3HWLA

Crystal structure of t4 lysozyme with the unnatural amino acid p-acetyl-l-phenylalanine incorporated at position 131
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
162
structure length
161
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFCQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDCVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAANLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Site-directed spin labeling of a genetically encoded unnatural amino acid.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 57
structure length 161
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2009-06-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3hwlA00
1L87A 2ANVA 1CV4A 1XJUA 1OVKA 201LA 1QSQA 3C7YA 1LI2A 4I7TA 145LA 1L08A 1L38A 1L74A 3HWLA 143LA 4I7QA 1L01A 1L95A 2CUUA 1QTDA 4LDEA 1L14A 1L89A 137LA 1K28A 1L02A 2RBQA 175LA 2HUMA 167LA 2B6YA 1B6IA 1L43A 1L64A 3L2XA 1QTCA 3HDEA 4YXAC 3OE9A 1C65A 1SX7A 1L09A 1L32A 1L92A 1TLAA 1P2LA 3OE8A 1QT3A 255LA 4ZPUA 3GUJA 4OO9A 1L50A 1QUGA 252LA 1L62A 1L86A 214LA 4EPIA 3HTFA 1XJTA 168LA 1L03A 1L63A 1P46A 1L23A 3OE6A 1OVJA 2OE7X 3C83A 4LZMA 3SB5A 1C6KA 1L97A 200LA 1LW9A 109LA 1OV5A 1L18A 3NY8A 1L49A 259LA 1LGWA 104LA 1P36A 1C6CA 1C6DA 1CU5A 1DYDA 1L27A 170LA 1LWKA 3NYAA 1CX7A 2B73A 150LA 1PQOA 3C7WA 155LA 2OTZX 4I7NA 1G0KA 237LA 184LA 1CU3A 1CV6A 1L73A 2F2QA 2OE4X 1CU6A 2B6XA 1CU2A 3C8QA 1PQKA 152LA 1KS3A 1CUPA 178LA 148LE 1P64A 2NTGA 3C81A 3HTGA 185LA 1G0GA 198LA 238LA 1OYUA 1QS5A 102LA 1G0JA 4W51A 227LA 3DMVA 4W56A 197LA 2LZMA 1JQUA 1P37A 244LA 4I7PA 250LA 130LA 2A4TA 1CVKA 1L17A 1D2WA 4EJ4A 171LA 103LA 1L56A 222LA 1SWZA 1L26A 245LA 169LA 1OV7A 248LA 3DNAA 1L60A 1LYIA 1P7SA 1C6NA 1L45A 161LA 212LA 1C6EA 230LA 1L0JA 256LA 1CV5A 1C66A 4GRVA 1ZURA 220LA 1L82A 3DMZA 1L54A 2ANXA 3ODUA 190LA 4W55A 1L37A 115LA 1L35A 141LA 2RB1X 4S0WA 3RUNA 1L19A 1C6QA 261LA 2B6WA 4PK0A 4ARLA 3JR6A 1C6HA 3G3VA 3HH5A 3V2YA 1L13A 2B6TA 1L72A 2RBRA 1L51A 1L24A 2Z6BA 4EKQA 3OE0A 229LA 1L85A 2RAZX 186LA 1PQDA 4ARQB 225LA 3HH6A 1C6AA 3C8SA 1LGUA 4DJHA 1C68A 1L67A 1L76A 4I7LA 1L16A 2O4WA 246LA 4I7KA 1LYJA 159LA 243LA 1D9WA 189LA 1QUHA 1L20A 2B74A 3DN4A 1DYGA 1C60A 165LA 232LA 164LA 2OU9A 144LA 3GUMA 4W57A 1SSWA 1C64A 2RAYX 112LA 1T6HA 1L12A 1L46A 2RBOA 1LYGA 4W54A 3HT9A 247LA 1OWZA 3FADA 1LYEA 1OVHA 1WTHA 3SB8A 2OU0X 110LA 3GUIA 3SB6A 1DYFA 1PQIA 6LZMA 226LA 4DKLA 1OWYA 1CU0A 1G1VA 176LA 3HUQA 166LA 142LA 1LI6A 3EMLA 1L98A 1D3JA 1KW7A 1G0LA 3HT6A 3FA0A 1D3NA 3FI5A 205LA 1L79A 5I14A 3SN6R 223LA 1L61A 4ARQA 1CV0A 174LA 1L52A 215LA 181LA 211LA 1LWGA 195LA 1L99A 1QT4A 1CV1A 120LA 1CUQA 1L05A 4EKRA 1L53A 1L57A 1L58A 1L48A 1L33A 3CDTA 240LA 1CTWA 3K2RA 1L66A 1T8GA 239LA 4W59A 1DYBA 3HUKA 1KW5A 1L21A 1C6LA 2B72A 1C67A 1L34A 3VW7A 118LA 2RB0X 2RH1A 3HH3A 3PDSA 249LA 1C6GA 1G1WA 1L55A 1L96A 257LA 4YXCA 221LA 3HU9A 123LA 1L11A 262LA 3HTDA 187LA 1CV3A 254LA 3DN3A 1L47A 236LA 140LA 138LA 3LZMA 4ARPA 1P2RA 1L70A 1QUOA 1C6PA 1D3MA 2QARC 3DN8A 1QTZA 1L40A 4I7MA 4EKPA 192LA 127LA 3C82A 2LCBA 1CX6A 3F9LA 3GULA 1G0QA 253LA 1L91A 2HUKA 1C6BA 2NTHA 1LYDA 182LA 1L06A 1L71A 1L10A 3SBBC 1LGXA 1QT8A 2F32A 3CDRA 1L25A 3HUAA 2RBPA 1LYFA 1L29A 4GBRB 3DN6A 5LZMA 241LA 157LA 1LYHA 180LA 3UONA 1G07A 3HDFA 172LA 122LA 228LA 258LA 1L90A 1DYEA 1C6JA 129LA 1L30A 1C6TA 1L0KA 2F47A 3PBLA 151LA 1JTNA 2Q9EA 4W52A 1L88A 4ARJA 3HU8A 3DN0A 1G0PA 3HT7A 4ARMB 3QAKA 163LA 2HULA 1L59A 2OTYX 160LA 219LA 1QTHA 1XEPA 3HH4A 233LA 2LC9A 1LI3A 3CDOA 1C69A 242LA 1L41A 2RBNA 4EKSA 158LA 4I7SA 183LA 128LA 191LA 1L22A 196LA 1C63A 1KY0A 1L39A 1C6FA 213LA 3C8RA 2B6ZA 209LA 4LDOA 1QTBA 1P3NA 1QSBA 1L36A 1L84A 260LA 3SBAA 1L83A 1T97A 177LA 2IGCA 1L75A 251LA 1C6IA 1L68A 1L15A 1P6YA 3DN2A 156LA 3F8VA 1L94A 2QB0B 1SWYA 3DMXA 210LA 3SB7A 1QT6A 216LA 4ARMA 1L80A 3CDQA 3GUPA 3C7ZA 1C6MA 1ZYTA 146LA 3G3XA 4EXMA 2RBSA 1QS9A 2RB2X 1C61A 3V2WA 1D2YA 1NHBA 234LA 1JTMA 4I7OA 199LA 235LA 4I7JA 108LA 111LA 3GUKA 1DYCA 4EPFA 107LA 1SX2A 1L28A 4K5YA 7LZMA 4YX7C 1L07A 2OU8A 131LA 1KNIA 3GUNA 3HT8A 2B7XA 218LA 2OE9X 1PQJA 1L31A 2B75A 1QT5A 4E97A 4PJZA 4AQNA 125LA 3HTBA 1T8AA 1L69A 224LA 1L65A 1EPYA 4LDLA 119LA 2OEAX 3L64A 1KY1A 4W53A 147LA 3G3WA 126LA 114LA 1P56A 4W58A 1LLHA 4I7RA 1QUDA 2O79A 2O7AA 2B70A 1L93A 1G0MA 217LA 3C80A 1C62A 3CDVA 3GUOA 1G06A 149LA 2Q9DA 1I6SA 1QTVA 1L00A 231LA 4DAJA 1QT7A 3DKEX 1DYAA 1L81A 1L42A 139LA 1SSYA 1ZWNA 1L44A 173LA 3D4SA 113LA 162LA 3SB9A 1P5CA 1LPYA 1T8FA 3RZEA 3NY9A 2L78A 1D3FA 3DN1A 4IAPA 188LA 1L04A 1L77A 206LA 1PQMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2XQOA 3RT5X 1L87A 3RNXA 1JKDA 2ANVA 1G7HC 4HSFA 1J1OY 1B7MA 4X3BA 1L38A 1AZFA 2LYOA 1OUFA 1IP1A 1QTDA 4Z41A 1HFYA 1JHLA 2XJWA 2DQHY 1XGPC 3TXGA 1K28A 4FJRA 1L02A 2RBQA 1CKDA 2HUMA 5FDJA 1L64A 1LHMA 4WMGA 1C65A 3TMVA 1SX7A 1LSMA 4XN6A 1QT3A 4ZPUA 5B59A 4R0FA 4ANRA 1L86A 1IP5A 1LMAA 1NF5A 4NGLA 1T6VL 3WW6A 1AT5A 2A7DA 1C6KA 200LA 1GF5A 1LW9A 1L18A 2BQGA 1L49A 4RLNA 104LA 1CJ6A 1DYDA 2BQMA 3WUAA 3NYAA 2YBJA 1VEDA 1G7LC 4H9BA 1VAUA 3B0IA 4ZFPA 2YSSC 237LA 184LA 2F2QA 1OUEA 4AXTA 1CU6A 3C8QA 4XENA 2DQGY 148LE 1D0LA 2NTGA 2MECA 3C81A 3HTGA 2BQKA 1GB6A 198LA 1HMLA 1G0JA 2MEHA 4J1AA 3LN2A 1P37A 1FLWA 2DQDY 1OUIA 1LZYA 4IJ4A 5K7OA 1CVKA 1AKIA 2XBSA 1GXV2 2EKSC 2D91A 5B06A 3WU9A 3TMWA 1IWUA 1L56A 4WOAA 1H87A 4B0DA 132LA 1LHLA 1D9UA 1OV7A 4PHIA 4HJYA 4W94A 3N9AA 1P7SA 1C6NA 1L45A 2Z18A 2ZWBA 4B1AA 230LA 1WQQA 1GEZA 4GRVA 1TCYA 2ANXA 3ODUA 1YIKA 2EPEA 1GBWA 4NEBA 115LA 141LA 5KXTA 4PPOA 1YROA 2HUBA 4B4JA 4PK0A 1UIAA 3HH5A 1DZBX 3V2YA 2RBRA 207LA 1LMQA 1L85A 1REMA 4ARQB 4DJHA 1C68A 1L67A 1DI3A 246LA 2FYDA 1LYJA 4MR1A 1D9WA 3CT0A 4RLMA 1I1ZA 3DN4A 1C60A 3GUMA 1LZSA 3WULA 1GB7A 4W57A 5KKIA 1JSFA 1T6HA 1L12A 1YAOA 3OK0A 1HEMA 1LYEA 110LA 3SB6A 1DYFA 4DKLA 1OWYA 4M6DA 3HUQA 3AJNA 2CGIA 1GFHA 1REZA 1XEKA 1XEJA 5KJ9A 3HT6A 3K3TA 205LA 1L79A 1L61A 4LYCA 1GFVA 4ARQA 1CV0A 174LA 1IWVA 4DQJA 1L52A 3WXUA 1IOQA 4N0JA 1IC7Y 1JEFA 2BQLA 4IATA 4LGKA 195LA 120LA 1L05A 5I54A 1BVXA 4H94A 2MEFA 1L66A 2EQLA 1L21A 2B72A 1IC4Y 118LA 2RB0X 2RH1A 1OUBA 2MEBA 2Z37A 7LYZA 1L96A 221LA 4CHXA 4QY9A 254LA 3IJVA 1L47A 2ZQ4A 3LZMA 3IJUA 1H6MA 4DD3A 1BB4A 1NBYC 2QARC 3W6BA 1B9OA 1QTZA 1F6RA 2H5ZA 1IR7A 1YKXX 2LCBA 1JJ1A 1HERA 2Z38A 2CWIA 1UCOA 5KXRA 3GULA 1G0QA 1HSWA 1SQ2L 3A92A 1LYDA 1GFJA 3LYOA 4I8SA 4LT2A 3SBBC 2W1LA 3AZ6A 1L29A 5L9JA 2BQOA 4LYMA 4HPIA 3P64A 241LA 2B5ZA 1LYHA 3UONA 1G07A 2X0AA 4J7VA 4WLDA 1FDLY 4DDCA 258LA 1C6JA 1LMNA 1L30A 1REXA 1L0KA 2GV0A 3PBLA 1JTNA 1DI5A 1P2CC 4H9EA 4WLXA 4ARJA 1NDGC 219LA 4QDNA 5LYMA 1XEPA 1B7SA 2DQIY 1C7PA 4YENA 1YAQA 1L41A 1RJCB 4HV2A 183LA 128LA 135LA 4XJGA 1KY0A 213LA 3P66A 2B6ZA 209LA 3BKVA 4LDOA 4N9RA 1P3NA 4QGZA 1QSBA 1L36A 1IX0A 1T97A 4H92A 1NQIA 4TX7A 5HQ1A 1L94A 2QB0B 1GF9A 3A67Y 1IEEA 153LA 3HBHA 1XSFA 1VATA 1UIDA 3CDQA 3GUPA 4CGEA 1ZYTA 1DQJC 2W1YA 4EXMA 2RBSA 2LHMA 1UBZA 4LYBA 1GF0A 1G7JC 1GB0A 2FYCA 1NHBA 4ZIXA 1JTMA 2DQFC 4MSTA 2HEEA 4OWHA 1L28A 1L07A 4UWVA 3GUNA 1B5YA 4B4IA 4OWEA 2B7XA 1PQJA 4WLYA 2B75A 125LA 119LA 3L64A 1KY1A 5KXKA 1V7SA 5KXZA 1HEOA 4FDYA 1QDTA 2O79A 2W1XA 3TXKA 4CFPA 1CKFA 2WARA 1L93A 5DM9A 3C80A 5FEKA 3ULRA 2W1MA 5KXYA 3D9AC 3BKHA 1LZ9A 2HECA 4PGJB 3D4SA 4H93A 113LA 162LA 1IR9A 3B0KA 2F30A 4WL6A 5LVIA 1LZ6A 2ZIKA 1YKYX 2ZNWY 201LA 4ML7A 4GLVA 1L08A 1IWXA 3HFMY 3HWLA 4NHQA 4I7QA 3AGIA 1UIGA 4LDEA 1GBXA 1CJ9A 137LA 1GB9A 1REYA 175LA 167LA 3L2XA 1WQNA 1OUCA 3HDEA 4YOPA 2F4AA 2AUBA 5F81A 1NHEA 3LYZA 5DN4A 1XJTA 1HSXA 4H9IA 1L63A 3OE6A 1B7NA 1L23A 1LJJA 1OVJA 2OE7X 4LZMA 1L97A 1OV5A 259LA 4OOOA 1IOCA 1C6DA 1CU5A 4NGYA 170LA 1IIZA 1AT6A 150LA 1PQOA 1I56A 155LA 4I7NA 3WUMA 1GXXA 1CV6A 1GFTA 1PQKA 152LA 1KS3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2XQO A;  3RT5 X;  1L87 A;  3RNX A;  1JKD A;  2ANV A;  1G7H C;  4HSF A;  1J1O Y;  1B7M A;  4X3B A;  1L38 A;  1AZF A;  2LYO A;  1OUF A;  1IP1 A;  1QTD A;  4Z41 A;  1HFY A;  1JHL A;  2XJW A;  2DQH Y;  1XGP C;  3TXG A;  1K28 A;  4FJR A;  1L02 A;  2RBQ A;  1CKD A;  2HUM A;  5FDJ A;  1L64 A;  1LHM A;  4WMG A;  1C65 A;  3TMV A;  1SX7 A;  1LSM A;  4XN6 A;  1QT3 A;  4ZPU A;  5B59 A;  4R0F A;  4ANR A;  1L86 A;  1IP5 A;  1LMA A;  1NF5 A;  4NGL A;  1T6V L;  3WW6 A;  1AT5 A;  2A7D A;  1C6K A;  200L A;  1GF5 A;  1LW9 A;  1L18 A;  2BQG A;  1L49 A;  4RLN A;  104L A;  1CJ6 A;  1DYD A;  2BQM A;  3WUA A;  3NYA A;  2YBJ A;  1VED A;  1G7L C;  4H9B A;  1VAU A;  3B0I A;  4ZFP A;  2YSS C;  237L A;  184L A;  2F2Q A;  1OUE A;  4AXT A;  1CU6 A;  3C8Q A;  4XEN A;  2DQG Y;  148L E;  1D0L A;  2NTG A;  2MEC A;  3C81 A;  3HTG A;  2BQK A;  1GB6 A;  198L A;  1HML A;  1G0J A;  2MEH A;  4J1A A;  3LN2 A;  1P37 A;  1FLW A;  2DQD Y;  1OUI A;  1LZY A;  4IJ4 A;  5K7O A;  1CVK A;  1AKI A;  2XBS A;  1GXV 2;  2EKS C;  2D91 A;  5B06 A; 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