3HH4A

New azaborine compounds bind to the t4 lysozyme l99a cavity - benzene as control
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAAAINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Boron mimetics: 1,2-dihydro-1,2-azaborines bind inside a nonpolar cavity of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 61
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2009-05-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3hh4A00
1P5CA 1LPYA 4LDLA 104LA 1CUPA 247LA 1L31A 2B6YA 2F47A 4I7NA 2OE7X 248LA 4EJ4A 175LA 2OE4X 2QB0B 1C6TA 131LA 144LA 7LZMA 1L45A 146LA 2B70A 1CU6A 1QTZA 1LI6A 1CX6A 1OWZA 1D3FA 109LA 3HT9A 259LA 4LDEA 3HH3A 3DNAA 1G1VA 231LA 1T8FA 2O79A 3HH6A 1PQKA 3GUIA 3SB8A 196LA 1G06A 139LA 1L53A 1QTDA 184LA 3C7WA 1L06A 2CUUA 192LA 1LYHA 141LA 205LA 168LA 1C67A 1L62A 2O4WA 4W55A 6LZMA 3DN0A 1C64A 1L51A 1ZURA 1L49A 128LA 1P3NA 2RBOA 3L64A 3DMVA 3G3XA 1L00A 1L52A 174LA 3PBLA 2B74A 1T97A 1L04A 1ZWNA 1L92A 1L60A 237LA 212LA 130LA 3SN6R 147LA 1L36A 138LA 181LA 3SB7A 4EPIA 1CX7A 1XEPA 4EKSA 1L02A 3JR6A 1OV5A 3HDFA 1L59A 2Q9DA 1L48A 1L46A 1PQOA 232LA 261LA 182LA 1KS3A 143LA 4W53A 1L10A 1QUGA 4I7MA 3HH4A 1LGXA 166LA 1CVKA 1L73A 1L03A 1QTVA 3DN8A 1C6NA 1OWYA 1D3MA 3HT7A 1LWGA 258LA 1KNIA 156LA 2L78A 2B7XA 1SWZA 3GUPA 1L80A 3F9LA 1OVKA 1C6EA 3VW7A 3GUKA 251LA 1L98A 3F8VA 2A4TA 3K2RA 114LA 2Q9EA 1PQIA 3DN2A 155LA 1QUOA 189LA 4I7OA 1G0KA 1L07A 1L50A 3HTFA 2IGCA 4EKRA 4ARLA 1T8AA 219LA 1L41A 1PQJA 2NTHA 1C63A 1C6KA 3GULA 228LA 150LA 1C61A 2F32A 3DMZA 108LA 3C83A 1G0QA 226LA 1C6HA 1P46A 4ZPUA 221LA 1L89A 1TLAA 1CV1A 1DYDA 240LA 1G0PA 195LA 3PDSA 224LA 3HT6A 4I7JA 197LA 2OU8A 162LA 1QUDA 206LA 3HUKA 3HTBA 1L01A 3QAKA 115LA 2B73A 1KW5A 4I7RA 246LA 163LA 3NY8A 1SX7A 1P36A 2RBNA 1L86A 152LA 3C8SA 1JTMA 4W54A 171LA 4AQNA 4DJHA 3HTDA 213LA 1L05A 1L19A 222LA 1L12A 3HH5A 3G3VA 3V2WA 3HT8A 1G07A 1T6HA 4LDOA 4EKQA 4E97A 1L66A 4GBRB 1SSWA 1I6SA 3OE8A 4I7QA 4I7TA 4EPFA 1G0GA 1L11A 2LZMA 1QS5A 3NY9A 2B6WA 3SBAA 245LA 169LA 1C6GA 253LA 1C6QA 1LW9A 4DKLA 1QTBA 1QT8A 164LA 1EPYA 1CV5A 2RH1A 3SB6A 3C7YA 4W52A 1L34A 126LA 1L85A 2NTGA 3HUAA 1L96A 3SBBC 3EMLA 1L99A 1L94A 1L77A 238LA 3GUOA 2ANXA 157LA 142LA 145LA 1QSQA 2OU9A 1L93A 140LA 190LA 3DMXA 1QT4A 102LA 230LA 214LA 223LA 123LA 1DYCA 3RZEA 216LA 186LA 1L0JA 199LA 1OVHA 1L40A 3C8RA 4ARMB 1L28A 5I14A 1C6DA 1L17A 1L25A 2RAYX 1LI3A 137LA 1DYFA 1CUQA 1L16A 2RBSA 4ARPA 4W59A 234LA 2RAZX 1L88A 1QT5A 1L68A 1L76A 1P6YA 1L81A 1QT6A 1D2YA 1L82A 2OTYX 2OTZX 198LA 4GRVA 1L09A 1QUHA 1C6FA 260LA 1L84A 5LZMA 262LA 241LA 159LA 1C6AA 1L65A 2ANVA 129LA 1QSBA 149LA 3C8QA 161LA 1C6JA 3CDQA 1CU0A 107LA 1L42A 1L87A 1L38A 1SX2A 2B72A 2F2QA 173LA 1LLHA 2OE9X 1DYEA 4EXMA 1L90A 103LA 1LYEA 4ARJA 1C6LA 3HU8A 1PQMA 1L13A 255LA 1OYUA 1LGWA 1QT3A 1KY0A 243LA 3NYAA 177LA 1L54A 220LA 3GUJA 170LA 180LA 1XJTA 1SWYA 3CDVA 1L43A 1L55A 1LYFA 1L37A 1C6IA 188LA 2B6ZA 3GUMA 4W56A 1L44A 1L22A 2O7AA 257LA 3HUQA 1L23A 127LA 3L2XA 4ARQA 1L97A 4YX7C 3C80A 2RB2X 227LA 3UONA 1L57A 112LA 3HTGA 1L30A 1L71A 3OE0A 1P2RA 1LYDA 1L33A 1L29A 1L70A 118LA 1QTHA 2Z6BA 3C82A 3DKEX 1QTCA 1C62A 1L08A 1ZYTA 3HDEA 3RUNA 1OV7A 4K5YA 1L27A 242LA 125LA 178LA 3SB5A 256LA 1C65A 210LA 3HU9A 1LI2A 4DAJA 1C69A 1L15A 1L58A 1G0JA 4YXAC 3V2YA 1LYJA 233LA 3SB9A 2B75A 1L35A 3C81A 1LWKA 110LA 3ODUA 236LA 2OEAX 4W51A 218LA 1L24A 120LA 3LZMA 1WTHA 4I7KA 1L14A 1L18A 211LA 1D3NA 1L83A 3HWLA 1CTWA 185LA 2B6XA 1L63A 1KW7A 4PJZA 3C7ZA 2RB1X 209LA 3DN6A 4EKPA 4I7SA 1OVJA 2LCBA 1SSYA 113LA 165LA 1G0LA 1P37A 201LA 1QT7A 235LA 3GUNA 1DYGA 3FA0A 250LA 183LA 1L72A 148LE 167LA 1CV3A 1CV0A 3D4SA 1L75A 4IAPA 229LA 1C6PA 4I7PA 3DN3A 4OO9A 1B6IA 1CU3A 1L26A 239LA 1CV6A 1JTNA 3CDTA 4PK0A 3OE9A 1L74A 1D3JA 1C6MA 1JQUA 1P56A 4ARMA 1L39A 1DYAA 1G1WA 1C66A 4W58A 1D2WA 3CDRA 1XJUA 4I7LA 1T8GA 151LA 1PQDA 1L64A 172LA 244LA 4YXCA 160LA 1P7SA 2HUMA 2RBPA 1P2LA 1C6BA 1K28A 1L69A 3OE6A 1C60A 1L67A 2RBRA 119LA 111LA 1CU5A 1L21A 1P64A 1G0MA 1CU2A 1QS9A 1KY1A 1LGUA 3CDOA 2RBQA 225LA 3FI5A 2LC9A 3DN1A 3G3WA 1DYBA 2OU0X 2B6TA 1L79A 252LA 2HUKA 200LA 1L20A 1L47A 1L95A 1LYGA 3DN4A 3FADA 176LA 1L0KA 1L32A 2RB0X 1CV4A 1C6CA 1NHBA 1D9WA 1L61A 249LA 187LA 4LZMA 158LA 215LA 254LA 1LYIA 191LA 4ARQB 2QARC 1C68A 4S0WA 217LA 122LA 1L56A 2HULA 4W57A 1L91A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2BQCA 104LA 1LYSA 3ATNA 2W1LA 248LA 4EJ4A 1HEQA 7LZMA 2B70A 1IOSA 1GFUA 1LI6A 1CX6A 3LHMA 4LDEA 5E4PA 4MSTA 1GF0A 2HTXA 4N1CC 1XGUC 4PRQA 3CSRA 3TXKA 1C7PA 1NDMC 2DBTA 1DI3A 3C7WA 1YKXX 1GFAA 2O4WA 1L62A 5KXXA 3DN0A 1TEWA 1L51A 3DMVA 3G3XA 3PBLA 2DQEY 4WM1A 1T97A 1OUJA 4KL7A 1ZWNA 4HTQA 237LA 1LJFA 4J7VA 4NHPA 1CKDA 181LA 3SB7A 1FBIX 3ZVQB 1WQNA 1HC0A 1GFRA 3TMWA 1GFVA 1OV5A 4GLAA 1PQOA 3B0OA 261LA 1TDYA 1DI4A 4W53A 1LZEA 5B07A 1GB9A 2HEBA 4I7MA 1LGXA 1CVKA 1V7TA 2BLXA 2LHMA 4GCBA 3HT7A 4R0FA 2YBNA 5J7CA 156LA 2MEBA 2Z2FA 2L78A 4N9RA 4OWAA 1LJ4A 1SWZA 3GUPA 3A3RX 5KXWA 251LA 1HFZA 1L98A 3LZ2A 1IWVA 2BQKA 114LA 1CJ7A 2D4IA 1GHLA 1LMCA 4OOTA 155LA 189LA 2BQEA 5EBHA 4OW1A 4TSCA 4WLYA 3HTFA 1RJCB 3A91A 4EOFA 1UUZC 3W6FA 2F30A 2NTHA 1C63A 1SQ2L 3EXDA 3DMZA 1IEEA 4L41A 1LKSA 3TXDA 1JSFA 240LA 195LA 1BQLY 3TXEA 3AW6A 3BKHA 197LA 1YAMA 1EL1A 1LZYA 2B73A 1KW5A 246LA 5C6IA 1L86A 193LA 4DJHA 213LA 2Z39A 1L12A 3G3VA 1QDRA 1G07A 4LDOA 4DT3A 1CKCA 1L66A 2CJLA 1SSWA 1YAQA 1KIRC 1I20A 1GF7A 4H94A 1G0GA 1L11A 1INUA 4OOOA 1HEWA 1QS5A 4PJ2C 169LA 1F0WA 1DKKA 1LZCA 1GEZA 2ZWBA 1Z55A 1N4FA 3J6KA 3WPJA 1GXXA 1L85A 2NTGA 3EMLA 2ZNXY 1L94A 2XJWA 1ZVYB 1CJ9A 1GB2A 142LA 4NSIA 4HTKA 1UIDA 3GXKA 4CJ2A 2D4KA 1F6SA 1LSYA 4WG1A 4H9AA 4NHQA 5F9XA 3OK0A 1QT4A 3W6CA 123LA 1L0JA 2IHLA 4J1AA 1L25A 1XGTC 1LI3A 5DM9A 1NDGC 4ARPA 1HF4A 2RBSA 1L68A 1B7RA 4WO9A 1L82A 1WTMA 133LA 3SP3A 153LA 3CB7A 208LA 1L84A 5LZMA 3T36A 2CGIA 3RT5X 4WM4A 4XENA 1RE2A 1L65A 2F4GA 161LA 1WQRA 1C6JA 3AZ5A 1NWGA 4ZEEA 1IC7Y 1L42A 1SX2A 4LYMA 1IVMA 5B1FA 1LLHA 1J1PY 1PQMA 1VEDA 1OYUA 1LMNA 1H6MA 5APDA 243LA 1L54A 3WU8A 170LA 2YBHA 5KKIA 1AM7A 1GB7A 3B72A 1UIBA 3CT0A 2DQCY 2DQAA 2Z37A 2EIZC 2B6ZA 1L44A 4NGVA 1JISA 2O7AA 2G4QA 2YSSC 4NSJA 1NF5A 1PS5A 3OJPA 5B59A 4ARQA 1B7QA 1FLQA 3CSQA 5FELA 1IC5Y 1IWZA 3C80A 1LZDA 1T6VL 3OE0A 1L33A 1L29A 1L70A 4MCKA 1YQVY 3HDEA 2MEHA 3RUNA 5KY1A 5LXWA 1L27A 1C65A 3TXBA 1LJKA 1KXXA 1LSZA 4M6DA 1GBSA 1YIKA 3SB9A 4B1AA 5LINA 3N9CA 4XJFA 1IIZA 4O34A 3TMXA 1GF6A 4CFPA 1BWHA 2W1MA 5KKJA 2MEFA 1UIFA 4GN4A 120LA 1UIHA 1J1OY 3HWLA 3AGIA 1L63A 4ETEA 3C7ZA 5APEA 209LA 4EKPA 1A2YC 2LCBA 1JTTL 1SSYA 235LA 1JHLA 1WQMA 1LHHA 148LE 3D4SA 4DWXA 4HTNA 2H9JA 1JKBA 1NQIA 4DD7A 1D3JA 2YBIA 1XGQC 2G4NA 1P56A 4ARMA 1DYAA 1HSXA 3CDRA 2DQHY 3EMSA 4AGAA 4YXCA 1P7SA 1P2CC 111LA 2ZIKA 1UIGA 4TSBA 1YAOA 1B7NA 1DYBA 3K3TA 1L79A 1B7LA 4UWNA 6LYZA 5KXTA 1REXA 1L20A 1L95A 3DN4A 4XJHA 1IP3A 2RB0X 1CV4A 4G4HA 1D9WA 1L61A 249LA 187LA 5JENB 4BAFA 4ARQB 217LA 1IO5A 2HULA 4DDAA 2YDGA 1GFHA 1JKAA 1DQJC 1KXWA 2F47A 4LT1A 1IWXA 5B05A 131LA 4DQJA 1LSEA 4NGJA 2Q0MX 4B4JA 1CU6A 3HBEX 1YANA 3HT9A 1UICA 231LA 1XEIA 2O79A 3HH6A 4H1PA 1AKIA 1G7LC 3TXJA 196LA 4YOPA 2BQLA 1LZGA 1G06A 1L53A 1A4VA 4ZIXA 4N5RA 1C45A 4DYGA 1OUDA 5HNCA 1C10A 205LA 6LZMA 5C6LA 1BVXA 3L64A 2B74A 1G7HC 2LZTA 3TMUA 4IJ4A 4WMGA 4GCDA 3SN6R 1RCMA 4C5FA 3G3AB 138LA 4EPIA 1CX7A 1AT6A 2Z18A 2MEEA 3JR6A 1IP4A 1L59A 182LA 2RSCA 4HJVA 3HBDA 1LMPA 258LA 135LA 4H9HA 1HFXA 1B7MA 1G7JC 3F9LA 3A93A 1OVKA 3ULRA 1C6EA 3VW7A 1IOTA 3WU7A 1DXJA 3CT5A 3K2RA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2BQC A;  104L A;  1LYS A;  3ATN A;  2W1L A;  248L A;  4EJ4 A;  1HEQ A;  7LZM A;  2B70 A;  1IOS A;  1GFU A;  1LI6 A;  1CX6 A;  3LHM A;  4LDE A;  5E4P A;  4MST A;  1GF0 A;  2HTX A;  4N1C C;  1XGU C;  4PRQ A;  3CSR A;  3TXK A;  1C7P A;  1NDM C;  2DBT A;  1DI3 A;  3C7W A;  1YKX X;  1GFA A;  2O4W A;  1L62 A;  5KXX A;  3DN0 A;  1TEW A;  1L51 A;  3DMV A;  3G3X A;  3PBL A;  2DQE Y;  4WM1 A;  1T97 A;  1OUJ A;  4KL7 A;  1ZWN A;  4HTQ A;  237L A;  1LJF A;  4J7V A;  4NHP A;  1CKD A;  181L A;  3SB7 A;  1FBI X;  3ZVQ B;  1WQN A;  1HC0 A;  1GFR A;  3TMW A;  1GFV A;  1OV5 A;  4GLA A;  1PQO A;  3B0O A;  261L A;  1TDY A;  1DI4 A;  4W53 A;  1LZE A;  5B07 A;  1GB9 A;  2HEB A;  4I7M A;  1LGX A;  1CVK A;  1V7T A;  2BLX A;  2LHM A;  4GCB A;  3HT7 A;  4R0F A;  2YBN A;  5J7C A;  156L A;  2MEB A;  2Z2F A;  2L78 A;  4N9R A;  4OWA A;  1LJ4 A;  1SWZ A;  3GUP A;  3A3R X;  5KXW A;  251L A;  1HFZ A;  1L98 A;  3LZ2 A;  1IWV A;  2BQK A;  114L A;  1CJ7 A;  2D4I A;  1GHL A;  1LMC A;  4OOT A;  155L A;  189L A;  2BQE A;  5EBH A; 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