3B0IA

Crystal structure of recombinant human alpha lactalbumin
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
121
structure length
121
Chain Sequence
MKQFTKCELSQLLKDIDGYGGIALPELICTMFHTSGYDTQAIVENNESTEYGLFQISNKLWCKSSQVPQSRNICDISCDKFLDDDITDDIMCAKKILDIKGIDYWLAHKALCTEKLEQWLC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural insights into the stability perturbations induced by N-terminal variation in human and goat alpha-lactalbumin
pubmed doi rcsb
molecule keywords Alpha-lactalbumin
molecule tags Metal binding protein
source organism Homo sapiens
total genus 39
structure length 121
sequence length 121
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3b0iA00
2D4JA 1GB2A 3A3RX 1ALCA 4LYMA 1CJ6A 1B5YA 5D5CA 5LYZA 2DQFC 1GEZA 1KIRC 1FKQA 3A6CY 2GV0A 1IP7A 1GFRA 1UIHA 4LT2A 3E3DA 2HUBA 4XJGA 3IWRA 3AJNA 1CKFA 4GN5C 4H9CA 4WLTA 1BB7A 1GAYA 5KXTA 3ATNA 4TWSA 1B5UA 4HSFA 2F2NA 4N5RA 5HNLA 4ZFPA 1REZA 1UIEA 4B49A 154LA 3AZ6A 3A6BY 5D5FA 3D9AC 3A94A 3ATOA 1OUAA 4DYGA 1DZBX 1YL1X 3TXFA 4BAFA 1LJ3A 5L9JA 1LJGA 1UA6Y 2D4KA 2FYCA 3FI7A 1QSAA 3D3DA 2LYOA 4NHPA 5JENB 4Z46A 1WQOA 1GB0A 1RE2A 4C5FA 3RW8A 4X3BA 3LN2A 2ZQ3A 1EQ5A 1LSAA 153LA 5F9XA 1BWIA 3AZ4A 1LZNA 1HEMA 1OUEA 1PS5A 4P2EA 1WVVA 2LZ2A 4NHIA 1GB9A 1LSCA 2BQIA 2HEAA 6LYTA 4LT1A 3W6CA 5FDJA 1IC4Y 1XSFA 4NG8A 1LMNA 3N9CA 1JTTL 3TMXA 1AKIA 1YAMA 1UIBA 4H9AA 1G7HC 1B7PA 4CFOA 4NSJA 1ZVYB 3BKHA 1GXXA 3P65A 2BQMA 4WG7A 4HTNA 4KL7A 5LVJA 1LSNA 1BWJA 1FKVA 1CKGA 2BLXA 1LZBA 2BAAA 1T3PA 1JTOL 1VATA 1VDQA 2ZNXY 1GFJA 1HEPA 1D0LA 2PC2A 3RT5X 1BB6A 3WPJA 1GFKA 3IJVA 3WUNA 4GLVA 5HMJA 1LMPA 1ZVHL 2ZWBA 3W6DA 5APEA 135LA 2DQIY 3A34A 3EXDA 3N9AA 1A2YC 2MEFA 1HELA 3AGGG 1JEFA 4PRUA 3CSQA 5LAGA 4GLAA 1C10A 4NIJA 3P66A 4EMNA 4H8YA 5B59A 4OWCA 2HEBA 4B4EA 2CWIA 2HEFA 4RW1A 5II3A 4B0DA 1DQJC 4DT3A 3A90A 5KXWA 1GF4A 1LJ4A 4I8SA 3QE8A 1WQQA 5KY1A 1JPOA 8LYZA 1H87A 5E4PA 5APCA 3TXDA 4UWNA 2C8OA 1C43A 1YKZX 1GD6A 5F81A 4M4OA 4XJFA 5APDA 3B6LA 1LHLA 2BQGA 1FDLY 5KXPA 1YKYX 2Z18A 1HEQA 4W96A 4H9IA 4G9SA 1NBZC 4DD0A 2HEEA 4N1CC 4WLYA 4H8ZA 7LYZA 3QY4A 1IP2A 1YAOA 4HV1A 3RZ4A 5A3ZA 4KT3A 3T36A 2ZYCA 2ZYPA 1T6VL 4ETAA 2LHMA 3W6EA 5LA8A 5FHWA 1GF6A 4QDNA 1V7TA 4E3UA 1JJ3A 3CT0A 3TXKA 3W6FA 1P2CC 3AYQA 4NY5A 4RLNA 2DQGY 4TUNA 1J1PY 1G7IC 5FELA 4OW1A 1IP6A 2VB1A 1IVMA 5I4YA 2MECA 5LVGA 4WOAA 1N4FA 1OUBA 4DD2A 1TDYA 1LAAA 2XBRA 1JJ0A 3CQLA 3VWOA 3P64A 1NHEA 1MLCE 1FLWA 3GXKA 1GBXA 2BQAA 4NGVA 5KXKA 1E8LA 3WW5A 5B05A 1B9OA 1UUZC 4DC4A 1IOQA 1GB6A 1REMA 4LYOA 1HC0A 1VDTA 1XGPC 4WO9A 1O23A 1GFHA 1DI4A 1VAUA 1BVKC 1JSFA 2YDGA 4PRQA 1LHIA 3W6AA 1OUJA 1CKDA 1B7LA 1GE1A 2MEGA 4J7VA 4XENA 1NQIA 1IP1A 1HHLA 1LYSA 1IWZA 5LVKA 1UBZA 3WUAA 2DQAA 4DD1A 5J7CA 3OJPA 4LFXA 4Z41A 1IC5Y 1LZYA 5LINA 1LYYA 1UIDA 4OOTA 1LJEA 4AXTA 4H1PA 1UICA 4C3WA 1C08C 1EQ4A 1SLYA 4LYTA 2Z38A 4QGZA 5KXZA 1B5WA 1BB5A 1W6ZA 4B1AA 1QSWA 3B0OA 1LJFA 1LMQA 4OOOA 1BWHA 2DQCY 3J6KA 1YIKA 1GF7A 2Z39A 3N9EA 3CT1A 2BQEA 1LSMA 1I1ZA 4AGAA 3A95A 5KKIA 3HBHA 2F4GA 3A91A 4HPIA 1F10A 5KXYA 3TXIA 1WQRA 2BQBA 1YILA 1GFVA 1HNLA 3LYZA 1AT5A 5I53A 1B5ZA 5KXOA 5K7OA 2H5ZA 4GN3A 1IY3A 1LJHA 1NDMC 1LYZA 2DKVA 4TSCA 4WG1A 1XEJA 1I20A 1JKCA 1QTEA 1MELL 1YAPA 4A7DA 1LSEA 2BLYA 1D6QA 5I4XA 3HFMY 1DKJA 1JTPL 1QDTA 4NSIA 1IR7A 1NWGA 1FBIX 1GF8A 1GEVA 1YQVY 2BQLA 1IWXA 4MSTA 4XJHA 1NBYC 2CJLA 5LA5A 4NHQA 1UIAA 4NGLA 1J1XY 1LMTA 1YANA 4KXIA 1B7QA 5KXNA 1D6PA 2BQCA 1TCYA 1LJKA 3WULA 4ZEEA 1WVUA 3TXEA 1IOCA 1GDXA 3CT5A 4WM6A 1YKXX 1B7NA 5E9RA 1IEEA 1YROA 1JUGA 3W6BA 5DN5A 2XBSA 1NF5A 1F6SA 1HFXA 1TEWA 1LZ6A 1OUGA 1HSWA 1GBZA 4L41A 1BB4A 3TMVA 4DWXA 1OUDA 3CB7A 1LZ1A 2HEDA 1IP3A 1GB5A 1KXWA 1LZCA 1TAYA 1J1OY 4O34A 1YL0X 2ZQ4A 4ANRA 1JKAA 3WXTA 1FLYA 3WU8A 3MGWA 2BQOA 3EO5A 1LKSA 4NWEA 1EL1A 1LCNA 3P4ZA 1RI8B 2I6ZA 4NGJA 1D9UA 1GFGA 4PPOA 1GF3A 1G7JC 2ZILA 2CGIA 2XTHA 3AGHA 5C6LA 1IOSA 4N1EI 4RDSA 4YF2A 1QDRA 3LYOA 3LZ2A 5F14A 1LZ8A 1HFYA 5FSTA 4UWUA 5DN4A 4NHTA 1GHLA 4U3XB 2G4NA 1D0MA 1LMAA 1HMLA 3A93A 1GF0A 1REYA 4ETDA 5KXMA 1NMMA 4OWBA 5I5QA 5IHGA 4D9ZA 4J1BA 1VDPA 1HENA 1LYOA 1VEDA 4WM2A 1GBOA 4ET9A 1DPWA 3AW6A 5KXRA 1KIPC 1UC0A 4WLDA 4HJYA 207LA 3K3TA 1IOTA 1LHMA 4MR1A 2MEIA 193LA 4DD7A 1NDGC 4GN4A 4YM8A 4LYCA 1GB8A 1UIFA 2MEEA 4WM3A 4NGWA 4DDCA 4H91A 1GFUA 1LJIA 1VDSA 4CJ2A 1GE2A 5C6IA 2LZTA 4LZTA 1IR9A 4XJDA 1OUFA 1FLQA 1GDWA 5F16A 2HTXA 6LYZA 4UWVA 1GBWA 2ZNWY 4IATA 5HLLA 2BQFA 3WU7A 4ZIXA 1IWWA 2MEBA 2HU1A 1DKKA 4BADA 4MCKA 1B7RA 1GB3A 3M3UA 1JIYA 4TX7A 1B7OA 1JSEA 5LIOA 4ETBA 4GCDA 1IORA 4CHXA 2I26L 4H90A 4OWEA 3WW6A 1JHLA 4RW2A 1HMKA 5M1YA 4W94A 1HF4A 1AM7A 1LZ4A 5C6JA 1F6RA 3ZEKA 2AUBA 1IO5A 4ML7A 1OQMA 1FLUA 1HFZA 2FBDA 2D4IA 4PHIA 4HTKA 5B07A 5LXWA 1LZAA 5IELA 5I54A 5ILFA 1JJ1A 1D0KA 5LAFA 1IWTA 1WQMA 4H9BA 2NWDX 1QUSA 3HBDA 4LT0A 3WVXA 1QTKA 3A67Y 4CFPA 2DQJY 4HP0A 1B0DA 4DDBA 1LZTA 3WUMA 1OUHA 1LKRA 3WU9A 1BB3A 2LYZA 2YSSC 2Z2EA 4LFPA 1AZFA 5L3HA 2YBNA 4DD9A 5KKJA 1LJJA 2WARA 1C46A 1JKBA 1RFPA 4LYBA 3WPLA 4Z3MA 5KXSA 2YBMA 2BQKA 4HV2A 4QY9A 4J0LA 5LVIA 1SQ2L 1LMOA 1RCMA 3BKVA 1LOZA 2D91A 2RSCA 1IWUA 4YOPA 3WH1A 1DXJA 1IIZA 1CJ8A 2EKSC 5LYTA 1LMCA 1LZ9A 1BHZA 1CKHA 3ULRA 1LTMA 1WQPA 4WL6A 2C8PA 5HNCA 3TMUA 1GAZA 134LA 1IC7Y 1BVXA 4G49A 3ZVQB 4GCBA 1LJNA 133LA 2DQHY 1JKDA 1GWDA 2Z12A 4I0CA 4NEBA 4G4BA 4NGZA 3SP3A 1LPIA 3KAMA 4H9EA 1XEKA 1CJ9A 3A3QA 4GCCA 2BQNA 2W1MA 1GE3A 3TXGA 2YVBA 5FEKA 1LSBA 1INUA 1C45A 1CJ7A 3QNGA 3A8ZA 1GF9A 1GFTA 4NGIA 1HSXA 2W1YA 1XGUC 4QEQA 1IY4A 1WTNA 1BGIA 4XADA 2X0AA 3M18B 1LZGA 4BS7A 1WTMA 5DLAA 3AGIA 1I56A 4KPMA 1HEWA 1W08A 3B0IA 4HTQA 5A3EA 3CSZA 1G7MC 1HERA 4II8A 1B5XA 4WMGA 5KXLA 1UCOA 1LZ5A 4G4CA 1LSGA 1GXV2 3ZVQA 1IX0A 5DM9A 3WYHA 4GCFA 1VFBC 5HQ1A 4NGOA 1AT6A 3A92A 1KXYA 4YENA 4WL7A 2YBLA 3W3EA 2G4PA 4WM1A 4ETCA 1LSPA 1WQNA 5FCPA 3WMKA 1F0WA 4WLXA 1GFEA 3TXBA 4LT3A 1JISA 2F4AA 1IWVA 1UIGA 4FJRA 1CNSA 4LYZA 4NHSA 5ILCA 3TXJA 2H9JA 3T6UA 1JITA 3HBEX 1V7SA 5DL9A 2A7DA 1LHJA 3TMWA 2BQHA 1GBSA 2HECA 2Y8PA 3EMSA 4NSGA 2YBJA 1YAQA 1REXA 1B7MA 5B1GA 4ET8A 4PGJB 2ZIJA 3GXRA 3B0KA 1LZRA 2CDSA 4H93A 1C7PA 2G4QA 4NWHA 1GBYA 4ETEA 5KJ9A 1DPXA 1GE0A 1LZSA 2B5ZA 2BQJA 3LYTA 3WXUA 4OWHA 9LYZA 1LZDA 1DI5A 4HPEA 1QIOA 3WVYA 5F9UA 1IP4A 2BQDA 4HJZA 1GE4A 4HJVA 208LA 4J1AA 2XJWA 2Z37A 4IJ4A 2FBBA 1GFAA 3IJUA 1KXXA 4H9FA 1B7SA 2Z19A 4YEOA 1OP9B 3J4GA 4BAPA 1EQEA 1LHKA 2MEDA 2MEHA 4H8XA 1OUIA 1ZV5L 2EIZC 4B4IA 2W1LA 4NSHA 4GCEA 4NFVA 4N8ZA 2A7FA 4B4JA 4M6DA 1PZYA 5APFA 3FE0A 3LYMA 1B2KA 2Z2FA 4CGEA 1LSYA 4N0JA 194LA 4EOFA 1CKCA 2F30A 3AZ7A 3TXHA 5LYMA 1NKHA 1GF5A 3G3BB 3G3AB 5L3IA 1JWRA 3AZ5A 4YEMA 3WL2A 1XFPL 1LSZA 4XN6A 4DD3A 5KXXA 4FDYA 4NGKA 3LZTA 1IWYA 1TBYA 3AB6A 4H9HA 2EPEA 1LHHA 1G7LC 3EBAB 4N9RA 2YBIA 5B1FA 3WPKA 1QQYA 1XGTC 3CSRA 1A4VA 4R6CA 4XYYA 4XJIA 5IDDA 1RJCB 3P68A 2Q0MX 3RU5A 2D6BA 2I25L 1GPQC 2BPUA 1ZMYL 2YBHA 2DQDY 4OWAA 1DI3A 4DDAA 2IHLA 2DBTA 2MEAA 3F6ZA 4G4HA 1IP5A 4NG1A 4NGYA 4LGKA 5LVHA 1OUCA 1BQLY 1H6MA 4WO6A 1XGRC 1LZEA 5HMVA 3AW7A 2W1XA 1QUTA 4TTDA 2ZIKA 1LSFA 2FYDA 1B5VA 2HU3A 1KIQC 2H9KA 5T3FA 1XEIA 3LHMA 5EBHA 1Z55A 2IFFY 4H92A 2EQLA 4H94A 4R0FA 2LYMA 1HEOA 3OK0A 1UACY 3A96A 4RLMA 4TSBA 1FN5A 5AMYA 3RNXA 1GB7A 1LSDA 5B06A 4Z98A 1XGQC 3B72A 4WM5A 4IASA 2N5ZA 4WM4A 4PJ2C 2DQEY 4XJBA 132LA 1IR8A 5I4WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L94A 5D5CA 1GEZA 3A6CY 1L14A 1QS5A 3E3DA 4XJGA 1CKFA 1BB7A 1GAYA 3ATNA 4TWSA 5HNLA 4N5RA 4ZFPA 3DMZA 3HU8A 4B49A 1L31A 1DZBX 148LE 176LA 1LJ3A 1LJGA 2D4KA 2FYCA 1QSAA 254LA 1GB0A 1QT6A 1LYGA 3CDOA 4EKQA 153LA 239LA 1GB9A 6LYTA 257LA 5FDJA 1JTTL 1L36A 1YAMA 261LA 4H9AA 4ARJA 1ZVYB 1GXXA 3P65A 4GRVA 1L40A 4ARMB 1LSNA 1BWJA 1JTOL 2ZNXY 2PC2A 3F8VA 1QTVA 3WUNA 4S0WA 1C62A 214LA 1LMPA 5APEA 135LA 1A2YC 3AGGG 1JEFA 3CSQA 4GLAA 4EMNA 1L67A 2NTGA 4OWCA 4I7RA 2HEFA 4RW1A 3A90A 5KXWA 3QE8A 4W52A 3TXDA 4M4OA 1C43A 2RAZX 4XJFA 5APDA 160LA 5KXPA 2HEEA 251LA 1XJTA 1CV0A 109LA 5A3ZA 3T36A 1L50A 3HUQA 2RB2X 5FHWA 4QDNA 1V7TA 3W6FA 4NY5A 4TUNA 4OW1A 1N4FA 4ARPA 1LAAA 1C6BA 3VWOA 1L95A 1PQMA 5KXKA 230LA 1UUZC 1GB6A 1GFHA 2YDGA 1BVKC 1CKDA 1B7LA 4J7VA 4XENA 1HHLA 5LVKA 1IWZA 3WUAA 5J7CA 2DQAA 3OJPA 1UIDA 4AXTA 1LJEA 4C3WA 1C08C 1SLYA 4QGZA 4DQ7A 4B1AA 1LMQA 165LA 3N9EA 2BQEA 182LA 1JQUA 1LSMA 4DQJA 3HBHA 2F4GA 3A91A 5KXYA 1WQRA 2BQBA 1L01A 1GFVA 3LYZA 1L35A 5K7OA 2H5ZA 4TSCA 1NDMC 4WG1A 1LYZA 1XEJA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2D4J A;  1GB2 A;  3A3R X;  1ALC A;  4LYM A;  1CJ6 A;  1B5Y A;  5D5C A;  5LYZ A;  2DQF C;  1GEZ A;  1KIR C;  1FKQ A;  3A6C Y;  2GV0 A;  1IP7 A;  1GFR A;  1UIH A;  4LT2 A;  3E3D A;  2HUB A;  4XJG A;  3IWR A;  3AJN A;  1CKF A;  4GN5 C;  4H9C A;  4WLT A;  1BB7 A;  1GAY A;  5KXT A;  3ATN A;  4TWS A;  1B5U A;  4HSF A;  2F2N A;  4N5R A;  5HNL A;  4ZFP A;  1REZ A;  1UIE A;  4B49 A;  154L A;  3AZ6 A;  3A6B Y;  5D5F A;  3D9A C;  3A94 A;  3ATO A;  1OUA A;  4DYG A;  1DZB X;  1YL1 X;  3TXF A;  4BAF A;  1LJ3 A;  5L9J A;  1LJG A;  1UA6 Y;  2D4K A;  2FYC A;  3FI7 A;  1QSA A;  3D3D A;  2LYO A;  4NHP A;  5JEN B;  4Z46 A;  1WQO A;  1GB0 A;  1RE2 A;  4C5F A;  3RW8 A;  4X3B A;  3LN2 A;  2ZQ3 A;  1EQ5 A;  1LSA A;  153L A;  5F9X A;  1BWI A;  3AZ4 A;  1LZN A;  1HEM A;  1OUE A;  1PS5 A;  4P2E A;  1WVV A;  2LZ2 A;  4NHI A;  1GB9 A;  1LSC A;  2BQI A;  2HEA A;  6LYT A;  4LT1 A;  3W6C A;  5FDJ A;  1IC4 Y;  1XSF A;  4NG8 A;  1LMN A;  3N9C A;  1JTT L;  3TMX A;  1AKI A;  1YAM A;  1UIB A;  4H9A A;  1G7H C;  1B7P A;  4CFO A; 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 1EQE A;  1LHK A;  2MED A;  2MEH A;  4H8X A;  1OUI A;  1ZV5 L;  2EIZ C;  4B4I A;  2W1L A;  4NSH A;  4GCE A;  4NFV A;  4N8Z A;  2A7F A;  4B4J A;  4M6D A;  1PZY A;  5APF A;  3FE0 A;  3LYM A;  1B2K A;  2Z2F A;  4CGE A;  1LSY A;  4N0J A;  194L A;  4EOF A;  1CKC A;  2F30 A;  3AZ7 A;  3TXH A;  5LYM A;  1NKH A;  1GF5 A;  3G3B B;  3G3A B;  5L3I A;  1JWR A;  3AZ5 A;  4YEM A;  3WL2 A;  1XFP L;  1LSZ A;  4XN6 A;  4DD3 A;  5KXX A;  4FDY A;  4NGK A;  3LZT A;  1IWY A;  1TBY A;  3AB6 A;  4H9H A;  2EPE A;  1LHH A;  1G7L C;  3EBA B;  4N9R A;  2YBI A;  5B1F A;  3WPK A;  1QQY A;  1XGT C;  3CSR A;  1A4V A;  4R6C A;  4XYY A;  4XJI A;  5IDD A;  1RJC B;  3P68 A;  2Q0M X;  3RU5 A;  2D6B A;  2I25 L;  1GPQ C;  2BPU A;  1ZMY L;  2YBH A;  2DQD Y;  4OWA A;  1DI3 A;  4DDA A;  2IHL A;  2DBT A;  2MEA A;  3F6Z A;  4G4H A;  1IP5 A;  4NG1 A;  4NGY A;  4LGK A;  5LVH A;  1OUC A;  1BQL Y;  1H6M A;  4WO6 A;  1XGR C;  1LZE A;  5HMV A;  3AW7 A;  2W1X A;  1QUT A;  4TTD A;  2ZIK A;  1LSF A;  2FYD A;  1B5V A;  2HU3 A;  1KIQ C;  2H9K A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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