3C82A

Bacteriophage lysozyme t4 lysozyme mutant k85a/r96h
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLAPVYDSLDAVRHCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Contributions of all 20 amino acids at site 96 to the stability and structure of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
molecule tags Hydrolase
source organism Bacteriophage t4
total genus 57
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2008-02-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3c82A00
1OV7A 1QTHA 3C80A 226LA 1L89A 2RBQA 1LYJA 183LA 3HT8A 3L2XA 234LA 3HDEA 3EMLA 2HUKA 1D3JA 1C64A 1G1WA 159LA 1PQDA 1P6YA 1CV4A 175LA 3CDVA 1OVKA 1G0QA 1QTBA 5I14A 1C67A 199LA 181LA 1C6GA 4EXMA 229LA 228LA 114LA 2F2QA 3G3WA 242LA 166LA 3DMVA 4I7LA 155LA 1L80A 1EPYA 3GUIA 3DN4A 1QUOA 2OTYX 1PQKA 4EJ4A 1XJUA 1L38A 3SBBC 1CX6A 1L0JA 1L35A 1L91A 103LA 164LA 1P46A 1KY0A 205LA 2B6XA 1C6KA 1L73A 1WTHA 2RBOA 2QB0B 2LZMA 4DJHA 3OE0A 3GUJA 3SN6R 1L67A 3GULA 1L13A 1OYUA 1LI2A 169LA 2RBNA 233LA 1G0GA 3DKEX 3DN8A 146LA 262LA 1T6HA 112LA 1P2RA 1L06A 4I7NA 4EKSA 119LA 4YX7C 1L50A 1C6DA 247LA 3HTDA 2LCBA 1LYDA 1L60A 4K5YA 251LA 3RZEA 244LA 1L68A 110LA 3SB8A 1T97A 128LA 1L03A 3OE8A 1LGXA 4YXAC 4ARMB 130LA 2Z6BA 1L31A 3HH4A 3DMZA 3L64A 4OO9A 1L11A 1NHBA 2B75A 2NTGA 1CUQA 1L53A 3DN6A 1D3MA 3HU9A 1LGUA 1L52A 150LA 1L14A 158LA 162LA 1DYDA 1LI6A 1QTVA 2OE4X 3CDQA 3HTBA 2HUMA 3V2YA 189LA 1CX7A 1L96A 1C6EA 190LA 1L57A 2RBSA 3C83A 1L66A 1PQIA 1C60A 1P5CA 236LA 4W54A 2B6ZA 1L54A 1G1VA 1C6NA 1QT6A 1L23A 7LZMA 1L82A 4ARPA 3SBAA 1L41A 3DMXA 1L26A 1SSYA 1L64A 1SX7A 3DN1A 4ARMA 1L86A 1L04A 231LA 3C7ZA 4I7SA 3CDRA 3NY9A 1L30A 1OVJA 1CU5A 222LA 215LA 2OU0X 1DYFA 2OU9A 1CU0A 1L88A 195LA 1L40A 260LA 184LA 2OE9X 1LWGA 2O79A 1OWYA 2B6TA 1DYBA 1L49A 3FADA 3F9LA 1D2WA 145LA 148LE 259LA 111LA 5LZMA 186LA 1LI3A 1L51A 232LA 1QUGA 3ODUA 1QT7A 1C6QA 1P36A 227LA 1L21A 1L0KA 1XJTA 1C6HA 1L58A 4W56A 1QTZA 1G07A 4W58A 4ARQB 2RAZX 3HWLA 4W51A 1CV1A 3OE9A 4I7PA 2B6YA 1LWKA 3FI5A 182LA 1QTCA 3RUNA 1DYAA 1L69A 142LA 1L94A 1SX2A 3HU8A 196LA 3C82A 1L46A 2F32A 1XEPA 1JTMA 126LA 173LA 1C65A 1L01A 2CUUA 258LA 1L02A 4YXCA 129LA 3SB9A 256LA 4EKQA 2RBPA 2OE7X 1LYIA 1CV3A 1QSQA 2RAYX 217LA 4ARQA 4GRVA 1C6JA 4W53A 1CU2A 1L84A 2B6WA 254LA 4W59A 1C6PA 1L90A 1ZYTA 211LA 123LA 4ARLA 1L27A 4EPIA 171LA 4EKPA 1TLAA 212LA 1L25A 2B70A 118LA 3G3XA 3GUOA 1P2LA 224LA 147LA 1PQMA 1CU6A 120LA 3QAKA 178LA 1L85A 1C63A 2A4TA 1D3FA 180LA 122LA 1ZURA 219LA 2RB2X 127LA 2ANVA 2B74A 152LA 187LA 1QUDA 1C6TA 1G0PA 1QS5A 1L45A 163LA 3VW7A 239LA 1C66A 3F8VA 3GUPA 1L93A 198LA 3PBLA 4W55A 1LYHA 3HUAA 1LW9A 4EKRA 1L77A 216LA 1OVHA 240LA 3HT7A 1L71A 1L62A 1L05A 225LA 139LA 1T8FA 3SB5A 1C6FA 3CDOA 1QT4A 245LA 261LA 3DNAA 1L56A 3K2RA 1QTDA 255LA 4GBRB 1SSWA 252LA 174LA 1L55A 1LYFA 1L59A 2B72A 167LA 3SB7A 1C69A 177LA 209LA 230LA 1L98A 1D9WA 1L72A 102LA 1L10A 151LA 3NYAA 1CUPA 1ZWNA 131LA 4I7KA 4E97A 1QT5A 4ZPUA 1C6IA 1L92A 1L95A 3CDTA 2RB0X 185LA 1JQUA 1L81A 3G3VA 2O4WA 1QT3A 1L70A 1DYCA 1P56A 1L33A 1PQOA 3OE6A 4DKLA 144LA 4LZMA 4LDLA 6LZMA 1P37A 1L16A 1C6BA 200LA 1G06A 1L32A 221LA 2RH1A 3HTFA 220LA 140LA 4I7QA 1C6LA 1C6CA 1KY1A 3HT9A 2OTZX 1CTWA 1KS3A 1PQJA 3C8QA 1L97A 1L12A 1L28A 1CV5A 1L83A 2IGCA 1CU3A 4LDEA 1L79A 253LA 1SWYA 1OV5A 143LA 250LA 2OEAX 3DN3A 4PK0A 1LGWA 2HULA 1D3NA 1LPYA 2Q9EA 1L09A 214LA 3HTGA 1G0MA 248LA 2Q9DA 1QS9A 3C7WA 3C8SA 3LZMA 1L74A 160LA 109LA 1C61A 157LA 1L22A 1L36A 1T8AA 1L76A 2F47A 1L20A 3HT6A 1JTNA 1L39A 2LC9A 246LA 4PJZA 1C68A 1KNIA 2NTHA 3PDSA 4IAPA 168LA 1L18A 1T8GA 1G0KA 1L44A 2B73A 1CVKA 2OU8A 3GUKA 141LA 104LA 176LA 1G0LA 3D4SA 1L37A 3DN2A 1SWZA 1L19A 1I6SA 257LA 138LA 115LA 243LA 156LA 4I7RA 137LA 1DYGA 191LA 4I7OA 1KW7A 4ARJA 3HH5A 4EPFA 1L17A 1KW5A 113LA 1L48A 1B6IA 107LA 1LYEA 192LA 161LA 1OWZA 3DN0A 1L65A 2ANXA 1L63A 3HH3A 4I7JA 237LA 3HDFA 2L78A 4I7TA 4I7MA 1L75A 1P7SA 1C6MA 241LA 1C62A 3UONA 3HH6A 165LA 1DYEA 3GUNA 3HUQA 172LA 1L34A 223LA 2O7AA 3GUMA 3SB6A 1P3NA 4W57A 188LA 3C7YA 235LA 149LA 4LDOA 1L08A 3C81A 218LA 1L29A 1C6AA 3JR6A 2RBRA 3FA0A 197LA 201LA 1K28A 1QUHA 2B7XA 4S0WA 1L99A 213LA 238LA 1LYGA 1QSBA 125LA 170LA 1G0JA 2QARC 206LA 4AQNA 3C8RA 1L87A 1CV0A 1D2YA 1L43A 1L07A 2RB1X 3HUKA 1L00A 1L15A 1L61A 3V2WA 249LA 1CV6A 4DAJA 1L42A 108LA 1L47A 210LA 4W52A 1P64A 1L24A 3NY8A 1LLHA 1QT8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NHTA 3M3UA 1L89A 5F14A 1LYJA 4AGAA 183LA 3HT8A 1JITA 1IOCA 4TTDA 1G1WA 1D6PA 4NY5A 1CV4A 1YL0X 4TWSA 4OW1A 1HMKA 4EXMA 2IHLA 3KAMA 114LA 5KXWA 2ZILA 1I20A 4WL7A 1QUOA 1XJUA 1L38A 3SBBC 1L91A 164LA 1XEIA 2RBOA 1QDRA 1YAOA 4DJHA 4LYMA 5LVIA 1JKBA 1OYUA 2Z12A 233LA 1P2RA 1LMTA 1QUSA 1L06A 4EKSA 5KXNA 1F10A 1UCOA 1C6DA 3P4ZA 1LYDA 1CNSA 2DQJY 1YAPA 1NDMC 1AT6A 1GF4A 3RZEA 1FN5A 1LZ9A 110LA 1KIQC 3OE8A 4II8A 2BQMA 1HFZA 2Z6BA 3DMZA 1GFJA 3ATNA 4LZTA 1CUQA 1JKCA 5D5FA 3DN6A 1REXA 1REYA 2W1LA 1B5ZA 1LSPA 2BQCA 1LI6A 2OE4X 3CDQA 3HTBA 2HUMA 1HSXA 1B7NA 1L57A 1L66A 4NG1A 1NDGC 3AZ5A 1JEFA 3SP3A 6LYTA 1L82A 2EKSC 1C45A 4ARPA 1LZ5A 4I0CA 1SSYA 1SX7A 3J6KA 1XGQC 231LA 3C7ZA 3F6ZA 3CDRA 3NY9A 5KXLA 2F4GA 1JKDA 1CU5A 1NBYC 1L88A 4LGKA 4RDSA 4WLYA 1H6MA 2O79A 1IO5A 2BQEA 4HJVA 4XJHA 4DD2A 1L49A 3FADA 1IR8A 259LA 4FDYA 3ZVQB 4NIJA 1DI3A 1C6QA 1IY4A 1P36A 227LA 2DQHY 4HTKA 3LHMA 1L21A 1XJTA 4J1AA 1HEPA 1L58A 2G4QA 1QTZA 1LHJA 4W51A 1LJGA 3CT1A 3FI5A 1QSWA 1OUBA 1OUJA 1DKJA 1SX2A 3TMWA 2F32A 1LZCA 4L41A 1V7TA 1L01A 2CUUA 1HFYA 1UIDA 1WTNA 4WMGA 3SB9A 1N4FA 1UIGA 4I8SA 2F30A 1GEVA 2I6ZA 2B5ZA 4ARQA 4GRVA 1CU2A 254LA 3TXEA 1WVVA 4Z46A 3W6BA 1L90A 4PGJB 2A7DA 2YBHA 3WU9A 5FDJA 4EPIA 4A7DA 1SLYA 1TLAA 1MLCE 5ILCA 4DT3A 3A96A 1P2LA 2N5ZA 3WMKA 4Z41A 147LA 1GB5A 1PQMA 4W94A 5L3HA 1EQEA 4M4OA 3LZ2A 122LA 1LZBA 1YANA 152LA 1C6TA 1GDXA 1JTOL 1JSEA 4NGKA 3VW7A 1OVHA 3HT7A 225LA 3RT5X 1D6QA 3AW6A 1IP2A 1QTDA 255LA 1RJCB 1LZAA 2BQHA 1LYFA 3HBDA 3WUNA 8LYZA 1D9WA 1L10A 2D91A 1GB9A 1LSDA 1GBYA 4ZPUA 1C6IA 1LYYA 1L95A 2DBTA 1GAYA 3WUAA 2CGIA 1IWZA 3B0OA 1FKVA 1L81A 2G4NA 2O4WA 1QT3A 1L70A 1P56A 1L33A 1TAYA 1GE4A 4LZMA 4LDLA 1RFPA 1VDQA 1P37A 1L16A 5I4YA 200LA 1G06A 2H5ZA 2XBRA 1L32A 4WG1A 2MEDA 1IP7A 2YBJA 3A8ZA 2RH1A 3HTFA 4CGEA 153LA 140LA 1UIAA 2BLYA 5IHGA 1C6LA 1C6CA 1BWJA 3HT9A 2Z19A 1WQOA 3BKHA 1KS3A 1DI5A 3C8QA 4J1BA 1GFRA 1L97A 2CWIA 1CV5A 2HEAA 3WW6A 253LA 1JJ1A 4H92A 1D0MA 3AGGG 5HLLA 248LA 1QS9A 2FBBA 109LA 1HEWA 2XJWA 1GFTA 1L36A 2F47A 3HT6A 3LYZA 2LC9A 3A94A 4R6CA 1KNIA 4B0DA 4NGLA 1HEMA 4ETBA 1CVKA 3GUKA 5LYTA 1IP1A 3DN2A 1OUDA 1LSEA 5I5QA 1QSAA 4DD9A 5M1YA 3WVYA 1GAZA 1YAMA 1OUHA 4I7OA 4ARJA 3AGHA 1KW5A 2XQOA 113LA 1L48A 2ZNWY 1LYEA 3CSRA 1OWZA 4WM1A 5EBHA 4H91A 2MEGA 1BB6A 1YKXX 1LMQA 4YM8A 2L78A 1WQNA 1INUA 2LZTA 5F81A 1LSGA 1GF6A 3GUNA 3HUQA 172LA 223LA 2O7AA 1G7HC 4HJYA 5APEA 235LA 149LA 4LDOA 5I4WA 3RZ4A 1LHMA 4GCEA 2IFFY 3FA0A 4HPIA 201LA 3N9CA 4IASA 4TSCA 1E8LA 1DPWA 5LVGA 5C6LA 3N9EA 1QSBA 3B72A 1L87A 5DLAA 1L15A 5DM9A 3V2WA 1L42A 2H9KA 5II3A 5KY1A 1L24A 1LCNA 1UIHA 1DPXA 3C80A 226LA 4PRUA 1LZRA 3L2XA 234LA 3EMLA 1D3JA 1F6SA 4OOOA 1NF5A 1AZFA 5J7CA 1JJ0A 4OWBA 5I14A 181LA 5LVJA 2G4PA 2F2NA 228LA 4ZIXA 166LA 3DMVA 1AT5A 4I7LA 155LA 2XTHA 2Z18A 3GUIA 6LYZA 3EMSA 4EJ4A 1OUGA 1P46A 1KY0A 2H9JA 1L73A 1WTHA 3A3RX 5KXMA 5APCA 3WXUA 3ATOA 3OE0A 1JKAA 3GUJA 5B05A 3GULA 1LMPA 3VWOA 4ETEA 169LA 1LYSA 2RBNA 2NWDX 146LA 4H8XA 3P64A 2C8OA 132LA 119LA 4N8ZA 4LFPA 1FLQA 5LAFA 1L60A 3A91A 1BGIA 1LJJA 1GB7A 1GF9A 4H9IA 1L68A 128LA 4NSGA 3WYHA 4YXAC 1HSWA 4UWVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4NHT A;  3M3U A;  1L89 A;  5F14 A;  1LYJ A;  4AGA A;  183L A;  3HT8 A;  1JIT A;  1IOC A;  4TTD A;  1G1W A;  1D6P A;  4NY5 A;  1CV4 A;  1YL0 X;  4TWS A;  4OW1 A;  1HMK A;  4EXM A;  2IHL A;  3KAM A;  114L A;  5KXW A;  2ZIL A;  1I20 A;  4WL7 A;  1QUO A;  1XJU A;  1L38 A;  3SBB C;  1L91 A;  164L A;  1XEI A;  2RBO A;  1QDR A;  1YAO A;  4DJH A;  4LYM A;  5LVI A;  1JKB A;  1OYU A;  2Z12 A;  233L A;  1P2R A;  1LMT A;  1QUS A;  1L06 A;  4EKS A;  5KXN A;  1F10 A;  1UCO A;  1C6D A;  3P4Z A;  1LYD A;  1CNS A;  2DQJ Y;  1YAP A;  1NDM C;  1AT6 A;  1GF4 A;  3RZE A;  1FN5 A;  1LZ9 A;  110L A;  1KIQ C;  3OE8 A;  4II8 A;  2BQM A;  1HFZ A;  2Z6B A;  3DMZ A;  1GFJ A;  3ATN A;  4LZT A;  1CUQ A;  1JKC A;  5D5F A;  3DN6 A;  1REX A;  1REY A;  2W1L A;  1B5Z A;  1LSP A;  2BQC A;  1LI6 A;  2OE4 X;  3CDQ A;  3HTB A;  2HUM A;  1HSX A;  1B7N A;  1L57 A;  1L66 A;  4NG1 A;  1NDG C;  3AZ5 A;  1JEF A;  3SP3 A;  6LYT A;  1L82 A;  2EKS C;  1C45 A;  4ARP A;  1LZ5 A;  4I0C A;  1SSY A;  1SX7 A;  3J6K A;  1XGQ C;  231L A;  3C7Z A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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