3CSZA

Crystal and cryoem structural studies of a cell wall degrading enzyme in the bacteriophage phi29 tail
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
159
structure length
159
Chain Sequence
MVYVSNKYLTMSEMKVNAQYILNYLSSNGWTKQAICGMLGNMQSESTINPGLWQNLDEGNTSLGFGLVQWTPASNYINWANSQGLPYKNMDSELKRIIWEVNNNAQWINLRDMTFKEYIKSTKTPRELAMIFLASYERPANPNQPERGDQAEYWYKNLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal and cryoEM structural studies of a cell wall degrading enzyme in the bacteriophage phi29 tail.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Morphogenesis protein 1
molecule tags Hydrolase
source organism Bacteriophage phi-29
total genus 61
structure length 159
sequence length 159
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF18013 Phage_lysozyme2 Phage tail lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3cszA00
1DKKA 3T36A 4MR1A 4X3BA 4B4IA 5B07A 3AZ5A 4N1CC 1WQQA 5B59A 2DQFC 3CSZA 4H9EA 1LMQA 1LMTA 3AZ6A 1WQMA 4GCEA 3P4ZA 1B7MA 3LYOA 4WOAA 4ETAA 1REXA 2BQCA 3A6CY 1LJ4A 1LMCA 4GCDA 4GN4A 5KKJA 5KXRA 1DZBX 1HEMA 1LSMA 1LZNA 3QE8A 2Z38A 4R0FA 4WM5A 1HEOA 3W6FA 4HJVA 4GCCA 133LA 5B06A 5AMYA 1LZTA 2MEEA 2ZQ4A 5KXZA 4PRQA 3WU7A 1NDGC 1LZGA 1VEDA 3CSQA 1NF5A 2HECA 4OWBA 2C8PA 4WLDA 3TXGA 153LA 4XYYA 1VFBC 1GDWA 2BQDA 1IWYA 1FN5A 2BLYA 2I26L 4ML7A 4P2EA 1B5UA 4QDNA 3ZVQA 2FBBA 1GB2A 3A91A 2C8OA 1IOQA 2DQDY 1GF3A 1BB7A 1WQRA 2EPEA 4HJZA 4NEBA 3WYHA 4KT3A 1VDPA 2BQKA 1OUCA 3IWRA 1GAYA 4M4OA 1GE2A 134LA 1GB3A 3IJUA 2LYZA 5LINA 4WG7A 1HMKA 3LYTA 1NMMA 1LZYA 4I0CA 4O34A 1P2CC 3K3TA 1JTPL 4UWUA 1YAQA 1IOCA 1V7TA 2LZTA 2HEEA 1HELA 2Z39A 5KXLA 1G7IC 1XGUC 4H9CA 4IJ4A 2YBNA 1ZV5L 3P66A 3QNGA 8LYZA 3B72A 1TDYA 3A95A 1VATA 4AXTA 5IELA 1IOTA 2MEDA 4LT3A 3N9AA 4XJHA 1DQJC 5C6IA 2CWIA 4J7VA 3AJNA 1FBIX 2YBIA 4GN5C 4RLNA 4LYZA 4NSIA 1B2KA 1HENA 1QUTA 1SQ2L 1J1OY 2IHLA 1J1PY 1LMPA 1B5YA 1EL1A 4LT0A 4WLYA 3A94A 1XGRC 4WL6A 5D5CA 5HMJA 3WULA 1JJ0A 3AW7A 4OWEA 1BB5A 2B5ZA 1B7RA 2DQIY 2HEFA 4J1BA 4MCKA 4WG1A 3FI7A 4NHPA 4DT3A 5J7CA 5LA8A 1NQIA 1JIYA 1DXJA 2PC2A 1OUBA 2DQGY 4A7DA 1IR7A 1C46A 2AUBA 1BGIA 3EMSA 1WVVA 1IP6A 1LZ5A 4WM2A 1B7QA 2MEAA 4LZTA 4D9ZA 1C43A 1C45A 1VDTA 1VAUA 1GBSA 4DDAA 1GXXA 4QY9A 4OWCA 1HFZA 3N9EA 4EOFA 1C7PA 1NBYC 3MGWA 3N9CA 3A34A 2MEHA 3RT5X 1GE1A 1D6QA 2A7DA 1LJHA 2F30A 4TSBA 5FHWA 4FJRA 5FCPA 5KXKA 5A3ZA 2BQBA 3EBAB 4YF2A 4TSCA 4H90A 193LA 1QSWA 1YL0X 4NGOA 4NIJA 1LZCA 2NWDX 5LVJA 1CJ8A 1GFRA 4N9RA 5IDDA 1GDXA 1GFKA 1QSAA 1NDMC 3AW6A 5APCA 4H9IA 4M6DA 3J4GA 5KXXA 1MLCE 1REYA 4LT1A 5HLLA 4C3WA 2DKVA 4UWNA 3A6BY 4NSHA 1JTOL 2CGIA 2LHMA 2EQLA 2I25L 135LA 2ZYPA 4H1PA 1LCNA 2Q0MX 4NGWA 5KXNA 3B0KA 4DD7A 5HQ1A 5F16A 1IWXA 1IC7Y 1N4FA 2W1MA 2Z19A 1GE0A 4UWVA 5I54A 3OK0A 3E3DA 1BHZA 5LA5A 208LA 4WM3A 3P65A 4CFPA 2Y8PA 1I56A 4PRUA 1IP7A 2MEGA 1IWTA 1GF4A 4NSJA 5FDJA 1F0WA 4CGEA 1JKCA 3WXTA 3W6DA 4E3UA 4R6CA 4BS7A 1B5VA 1CKDA 1LMOA 1F10A 1QIOA 1WQOA 1IP1A 5KKIA 2D4JA 5FEKA 1VDSA 1VDQA 1UIBA 1WTMA 1YKYX 4QGZA 5LYMA 1TCYA 2YBJA 5DN4A 5JENB 4IASA 2G4QA 1IP3A 2XJWA 2YBMA 1LSAA 3WVYA 1DI5A 1JUGA 1LHIA 3CSRA 4LFXA 4N8ZA 5F9UA 1BQLY 1LJNA 3AGIA 1H6MA 5KXPA 4AGAA 4Z46A 1IY3A 2X0AA 1B7SA 1GF5A 2ZWBA 4DWXA 4ZEEA 1GF0A 2H5ZA 1LMAA 2DQHY 4N0JA 3W6BA 4ZFPA 1AM7A 1B7PA 4NY5A 2DBTA 1QDTA 5LAGA 1LSPA 1LHHA 1GFGA 1OUIA 2DQAA 4XJDA 4HPIA 4OW1A 4EMNA 1GPQC 2ZNWY 1FLUA 2DQCY 1GHLA 4CHXA 1LSCA 4G9SA 1JKDA 4NGZA 3BKHA 3ATNA 2HUBA 3KAMA 1GB5A 5APFA 5KJ9A 1LZEA 1NBZC 1BB6A 3A8ZA 1HSWA 3AB6A 1UIHA 4CJ2A 1I1ZA 2W1XA 4XENA 5I53A 1XEIA 4OOTA 1CJ9A 4II8A 5IHGA 1LZ9A 3P64A 4WMGA 5B1GA 2LZ2A 3RZ4A 5LYZA 4DD3A 2BQEA 4G49A 1LZSA 4TX7A 4U3XB 4N1EI 3VWOA 1GFVA 1AZFA 3RU5A 1LZRA 2HEDA 1LYZA 4PGJB 4XN6A 3A92A 2ZIJA 3AZ7A 2DQEY 3WU9A 1LZDA 4NWHA 2ZILA 154LA 4Z3MA 2FBDA 5LAFA 1IWUA 2Z12A 4NG8A 1NWGA 5FSTA 4BAPA 3ZEKA 3TXHA 1XGPC 3TXJA 5HMVA 1LHJA 4HV2A 2BQNA 5KXYA 4H8YA 4Z41A 4J1AA 1XFPL 4DDCA 1G7LC 4HTNA 2D4KA 3IJVA 2D4IA 1UUZC 1TBYA 2XTHA 1LYSA 4PHIA 3WMKA 4B49A 1AT5A 1OQMA 1QDRA 4FDYA 4HPEA 3WVXA 1LJKA 3LHMA 1HNLA 3WUMA 1JJ1A 5LVGA 3WW5A 5C6LA 4PJ2C 1OUGA 1UA6Y 4Z98A 5LVHA 1CKCA 1LSFA 1LJIA 4J0LA 194LA 2BQLA 1IX0A 5F81A 2D91A 1GWDA 1MELL 3P68A 5ILFA 1BWIA 1NHEA 5ILCA 1IO5A 2IFFY 5LIOA 3LN2A 3WUNA 1DPWA 3TMXA 3WW6A 4RW2A 4B1AA 1IR9A 2EKSC 1LSYA 3BKVA 4H93A 5E9RA 5I4XA 3CQLA 1LTMA 3G3BB 3WPKA 1GBWA 1ALCA 1BB3A 4ETBA 1IP4A 1YKXX 1JTTL 3D9AC 4OWAA 2G4NA 2A7FA 1RFPA 1YKZX 4WLXA 3WPJA 1KIRC 5A3EA 6LYTA 3TMUA 1B0DA 1LJFA 1DI3A 1OUHA 1XGTC 4RDSA 4DD2A 2W1LA 3RNXA 4KPMA 4LYMA 1HF4A 3EO5A 3W6EA 5DN5A 5DLAA 1JHLA 1CKFA 1YL1X 4HV1A 5KY1A 3WL2A 3HBEX 1CNSA 5D5FA 1JITA 3CT0A 1AT6A 1GF9A 1UIFA 4XJIA 4WO9A 4W96A 1WVUA 1HMLA 4NGYA 4NWEA 4WM4A 5II3A 4KL7A 4GCBA 1SLYA 1GFHA 3J6KA 1IY4A 1JISA 1GD6A 1O23A 4HSFA 4YM8A 3ZVQB 1LYOA 2YBHA 1A2YC 4G4CA 1UCOA 1GB9A 5I4WA 1LZAA 2BQJA 1LSNA 2Z2FA 1Z55A 4WO6A 1UIAA 4NGIA 1UIEA 1IP2A 1GB8A 1WTNA 4YEMA 3LYZA 1GBOA 4NHSA 3ATOA 4ETDA 1IVMA 2RSCA 4HJYA 2BQOA 4QEQA 2EIZC 4IATA 1HEWA 1IWWA 2Z18A 1CKGA 2VB1A 1IC5Y 1XGQC 1FLQA 4H9FA 3B6LA 5I4YA 4LFPA 3HBHA 1JPOA 1LJGA 1HC0A 3AGHA 1JKBA 1G7MC 2BQAA 5I5QA 2YDGA 1GFEA 1QTEA 2F4AA 1LMNA 4RLMA 1CKHA 3G3AB 1BB4A 4YEOA 4H9AA 1FLYA 3TXDA 1RJCB 4GN3A 1KIPC 4NGJA 1IOSA 4OOOA 1WQNA 2WARA 1LHLA 2LYOA 5LXWA 1B7OA 2G4PA 3LZTA 4BAFA 1RE2A 4RW1A 9LYZA 1W6ZA 2H9JA 4B4JA 1GFAA 5E4PA 2I6ZA 5F9XA 1G7JC 3RW8A 1IWZA 4XADA 1D9UA 3OJPA 2HTXA 1EQEA 1IC4Y 1T6VL 2HEAA 2ZIKA 3LZ2A 3QY4A 1JEFA 2F2NA 2MEBA 1LPIA 1UIDA 3WH1A 4G4HA 3TXBA 1LKSA 3CT1A 2N5ZA 2W1YA 3AZ4A 3M18B 5L9JA 5KXSA 1YIKA 1HFXA 1YROA 4H9BA 5L3HA 1LOZA 4NG1A 1GF7A 1LZ8A 1JKAA 4GLVA 1WQPA 1B7NA 3TXEA 5KXMA 4H8XA 1GB7A 4WM1A 1LSBA 1XEKA 1REZA 2CDSA 1GF8A 1JJ3A 1LYYA 1NKHA 1DPXA 1GAZA 2LYMA 3CT5A 5B1FA 3GXKA 5L3IA 4PPOA 1HEQA 4LT2A 1LKRA 1BVXA 2GV0A 4I8SA 4OWHA 1CJ7A 5K7OA 1TAYA 1HERA 1UACY 3WUAA 1JSEA 4NFVA 2D6BA 4H92A 2BAAA 2H9KA 1HHLA 3FE0A 2DQJY 3WPLA 3D3DA 2Z37A 3TXIA 4L41A 1RCMA 1LAAA 4LGKA 4LYBA 1EQ4A 3A3QA 4DD9A 2YVBA 1DI4A 3A3RX 1UBZA 1LSEA 1D0KA 2BQFA 4XJGA 1F6RA 3SP3A 1D0MA 5KXTA 2BQHA 1KXWA 1ZVYB 1LZBA 2BQMA 2BQIA 4NSGA 3ULRA 1E8LA 1ZMYL 5KXWA 5LVIA 1A4VA 1GEVA 1FKVA 4XJBA 1GXV2 4LYOA 3T6UA 5DM9A 1GBZA 1QTKA 1LSZA 1FLWA 2ZQ3A 4WM6A 1LJ3A 2HU3A 5M1YA 1B5ZA 1YAOA 1DKJA 1JWRA 207LA 2XBRA 1INUA 4H94A 2BQGA 4B0DA 1GB0A 4LYTA 1B5XA 3EXDA 4ANRA 4DC4A 1BVKC 4ETCA 5LVKA 1W08A 4G4BA 1G7HC 1GE4A 4WL7A 1HFYA 1HSXA 2MECA 1LHKA 4ET9A 1XEJA 1OUDA 1GB6A 1LZ1A 4NHQA 1I20A 2YSSC 3HBDA 3WU8A 2ZNXY 5T3FA 1IR8A 1OUJA 3TXKA 5HNCA 1GE3A 4KXIA 3W6CA 1IORA 4WLTA 3A96A 1EQ5A 1IP5A 3W6AA 4H9HA 4HTQA 4YOPA 1LZ6A 5HNLA 1YQVY 2XBSA 1GEZA 4B4EA 1H87A 1PS5A 1XSFA 1FDLY 4ETEA 4DDBA 4NGKA 3B0IA 3HFMY 4CFOA 1ZVHL 1TEWA 1OUFA 1REMA 1C10A 4TTDA 5F14A 1OUAA 7LYZA 1V7SA 1F6SA 4LYCA 1FKQA 2Z2EA 1IIZA 4N5RA 2MEFA 4DD0A 3TMVA 3A93A 1KXXA 1J1XY 5C6JA 4BADA 1LZ4A 2FYCA 4NGVA 1LSGA 2FYDA 4XJFA 3W3EA 4DYGA 2ZYCA 3TXFA 3B0OA 4NGLA 2YBLA 1B9OA 1B5WA 4YENA 5KXOA 2HEBA 4NHIA 1RI8B 1GF6A 1GFUA 3A67Y 1JSFA 6LYZA 4TUNA 3WXUA 5LYTA 2F4GA 1LHMA 1YILA 4GCFA 1GFTA 1LJJA 1BWJA 1UIGA 3AYQA 5B05A 1AKIA 1B7LA 1KXYA 1YAPA 4HTKA 1D0LA 4MSTA 3TMWA 2MEIA 1LJEA 5FELA 1HEPA 4W94A 2CJLA 1IWVA 1BWHA 1QUSA 3GXRA 4HP0A 5APEA 1OP9B 4ZIXA 3AGGG 1T3PA 4C5FA 1GBXA 132LA 2HU1A 1C08C 3M3UA 2BPUA 4H91A 1QQYA 5DL9A 1UICA 1KIQC 1PZYA 1YAMA 5APDA 3A90A 1D6PA 4ET8A 1LSDA 3CB7A 4H8ZA 1GFJA 4GLAA 5EBHA 1YANA 1IEEA 3LYMA 1OUEA 1CJ6A 4NHTA 1UC0A 1GBYA 2BLXA 4TWSA 3F6ZA 4DD1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3T36A 1LPYA 4X3BA 5B07A 1L50A 3G3VA 1WQQA 3HTDA 228LA 1LMQA 4H9EA 1LMTA 3AZ6A 168LA 3LYOA 4GCDA 1DZBX 2Z38A 4HJVA 4GCCA 133LA 1L71A 4PRQA 2C8PA 1QT6A 1C6GA 1VFBC 173LA 2BLYA 4P2EA 2FBBA 2HUKA 2C8OA 2DQDY 1LYJA 4HJZA 4NEBA 1P56A 4M4OA 1GB3A 3IJUA 3LYTA 177LA 1NMMA 2OE4X 4O34A 1IOCA 1L44A 1V7TA 1LWGA 1OV5A 1G7IC 3CDTA 5IELA 2MEDA 3N9AA 2OU9A 1FBIX 1QTCA 4ARMA 1SQ2L 1LMPA 2Z6BA 4LT0A 1XGRC 5HMJA 3AW7A 3EMLA 1BB5A 2B5ZA 3DN0A 4J1BA 4MCKA 4NHPA 1JIYA 4A7DA 1D3JA 1IP6A 4D9ZA 4GBRB 1C45A 1VAUA 4OWCA 2QB0B 4LZMA 3A34A 1LI3A 3RT5X 1GE1A 2F30A 4TSCA 4H90A 193LA 226LA 3HH5A 2NWDX 3G3XA 4N9RA 1D3FA 1C6QA 5APCA 2O79A 3J4GA 1REYA 4C3WA 2O4WA 3C80A 4NSHA 2CGIA 135LA 1C65A 1LCNA 4NGWA 5KXNA 1G0KA 213LA 1IWXA 1N4FA 4I7MA 2Y8PA 2B70A 1GF4A 1L15A 3WXTA 4BS7A 1B5VA 5KKIA 2D4JA 262LA 234LA 1L92A 1UIBA 1YKYX 1CV1A 5LYMA 5JENB 4IASA 2XJWA 2YBMA 1LSAA 3WVYA 2OE7X 1DI5A 1JUGA 1LHIA 4LFXA 4W55A 4S0WA 151LA 1B7SA 1GF5A 2ZWBA 4ZFPA 1OUIA 197LA 1D2YA 4G9SA 1JKDA 231LA 3C83A 4ARQB 5KJ9A 3AB6A 3A8ZA 199LA 3FA0A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1DKK A;  3T36 A;  4MR1 A;  4X3B A;  4B4I A;  5B07 A;  3AZ5 A;  4N1C C;  1WQQ A;  5B59 A;  2DQF C;  3CSZ A;  4H9E A;  1LMQ A;  1LMT A;  3AZ6 A;  1WQM A;  4GCE A;  3P4Z A;  1B7M A;  3LYO A;  4WOA A;  4ETA A;  1REX A;  2BQC A;  3A6C Y;  1LJ4 A;  1LMC A;  4GCD A;  4GN4 A;  5KKJ A;  5KXR A;  1DZB X;  1HEM A;  1LSM A;  1LZN A;  3QE8 A;  2Z38 A;  4R0F A;  4WM5 A;  1HEO A;  3W6F A;  4HJV A;  4GCC A;  133L A;  5B06 A;  5AMY A;  1LZT A;  2MEE A;  2ZQ4 A;  5KXZ A;  4PRQ A;  3WU7 A;  1NDG C;  1LZG A;  1VED A;  3CSQ A;  1NF5 A;  2HEC A;  4OWB A;  2C8P A;  4WLD A;  3TXG A;  153L A;  4XYY A;  1VFB C;  1GDW A;  2BQD A;  1IWY A;  1FN5 A;  2BLY A;  2I26 L;  4ML7 A;  4P2E A;  1B5U A;  4QDN A;  3ZVQ A;  2FBB A;  1GB2 A;  3A91 A;  2C8O A;  1IOQ A;  2DQD Y;  1GF3 A;  1BB7 A;  1WQR A;  2EPE A;  4HJZ A;  4NEB A;  3WYH A;  4KT3 A;  1VDP A;  2BQK A;  1OUC A;  3IWR A;  1GAY A;  4M4O A;  1GE2 A;  134L A;  1GB3 A;  3IJU A;  2LYZ A;  5LIN A;  4WG7 A;  1HMK A;  3LYT A;  1NMM A;  1LZY A;  4I0C A;  4O34 A;  1P2C C;  3K3T A; 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 3W6C A;  1IOR A;  4WLT A;  3A96 A;  1EQ5 A;  1IP5 A;  3W6A A;  4H9H A;  4HTQ A;  4YOP A;  1LZ6 A;  5HNL A;  1YQV Y;  2XBS A;  1GEZ A;  4B4E A;  1H87 A;  1PS5 A;  1XSF A;  1FDL Y;  4ETE A;  4DDB A;  4NGK A;  3B0I A;  3HFM Y;  4CFO A;  1ZVH L;  1TEW A;  1OUF A;  1REM A;  1C10 A;  4TTD A;  5F14 A;  1OUA A;  7LYZ A;  1V7S A;  1F6S A;  4LYC A;  1FKQ A;  2Z2E A;  1IIZ A;  4N5R A;  2MEF A;  4DD0 A;  3TMV A;  3A93 A;  1KXX A;  1J1X Y;  5C6J A;  4BAD A;  1LZ4 A;  2FYC A;  4NGV A;  1LSG A;  2FYD A;  4XJF A;  3W3E A;  4DYG A;  2ZYC A;  3TXF A;  3B0O A;  4NGL A;  2YBL A;  1B9O A;  1B5W A;  4YEN A;  5KXO A;  2HEB A;  4NHI A;  1RI8 B;  1GF6 A;  1GFU A;  3A67 Y;  1JSF A;  6LYZ A;  4TUN A;  3WXU A;  5LYT A;  2F4G A;  1LHM A;  1YIL A;  4GCF A;  1GFT A;  1LJJ A;  1BWJ A;  1UIG A;  3AYQ A;  5B05 A;  1AKI A;  1B7L A;  1KXY A;  1YAP A;  4HTK A;  1D0L A;  4MST A;  3TMW A;  2MEI A;  1LJE A;  5FEL A;  1HEP A;  4W94 A;  2CJL A;  1IWV A;  1BWH A;  1QUS A;  3GXR A;  4HP0 A;  5APE A;  1OP9 B;  4ZIX A;  3AGG G;  1T3P A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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