3OJPA

D52n mutant of hen egg white lysozyme (hewl)
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTNYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Gallus gallus
publication title D52N Mutant of Hen Egg White Lysozyme (HEWL)
rcsb
molecule keywords Lysozyme C
total genus 46
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2010-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3ojpA00
4W94A 1N4FA 1TEWA 5IELA 4MR1A 2MEGA 1V7TA 3AZ5A 1I56A 1RE2A 1IP5A 4UWVA 4HV1A 1JISA 1KXYA 4XYYA 3W6EA 4W96A 2MEAA 1OUGA 3N9CA 2CDSA 4NSJA 1HFXA 3FI7A 3AZ7A 2CJLA 2W1LA 3AZ6A 3M18B 4DDCA 1GF5A 1LHIA 4HP0A 4TWSA 4DD0A 5KXLA 5L9JA 4D9ZA 5I4WA 3QY4A 3TXEA 3RT5X 1WVUA 4PJ2C 1GWDA 3WXTA 4NGLA 3EMSA 5LVHA 3A90A 4MCKA 1GFVA 3AW6A 1LSGA 1HEWA 5LA5A 5M1YA 1G7LC 1LSNA 1UBZA 3AGHA 2ZIKA 1IP6A 4C3WA 4LT1A 2Z39A 2F2NA 1JKCA 3RNXA 1D0KA 5ILCA 1IP3A 3B0IA 4BAPA 4HJVA 1NBYC 1B5YA 2C8PA 1NDGC 2IHLA 3CQLA 4NWHA 5DLAA 1B5ZA 1I20A 3TMVA 1FLUA 1HMKA 1NQIA 3OK0A 5B1FA 1IWTA 1QDTA 4WL7A 4J0LA 5KXKA 1JSFA 1LMOA 1IO5A 1OUCA 4G4HA 4KT3A 1LYYA 3WW5A 3WPKA 1B5WA 2D4IA 2MEEA 1HEMA 4GLVA 1WTMA 1XGRC 4YOPA 1LJ3A 1B7QA 1UIEA 3EBAB 4KXIA 1IR9A 5KXYA 1GDXA 1LTMA 3WVXA 1JTPL 1LZCA 3WUNA 5C6LA 1RCMA 4NY5A 3A6CY 3CSQA 1GB2A 4NGJA 5FDJA 5KXWA 4XJGA 1GE0A 2HUBA 5FSTA 5D5CA 2DQEY 1GF9A 1LZSA 3LYZA 4L41A 3GXKA 1IOCA 1WQPA 2DQFC 1DQJC 4E3UA 3BKHA 4NG8A 1G7IC 4OWBA 4NGZA 4TUNA 1LJFA 3D9AC 3QNGA 1ZVYB 4H8ZA 4OWAA 1VDQA 1B5VA 1HNLA 2BQDA 4H9CA 5B59A 1CNSA 2BQBA 1DPWA 4H8YA 2HTXA 4FJRA 5HQ1A 2ZNWY 2CWIA 2A7FA 5DN5A 4GCBA 2DKVA 2LZ2A 2LYZA 5J7CA 4GCFA 2IFFY 3ATOA 4NHSA 1DKJA 1YL0X 4G9SA 4UWUA 4LYOA 5FHWA 1LSYA 1UCOA 3A67Y 1YL1X 1KIRC 1ALCA 4PRUA 1G7JC 1YAPA 1IY3A 5F14A 1LKRA 1GB9A 1FKQA 1LZ1A 1AT6A 1GB0A 1A4VA 3GXRA 3TXKA 2BQEA 4ETCA 1HC0A 1I1ZA 5LVJA 4RLNA 1REMA 1YAMA 2D6BA 4ET8A 3LYOA 3LYMA 3WXUA 2FBDA 4OOTA 1H6MA 2I6ZA 1A2YC 1GF7A 3WUAA 3LYTA 5DN4A 1UC0A 5LIOA 1E8LA 5DL9A 1QTEA 4XADA 3WVYA 4DC4A 3W6BA 1LHMA 5APDA 5KXNA 1BB7A 5K7OA 1GFGA 2NWDX 1CKDA 2XJWA 2LYOA 2CGIA 2D91A 3W6DA 4B4IA 2DQAA 1SLYA 1GDWA 1DI4A 3IJUA 4HSFA 2YDGA 1GEVA 5A3EA 1JJ3A 5LXWA 2LHMA 2Y8PA 4ETEA 2GV0A 3AGGG 5LYZA 5HLLA 4O34A 1JITA 2BQJA 1IP7A 1HMLA 1GXV2 1LSDA 4PHIA 4DD9A 1IIZA 4TSBA 2Z2FA 2EKSC 3P66A 3ZVQA 4YEMA 1YQVY 1XGQC 4YEOA 1MLCE 1BVKC 1OQMA 5KXZA 1GFKA 1HENA 3LZ2A 4RW1A 1VDSA 2FBBA 1IP1A 5HNLA 4PGJB 1IORA 1WTNA 1VEDA 1LJGA 2FYDA 4GN5C 4XJDA 1GFAA 4H94A 1SQ2L 1LHLA 1LZ6A 4H9EA 1GFJA 1OUJA 2BQAA 4UWNA 4WMGA 3TXJA 4NHQA 3TXIA 4NSGA 2X0AA 4WM1A 1QDRA 1O23A 3N9AA 3ULRA 2BQOA 1WQNA 3P68A 4LYBA 4ET9A 1LSAA 5I4YA 1WVVA 2MEFA 1FBIX 207LA 3J6KA 4WLXA 3A34A 1YAQA 1GB6A 1HFZA 1FLYA 1UIDA 5IDDA 4NGIA 1JKBA 1GXXA 1LZAA 1YKXX 3P65A 4GLAA 5LAFA 1GF6A 4XJFA 2H9JA 1LZ5A 1JTTL 1ZMYL 3TXDA 2Z2EA 5KXRA 1GE4A 1W6ZA 1DZBX 1BB5A 1YROA 1REXA 2XTHA 5LVIA 4ML7A 2F4GA 4DD2A 3P64A 1BVXA 1WQQA 4ETAA 1GB7A 1OUBA 1GE2A 1LJJA 2BQKA 2Z38A 5KXSA 4X3BA 5KXTA 3ATNA 1XGPC 1B2KA 2BQFA 3CSRA 2G4PA 4LT3A 5D5FA 4HTKA 1D9UA 3CT5A 4NHPA 4EOFA 4OOOA 4R6CA 1WQMA 4Z46A 4ETBA 1IR7A 1UA6Y 5FELA 3EXDA 1QUTA 1JJ0A 4NHTA 1BGIA 1BB3A 2YBLA 1LJKA 1VAUA 1B7SA 4G49A 1JUGA 3CSZA 4G4BA 1UIBA 3FE0A 4HPIA 5APCA 5LAGA 3WYHA 1JPOA 5E4PA 1IP2A 3M3UA 3W6AA 3WU8A 1QSWA 1DI5A 1C08C 4ANRA 1F0WA 4CFPA 4LYCA 1UACY 1LZGA 2N5ZA 5I53A 4B49A 3HBEX 2DQIY 1LSEA 1LJIA 4NGKA 1P2CC 4Z41A 2LYMA 3AYQA 1UIGA 4NIJA 1LCNA 1DPXA 1MELL 5LINA 1DXJA 1GHLA 1IWVA 4B4EA 1HEOA 4YM8A 153LA 2ZNXY 4DYGA 1LJNA 4DD1A 1LKSA 3TXHA 1LHJA 4RLMA 4Z98A 4N1CC 4NG1A 1WQRA 3IWRA 1IC7Y 2I25L 1T3PA 4WG1A 4ZIXA 1GE3A 4AGAA 1GB3A 4WOAA 1UIHA 3A95A 3SP3A 4GCDA 1HHLA 3AB6A 5KXMA 1NF5A 3CT1A 4H93A 3N9EA 4OWCA 2BLYA 1IVMA 1YILA 1JJ1A 135LA 3A8ZA 1LZDA 1LPIA 3G3BB 1FN5A 2BQCA 2HEFA 2VB1A 2ZQ4A 3WU9A 1LZYA 1UIAA 2EIZC 5I4XA 1QSAA 4BS7A 1AZFA 1J1OY 1UIFA 4WLDA 5I5QA 5F9UA 4WM6A 1INUA 2HU1A 2YBIA 5JENB 1LSCA 1GEZA 1CJ7A 1UICA 4XJIA 1B7MA 3LZTA 1KIQC 4J1AA 1RJCB 1GBOA 4NFVA 1LZRA 4C5FA 1TDYA 3TMUA 1LHKA 1IC5Y 1LYSA 4H9BA 3T6UA 4H8XA 1LJHA 2BQIA 2HEDA 1F6RA 2W1XA 3F6ZA 1DI3A 1KXXA 1HF4A 1OUHA 1LYOA 2HU3A 4H9IA 4MSTA 4NGOA 1GD6A 2BQLA 4N1EI 3ZEKA 4ZFPA 4XJBA 1YAOA 1PS5A 2DQJY 1XGTC 1VFBC 4DD3A 4II8A 2BQNA 4NWEA 6LYTA 4M4OA 4H1PA 1GBSA 1JTOL 2ZIJA 1OUEA 4WO9A 4KL7A 3EO5A 4LT0A 4DDAA 5LA8A 1NBZC 2HEEA 4N5RA 5KXXA 2BPUA 1AM7A 1KIPC 2HECA 1NMMA 4H9HA 4H9AA 5KJ9A 1GBXA 4QDNA 5ILFA 4IATA 6LYZA 4NEBA 1GE1A 3RZ4A 3A6BY 1GAYA 2FYCA 3B6LA 1C7PA 1LSMA 2YBJA 9LYZA 1EQ5A 2C8OA 3HBDA 2MEBA 1IOTA 4A7DA 1C46A 1GB8A 1AT5A 1B7RA 5A3ZA 3HFMY 2H9KA 5C6IA 4XJHA 3TMWA 1VATA 1J1XY 3KAMA 5LVGA 1IWWA 8LYZA 5LYMA 1CKGA 4HV2A 1XEKA 1JKDA 4CJ2A 4H91A 2H5ZA 1H87A 1LJEA 1EQ4A 3RW8A 3TMXA 1HFYA 4QY9A 5HMJA 1FKVA 1QUSA 1GBYA 2F4AA 1IWYA 1D0LA 4P2EA 3TXGA 3AJNA 1YKZX 1OUAA 1GF8A 4GN4A 1FLWA 1G7HC 1TAYA 5B07A 1GAZA 3OJPA 4EMNA 3G3AB 4WM5A 1YANA 3HBHA 1OUIA 1LAAA 1LZTA 5HNCA 1F10A 1VDTA 4R0FA 1D6PA 5KXPA 1BWJA 4HPEA 4TSCA 4ZEEA 4YF2A 5KXOA 1LMNA 1OUDA 1FLQA 4WO6A 1JHLA 1QQYA 2ZILA 3ZVQB 1B0DA 4WL6A 1HEPA 1LHHA 4B1AA 3E3DA 2HEAA 2LZTA 4IJ4A 3K3TA 1GFRA 1GPQC 2W1MA 4PRQA 5LVKA 2YBHA 3CT0A 5KY1A 1BWIA 1AKIA 1EQEA 1HEQA 3B72A 2B5ZA 4J1BA 4OWEA 4J7VA 2YBNA 5II3A 1B9OA 1JWRA 3BKVA 1XEIA 134LA 3J4GA 1HERA 2Z12A 3A93A 4I0CA 4OWHA 5L3HA 4DDBA 5B1GA 1W08A 1IC4Y 2BAAA 4LZTA 1LYZA 4OW1A 1RI8B 5IHGA 4I8SA 1VDPA 4RW2A 4GCCA 1B7NA 1GFTA 2Z37A 4LFXA 2Z19A 4WM4A 4N9RA 4BAFA 2MECA 1JEFA 1NKHA 1B7PA 4LT2A 1IR8A 1QTKA 2DBTA 2BQGA 1IOQA 1LZEA 3CB7A 3D3DA 4NSIA 3WL2A 5KKJA 1XGUC 4NHIA 2ZWBA 1OP9B 3WMKA 1LZNA 2ZYCA 5F16A 1D0MA 1LMQA 1WQOA 3WPJA 4KPMA 1NWGA 4WLTA 5B05A 1TBYA 1HSWA 1B5XA 1TCYA 2Q0MX 2HEBA 1LOZA 1V7SA 4NGWA 4ETDA 5B06A 4HTQA 4CHXA 4N8ZA 1XEJA 1J1PY 4BADA 5APEA 1C45A 2MEIA 5AMYA 1GBZA 5LYTA 1CJ8A 3WULA 154LA 3A91A 1T6VL 4HJYA 1Z55A 193LA 2WARA 4TTDA 4XENA 5E9RA 1LZ8A 208LA 2MEDA 2BLXA 2Z18A 4HJZA 5EBHA 1LMCA 1IWXA 4LYZA 2PC2A 4U3XB 1YKYX 2D4JA 3A3RX 1IOSA 1LMPA 1BWHA 4WG7A 4FDYA 3VWOA 4IASA 1GF4A 2EPEA 2AUBA 4TX7A 1IP4A 2A7DA 2DQGY 1B5UA 4B0DA 2RSCA 1D6QA 1HELA 4AXTA 1GBWA 3WW6A 7LYZA 1CKCA 5KKIA 3IJVA 5HMVA 1JSEA 5L3IA 1REZA 4HTNA 3B0OA 2DQCY 4NGYA 3W6FA 1CKHA 2MEHA 1B7LA 4WLYA 3W3EA 4LFPA 1LSPA 3P4ZA 1B7OA 4NGVA 2YSSC 4Z3MA 1UUZC 2I26L 2G4QA 132LA 1GB5A 1LMAA 1LMTA 1ZV5L 4CFOA 1G7MC 4XN6A 4WM2A 1C10A 3WUMA 5C6JA 3A3QA 5F81A 4B4JA 1XFPL 2EQLA 2XBRA 1DKKA 4LYMA 1GFHA 5FCPA 1LZ4A 1KXWA 3QE8A 2YBMA 4GCEA 4DD7A 1GF0A 4N0JA 3T36A 1IY4A 3TXFA 4H9FA 1BQLY 1ZVHL 4PPOA 3AZ4A 3RU5A 4DWXA 1IEEA 1LSBA 1QIOA 1GFUA 1JKAA 1BB6A 1YIKA 2XBSA 3A94A 4CGEA 4GN3A 3AGIA 4QGZA 3W6CA 1IWZA 2ZYPA 1CJ6A 1REYA 1FDLY 3LHMA 4H90A 3TXBA 1NDMC 1RFPA 2G4NA 3A92A 4LGKA 133LA 4WM3A 3WH1A 3A96A 1F6SA 194LA 2BQHA 4YENA 5DM9A 1CJ9A 1CKFA 3AW7A 1IWUA 1LSFA 2DQDY 1GF3A 2YVBA 1JIYA 1PZYA 1BB4A 4M6DA 1BHZA 1EL1A 5FEKA 1OUFA 5APFA 3B0KA 1NHEA 2D4KA 1LJ4A 3MGWA 4LYTA 4QEQA 2ZQ3A 1GFEA 1LZBA 5T3FA 4RDSA 4G4CA 1LSZA 2F30A 4DT3A 2W1YA 3LN2A 1HSXA 4H92A 5I54A 5F9XA 1XSFA 2DQHY 1C43A 3WPLA 2BQMA 4NSHA 1IX0A 1LZ9A 3WU7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
214LA 5IELA 4MR1A 1V7TA 3AZ5A 1I56A 1RE2A 3F9LA 4UWVA 228LA 3N9CA 4DDCA 4W58A 5L9JA 5I4WA 3TXEA 4NGLA 3A90A 2B75A 5M1YA 1G7LC 1QTCA 3AGHA 1L38A 2Z39A 1QT4A 3C81A 1IP3A 1KY1A 1NBYC 1NDGC 126LA 4NWHA 1HMKA 159LA 1L13A 4WL7A 1IO5A 1LYYA 1B5WA 2D4IA 2MEEA 4GLVA 1WTMA 4YOPA 191LA 3EBAB 1IR9A 162LA 1LTMA 3WVXA 3WUNA 4NY5A 103LA 5FDJA 5D5CA 4IAPA 4YXAC 3GXKA 2DQFC 1G7IC 4OWBA 1LJFA 1ZVYB 4H8ZA 1VDQA 2BQDA 2BQBA 4H8YA 2HTXA 205LA 4I7PA 2O79A 5HQ1A 2CWIA 152LA 2A7FA 5DN5A 4GCBA 2LYZA 1ZURA 3ATOA 1YL0X 1UCOA 1YL1X 4PRUA 4ETCA 1GB0A 1A4VA 3GXRA 4RLNA 1REMA 1YAMA 2B6WA 3LYOA 2FBDA 1H6MA 4I7NA 253LA 5DN4A 5LIOA 1E8LA 1QTEA 1L04A 4XADA 216LA 4DC4A 3W6BA 5APDA 1L70A 143LA 5K7OA 1CKDA 4B4IA 4HSFA 1DI4A 1P3NA 4ARQA 1EPYA 1JJ3A 1L61A 4LDLA 1JITA 1T6HA 2BQJA 3HUAA 1GXV2 4PHIA 125LA 4TSBA 4YEMA 4C5FA 1XGQC 190LA 4GN5C 1VEDA 1GFAA 4H9EA 3TXJA 4NHQA 1QDRA 3ULRA 1L84A 2BQOA 4ET9A 3P68A 1LSAA 1WVVA 3A34A 1YAQA 1JQUA 1L55A 4GRVA 4XJFA 1W6ZA 2F4GA 1L68A 1SX2A 2Z38A 5D5FA 1D9UA 3CT5A 4NHPA 4R6CA 1IR7A 1UA6Y 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4W94 A;  1N4F A;  1TEW A;  5IEL A;  4MR1 A;  2MEG A;  1V7T A;  3AZ5 A;  1I56 A;  1RE2 A;  1IP5 A;  4UWV A;  4HV1 A;  1JIS A;  1KXY A;  4XYY A;  3W6E A;  4W96 A;  2MEA A;  1OUG A;  3N9C A;  2CDS A;  4NSJ A;  1HFX A;  3FI7 A;  3AZ7 A;  2CJL A;  2W1L A;  3AZ6 A;  3M18 B;  4DDC A;  1GF5 A;  1LHI A;  4HP0 A;  4TWS A;  4DD0 A;  5KXL A;  5L9J A;  4D9Z A;  5I4W A;  3QY4 A;  3TXE A;  3RT5 X;  1WVU A;  4PJ2 C;  1GWD A;  3WXT A;  4NGL A;  3EMS A;  5LVH A;  3A90 A;  4MCK A;  1GFV A;  3AW6 A;  1LSG A;  1HEW A;  5LA5 A;  5M1Y A;  1G7L C;  1LSN A;  1UBZ A;  3AGH A;  2ZIK A;  1IP6 A;  4C3W A;  4LT1 A;  2Z39 A;  2F2N A;  1JKC A;  3RNX A;  1D0K A;  5ILC A;  1IP3 A;  3B0I A;  4BAP A;  4HJV A;  1NBY C;  1B5Y A;  2C8P A;  1NDG C;  2IHL A;  3CQL A;  4NWH A;  5DLA A;  1B5Z A;  1I20 A;  3TMV A;  1FLU A;  1HMK A;  1NQI A;  3OK0 A;  5B1F A;  1IWT A;  1QDT A;  4WL7 A;  4J0L A;  5KXK A;  1JSF A;  1LMO A;  1IO5 A;  1OUC A;  4G4H A;  4KT3 A;  1LYY A;  3WW5 A;  3WPK A;  1B5W A;  2D4I A;  2MEE A;  1HEM A;  4GLV A;  1WTM A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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