2ZNWY

Crystal structure of scfv10 in complex with hen egg lysozyme
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Specific fluorine labeling of the HyHEL10 antibody affects antigen binding and dynamics
pubmed doi rcsb
molecule keywords ScFv10
molecule tags Immune system/hydrolase
source organism Mus musculus
total genus 48
structure length 129
sequence length 129
chains with identical sequence Z
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2008-05-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
Y PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2znwY00
3LHMA 1GB5A 2F30A 4RW1A 1GFKA 1HFZA 2YBLA 1DZBX 4LT3A 1FBIX 1REXA 1GBOA 4RW2A 4CJ2A 4AXTA 1W08A 5I4XA 4HP0A 1GDWA 3HFMY 1GF5A 1OUBA 2N5ZA 4H1PA 4DD9A 5HQ1A 3WL2A 4AGAA 5IELA 4LYBA 4GN5C 1YKYX 4X3BA 1LZEA 1V7TA 4DD0A 1JKAA 1FKVA 1IVMA 1C10A 5B05A 4XENA 5KXKA 1P2CC 5KJ9A 1NBYC 4ZFPA 5LVHA 4LT1A 1YQVY 1VAUA 2LZ2A 3ATNA 1UA6Y 3TMWA 3LZTA 1GE4A 4WLDA 4EMNA 1JIYA 1T6VL 1B7SA 1C7PA 4XJHA 1G7IC 1KXWA 1CKHA 1FKQA 4I8SA 4LYZA 3E3DA 1IP4A 3B0KA 4YM8A 4B1AA 4TSCA 3A90A 3A93A 1B2KA 2Z38A 3ZVQB 2ZIKA 4H9EA 2FBBA 4PRQA 2MEGA 2DQDY 2H9KA 1HF4A 1LZ9A 1O23A 1QDRA 1UIEA 1IWWA 1GB3A 1IC7Y 3M3UA 4XJGA 1DI5A 2BPUA 5E4PA 5KXWA 3TXBA 1NDGC 3A95A 4H90A 3EMSA 5B06A 2DQCY 1JKDA 2F4AA 1FLQA 1LSFA 1WVUA 1KXYA 4WM1A 1LZRA 4IJ4A 1LHIA 3AZ7A 4H94A 5F9UA 1HERA 4OWEA 5FDJA 3A94A 3T36A 1WQMA 2W1XA 1QUSA 1LOZA 2XBSA 2B5ZA 1LSPA 4XJBA 2RSCA 1FLUA 1XEIA 4R0FA 5I53A 1B7MA 3BKVA 4GCEA 1QTEA 1CNSA 4B49A 1F10A 3B6LA 4QDNA 2G4QA 3TXJA 1TCYA 2HU1A 4Z98A 1G7HC 5ILCA 3TXFA 3D9AC 5LVKA 6LYTA 1OUJA 1LMCA 3A6BY 1LYZA 1C46A 1DXJA 1T3PA 4G9SA 1HEPA 3WW5A 1DKKA 3HBDA 3T6UA 3QNGA 1KIRC 1LMPA 4ET8A 1AM7A 4G4CA 4H8XA 132LA 2W1MA 133LA 2G4NA 4HTKA 1RE2A 5DL9A 1GWDA 1HFYA 5LVJA 1GE0A 1B5ZA 2XJWA 1XEJA 4WOAA 1F6SA 2YBMA 4ETAA 2A7DA 1IEEA 5F16A 4PJ2C 1LJ3A 1XGQC 1CKFA 3B0OA 2BQFA 4WLTA 5A3ZA 5JENB 5E9RA 5HNCA 5II3A 1JITA 2I25L 4B0DA 1D9UA 4HTNA 2F2NA 4CFPA 1NQIA 1GB8A 1WQNA 2F4GA 2ZNXY 5M1YA 2Z19A 1GF6A 4WMGA 3WPJA 3A34A 5DN4A 5DN5A 3AB6A 2LHMA 1GF8A 1UIHA 1OP9B 4ETBA 1TDYA 1NHEA 5APDA 3TMXA 2DKVA 4RDSA 4UWUA 1GEZA 3A91A 4HTQA 1GFUA 4WM6A 1IP5A 1BB6A 4HPIA 2CJLA 1IWZA 1XFPL 4M4OA 1GDXA 1HEWA 1HMLA 4N1EI 1JTPL 5I4WA 1CJ9A 5B59A 5KXMA 1IOCA 1A4VA 1GB9A 2XTHA 4WLYA 4NGZA 3P66A 193LA 1C45A 207LA 4OWCA 5C6IA 4HPEA 1LZ5A 3W6BA 3A96A 5KXSA 1LJEA 4QGZA 4DT3A 4LYCA 5LA8A 1BQLY 1GB6A 1WTNA 3AZ4A 4H9AA 4OWBA 1DQJC 1VDQA 2YVBA 1GHLA 3EBAB 3ZEKA 1BGIA 4ML7A 1A2YC 1NKHA 5F81A 4GN4A 1HMKA 4MSTA 4B4IA 5KKIA 1QTKA 1JTTL 1LJFA 1H6MA 4B4EA 4J1BA 2PC2A 4OWHA 2Z12A 154LA 3WPKA 1TEWA 1WTMA 2D4IA 5DM9A 4DYGA 9LYZA 1B5UA 4Z46A 2NWDX 1DPWA 134LA 4I0CA 1AT5A 1LJ4A 1LHJA 1OUIA 1BB4A 1D0KA 1MELL 1IC4Y 2H9JA 1ZMYL 4H9HA 5F9XA 1LYOA 4CFOA 1NF5A 1B5WA 1OUCA 4XYYA 4A7DA 4WL7A 5LA5A 3A67Y 5IDDA 4TX7A 3AGIA 3WPLA 1LCNA 4DD2A 1IORA 2ZQ4A 1VFBC 2D4JA 4NGIA 2HECA 2MECA 1B7RA 4UWVA 4NGVA 1GAYA 3HBEX 4GCBA 5KY1A 1IR7A 3CSQA 1IP1A 4NHPA 2D6BA 5LAFA 5KXZA 1GB0A 4RLNA 4TUNA 1XGRC 1D6QA 1LJGA 2FYCA 2FYDA 1GAZA 3CT5A 1GFGA 1LKRA 1GFHA 1YKXX 3LYMA 3A6CY 5APEA 1LHLA 1GF7A 2D4KA 1LZDA 3RT5X 4DDBA 1UIFA 1LZCA 3SP3A 1B9OA 1HELA 2CWIA 4OWAA 1D0MA 4QEQA 3WMKA 1QDTA 4H92A 5L9JA 2MEHA 1BVKC 5I5QA 1JUGA 4DD7A 1OQMA 1LZSA 2LZTA 2BQLA 1LJNA 2DBTA 2MEDA 1AT6A 3WU9A 1C08C 2ZYPA 4LYOA 4OOTA 4WM2A 1JISA 5FEKA 1CKDA 1HEMA 1VDSA 1BHZA 2YBJA 1B7OA 4ET9A 1FLWA 2BQDA 2ZYCA 3P65A 4GCFA 2IFFY 2YDGA 5EBHA 3K3TA 4WG7A 2LYZA 1GF4A 4HJZA 1QQYA 2DQEY 2Z18A 4GLAA 1IOTA 2BQGA 2W1LA 1GPQC 2Z2FA 135LA 1YAPA 4MCKA 4TSBA 1JTOL 2YBNA 4ZIXA 7LYZA 3FE0A 3TXGA 8LYZA 1IWUA 1H87A 1F0WA 1AKIA 4IASA 1TBYA 4LFPA 5HNLA 1IX0A 1LJJA 2LYOA 1B7LA 4LYTA 1LAAA 2DQFC 1IY4A 4M6DA 1LZGA 3IJVA 3W6FA 3TXIA 2BAAA 3MGWA 1LMAA 3J6KA 1B5XA 1LHMA 1REZA 2BQCA 2Q0MX 4YEOA 1IWTA 1IR8A 4H8ZA 5KXYA 1VATA 2HEDA 5KKJA 5IHGA 1UACY 1LZYA 4MR1A 1FLYA 1JJ1A 1JWRA 4NHIA 4O34A 1GF0A 2DQGY 4B4JA 5KXLA 1UIGA 1VDPA 1UCOA 4G4BA 1J1OY 1ZVYB 2DQAA 1CKGA 1FN5A 1XGUC 4L41A 4NFVA 3QE8A 4NWHA 1LSYA 5KXPA 1BWJA 1LZNA 4WO9A 4YF2A 3AJNA 1OUHA 1UIAA 4NSIA 2Z37A 4CGEA 2DQJY 5K7OA 1PS5A 1HEOA 3WVYA 4WG1A 1SQ2L 3W6CA 1N4FA 1UIBA 1IIZA 3IJUA 3A92A 153LA 1EL1A 2FBDA 3AZ5A 4NSGA 3RNXA 3AZ6A 1GBWA 1GEVA 194LA 1B5YA 2X0AA 2XBRA 1GF9A 2CGIA 2MEBA 3WH1A 2C8PA 5ILFA 1ZV5L 1LJIA 4WM3A 1GF3A 1QIOA 1OUDA 4H9CA 3P4ZA 2ZIJA 5LAGA 3G3BB 1RI8B 1LSCA 2HEEA 1ALCA 5KXTA 5HMJA 1IR9A 3TMUA 1YROA 1XGTC 4DWXA 1Z55A 5D5CA 2I6ZA 2MEEA 1INUA 3EXDA 4QY9A 2BQKA 3A3RX 1GFRA 2BQAA 1JKCA 4PGJB 3WU7A 1HHLA 5D5FA 2MEAA 1IOSA 2HTXA 4WLXA 2HEFA 1SLYA 1HSWA 2BQJA 1B0DA 1TAYA 2EQLA 4C5FA 4YOPA 4KL7A 5FSTA 5APFA 5LYTA 3CT0A 2YSSC 1NMMA 4FJRA 4N5RA 1CJ7A 1B7NA 1EQ4A 4FDYA 1LZ4A 1WQOA 3W6EA 2Z2EA 1B7QA 3CB7A 3G3AB 1QSWA 4J7VA 4N1CC 3RZ4A 1G7MC 3ULRA 3RW8A 1BB3A 1YIKA 4XJDA 3P68A 4ETEA 3P64A 4OW1A 4YEMA 1LTMA 1LZ6A 4XJIA 2IHLA 1LZBA 1UIDA 4LZTA 1I56A 4PPOA 4BAFA 4J1AA 1PZYA 3VWOA 3WU8A 3CT1A 3B0IA 4KPMA 1GE3A 1WVVA 1DI3A 1GBZA 3AYQA 1BB7A 1IWYA 1UUZC 2YBHA 5B1GA 4ANRA 1V7SA 1IY3A 4XJFA 4C3WA 4DD3A 5L3IA 3WUNA 1HSXA 4GCCA 4II8A 4H93A 1LHKA 5T3FA 1HEQA 2BLXA 1LSBA 2BQBA 1LZTA 1YILA 3WVXA 1IWXA 4HV2A 2MEIA 1CJ8A 1LYYA 4NGOA 1JEFA 1WQQA 4BAPA 5HMVA 5C6LA 208LA 4GLVA 1GBSA 4NSHA 4KT3A 4XN6A 1GE2A 2BQOA 2ZQ3A 4OOOA 4H8YA 2BQEA 2CDSA 4NGKA 4NHTA 4NG8A 1C43A 4DDAA 4DC4A 5LINA 2AUBA 4GCDA 4WM4A 1UBZA 4G4HA 5B07A 1GFTA 1YANA 5LYMA 1LJHA 5LIOA 1VDTA 1UICA 1IP7A 1IP6A 4HSFA 1LJKA 4LFXA 2MEFA 3LZ2A 4NGYA 3W6DA 2GV0A 3WXTA 1CKCA 3WXUA 2EKSC 1GBXA 4NG1A 4Z41A 5J7CA 4NGJA 1VEDA 4NWEA 1BWHA 4BADA 4WM5A 5C6JA 2YBIA 4H91A 2DQHY 4DD1A 3ATOA 3FI7A 1OUAA 1IP2A 1IC5Y 1LMQA 1WQPA 3TXHA 3TXKA 1D6PA 3QY4A 2H5ZA 1JSEA 2EPEA 3B72A 3WUMA 5LVGA 4ZEEA 1YKZX 1LSZA 5I4YA 6LYZA 4PHIA 1JJ3A 1XGPC 3LYOA 2HEAA 4P2EA 4CHXA 1HC0A 4YENA 4LT0A 5I54A 1REYA 1F6RA 1W6ZA 1WQRA 1B5VA 1YAQA 3D3DA 1RJCB 2BQNA 5LYZA 3ZVQA 1RCMA 1J1XY 2W1YA 2EIZC 3WYHA 3CSZA 3TXDA 1LZ1A 5HLLA 1YAMA 4NGLA 4XADA 5DLAA 4LT2A 4TTDA 3TMVA 4HJYA 1LSNA 5KXRA 1KIQC 4HJVA 2ZNWY 5FCPA 1XEKA 2HU3A 1J1PY 4NEBA 1NWGA 1EQEA 1NBZC 1GB7A 1BVXA 1GXV2 1I1ZA 1KXXA 1OUEA 1DI4A 1LPIA 4D9ZA 5L3HA 2BQIA 1D0LA 1GD6A 5KXNA 3OK0A 1QUTA 1YL1X 4ETCA 1IWVA 1LZ8A 2Z39A 3IWRA 3LYTA 4UWNA 5FHWA 1LMOA 1LMTA 3N9EA 5AMYA 4Z3MA 1LSGA 1LYSA 3LN2A 3M18B 4KXIA 2Y8PA 3WW6A 4GN3A 1GFVA 2A7FA 3A3QA 3AW6A 3N9CA 4NSJA 5B1FA 1NDMC 4EOFA 1FDLY 4H9BA 2HEBA 4TWSA 1IO5A 3EO5A 4RLMA 4E3UA 2BQMA 3AGGG 4R6CA 1RFPA 5APCA 4J0LA 5A3EA 1GFEA 2ZWBA 1UC0A 2D91A 3AW7A 4H9IA 4LGKA 1REMA 1GFAA 1LSAA 1XSFA 1E8LA 4HV1A 1OUGA 4NIJA 5FELA 1LSDA 4PRUA 5F14A 5LXWA 4LYMA 1BB5A 1DKJA 1KIPC 1ZVHL 3CQLA 3A8ZA 1HNLA 2VB1A 1JSFA 5LVIA 3GXKA 3N9AA 1GFJA 2BQHA 2G4PA 3F6ZA 1MLCE 4NY5A 1LMNA 3KAMA 4H9FA 1BWIA 2ZILA 3GXRA 3WULA 1JJ0A 3WUAA 5KXOA 4G49A 3AGHA 1QSAA 2HUBA 1GBYA 4BS7A 1IOQA 3W3EA 2BLYA 4N0JA 1LHHA 3CSRA 4ETDA 1DPXA 1HFXA 1LKSA 4WO6A 1LSEA 1LZAA 3OJPA 4WL6A 2DQIY 1B7PA 1JKBA 1JHLA 4NHSA 4W94A 2C8OA 2WARA 1IP3A 1YAOA 4DDCA 1GE1A 3LYZA 3TXEA 3W6AA 1I20A 1CJ6A 1G7JC 1GB2A 1LSMA 2I26L 4NGWA 1G7LC 1JPOA 4N9RA 4N8ZA 4NHQA 1GXXA 1YL0X 4IATA 5KXXA 3BKHA 1EQ5A 1HENA 3J4GA 1OUFA 4U3XB 4W96A 3RU5A 3HBHA 2LYMA 1AZFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3LHMA 1LW9A 1L22A 3CDTA 4LT3A 1G07A 1GBOA 1KW7A 1L68A 2NTGA 3HFMY 1GF5A 4DD9A 5HQ1A 1L66A 1C6DA 248LA 4I7KA 4X3BA 1V7TA 4W56A 2F47A 125LA 5KXKA 1L26A 2LZ2A 3HUQA 1GE4A 1KXWA 4B1AA 3A93A 1L65A 1QDRA 1UIEA 4XJGA 3QAKA 5KXWA 3TXBA 180LA 3A95A 4H90A 3EMSA 1DYBA 5B06A 189LA 2F4AA 2LCBA 1LSFA 3K2RA 4H94A 1L59A 3F8VA 1QUSA 197LA 1LSPA 1FLUA 4R0FA 1B7MA 4GCEA 159LA 2HU1A 4Z98A 5ILCA 3EMLA 161LA 1LLHA 3NYAA 1DXJA 110LA 3QNGA 1KIRC 1LMPA 1HFYA 2XJWA 1XEJA 1QSQA 2YBMA 5F16A 1LJ3A 2OE4X 1L19A 1KS3A 5HNCA 1JITA 128LA 1D9UA 1SWYA 1GB8A 2F4GA 1GF6A 1CV4A 4WMGA 3A34A 3CDQA 109LA 1L30A 1TDYA 1GEZA 4HTQA 4W55A 1GFUA 1BB6A 4HPIA 4M4OA 5I4WA 4N1EI 1GB9A 4NGZA 3P66A 5C6IA 3W6BA 1LJEA 5LA8A 4ARQB 1WTNA 1DQJC 144LA 1VDQA 1C6QA 1GHLA 3ZEKA 4ML7A 3SB5A 1KY0A 226LA 231LA 3GULA 1QTKA 1H6MA 4B4EA 1C6FA 2PC2A 1SX2A 227LA 256LA 254LA 2LC9A 1C63A 1LJ4A 2H9JA 1OUIA 1ZMYL 4H9HA 5F9XA 4ARMB 1B5WA 4XYYA 172LA 1LCNA 4AQNA 4DD2A 2ZQ4A 230LA 1VFBC 214LA 4NGIA 1C6CA 3HBEX 4GCBA 4GRVA 1IP1A 1CUQA 122LA 1GB0A 1D6QA 3SB8A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3LHM A;  1GB5 A;  2F30 A;  4RW1 A;  1GFK A;  1HFZ A;  2YBL A;  1DZB X;  4LT3 A;  1FBI X;  1REX A;  1GBO A;  4RW2 A;  4CJ2 A;  4AXT A;  1W08 A;  5I4X A;  4HP0 A;  1GDW A;  3HFM Y;  1GF5 A;  1OUB A;  2N5Z A;  4H1P A;  4DD9 A;  5HQ1 A;  3WL2 A;  4AGA A;  5IEL A;  4LYB A;  4GN5 C;  1YKY X;  4X3B A;  1LZE A;  1V7T A;  4DD0 A;  1JKA A;  1FKV A;  1IVM A;  1C10 A;  5B05 A;  4XEN A;  5KXK A;  1P2C C;  5KJ9 A;  1NBY C;  4ZFP A;  5LVH A;  4LT1 A;  1YQV Y;  1VAU A;  2LZ2 A;  3ATN A;  1UA6 Y;  3TMW A;  3LZT A;  1GE4 A;  4WLD A;  4EMN A;  1JIY A;  1T6V L;  1B7S A;  1C7P A;  4XJH A;  1G7I C;  1KXW A;  1CKH A;  1FKQ A;  4I8S A;  4LYZ A;  3E3D A;  1IP4 A;  3B0K A;  4YM8 A;  4B1A A;  4TSC A;  3A90 A;  3A93 A;  1B2K A;  2Z38 A;  3ZVQ B;  2ZIK A;  4H9E A;  2FBB A;  4PRQ A;  2MEG A;  2DQD Y;  2H9K A;  1HF4 A;  1LZ9 A;  1O23 A;  1QDR A;  1UIE A;  1IWW A;  1GB3 A;  1IC7 Y;  3M3U A;  4XJG A;  1DI5 A;  2BPU A;  5E4P A;  5KXW A;  3TXB A;  1NDG C;  3A95 A;  4H90 A;  3EMS A;  5B06 A;  2DQC Y;  1JKD A;  2F4A A;  1FLQ A; 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 1LMT A;  3N9E A;  5AMY A;  4Z3M A;  1LSG A;  1LYS A;  3LN2 A;  3M18 B;  4KXI A;  2Y8P A;  3WW6 A;  4GN3 A;  1GFV A;  2A7F A;  3A3Q A;  3AW6 A;  3N9C A;  4NSJ A;  5B1F A;  1NDM C;  4EOF A;  1FDL Y;  4H9B A;  2HEB A;  4TWS A;  1IO5 A;  3EO5 A;  4RLM A;  4E3U A;  2BQM A;  3AGG G;  4R6C A;  1RFP A;  5APC A;  4J0L A;  5A3E A;  1GFE A;  2ZWB A;  1UC0 A;  2D91 A;  3AW7 A;  4H9I A;  4LGK A;  1REM A;  1GFA A;  1LSA A;  1XSF A;  1E8L A;  4HV1 A;  1OUG A;  4NIJ A;  5FEL A;  1LSD A;  4PRU A;  5F14 A;  5LXW A;  4LYM A;  1BB5 A;  1DKJ A;  1KIP C;  1ZVH L;  3CQL A;  3A8Z A;  1HNL A;  2VB1 A;  1JSF A;  5LVI A;  3GXK A;  3N9A A;  1GFJ A;  2BQH A;  2G4P A;  3F6Z A;  1MLC E;  4NY5 A;  1LMN A;  3KAM A;  4H9F A;  1BWI A;  2ZIL A;  3GXR A;  3WUL A;  1JJ0 A;  3WUA A;  5KXO A;  4G49 A;  3AGH A;  1QSA A;  2HUB A;  1GBY A;  4BS7 A;  1IOQ A;  3W3E A;  2BLY A;  4N0J A;  1LHH A;  3CSR A;  4ETD A;  1DPX A;  1HFX A;  1LKS A;  4WO6 A;  1LSE A;  1LZA A;  3OJP A;  4WL6 A;  2DQI Y;  1B7P A;  1JKB A;  1JHL A;  4NHS A;  4W94 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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