3HH5A

New azaborine compounds bind to the t4 lysozyme l99a cavity - 1-ethyl-2-hydro-1,2-azaborine
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAAAINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Boron mimetics: 1,2-dihydro-1,2-azaborines bind inside a nonpolar cavity of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 61
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2009-05-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3hh5A00
4DAJA 2RB1X 2RH1A 1K28A 4LZMA 174LA 1XEPA 1L35A 1CU3A 1CV6A 1L14A 1QT5A 131LA 231LA 192LA 1L29A 3SB6A 176LA 1L23A 2RBQA 3HTDA 4ARQB 1L74A 3DN6A 3ODUA 1G0QA 257LA 1L79A 4AQNA 3GUOA 3HH4A 1L47A 1G0PA 252LA 2LZMA 4EPIA 1CU6A 2O4WA 2L78A 1QUGA 151LA 1L63A 210LA 1QTZA 1L16A 1L85A 182LA 141LA 126LA 1WTHA 1XJTA 4W52A 1L01A 2OU8A 146LA 2NTGA 1L0KA 1JQUA 1LGXA 242LA 1G06A 1PQMA 4PK0A 1LYGA 1L71A 2HULA 1L99A 1D3JA 1CV5A 148LE 152LA 1L04A 1ZYTA 253LA 1LLHA 2B6ZA 3C8QA 1L07A 3CDTA 1KW7A 2OU0X 218LA 3HUKA 4K5YA 245LA 4W56A 2F32A 166LA 158LA 199LA 1G0MA 243LA 1L67A 2B75A 1LYFA 2QB0B 1L45A 1QT8A 111LA 4ZPUA 1CV0A 1L08A 1CVKA 1QS9A 1JTMA 171LA 1DYBA 1CV3A 1L84A 3GUIA 3HTGA 164LA 1PQIA 1L89A 1LGUA 1L0JA 4EKQA 4YXAC 1KS3A 1C61A 2RB0X 184LA 168LA 1L32A 1D3NA 173LA 1L09A 185LA 2OEAX 1C6BA 1ZURA 6LZMA 3HU8A 129LA 3GUMA 1L00A 1OV5A 2RAZX 233LA 4S0WA 5LZMA 1P7SA 187LA 2Z6BA 3DN4A 3HT8A 1KW5A 1L75A 1LI3A 163LA 3D4SA 142LA 1C6CA 1L95A 4LDOA 247LA 3RUNA 206LA 1QTDA 1LYDA 3CDVA 3HWLA 2RBNA 3C80A 170LA 2B73A 2CUUA 3K2RA 1L80A 3SB9A 2B6XA 1L93A 1L12A 1LI2A 1DYCA 3HT9A 1G0JA 1CUPA 1D2WA 258LA 239LA 1PQOA 1QTCA 2NTHA 186LA 3DKEX 228LA 3NY9A 1TLAA 1QT4A 260LA 3DN2A 2B6TA 1L11A 4LDLA 1P3NA 3JR6A 4EXMA 1T8GA 3HDFA 108LA 159LA 1P2LA 3DN1A 1OWZA 4I7MA 149LA 3DNAA 1L48A 1OV7A 1XJUA 4LDEA 128LA 2OU9A 4I7NA 3L2XA 1CV1A 1L60A 4I7RA 4W57A 1L73A 259LA 3DN3A 1QSQA 237LA 1CV4A 1DYGA 3C7ZA 1L30A 155LA 3G3WA 1L13A 248LA 3GUJA 209LA 1C6QA 1L06A 147LA 1LPYA 261LA 1L03A 201LA 1L57A 2RB2X 1C69A 1C6HA 1L52A 4W53A 1P37A 143LA 3HU9A 4I7OA 224LA 190LA 123LA 1P2RA 1L65A 1DYFA 1P56A 1OYUA 4I7JA 4I7SA 157LA 3UONA 1L96A 1D2YA 4ARPA 4DKLA 1QT6A 1L81A 4YX7C 4EKSA 1C60A 2OE9X 1G0LA 1QTVA 1C68A 1T6HA 115LA 3SB8A 1G1VA 1P5CA 1LYHA 175LA 1NHBA 1L25A 1L37A 235LA 250LA 1L40A 1L69A 1C6LA 1L88A 137LA 3NYAA 221LA 3DMZA 1C6MA 3CDOA 3DN8A 3SB5A 1I6SA 113LA 1L56A 183LA 3HUQA 1L97A 1QUHA 1L55A 1L34A 1L66A 1SSYA 2IGCA 4YXCA 2RBRA 140LA 2OE7X 244LA 4EKPA 3PDSA 1L72A 3DMXA 161LA 167LA 4I7TA 1C6EA 1L43A 3DMVA 1KNIA 1DYEA 254LA 1L28A 4W55A 1L82A 215LA 1L42A 1LGWA 1LI6A 1LWKA 1P46A 3HTFA 1L86A 216LA 127LA 214LA 4ARMA 1L44A 213LA 3HT6A 3QAKA 1QUDA 3G3XA 1SSWA 3HT7A 4ARLA 1L18A 3HUAA 104LA 227LA 1L92A 1C6PA 229LA 172LA 1L33A 130LA 114LA 1L68A 1L83A 238LA 2LC9A 1G1WA 1PQKA 4I7KA 3C83A 1CU5A 1QS5A 256LA 1LYIA 1P36A 1L50A 1L58A 236LA 1JTNA 107LA 4GRVA 1DYDA 1T8FA 1QTBA 2F47A 1SWZA 1L22A 1L10A 225LA 2RBSA 2RBOA 240LA 1LW9A 1L15A 3FI5A 3L64A 2ANVA 3OE6A 1C6DA 1T8AA 122LA 1G0KA 3RZEA 1P6YA 1L24A 110LA 4OO9A 125LA 1KY1A 138LA 1QT7A 4W59A 150LA 1L05A 1L46A 3HTBA 4ARQA 3CDRA 3OE8A 139LA 4I7LA 5I14A 1QSBA 205LA 2O7AA 2HUMA 1KY0A 2ANXA 2Q9DA 1QT3A 1C65A 1L21A 241LA 3C82A 4W51A 2B6WA 1DYAA 156LA 1C6NA 262LA 2HUKA 4EKRA 223LA 198LA 3HH3A 4E97A 1CU2A 1C6GA 188LA 1C6FA 3G3VA 4EPFA 3GUNA 119LA 1OVKA 3SBBC 1C6TA 3EMLA 1L59A 1G07A 1QUOA 1T97A 1L36A 1L77A 1L17A 3DN0A 165LA 120LA 1L54A 4I7QA 1OVHA 226LA 2Q9EA 3CDQA 1L98A 4GBRB 1CX6A 3HH6A 3GULA 3HDEA 3C8RA 4W58A 112LA 200LA 1L91A 3OE9A 1C64A 1EPYA 1D3FA 1C62A 4PJZA 1L41A 162LA 1G0GA 1L76A 103LA 3V2WA 3NY8A 181LA 1PQDA 3C81A 2OTYX 232LA 1C63A 145LA 1L38A 3F8VA 2OTZX 1L64A 2QARC 3PBLA 4ARJA 1L20A 230LA 219LA 4W54A 1L87A 1L61A 1L19A 3SB7A 3SN6R 1CX7A 3HH5A 2B74A 178LA 197LA 3C7YA 1L51A 1OWYA 1SX2A 1L94A 1LWGA 3F9LA 4ARMB 118LA 1L39A 4EJ4A 4I7PA 1C67A 2O79A 2F2QA 212LA 246LA 1C6AA 160LA 1P64A 7LZMA 217LA 177LA 2RAYX 3FA0A 1PQJA 144LA 195LA 191LA 1C6IA 1D9WA 1L27A 2B72A 1SX7A 102LA 4DJHA 1ZWNA 1L26A 109LA 1CTWA 249LA 2LCBA 234LA 3C7WA 3GUKA 2A4TA 196LA 3C8SA 2B70A 169LA 1L62A 220LA 2OE4X 1L02A 251LA 1L31A 1LYJA 3VW7A 2B6YA 180LA 3LZMA 2RBPA 1CUQA 255LA 1C66A 1C6KA 1LYEA 4IAPA 1B6IA 3SBAA 1L70A 222LA 3OE0A 3FADA 189LA 3V2YA 2B7XA 1D3MA 1OVJA 1CU0A 1SWYA 211LA 1L53A 1L90A 1QTHA 1L49A 1C6JA 3GUPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1D0KA 2RB1X 1K28A 3G3AB 4UWVA 3ULRA 1HFZA 1TBYA 5LAFA 1AM7A 1GAZA 3HTDA 1L23A 4XENA 1LYSA 1G0QA 1L79A 2BQNA 3GUOA 2YBHA 3E3DA 4EPIA 4H93A 1UACY 1LSEA 1JPOA 1UIFA 1LZ5A 1L16A 3CSZA 1IVMA 3N9CA 1XEKA 1DKKA 126LA 4W52A 1L01A 2ZQ4A 1G06A 1LTMA 1PQMA 1LYGA 4PJ2C 1WQQA 1ZV5L 3TXIA 1L04A 1HEWA 5B1FA 1L07A 4K5YA 1JKBA 1UIAA 158LA 199LA 4NHQA 2HU3A 1LYFA 5C6IA 1D0LA 111LA 4ZPUA 5KKJA 5KXNA 1CV0A 1L08A 4NHIA 2Z19A 1CVKA 5KXOA 5D5CA 1B7OA 1IWTA 4LYZA 1HELA 4X3BA 1DKJA 1L89A 1GB9A 1LSBA 2LYMA 4YXAC 184LA 168LA 3WH1A 3RZ4A 3A6BY 1RCMA 1GFVA 4NGOA 1C6BA 2HU1A 1ZURA 1OV5A 2RAZX 3RT5X 1EL1A 4ETDA 4NSGA 3DN4A 1LI3A 163LA 2YBNA 1REZA 1QTDA 1LYDA 1WQOA 4B4IA 1OUEA 1GB2A 1GFAA 3C80A 1QQYA 3SB9A 2B6XA 2Q0MX 1DYCA 3HT9A 5LAGA 4XJDA 3WU7A 1WQMA 1P3NA 1B5WA 1J1PY 3AZ7A 1B9OA 3JR6A 3HDFA 159LA 2EQLA 1P2LA 3DNAA 1L48A 1OV7A 5LYMA 1IP5A 2OU9A 5L3HA 3L2XA 1LYOA 4IJ4A 4NGYA 4XYYA 4I7RA 1B7NA 1GEZA 5LVKA 3C7ZA 1L30A 155LA 2XBSA 3WYHA 4GLAA 1L13A 4NGJA 248LA 1C6QA 1LPYA 1WQRA 4WLXA 2RB2X 1P37A 4WL6A 1GE0A 2ZIKA 1GBZA 1GFTA 1P2RA 1OUDA 1LZSA 1OYUA 2DQCY 1L96A 4DD2A 1HFXA 1C68A 4OWCA 1TAYA 1LYHA 2D4JA 1IO5A 2Z12A 175LA 4H9EA 250LA 3P65A 2WARA 5B06A 1L88A 3DMZA 1LJNA 3CDOA 3SB5A 1L34A 1GFJA 4FDYA 4XJBA 3DMXA 4GCCA 1GFGA 4HJYA 2FBDA 4ETEA 167LA 1G7HC 2GV0A 4LYMA 4R6CA 1L28A 4KL7A 3P68A 5FELA 4GN3A 5L9JA 1LWKA 1EQ4A 1YKXX 1T6VL 213LA 3HT6A 4H92A 4RW1A 4ARLA 1L18A 3HUAA 1LJIA 227LA 4NIJA 2ZILA 238LA 1L33A 130LA 114LA 1LSNA 1LMCA 1GXXA 4GCFA 4DQ7A 3BKHA 1CU5A 3A94A 1LZDA 236LA 1FN5A 4NEBA 1DYDA 4HPEA 2F47A 4OWBA 2D91A 1SWZA 1ZVYB 4WMGA 1L10A 1YKZX 3D3DA 1IC7Y 1UIHA 4PHIA 1YILA 240LA 1O23A 2EIZC 5APCA 3OE6A 1GDWA 3CQLA 3RZEA 1LYYA 4RW2A 3WPJA 1H6MA 1B7RA 1W6ZA 3HTBA 1KXYA 3M18B 5F16A 4YEOA 205LA 2MEIA 1KY0A 1E8LA 3AZ6A 4I0CA 1BHZA 241LA 1YKYX 4IASA 4NHPA 4W51A 4H9IA 2H9KA 4EKRA 3HH3A 1GFUA 1CJ8A 4E97A 3HFMY 5LVJA 1L36A 4LYOA 5FHWA 5LVHA 1F10A 3DN0A 165LA 1L54A 3TXEA 1QTEA 1L98A 4GBRB 3HH6A 3A90A 3GULA 3C8RA 1IWUA 4LT1A 3OE9A 4Z98A 3LYMA 2MEDA 1L41A 103LA 5I4YA 3C81A 2OTYX 4O34A 1GB7A 2DQHY 4YENA 1LPIA 3F8VA 4B4JA 1B5XA 4NGKA 219LA 4W54A 1IEEA 1D9UA 3SB7A 3SN6R 3A8ZA 4LZTA 1CX7A 3HH5A 178LA 3C7YA 4W96A 1L51A 1YAOA 1SX2A 1LWGA 3F9LA 4WOAA 118LA 1BWIA 1KXXA 2IFFY 2F2QA 3WVXA 3AJNA 5KXPA 1C6AA 1WTNA 1BWJA 1PQJA 144LA 3RNXA 195LA 1C6IA 3CT5A 1TEWA 4DDAA 1UICA 1BB3A 1L27A 2B72A 4WM5A 4DJHA 2BQDA 249LA 1LZBA 5B07A 4II8A 2LCBA 4B49A 4J0LA 3TXDA 5LIOA 1L62A 1QDTA 220LA 4N5RA 1L02A 1L31A 2B6YA 2RBPA 4HV1A 1C08C 2CDSA 1A2YC 222LA 1BB4A 211LA 1CU0A 1VATA 1L49A 1C6JA 2MECA 1GWDA 1JSEA 5A3ZA 8LYZA 1HF4A 1XEPA 1CU3A 4NFVA 1CV6A 1L14A 131LA 231LA 1REYA 1L29A 2HEAA 4WO6A 1RJCB 2BQCA 4AQNA 1B0DA 1NMMA 1G0PA 1UIGA 2LZMA 5ILCA 1D6PA 2O4WA 2BQKA 4OWEA 1SLYA 4J1AA 1XSFA 1G7MC 1QTZA 1L85A 1GE3A 182LA 4RLMA 1OUAA 1LSFA 1JQUA 1REMA 3A95A 1H87A 242LA 1HMKA 1IR8A 148LE 3W6DA 1G7IC 2Z2FA 4TTDA 3CDTA 1KW7A 245LA 5LA8A 3QY4A 1L67A 2B75A 3ZEKA 1LZAA 1GF6A 1QT8A 1IWWA 4H1PA 4M4OA 1REXA 171LA 1DYBA 3GUIA 4OWAA 4DD1A 1DI3A 1GF7A 3B6LA 3B72A 2W1XA 4N9RA 4EKQA 1KS3A 1FLYA 2BPUA 1L09A 185LA 2A7FA 6LZMA 3GUMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1D0K A;  2RB1 X;  1K28 A;  3G3A B;  4UWV A;  3ULR A;  1HFZ A;  1TBY A;  5LAF A;  1AM7 A;  1GAZ A;  3HTD A;  1L23 A;  4XEN A;  1LYS A;  1G0Q A;  1L79 A;  2BQN A;  3GUO A;  2YBH A;  3E3D A;  4EPI A;  4H93 A;  1UAC Y;  1LSE A;  1JPO A;  1UIF A;  1LZ5 A;  1L16 A;  3CSZ A;  1IVM A;  3N9C A;  1XEK A;  1DKK A;  126L A;  4W52 A;  1L01 A;  2ZQ4 A;  1G06 A;  1LTM A;  1PQM A;  1LYG A;  4PJ2 C;  1WQQ A;  1ZV5 L;  3TXI A;  1L04 A;  1HEW A;  5B1F A;  1L07 A;  4K5Y A;  1JKB A;  1UIA A;  158L A;  199L A;  4NHQ A;  2HU3 A;  1LYF A;  5C6I A;  1D0L A;  111L A;  4ZPU A;  5KKJ A;  5KXN A;  1CV0 A;  1L08 A;  4NHI A;  2Z19 A;  1CVK A;  5KXO A;  5D5C A;  1B7O A;  1IWT A;  4LYZ A;  1HEL A;  4X3B A;  1DKJ A;  1L89 A;  1GB9 A;  1LSB A;  2LYM A;  4YXA C;  184L A;  168L A;  3WH1 A;  3RZ4 A;  3A6B Y;  1RCM A;  1GFV A;  4NGO A;  1C6B A;  2HU1 A;  1ZUR A;  1OV5 A;  2RAZ X;  3RT5 X;  1EL1 A;  4ETD A;  4NSG A;  3DN4 A;  1LI3 A;  163L A;  2YBN A;  1REZ A;  1QTD A;  1LYD A;  1WQO A;  4B4I A;  1OUE A;  1GB2 A;  1GFA A;  3C80 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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