3HWLA

Crystal structure of t4 lysozyme with the unnatural amino acid p-acetyl-l-phenylalanine incorporated at position 131
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
162
structure length
161
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFCQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDCVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAANLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Site-directed spin labeling of a genetically encoded unnatural amino acid.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
total genus 57
structure length 161
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2009-06-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3hwlA00
1L31A 1CUPA 1L21A 103LA 211LA 1QT8A 4PK0A 231LA 4I7QA 5I14A 3PDSA 182LA 151LA 1L95A 1QS9A 1OVJA 1T8FA 1C6JA 2Q9DA 1CU3A 2LCBA 1L12A 217LA 192LA 250LA 2HUKA 3HT6A 239LA 1C69A 1T6HA 2B6TA 3GUIA 160LA 2RBRA 4W52A 4ARMB 1T8AA 1L83A 205LA 227LA 249LA 1CU0A 2NTHA 2HUMA 1C61A 3C80A 1L0JA 1LYGA 112LA 4S0WA 108LA 152LA 2Z6BA 4EKPA 1L06A 1L44A 1L10A 4YXCA 180LA 1CV6A 4ARLA 1L30A 3HTBA 1D3NA 2OE9X 1C67A 1CV4A 3SBBC 1L40A 3HH6A 1QS5A 3DN2A 122LA 2OU8A 1LYDA 1L36A 1PQDA 3CDRA 1L60A 196LA 1LYFA 4DJHA 1DYGA 1L57A 1C6KA 174LA 3D4SA 3OE6A 4ARMA 1PQIA 4EKRA 1PQJA 3HWLA 3DKEX 1L15A 3HUKA 3SB9A 3C7YA 4LDEA 1L55A 3DN8A 1L27A 3VW7A 1C60A 2RH1A 2A4TA 3C7WA 1L16A 1CU6A 1DYAA 1C6QA 3JR6A 2RBPA 3G3VA 3HUAA 2O79A 3C82A 164LA 3HH5A 1QT7A 131LA 1KNIA 1D3MA 3SB8A 123LA 1G0JA 3HUQA 2B6YA 169LA 1L61A 3NY9A 1L99A 1C6MA 1EPYA 1L49A 168LA 1L45A 232LA 119LA 4I7SA 1SX7A 1LI6A 115LA 3CDTA 1C6PA 1L01A 1L13A 3GUPA 3V2WA 1PQOA 3NYAA 1P46A 257LA 1L63A 4LDLA 102LA 1G0MA 1L14A 7LZMA 2F47A 4IAPA 1L34A 1C6BA 1L29A 3GUOA 224LA 4LZMA 215LA 3DN4A 1OV5A 218LA 113LA 1QUHA 1L76A 1KS3A 1ZURA 120LA 4EKQA 109LA 110LA 1KY0A 1QSBA 198LA 1L98A 3HH3A 3NY8A 2RB1X 1C6GA 1G0PA 254LA 1L0KA 1QTHA 181LA 248LA 2B7XA 3GUMA 4GBRB 236LA 1LLHA 2RBNA 161LA 1OVHA 237LA 1L74A 3QAKA 1L02A 1XEPA 2OTYX 1L62A 1L39A 1L56A 3DMZA 157LA 3L2XA 2NTGA 2Q9EA 212LA 1L35A 1SSWA 1C6FA 3C81A 3C8RA 1LPYA 3HU9A 1L25A 1CU5A 3OE8A 4W54A 223LA 1P3NA 4EXMA 128LA 260LA 1QT3A 1JTMA 1T8GA 4W57A 3RUNA 183LA 1L22A 1L96A 1L97A 1L08A 3HH4A 2OTZX 1KW7A 125LA 1QTZA 1L50A 1L47A 2OU9A 1C64A 1LYEA 2O7AA 1DYFA 4I7TA 1D9WA 4K5YA 241LA 1L58A 4E97A 1L51A 3L64A 1L71A 1DYDA 240LA 3CDVA 139LA 210LA 4EPIA 3EMLA 146LA 1L64A 1QTCA 1L91A 1L23A 1L19A 255LA 150LA 1CU2A 3UONA 242LA 220LA 145LA 1L73A 1CUQA 4OO9A 199LA 2O4WA 213LA 1OYUA 4W56A 147LA 1D3JA 1D3FA 1I6SA 1C6IA 1QSQA 229LA 1L43A 1CTWA 4ARQA 3V2YA 3C7ZA 1L37A 1SWYA 214LA 245LA 1C6TA 4I7PA 2F32A 1C68A 114LA 137LA 1L75A 166LA 1CV1A 185LA 1L38A 1C66A 2CUUA 127LA 1G0GA 170LA 1JQUA 1P2LA 2B73A 1LYJA 258LA 1P64A 187LA 2RB2X 1L04A 1L86A 2LC9A 3F8VA 1ZWNA 3FI5A 3HDFA 1G0QA 1C63A 1C6LA 1L82A 1L09A 148LE 2ANVA 1L52A 3HT7A 4EPFA 1P2RA 130LA 4EKSA 246LA 191LA 142LA 140LA 2RBOA 1L32A 1L85A 4DAJA 2LZMA 1P56A 156LA 2OEAX 1L92A 1L94A 1XJUA 235LA 3LZMA 1L41A 1L48A 1L46A 1C6HA 176LA 177LA 1ZYTA 1P36A 1LI3A 1C6AA 3C8SA 3GULA 4W55A 1L80A 209LA 1L17A 1G0LA 143LA 1L26A 1L53A 1G0KA 1D2WA 3SBAA 1CX7A 1P5CA 3GUNA 4YXAC 1TLAA 1CV0A 126LA 1G1VA 200LA 3FA0A 1B6IA 4AQNA 2B72A 3C83A 1LGUA 162LA 3HT8A 165LA 1C65A 1L07A 1L79A 2RBSA 1L05A 2ANXA 155LA 1QTDA 1CX6A 1WTHA 1XJTA 261LA 2B70A 1C6EA 3HTFA 3OE9A 1OVKA 3DMXA 1C62A 3OE0A 1LW9A 1L81A 243LA 1LI2A 225LA 1C6NA 3F9LA 262LA 1C6CA 1OWZA 2HULA 2L78A 173LA 1L66A 1L03A 244LA 3CDQA 1L68A 3G3WA 1G07A 4DKLA 2QARC 3GUJA 4ARQB 1LYHA 1QUGA 1L89A 3DN3A 3HU8A 4W59A 188LA 3DNAA 3ODUA 4W58A 138LA 219LA 171LA 4W53A 259LA 1T97A 206LA 189LA 4I7JA 2B6ZA 1G06A 1LGWA 158LA 1G1WA 221LA 178LA 1LGXA 4GRVA 228LA 167LA 226LA 1L87A 107LA 3SB7A 3DN1A 1QTVA 233LA 1L93A 1DYCA 1L24A 3C8QA 3FADA 1QUOA 1QUDA 1L33A 1KY1A 1L28A 118LA 3SB6A 4YX7C 1SSYA 2RAYX 216LA 1L11A 141LA 1L77A 3DN6A 129LA 1P6YA 4EJ4A 4PJZA 252LA 159LA 104LA 3PBLA 1D2YA 238LA 1L65A 1DYEA 1PQKA 163LA 1CV3A 234LA 1QTBA 184LA 2RBQA 247LA 4I7KA 175LA 6LZMA 201LA 3DN0A 149LA 1LWGA 2B6WA 2F2QA 1L00A 1LWKA 3SN6R 190LA 1QT6A 4W51A 222LA 3HT9A 1JTNA 1CVKA 4ARJA 3GUKA 3RZEA 1L84A 1SX2A 4LDOA 1P7SA 1L67A 1QT4A 256LA 1P37A 4I7RA 1LYIA 1QT5A 230LA 1C6DA 1NHBA 1OWYA 2RB0X 253LA 4I7OA 3HDEA 2OE4X 3DMVA 5LZMA 251LA 1PQMA 111LA 1KW5A 3G3XA 4ARPA 1L20A 197LA 4I7NA 3SB5A 1L72A 1OV7A 4I7MA 1DYBA 4I7LA 2QB0B 1SWZA 2B75A 1K28A 1L70A 172LA 1CV5A 1L54A 1L59A 1L88A 2B74A 2B6XA 2RAZX 3CDOA 4ZPUA 1L18A 3HTDA 3K2RA 2OU0X 144LA 1L42A 1L90A 2IGCA 3HTGA 195LA 1L69A 2OE7X 186LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IWUA 1CUPA 1HEMA 1BWIA 3GXRA 151LA 1TBYA 1OUAA 1LJKA 1C6JA 2Q9DA 1GWDA 4LYOA 3BKHA 3WULA 1C69A 1JIYA 1T6HA 2B6TA 2RBRA 2HEBA 205LA 227LA 249LA 3N9AA 153LA 2HUMA 1JJ0A 108LA 3ULRA 2F4GA 4GLAA 2Z6BA 1L06A 4YXCA 1YKZX 4HJYA 1L30A 3HTBA 3HBEX 2OE9X 2DQJY 3TXJA 1L40A 4J0LA 4WMGA 1LYDA 1LSPA 1L60A 1LYFA 1KIQC 4HJZA 1C6KA 1PQIA 4PRUA 1LYZA 1QDTA 1PQJA 1AM7A 3HWLA 1F6SA 1GF4A 3A90A 1GB0A 4E3UA 5KXZA 3VW7A 2RH1A 133LA 1CU6A 4H1PA 1C6QA 3JR6A 2X0AA 1LZ6A 3WPKA 4MSTA 1GFVA 3HUAA 5HNCA 2O79A 3C82A 164LA 1QT7A 1KNIA 1NQIA 3SB8A 3HUQA 169LA 4DQ7A 4TUNA 1LZEA 3AZ4A 4I7SA 1SX7A 1CKFA 1HELA 2BQEA 3CDTA 4LYZA 1FDLY 1D0KA 3GUPA 1PQOA 1P46A 2YBIA 1LKSA 3A3RX 2EIZC 3OK0A 4IAPA 1L29A 1LZGA 3GUOA 4LZTA 1E8LA 1LJ4A 3T6UA 3WUAA 2DQCY 1IP3A 1L76A 1UCOA 2D91A 1UUZC 1WQOA 120LA 193LA 4PGJB 110LA 1QSBA 3NY8A 4GCEA 1C6GA 1G0PA 4DDCA 1B7PA 1QTHA 181LA 2B7XA 3WU9A 1GPQC 4DD1A 2RBNA 3A8ZA 3QAKA 1VDPA 4C5FA 1XEPA 2BQMA 2OTYX 2Z12A 1L56A 2BQBA 1IP4A 4UWUA 2MEBA 5M1YA 1SSWA 1C6FA 1HEWA 1WQMA 1B7OA 1PZYA 3TMXA 5II3A 1CU5A 3OE8A 4WM3A 5D5CA 2EKSC 223LA 2CJLA 3A93A 4EXMA 4GN3A 1REZA 128LA 260LA 4X3BA 1QT3A 4W57A 3A6BY 1WQQA 4LYMA 1F10A 1ZVHL 2DQDY 4CJ2A 2FBDA 2O7AA 1DYFA 2W1XA 5IDDA 1D9WA 5I54A 4WG7A 1HEPA 4E97A 135LA 4H9BA 4EPIA 1B5ZA 1B5VA 3EXDA 3WW6A 1SQ2L 255LA 4N9RA 3UONA 3P66A 4OO9A 4LFPA 2HEAA 4OWEA 1I6SA 4CHXA 5E4PA 1G7MC 3C7ZA 1SWYA 1C6TA 4NG8A 1GFKA 2F32A 1C68A 1CKCA 1GE0A 2LYMA 1L75A 3B6LA 4QEQA 185LA 2CUUA 3WH1A 4WL7A 1XGQC 4YF2A 258LA 187LA 2RB2X 1L04A 1L86A 2LC9A 1LHHA 1YAMA 3CT0A 4B4IA 1Z55A 4H8ZA 2ANVA 1L52A 130LA 3TMUA 4EKSA 2YBMA 1GFRA 140LA 1FN5A 4OWCA 1QIOA 1HNLA 1YAPA 1L92A 4A7DA 1L94A 1XJUA 5B1FA 1G7LC 1UACY 1C6HA 4AGAA 1YILA 1ZYTA 1C6AA 3C8SA 1P2CC 1JITA 1G0LA 143LA 3CB7A 5HMVA 2CWIA 3K3TA 1TLAA 2MECA 126LA 1LZCA 4NGVA 1B6IA 1DKJA 2HECA 4DD7A 1F0WA 4NHSA 3A34A 5LXWA 1IVMA 1HEOA 1L05A 1JKCA 2ANXA 1LZ8A 1IORA 1EL1A 1XJTA 4NGYA 5DLAA 4RW1A 1OUJA 4NHPA 1LOZA 1V7SA 1B7MA 1HFXA 3CT1A 1C6CA 1OWZA 2HULA 173LA 5LVIA 1UIHA 4YENA 3CDQA 1L68A 3G3WA 1GXXA 4L41A 3RW8A 2Z38A 1GE4A 1QUGA 1L89A 3DNAA 138LA 3AW6A 1I20A 171LA 4LT1A 4I7JA 4CFOA 2B6ZA 1KXXA 1G06A 158LA 221LA 2Z39A 1LGXA 2PC2A 3RZ4A 228LA 1IC7Y 226LA 1UIEA 107LA 1VDQA 3SB7A 5LYTA 3W3EA 3TXHA 1QUOA 4GN5C 2RSCA 118LA 3B0KA 2RAYX 4PHIA 5L3IA 3BKVA 2I6ZA 1LZYA 3EO5A 1B7RA 1D2YA 1GE2A 1L65A 4QDNA 1QTBA 5LYZA 2LYOA 4I7KA 1CJ9A 149LA 1LWGA 3EBAB 1L00A 1QT6A 2Z37A 4KXIA 1JTNA 3GUKA 1OUGA 3RZEA 1LYYA 1L84A 1OUHA 4H9CA 5KXKA 1WQNA 134LA 4LDOA 1P7SA 1QT4A 1P37A 2MEFA 1BB4A 4DD9A 4EOFA 4ETBA 1IY3A 2BQHA 4CFPA 3LZTA 1VAUA 111LA 4ARPA 1HFZA 1OV7A 4I7MA 4I7LA 4G4BA 3FE0A 5I4XA 1L54A 2B6XA 4WM6A 2B74A 3CDOA 4TWSA 1L18A 3WVXA 1LSYA 4W94A 2HEDA 2IGCA 3W6EA 195LA 2OE7X 1NDGC 1LZBA 2DQEY 4ETDA 194LA 1L21A 103LA 4PPOA 4PK0A 1GEVA 1JHLA 5APDA 1UIFA 4NSGA 1OVJA 5B05A 4LT0A 2XQOA 2YSSC 3HT6A 239LA 1UC0A 3P4ZA 3AJNA 3CSRA 1LSFA 1V7TA 3WVYA 1LMCA 4ARMB 1HF4A 4WL6A 1UIGA 3C80A 2H9KA 4S0WA 1EQEA 3HBHA 5DM9A 152LA 1LCNA 3P68A 1L44A 4XJHA 1IR7A 1D3NA 1TAYA 3OJPA 1BQLY 1BVXA 1IR8A 1XEIA 3DN2A 122LA 1ZVYB 2OU8A 3A95A 1PQDA 4HTNA 1GDWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1IWU A;  1CUP A;  1HEM A;  1BWI A;  3GXR A;  151L A;  1TBY A;  1OUA A;  1LJK A;  1C6J A;  2Q9D A;  1GWD A;  4LYO A;  3BKH A;  3WUL A;  1C69 A;  1JIY A;  1T6H A;  2B6T A;  2RBR A;  2HEB A;  205L A;  227L A;  249L A;  3N9A A;  153L A;  2HUM A;  1JJ0 A;  108L A;  3ULR A;  2F4G A;  4GLA A;  2Z6B A;  1L06 A;  4YXC A;  1YKZ X;  4HJY A;  1L30 A;  3HTB A;  3HBE X;  2OE9 X;  2DQJ Y;  3TXJ A;  1L40 A;  4J0L A;  4WMG A;  1LYD A;  1LSP A;  1L60 A;  1LYF A;  1KIQ C;  4HJZ A;  1C6K A;  1PQI A;  4PRU A;  1LYZ A;  1QDT A;  1PQJ A;  1AM7 A;  3HWL A;  1F6S A;  1GF4 A;  3A90 A;  1GB0 A;  4E3U A;  5KXZ A;  3VW7 A;  2RH1 A;  133L A;  1CU6 A;  4H1P A;  1C6Q A;  3JR6 A;  2X0A A;  1LZ6 A;  3WPK A;  4MST A;  1GFV A;  3HUA A;  5HNC A;  2O79 A;  3C82 A;  164L A;  1QT7 A;  1KNI A;  1NQI A;  3SB8 A;  3HUQ A;  169L A;  4DQ7 A;  4TUN A;  1LZE A;  3AZ4 A;  4I7S A;  1SX7 A;  1CKF A;  1HEL A;  2BQE A;  3CDT A;  4LYZ A;  1FDL Y;  1D0K A;  3GUP A;  1PQO A;  1P46 A;  2YBI A;  1LKS A;  3A3R X;  2EIZ C;  3OK0 A;  4IAP A;  1L29 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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