3L64A

T4 lysozyme s44e/wt*
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKEELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Determination of alpha-helix propensity within the context of a folded protein. Sites 44 and 131 in bacteriophage T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 59
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2009-12-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3l64A00
1L18A 1D9WA 1L79A 1LYFA 1P2RA 157LA 1L22A 4W56A 1L67A 228LA 1LYEA 1L83A 1CU5A 1G0LA 2B7XA 114LA 188LA 3HU8A 180LA 224LA 1L51A 1ZURA 1P6YA 1L72A 1T8AA 3HTGA 184LA 1L68A 1KY1A 3DMZA 3GUPA 1JQUA 1L31A 1SX7A 2CUUA 3RZEA 1CTWA 1LI6A 3NY9A 1L49A 1CV1A 3V2YA 3PDSA 166LA 1L25A 119LA 3UONA 2Q9EA 239LA 3DN2A 4LDOA 183LA 1G07A 2QARC 1OWYA 2IGCA 167LA 1DYFA 1L03A 3HUKA 4I7NA 4W52A 4S0WA 142LA 3OE6A 4ARMA 1L30A 3HH5A 170LA 2OE7X 1KW7A 187LA 3HT7A 3HWLA 1L32A 1L64A 1L65A 4EJ4A 111LA 2OU0X 1L69A 1L28A 1C6PA 244LA 1CVKA 1C69A 3NY8A 4DAJA 1C6QA 4W59A 2OE4X 246LA 3CDVA 1C64A 4GRVA 1L66A 1QUGA 199LA 1L46A 126LA 4K5YA 102LA 2B75A 1P36A 4PJZA 1L37A 4GBRB 1L96A 4I7TA 1L01A 4W51A 110LA 1JTMA 1L09A 1LYIA 1QUDA 2RBOA 5LZMA 4LDEA 3DNAA 109LA 149LA 3DN8A 2QB0B 2NTHA 3GUIA 108LA 251LA 3RUNA 3F8VA 3HT6A 1P2LA 1K28A 1L52A 1L44A 3HUQA 1T8FA 145LA 2OE9X 186LA 4ARQB 1DYEA 1L91A 217LA 118LA 1L92A 1L38A 1L57A 214LA 1LGUA 1LYDA 1L10A 1L82A 1L60A 1L94A 1L11A 250LA 3OE9A 1L89A 1OYUA 1T97A 1QSBA 1SSYA 3GUNA 4I7SA 152LA 3L64A 3OE0A 2RBNA 236LA 1C6JA 4OO9A 4W58A 1C65A 1L93A 1P64A 1C6FA 1QTDA 1L59A 1T8GA 240LA 137LA 3CDTA 162LA 1D3NA 231LA 3C8SA 161LA 1SWZA 1L19A 2RBQA 2HULA 112LA 113LA 3G3WA 3GUKA 1CV3A 247LA 241LA 1G0KA 4I7JA 103LA 3C80A 175LA 216LA 1OWZA 1C63A 233LA 225LA 2LZMA 209LA 1L17A 248LA 178LA 259LA 130LA 4ARQA 1LYJA 1L39A 1L45A 3D4SA 3C82A 1SSWA 1C6KA 3HH6A 4ARPA 1LGWA 1L87A 4EKPA 1L61A 4EKQA 1I6SA 220LA 1L56A 230LA 2OU8A 2L78A 3C7ZA 4ARLA 1CV6A 3PBLA 1LWKA 2B6ZA 191LA 1C6TA 4I7OA 1QT5A 3V2WA 1C60A 3F9LA 3GULA 4W53A 168LA 3C7YA 3DMXA 198LA 1L08A 1D2YA 1L75A 212LA 2B74A 234LA 171LA 1L23A 254LA 4EPFA 3GUMA 3SB8A 140LA 2O79A 226LA 3HH3A 4I7QA 1LYHA 2Z6BA 1T6HA 1KNIA 3DN1A 2B6WA 190LA 196LA 120LA 1QSQA 169LA 1QTBA 1L43A 146LA 1L97A 235LA 1DYDA 1L36A 2RH1A 3DN6A 1D2WA 1C6IA 3K2RA 4LZMA 1D3FA 3SB5A 1L20A 218LA 3DMVA 3G3XA 3L2XA 1C68A 1L05A 4EXMA 195LA 1LYGA 3CDQA 1L00A 1P37A 1G1VA 1L74A 1SWYA 223LA 1C6GA 1L54A 1C6EA 3HTFA 2OTZX 256LA 2RBRA 2F2QA 158LA 3C83A 1D3JA 1XJUA 1L47A 159LA 4IAPA 104LA 1C6LA 1L99A 1QUOA 3ODUA 1C62A 3C7WA 221LA 1L85A 2RAYX 1L81A 1LPYA 1C6DA 1LLHA 1L53A 1OVJA 237LA 1TLAA 3SB9A 4YX7C 1G0JA 148LE 1QT4A 1L26A 1LI3A 1PQMA 1L48A 227LA 1L80A 4W55A 3JR6A 255LA 6LZMA 3HU9A 174LA 258LA 1L07A 262LA 3CDOA 185LA 1L95A 1LI2A 123LA 156LA 138LA 1C6HA 1LWGA 173LA 4LDLA 1L24A 3GUOA 2ANVA 3HUAA 1L76A 4DKLA 1PQKA 1L86A 127LA 1L06A 1L73A 2O4WA 2RAZX 3HT8A 3DKEX 1QT8A 3EMLA 4EKRA 4I7LA 1QTZA 2OEAX 2OU9A 2OTYX 2F47A 1L40A 1L29A 1QTHA 1L02A 1L41A 211LA 260LA 1CUPA 143LA 1L98A 2HUMA 4ARMB 1C6AA 3SB7A 176LA 160LA 2B72A 1L42A 1G0PA 1CX6A 1KY0A 1C66A 1L13A 1L12A 1L0KA 215LA 3SN6R 3FI5A 3HT9A 2ANXA 3HTDA 4DJHA 238LA 1NHBA 1P56A 1SX2A 3NYAA 4ARJA 1QT6A 222LA 3DN3A 3LZMA 122LA 4YXAC 3C8QA 1C61A 210LA 1WTHA 1G0MA 1CU0A 1C6NA 1L27A 1P46A 2B6TA 3HTBA 213LA 4AQNA 3QAKA 1JTNA 197LA 252LA 1LW9A 3CDRA 1L50A 3VW7A 232LA 243LA 1EPYA 1L58A 1D3MA 1L71A 1L15A 1G06A 1L16A 2LCBA 3FADA 1C6BA 1KS3A 4PK0A 1C67A 150LA 1OVHA 2B6YA 5I14A 139LA 3HDFA 229LA 144LA 1L35A 1CU3A 2B6XA 1L90A 1DYCA 164LA 2F32A 1OV5A 1L77A 1XJTA 177LA 4ZPUA 3SB6A 189LA 1L14A 1PQOA 1QS9A 2A4TA 172LA 182LA 249LA 163LA 181LA 219LA 7LZMA 1L04A 1B6IA 1CUQA 1P7SA 1CU6A 4E97A 3FA0A 1ZYTA 3C81A 4I7MA 4I7PA 1L33A 3OE8A 2RBSA 1QUHA 261LA 2HUKA 141LA 2O7AA 3SBAA 1G1WA 1L63A 1PQIA 257LA 1G0QA 1L34A 2NTGA 1LGXA 1ZWNA 1QTCA 1L62A 4W54A 1QT3A 4W57A 1KW5A 2RBPA 1CU2A 2RB1X 1P5CA 1C6MA 115LA 1CV4A 1L84A 245LA 1L55A 1C6CA 1CV5A 1XEPA 3GUJA 253LA 3C8RA 3SBBC 1PQJA 192LA 128LA 125LA 3G3VA 1QS5A 1QTVA 1DYGA 1L0JA 2B70A 151LA 2RB2X 165LA 2B73A 1L70A 205LA 107LA 3HDEA 1P3NA 1CV0A 1G0GA 1L88A 1OVKA 1L21A 147LA 2LC9A 4I7KA 2Q9DA 4EPIA 155LA 1DYBA 242LA 3DN4A 200LA 131LA 4EKSA 3HH4A 1OV7A 4I7RA 3DN0A 206LA 201LA 1DYAA 1CX7A 4YXCA 2RB0X 1PQDA 129LA 1QT7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5ILFA 4LFXA 1B5YA 1GF5A 3TMWA 1BVKC 5L9JA 1DQJC 1LYEA 4H9HA 1CU5A 2B7XA 5C6LA 4H9FA 3ZVQB 5FDJA 1LZ4A 5B1GA 5KJ9A 224LA 1LMTA 1AZFA 3WU8A 1L72A 4CJ2A 1L68A 1KY1A 1GDWA 3GUPA 3DMZA 2D4IA 2HEBA 2XQOA 2C8OA 3AW7A 3NY9A 5M1YA 2BQOA 3V2YA 3UONA 3A6CY 2Q9EA 3P4ZA 4WM2A 4B1AA 1G07A 2C8PA 1H87A 2IGCA 4I7NA 2MEHA 4S0WA 1JJ0A 3HH5A 3WW5A 2OE7X 1KW7A 1ALCA 1VAUA 1LKSA 4YEMA 4Z3MA 1LZSA 111LA 2OU0X 1L28A 4OW1A 4U3XB 1KXXA 2BQLA 1LJGA 1C6QA 3CDVA 1L46A 2G4PA 4K5YA 102LA 4ETDA 1L37A 4GBRB 5KKJA 1UCOA 5LZMA 5LYMA 1IWYA 149LA 1IX0A 1LJJA 1OUCA 5IDDA 2NTHA 3TXDA 2YBMA 2YBHA 3LN2A 3IJUA 4LYBA 3HT6A 1L52A 1IP3A 3A34A 3HUQA 1GBXA 1GF6A 3GXKA 1L91A 118LA 1L57A 1LGUA 1L60A 1L94A 1BGIA 1BB3A 2F2NA 1T97A 6LYTA 1QSBA 3HFMY 1N4FA 152LA 1GBSA 4KXIA 1HEPA 3AGHA 1B7PA 2FBBA 4LT1A 1C65A 1L93A 1L59A 4KT3A 1B7LA 112LA 5F81A 1UIGA 1BWJA 3G3WA 3GUKA 1CV3A 103LA 3C80A 175LA 216LA 5LVIA 2DQGY 1GFRA 259LA 1LOZA 2VB1A 4H9BA 1LMQA 1BQLY 1B0DA 5C6JA 1LZBA 1L61A 133LA 1HFXA 1XGPC 2Z18A 4DWXA 1JITA 4L41A 1CKDA 1LJFA 5KXXA 1CV6A 1J1XY 191LA 4NGOA 3A94A 4QEQA 2Z2FA 1BVXA 3V2WA 3B72A 1YL0X 3GULA 1GE2A 2F4GA 2MEEA 1VFBC 208LA 3TXGA 3AJNA 234LA 1L23A 254LA 4EPFA 4G49A 3EMSA 140LA 5KKIA 1LSDA 4RW2A 4RDSA 3HH3A 5B59A 1JHLA 2Z6BA 3DN1A 3QNGA 1TCYA 1QUTA 5LVHA 1C6IA 4LZMA 1L20A 2CGIA 1IWXA 218LA 3DMVA 2FYDA 4P2EA 1C68A 1HNLA 1L74A 223LA 2MEFA 1DI5A 3A6BY 2FBDA 1GB0A 158LA 2F2QA 4XJGA 4XN6A 3TXKA 2DQEY 3ODUA 2LZTA 3C7WA 2DQHY 221LA 4N1CC 2RAYX 1C6DA 237LA 4YX7C 1G0JA 1QTEA 1L26A 1DKJA 3CT0A 227LA 2YDGA 3JR6A 255LA 3P65A 4NSJA 1C45A 4DYGA 1VDPA 258LA 3A95A 1IVMA 3G3AB 1L07A 4GN3A 185LA 1L95A 1LI2A 5HLLA 1LMNA 1F6RA 3WXTA 156LA 3K3TA 3HUAA 1L76A 1DPWA 1OUDA 2YBNA 3CT5A 1B7NA 127LA 1L73A 2RAZX 3HT8A 3EO5A 1REXA 4H9CA 4HTKA 5LA8A 4HPEA 3EBAB 4LYZA 1LJEA 4EKRA 2BQFA 1UC0A 2OTYX 4AGAA 1IWVA 1IP1A 1L41A 260LA 4KPMA 4WLTA 1CUPA 2DQCY 5KXTA 4ARMB 4KL7A 2B72A 3A90A 1G0PA 1CX6A 4GCFA 1ZMYL 4OOOA 1L0KA 2DKVA 1GE0A 1JJ3A 4D9ZA 1DZBX 215LA 4B49A 1GWDA 1KXYA 3FI5A 4LYOA 4B0DA 4UWUA 1JPOA 5KXSA 1YAMA 4H9IA 238LA 4LT2A 4WLYA 1P56A 2W1XA 3NYAA 3LZMA 3DN3A 1G7LC 1CJ9A 5KXLA 1LHMA 1IC7Y 4LGKA 1WTHA 4NGJA 1G0MA 1HERA 1V7TA 1UA6Y 4AQNA 197LA 4B4EA 4LYCA 4H93A 1L50A 5JENB 1RCMA 4HTQA 2Y8PA 1D3MA 4NWHA 2HECA 1L16A 3FADA 1GAZA 1KS3A 2H9KA 4PK0A 3FI7A 150LA 5B1FA 139LA 229LA 1L35A 1CU3A 4II8A 1DYCA 4WM5A 5EBHA 3SB6A 1LTMA 1WTNA 1ZVYB 1FBIX 1TEWA 2BQBA 182LA 4H1PA 1TAYA 2HTXA 3A3RX 4E97A 3FA0A 3C81A 1GF8A 3OE8A 4M4OA 2F30A 1FLWA 1C10A 2HEAA 2O7AA 3MGWA 1PQIA 2NTGA 1ZWNA 2BPUA 4H8YA 2RBPA 2ZYCA 2HEEA 1B7SA 192LA 3IWRA 1QS5A 1EL1A 2RB2X 2D6BA 4FJRA 4GCDA 1G0GA 4ETAA 3WPLA 4I7KA 1DXJA 2Q9DA 3CSRA 1YKYX 242LA 4EKSA 131LA 1LHHA 4DD2A 4Z46A 3DN0A 5FELA 4H90A 1BWIA 4NY5A 129LA 4G4CA 1LYFA 5LVGA 157LA 1L22A 4J7VA 4TX7A 1LZ1A 1L83A 1G0LA 1LJIA 4EMNA 4TSBA 5B05A 1KIPC 4LYMA 1FLQA 2W1LA 4M6DA 1LJHA 5LAGA 2N5ZA 1GF0A 1NF5A 2CUUA 1B5UA 1MELL 1LI6A 1L49A 1CV1A 1L25A 5APFA 4WM1A 2QARC 3WUAA 1ZVHL 3QY4A 1L30A 1B7QA 1JISA 170LA 1IY4A 4NHPA 1DKKA 1G7IC 4BS7A 2A7DA 4QGZA 1C6PA 1CKHA 4H92A 4GLAA 1C69A 5APEA 3ZVQA 2HU3A 1HEQA 246LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5ILF A;  4LFX A;  1B5Y A;  1GF5 A;  3TMW A;  1BVK C;  5L9J A;  1DQJ C;  1LYE A;  4H9H A;  1CU5 A;  2B7X A;  5C6L A;  4H9F A;  3ZVQ B;  5FDJ A;  1LZ4 A;  5B1G A;  5KJ9 A;  224L A;  1LMT A;  1AZF A;  3WU8 A;  1L72 A;  4CJ2 A;  1L68 A;  1KY1 A;  1GDW A;  3GUP A;  3DMZ A;  2D4I A;  2HEB A;  2XQO A;  2C8O A;  3AW7 A;  3NY9 A;  5M1Y A;  2BQO A;  3V2Y A;  3UON A;  3A6C Y;  2Q9E A;  3P4Z A;  4WM2 A;  4B1A A;  1G07 A;  2C8P A;  1H87 A;  2IGC A;  4I7N A;  2MEH A;  4S0W A;  1JJ0 A;  3HH5 A;  3WW5 A;  2OE7 X;  1KW7 A;  1ALC A;  1VAU A;  1LKS A;  4YEM A;  4Z3M A;  1LZS A;  111L A;  2OU0 X;  1L28 A;  4OW1 A;  4U3X B;  1KXX A;  2BQL A;  1LJG A;  1C6Q A;  3CDV A;  1L46 A;  2G4P A;  4K5Y A;  102L A;  4ETD A;  1L37 A;  4GBR B;  5KKJ A;  1UCO A;  5LZM A;  5LYM A;  1IWY A;  149L A;  1IX0 A;  1LJJ A;  1OUC A;  5IDD A;  2NTH A;  3TXD A;  2YBM A;  2YBH A;  3LN2 A;  3IJU A;  4LYB A;  3HT6 A;  1L52 A;  1IP3 A;  3A34 A;  3HUQ A;  1GBX A;  1GF6 A;  3GXK A;  1L91 A;  118L A;  1L57 A;  1LGU A;  1L60 A;  1L94 A;  1BGI A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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