3GUNA

T4 lysozyme m102e/l99a mutant with buried charge in apolar cavity--aniline binding
Total Genus 51

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
162
structure length
161
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDCEGYYTIGIGHLLTKSPDLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAAINEVFQMGVTGVAGFTNVLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQCPDRAKRVITTFRTGTWDAYK

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
AH1 (3-11)AH3 (60-80)AH5 (98-106)3H1 (159-161)O1 (21-142)TI1 (20-23)S2 (24-28)S3 (31-32)AH2 (39-50)TIV3 (54-57)AH4 (83-90)TIV5 (93-96)TIV4 (92-95)TIV6 (94-98)AH9 (137-141)AH10 (143-155)AH6 (108-113)AH7 (115-123)AH8 (126-134)EMPTYS1 (14-20)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Use of stabilizing mutations to engineer a charged group within a ligand-binding hydrophobic cavity in T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
total genus 51
structure length 161
sequence length 162
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2009-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3gunA00
118LA 1QUHA 3PDSA 3CDVA 142LA 1CV4A 1QTHA 110LA 2OTZX 1P2LA 1D9WA 1P37A 3DMVA 1QT5A 125LA 246LA 1QSBA 1L90A 4W55A 1D2WA 1L56A 1G1WA 3G3VA 4W52A 3HH6A 1L34A 2RBPA 2B75A 3HT8A 170LA 1L93A 1D3MA 3OE6A 1CUQA 1D3NA 1L80A 3L64A 1KW7A 217LA 144LA 1CX7A 4I7KA 2RBOA 108LA 4ARMA 1SX7A 243LA 109LA 1DYBA 1G07A 3HH5A 112LA 131LA 3GULA 191LA 3DMZA 223LA 180LA 2B73A 1QT4A 113LA 102LA 1L54A 1L19A 1QUOA 2OEAX 1C6JA 218LA 1L79A 1L57A 2QB0B 1L55A 4LDEA 1DYFA 3OE8A 1CV1A 4LDLA 237LA 1QSQA 2CUUA 2OU8A 1C6BA 1DYAA 7LZMA 1P2RA 155LA 1LYHA 213LA 1CU2A 3GUPA 1L31A 1C66A 1CV6A 2ANXA 4I7TA 209LA 1OV7A 1LYGA 1QT3A 1LLHA 1L37A 3C7WA 2RB0X 1L86A 1G0QA 1OVJA 1L11A 1C6IA 4ARJA 1LI3A 127LA 3GUIA 2B6ZA 1P46A 157LA 4I7OA 3FA0A 141LA 149LA 186LA 1CU3A 3C8SA 1LYIA 128LA 3SB9A 1ZURA 3CDRA 4I7NA 130LA 1L98A 257LA 3F8VA 1QT6A 1L52A 238LA 220LA 1L14A 3HUQA 1L43A 227LA 1LW9A 3GUKA 1L62A 1T6HA 3GUJA 1QTBA 229LA 4I7PA 1L42A 3CDTA 4EKQA 4I7JA 247LA 3C83A 1L89A 1OYUA 2RAZX 3HDFA 1G0PA 3C8RA 1ZYTA 1G0GA 1C69A 4EPIA 1KY0A 241LA 226LA 1L61A 1L15A 1D3FA 233LA 1P5CA 1QT8A 5LZMA 3DMXA 1L44A 4GBRB 1CU0A 1C6AA 1C6HA 1KW5A 1LI2A 3FI5A 2OE9X 2A4TA 137LA 2HUKA 2RBSA 190LA 178LA 1C62A 1D2YA 1JQUA 2F32A 225LA 1L74A 2B6TA 3DN8A 215LA 111LA 1L73A 4ARQB 1C6LA 3DN2A 166LA 205LA 2IGCA 1OVKA 2RBRA 176LA 1SX2A 3GUOA 1C6CA 1L88A 1C6MA 184LA 187LA 4YX7C 1T8FA 4EKSA 174LA 231LA 156LA 3NY9A 4DAJA 1L41A 2B72A 1G0LA 206LA 260LA 169LA 1L50A 126LA 1CV0A 1L00A 1L83A 1L10A 2OU9A 145LA 251LA 1L12A 147LA 253LA 1JTNA 3C80A 3SB7A 230LA 3GUNA 234LA 1C6EA 2OTYX 4K5YA 185LA 1L02A 1L38A 1L07A 2F2QA 4LZMA 4PJZA 4W59A 2RB2X 1L70A 1L77A 1L95A 152LA 1L96A 3OE9A 1L46A 219LA 3HTFA 1SWYA 1L36A 1ZWNA 235LA 1L33A 1L17A 2RB1X 1L84A 2Q9DA 3RUNA 2B6WA 3NY8A 1QTDA 1L05A 3V2YA 1L75A 1L08A 2NTGA 1DYEA 120LA 1P3NA 1C68A 256LA 4I7MA 168LA 3G3WA 3UONA 1L24A 1QUDA 1C63A 2B6XA 3HH3A 259LA 1QTZA 150LA 3F9LA 3C7ZA 1CU6A 4W57A 4W53A 4OO9A 1PQIA 1G0MA 167LA 1KS3A 1L0KA 1P6YA 182LA 4ARPA 4I7RA 3SB8A 3ODUA 1G0JA 1L40A 148LE 171LA 143LA 188LA 2OE4X 1DYCA 250LA 254LA 1L16A 1C6TA 1QUGA 3NYAA 1OV5A 3DN3A 1WTHA 4YXAC 1L32A 258LA 3DNAA 1P7SA 3HTDA 3PBLA 1L03A 3HTBA 1CV3A 1C6PA 1OWYA 1SSYA 4S0WA 3HWLA 165LA 4IAPA 2B74A 196LA 1KY1A 216LA 2B7XA 1LYDA 4YXCA 4ZPUA 1PQKA 236LA 2QARC 1C61A 1QTVA 1D3JA 3DKEX 1L91A 1L09A 162LA 172LA 224LA 1XJUA 1C60A 2ANVA 1L28A 1L21A 107LA 228LA 210LA 2B70A 1PQDA 3K2RA 1OVHA 1L30A 1L97A 1L68A 3DN1A 1PQMA 3VW7A 1C64A 1XJTA 114LA 4W51A 1SSWA 232LA 1QTCA 3HUAA 4EJ4A 1G06A 1L06A 1NHBA 1L59A 3DN0A 199LA 183LA 239LA 1G1VA 1L51A 3GUMA 2LCBA 1PQOA 1C6DA 1L53A 1OWZA 255LA 2LZMA 1L39A 1C6GA 1C6NA 1P64A 181LA 1CVKA 3C81A 123LA 1LI6A 1P36A 4I7LA 4DKLA 3SB6A 1G0KA 4E97A 139LA 3LZMA 1L76A 3CDOA 3HT7A 197LA 4W56A 3FADA 3C7YA 3C82A 4I7QA 2NTHA 1LPYA 2RAYX 1KNIA 3EMLA 1L18A 1L92A 2O7AA 1L85A 1LWGA 3HT6A 3SBAA 1L20A 3CDQA 173LA 4W58A 2RBNA 1L72A 201LA 1LGWA 1L99A 1L58A 214LA 1CUPA 2HULA 2F47A 4ARQA 3SN6R 3HU8A 129LA 244LA 1L82A 1B6IA 2RBQA 1L0JA 1DYDA 3HT9A 221LA 3SB5A 1QS9A 1XEPA 1JTMA 252LA 138LA 2OE7X 4EPFA 115LA 1LGXA 4AQNA 195LA 1LYEA 140LA 2Z6BA 4PK0A 2O79A 1C67A 103LA 1LGUA 1C6QA 3JR6A 4LDOA 3HH4A 242LA 4EXMA 146LA 240LA 3D4SA 212LA 4W54A 1CX6A 200LA 104LA 161LA 1EPYA 1L01A 2LC9A 1SWZA 261LA 1P56A 1L65A 198LA 1L25A 159LA 2RH1A 245LA 1QT7A 2L78A 3RZEA 1L81A 1L87A 175LA 1K28A 1L69A 1L27A 4ARLA 1L04A 3SBBC 151LA 1L67A 1L71A 2B6YA 2HUMA 2Q9EA 249LA 158LA 1L26A 3DN4A 3HUKA 1TLAA 1L49A 3OE0A 1L13A 1L47A 3QAKA 1LWKA 1LYJA 1PQJA 5I14A 1T8AA 222LA 4ARMB 3V2WA 1CU5A 1L45A 3C8QA 4GRVA 248LA 211LA 3G3XA 1T8GA 4EKPA 1L64A 160LA 189LA 119LA 1L63A 1C65A 1I6SA 3HDEA 4EKRA 1T97A 163LA 2O4WA 1L23A 1C6FA 1DYGA 1L60A 1L94A 3HTGA 122LA 3L2XA 1CTWA 4DJHA 4I7SA 1L66A 1L22A 1QS5A 2OU0X 1C6KA 3DN6A 1L48A 177LA 164LA 1LYFA 262LA 3HU9A 1L35A 192LA 1CV5A 1L29A 6LZMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LZ4A 118LA 1QUHA 1REZA 1QTHA 3LYMA 1XEKA 2H5ZA 3DMVA 1QT5A 125LA 2G4PA 3G3BB 4QEQA 5HNLA 4W52A 3HH6A 1GB7A 2B75A 4WG7A 1I56A 4QDNA 1GFEA 217LA 4BADA 1SX7A 243LA 1LZ5A 112LA 5B1GA 4OWAA 2Z2EA 180LA 2B73A 3ATOA 1L19A 2OEAX 4TTDA 4G4CA 218LA 2ZNWY 1DYFA 1GF8A 1QSQA 1C08C 4KPMA 7LZMA 4B0DA 1UIEA 3WPLA 4I7TA 209LA 1BGIA 1QT3A 4Z3MA 4WM4A 1AKIA 1IWWA 1UBZA 7LYZA 1L11A 1LZEA 2BQMA 2BQAA 4NG1A 3WU9A 4NHPA 4DD3A 1LMAA 132LA 2HEDA 3TMWA 4N1EI 1P2CC 1VDPA 2VB1A 5KKIA 2HU1A 128LA 1DPXA 3CT5A 2I26L 2CDSA 4I7NA 4OOOA 1F10A 130LA 1B0DA 4H92A 1WQNA 3W6EA 4Z41A 4DYGA 4HJVA 3GUKA 1NMMA 1L42A 1L89A 5II3A 3HDFA 4YM8A 4PJ2C 1FKQA 3WPJA 3EMSA 4DD9A 1QT8A 5LZMA 1HFYA 1G7MC 1CU0A 4L41A 1C6HA 3HBHA 1LI2A 1IC7Y 2OE9X 4NGJA 178LA 1D2YA 2D91A 1IORA 1DI5A 5FHWA 4NGIA 1E8LA 3ZEKA 1JTOL 4WM2A 1OUJA 205LA 4W94A 176LA 3GUOA 4CGEA 4ETBA 231LA 156LA 4NGLA 3W3EA 1L41A 2B72A 260LA 4NEBA 4WM3A 1GB8A 3BKVA 251LA 2W1MA 4GLVA 1NF5A 1BB7A 1GBWA 230LA 3GUNA 1IWZA 4GLAA 1WQRA 185LA 2XQOA 3CT1A 1JJ0A 1L46A 2DBTA 3W6BA 5I4YA 1LJGA 4NSIA 1IX0A 1BB5A 2B5ZA 1LZTA 1YILA 3P66A 2ZIKA 1JITA 1ZWNA 4WO9A 2RB1X 1GBSA 1LSDA 1NDGC 2B6WA 1GEZA 1ZVYB 1DYEA 5F9XA 4DD7A 1GBYA 3G3WA 150LA 1IWVA 3F9LA 3C7ZA 1G0MA 4CJ2A 3WXTA 1AT5A 4Z98A 1OUAA 5C6JA 5D5FA 2BAAA 1SLYA 4ARPA 5C6IA 3G3AB 2H9JA 3DN3A 4LFPA 3DNAA 1L03A 1CV3A 2I6ZA 3TXFA 1LZRA 3HWLA 1INUA 4DQ5A 4IAPA 2DQHY 1XEIA 4DT3A 236LA 3J4GA 4NSGA 1QTVA 1D3JA 1L91A 3K3TA 172LA 4G49A 5A3ZA 4ETCA 3GXRA 2F30A 1LJIA 1OUEA 1B7RA 5KY1A 1LZ8A 3VW7A 1LPIA 1UIAA 4W51A 3HBDA 4H94A 1SSWA 232LA 3FE0A 1QTCA 4EJ4A 1G06A 3AYQA 1H6MA 1L51A 1C6DA 255LA 2LZMA 1L39A 3A3QA 2HECA 2MECA 1YKZX 3B0OA 3TXDA 4I7LA 3SB6A 197LA 4NGWA 3C7YA 4I7QA 1B5WA 3EMLA 1PS5A 1L92A 3HT6A 2RBNA 1L58A 4H8YA 1CKHA 1L82A 3W6AA 4J1AA 2D4KA 1LKRA 1FBIX 5KXNA 1XEPA 4WLYA 5APCA 1WQQA 3W6DA 4RLMA 4RW2A 1D6PA 2F4GA 3A92A 1C6QA 1OUGA 5LVIA 1GXXA 3EO5A 4N9RA 4EXMA 146LA 240LA 1GE4A 2EKSC 1QTEA 3T6UA 1CX6A 104LA 2BQKA 261LA 1P56A 4PPOA 1B7LA 1WVUA 5LYTA 1HNLA 4NHTA 5T3FA 4N1CC 3WPKA 1B7NA 5FEKA 3SP3A 4DD2A 1LZBA 1HMKA 1L67A 249LA 1L26A 3D3DA 4TSBA 1TLAA 2YBHA 1GFJA 1GE2A 1LMQA 1LWKA 3TXKA 5K7OA 1GB5A 1YQVY 1L45A 4GRVA 1T8GA 3A94A 1I6SA 4LT0A 1GFKA 2BQDA 2O4WA 2D6BA 1L23A 1L60A 3L2XA 4DJHA 3LZ2A 1L48A 1O23A 3W6CA 1LOZA 192LA 4OWCA 1IWTA 142LA 1CV4A 110LA 4GCBA 1P37A 246LA 3A3RX 3F6ZA 1L90A 1L56A 2EPEA 4LT2A 1L34A 2RBPA 5D5CA 3OE6A 4G9SA 1XGUC 3N9AA 4C5FA 2HEAA 1CX7A 2RBOA 108LA 1XGPC 5A3EA 1LJ4A 3GULA 191LA 3DMZA 4WL7A 1QIOA 1QUOA 4J1BA 4HTKA 4ETAA 1L79A 1L55A 2Q0MX 1LSFA 1D0KA 2OU8A 4H8ZA 1P2RA 1OUBA 1OUFA 1WTNA 3GUPA 1L31A 1CV6A 3KAMA 1NDMC 1LYGA 3LYOA 1LLHA 3C7WA 2RB0X 194LA 1L86A 4WOAA 4NGZA 1VDTA 3A8ZA 4ARJA 3ZVQB 3N9CA 1B5XA 3GUIA 2B6ZA 1P46A 157LA 3FA0A 186LA 1JHLA 3D9AC 3C8SA 1LYIA 5LXWA 1ZURA 1CKCA 1NWGA 3CDRA 5KXMA 1QT6A 2ZWBA 1GFAA 3LN2A 3A96A 134LA 4LYMA 238LA 3P65A 220LA 1L14A 1L43A 227LA 1LW9A 1D0LA 3AJNA 229LA 4I7PA 4H90A 4E3UA 1LZCA 1OYUA 2RAZX 3CSQA 1IOCA 1AT6A 1QDTA 4OW1A 8LYZA 5KKJA 2DQIY 1C69A 1KY0A 2LZTA 226LA 1B7SA 1L61A 1D3FA 1QSWA 1P5CA 1L44A 1C6AA 1TCYA 1XGTC 1QTKA 2HUKA 2RBSA 1JQUA 5FSTA 4OWBA 1IP1A 215LA 1L73A 1LJ3A 4ARQB 1C6LA 3DN2A 4J7VA 1D6QA 2RBRA 3N9EA 5M1YA 1JEFA 4YX7C 1EQ5A 1LZ1A 4EKSA 1JKCA 1CJ9A 174LA 3NY9A 3P68A 5L3IA 2MEHA 1FKVA 1JSEA 1HFXA 206LA 3LZTA 169LA 126LA 6LYTA 3QNGA 1YL1X 5APEA 4WMGA 1C7PA 5IDDA 1FLWA 5I4XA 1FLUA 4DD0A 5DN5A 1GF3A 2YSSC 4W59A 2RB2X 1L70A 152LA 3HTFA 2W1LA 1JJ1A 1B7PA 4CFOA 1DI3A 3WXUA 3ATNA 1GF0A 3TXBA 2DQFC 3EBAB 4M4OA 2Q9DA 1GDXA 5FDJA 1MLCE 1QTDA 3V2YA 120LA 4XJHA 1C68A 4I7MA 4KT3A 1L24A 4DQ7A 1QUDA 259LA 3TXEA 1LSEA 4ET8A 1VAUA 167LA 1JKAA 1P6YA 2XTHA 4MCKA 3SB8A 4DWXA 3ODUA 1FLQA 148LE 188LA 3A6CY 3IJVA 3TMUA 1LYYA 1J1PY 5KXZA 5KXWA 4YXAC 2ZYPA 4RLNA 1GBOA 258LA 1IWUA 2BQIA 2BQCA 165LA 2B74A 196LA 1KY1A 3ULRA 2YBIA 1DI4A 2N5ZA 2QARC 3ZVQA 4XJBA 5DM9A 162LA 1UC0A 5KXOA 3CSZA 5LAGA 5KXKA 2ANVA 1L21A 228LA 4H93A 5KXSA 1VATA 2B70A 5L3HA 1KXYA 1L30A 2RSCA 1HEWA 1L68A 1B2KA 4HV2A 1N4FA 1PQMA 1XJTA 114LA 4R0FA 5KXRA 2DQEY 4G4BA 3HUAA 1L06A 1L59A 199LA 2HTXA 3B6LA 1IVMA 4WM1A 1B7QA 2LCBA 1G7HC 2LZ2A 1VDSA 1L53A 1OWZA 4ETDA 2PC2A 4R6CA 3C81A 123LA 1HMLA 4DD1A 139LA 3LZMA 4WM5A 1W6ZA 1L76A 3CDOA 3HT7A 1JKDA 1HEPA 5HQ1A 2XBSA 4GCCA 1UIFA 2YDGA 2NTHA 1L18A 1L85A 1LWGA 4ANRA 2HEFA 1L20A 1QDRA 3A95A 4W58A 4CFPA 2F47A 2I25L 1LJKA 4TSCA 4ARQA 3SN6R 3WMKA 4B4IA 1LHMA 129LA 2DQJY 1L0JA 3HT9A 3SB5A 221LA 1QS9A 252LA 115LA 1LGXA 1JUGA 2MEBA 1LYEA 3GXKA 3WU7A 2Z6BA 2O79A 1C67A 4UWNA 1G7LC 103LA 1LGUA 3TXHA 1V7TA 9LYZA 212LA 4W54A 2XBRA 4XJFA 1LSNA 161LA 1L01A 2LC9A 1SWZA 2C8PA 1L65A 2D4JA 198LA 3A93A 4UWVA 1LSZA 2MEIA 1B7MA 1L87A 1L81A 1LZSA 1K28A 1L69A 5EBHA 4QGZA 4AXTA 1L04A 151LA 2Q9EA 4LYZA 158LA 2LYZA 4N0JA 1L49A 3OE0A 1L13A 1UIDA 1GE1A 1HEOA 3E3DA 1IIZA 3QAKA 4YENA 4YOPA 3C8QA 4WO6A 3A67Y 5FCPA 4CHXA 1OUIA 207LA 1C65A 4YF2A 1T97A 1B5ZA 1DKKA 5LA8A 1DYGA 5I5QA 1IR7A 3TMVA 2BPUA 154LA 1QS5A 4XJGA 2MEEA 5APFA 164LA 3RU5A 3TXJA 1L29A 4HJZA 4H9FA 3CDVA 2OTZX 1P2LA 5LA5A 3LYTA 4W55A 3WW5A 1G1WA 3G3VA 1CJ7A 1GF6A 2LHMA 1HSWA 1GB9A 3HT8A 1FLYA 170LA 1LKSA 3CQLA 1L80A 4LYOA 5FELA 1HERA 4ARMA 1J1OY 1LTMA 3OJPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1LZ4 A;  118L A;  1QUH A;  1REZ A;  1QTH A;  3LYM A;  1XEK A;  2H5Z A;  3DMV A;  1QT5 A;  125L A;  2G4P A;  3G3B B;  4QEQ A;  5HNL A;  4W52 A;  3HH6 A;  1GB7 A;  2B75 A;  4WG7 A;  1I56 A;  4QDN A;  1GFE A;  217L A;  4BAD A;  1SX7 A;  243L A;  1LZ5 A;  112L A;  5B1G A;  4OWA A;  2Z2E A;  180L A;  2B73 A;  3ATO A;  1L19 A;  2OEA X;  4TTD A;  4G4C A;  218L A;  2ZNW Y;  1DYF A;  1GF8 A;  1QSQ A;  1C08 C;  4KPM A;  7LZM A;  4B0D A;  1UIE A;  3WPL A;  4I7T A;  209L A;  1BGI A;  1QT3 A;  4Z3M A;  4WM4 A;  1AKI A;  1IWW A;  1UBZ A;  7LYZ A;  1L11 A;  1LZE A;  2BQM A;  2BQA A;  4NG1 A;  3WU9 A;  4NHP A;  4DD3 A;  1LMA A;  132L A;  2HED A;  3TMW A;  4N1E I;  1P2C C;  1VDP A;  2VB1 A;  5KKI A;  2HU1 A;  128L A;  1DPX A;  3CT5 A;  2I26 L;  2CDS A;  4I7N A;  4OOO A;  1F10 A;  130L A;  1B0D A;  4H92 A;  1WQN A;  3W6E A;  4Z41 A;  4DYG A;  4HJV A;  3GUK A;  1NMM A;  1L42 A;  1L89 A;  5II3 A;  3HDF A;  4YM8 A;  4PJ2 C;  1FKQ A;  3WPJ A;  3EMS A;  4DD9 A;  1QT8 A;  5LZM A;  1HFY A;  1G7M C;  1CU0 A;  4L41 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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