3CT0A

Crystal and cryoem structural studies of a cell wall degrading enzyme in the bacteriophage phi29 tail
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
159
structure length
159
Chain Sequence
MVYVSNKYLTMSEMKVNAQYILNYLSSNGWTKQAICGMLGNMQSESTINPGLWQNLDEGNTSLGFGLVQWTPASNYINWANSQGLPYKNMDSELKRIIWEVNNNAQWINLRDMTFKEYIKSTKTPRELAMIFLASYERPANPNQPERGDQAEYWYKNLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Bacteriophage phi-29
publication title Crystal and cryoEM structural studies of a cell wall degrading enzyme in the bacteriophage phi29 tail.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Morphogenesis protein 1
total genus 61
structure length 159
sequence length 159
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-04-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF18013 Phage_lysozyme2 Phage tail lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3ct0A00
1UA6Y 1B7NA 3CSRA 1HSWA 1QUTA 1H6MA 2LZTA 1LYSA 4BAPA 4TTDA 4DD2A 1W6ZA 4G9SA 1B5WA 4TSCA 1WQNA 2YDGA 3N9AA 1LSPA 2LZ2A 3LN2A 1BWIA 4CHXA 1EQEA 4BS7A 4H92A 4NG8A 3AW7A 1F6RA 5DL9A 4NIJA 1OUDA 4YEMA 1GF5A 3T6UA 4WM4A 4J1BA 1HNLA 3SP3A 4ETCA 4XJHA 1GFJA 4WL6A 2YBHA 3AZ5A 3AGGG 3WPKA 1NMMA 2N5ZA 3FI7A 3CT1A 4RDSA 1HSXA 1UCOA 2H5ZA 1NF5A 1WQOA 1LSMA 4UWVA 1NBZC 1LSEA 2BQMA 5B1GA 4WLTA 1JTOL 3WULA 5I4YA 1LZTA 5KXKA 3A95A 1LCNA 1UIEA 1GB9A 3OJPA 4ML7A 193LA 1HF4A 4WM3A 1BB4A 2YBMA 5APFA 3G3BB 1IP3A 5II3A 5DLAA 1XEKA 3WU9A 1UBZA 1DPWA 1JISA 1LYYA 5KXZA 4GCEA 3RW8A 3HBEX 5A3ZA 4LFPA 3QY4A 1BB3A 4OW1A 1CKDA 1WVUA 3KAMA 1D0MA 3LYZA 4N5RA 1LZEA 1BVKC 3LYTA 2WARA 2HUBA 2W1LA 4DD9A 4ETEA 1DXJA 1LOZA 2Z18A 1SQ2L 2PC2A 2DQJY 4H1PA 3LZTA 3ZEKA 4B1AA 1LYZA 3ATNA 2W1YA 1NHEA 2MEIA 2CJLA 1JTTL 1GBOA 2H9JA 4U3XB 4ZIXA 1DQJC 4CFOA 5B59A 1IVMA 4NWHA 1NKHA 3W6AA 1UC0A 4BADA 2XTHA 4N1EI 1B5YA 1KXWA 1OUCA 1TDYA 3AGIA 2Z2EA 4YOPA 1C10A 3TXDA 1FKQA 1LMAA 2MECA 2W1XA 1IR7A 1LJGA 1FLYA 2BQNA 2HEEA 4HP0A 4HTKA 1O23A 4NGOA 4PHIA 5KKJA 1FLWA 1HHLA 1YKZX 2DQHY 2ZQ4A 4PGJB 1OUGA 3AZ6A 4PRQA 5J7CA 1YKYX 5FSTA 1XEJA 1GF8A 2DQFC 2LHMA 2ZIJA 2H9KA 3AJNA 4GN3A 5E9RA 4DDAA 4NSGA 1GE1A 1IWZA 3EO5A 1GBYA 3F6ZA 1JKCA 1F6SA 2F4GA 2BQGA 3AW6A 5C6LA 1JJ3A 1GFKA 5IDDA 3LYMA 1HFXA 2I25L 3GXRA 5B07A 5LYZA 4AGAA 4D9ZA 1YAQA 5C6JA 5LVJA 1GB0A 1KIPC 5KXOA 5M1YA 208LA 4Z98A 4YEOA 4CGEA 5LINA 1GBXA 1VATA 1ZV5L 4PRUA 1HERA 1IP2A 4O34A 1B7RA 1GBSA 1LZAA 3AGHA 3FE0A 1LMQA 4AXTA 3TXGA 1W08A 3A6BY 4NY5A 5IHGA 1T6VL 3GXKA 4H9IA 4R0FA 1LZDA 5D5CA 1GE3A 2XJWA 4QEQA 2F30A 2XBRA 1BB7A 1OUIA 4N9RA 5KXYA 1LMTA 1UICA 4NHPA 1FLUA 134LA 4HPEA 1QDRA 1YANA 4LYBA 4X3BA 2Z37A 5HMVA 3A96A 1BWJA 3HBHA 2Y8PA 4WO6A 5LYTA 5HNCA 1GDXA 5I54A 1HC0A 1JPOA 1OUEA 2Z2FA 4HTQA 4M6DA 1UIAA 5EBHA 1IOSA 1REXA 4YENA 2ZNWY 1CKHA 5KXPA 1PS5A 5LIOA 4R6CA 4RLNA 3W6FA 8LYZA 1HEPA 4NHSA 4LT3A 4KXIA 4NGYA 5A3EA 2G4PA 3ZVQA 1IC5Y 1JKAA 1CJ9A 2ZYCA 3A6CY 4H9FA 1UACY 4NGIA 4WLDA 4DYGA 5L9JA 1JKBA 3WPJA 3CT5A 4H9HA 4HJZA 1IP7A 1B7PA 4MCKA 4B4EA 1GFRA 1I1ZA 207LA 4MR1A 5I4XA 3W6EA 4IJ4A 2A7DA 4LT1A 3WXTA 3WUNA 5T3FA 194LA 1JTPL 5AMYA 2BQIA 4GCBA 5L3HA 1ZVYB 3TMWA 2HECA 3K3TA 3WUAA 3TMVA 2EPEA 1JUGA 1GFHA 2EQLA 3IWRA 1QTKA 1B9OA 1GBZA 1VDSA 1VDQA 1IX0A 1GFAA 3A3RX 3P68A 2A7FA 4L41A 5KJ9A 5LVIA 4HV1A 4H9AA 9LYZA 3CB7A 2BLYA 5B06A 4NGLA 4OWHA 1JKDA 2MEFA 4BAFA 4XJFA 2VB1A 3TXHA 1LJHA 1CKGA 1IOTA 3TXIA 3WYHA 2EIZC 1MLCE 2ZYPA 3TXEA 3TXFA 4CJ2A 1GF3A 1HEQA 1D6QA 1GB3A 5L3IA 1REZA 3AZ4A 4XJIA 3A94A 2F2NA 1LSDA 2G4NA 4DDBA 1XGTC 2MEDA 2X0AA 2Z19A 2HEBA 133LA 1IWTA 4XADA 2D4JA 1CKCA 1EQ5A 1NWGA 4NHTA 1RJCB 4H94A 4E3UA 4C3WA 1LSFA 1OUFA 1XSFA 4H9CA 5KXTA 1LZ1A 1RI8B 5LAFA 1UIDA 1B0DA 4DT3A 1OUBA 1JSEA 1A4VA 2DKVA 3P4ZA 1C46A 3BKHA 6LYZA 1LZ5A 4TUNA 1IP6A 3EBAB 4J0LA 4WO9A 1GXXA 1HMKA 1B7LA 3CT0A 1LHHA 3IJVA 5KXNA 1F10A 1LZRA 1LSAA 4N8ZA 3RNXA 1XEIA 2Q0MX 1AT6A 4KL7A 1LSGA 3WVYA 3P64A 4G4HA 1EL1A 1GFUA 1J1OY 3AYQA 1YQVY 4FJRA 2C8PA 4H8XA 2BQFA 2MEGA 4ET9A 2HEAA 4DD3A 1B7OA 1G7HC 2D4KA 3RU5A 3P66A 1TAYA 4HTNA 1WTMA 2BQAA 1AKIA 4B4JA 1YL0X 4P2EA 1GF6A 1VFBC 4GN4A 1GB6A 5LAGA 4H90A 1YILA 3AB6A 5KXLA 4WLYA 3TMXA 4DWXA 3RT5X 4UWUA 3WH1A 2HU1A 5APCA 1B7QA 1BB6A 4OWCA 4RLMA 5F9UA 5FCPA 1RE2A 1JITA 2Z39A 4H91A 1UIHA 3LZ2A 4H8ZA 4DDCA 1GE0A 1LMNA 5FDJA 4RW1A 4HV2A 1LJNA 5I4WA 1LKSA 3WW5A 4J7VA 2YBNA 2DQAA 4J1AA 5I53A 5KXSA 3A8ZA 3G3AB 4NGJA 3M18B 4HSFA 4G4CA 2YBLA 3TMUA 1FN5A 1GDWA 1N4FA 3WL2A 5D5FA 2FYCA 1QTEA 4NHQA 1UIGA 2LYZA 4LT2A 3A91A 1FLQA 1GB7A 1UUZC 5LVGA 3A90A 4OWEA 4KT3A 4Z41A 3WU8A 1IWVA 1IEEA 1LSCA 1OUHA 4WM2A 1GFGA 1PZYA 1LZ9A 1DZBX 1VDTA 2BQBA 1GHLA 3D9AC 5K7OA 1AM7A 4DD7A 4GN5C 2C8OA 1P2CC 1GF4A 2MEAA 4N0JA 4C5FA 5ILFA 1LZSA 1ZVHL 4B49A 5HMJA 2YBIA 3WPLA 4ET8A 2ZQ3A 3TXKA 3QE8A 1D0LA 1IY3A 1GAZA 1LPIA 1LZNA 1GD6A 2EKSC 2HTXA 1C43A 2I26L 1LJ4A 2ZILA 1IP4A 2B5ZA 4NGWA 4WOAA 1NBYC 2YBJA 1B5UA 1DPXA 4FDYA 1GWDA 2BQLA 1KXXA 2HEDA 1LJFA 1DI3A 4G49A 1REYA 3TXBA 1WQRA 1TCYA 4MSTA 4QDNA 2ZIKA 5KXMA 1GFTA 1KXYA 1GF0A 1BQLY 2XBSA 4XJGA 1BVXA 3J4GA 1LJJA 4Z46A 4ZEEA 3WVXA 1SLYA 1IWWA 4OWBA 2DQEY 4ZFPA 5JENB 4GLAA 3N9EA 4ANRA 1AT5A 1J1PY 5F9XA 1OUAA 1I56A 4I8SA 4B4IA 1GBWA 1LMCA 3A92A 4WM5A 3ULRA 5APEA 1YAOA 4WM1A 4OOOA 2D4IA 3HFMY 4UWNA 4QY9A 5LA5A 1LHIA 4QGZA 4I0CA 5KXWA 1RCMA 4N1CC 3CQLA 1LHMA 4H8YA 2W1MA 1LSZA 1GFVA 3P65A 3B0KA 1LZCA 1LZ6A 1B5XA 1IOQA 1HFYA 4LYCA 2FBBA 4NEBA 4W96A 4NGVA 1CJ6A 2BAAA 2I6ZA 5LVHA 4PPOA 4TSBA 1LAAA 5HLLA 2BLXA 4LFXA 1A2YC 4WLXA 154LA 1IIZA 2DQGY 2MEEA 1IO5A 1ALCA 3QNGA 4NWEA 1KIQC 4H9BA 4WL7A 1LZYA 4IASA 1YIKA 3HBDA 1GE2A 2BQOA 3EMSA 1LZ8A 3BKVA 4HJYA 1JSFA 5ILCA 1HFZA 3A67Y 5B05A 1LMOA 1V7TA 5FEKA 4PJ2C 3W6CA 1XGPC 1YROA 1QIOA 3WW6A 3LHMA 1B7MA 2FBDA 2LYMA 3VWOA 1KIRC 5B1FA 2CDSA 1E8LA 1IOCA 4HJVA 4LT0A 1QSWA 1GB8A 4ETDA 1WQQA 1XGRC 1D9UA 5LA8A 1DI5A 2CWIA 5FHWA 1XGQC 1LZBA 1FBIX 2MEHA 1BHZA 5F16A 1XFPL 4LYOA 1LHLA 4NSIA 2MEBA 1HEWA 1GF7A 4KPMA 1GB5A 1LTMA 1LSNA 1TBYA 1LMPA 3IJUA 4RW2A 2BPUA 1WQMA 1HMLA 1B7SA 4NSJA 1J1XY 2G4QA 4M4OA 5KY1A 4H9EA 1LJ3A 1V7SA 6LYTA 4WMGA 1CJ7A 4XENA 2F4AA 2IHLA 4OOTA 4DC4A 3W3EA 1JJ0A 1ZMYL 3MGWA 4B0DA 3A93A 4NHIA 7LYZA 5KXRA 4NGKA 2ZWBA 2DQIY 2IFFY 2YVBA 1IWYA 4XN6A 1YKXX 1IWUA 1JHLA 1G7JC 3A34A 1C7PA 1LJKA 4A7DA 1LZGA 1BWHA 1DI4A 4WG1A 2BQJA 2Z12A 5LYMA 1GPQC 1YL1X 1LKRA 1IWXA 1JIYA 1JJ1A 5I5QA 3ZVQB 1B2KA 1D0KA 4EOFA 2AUBA 4WG7A 1HELA 3W6BA 1GE4A 5HNLA 1I20A 4CFPA 1UIFA 5DN5A 1TEWA 1NQIA 3T36A 1VDPA 1WVVA 1CJ8A 1VEDA 3ATOA 5F14A 1XGUC 1QUSA 3LYOA 4YM8A 1CNSA 2D91A 3J6KA 1IR8A 1G7MC 1LSBA 4HPIA 4II8A 4NSHA 3TXJA 1YAMA 1UIBA 4W94A 1T3PA 4LZTA 1G7LC 1WTNA 2HEFA 2HU3A 3N9CA 4GLVA 4Z3MA 1AZFA 1IORA 4G4BA 4NFVA 5APDA 1YAPA 5C6IA 2DQDY 1LJIA 4IATA 1HENA 1GXV2 5HQ1A 4ETBA 1BB5A 3WXUA 3E3DA 1QSAA 4H93A 153LA 1FKVA 1D6PA 1B5VA 1JWRA 1DKKA 1C45A 1GF9A 4YF2A 1EQ4A 2CGIA 1IP5A 2D6BA 2LYOA 1HEMA 1QQYA 1IY4A 4XYYA 4LYMA 1H87A 1IC4Y 3AZ7A 1CKFA 2GV0A 4GCCA 1NDGC 2BQCA 3A3QA 1RFPA 3B6LA 1IC7Y 3M3UA 5FELA 4TX7A 2FYDA 1MELL 2BQDA 1LSYA 1IP1A 5LXWA 135LA 4NGZA 4NG1A 2BQEA 1GAYA 3B72A 2BQHA 4EMNA 1G7IC 1LJEA 3B0OA 5IELA 1DKJA 1VAUA 1Z55A 4GCDA 4ETAA 5KXXA 1B5ZA 4LGKA 2BQKA 1OP9B 5F81A 1BGIA 1NDMC 1FDLY 3B0IA 3RZ4A 1OUJA 2DBTA 4XJDA 1GEZA 2RSCA 1GB2A 4LYTA 1QDTA 5DN4A 5DM9A 3W6DA 5KKIA 4WM6A 2DQCY 4XJBA 1OQMA 4LYZA 3OK0A 3WU7A 3EXDA 4TWSA 2ZNXY 4DD0A 1IR9A 4GCFA 1LHKA 4OWAA 1JEFA 1LHJA 2Z38A 3WMKA 3WUMA 5LVKA 1GFEA 5E4PA 1HEOA 1INUA 132LA 1LYOA 2NWDX 2YSSC 1GEVA 3CSQA 1F0WA 1C08C 1LZ4A 1WQPA 3CSZA 3D3DA 4DD1A 1REMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1KY0A 1B7NA 3CSRA 1HSWA 4ARJA 3C7YA 3DN4A 4DD2A 4G9SA 1LSPA 1BWIA 1C60A 4NG8A 4LZMA 1F6RA 3L2XA 1L47A 3T6UA 4ETCA 4XJHA 1C6GA 2N5ZA 1HSXA 1C6LA 1LSMA 1L52A 2Z6BA 1UIEA 1GB9A 1L15A 4WM3A 1BB4A 5DLAA 1LYYA 1C64A 1D0MA 1LZEA 3LYTA 157LA 2W1LA 1L57A 2Z18A 2PC2A 1LYZA 1T6HA 2W1YA 2H9JA 2ANVA 4U3XB 4S0WA 1NKHA 3W6AA 2XTHA 3CDQA 1D3FA 1QSBA 114LA 1IR7A 1LJGA 5KKJA 155LA 1YKZX 3HUQA 1YKYX 5E9RA 2ZIJA 3AJNA 2H9KA 3HH3A 4NSGA 1GE1A 4I7SA 1IWZA 205LA 3EO5A 3F6ZA 1G06A 1C6TA 159LA 2I25L 1L40A 5LYZA 4AGAA 5M1YA 1KIPC 3DN3A 1G0GA 191LA 1D9WA 1QS9A 3EMLA 3TXGA 115LA 1LYEA 1W08A 190LA 3GXKA 4QEQA 4PJZA 1G07A 1OUIA 134LA 2Z37A 3SB8A 3RZEA 3HBHA 4WO6A 1GDXA 1P2LA 5I54A 1OUEA 4M6DA 1REXA 4YENA 2F32A 5KXPA 3HH4A 4R6CA 8LYZA 3HTDA 5A3EA 2ZYCA 3A6CY 4LDLA 1JKBA 3WPJA 1GFRA 123LA 3WUNA 1P2RA 1JTPL 1ZVYB 3TMWA 2EPEA 1JUGA 1GFHA 1L89A 3DN2A 3IWRA 2A4TA 1QTKA 149LA 1VDQA 1GFAA 3P68A 5KJ9A 3C80A 162LA 4OWHA 2VB1A 1DYDA 4W59A 3WYHA 2ZYPA 3TXFA 1GF3A 210LA 6LZMA 1GB3A 2LC9A 3AZ4A 4XJIA 1LSDA 4DDBA 2MEDA 1IWTA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1UA6 Y;  1B7N A;  3CSR A;  1HSW A;  1QUT A;  1H6M A;  2LZT A;  1LYS A;  4BAP A;  4TTD A;  4DD2 A;  1W6Z A;  4G9S A;  1B5W A;  4TSC A;  1WQN A;  2YDG A;  3N9A A;  1LSP A;  2LZ2 A;  3LN2 A;  1BWI A;  4CHX A;  1EQE A;  4BS7 A;  4H92 A;  4NG8 A;  3AW7 A;  1F6R A;  5DL9 A;  4NIJ A;  1OUD A;  4YEM A;  1GF5 A;  3T6U A;  4WM4 A;  4J1B A;  1HNL A;  3SP3 A;  4ETC A;  4XJH A;  1GFJ A;  4WL6 A;  2YBH A;  3AZ5 A;  3AGG G;  3WPK A;  1NMM A;  2N5Z A;  3FI7 A;  3CT1 A;  4RDS A;  1HSX A;  1UCO A;  2H5Z A;  1NF5 A;  1WQO A;  1LSM A;  4UWV A;  1NBZ C;  1LSE A;  2BQM A;  5B1G A;  4WLT A;  1JTO L;  3WUL A;  5I4Y A;  1LZT A;  5KXK A;  3A95 A;  1LCN A;  1UIE A;  1GB9 A;  3OJP A;  4ML7 A;  193L A;  1HF4 A;  4WM3 A;  1BB4 A;  2YBM A;  5APF A;  3G3B B;  1IP3 A;  5II3 A;  5DLA A;  1XEK A;  3WU9 A;  1UBZ A;  1DPW A;  1JIS A;  1LYY A;  5KXZ A;  4GCE A;  3RW8 A;  3HBE X;  5A3Z A;  4LFP A;  3QY4 A;  1BB3 A;  4OW1 A;  1CKD A;  1WVU A;  3KAM A;  1D0M A;  3LYZ A;  4N5R A;  1LZE A;  1BVK C;  3LYT A;  2WAR A;  2HUB A;  2W1L A; 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 4W94 A;  1T3P A;  4LZT A;  1G7L C;  1WTN A;  2HEF A;  2HU3 A;  3N9C A;  4GLV A;  4Z3M A;  1AZF A;  1IOR A;  4G4B A;  4NFV A;  5APD A;  1YAP A;  5C6I A;  2DQD Y;  1LJI A;  4IAT A;  1HEN A;  1GXV 2;  5HQ1 A;  4ETB A;  1BB5 A;  3WXU A;  3E3D A;  1QSA A;  4H93 A;  153L A;  1FKV A;  1D6P A;  1B5V A;  1JWR A;  1DKK A;  1C45 A;  1GF9 A;  4YF2 A;  1EQ4 A;  2CGI A;  1IP5 A;  2D6B A;  2LYO A;  1HEM A;  1QQY A;  1IY4 A;  4XYY A;  4LYM A;  1H87 A;  1IC4 Y;  3AZ7 A;  1CKF A;  2GV0 A;  4GCC A;  1NDG C;  2BQC A;  3A3Q A;  1RFP A;  3B6L A;  1IC7 Y;  3M3U A;  5FEL A;  4TX7 A;  2FYD A;  1MEL L;  2BQD A;  1LSY A;  1IP1 A;  5LXW A;  135L A;  4NGZ A;  4NG1 A;  2BQE A;  1GAY A;  3B72 A;  2BQH A;  4EMN A;  1G7I C;  1LJE A;  3B0O A;  5IEL A;  1DKJ A;  1VAU A;  1Z55 A;  4GCD A;  4ETA A;  5KXX A;  1B5Z A;  4LGK A;  2BQK A;  1OP9 B;  5F81 A;  1BGI A;  1NDM C;  1FDL Y;  3B0I A;  3RZ4 A;  1OUJ A;  2DBT A;  4XJD A;  1GEZ A;  2RSC A;  1GB2 A;  4LYT A;  1QDT A;  5DN4 A;  5DM9 A;  3W6D A;  5KKI A;  4WM6 A;  2DQC Y;  4XJB A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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