3HBHA

Class iv chitinase structure from picea abies at 2.25a
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
204
structure length
204
Chain Sequence
SVGGIISQSFFNGLAGGAASSCEGKGFYTYNAFIAAANAYSGFGTTGSNDVKKRELAAFFANVMHETGGLCYINEKNPPINYCQSSSTWPCTSGKSYHGRGPLQLSWNYNYGAAGKSIGFDGLNNPEKVGQDSTISFKTAVWFWMKNSNCHSAITSGQGFGGTIKAINSMECNGGNSGEVSSRVNYYKKICSQLGVDPGANVSC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The first crystal structures of a family 19 class IV chitinase: the enzyme from Norway spruce.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Class IV chitinase Chia4-Pa2
molecule tags Hydrolase
source organism Picea abies
total genus 75
structure length 204
sequence length 204
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2009-05-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00182 Glyco_hydro_19 Chitinase class I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3hbhA01
3.30.20.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Endochitinase; domain 2 Endochitinase, domain 2 3hbhA02
1D0KA 1LZRA 4XJBA 1B7QA 5JENB 5LAGA 4HPIA 4Z98A 5HNCA 4NSIA 4WL7A 3GXKA 4G49A 4XN6A 4R6CA 1B0DA 3A8ZA 2D4IA 2MEBA 1YAPA 2YBMA 4I8SA 1IORA 4NGJA 1HEWA 1QUSA 4LYCA 4PGJB 2HEDA 3K3TA 4CGEA 1REXA 3LYTA 1VDSA 1VATA 2LYZA 4ZIXA 4NWHA 2BLXA 1KIRC 5E9RA 1HHLA 3RT5X 3WXUA 5LYTA 3ATNA 4TX7A 1LJJA 2ZYPA 1GDXA 1WVVA 5F14A 1QUTA 4CJ2A 1BB6A 2BQJA 3AJNA 1UBZA 208LA 1GF9A 1BHZA 1LHJA 3FI7A 1GFAA 1GF0A 1LSDA 1FLUA 3IWRA 4B49A 2EIZC 4RW1A 5EBHA 1CNSA 1OUDA 1BWIA 1LJNA 1LZ1A 2HEFA 3ULRA 1JITA 3EBAB 5M1YA 2H9JA 4B4JA 1IY3A 4DYGA 2LYMA 1OQMA 2ZQ4A 1IWZA 3BKVA 4LFXA 1NBYC 1LSFA 1NQIA 1GBSA 1ALCA 5FHWA 1RE2A 3EXDA 1F0WA 2DKVA 4LT3A 4X3BA 1GF7A 3W6CA 3EMSA 5KKJA 5KY1A 1GBZA 3A6CY 1N4FA 2Z18A 3BKHA 4H1PA 1C43A 5KXMA 3LHMA 4H94A 1GE4A 5FEKA 3A90A 1IWTA 1QTKA 4W96A 2YBNA 5F9XA 4WG7A 1IP1A 4G4HA 4WLTA 2G4QA 3CSRA 3WVXA 4QY9A 3WVYA 1GF4A 1RJCB 2YBJA 5KXOA 1XGQC 4GLVA 1I20A 1HEMA 2X0AA 4DWXA 4N0JA 4FJRA 4H9HA 5ILCA 1LMQA 1JISA 1LJ3A 1LMAA 4CFOA 4XJIA 2EKSC 2EQLA 1HC0A 1EL1A 4HTKA 5B07A 4D9ZA 4IATA 4WM1A 1LJKA 2HEEA 4Z46A 4DDBA 3A91A 1GFGA 1JTOL 4OWEA 2BPUA 4NGVA 1LJEA 3W6AA 1GXXA 4WLXA 5FCPA 4WLDA 3WPJA 1YILA 5KXRA 5HMJA 4LZTA 4H9FA 4DD7A 2ZIKA 2D91A 1D6QA 1LZSA 1NMMA 4Z3MA 4WLYA 3WPKA 2EPEA 5APDA 4NHPA 1XGTC 3T6UA 2LYOA 4WG1A 4GCDA 4IJ4A 3P65A 3M3UA 3W6FA 2Z38A 5B1FA 4TSCA 1O23A 2GV0A 5LYMA 1HERA 3OK0A 1GAYA 4MSTA 1GE3A 3W6BA 4GN3A 4J7VA 4EOFA 4H9BA 1HEQA 1LHMA 3W6DA 3SP3A 1DKJA 3AGHA 4H91A 5KXKA 3IJVA 4GCFA 2YBLA 3TXBA 1HF4A 1CKCA 1NHEA 4DD2A 2ZNWY 1HFYA 4HJZA 5KXTA 2W1LA 1C46A 2I25L 3TXEA 2HEBA 1LMCA 5I4YA 4MCKA 153LA 1UICA 3J4GA 2BQKA 1BB7A 2FBDA 1LZYA 3AW6A 4GCCA 4RLMA 1YROA 3AYQA 4NHTA 4KL7A 1IR9A 2HTXA 2BQLA 4DD0A 5I4XA 4ETDA 1WQNA 1QDRA 1AT6A 5K7OA 1EQEA 1ZV5L 1DZBX 3OJPA 3WMKA 1UACY 4KXIA 4QDNA 5IHGA 1LZDA 1J1XY 5LAFA 1LCNA 1IP4A 1LZCA 194LA 1OUJA 4H8ZA 3TMUA 133LA 1IO5A 1BB4A 1BB3A 5KXNA 4GN4A 1FBIX 1EQ5A 1GF6A 2RSCA 2FYCA 4TTDA 2ZILA 3W3EA 2IHLA 1AM7A 1BVKC 1DQJC 1UIBA 1B7SA 2XBRA 5KJ9A 3P64A 1JKDA 1YQVY 2BQIA 1JPOA 1B9OA 2DQCY 3G3BB 3G3AB 4H8YA 4ML7A 5KXPA 5KXXA 1IX0A 1NBZC 1I1ZA 4GLAA 1LSMA 4TUNA 5B1GA 4NSJA 132LA 4HJYA 4UWVA 1IR7A 5AMYA 4FDYA 5C6LA 1HNLA 2DQGY 5L3HA 4RLNA 2BQCA 3D9AC 1BB5A 3ZEKA 1ZVYB 1QIOA 1GXV2 1XSFA 4ETEA 1HSWA 3RW8A 1GB7A 4DC4A 4RW2A 4HTNA 4H9CA 1NDGC 4N1CC 1B7NA 1NDMC 1JWRA 1KXYA 3WU7A 1TCYA 2Z37A 3LYZA 2MEIA 2ZIJA 1VDTA 1LTMA 4C5FA 1JJ1A 1H6MA 2BLYA 1CKDA 1ZMYL 4DDCA 2DQIY 1GEVA 3F6ZA 4N9RA 5A3EA 1BQLY 1UIAA 2DQAA 4A7DA 5E4PA 4M6DA 4W94A 1IIZA 134LA 2YBIA 3AZ7A 4ET8A 2DQEY 4HTQA 1B5WA 1CJ9A 1RI8B 1IWVA 1VAUA 4ANRA 1G7JC 2I26L 3ZVQA 2LZTA 1HEOA 4HP0A 4NWEA 1WQQA 3E3DA 2BAAA 3N9CA 4NGYA 4TSBA 2BQAA 4XJGA 3RZ4A 1NF5A 1JKAA 1LZGA 1AT5A 1LSEA 4OWAA 1F10A 1C08C 1LZ8A 4ETBA 1HFZA 1JTTL 3ATOA 2Z19A 2Z39A 2HEAA 5APEA 1IVMA 1IC7Y 1YANA 3WU9A 2LZ2A 5KKIA 5LYZA 2ZYCA 1FDLY 4XYYA 1PZYA 1LJFA 1XEIA 3QE8A 1GB8A 1GBWA 1VDPA 4N8ZA 2IFFY 1OUBA 1AZFA 4GN5C 1LHKA 2F30A 3A3RX 3B0OA 1LZ9A 1IWXA 2BQGA 1WQRA 4KT3A 4H93A 1RCMA 3TXIA 1LSCA 1UIGA 1DI5A 2BQFA 4LYMA 2MECA 4H9IA 2DQDY 2HU3A 5FELA 4DD9A 2Z2EA 1WQOA 4N1EI 3WUAA 1GB2A 2XBSA 3D3DA 1SQ2L 1WTNA 207LA 4ETCA 1UIDA 1UA6Y 5KXYA 1CKGA 5KXZA 3WULA 1B7OA 5A3ZA 4DD3A 5L9JA 2D4JA 2VB1A 1IP7A 4MR1A 1REMA 2XTHA 1LYYA 135LA 4YEOA 5HLLA 2A7DA 1IP2A 2HUBA 3WUMA 1NWGA 2DQHY 1DKKA 1LSYA 1IC5Y 1CJ6A 1RFPA 1YL1X 3B6LA 1IWWA 4NGOA 2D4KA 3AZ4A 2AUBA 1AKIA 4G4CA 5LINA 1LZBA 1QTEA 4NEBA 5F9UA 1HELA 4ET9A 3WYHA 5ILFA 1G7MC 2CWIA 3N9AA 3CSZA 1OUGA 1IOTA 2F4GA 8LYZA 1FKVA 1GE2A 3TXJA 4PPOA 1D0MA 4Z41A 1G7IC 5IELA 1GF3A 1LKRA 1W08A 1KIPC 1GWDA 1UIHA 1E8LA 4WM6A 1J1PY 5LA8A 2F2NA 1PS5A 1LJ4A 1QSWA 1XFPL 4LYTA 1LJGA 1INUA 2LHMA 5D5FA 4ETAA 3A67Y 1T3PA 5II3A 1OUFA 4H9EA 3QY4A 1LSGA 1REYA 2H9KA 1JEFA 4U3XB 1XEKA 3TXFA 1XGUC 2FYDA 1FLQA 1B7PA 4H9AA 1HSXA 1QQYA 1G7LC 1B5VA 6LYZA 3KAMA 154LA 3WH1A 2DBTA 5LXWA 9LYZA 1LOZA 1XGRC 3A95A 1CKHA 1LMOA 1A4VA 1B7MA 1J1OY 1GBXA 3T36A 1OUAA 4LYZA 4NGIA 3IJUA 4CHXA 1JSEA 1TAYA 2B5ZA 2D6BA 1WQMA 1D0LA 5F16A 4J0LA 1XGPC 3CB7A 1CKFA 4OWBA 1LHHA 1CJ8A 1ZVHL 5DL9A 1DPWA 2BQOA 1EQ4A 3P66A 4TWSA 1B7LA 1LZTA 3FE0A 4QEQA 1LJIA 1LZ4A 3A3QA 2BQEA 3MGWA 4HV2A 1IR8A 2Y8PA 4J1BA 4XENA 5LVKA 1GBYA 2W1MA 1QDTA 1OUEA 4BAPA 4HPEA 1Z55A 1V7TA 4BADA 5LVGA 3B0KA 1T6VL 1BWJA 1GDWA 2W1YA 2YBHA 3GXRA 1IWYA 4LFPA 4ZEEA 1GB9A 3A96A 4NSHA 4ZFPA 1LYOA 1DPXA 3ZVQB 4LYOA 3QNGA 1GHLA 1LYSA 2CGIA 3HFMY 3M18B 1HEPA 4NG8A 2MEAA 4WM2A 3TXGA 4M4OA 1YKZX 1YAQA 1MLCE 1IOCA 4O34A 3A93A 5T3FA 3WW6A 3HBHA 1DI3A 3HBEX 1YL0X 1UCOA 2MEFA 3WXTA 4C3WA 4YM8A 4J1AA 4OOOA 4WMGA 1IOSA 1D6PA 3CT1A 1FKQA 4WM4A 3CT0A 4NG1A 3TXHA 3WU8A 4B4EA 5HMVA 1V7SA 1GE0A 1TBYA 1D9UA 1GFEA 1HMLA 1OUCA 1IP6A 4BAFA 3N9EA 2BQBA 3WL2A 1G7HC 1BWHA 1IP5A 3AB6A 4B4IA 1HFXA 1GB3A 2FBBA 4P2EA 1UIFA 3LYOA 5B05A 4NFVA 3A94A 3B72A 1B7RA 4YEMA 3LZTA 5C6IA 1JJ0A 1QSAA 2YDGA 4PRUA 1VDQA 1P2CC 4DDAA 1LAAA 4E3UA 1JTPL 1LSAA 1REZA 2MEEA 1GFHA 4NHSA 1LJHA 4G9SA 4N5RA 2DQFC 3TXDA 1YKYX 1F6SA 5J7CA 1GAZA 4PRQA 4AGAA 1VFBC 1LMTA 4WOAA 4BS7A 4NHQA 1GFKA 3CT5A 7LYZA 3AGIA 1JKBA 4GCBA 2Z2FA 5HQ1A 1LKSA 4OOTA 2BQNA 2HU1A 3A92A 4CFPA 5I53A 1JUGA 4B1AA 1LYZA 2Z12A 1JHLA 1LZAA 1GB5A 1IY4A 2BQMA 2YVBA 1MELL 3TXKA 1GEZA 2MEGA 4NSGA 1BVXA 4OW1A 2XJWA 2F4AA 4LT2A 5FSTA 4NGLA 5F81A 5B59A 4EMNA 1GB0A 4QGZA 2MEHA 4R0FA 1LZ5A 4AXTA 1GB6A 2I6ZA 1IEEA 4YF2A 5DM9A 1IC4Y 3RNXA 1FN5A 5LVJA 1JKCA 3EO5A 2ZQ3A 1GFUA 1XEJA 4LT1A 4LGKA 193LA 5HNLA 2H5ZA 5LVHA 4OWHA 1UUZC 2G4NA 1FLYA 1A2YC 3HBDA 4UWNA 1IWUA 4NIJA 1LPIA 2NWDX 4YENA 1FLWA 4PHIA 4DD1A 2CDSA 4LYBA 1DI4A 1KXWA 2HECA 1B5XA 4H8XA 3AGGG 1LHIA 1WTMA 4WM3A 2C8OA 1UIEA 4RDSA 1GF5A 2BQHA 1B5ZA 3P4ZA 4G4BA 1GBOA 4NGZA 4HJVA 4WO6A 4XADA 5B06A 1F6RA 5LVIA 1GF8A 2ZNXY 1HMKA 1LSPA 2G4PA 1LHLA 1LZNA 2C8PA 3A34A 4XJFA 4WO9A 4L41A 1DXJA 4YOPA 3WPLA 6LYTA 2WARA 3TMWA 3WW5A 1OUIA 5KXLA 3TMVA 3CQLA 1C7PA 3A6BY 5I5QA 5KXSA 5KXWA 3AZ5A 5I54A 1KXXA 1LMPA 2DQJY 4WL6A 1IOQA 1TEWA 1JIYA 1GE1A 4UWUA 1VEDA 4GCEA 3TMXA 4KPMA 4WM5A 1YAOA 4HV1A 1B2KA 1HENA 4I0CA 2W1XA 1WVUA 4IASA 1GFTA 4II8A 5FDJA 1JJ3A 1JSFA 4H90A 3AZ6A 2A7FA 1YAMA 1B5YA 1LMNA 1OUHA 5IDDA 5I4WA 4HSFA 4NGWA 3LZ2A 5C6JA 5LIOA 4B0DA 1B5UA 1GFJA 2ZWBA 2Q0MX 4NGKA 5D5CA 1WQPA 4LT0A 1C45A 1GPQC 5LA5A 2CJLA 5DN5A 1I56A 1GD6A 4NY5A 5L3IA 1OP9B 4XJHA 5APCA 4XJDA 3P68A 1H87A 4NHIA 4PJ2C 2YSSC 3VWOA 1LZ6A 1YIKA 1NKHA 1YKXX 5DN4A 1KIQC 1BGIA 5DLAA 4DT3A 3CSQA 1SLYA 4H92A 1C10A 1LSBA 1W6ZA 3AW7A 3B0IA 1GFRA 1CJ7A 3W6EA 3WUNA 1TDYA 1UC0A 2MEDA 5APFA 1LSNA 1LSZA 1GFVA 3RU5A 2N5ZA 3J6KA 2BQDA 1IP3A 3LN2A 2PC2A 1LZEA 4OWCA 3LYMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5HNCA 4WL7A 4XN6A 1P2RA 1L10A 249LA 2L78A 1QUSA 4LYCA 3K3TA 4CGEA 1KW7A 2RBNA 3ATNA 1LJJA 170LA 1WVVA 5F14A 1QUTA 4CJ2A 3PDSA 2BQJA 208LA 1LHJA 3FI7A 1P3NA 1FLUA 1QTZA 4B49A 4RW1A 1BWIA 3ULRA 1KW5A 1CV0A 1L69A 1C6QA 3BKVA 1LSFA 1NQIA 1RE2A 3EXDA 3EMSA 3A6CY 1N4FA 261LA 3BKHA 1C43A 1K28A 1GE4A 3C82A 1QTKA 5F9XA 4G4HA 3CSRA 3UONA 1L38A 3WVYA 2YBJA 1C65A 4N0JA 5ILCA 4CFOA 2EQLA 1HC0A 1EL1A 4HTKA 4D9ZA 4WM1A 4DDBA 3A91A 1GXXA 4WLXA 3RUNA 4EKQA 2D91A 1NMMA 3WPKA 2EPEA 2B6YA 1XGTC 3PBLA 3W6FA 5B1FA 1L30A 1HERA 1GAYA 4MSTA 1LI3A 1HEQA 3OE0A 110LA 1HF4A 2ZNWY 4W57A 5KXTA 5LZMA 4KL7A 1L59A 103LA 1LGWA 4I7OA 1J1XY 1L92A 195LA 194LA 3TMUA 5KXNA 4S0WA 1KY0A 1B7SA 2XBRA 1YQVY 2BQIA 5KXXA 1JPOA 3G3AB 4H8YA 1NBZC 1LSMA 4NSJA 173LA 5AMYA 1SWZA 5L3HA 1C6AA 3D9AC 1BB5A 1ZVYB 1C64A 1L29A 1LI6A 1GB7A 3DN4A 260LA 3WU7A 1TCYA 2Z37A 2MEIA 1L90A 2ZIJA 4C5FA 4I7TA 1CKDA 2DQIY 3CDQA 1LI2A 4W54A 1RI8B 4ANRA 4EPFA 2LZTA 4TSBA 1NF5A 1L09A 1LSEA 1CX6A 2HULA 1F10A 1HFZA 3HTGA 223LA 3WU9A 2LZ2A 1KS3A 5KKIA 1CTWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1D0K A;  1LZR A;  4XJB A;  1B7Q A;  5JEN B;  5LAG A;  4HPI A;  4Z98 A;  5HNC A;  4NSI A;  4WL7 A;  3GXK A;  4G49 A;  4XN6 A;  4R6C A;  1B0D A;  3A8Z A;  2D4I A;  2MEB A;  1YAP A;  2YBM A;  4I8S A;  1IOR A;  4NGJ A;  1HEW A;  1QUS A;  4LYC A;  4PGJ B;  2HED A;  3K3T A;  4CGE A;  1REX A;  3LYT A;  1VDS A;  1VAT A;  2LYZ A;  4ZIX A;  4NWH A;  2BLX A;  1KIR C;  5E9R A;  1HHL A;  3RT5 X;  3WXU A;  5LYT A;  3ATN A;  4TX7 A;  1LJJ A;  2ZYP A;  1GDX A;  1WVV A;  5F14 A;  1QUT A;  4CJ2 A;  1BB6 A;  2BQJ A;  3AJN A;  1UBZ A;  208L A;  1GF9 A;  1BHZ A;  1LHJ A;  3FI7 A;  1GFA A;  1GF0 A;  1LSD A;  1FLU A;  3IWR A;  4B49 A;  2EIZ C;  4RW1 A;  5EBH A;  1CNS A;  1OUD A;  1BWI A;  1LJN A;  1LZ1 A;  2HEF A;  3ULR A;  1JIT A;  3EBA B;  5M1Y A;  2H9J A;  4B4J A;  1IY3 A;  4DYG A;  2LYM A;  1OQM A;  2ZQ4 A;  1IWZ A;  3BKV A;  4LFX A;  1NBY C;  1LSF A;  1NQI A;  1GBS A;  1ALC A;  5FHW A;  1RE2 A;  3EXD A;  1F0W A;  2DKV A;  4LT3 A;  4X3B A;  1GF7 A;  3W6C A;  3EMS A;  5KKJ A;  5KY1 A;  1GBZ A;  3A6C Y;  1N4F A; 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 1B5Z A;  3P4Z A;  4G4B A;  1GBO A;  4NGZ A;  4HJV A;  4WO6 A;  4XAD A;  5B06 A;  1F6R A;  5LVI A;  1GF8 A;  2ZNX Y;  1HMK A;  1LSP A;  2G4P A;  1LHL A;  1LZN A;  2C8P A;  3A34 A;  4XJF A;  4WO9 A;  4L41 A;  1DXJ A;  4YOP A;  3WPL A;  6LYT A;  2WAR A;  3TMW A;  3WW5 A;  1OUI A;  5KXL A;  3TMV A;  3CQL A;  1C7P A;  3A6B Y;  5I5Q A;  5KXS A;  5KXW A;  3AZ5 A;  5I54 A;  1KXX A;  1LMP A;  2DQJ Y;  4WL6 A;  1IOQ A;  1TEW A;  1JIY A;  1GE1 A;  4UWU A;  1VED A;  4GCE A;  3TMX A;  4KPM A;  4WM5 A;  1YAO A;  4HV1 A;  1B2K A;  1HEN A;  4I0C A;  2W1X A;  1WVU A;  4IAS A;  1GFT A;  4II8 A;  5FDJ A;  1JJ3 A;  1JSF A;  4H90 A;  3AZ6 A;  2A7F A;  1YAM A;  1B5Y A;  1LMN A;  1OUH A;  5IDD A;  5I4W A;  4HSF A;  4NGW A;  3LZ2 A;  5C6J A;  5LIO A;  4B0D A;  1B5U A;  1GFJ A;  2ZWB A;  2Q0M X;  4NGK A;  5D5C A;  1WQP A;  4LT0 A;  1C45 A;  1GPQ C;  5LA5 A;  2CJL A;  5DN5 A;  1I56 A;  1GD6 A;  4NY5 A;  5L3I A;  1OP9 B;  4XJH A;  5APC A;  4XJD A;  3P68 A;  1H87 A;  4NHI A;  4PJ2 C;  2YSS C;  3VWO A;  1LZ6 A;  1YIK A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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