3C7ZA

T4 lysozyme mutant d89a/r96h at room temperature
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYASLDAVRHCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Contributions of all 20 amino acids at site 96 to the stability and structure of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
molecule tags Hydrolase
source organism Bacteriophage t4
total genus 54
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2008-02-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3c7zA00
2OU8A 3VW7A 1L33A 1I6SA 200LA 1L0KA 3DN1A 1C6EA 1L07A 1L56A 1PQMA 198LA 1L41A 3FI5A 6LZMA 3NY8A 4W52A 1KY0A 1LPYA 1L89A 1QT8A 3HDFA 1D3FA 3HT9A 1PQKA 255LA 5LZMA 247LA 1CX7A 3DKEX 3GULA 1L80A 4EKSA 111LA 175LA 1NHBA 4W51A 1G06A 1SWZA 233LA 1P5CA 1T8FA 2ANXA 146LA 180LA 1L97A 1L17A 1G1VA 1LYDA 248LA 1L77A 1CU5A 2F47A 1L51A 3HH5A 1L31A 109LA 3LZMA 1C66A 1G0MA 225LA 3QAKA 1T97A 1L68A 2QB0B 3DMZA 205LA 229LA 2LZMA 1T6HA 259LA 159LA 3OE6A 2B6TA 1L21A 3HUAA 1C64A 1DYCA 1QT3A 1C6NA 1JTMA 3C7ZA 4PJZA 1LYGA 1C6LA 3SBAA 1L48A 4DAJA 1CTWA 4I7JA 103LA 181LA 251LA 1QS5A 1OV7A 1L66A 1CUQA 2F32A 1C63A 1ZYTA 139LA 1SSYA 1QTHA 3DN8A 3L64A 1P64A 4ARLA 1D3MA 1L40A 2LC9A 1L72A 2B70A 3CDRA 1LGWA 1L86A 160LA 112LA 1L95A 3OE8A 2OE9X 1L91A 3SB5A 257LA 1L79A 1L34A 1L00A 169LA 4ARJA 1LLHA 3CDVA 3HU9A 127LA 1XEPA 3DN0A 1L62A 1LYEA 4EXMA 3HUQA 1L11A 2O79A 2F2QA 3HH6A 2O7AA 2RBRA 2B7XA 1L02A 1L70A 1QSQA 218LA 3DN2A 2B74A 1L85A 107LA 176LA 192LA 1C6HA 1L64A 1LYHA 1L01A 1L23A 2Q9EA 190LA 235LA 2RB2X 223LA 148LE 2LCBA 4ARQB 1OVJA 4I7MA 3FADA 1LI3A 3C81A 155LA 239LA 1QTDA 158LA 1L10A 1K28A 102LA 1L36A 2HUKA 201LA 3HT8A 1KNIA 1CUPA 3GUKA 1L27A 1L32A 1PQJA 4EKRA 162LA 1L30A 3L2XA 4DJHA 2OEAX 131LA 1C6MA 1L83A 1L57A 3F8VA 3DMVA 3OE9A 1C6FA 1QTCA 4W57A 1P36A 1L12A 4YXCA 191LA 1JTNA 2OU9A 1L90A 1L96A 1L08A 1L87A 3CDQA 4ARQA 1LW9A 1CV6A 1T8AA 2B6ZA 1QTBA 2CUUA 1LI6A 3CDTA 212LA 173LA 140LA 2RB1X 108LA 209LA 4LDEA 1LWGA 261LA 3GUJA 1L15A 4I7NA 2ANVA 167LA 1D3JA 258LA 4E97A 3HH4A 2O4WA 1G1WA 4I7PA 3GUMA 1L74A 3SB9A 145LA 1KY1A 1ZURA 189LA 3OE0A 130LA 215LA 1CX6A 1DYBA 1KS3A 4W55A 4ARMB 3FA0A 3SN6R 1L13A 2RBSA 147LA 262LA 4GRVA 2RBNA 1L0JA 177LA 2B73A 3RUNA 151LA 1L26A 1PQOA 2B6WA 150LA 1PQIA 2B72A 4W56A 157LA 3HUKA 4I7RA 250LA 3DN4A 1OVHA 2NTHA 210LA 1DYGA 3C83A 3C8SA 3DN6A 4EPFA 1G0PA 1OWYA 1QT5A 244LA 4ARPA 4W53A 1EPYA 1L63A 1L94A 197LA 1QUHA 1SSWA 182LA 4OO9A 3EMLA 1C65A 164LA 1P6YA 2B75A 4ARMA 184LA 1L42A 3G3VA 4IAPA 219LA 2RH1A 1L60A 1L59A 1C61A 1D3NA 2A4TA 1L09A 1OVKA 3GUPA 1B6IA 178LA 3K2RA 1SX2A 1C6GA 2B6YA 195LA 1D2WA 1L82A 1C6PA 104LA 1CU3A 7LZMA 156LA 161LA 152LA 1ZWNA 1L54A 1SX7A 3G3XA 3HDEA 1L92A 245LA 246LA 168LA 126LA 4I7OA 230LA 1QUOA 3D4SA 185LA 1G0KA 3PBLA 241LA 1L29A 122LA 1KW7A 120LA 1C60A 3NY9A 1XJTA 3DNAA 1CV1A 1L52A 249LA 4I7LA 4W58A 4EKQA 4I7SA 1CV3A 1L37A 1L49A 1P2LA 3DMXA 3HTBA 1KW5A 4YXAC 1P46A 1L75A 3V2WA 1DYAA 1OV5A 4I7TA 149LA 3DN3A 2RB0X 228LA 2L78A 4ZPUA 188LA 1L14A 1L93A 224LA 1L73A 196LA 1L39A 114LA 2IGCA 3GUNA 4LDOA 1C6IA 1L99A 170LA 4PK0A 3HH3A 4LZMA 1C62A 252LA 3RZEA 256LA 1CV4A 1C6KA 1OWZA 171LA 1L65A 221LA 4DKLA 1L47A 3JR6A 3HU8A 144LA 1L58A 1WTHA 1QUGA 1L16A 231LA 1L84A 1G0JA 236LA 2OTYX 113LA 1L76A 1L25A 142LA 1L71A 1D9WA 242LA 2Q9DA 4GBRB 3SB6A 1G0GA 3HTGA 3HTFA 2RAYX 1CV5A 216LA 1L20A 1TLAA 2Z6BA 4W59A 3HWLA 1P7SA 1SWYA 138LA 3SB8A 1C69A 3C7WA 254LA 222LA 1P56A 1L98A 1QSBA 2HULA 238LA 1L18A 214LA 2OE4X 4YX7C 3F9LA 2OE7X 1LYFA 3UONA 1CV0A 186LA 1C6AA 199LA 1L22A 2NTGA 1QUDA 2RBOA 1QT7A 1L06A 1L67A 174LA 3C8QA 3PDSA 143LA 128LA 1G0LA 1C6CA 165LA 1DYFA 1QS9A 260LA 2RBPA 3C7YA 2HUMA 1OYUA 3NYAA 2RBQA 1L04A 1L50A 1XJUA 118LA 141LA 1P2RA 213LA 1L03A 1L46A 1QTZA 1C6TA 1C6JA 1LI2A 123LA 232LA 166LA 1L88A 4S0WA 187LA 1L45A 1CU6A 1LGUA 211LA 227LA 3GUIA 226LA 1C6DA 217LA 2B6XA 1PQDA 1CVKA 3G3WA 1L81A 234LA 4I7KA 3C8RA 1P37A 2RAZX 1CU0A 183LA 3C82A 3SBBC 4LDLA 1LWKA 1QT6A 3HTDA 172LA 1DYEA 206LA 1L35A 125LA 1C6QA 1CU2A 3V2YA 2QARC 129LA 3C80A 240LA 137LA 1LGXA 2OTZX 1L61A 4EPIA 1LYJA 3SB7A 3ODUA 1G07A 5I14A 4AQNA 1D2YA 3HT7A 4I7QA 1C68A 163LA 1L28A 1L53A 1L19A 253LA 4EKPA 110LA 1L69A 1P3NA 3HT6A 1C67A 1QT4A 220LA 1JQUA 1L05A 1DYDA 2OU0X 3CDOA 1LYIA 1G0QA 119LA 1C6BA 4W54A 1T8GA 1L24A 1L38A 237LA 243LA 1L55A 1L43A 1QTVA 115LA 4EJ4A 4K5YA 1L44A 3GUOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3RNXA 5KXMA 1XEIA 4R0FA 4DDCA 5APDA 3WUAA 1L0KA 1CNSA 1L07A 4NGKA 3AZ7A 1DI5A 1L41A 1NDGC 5AMYA 5IELA 3WYHA 4W52A 1KY0A 1LPYA 1L89A 1GF3A 1JTOL 2DQEY 3DKEX 1CX7A 4EKSA 175LA 7LYZA 1SWZA 2W1MA 2ANXA 3WVYA 1L97A 1JJ0A 1LYDA 1L77A 1CU5A 3VWOA 3TMWA 109LA 3LZMA 1JHLA 2QB0B 1NDMC 4DDAA 205LA 4C5FA 3WUNA 2MEBA 3QY4A 259LA 3WU9A 2LHMA 3IJVA 5HMJA 4NFVA 4OWEA 1YAQA 3LYOA 2A7DA 1WQNA 4PHIA 1DYCA 1WQOA 1LTMA 5I53A 4RLMA 4OWHA 1C6LA 103LA 251LA 1JKAA 3WL2A 1LSFA 4GCCA 5IHGA 3DN8A 2Z37A 4RW1A 4CJ2A 1D3MA 1FKVA 2B70A 1OUJA 1LGWA 112LA 3ZVQB 3B0IA 4H8ZA 5HNLA 4EOFA 1L91A 3AW7A 5E9RA 4AGAA 1L34A 1L00A 169LA 4QY9A 4HJZA 2LYOA 3CSQA 1LPIA 1L62A 1LJEA 1LYEA 3HUQA 208LA 1TDYA 2F2QA 4ETCA 1LYSA 4UWVA 3CT1A 1OQMA 1L70A 1LJ3A 107LA 176LA 1L64A 4CGEA 2HECA 3LYTA 2XQOA 1JUGA 2D4IA 2LCBA 4WO9A 5ILFA 1OVJA 4I7MA 4NGLA 3FADA 1DI4A 1KXWA 1QTDA 1VDQA 158LA 4AXTA 5FDJA 1L36A 5IDDA 2XTHA 3HBHA 1PQJA 1HEOA 5LYTA 3L2XA 1C6MA 1NHEA 3DMVA 1C6FA 1GE3A 1VATA 4WM3A 1QTCA 1P36A 1L12A 3AZ4A 1BVXA 1LJJA 2OU9A 4G4CA 1L87A 1LW9A 1CV6A 5HNCA 1QTBA 2DQHY 3CDTA 5B05A 2YBHA 3IWRA 1E8LA 261LA 2B5ZA 3N9EA 1D3JA 3HH4A 1B0DA 2IFFY 3G3BB 1DPWA 4XENA 3SB9A 1LJGA 3OE0A 5LINA 215LA 2ZIJA 1OUDA 1F10A 4LYTA 4ML7A 1L13A 1YKZX 2RBSA 3N9AA 1XGRC 3HBDA 1I20A 5L9JA 1GB3A 2B73A 4GCBA 1L26A 1GFGA 1PQOA 1UIFA 2DQDY 4I7RA 250LA 1B7PA 2IHLA 3AGHA 3FE0A 1OVHA 4MR1A 3DN6A 1IORA 1QDTA 3A6CY 1WTNA 1UIHA 2HTXA 1OWYA 4WO6A 197LA 1QUHA 1LYZA 2MEHA 3EMLA 2B75A 3G3VA 1L42A 1OUGA 4LYOA 2A4TA 1GFHA 4BADA 1GEVA 3SP3A 1LHIA 1L82A 1CU3A 152LA 3T36A 1L54A 1C08C 1V7SA 2Z39A 2W1YA 230LA 3D4SA 4NGOA 4H9HA 1KW7A 2ZWBA 3W6AA 1CV1A 1LMAA 1L37A 1L49A 3W3EA 1P2LA 1B9OA 3V2WA 1JITA 3WU7A 3M18B 4I7TA 149LA 4NGVA 4I0CA 4WLYA 4ZPUA 188LA 1L14A 1L93A 224LA 196LA 2IGCA 1Z55A 1C6IA 170LA 4NGWA 5LVHA 2DKVA 1B2KA 3HU8A 1L58A 231LA 1L84A 1IP7A 1JKDA 1G0JA 1YL0X 1RJCB 4N1EI 3HFMY 1D9WA 242LA 2YBIA 1IY4A 3A8ZA 3AGGG 4NWHA 3HWLA 1QIOA 1C69A 1IEEA 3W6CA 222LA 1GDXA 1P56A 1QSBA 4MSTA 1HEWA 1TEWA 1YKXX 3F9LA 186LA 1C6AA 199LA 3W6BA 1L22A 2NTGA 4W96A 1L06A 1LHKA 1L67A 143LA 2MEAA 4LYCA 1C6CA 2VB1A 4WOAA 1DYFA 1IWXA 2EQLA 2RBPA 4GN3A 1UIBA 1OYUA 3A92A 1XJUA 1JJ3A 1LI2A 3J4GA 3TMVA 232LA 4S0WA 2G4NA 3ATOA 3TXDA 187LA 1CU6A 1LGUA 6LYTA 4TUNA 226LA 217LA 1EQEA 234LA 4I7KA 3C8RA 1P37A 1UICA 4H94A 1LWKA 2FYDA 4IATA 4B4JA 1QT6A 1LZTA 1RFPA 4OOOA 3V2YA 3A95A 4NSGA 4OOTA 5HMVA 4G49A 4NSJA 4ET8A 3QNGA 2H9KA 2D4KA 3HT7A 4I7QA 1L19A 2EPEA 253LA 5LAGA 110LA 1L69A 3HT6A 1RCMA 1XGTC 4NG1A 2LZTA 1DYDA 4WMGA 4N1CC 4UWNA 3WH1A 3TXIA 119LA 1IOTA 1WVVA 1L55A 1L44A 4RW2A 3VW7A 1GFEA 200LA 1CKDA 1IO5A 3DN1A 1G7LC 1C6EA 1LHLA 132LA 3W6DA 3FI5A 1XSFA 3FI7A 3GXRA 1LHJA 5FHWA 4LYZA 5ILCA 3WPLA 1G06A 1QUTA 4GCDA 233LA 1IOCA 5L3HA 2CWIA 1HFZA 4B49A 1WTMA 1GFAA 2BQLA 2F47A 2HEDA 1HC0A 4CFOA 1WQMA 2BQCA 1LSCA 1L31A 1SLYA 3IJUA 3QAKA 1NQIA 1T97A 2MEGA 1DPXA 1HFXA 1GF5A 2H5ZA 5EBHA 3AZ6A 3OE6A 3HUAA 1C64A 134LA 1VDSA 3C7ZA 4PJZA 1LYGA 4I7JA 181LA 5FELA 1IWYA 2F32A 1C63A 5I4XA 1LZ5A 1QSWA 1QTHA 3T6UA 4Z3MA 4DWXA 3L64A 4GLAA 1G7IC 3A90A 4ETAA 4ARLA 4EMNA 1L40A 2LC9A 4II8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3RNX A;  5KXM A;  1XEI A;  4R0F A;  4DDC A;  5APD A;  3WUA A;  1L0K A;  1CNS A;  1L07 A;  4NGK A;  3AZ7 A;  1DI5 A;  1L41 A;  1NDG C;  5AMY A;  5IEL A;  3WYH A;  4W52 A;  1KY0 A;  1LPY A;  1L89 A;  1GF3 A;  1JTO L;  2DQE Y;  3DKE X;  1CX7 A;  4EKS A;  175L A;  7LYZ A;  1SWZ A;  2W1M A;  2ANX A;  3WVY A;  1L97 A;  1JJ0 A;  1LYD A;  1L77 A;  1CU5 A;  3VWO A;  3TMW A;  109L A;  3LZM A;  1JHL A;  2QB0 B;  1NDM C;  4DDA A;  205L A;  4C5F A;  3WUN A;  2MEB A;  3QY4 A;  259L A;  3WU9 A;  2LHM A;  3IJV A;  5HMJ A;  4NFV A;  4OWE A;  1YAQ A;  3LYO A;  2A7D A;  1WQN A;  4PHI A;  1DYC A;  1WQO A;  1LTM A;  5I53 A;  4RLM A;  4OWH A;  1C6L A;  103L A;  251L A;  1JKA A;  3WL2 A;  1LSF A;  4GCC A;  5IHG A;  3DN8 A;  2Z37 A;  4RW1 A;  4CJ2 A;  1D3M A;  1FKV A;  2B70 A;  1OUJ A;  1LGW A;  112L A;  3ZVQ B;  3B0I A;  4H8Z A;  5HNL A;  4EOF A;  1L91 A;  3AW7 A;  5E9R A;  4AGA A;  1L34 A;  1L00 A;  169L A;  4QY9 A;  4HJZ A;  2LYO A;  3CSQ A;  1LPI A;  1L62 A;  1LJE A;  1LYE A;  3HUQ A;  208L A;  1TDY A;  2F2Q A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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