3HH6A

New azaborine compounds bind to the t4 lysozyme l99a cavity -ethylbenzene as control
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
163
structure length
163
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAAAINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Boron mimetics: 1,2-dihydro-1,2-azaborines bind inside a nonpolar cavity of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
molecule keywords Lysozyme
total genus 61
structure length 163
sequence length 163
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2009-05-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3hh6A00
1L34A 1G1WA 1L42A 209LA 3V2YA 1CV6A 223LA 4EKSA 2B6YA 1G07A 1T8FA 1SSWA 1D2YA 213LA 142LA 3CDOA 4E97A 122LA 3C82A 3FADA 1LYDA 1L90A 3G3VA 5I14A 1G0PA 4DAJA 1T8AA 2OEAX 4I7LA 3GUNA 1C69A 237LA 3HTDA 1C6MA 2O4WA 217LA 1L66A 3VW7A 4W59A 1P46A 1XJUA 3DN3A 186LA 1L72A 1SWZA 1L64A 4I7SA 244LA 1DYEA 151LA 2B75A 2B73A 214LA 1L71A 261LA 228LA 4W52A 3UONA 168LA 1L45A 1L11A 3HU8A 158LA 161LA 2RBQA 3C7YA 1L22A 1L21A 141LA 3OE0A 3GUIA 1L05A 3C7WA 1CU6A 216LA 3QAKA 110LA 1L89A 1C61A 1L73A 4I7OA 129LA 1EPYA 1G0MA 4AQNA 1SWYA 1P64A 1P56A 212LA 139LA 3C8RA 1L58A 152LA 3DN6A 3OE8A 1C6FA 251LA 2O7AA 167LA 1C6LA 1CX7A 1L70A 1PQJA 176LA 4I7RA 171LA 1L41A 1JTMA 192LA 3C7ZA 3DN4A 227LA 258LA 113LA 2A4TA 1T6HA 1L13A 1T97A 4ARPA 3CDQA 247LA 3JR6A 1B6IA 1C6TA 239LA 3G3XA 156LA 1LYEA 172LA 1L79A 1QTZA 2OU0X 4ARJA 1L91A 3HH6A 3DMXA 1C68A 1L68A 187LA 3DNAA 1L81A 1CV3A 1L00A 1KW5A 2B7XA 160LA 4W55A 1C60A 1QTVA 2B74A 1QSBA 1L02A 3DKEX 1KS3A 1C6IA 3GUOA 219LA 4EKPA 1QUGA 1LGUA 3RZEA 2RB2X 123LA 1CV5A 1LYGA 189LA 1C64A 1CX6A 4I7KA 1LYJA 4EPFA 1L33A 1G06A 1L80A 120LA 234LA 2Q9DA 4W58A 2B70A 224LA 1L35A 1L85A 1LPYA 1QT4A 1XEPA 1SX2A 236LA 174LA 2OTZX 1L40A 1C6HA 3SB9A 4EKQA 1L32A 3L2XA 1D9WA 233LA 2B72A 2B6XA 1L30A 190LA 175LA 2LCBA 3HTGA 257LA 2OE9X 1P7SA 2RH1A 1JQUA 3DN8A 1DYAA 4YXCA 1KY0A 1L94A 3RUNA 3HWLA 138LA 1QS9A 195LA 147LA 1C63A 1CUPA 1JTNA 148LE 2NTHA 2B6ZA 1PQDA 1L0JA 3CDVA 240LA 1L61A 254LA 3HU9A 4W51A 1DYCA 3EMLA 1L44A 1L95A 3GUMA 4GBRB 170LA 3SN6R 2F32A 126LA 4EXMA 1L75A 1L96A 197LA 4W57A 2RBNA 1C67A 2ANVA 1L37A 3HDFA 3C80A 3HTBA 242LA 103LA 163LA 211LA 2F47A 1P2LA 140LA 1L57A 1QT5A 1QSQA 252LA 4I7MA 1C6DA 1P2RA 1L03A 2B6TA 4W56A 198LA 1TLAA 3ODUA 6LZMA 1L62A 1OWZA 3SB6A 1ZWNA 1CVKA 1L84A 3DMVA 155LA 1L16A 2Q9EA 1D3NA 1P37A 2B6WA 4I7PA 1ZYTA 1KNIA 3HT8A 1L67A 4ARQA 1QUDA 3SBAA 2RBPA 1QT8A 2CUUA 1CU0A 1L83A 1L25A 1CU2A 1OWYA 3GUKA 3HH4A 1L04A 3DN0A 3HDEA 1DYGA 1C6EA 3DN2A 2RB1X 2HUMA 5LZMA 221LA 184LA 2QB0B 1LYFA 137LA 246LA 1LYHA 1DYBA 3HUKA 4W53A 3SB8A 1PQIA 3G3WA 3OE6A 1C66A 4GRVA 1LI6A 1LWGA 1P3NA 1P6YA 1QT6A 1L92A 200LA 166LA 210LA 2RAZX 4K5YA 191LA 1L46A 1G0JA 3K2RA 1KW7A 104LA 145LA 157LA 1L93A 1L27A 1PQMA 1L82A 1WTHA 1L14A 2RBSA 1L74A 4EJ4A 115LA 1D3MA 1PQOA 255LA 1C6BA 1OVHA 183LA 111LA 3NY9A 1L86A 1OV7A 128LA 218LA 1OYUA 2Z6BA 1L36A 3F8VA 108LA 149LA 1CV4A 1L12A 2RB0X 4I7NA 1DYFA 159LA 3NYAA 1L98A 1CV0A 1ZURA 1L51A 1L59A 4S0WA 3LZMA 230LA 259LA 3GUPA 2RBRA 1L26A 3C8QA 1L39A 1L65A 1L48A 1OVKA 1L60A 118LA 1L76A 109LA 225LA 3NY8A 185LA 1L56A 1L10A 2OU9A 1L08A 1CUQA 1QTDA 1NHBA 1D2WA 3L64A 4LDLA 150LA 3C8SA 125LA 131LA 2IGCA 1L49A 1QUOA 3GUJA 250LA 1L15A 1L20A 1LGXA 1L87A 2OU8A 260LA 241LA 1L97A 4DJHA 1DYDA 3HTFA 1L01A 1LGWA 1L43A 3PBLA 1C6JA 4YX7C 2HUKA 1L06A 169LA 1LLHA 4PK0A 1LI2A 229LA 165LA 245LA 206LA 3SBBC 1QTHA 1L09A 1G0QA 181LA 1D3FA 262LA 102LA 1C6KA 1C6NA 1SSYA 143LA 114LA 1L17A 4EKRA 3OE9A 232LA 243LA 3HUAA 4W54A 1QS5A 3CDRA 1L54A 1L55A 177LA 1L18A 231LA 238LA 3CDTA 127LA 2RBOA 1L0KA 1C6AA 1OV5A 4ARQB 4IAPA 146LA 1CV1A 178LA 3PDSA 1LYIA 1P5CA 220LA 3C81A 1C6CA 1LW9A 215LA 4I7JA 1QT7A 4ARLA 2LZMA 1CU3A 199LA 1L50A 235LA 4OO9A 256LA 3C83A 249LA 4PJZA 1G0KA 1XJTA 4LDOA 173LA 1C6GA 3HT6A 1L99A 2QARC 1L29A 3F9LA 1OVJA 164LA 205LA 1C62A 2RAYX 107LA 1K28A 1PQKA 4DKLA 226LA 1QT3A 1L88A 4EPIA 3D4SA 1L69A 1C6PA 1C65A 2F2QA 1L19A 3FA0A 3DMZA 1LI3A 3V2WA 4I7TA 1L23A 248LA 2HULA 1L28A 3GULA 222LA 180LA 196LA 2OE7X 3HT9A 4YXAC 4LZMA 1I6SA 4ZPUA 3HUQA 3HH5A 4I7QA 1L77A 4LDEA 201LA 2NTGA 3SB5A 130LA 112LA 1CTWA 182LA 1L63A 1QTCA 2O79A 3HH3A 7LZMA 1LWKA 1L07A 1G0LA 1QTBA 1D3JA 1C6QA 1G0GA 2OTYX 1G1VA 1P36A 162LA 1L47A 1T8GA 1QUHA 3SB7A 1SX7A 2L78A 1KY1A 3FI5A 3DN1A 1L24A 188LA 2LC9A 2OE4X 4ARMA 4ARMB 3HT7A 1L38A 1CU5A 1L52A 2ANXA 144LA 119LA 1L53A 253LA 1L31A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1G1WA 1ALCA 3WPJA 4EKSA 4H9IA 4IASA 1SSWA 1RJCB 2X0AA 1WQOA 2YVBA 4TUNA 4ET9A 4E97A 3C82A 4HPIA 1SQ2L 3FADA 3RT5X 5I14A 4DAJA 1CKGA 4NHQA 2OEAX 4I7LA 4ETAA 5M1YA 3HTDA 1KXXA 1SWZA 1L64A 4DD2A 1IEEA 214LA 1IOTA 1LZAA 5B1GA 3QNGA 4G9SA 3TXKA 3P64A 3C7YA 4H1PA 1INUA 4TTDA 1CJ7A 1JJ1A 1UA6Y 3GUIA 1LZBA 110LA 3D9AC 5ILCA 1G0MA 3WPKA 3DN6A 2FBDA 4R6CA 251LA 2BQHA 1FN5A 1BHZA 171LA 1L41A 113LA 1T97A 3ATOA 247LA 5HMJA 1C6TA 4ETCA 1GF7A 4IJ4A 4ZFPA 1L91A 135LA 3HFMY 1YROA 5LVGA 3DMXA 1DKKA 2EPEA 1L81A 1KW5A 2ZQ3A 4Z41A 1YAMA 1C60A 1LJFA 4HV1A 1QUSA 3DKEX 1P2CC 3WH1A 3QE8A 1C6IA 219LA 5KXLA 1QUGA 2LZ2A 4N1EI 123LA 5DN5A 3VWOA 1G06A 4M6DA 1L35A 1L85A 4WL6A 5FSTA 1SX2A 1BB5A 1HSXA 3A94A 2OTZX 2MECA 3LN2A 3SB9A 2Z2EA 5C6JA 1JKAA 233LA 1WQRA 1RI8B 1JTOL 1P7SA 1JQUA 5LVKA 3DN8A 1LMQA 1LZRA 3RUNA 3HWLA 4H93A 1GF3A 4FDYA 138LA 1QS9A 4H9AA 1CUPA 1LSZA 5JENB 1B0DA 2NTHA 1LZ6A 1VAUA 1DYCA 1HF4A 2LZTA 3WUNA 1HHLA 2D4IA 4GN5C 1I20A 1LMCA 126LA 1WVVA 1L75A 1J1OY 1HEWA 4NSIA 2HEAA 1L37A 5A3ZA 1HEMA 1IP2A 1HC0A 4O34A 2YBHA 4DQ5A 4TSCA 5I53A 2YBMA 4CHXA 2B6TA 5I4WA 1BWIA 5L3HA 5B59A 1JTPL 4W96A 4OWHA 1D9UA 155LA 5KJ9A 4XN6A 1GE4A 1YQVY 3HT8A 1XEIA 1HERA 1QUDA 5LAGA 3SBAA 2RBPA 2CUUA 1ZVHL 4WMGA 4DD1A 3HH4A 1DYGA 2RSCA 3N9AA 3WW6A 2HUMA 1TAYA 184LA 2QB0B 1VATA 4WM3A 5KXNA 3OE6A 4NHPA 3M3UA 1LI6A 1JITA 1P3NA 166LA 4YF2A 1B5UA 4K5YA 1G0JA 1VDQA 145LA 3ZVQA 4ET8A 1L27A 1BB4A 1G7LC 1NDGC 3B72A 2RBSA 4WLDA 4NGZA 4EJ4A 4RLMA 255LA 111LA 3BKHA 2EIZC 1LSEA 1SLYA 4HTNA 1VDPA 4WG7A 4LYBA 4OWEA 2Z6BA 1LJHA 1IORA 159LA 2BLYA 1L98A 2MEAA 1BVXA 230LA 3WXUA 1LAAA 1BQLY 1L48A 1OVKA 4ETDA 4OWBA 1D2WA 4HSFA 4H8XA 150LA 1F6SA 3AZ6A 3GUJA 5DN4A 1L15A 2DQDY 4WM2A 1QQYA 1JSEA 1IOQA 1DYDA 3SP3A 5DLAA 2BQAA 1TBYA 3A91A 2HUKA 1L06A 4DD7A 169LA 2G4PA 3N9EA 5APCA 1IWXA 1C6NA 3W6AA 4IATA 114LA 1AKIA 4NSHA 1JKCA 3OE9A 243LA 1UIEA 1QS5A 1H87A 1L55A 1AT5A 1QTKA 1JTTL 1L18A 127LA 1HEOA 4QY9A 1L0KA 1C6AA 3AZ5A 3CSZA 2H9KA 4H91A 1P5CA 2LZMA 1CU3A 3C83A 1B7LA 1XJTA 3AGHA 4LDOA 4Z46A 1TDYA 1D0LA 1L99A 2QARC 4H9EA 4HP0A 5I54A 1HMLA 3AZ4A 4LFPA 2RAYX 2Z2FA 226LA 2Z37A 2BQCA 1QT3A 1UICA 1L88A 1I56A 3D4SA 4KPMA 4LGKA 3RU5A 1EQEA 1C65A 3HBHA 3FA0A 4NSJA 2HULA 1YKXX 1L28A 3GULA 4LZMA 1I6SA 3WVXA 3A3RX 1WVUA 3HUQA 1L77A 4LDEA 3HBEX 1GFVA 130LA 112LA 3HH3A 4AXTA 1D3JA 3AW6A 1C6QA 2ZQ4A 1YILA 1FLQA 1P36A 162LA 2XQOA 3W6FA 1L24A 2Q0MX 3HT7A 4B49A 1LSDA 1L52A 5B05A 1GF4A 1LSAA 1V7SA 1T8FA 5APFA 1YL0X 4GCCA 2DQFC 2MEBA 2W1YA 1GWDA 3B0OA 3CSRA 3G3VA 1G0PA 1LPIA 1HNLA 4YEOA 1LZ1A 1UIBA 4H9CA 1VEDA 1OUDA 2O4WA 3CT5A 1L72A 4TX7A 4NGKA 2MEDA 5HNLA 4BAFA 3LZTA 4I7SA 244LA 5LVJA 4XJIA 4W52A 2ZWBA 168LA 3GXKA 1L11A 161LA 5C6LA 2H5ZA 1QUTA 1HSWA 1CU6A 3QAKA 1HEQA 5K7OA 1L89A 1C61A 1LMAA 1GEVA 1SWYA 3J6KA 3C8RA 152LA 3OE8A 1C6FA 1IIZA 2O7AA 1YKZX 4H94A 3A96A 4B0DA 3DN4A 1AT6A 1JTMA 227LA 1T6HA 1L13A 3GXRA 4ARPA 2LYZA 3G3XA 1LHIA 156LA 1IP6A 1L79A 4C3WA 3HH6A 5KXYA 1C68A 1UACY 3P66A 1GB8A 4II8A 4RLNA 4LT2A 1CV3A 5KXOA 4W55A 5DL9A 1QTVA 5C6IA 2B74A 3AZ7A 4NSGA 4WLYA 1KS3A 1DPXA 5APEA 3RZEA 2RB2X 1KIQC 3LYTA 1GBZA 3W6BA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1G1W A;  1ALC A;  3WPJ A;  4EKS A;  4H9I A;  4IAS A;  1SSW A;  1RJC B;  2X0A A;  1WQO A;  2YVB A;  4TUN A;  4ET9 A;  4E97 A;  3C82 A;  4HPI A;  1SQ2 L;  3FAD A;  3RT5 X;  5I14 A;  4DAJ A;  1CKG A;  4NHQ A;  2OEA X;  4I7L A;  4ETA A;  5M1Y A;  3HTD A;  1KXX A;  1SWZ A;  1L64 A;  4DD2 A;  1IEE A;  214L A;  1IOT A;  1LZA A;  5B1G A;  3QNG A;  4G9S A;  3TXK A;  3P64 A;  3C7Y A;  4H1P A;  1INU A;  4TTD A;  1CJ7 A;  1JJ1 A;  1UA6 Y;  3GUI A;  1LZB A;  110L A;  3D9A C;  5ILC A;  1G0M A;  3WPK A;  3DN6 A;  2FBD A;  4R6C A;  251L A;  2BQH A;  1FN5 A;  1BHZ A;  171L A;  1L41 A;  113L A;  1T97 A;  3ATO A;  247L A;  5HMJ A;  1C6T A;  4ETC A;  1GF7 A;  4IJ4 A;  4ZFP A;  1L91 A;  135L A;  3HFM Y;  1YRO A;  5LVG A;  3DMX A;  1DKK A;  2EPE A;  1L81 A;  1KW5 A;  2ZQ3 A;  4Z41 A;  1YAM A;  1C60 A;  1LJF A;  4HV1 A;  1QUS A;  3DKE X;  1P2C C;  3WH1 A;  3QE8 A;  1C6I A;  219L A;  5KXL A;  1QUG A;  2LZ2 A;  4N1E I;  123L A;  5DN5 A;  3VWO A;  1G06 A;  4M6D A;  1L35 A;  1L85 A;  4WL6 A;  5FST A;  1SX2 A;  1BB5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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