3HH3A

New azaborine compounds bind to the t4 lysozyme l99a cavity - 1,2-dihydro-1,2-azaborine
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAAAINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Boron mimetics: 1,2-dihydro-1,2-azaborines bind inside a nonpolar cavity of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 57
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2009-05-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3hh3A00
1PQOA 2CUUA 1G1VA 1L57A 3CDTA 3NY9A 1LI3A 1L51A 1P64A 3SN6R 243LA 4I7NA 187LA 3DNAA 1L0KA 239LA 3C80A 4ARJA 4ARMA 4W55A 175LA 2ANVA 1QT3A 1QSBA 1C6KA 1L12A 1L79A 1QT7A 1L03A 262LA 4YXCA 1PQKA 155LA 3G3WA 249LA 1L80A 1L04A 1OVKA 195LA 1C63A 3QAKA 1L93A 1KNIA 1SSWA 246LA 3RUNA 1G0QA 1L61A 4I7PA 2F47A 1L43A 1LYJA 1L60A 1P36A 158LA 1DYAA 1L73A 2A4TA 4GRVA 160LA 163LA 1C6FA 1L20A 3UONA 3DN3A 2OTZX 1KW7A 1C6NA 1L28A 3HTBA 2B6XA 3GUKA 4S0WA 3HUQA 1OWYA 1L14A 7LZMA 1C6IA 4E97A 256LA 4YXAC 3C8QA 3D4SA 218LA 219LA 1C6QA 228LA 173LA 190LA 169LA 182LA 2Z6BA 1G06A 220LA 3DKEX 110LA 1L19A 241LA 152LA 2B7XA 3NYAA 1L63A 1L72A 1P5CA 4ARLA 1CV4A 1D2YA 1L13A 130LA 4ARPA 1OWZA 1L05A 2B73A 2B6ZA 1LGUA 1L07A 1CV5A 4I7TA 4I7SA 2LZMA 2F32A 3HU8A 1DYBA 4ARQB 1QSQA 1D3FA 253LA 3C8RA 1ZURA 3HT9A 3OE9A 192LA 1LPYA 3DN4A 3SB8A 247LA 191LA 3HTFA 1L16A 3GUMA 180LA 248LA 1JTNA 3SBBC 1QUOA 197LA 104LA 4I7MA 2IGCA 2RBRA 1L92A 4ARMB 231LA 3HH6A 3L64A 1XJUA 2NTHA 3HH5A 223LA 2L78A 1QUGA 3SB9A 244LA 1L25A 3C8SA 1L00A 1QUHA 3DMVA 3HUKA 1SWZA 4DKLA 1C66A 1G0MA 103LA 254LA 2RH1A 186LA 1L49A 102LA 1L53A 1L90A 3OE0A 1L88A 4EJ4A 1LYFA 1QTBA 122LA 1D9WA 3C82A 138LA 209LA 1L01A 113LA 236LA 255LA 123LA 1L02A 1LYGA 215LA 222LA 1L27A 3HH4A 142LA 1P3NA 1L17A 1NHBA 1C6CA 107LA 3VW7A 260LA 181LA 1C68A 230LA 1P56A 259LA 176LA 1T97A 1DYCA 1SSYA 1TLAA 184LA 4EKSA 1WTHA 1C6JA 1D3JA 4I7RA 2RBPA 3CDVA 3DN2A 1L97A 225LA 1L83A 3DN6A 2B6YA 4EKPA 1QTVA 4EXMA 1L11A 165LA 3HUAA 4K5YA 151LA 2B6TA 3CDRA 177LA 3HT7A 4PK0A 139LA 3HU9A 1L74A 1L91A 1G1WA 201LA 2B70A 234LA 1L55A 1L21A 1QTHA 1B6IA 1L15A 1C6AA 143LA 2OTYX 3DMZA 1KY0A 3F8VA 1SX2A 1JQUA 1OYUA 1L29A 1XEPA 1P46A 170LA 1QTZA 3DN0A 3ODUA 1CV3A 2RBQA 3V2WA 1L52A 1QT4A 240LA 251LA 1DYDA 3L2XA 128LA 1LGWA 1CV1A 145LA 2B6WA 4PJZA 174LA 2OE9X 1L47A 3FI5A 2OU8A 238LA 1QUDA 2Q9EA 1G07A 1G0LA 1ZYTA 149LA 258LA 1L70A 1L50A 159LA 1I6SA 1CVKA 1CV6A 1L64A 1L98A 167LA 1C6LA 1SX7A 129LA 1T8FA 1C60A 1L06A 2RB2X 4W54A 148LE 1P2LA 3DN8A 4IAPA 146LA 1L95A 141LA 112LA 1D3MA 217LA 1C6MA 1QTCA 1SWYA 2RAZX 3K2RA 1QTDA 3NY8A 1QT5A 4GBRB 4EPFA 1L26A 1L37A 2O7AA 1OVJA 235LA 1LYHA 1G0JA 1CU3A 1P2RA 108LA 213LA 2OU9A 1L89A 1C6TA 4ZPUA 6LZMA 257LA 1L48A 4I7JA 4I7OA 1G0PA 1G0KA 4I7QA 1QS5A 216LA 2O4WA 1G0GA 224LA 1C62A 1L42A 2OEAX 1C6PA 1L46A 1L96A 1KS3A 2QB0B 1KW5A 1C6GA 1L58A 205LA 3C7WA 1T8AA 1K28A 3C81A 1C69A 1OV5A 4W57A 2B75A 1DYFA 127LA 126LA 196LA 1L77A 3HDEA 3SB7A 120LA 1P6YA 157LA 237LA 2HUKA 232LA 1L30A 2ANXA 164LA 1PQJA 1L59A 2NTGA 198LA 2OU0X 2OE7X 178LA 1QS9A 3SB6A 3GUOA 1CU6A 4LDLA 1L33A 2RBOA 1L85A 211LA 1EPYA 3GUJA 2RBNA 1LWKA 245LA 214LA 1C6DA 2B74A 4AQNA 166LA 161LA 1L35A 119LA 261LA 2QARC 189LA 3SBAA 3LZMA 185LA 1L76A 1T8GA 1T6HA 2HUMA 3GUPA 212LA 188LA 1L38A 156LA 200LA 3DMXA 1L75A 1OV7A 1L44A 3G3VA 3GULA 4EPIA 4DJHA 4OO9A 168LA 3HDFA 4W53A 1D2WA 1L10A 2F2QA 4LZMA 2O79A 199LA 1L86A 3OE6A 3CDOA 1LI2A 1PQIA 1L82A 3C7YA 1P37A 118LA 2Q9DA 1L45A 1LYEA 2HULA 1L41A 1C67A 125LA 3HTGA 131LA 1L56A 1PQMA 1QT6A 1CTWA 1QT8A 1KY1A 114LA 172LA 2OE4X 1L81A 1LYDA 4YX7C 1L31A 1L87A 1L24A 1C64A 4LDEA 3OE8A 147LA 1L71A 221LA 1C6HA 1ZWNA 1L39A 3C7ZA 3HTDA 1L0JA 1L22A 1CU5A 210LA 137LA 1L40A 1L84A 242LA 229LA 1L23A 1XJTA 3EMLA 1OVHA 1L62A 1C6BA 1CX6A 4W59A 162LA 1L18A 1CU2A 4W51A 150LA 1L66A 2RAYX 4DAJA 1L36A 3RZEA 3GUIA 206LA 5LZMA 4W52A 1L67A 3FA0A 3HH3A 1LGXA 3CDQA 4LDOA 3HWLA 1L34A 1C61A 4W58A 3C83A 144LA 1CUQA 3PBLA 2LC9A 1C65A 4EKQA 111LA 3FADA 250LA 3JR6A 252LA 1LYIA 226LA 1LW9A 1L32A 3SB5A 1PQDA 140LA 4W56A 233LA 2LCBA 1JTMA 1CX7A 1LI6A 115LA 4EKRA 1P7SA 1L94A 1CU0A 1L09A 1L99A 1DYEA 1LLHA 2RB1X 2RB0X 1L65A 5I14A 3HT8A 1CUPA 227LA 1L69A 1C6EA 3HT6A 171LA 3GUNA 3DN1A 109LA 3F9LA 3PDSA 1LWGA 3G3XA 1CV0A 3V2YA 1D3NA 183LA 4I7KA 2B72A 1L54A 4I7LA 1DYGA 1L08A 1L68A 2RBSA 4ARQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4HV1A 2CUUA 2CWIA 1G1VA 3CDTA 3NY9A 4DD1A 1LI3A 3D3DA 3WMKA 4DD9A 2DBTA 1B5WA 5KXNA 239LA 2DQEY 1QT3A 1C6KA 5FELA 262LA 4YXCA 1PQKA 1JEFA 3KAMA 3G3WA 249LA 5F9XA 1L04A 1NQIA 1TCYA 207LA 1J1XY 2F47A 4U3XB 1LYJA 1P36A 4N0JA 1A2YC 160LA 1L20A 1B5XA 1LJFA 4G4CA 3GUKA 4S0WA 4NHTA 3N9CA 1LSMA 1HC0A 7LZMA 1C6IA 4YXAC 173LA 4XN6A 3IJVA 1H6MA 3IJUA 5KKIA 5HMVA 4J7VA 110LA 241LA 2B7XA 5KXKA 1LSGA 4ARLA 1KXXA 1B2KA 2BPUA 4ARPA 2B73A 3LZ2A 8LYZA 2FBDA 4LYTA 4DD7A 1L07A 1CV5A 4I7TA 4B4IA 4ARQB 5I5QA 253LA 1ZURA 192LA 4CGEA 2ZQ3A 3SB8A 1IY3A 1QUOA 154LA 104LA 4WM5A 1L92A 5LVGA 3VWOA 4PGJB 1YL0X 1L25A 3C8SA 4DKLA 1NKHA 103LA 3BKVA 4NGLA 2DKVA 1L53A 1JIYA 4TSCA 1I56A 1LZ4A 1BWHA 4Z46A 1LYFA 4LT0A 122LA 3C82A 138LA 2G4NA 1LMTA 113LA 1HFYA 4YENA 123LA 4C3WA 4GCDA 222LA 4HJZA 2MEIA 1P3NA 1B7LA 1L17A 1NHBA 1UIFA 1C68A 4NGYA 1D0LA 1SSYA 4RLMA 1IP5A 1LTMA 1D3JA 2A7FA 1OUJA 1D0MA 225LA 1L83A 3G3BB 5II3A 3B0IA 3RW8A 1L11A 165LA 1GE4A 5F14A 1LMOA 4K5YA 4B4EA 1LSPA 4H9EA 1B7QA 2YBMA 3MGWA 4PK0A 1UIBA 1GDWA 1QDTA 2BQCA 1G1WA 4KL7A 4LYZA 1VDQA 3W6DA 1C6AA 1KY0A 2Y8PA 1L29A 2BQDA 2YBJA 4UWNA 1QTZA 1BB7A 3WW6A 5LYMA 5FEKA 1L52A 1QT4A 2BQLA 240LA 1YAOA 1YL1X 1IR7A 2EQLA 1YROA 1IP1A 1BGIA 4LFXA 4W96A 3ATOA 145LA 1MELL 5LA5A 1D0KA 3FI5A 1LSDA 4NWEA 2OU8A 2Q9EA 1ZYTA 258LA 1B7OA 4GLAA 159LA 1GB5A 1L64A 5IDDA 129LA 3HBDA 1L95A 4WM4A 4RW2A 5APFA 1LMNA 1IWZA 217LA 1C6MA 1QTCA 1IP4A 3W3EA 3NY8A 1WTNA 4EPFA 1L26A 3TMUA 4WM6A 2O7AA 2LZ2A 1CJ9A 5B05A 208LA 1JITA 1GE3A 1GFVA 1GFHA 4X3BA 4I7OA 3P65A 1QS5A 2Z19A 4G49A 4H93A 1G0GA 1L42A 6LYZA 1GE0A 1FLYA 1L96A 1L58A 1K28A 1OV5A 2B75A 3CSZA 2HEEA 5D5CA 5HMJA 3HDEA 4WO9A 157LA 237LA 2HUKA 4BS7A 198LA 2OE7X 178LA 1RCMA 3P66A 1LZ1A 1OUIA 1EPYA 5L3HA 1OUDA 245LA 214LA 4AQNA 161LA 3SBAA 3LZMA 4N9RA 185LA 1GFUA 1L76A 1B7PA 1LZBA 200LA 3DMXA 4WG1A 4TWSA 1L44A 1TEWA 3P4ZA 4DDAA 4OWAA 1WQOA 1L10A 2BQGA 199LA 3OE6A 1L82A 2CDSA 1JSEA 2Q9DA 4WMGA 1GF0A 125LA 1L56A 3AJNA 1CTWA 1QT8A 1KY1A 172LA 4H94A 1LYDA 4YX7C 1BVKC 1IOSA 4BAPA 147LA 1QTKA 1C6HA 1CKGA 1L39A 4CJ2A 3A3RX 5KXZA 1KXYA 4HTQA 1CU5A 4LGKA 4YEMA 1B5VA 4XYYA 4QY9A 1O23A 3WPKA 1UBZA 4O34A 1UIEA 1HSXA 1CU2A 5KXYA 150LA 1L66A 3AZ5A 3WXTA 3GUIA 206LA 1GF7A 3A3QA 1MLCE 5ILFA 1GB2A 3HH3A 4H9HA 1XEJA 1C61A 1CUQA 2ZQ4A 4GCBA 1QTEA 3PBLA 1LJNA 4DWXA 1IWVA 4WM1A 5C6LA 4RLNA 4DQ7A 4W56A 1LYSA 3WU7A 1REZA 1HSWA 3LHMA 4EKRA 9LYZA 1PS5A 4QEQA 1L09A 1LLHA 1BB5A 5FSTA 1L65A 3HT8A 4LYBA 3F9LA 4WLTA 3TMWA 3WXUA 3SP3A 1HMKA 1N4FA 1L54A 1REXA 1L08A 1L68A 4ETEA 2X0AA 1LOZA 1F6RA 5E9RA 4NIJA 2BQBA 3RZ4A 1P64A 3SN6R 2HTXA 2DQIY 3J4GA 3IWRA 1LZ8A 2CGIA 3DNAA 4W55A 1L79A 1QT7A 5I4XA 1LJJA 3CSRA 2D4IA 1YKYX 1C63A 1L93A 1KNIA 3RUNA 5LAFA 5K7OA 1L43A 1L60A 4OOTA 1BB4A 1UIGA 1LJHA 1W6ZA 163LA 1VEDA 1YQVY 2OTZX 1KW7A 2XJWA 1C6NA 1L28A 1GB7A 1NHEA 3HTBA 1OWYA 1L14A 2XQOA 2D6BA 3AYQA 3T6UA 3TXGA 4E97A 3AGIA 4WOAA 2F2NA 3FI7A 3QNGA 1HFZA 228LA 1GB9A 4QGZA 1IP7A 5M1YA 220LA 1L19A 1LCNA 3RU5A 5B06A 4XENA 1OUCA 152LA 4DDBA 3A6BY 1LKRA 1LSNA 1OWZA 4I7SA 2F32A 1DYBA 1QSQA 3WH1A 2H9JA 3F6ZA 1D3FA 1LZSA 1LPYA 191LA 3HTFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4HV1 A;  2CUU A;  2CWI A;  1G1V A;  3CDT A;  3NY9 A;  4DD1 A;  1LI3 A;  3D3D A;  3WMK A;  4DD9 A;  2DBT A;  1B5W A;  5KXN A;  239L A;  2DQE Y;  1QT3 A;  1C6K A;  5FEL A;  262L A;  4YXC A;  1PQK A;  1JEF A;  3KAM A;  3G3W A;  249L A;  5F9X A;  1L04 A;  1NQI A;  1TCY A;  207L A;  1J1X Y;  2F47 A;  4U3X B;  1LYJ A;  1P36 A;  4N0J A;  1A2Y C;  160L A;  1L20 A;  1B5X A;  1LJF A;  4G4C A;  3GUK A;  4S0W A;  4NHT A;  3N9C A;  1LSM A;  1HC0 A;  7LZM A;  1C6I A;  4YXA C;  173L A;  4XN6 A;  3IJV A;  1H6M A;  3IJU A;  5KKI A;  5HMV A;  4J7V A;  110L A;  241L A;  2B7X A;  5KXK A;  1LSG A;  4ARL A;  1KXX A;  1B2K A;  2BPU A;  4ARP A;  2B73 A;  3LZ2 A;  8LYZ A;  2FBD A;  4LYT A;  4DD7 A;  1L07 A;  1CV5 A;  4I7T A;  4B4I A;  4ARQ B;  5I5Q A;  253L A;  1ZUR A;  192L A;  4CGE A;  2ZQ3 A;  3SB8 A;  1IY3 A;  1QUO A;  154L A;  104L A;  4WM5 A;  1L92 A;  5LVG A;  3VWO A;  4PGJ B;  1YL0 X;  1L25 A;  3C8S A;  4DKL A;  1NKH A;  103L A;  3BKV A;  4NGL A;  2DKV A;  1L53 A;  1JIY A;  4TSC A;  1I56 A;  1LZ4 A;  1BWH A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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