23A 1IC7Y 1GE3A 3WXTA 1LJHA 4ZIXA 4DDBA 1I20A 1GB5A 1HEOA 1QQYA 1GF4A 1PZYA 2BQEA 1LSAA 2BQCA 2HEBA 1RFPA 4N0JA 2MEEA 4GN3A 3TXDA 4WL7A 4HV2A 5FSTA 2NWDX 2DQEY 3SP3A 1CJ6A 4NSGA 1GXV2 2MEIA 1XSFA 1AKIA 4IASA 4Z98A 4EOFA 1HFZA 1OUCA 5FCPA 1LSYA 3E3DA 1YAPA 1LSBA 4H9BA 4Z3MA 4M6DA 1LZ6A 1CJ7A 3K3TA 1LPIA 3QE8A 1BB3A 5F9UA 3RZ4A 2H9JA 4NGOA 2WARA 1NQIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LCNA 1L36A 3CT0A 5KXNA 213LA 1ZVYB 1D0LA 3HUQA 3HUAA 3W6DA 1D9WA 5KXYA 3WVYA 194LA 2MEFA 2YBJA 1CJ9A 182LA 2OU0X 1L35A 4LDEA 1LI2A 1XJUA 1HFYA 227LA 1IP5A 1LJEA 1QTZA 1LZ8A 2HULA 3HDFA 3WU7A 4QY9A 5I14A 1L43A 107LA 1HSWA 3N9AA 198LA 108LA 3AGIA 4W96A 1L90A 1LYHA 1DYBA 162LA 248LA 1LMNA 3FI5A 144LA 3C81A 4ETBA 211LA 4ZFPA 3C8RA 1P5CA 4NWHA 177LA 2Z2FA 1RCMA 1OVKA 2HUMA 1L62A 2HEFA 1WQNA 2W1MA 4BAFA 1WTHA 1G1WA 4NEBA 2MEDA 1JKBA 3RUNA 5FELA 5B59A 3DMXA 2DBTA 151LA 1C7PA 2IFFY 1C64A 258LA 169LA 3AZ7A 4NGLA 1IR8A 1L30A 249LA 1ZURA 1C67A 4H9IA 1CV1A 1LJGA 1IP1A 4CGEA 2N5ZA 4I7QA 3RZEA 4LGKA 1BVXA 1I6SA 3A3QA 3OK0A 1FBIX 4LT2A 4EJ4A 4WLDA 1PQKA 1LJFA 1AT5A 4QGZA 1I1ZA 1IWUA 1GFRA 4FJRA 4H8ZA 2XQOA 1LSCA 4PJ2C 1QSQA 1JIYA 4I7OA 1KIRC 1P2RA 185LA 4DDCA 4ZPUA 4OO9A 1HERA 4Z46A 4FDYA 4WM5A 2CGIA 5DN4A 3SB9A 1C6LA 228LA 3A67Y 1LZSA 1IWZA 1YL0X 1LYIA 190LA 4GCFA 5K7OA 1L67A 4J7VA 4EPIA 1GF8A 4H9EA 1PQOA 1OUGA 1WTMA 2BQFA 1KIPC 3WH1A 1H87A 3WPLA 1LHIA 3CDVA 1IP2A 4CFOA 1CV3A 2HUKA 4DC4A 4LDOA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3TXG A;  1WQM A;  1LCN A;  1LYZ A;  2HTX A;  2HUB A;  3RU5 A;  1B5U A;  1UIE A;  4HJV A;  3CT0 A;  5KXN A;  1MEL L;  1F6S A;  2DQG Y;  4RLM A;  5M1Y A;  153L A;  1ZVY B;  1D0L A;  3GXR A;  3W6D A;  3WUN A;  1VDP A;  5KXY A;  3WVY A;  4H9C A;  4A7D A;  1XGP C;  1LZC A;  1AM7 A;  1LZN A;  4BS7 A;  194L A;  2MEF A;  1HEW A;  5L3H A;  5DLA A;  2YBJ A;  5AMY A;  133L A;  4CFP A;  1C45 A;  3P65 A;  4NFV A;  3CSQ A;  4GCC A;  1CJ9 A;  4NSJ A;  4XYY A;  1IIZ A;  1XEK A;  4H1P A;  3AGG G;  2CDS A;  1HFY A;  1RI8 B;  2DQI Y;  1IP5 A;  1LJE A;  1G7J C;  3A90 A;  5LIO A;  5B1F A;  2DQH Y;  2Y8P A;  1BWJ A;  5KXK A;  5DM9 A;  1LZ8 A;  4UWN A;  2BQH A;  5APE A;  3AZ4 A;  4YF2 A;  5JEN B;  4RLN A;  5KJ9 A;  1JEF A;  3WU7 A;  4QY9 A;  1BWH A;  1HSW A;  3N9A A;  5F16 A;  3AGI A;  3QNG A;  1YKZ X;  4GLV A;  4W96 A;  5FEK A;  3VWO A;  1J1P Y;  1LHM A;  4AGA A;  2Z12 A;  1LMN A;  1XGU C;  3MGW A;  4ETB A;  1HF4 A;  4ZFP A;  1C08 C;  2W1L A;  4NWH A;  4H90 A;  1JJ3 A;  5LYT A;  1C46 A;  4DD0 A;  2MEG A;  5EBH A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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