3HWLA

Crystal structure of t4 lysozyme with the unnatural amino acid p-acetyl-l-phenylalanine incorporated at position 131
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
162
structure length
161
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFCQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDCVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAANLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Site-directed spin labeling of a genetically encoded unnatural amino acid.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 57
structure length 161
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2009-06-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3hwlA00
175LA 4EXMA 1L76A 1LGWA 3D4SA 4I7NA 1L51A 3OE6A 4LZMA 4PK0A 102LA 172LA 1G1VA 1LYFA 1CU5A 1CX7A 2Z6BA 165LA 1QUDA 4I7LA 3HUQA 2RBSA 1C6KA 4W57A 123LA 251LA 4ARQB 1DYEA 2OE4X 1C6JA 3HT7A 1L83A 1L39A 1DYDA 4I7OA 3SB7A 1C65A 3C7WA 177LA 1L62A 4LDEA 1L19A 112LA 206LA 2B75A 1XJTA 4W59A 3DN2A 1LPYA 1L82A 2F2QA 4OO9A 168LA 1LW9A 1QUOA 1KNIA 1T8FA 1LWGA 2B6TA 143LA 2F32A 256LA 3DN6A 3G3VA 1CV1A 241LA 1L23A 1LYJA 4DJHA 1G1WA 3HUAA 196LA 1L75A 2OTYX 3OE8A 118LA 2HUKA 3OE0A 214LA 3G3XA 4YXAC 1KY0A 215LA 111LA 3HT8A 1L58A 1CV5A 1QUHA 160LA 2RB2X 1K28A 1L56A 2NTGA 1T97A 1WTHA 234LA 260LA 2RAYX 3DNAA 1L02A 1L21A 115LA 1D2WA 122LA 1ZURA 192LA 1L96A 231LA 2RBQA 1G0LA 3SBBC 2HUMA 4PJZA 1QT5A 167LA 1L88A 4W58A 1L00A 127LA 1QT7A 110LA 1C6DA 1G0JA 3C8RA 249LA 1L12A 1QTCA 4E97A 1LI6A 186LA 3NYAA 229LA 1XEPA 1QUGA 1OVJA 145LA 1L64A 243LA 3DMZA 1KW5A 1JQUA 2O4WA 4W54A 1C6TA 1L41A 226LA 4AQNA 3GUKA 3LZMA 1L94A 1C6GA 1L31A 4ARLA 4EPFA 250LA 3HWLA 1QT6A 161LA 1LI3A 1C6BA 1OV7A 3V2WA 191LA 7LZMA 1L87A 1C62A 3CDVA 3OE9A 2RB0X 1PQOA 1L65A 198LA 1SX7A 3C83A 1L46A 1L63A 252LA 3F9LA 1JTNA 3F8VA 235LA 188LA 1C6IA 5LZMA 1LYDA 3HTGA 1L07A 1L60A 1L05A 1ZYTA 1L26A 162LA 2B6XA 159LA 200LA 1L93A 158LA 3CDTA 254LA 1C64A 3RUNA 1L98A 1L95A 1L85A 2RBRA 120LA 1OYUA 2OU8A 3V2YA 1L04A 239LA 4I7KA 1LGUA 3PBLA 2OE7X 1L99A 3DMXA 1LI2A 3HU8A 3ODUA 3SBAA 1L71A 1CUQA 2OE9X 3L64A 237LA 4EKPA 1L15A 3PDSA 1OWYA 3GUIA 1G06A 3GUOA 3HT6A 220LA 1L47A 1L80A 1L40A 1C68A 1CV3A 1CU6A 3FI5A 1L70A 3C7ZA 4LDLA 1CU2A 236LA 1SX2A 2B73A 3DN3A 2IGCA 3SN6R 144LA 3C7YA 222LA 1P2RA 1L43A 1KY1A 1L11A 1DYAA 137LA 1G0KA 1L33A 1L24A 242LA 199LA 1C6NA 1L03A 4ARQA 2LZMA 1L18A 173LA 3GUJA 1C6LA 1OVKA 1D2YA 1L52A 1SSWA 1QTZA 1B6IA 114LA 255LA 1C67A 1QS9A 3RZEA 1OVHA 1LYEA 166LA 4I7SA 209LA 107LA 2O79A 1D3NA 221LA 1L91A 1C66A 3HUKA 3SB9A 1QS5A 1D3FA 3GULA 1CU0A 1QT4A 4LDOA 2RH1A 3FADA 3K2RA 2RBOA 1C6HA 1C61A 1L66A 4I7RA 5I14A 1L97A 1CX6A 103LA 213LA 2O7AA 185LA 1PQDA 247LA 3DN8A 4W56A 218LA 4I7JA 2HULA 1CVKA 1D9WA 2OTZX 4EPIA 1QTBA 1L01A 262LA 157LA 217LA 4EKQA 1L73A 3HT9A 3DN1A 1KS3A 3JR6A 1I6SA 2QARC 2A4TA 197LA 1L20A 1L67A 3L2XA 176LA 3G3WA 3FA0A 1L35A 1D3MA 1LWKA 1LGXA 223LA 2B6YA 119LA 4YX7C 1C63A 1L61A 3DN4A 3QAKA 1C6PA 3HH6A 1CV4A 1L59A 3CDRA 2B6ZA 3CDOA 150LA 3NY9A 3HH5A 164LA 180LA 1OWZA 1L55A 1CU3A 1L38A 4W55A 259LA 1L17A 1DYCA 1QSQA 261LA 183LA 1DYGA 1L0JA 4W51A 1QTVA 1PQMA 1PQKA 205LA 1T6HA 1D3JA 1L30A 1P7SA 1QTDA 152LA 138LA 1L22A 238LA 3NY8A 182LA 4ARPA 2CUUA 2B6WA 1OV5A 6LZMA 1P36A 171LA 2L78A 3HTBA 1QTHA 244LA 2OU0X 4S0WA 211LA 1QT3A 3HH4A 1L25A 1L92A 1G0QA 1LLHA 3DN0A 2B74A 210LA 4W53A 1L28A 1LYHA 4I7QA 1SWZA 139LA 108LA 1C6MA 1KW7A 2OEAX 1L27A 1L53A 233LA 1L69A 1DYBA 4W52A 3C82A 1P5CA 3C8QA 3HDFA 2RAZX 147LA 1DYFA 4IAPA 4EJ4A 125LA 212LA 181LA 1L68A 3GUNA 224LA 219LA 1T8GA 131LA 1JTMA 1L77A 1L45A 4I7MA 1L29A 230LA 216LA 142LA 4YXCA 140LA 1G0PA 1SWYA 3HH3A 1C6EA 187LA 1L16A 128LA 2Q9DA 4EKSA 3HTDA 4ZPUA 1L81A 126LA 170LA 1L32A 3HTFA 195LA 4ARMB 227LA 1PQIA 1C60A 1QSBA 151LA 2LCBA 129LA 2B7XA 1L89A 2QB0B 1L36A 228LA 3C8SA 3CDQA 3HU9A 4GBRB 1L34A 1L90A 2Q9EA 258LA 1T8AA 1L48A 1L42A 3HDEA 4DKLA 3C81A 1P46A 1CTWA 2NTHA 1L49A 4K5YA 190LA 1P3NA 1EPYA 248LA 3SB8A 246LA 1P64A 1C6FA 1L10A 2RB1X 1LYGA 1L79A 1L08A 3EMLA 4DAJA 169LA 4ARJA 130LA 4EKRA 141LA 4GRVA 3SB5A 1CUPA 1L86A 3C80A 1L0KA 109LA 1C6QA 1L74A 1L54A 3UONA 3GUPA 2RBNA 113LA 1P37A 2ANXA 1ZWNA 257LA 2F47A 1G07A 1L84A 3GUMA 4ARMA 2LC9A 1C69A 163LA 1L72A 1CV0A 184LA 245LA 2ANVA 174LA 3DKEX 156LA 2B72A 1QT8A 253LA 3DMVA 189LA 1CV6A 1P56A 1SSYA 178LA 1P2LA 148LE 1NHBA 104LA 240LA 1LYIA 232LA 2OU9A 1L06A 1L09A 155LA 1C6AA 1L37A 149LA 1P6YA 201LA 1G0GA 1L44A 1L57A 1L14A 2B70A 146LA 4I7TA 2RBPA 4I7PA 1L50A 1C6CA 1G0MA 225LA 1XJUA 1L13A 1PQJA 1TLAA 3SB6A 3VW7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1JTTL 1GE4A 1L51A 1Z55A 2MEEA 1G1VA 3AZ4A 1LYFA 3N9EA 2Z6BA 4I7LA 4NSJA 4H9FA 4G4CA 1DYEA 1C6JA 1B5UA 1L39A 4GCBA 1DYDA 1C65A 1L19A 2N5ZA 206LA 1GPQC 2B75A 1XJTA 4W59A 3TXJA 4YEOA 1L82A 1QUOA 1T8FA 1AKIA 1FKQA 4IATA 1QIOA 2F32A 256LA 2XQOA 1C08C 1LYJA 3TXBA 196LA 1LZ1A 2BQIA 2MEHA 2OTYX 5KXTA 5KXOA 118LA 4MCKA 1B9OA 3LZ2A 4KPMA 3G3XA 1BVKC 4GN3A 1KY0A 1JUGA 5APFA 2A7FA 3EXDA 3KAMA 4NWEA 2BQAA 2HEEA 2EQLA 3G3AB 1QSWA 4H9BA 1GE1A 1ZURA 192LA 1L96A 2RBQA 4G4HA 1GFHA 2HUMA 1IOSA 4PJZA 4NGWA 1LJEA 1UICA 1IVMA 2YBJA 2ZIKA 1G0JA 1NMMA 3N9CA 1L12A 3WUNA 1DKJA 5KXWA 5M1YA 3OJPA 1XEPA 1QUGA 3A92A 145LA 1D9UA 1NBYC 1DXJA 1KW5A 1WTMA 5LYTA 1IP2A 1CJ7A 2MEBA 1L41A 1L94A 4EPFA 1LI3A 7LYZA 3WU7A 3CDVA 1FBIX 5I5QA 3OE9A 4DQ7A 1D0MA 3AGIA 1L46A 2ZYPA 1L63A 3F9LA 3T6UA 235LA 1C6IA 1UCOA 5I4XA 3BKVA 4WO6A 4OOOA 1OUAA 1GB6A 4KL7A 159LA 5A3ZA 4ET8A 1DPXA 4N1CC 158LA 1LMAA 4LT0A 1NKHA 1GXXA 1L95A 4H9IA 1L85A 120LA 1OYUA 2OU8A 3V2YA 4I7KA 4PPOA 3A6BY 4WOAA 1LGUA 3PBLA 1LI2A 3HU8A 4Z41A 1EQ4A 2Z2FA 1KIPC 3W6AA 2WARA 1AM7A 3WUMA 2Q0MX 2YBNA 1YL0X 5L9JA 3B0IA 4QGZA 4CFOA 1L80A 1PS5A 1CU6A 3FI5A 1G7LC 3C7ZA 2IGCA 3C7YA 2ZNXY 4N5RA 1P2RA 1L33A 3A6CY 1ZMYL 5IHGA 1L03A 3F6ZA 4WO9A 3BKHA 1W08A 3EMSA 5F81A 5LA8A 1L52A 4WLYA 1B6IA 2Z12A 1LSDA 1QS9A 3RZEA 3VWOA 4AXTA 1IY3A 1GB7A 1EL1A 209LA 2HEDA 1L91A 4M6DA 1D3FA 3GULA 1C46A 1IWYA 3SP3A 3N9AA 2RH1A 1JJ3A 1L66A 5LVJA 1LZGA 185LA 3CQLA 218LA 1D9WA 5T3FA 4EPIA 1QTBA 5E4PA 5LYMA 1LZTA 157LA 1GDWA 1KS3A 1YAMA 1AT6A 4LYMA 4RW2A 1LJKA 1B7QA 1CJ6A 1L67A 2ZQ3A 4XJFA 3TMWA 3FA0A 1I56A 223LA 2B6YA 3AZ7A 3HH6A 4PHIA 1L59A 1GF7A 1LMCA 3CDRA 3NY9A 132LA 1IIZA 3HH5A 1OQMA 259LA 5LVHA 1FN5A 1LMOA 1DYCA 1RI8B 1QSQA 1WQQA 261LA 183LA 1L0JA 1GB2A 1QTVA 1PQMA 1LZCA 1PQKA 1D3JA 1P7SA 4C5FA 1WQOA 1LZNA 3M3UA 4N8ZA 1IR9A 4ARPA 4NEBA 2CUUA 6LZMA 3WXUA 2RSCA 3HTBA 1QTHA 4S0WA 1BB5A 4W53A 1JTPL 1LSEA 1LYHA 1D0KA 1SWZA 4FJRA 1C6MA 4HPEA 1HSXA 1F6SA 1GFGA 5LVKA 3C8QA 5DM9A 3HDFA 2RAZX 4D9ZA 125LA 134LA 1L68A 4U3XB 3CSQA 4DQ5A 1ZVHL 4LYCA 1GFEA 1L45A 4I7MA 4QEQA 4B4JA 3P64A 1GE3A 4YXCA 1C6EA 187LA 1L16A 1H6MA 4OOTA 4XADA 4II8A 2PC2A 1HERA 1INUA 1OUCA 1QSBA 5D5CA 4GLAA 228LA 3C8SA 3HU9A 1L34A 1L90A 1YAQA 5I4YA 1LHIA 3C81A 4GCDA 4OWBA 1CTWA 3QE8A 248LA 3SB8A 1P64A 1JSEA 2RB1X 1LYGA 4XJHA 4ETDA 1UIDA 4ARJA 1C7PA 4GRVA 1FKVA 2BQLA 2XBSA 5B06A 1B2KA 2RBNA 4WM6A 4H91A 257LA 5JENB 1IC7Y 1L84A 3CT0A 1NDMC 4ARMA 245LA 1LSCA 184LA 2ANVA 1QTEA 2Z39A 1NF5A 2F2NA 3IJUA 1GB8A 1SSYA 2H5ZA 1P2CC 1P2LA 148LE 240LA 1L06A 1RFPA 1O23A 4GCCA 3W3EA 1L44A 146LA 5APDA 4YEMA 3B6LA 1DI5A 1WQMA 4I7PA 4LT2A 1G0MA 1L13A 5IELA 4ZEEA 175LA 1LYYA 5B59A 3D4SA 4OWEA 3LYOA 4PK0A 4OWHA 102LA 172LA 3RU5A 4NGVA 2DQDY 1IP5A 4B4EA 2OE4X 3HT7A 1T3PA 1GE2A 1L62A 4C3WA 4LDEA 5I54A 3AYQA 4NGJA 3TXIA 4TSBA 5ILCA 4R0FA 4H8XA 1LPYA 1LSGA 3WMKA 3WPLA 1WQNA 2CDSA 1LW9A 2B6TA 4NGIA 2LZTA 4N9RA 1GFRA 1J1XY 2ZNWY 2F4GA 1HFXA 1OUDA 3OE0A 4QY9A 1OUHA 111LA 1GBXA 1CV5A 3QNGA 3WXTA 160LA 1GF3A 2RB2X 1JWRA 3OK0A 1T97A 4J1BA 2RAYX 1LHLA 3RNXA 4H92A 1D2WA 3A91A 231LA 133LA 1G0LA 4W58A 1L00A 2DQFC 127LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1JTT L;  1GE4 A;  1L51 A;  1Z55 A;  2MEE A;  1G1V A;  3AZ4 A;  1LYF A;  3N9E A;  2Z6B A;  4I7L A;  4NSJ A;  4H9F A;  4G4C A;  1DYE A;  1C6J A;  1B5U A;  1L39 A;  4GCB A;  1DYD A;  1C65 A;  1L19 A;  2N5Z A;  206L A;  1GPQ C;  2B75 A;  1XJT A;  4W59 A;  3TXJ A;  4YEO A;  1L82 A;  1QUO A;  1T8F A;  1AKI A;  1FKQ A;  4IAT A;  1QIO A;  2F32 A;  256L A;  2XQO A;  1C08 C;  1LYJ A;  3TXB A;  196L A;  1LZ1 A;  2BQI A;  2MEH A;  2OTY X;  5KXT A;  5KXO A;  118L A;  4MCK A;  1B9O A;  3LZ2 A;  4KPM A;  3G3X A;  1BVK C;  4GN3 A;  1KY0 A;  1JUG A;  5APF A;  2A7F A;  3EXD A;  3KAM A;  4NWE A;  2BQA A;  2HEE A;  2EQL A;  3G3A B;  1QSW A;  4H9B A;  1GE1 A;  1ZUR A;  192L A;  1L96 A;  2RBQ A;  4G4H A;  1GFH A;  2HUM A;  1IOS A;  4PJZ A;  4NGW A;  1LJE A;  1UIC A;  1IVM A;  2YBJ A;  2ZIK A;  1G0J A;  1NMM A;  3N9C A;  1L12 A;  3WUN A;  1DKJ A;  5KXW A;  5M1Y A;  3OJP A;  1XEP A;  1QUG A;  3A92 A;  145L A;  1D9U A;  1NBY C;  1DXJ A;  1KW5 A;  1WTM A;  5LYT A;  1IP2 A;  1CJ7 A;  2MEB A;  1L41 A;  1L94 A;  4EPF A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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