3AYQA

Crystal structure of inhibitor bound lysozyme from meretrix lusoria
Total Genus 45

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
122
structure length
122
Chain Sequence
FAGGTVSQRCLSCICKMESGCRNVGCKMDMGSLSCGYFQIKEAYWIDCGRPGSSWKSCAASSYCASLCVQNYMKRYAKWAGCPLRCEGFAREHNGGPRGCKKGSTIGYWNRLQKISGCHGVQ
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
EMPTYAH1 (8-19)AH6 (103-113)O1 (22-24)TIV1 (19-22)O2 (10-86)TIV3 (35-38)TI1 (36-39)S1 (26-29)S3 (40-41)S2 (32-35)AH3 (55-60)AH5 (86-95)AH2 (42-48)3H1 (78-80)AH4 (62-77)3H2 (99-101)TIV4 (95-98)O3 (13-118)TII1 (115-118)TII2 (118-121)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
publication title Crystal structure of inhibitor bound lysozyme from Meretrix lusoria
rcsb
molecule keywords Lysozyme
total genus 45
structure length 122
sequence length 122
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-05-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05497 Destabilase Destabilase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3ayqA00
1LZDA 4GCEA 2Z39A 1VDSA 4H8ZA 1YKYX 2FBDA 2Z18A 2MECA 1LJEA 4N5RA 5FHWA 4MSTA 5DL9A 4DDBA 1OQMA 5E4PA 5FELA 4M4OA 2YBIA 3N9EA 3WUNA 1JTOL 2C8PA 1LZCA 3TMVA 1GHLA 2ZYCA 1IP3A 3QNGA 3TXEA 4NG1A 1GWDA 1CKHA 1MELL 2BQMA 2LZ2A 3N9AA 4GN5C 4ETCA 4ZFPA 1LPIA 2YVBA 4PRUA 5LINA 2BQLA 3A67Y 3TXIA 3IJUA 1GF9A 2ZIKA 1EL1A 4H90A 4N1EI 4YEOA 1FDLY 2AUBA 4WLDA 4G4BA 3AYQA 4NFVA 5DN5A 4CHXA 1OUCA 5C6JA 2Z19A 3G3AB 5ILCA 1EQEA 4NHSA 1HF4A 5T3FA 1JWRA 2D6BA 3P66A 1YL0X 1LTMA 3EBAB 2EKSC 1LYOA 1XSFA 4LT2A 4OW1A 3J6KA 1LSFA 5LAFA 5LYZA 1NF5A 2I6ZA 4NY5A 1IWTA 3RT5X 1YANA 4GCBA 1IWYA 2DQHY 4NGYA 1C7PA 3LYMA 1HNLA 4AGAA 5KXKA 5KXZA 4LYCA 2BQGA 1GB6A 2MEGA 2DQAA 4OOOA 4QEQA 4MR1A 5K7OA 1GDXA 4N9RA 1JKDA 4NGJA 4B1AA 1VEDA 1G7JC 4HP0A 1XGQC 2W1XA 3HBDA 4LGKA 4FJRA 2D4KA 1IP2A 4LYZA 1DKJA 3AW6A 4NGLA 1B2KA 3WYHA 2MEHA 2BPUA 4QY9A 5KXMA 1EQ4A 1B5ZA 1G7HC 4XJBA 1WQMA 2BQDA 4PGJB 1QDTA 1JJ1A 1ZVYB 1GXV2 2H9JA 1UA6Y 3EMSA 3M18B 4GN4A 1YQVY 1AZFA 1B5XA 1LZGA 2DQJY 3A96A 1BB3A 1LZRA 5KXXA 1LAAA 4YM8A 4TSBA 1C46A 5KJ9A 4WG1A 5KXWA 1YL1X 3D9AC 1LHJA 4PJ2C 2D91A 3A90A 4RLMA 2IFFY 4H9FA 1NBYC 1B7MA 3P4ZA 1G7IC 5KXNA 1LMTA 1WVVA 2HUBA 4WL7A 1KXWA 2LYZA 1TAYA 4LT3A 3G3BB 5M1YA 1GXXA 1YAOA 1GF5A 2A7DA 4CFPA 3VWOA 1JJ3A 1GFHA 1DXJA 3WPLA 1WQQA 1IOCA 1N4FA 1CKCA 4NSIA 4XJDA 4GLVA 1JUGA 1QDRA 2YBHA 1HEQA 1F6RA 1LZAA 1F0WA 1D0MA 4WG7A 1WQNA 3ATNA 2Y8PA 1TCYA 1OUFA 4TTDA 1QQYA 1BB5A 3A8ZA 4C5FA 1REZA 1LSMA 1LZYA 1VDTA 3WULA 1VFBC 1B5UA 5LYTA 1LZ5A 4ETBA 5FSTA 4DD9A 1HMLA 4XJGA 4HTKA 1UIEA 2W1LA 3WXUA 3A93A 1B5YA 1IC5Y 1VDPA 1DI4A 1FLUA 4LT1A 4CJ2A 4GLAA 1OUIA 1UC0A 1HFZA 1IP6A 2H5ZA 1XGRC 3IWRA 4G4HA 1LZTA 4LYBA 2DQEY 3CSQA 4NHPA 5D5FA 3CQLA 1DPWA 4H8XA 1LMNA 4B0DA 1NWGA 1IO5A 1LMOA 4BS7A 1VDQA 3WXTA 5APCA 2YSSC 1OUDA 1OUGA 4NHTA 5KY1A 1LMQA 3FE0A 4HTNA 1IWWA 1YROA 3A91A 5LVGA 1XGPC 1GFKA 1LHLA 4OWBA 134LA 1QIOA 4D9ZA 2DBTA 2HU1A 1GD6A 4J1AA 2X0AA 1IWZA 4BAPA 1LMAA 1WQOA 4M6DA 4NHQA 4WM5A 1GAZA 1IWXA 3TXHA 5HQ1A 1RFPA 5LVJA 1JKBA 4GCFA 1DZBX 3HFMY 4NSHA 3LN2A 1DQJC 4UWVA 5C6LA 5KXSA 1IC4Y 1LJNA 4QDNA 1GFGA 1GB5A 2BQIA 2HEAA 1C10A 3LZTA 1LJ3A 5B1FA 4RLNA 1HENA 4WM2A 1CKDA 2LZTA 154LA 1GF6A 4H9BA 4IASA 4L41A 1P2CC 5II3A 3WU8A 4HJVA 4RDSA 3LYOA 1LZ6A 4MCKA 4NHIA 4DWXA 3CSZA 4DC4A 4YEMA 1JPOA 4NEBA 1GBSA 1I20A 1REMA 3WU7A 5HMVA 2ZQ3A 1JTTL 1LSAA 5LA5A 1NMMA 1BQLY 1KIPC 5APEA 1IOSA 4H8YA 2W1MA 7LYZA 1C45A 3WPJA 1B7RA 2HEBA 1FKVA 4N8ZA 1HELA 2DKVA 5KXTA 4II8A 3TXBA 4IJ4A 2VB1A 2N5ZA 1INUA 1LZ4A 1LJJA 1YAMA 4N0JA 4NGVA 1LHMA 1GE1A 1FLWA 1IEEA 3P65A 4Z98A 1UCOA 1GEVA 4RW2A 1IIZA 2BLYA 5IDDA 4LYMA 4YENA 4RW1A 3W6FA 5C6IA 5KXLA 3RZ4A 1WQRA 3WW5A 3P64A 1B7NA 1IWVA 1HSWA 4PRQA 1CJ8A 3B0IA 1FLYA 2H9KA 1PS5A 2PC2A 3A6BY 5APFA 3TXGA 1O23A 1J1OY 3LZ2A 4H93A 1B7SA 1RE2A 4KT3A 3A95A 1A4VA 1YKZX 1HERA 5JENB 4HPIA 4WM1A 2FYCA 1OUBA 1PZYA 1JSEA 4PHIA 1J1PY 1JEFA 2BQCA 2HECA 2MEBA 4XN6A 3A3RX 1NBZC 2MEEA 1QSAA 5EBHA 3QE8A 4H9EA 1CNSA 2GV0A 5B06A 4J1BA 2FBBA 4NWEA 1OUJA 2BQFA 1CKGA 1KIQC 1GF4A 2BQHA 1GFVA 1LJFA 5KKIA 1GB7A 5D5CA 1IX0A 1LYYA 3B72A 1LSZA 1LYSA 5LXWA 3TMUA 1RCMA 1LKSA 4H9CA 1WQPA 2CJLA 1CJ9A 4HJYA 4ML7A 1JITA 1GEZA 1TDYA 1WVUA 5A3ZA 1B9OA 3HBHA 1LSNA 4G9SA 1JISA 3AGGG 1LJHA 5KXPA 3WL2A 1LJIA 4WLXA 2IHLA 1LYZA 2EIZC 4DD7A 3WPKA 1GE3A 1AM7A 2D4JA 4DT3A 1JJ0A 4DDAA 1KIRC 1YAQA 4J7VA 1KXXA 2XJWA 4YOPA 4ETEA 1HEMA 4GN3A 1CJ6A 4XYYA 5L3IA 1DI5A 1LSGA 1GBWA 1HC0A 4NGZA 2DQCY 3B6LA 3BKHA 3A6CY 3CB7A 1IP4A 2MEAA 2LYOA 2F2NA 1D0LA 2ZNXY 5J7CA 4FDYA 1LJ4A 1HHLA 4HJZA 1LZBA 1RJCB 1UIHA 5FEKA 1ZV5L 1BWHA 4DD3A 2G4QA 3J4GA 4WO9A 1UIGA 1GAYA 2HEEA 1GBZA 3N9CA 1LJKA 5F9XA 1HFYA 2DQIY 3AZ5A 3CT1A 4I0CA 1V7TA 4TSCA 5HMJA 4ET8A 4DDCA 1UIBA 4ZIXA 5F14A 5KKJA 1D0KA 2RSCA 1IP7A 1NDGC 1UIFA 3TXFA 3WVYA 3LYZA 5IELA 5HNLA 1T6VL 5HNCA 2EPEA 1GFEA 4NGOA 1REYA 1QTEA 133LA 1SQ2L 1GF0A 1DKKA 3AGHA 4B4IA 1IP5A 1JHLA 1LKRA 1LSCA 1V7SA 3WMKA 4EOFA 5I4YA 4G49A 3WH1A 1IWUA 4BADA 4NGIA 1GDWA 1WTMA 1NHEA 1Z55A 4X3BA 5APDA 4R0FA 4LYTA 1IR7A 1RI8B 2Z37A 1AT6A 1ZVHL 2I26L 1D6PA 3HBEX 2DQGY 1XEJA 5I53A 1GBYA 1HEWA 4H1PA 4Z46A 4XENA 1LSPA 1KXYA 5LA8A 2HEFA 2HEDA 5HLLA 3AJNA 1LOZA 1GF8A 3SP3A 4GCDA 2F4GA 1H87A 1G7LC 2FYDA 1W08A 1IOQA 1BHZA 4QGZA 4HSFA 1GFAA 3P68A 3W6CA 1UICA 5IHGA 4U3XB 4WOAA 4B4EA 3RW8A 4Z3MA 4H9IA 1BVXA 1GB2A 1JKAA 1LZ9A 4NWHA 3TMXA 1J1XY 3EXDA 4GCCA 1HFXA 4KPMA 3TXJA 2YDGA 1LZ1A 1FKQA 1IY4A 2G4PA 1D6QA 4XJFA 5B05A 4H9AA 2WARA 3T6UA 2MEFA 3ATOA 3D3DA 1FLQA 1B7PA 1LSDA 1UBZA 2XBSA 3LHMA 3A3QA 4P2EA 4PPOA 1OUAA 1H6MA 5F16A 2B5ZA 1IOTA 1HSXA 8LYZA 5I4XA 5LVHA 3WUMA 3E3DA 3CT5A 1LMCA 1A2YC 2BQJA 3BKVA 1LZNA 5FDJA 1I1ZA 3RNXA 3W6EA 5LAGA 3K3TA 4YF2A 5A3EA 4UWUA 1D9UA 2Z38A 1W6ZA 3CT0A 5LYMA 3ULRA 3TXDA 4J0LA 5I54A 6LYTA 4HV2A 1GB9A 1XFPL 3T36A 3RU5A 3TMWA 1BB6A 1SLYA 3IJVA 3B0KA 1AKIA 1LZ8A 1B7OA 1XGTC 3WU9A 4ETDA 3AGIA 1NQIA 1DPXA 4C3WA 1LZEA 1B7LA 2BAAA 4TUNA 4XJIA 4ET9A 1IY3A 3GXRA 1E8LA 2A7FA 1B5WA 4OOTA 4O34A 1QUSA 2XBRA 5E9RA 4WM4A 4WL6A 1IR9A 1VATA 4XJHA 2I25L 3A94A 3AZ4A 1UUZC 9LYZA 193LA 1GE0A 2ZNWY 4OWCA 5LVIA 3W3EA 4ANRA 4B49A 1GF3A 1UACY 2YBNA 4N1CC 3MGWA 4NG8A 3AZ6A 1AT5A 4LFXA 2CWIA 4OWHA 1BWJA 1GFTA 2Z12A 1CJ7A 1LHHA 1XGUC 2BQBA 3WW6A 1C43A 2ZILA 2BLXA 1YAPA 1HMKA 1F10A 3AZ7A 2MEIA 3KAMA 4H94A 5KXRA 1GFRA 3WUAA 3W6DA 4NIJA 1JIYA 1GB8A 2DQDY 2BQKA 2YBLA 4NGWA 3ZEKA 1T3PA 5AMYA 6LYZA 2Z2FA 2D4IA 1B5VA 2MEDA 1LCNA 4UWNA 4WMGA 2ZWBA 1GBXA 3M3UA 1OP9B 4AXTA 4OWEA 2Q0MX 1G7MC 3GXKA 4LYOA 4R6CA 194LA 2BQNA 2BQAA 3WVXA 1FBIX 4H92A 1GF7A 4TWSA 1GB3A 4ETAA 3FI7A 1BVKC 4B4JA 1LZSA 3A34A 4H9HA 4LFPA 5B07A 4LT0A 4Z41A 3OK0A 1B7QA 1LSEA 5F9UA 1BB7A 1DI3A 1CKFA 3CSRA 4I8SA 5FCPA 1C08C 5DM9A 2CGIA 2F30A 4BAFA 1IP1A 4E3UA 2LHMA 1F6SA 1REXA 5DN4A 2YBMA 1HEPA 1YIKA 153LA 4DD2A 4WM6A 1UIAA 4IATA 2LYMA 1OUHA 4CGEA 2DQFC 4HPEA 4NGKA 4G4CA 3AW7A 5KXOA 1QSWA 4EMNA 1VAUA 2EQLA 4NSGA 4CFOA 1IORA 3W6BA 3F6ZA 3ZVQA 1BGIA 1JSFA 1NKHA 132LA 2HU3A 1GFJA 3AB6A 4H91A 3EO5A 2G4NA 5I4WA 1OUEA 5L3HA 3TXKA 208LA 2XTHA 1ZMYL 2F4AA 1JTPL 1LHIA 2CDSA 1XEKA 2YBJA 2C8OA 5DLAA 5KXYA 1GBOA 4TX7A 4LZTA 2NWDX 1NDMC 2ZIJA 2ZQ4A 5LIOA 4A7DA 5L9JA 4HTQA 1IR8A 1JKCA 4NSJA 4KL7A 207LA 1GPQC 4WLTA 4WO6A 1XEIA 4W94A 1BWIA 1LJGA 3A92A 1GE4A 1WTNA 3OJPA 1QTKA 3ZVQB 4DD0A 1GB0A 135LA 1UIDA 3LYTA 1GFUA 5B1GA 5B59A 1BB4A 4DYGA 1EQ5A 4ZEEA 1ALCA 4HV1A 4OWAA 1LHKA 5I5QA 1YKXX 1B0DA 1HEOA 4WLYA 1YILA 5ILFA 2W1YA 2ZYPA 4W96A 1GE2A 2BQOA 4KXIA 1QUTA 4XADA 1IVMA 1FN5A 3W6AA 2BQEA 1MLCE 2HTXA 4DD1A 1LSYA 1LMPA 3QY4A 4WM3A 5F81A 1TBYA 1I56A 1IC7Y 1TEWA 2Z2EA 3B0OA 5LVKA 1LSBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Z18A 1P37A 1LJEA 1D2YA 2RB0X 5DL9A 4W52A 189LA 3WUNA 3TMVA 1D3NA 3QNGA 1CKHA 1KY0A 2LZ2A 4ETCA 1OV7A 2BQLA 3A67Y 3TXIA 3IJUA 1EL1A 1L62A 4G4BA 3AYQA 4NFVA 3G3AB 1EQEA 4NHSA 3C8QA 2D6BA 2EKSC 183LA 1PQDA 5LAFA 2I6ZA 5KXKA 5I14A 2DQAA 4OOOA 4MR1A 184LA 1G1VA 4B1AA 4N9RA 2W1XA 4LGKA 1DKJA 4NGLA 3WYHA 4QY9A 144LA 5KXMA 1G7HC 1GXV2 2O79A 1L04A 3M18B 4GN4A 1LZGA 4TSBA 4WG1A 5KXWA 1LHJA 2D91A 4RLMA 4H9FA 4LT3A 3G3BB 5M1YA 1GF5A 2RBSA 1L56A 1JUGA 1HEQA 1WQNA 3ATNA 1OUFA 4TTDA 1BB5A 4C5FA 1VFBC 1I6SA 1EPYA 1LZ5A 4ETBA 5FSTA 1LYGA 3A93A 2NTHA 247LA 1CUQA 3PDSA 198LA 1L76A 1LGXA 3IWRA 1LZTA 4LYBA 2DQEY 1C6NA 1LI3A 1NWGA 4B0DA 3WXTA 2HUMA 5APCA 3A91A 1GD6A 4J1AA 5HQ1A 1IWXA 3SB9A 1JKBA 1L06A 1DZBX 4NSHA 1DQJC 5C6LA 5KXSA 1GB5A 2BQIA 1SWYA 212LA 4L41A 5II3A 4HJVA 1P6YA 2RBPA 1JPOA 2B6TA 3HU8A 1JTTL 1LSAA 1IOSA 3WPJA 1B7RA 1FKVA 4I7NA 4N8ZA 1HELA 2DKVA 2LCBA 3TXBA 2N5ZA 1INUA 2CUUA 1LHMA 1L52A 1FLWA 3P65A 1UCOA 4RW2A 1L58A 5IDDA 1OWYA 1CV6A 5KXLA 1LYJA 257LA 1CJ8A 150LA 1L53A 176LA 1L0KA 2A4TA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1LZD A;  4GCE A;  2Z39 A;  1VDS A;  4H8Z A;  1YKY X;  2FBD A;  2Z18 A;  2MEC A;  1LJE A;  4N5R A;  5FHW A;  4MST A;  5DL9 A;  4DDB A;  1OQM A;  5E4P A;  5FEL A;  4M4O A;  2YBI A;  3N9E A;  3WUN A;  1JTO L;  2C8P A;  1LZC A;  3TMV A;  1GHL A;  2ZYC A;  1IP3 A;  3QNG A;  3TXE A;  4NG1 A;  1GWD A;  1CKH A;  1MEL L;  2BQM A;  2LZ2 A;  3N9A A;  4GN5 C;  4ETC A;  4ZFP A;  1LPI A;  2YVB A;  4PRU A;  5LIN A;  2BQL A;  3A67 Y;  3TXI A;  3IJU A;  1GF9 A;  2ZIK A;  1EL1 A;  4H90 A;  4N1E I;  4YEO A;  1FDL Y;  2AUB A;  4WLD A;  4G4B A;  3AYQ A;  4NFV A;  5DN5 A;  4CHX A;  1OUC A;  5C6J A;  2Z19 A;  3G3A B;  5ILC A;  1EQE A;  4NHS A;  1HF4 A;  5T3F A;  1JWR A;  2D6B A;  3P66 A;  1YL0 X;  1LTM A;  3EBA B;  2EKS C;  1LYO A;  1XSF A;  4LT2 A;  4OW1 A;  3J6K A;  1LSF A;  5LAF A;  5LYZ A;  1NF5 A;  2I6Z A;  4NY5 A;  1IWT A;  3RT5 X;  1YAN A;  4GCB A;  1IWY A;  2DQH Y;  4NGY A;  1C7P A;  3LYM A;  1HNL A;  4AGA A;  5KXK A;  5KXZ A;  4LYC A;  2BQG A;  1GB6 A;  2MEG A;  2DQA A;  4OOO A;  4QEQ A;  4MR1 A;  5K7O A; 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 1CKF A;  3CSR A;  4I8S A;  5FCP A;  1C08 C;  5DM9 A;  2CGI A;  2F30 A;  4BAF A;  1IP1 A;  4E3U A;  2LHM A;  1F6S A;  1REX A;  5DN4 A;  2YBM A;  1HEP A;  1YIK A;  153L A;  4DD2 A;  4WM6 A;  1UIA A;  4IAT A;  2LYM A;  1OUH A;  4CGE A;  2DQF C;  4HPE A;  4NGK A;  4G4C A;  3AW7 A;  5KXO A;  1QSW A;  4EMN A;  1VAU A;  2EQL A;  4NSG A;  4CFO A;  1IOR A;  3W6B A;  3F6Z A;  3ZVQ A;  1BGI A;  1JSF A;  1NKH A;  132L A;  2HU3 A;  1GFJ A;  3AB6 A;  4H91 A;  3EO5 A;  2G4N A;  5I4W A;  1OUE A;  5L3H A;  3TXK A;  208L A;  2XTH A;  1ZMY L;  2F4A A;  1JTP L;  1LHI A;  2CDS A;  1XEK A;  2YBJ A;  2C8O A;  5DLA A;  5KXY A;  1GBO A;  4TX7 A;  4LZT A;  2NWD X;  1NDM C;  2ZIJ A;  2ZQ4 A;  5LIO A;  4A7D A;  5L9J A;  4HTQ A;  1IR8 A;  1JKC A;  4NSJ A;  4KL7 A;  207L A;  1GPQ C;  4WLT A;  4WO6 A;  1XEI A;  4W94 A;  1BWI A;  1LJG A;  3A92 A;  1GE4 A;  1WTN A;  3OJP A;  1QTK A;  3ZVQ B;  4DD0 A;  1GB0 A;  135L A;  1UID A;  3LYT A;  1GFU A;  5B1G A;  5B59 A;  1BB4 A;  4DYG A;  1EQ5 A;  4ZEE A;  1ALC A;  4HV1 A;  4OWA A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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