3K2RA

Crystal structure of spin labeled t4 lysozyme mutant k65v1/r76v1
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAECLFNQDVDAAVCGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Spin Labeled T4 Lysozyme Mutant K65V1/R76V1
rcsb
molecule keywords Lysozyme
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 59
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2009-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3k2rA00
1JTNA 1DYFA 4I7JA 3SB6A 4I7OA 3HH6A 3UONA 149LA 4EKSA 2RBQA 131LA 1C68A 3C83A 192LA 1KW7A 1CUQA 1L96A 1D2WA 1LGUA 2RBSA 1T6HA 1L83A 213LA 3HT8A 2ANXA 1LYHA 1L86A 1L50A 4DJHA 226LA 1K28A 1OYUA 4ARMB 147LA 1P2RA 3GUKA 3L2XA 4I7RA 3HTFA 3HUKA 3PDSA 2B6ZA 1QSQA 1LYEA 1P37A 104LA 1L34A 178LA 4I7TA 1OVHA 2F2QA 1DYDA 1C67A 250LA 1L08A 1L72A 3DKEX 1L61A 151LA 1C6TA 1L43A 2B6YA 1L56A 148LE 1C62A 3G3WA 3SB7A 1QUDA 1L53A 3HU8A 4I7KA 215LA 3GUMA 3PBLA 1SX2A 212LA 1C6CA 146LA 1L46A 4PK0A 4DAJA 1SSWA 4ARPA 122LA 1L00A 206LA 214LA 1L45A 200LA 1L27A 1TLAA 3G3XA 3DMZA 3RZEA 1C6AA 4EKQA 1C6LA 196LA 1PQIA 4EKRA 7LZMA 1C6QA 156LA 1L14A 1DYAA 1JQUA 140LA 1C6GA 1XJTA 1C6NA 1L25A 2B6WA 217LA 3DN1A 127LA 3GULA 1G0KA 1C6KA 4K5YA 3SN6R 210LA 1LWGA 171LA 2NTGA 240LA 1CX6A 4I7NA 1QTHA 4LZMA 1L09A 2IGCA 3C7WA 3OE9A 4LDLA 245LA 4W58A 1DYEA 1XJUA 1C6PA 198LA 1L52A 2B72A 187LA 1C6BA 1G1WA 1L57A 1L0JA 1KS3A 3DN6A 1L65A 126LA 2B70A 4I7SA 1LI2A 2LZMA 3DN0A 236LA 1G0JA 1L22A 5I14A 3LZMA 1G0MA 1CVKA 1L59A 4AQNA 234LA 3OE0A 260LA 2CUUA 3HUAA 114LA 1KY0A 172LA 218LA 152LA 1C6HA 1L71A 1ZYTA 2OE4X 2NTHA 177LA 1QT5A 1JTMA 165LA 258LA 1L40A 1L64A 243LA 222LA 1B6IA 1L20A 1LW9A 1LPYA 3DMVA 1C64A 3HH5A 1PQDA 4ARMA 1L70A 1D3MA 1L62A 1LLHA 4W51A 1C65A 1KW5A 2OU9A 102LA 3SBBC 1L19A 1PQKA 180LA 3CDQA 1LYFA 1LI6A 3C80A 1L38A 1L82A 3L64A 1L0KA 1OWYA 1T97A 1L75A 225LA 1SX7A 4YXCA 3NYAA 4I7LA 1L26A 1L05A 190LA 2HUKA 4DKLA 185LA 3OE6A 2RAZX 1LI3A 157LA 1L41A 1CV6A 4ZPUA 3CDOA 1L03A 1G0LA 1L76A 228LA 3C82A 1L51A 128LA 4GRVA 209LA 1C6JA 155LA 3DMXA 4IAPA 4W56A 120LA 4EPFA 1ZWNA 2Q9EA 1C6MA 1L87A 1L99A 1P64A 3DN8A 1NHBA 3C81A 182LA 1OWZA 113LA 3GUNA 3HWLA 1L74A 4OO9A 1QT7A 166LA 1L12A 1OV5A 3EMLA 1CV0A 1P56A 1L33A 4EKPA 1D9WA 1P7SA 1SWZA 262LA 1L29A 1QTVA 195LA 4EPIA 252LA 219LA 1CU6A 188LA 3F9LA 3HTGA 2B74A 1T8AA 1L10A 109LA 1L31A 4YXAC 4I7MA 3HT6A 176LA 1SWYA 223LA 1QUOA 1L60A 1G0GA 4ARQB 4W59A 3NY9A 1L01A 1ZURA 110LA 2QARC 4GBRB 130LA 1L32A 1OVKA 1CV4A 1QT8A 1EPYA 3CDTA 168LA 164LA 2OE7X 3G3VA 4E97A 1L42A 1L07A 2B73A 1L54A 1L11A 229LA 137LA 1L90A 230LA 1L23A 1KY1A 1L91A 1L48A 1QUGA 257LA 115LA 233LA 201LA 5LZMA 160LA 3SB8A 4LDOA 1QTDA 3JR6A 111LA 224LA 1L36A 1LYGA 1L79A 2B7XA 246LA 2F32A 2QB0B 1L47A 183LA 2RBRA 161LA 4W53A 3FADA 158LA 1WTHA 220LA 1D3FA 1PQMA 261LA 3HTBA 1L04A 1G06A 1C60A 189LA 1L84A 1L93A 1T8FA 235LA 1L92A 167LA 2LCBA 1OV7A 2B75A 3K2RA 1CU5A 1L39A 1CV1A 2HUMA 2Q9DA 1P3NA 2Z6BA 1C63A 1L69A 2HULA 125LA 2OU0X 1CTWA 2OEAX 3DN4A 4LDEA 129LA 1L81A 2RBNA 1C69A 4ARJA 3FA0A 1L89A 184LA 2B6XA 3SBAA 1OVJA 1CUPA 2O7AA 1QTZA 241LA 1XEPA 1L94A 1L13A 103LA 1L58A 3DN3A 175LA 142LA 2OU8A 3FI5A 1L67A 1L80A 256LA 4PJZA 216LA 1L06A 1CX7A 2L78A 4I7QA 3HT7A 170LA 1P46A 186LA 3QAKA 1QS9A 1L55A 191LA 4ARQA 1L15A 1P6YA 1L73A 1L30A 2O4WA 1DYBA 1C66A 162LA 3HUQA 247LA 2F47A 1C6EA 1DYCA 2RB0X 1L17A 1LYDA 4ARLA 141LA 1L21A 4W57A 3D4SA 1L66A 3GUIA 1QTCA 255LA 205LA 253LA 1L28A 1CU0A 1C61A 2RB2X 1C6DA 1T8GA 123LA 1QT4A 4W55A 1CV3A 199LA 181LA 3C8SA 259LA 1QT6A 1L77A 2O79A 227LA 1L49A 1P5CA 3GUJA 3RUNA 2OE9X 1L68A 2LC9A 3HH3A 3C8QA 1QSBA 107LA 1L88A 1G0PA 237LA 1I6SA 2RBOA 118LA 3F8VA 2OTZX 2RB1X 3C7YA 159LA 2ANVA 3GUPA 1L85A 1L98A 1CV5A 173LA 145LA 1QS5A 150LA 1L16A 1L44A 1G1VA 138LA 231LA 239LA 144LA 3V2WA 1C6IA 3CDVA 2RBPA 1L35A 3V2YA 197LA 1QUHA 244LA 143LA 3SB9A 1L95A 1PQOA 1DYGA 3HTDA 3HU9A 1L63A 238LA 1L18A 4EXMA 1C6FA 4S0WA 169LA 3ODUA 119LA 1CU3A 1QTBA 249LA 2A4TA 4W52A 1D3NA 211LA 3C7ZA 3HDFA 2RH1A 1LWKA 3C8RA 1LGXA 232LA 1QT3A 6LZMA 3HT9A 1L02A 112LA 1LGWA 248LA 1D2YA 174LA 1KNIA 3CDRA 3HH4A 1P36A 3OE8A 1LYJA 4EJ4A 3DN2A 1L24A 242LA 2B6TA 221LA 1G07A 1P2LA 108LA 3GUOA 2RAYX 1L37A 1D3JA 3HDEA 4W54A 1G0QA 3VW7A 3DNAA 139LA 1L97A 3SB5A 4I7PA 1PQJA 163LA 251LA 1SSYA 1CU2A 2OTYX 1LYIA 3NY8A 4YX7C 254LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ZWBA 1NMMA 3A6CY 4EKSA 4ZIXA 131LA 3C83A 192LA 1DKKA 1LOZA 1L83A 213LA 1XGTC 2ANXA 1CKDA 1LZ6A 2ZYCA 2MEDA 1GHLA 4P2EA 2BQIA 4YF2A 1UIHA 5F9XA 1OYUA 1FLYA 4ARMB 3L2XA 4WG1A 4I7RA 3P64A 1QSQA 1LYEA 1P37A 4L41A 4I7TA 1MELL 2MECA 3CSQA 1YL1X 1C6TA 4LT1A 3TXDA 4PPOA 1GE1A 1GB8A 5L9JA 4ET9A 5A3EA 1OUCA 1MLCE 4NGVA 4UWUA 1SX2A 4UWVA 4DAJA 1J1XY 1TEWA 1T3PA 1UIDA 5KXLA 1L00A 3A91A 1LAAA 3F6ZA 3A8ZA 3DMZA 3RZEA 5C6JA 5LA8A 1I56A 4EKRA 7LZMA 1IR8A 4GCEA 2NWDX 4MCKA 1L14A 3FI7A 1BWJA 5E4PA 127LA 3GULA 1G0KA 1C6KA 1LMOA 1LJEA 210LA 4NSIA 1YAOA 1CX6A 4DD3A 2WARA 3LYZA 1LZYA 5FHWA 5HQ1A 1L09A 5KXSA 2IGCA 245LA 1LJFA 4B1AA 2YBJA 4AXTA 5LVJA 1G1WA 2BQHA 4U3XB 1L65A 2LZMA 1WVUA 5I14A 3LZMA 1CVKA 1L59A 4B49A 4AQNA 218LA 3D3DA 2NTHA 4N5RA 1J1OY 7LYZA 1L40A 1HEPA 4PGJB 1LHJA 1L20A 2HEAA 3HH5A 4ARMA 1L70A 1HENA 1C10A 4W51A 1LSPA 1PQKA 4NG8A 180LA 2D4JA 4B4EA 4NEBA 1LZ5A 1L82A 4XJGA 3TXGA 1C46A 1KXYA 3N9EA 1L05A 4WOAA 1GF3A 3OE6A 3CT1A 2LYMA 4I8SA 1CV6A 4ZPUA 4NGWA 1IO5A 1KIRC 228LA 1G7HC 2BLYA 128LA 3GUNA 1LSBA 2F2NA 5B05A 1F6RA 1IIZA 1F0WA 1OV5A 3EMLA 4DDAA 1P56A 1D9WA 1BWHA 1SWZA 262LA 1QTVA 4C5FA 4XJHA 1OUJA 188LA 2B74A 1LSMA 1LSDA 4H8ZA 132LA 3HT6A 1SWYA 3A6BY 1I20A 4KXIA 1BB3A 1C7PA 2QARC 130LA 1LHHA 1EPYA 1LJHA 1LYSA 164LA 4XJDA 1DI4A 1LZGA 2BQKA 3ZEKA 4ANRA 2DQGY 1L11A 5LYZA 1IY3A 1NQIA 1IWUA 3OK0A 5J7CA 1L48A 4KPMA 5B07A 5KXOA 5D5CA 4LDOA 1QTDA 3JR6A 224LA 1LSGA 1L36A 1OUIA 1L79A 4I0CA 2F32A 3P68A 4H8YA 2Z37A 1B5XA 4W53A 4Z41A 1WTHA 5LVGA 3P4ZA 1B7PA 2MEEA 1BVXA 1T8FA 235LA 4N1CC 1IWXA 167LA 1IC5Y 3BKHA 1ZVHL 3AW6A 1CU5A 1CV1A 1C08C 2D4IA 1NHEA 1GF7A 4LYTA 1L69A 4E3UA 3DN4A 2RBNA 1GAZA 1LZBA 3SBAA 1JISA 1CUPA 4CFPA 2O7AA 1JUGA 3CT5A 1XEPA 1LZ4A 1L13A 1L58A 175LA 1XGPC 1L67A 1L80A 4YEOA 3HT7A 170LA 1IP1A 1LYOA 1LMPA 5I53A 1JKCA 186LA 1QS9A 3LYOA 2FBBA 1RCMA 3A90A 1XEJA 1L73A 1L30A 4NSJA 1JKDA 5KXXA 1C66A 4DQ7A 1B7QA 247LA 153LA 1JHLA 2Z2FA 2HEBA 5KXWA 141LA 4GN4A 3AJNA 1QTCA 3N9AA 1GB0A 1L28A 4OWAA 1CU0A 4R6CA 5KXZA 1GF6A 4W55A 259LA 2BQFA 1IWWA 1CKGA 1L68A 1UA6Y 3C8QA 4QGZA 3W3EA 107LA 1IWVA 5EBHA 1YKYX 1LJNA 2Z38A 1QSAA 2HTXA 2LZTA 1EQEA 2ANVA 1IEEA 150LA 1QS5A 1L44A 2DBTA 138LA 4GLVA 144LA 1C6IA 3CDVA 2RBPA 1IP5A 5IELA 1PQOA 1HHLA 4PHIA 1L63A 1VFBC 238LA 1L18A 2YDGA 3IJVA 1XFPL 4TSBA 1DPWA 119LA 249LA 2A4TA 4OWEA 1GBXA 3C7ZA 5APDA 1UICA 4H8XA 2RH1A 2CDSA 3A92A 1LWKA 3C8RA 5DL9A 1XGQC 1RI8B 2IHLA 1B7LA 1GE3A 1KXXA 5DM9A 3P65A 3B6LA 1LYJA 2AUBA 1ZMYL 5FELA 4CJ2A 4EJ4A 2B6TA 3A93A 5KY1A 108LA 3GUOA 4LYOA 2RAYX 2YVBA 1D3JA 4W54A 4HTKA 163LA 1SQ2L 2OTYX 1CU2A 1LZNA 1LYIA 3NY8A 3RW8A 3CT0A 1JTTL 1XSFA 1DYFA 1G7LC 1JJ3A 3SB6A 4I7OA 149LA 2RBQA 2YBMA 1D2WA 1LGUA 1NBYC 1VDQA 1OUGA 2DQIY 1QUTA 4NY5A 4BAFA 1D0KA 3WL2A 4DJHA 1GB3A 3P66A 2I25L 2Z18A 1P2RA 3GUKA 4OOOA 1D0MA 3HUKA 1L34A 1OVHA 2F2QA 1DYDA 1HMLA 1C67A 1CKFA 3CSRA 1B5UA 1L72A 1B7RA 151LA 2Z19A 4CHXA 1L56A 3SB7A 4WM3A 2XBRA 3HU8A 3AZ4A 4ET8A 4GCCA 4NHSA 1FN5A 212LA 5LYTA 1WTMA 214LA 4W94A 3G3XA 3IJUA 4EKQA 1RFPA 196LA 5LAFA 4HP0A 4HJYA 4WM2A 1JQUA 1XJTA 2H9KA 1V7TA 5FSTA 4XN6A 4YENA 5E9RA 2F4GA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2ZWB A;  1NMM A;  3A6C Y;  4EKS A;  4ZIX A;  131L A;  3C83 A;  192L A;  1DKK A;  1LOZ A;  1L83 A;  213L A;  1XGT C;  2ANX A;  1CKD A;  1LZ6 A;  2ZYC A;  2MED A;  1GHL A;  4P2E A;  2BQI A;  4YF2 A;  1UIH A;  5F9X A;  1OYU A;  1FLY A;  4ARM B;  3L2X A;  4WG1 A;  4I7R A;  3P64 A;  1QSQ A;  1LYE A;  1P37 A;  4L41 A;  4I7T A;  1MEL L;  2MEC A;  3CSQ A;  1YL1 X;  1C6T A;  4LT1 A;  3TXD A;  4PPO A;  1GE1 A;  1GB8 A;  5L9J A;  4ET9 A;  5A3E A;  1OUC A;  1MLC E;  4NGV A;  4UWU A;  1SX2 A;  4UWV A;  4DAJ A;  1J1X Y;  1TEW A;  1T3P A;  1UID A;  5KXL A;  1L00 A;  3A91 A;  1LAA A;  3F6Z A;  3A8Z A;  3DMZ A;  3RZE A;  5C6J A;  5LA8 A;  1I56 A;  4EKR A;  7LZM A;  1IR8 A;  4GCE A;  2NWD X;  4MCK A;  1L14 A;  3FI7 A;  1BWJ A;  5E4P A;  127L A;  3GUL A;  1G0K A;  1C6K A;  1LMO A;  1LJE A;  210L A;  4NSI A;  1YAO A;  1CX6 A;  4DD3 A;  2WAR A;  3LYZ A;  1LZY A;  5FHW A;  5HQ1 A;  1L09 A;  5KXS A;  2IGC A;  245L A;  1LJF A;  4B1A A;  2YBJ A;  4AXT A;  5LVJ A;  1G1W A;  2BQH A;  4U3X B;  1L65 A;  2LZM A;  1WVU A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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