3OK0A

E35a mutant of hen egg white lysozyme (hewl)
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFASNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title E35A Mutant of Hen Egg White Lysozyme (HEWL)
rcsb
molecule keywords Lysozyme C
molecule tags Hydrolase
source organism Gallus gallus
total genus 46
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2010-08-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3ok0A00
1B7RA 1KXYA 2ZIKA 2RSCA 1EQEA 1REYA 4WM6A 2F4GA 3W6AA 1LZ9A 1XGPC 1LSGA 4H9HA 4PPOA 1GB8A 1JTTL 1BB5A 3WPKA 4XYYA 1CKHA 5AMYA 4DD0A 4NY5A 4H9EA 1BVKC 5LYTA 1LHHA 1GFRA 5HQ1A 1GFJA 1IC5Y 133LA 1KXXA 1VDPA 4H90A 5DN5A 3WU9A 4XADA 1XEIA 4ETEA 2FYCA 1WQRA 4G9SA 1DKKA 1NMMA 1YAQA 5LYMA 1G7IC 4OWEA 1B5UA 4UWUA 4WM2A 5B07A 1LMAA 2FBDA 4B4IA 1GF4A 1HENA 1HC0A 4P2EA 1CNSA 3W6DA 1IR8A 4G4BA 207LA 1GF5A 1HEQA 4ET9A 4LYTA 1AT5A 1IP1A 1BWJA 1HEOA 1OP9B 4ETAA 1BB7A 2CWIA 2DQDY 1JEFA 4NHTA 2D4JA 4RDSA 3P4ZA 3WVXA 1GE0A 3AGHA 3GXRA 4NGLA 4XENA 1N4FA 5ILFA 1WVVA 1C10A 1LJIA 1MELL 2C8PA 5DN4A 4N0JA 3F6ZA 4NSJA 4QEQA 1YL1X 1HMKA 2ZNWY 1F6RA 1GFKA 2D4KA 1IOQA 1IOCA 1MLCE 1RFPA 2MECA 3TXFA 2MEAA 1AM7A 1LJ4A 1LHIA 5FCPA 4BS7A 2BQLA 2YBIA 1Z55A 1LZRA 1BHZA 3IWRA 3M18B 1GBOA 4GCBA 1FLQA 2YDGA 1JJ0A 4NEBA 5C6LA 4LYCA 4TSBA 1CJ9A 5FEKA 1QDRA 1TDYA 1UCOA 2EPEA 3WPJA 1IP7A 3WUMA 4G4CA 5E4PA 4DWXA 1LZ4A 3W3EA 4WLTA 1LZAA 5I53A 2HUBA 4LYZA 1IWYA 1OUIA 1LJGA 4WLXA 1LSBA 1UACY 5KKJA 3D3DA 1FN5A 4TWSA 1FLYA 1REXA 4WG7A 2EKSC 3P68A 1BGIA 1BB3A 1VATA 5KXLA 4GLAA 4H1PA 1UIGA 1QIOA 134LA 4GCEA 4RLNA 3RNXA 1LPIA 1JISA 4CFPA 3LYOA 1GBYA 4B4EA 1ZVHL 4QY9A 4PHIA 1HSWA 1JWRA 4YF2A 1LMNA 4NSHA 2Z19A 1IOTA 5LYZA 1LZCA 1HHLA 5II3A 1UIHA 1KXWA 2MEEA 2VB1A 2MEIA 3J6KA 4YEMA 1JKCA 2DQCY 4XJHA 1CJ7A 5F81A 2Z18A 5T3FA 3WXTA 1GBXA 2BAAA 2W1YA 1D0MA 1DPWA 1GB7A 2BQBA 2BQNA 3CT1A 5LXWA 2Y8PA 1LZYA 3QY4A 2D91A 4OWBA 3LZTA 1JSEA 3B72A 4DD7A 1GPQC 3QNGA 2LHMA 3HBHA 5LVHA 1NBYC 1IWUA 1F0WA 3N9EA 1CJ8A 3A6BY 4NHPA 1LJEA 1LJHA 1J1PY 5KXXA 1XEKA 3W6CA 135LA 4H9AA 4NGJA 1PZYA 4WL7A 4WG1A 1LSEA 5B06A 1LJJA 4DDBA 1LZSA 1JTPL 1UC0A 1IP4A 3G3AB 3LHMA 3AZ5A 4EMNA 1IR7A 4XJGA 5FSTA 1GB2A 3TXJA 3RZ4A 194LA 1UBZA 1HFZA 4HTNA 3WUAA 1GB6A 4YOPA 1GDXA 3WULA 3WYHA 1I20A 3AZ4A 2Q0MX 5I5QA 1HELA 4MCKA 5KXNA 1JTOL 3OJPA 1GBSA 5LVGA 1LJKA 1LMCA 2BQIA 4LT0A 1IVMA 3A92A 1NWGA 5M1YA 1HEPA 3FI7A 1LKRA 1TAYA 5KXTA 3B0KA 4H8YA 3TXGA 1HEMA 3AW7A 4GCFA 1NKHA 1LZDA 1YANA 5HMVA 2I26L 4Z98A 3WU8A 5KXPA 1VDQA 1NDGC 2D6BA 4B49A 2BLYA 1DXJA 2CDSA 4HTQA 1D6PA 1QTKA 4GCDA 2W1MA 4D9ZA 2MEGA 4J1AA 1REMA 4DD1A 2YBMA 4KPMA 1LSZA 1QSWA 1CKCA 1IEEA 4YM8A 5F16A 4WOAA 2LZTA 4B4JA 1GHLA 2DQHY 4DD3A 1HEWA 2FYDA 4H91A 4IJ4A 1GFUA 3WW6A 5IELA 1OUJA 5L3HA 3A6CY 5HNCA 1JUGA 1IY4A 1LKSA 5APFA 2H9KA 4GCCA 3RU5A 3A8ZA 1IWWA 3QE8A 4G4HA 4XJBA 4WL6A 4LZTA 2HEEA 1GXXA 1IWVA 1C7PA 1V7TA 4HJZA 2Z2EA 1LJNA 4XJIA 1GDWA 2Z39A 1IWZA 5IDDA 4DD2A 5APCA 3ATNA 3CB7A 3A91A 1INUA 4B0DA 1LZ6A 3AZ6A 4PJ2C 5LVJA 1GF7A 4H9IA 3AJNA 4H9BA 4NIJA 4LFXA 1VFBC 2BQGA 3W6FA 1LZ5A 1B0DA 1G7MC 2I6ZA 2LYOA 2ZQ3A 3ULRA 3OK0A 3J4GA 4HPIA 1GF0A 1FKQA 1O23A 5FELA 2PC2A 3CSQA 3FE0A 1GEZA 1XFPL 1SLYA 5F9XA 4O34A 3CT5A 4E3UA 1B5XA 1LZEA 2B5ZA 1DI3A 2DQIY 1HMLA 1FKVA 2BQOA 2N5ZA 1RE2A 4N5RA 1JKBA 5JENB 1AZFA 3TXDA 3ZEKA 1YAOA 2DQFC 4NGIA 1UIEA 2LYMA 5L9JA 1HF4A 3VWOA 1BWHA 3G3BB 4FJRA 1BQLY 1GFGA 1HSXA 1NDMC 2A7DA 3RT5X 4ETBA 5LINA 1WTMA 3A67Y 1VEDA 1GBWA 4KL7A 1NBZC 1OUCA 2EQLA 2F2NA 4GN3A 1VDTA 1XEJA 1G7JC 2BQMA 2CGIA 2I25L 3EMSA 2YBHA 5KXRA 4J1BA 2W1XA 2XBSA 3A3RX 5KXSA 4L41A 3T6UA 1OUHA 2D4IA 1HFXA 4LGKA 1A2YC 1DQJC 2HEBA 1WTNA 2HECA 1AT6A 3TXHA 5ILCA 4LFPA 1GXV2 3HBEX 1FLWA 5B59A 1QUTA 4XN6A 1JKAA 1B5ZA 4WO9A 1REZA 4AXTA 1LJFA 2XTHA 4AGAA 5HLLA 1IY3A 1OUFA 4FDYA 4MR1A 4NGVA 2BLXA 1JJ3A 1OUDA 3IJUA 1B9OA 4HJYA 1G7HC 2DBTA 4TTDA 4DC4A 5KJ9A 1D0LA 1QDTA 4LT2A 2HEFA 2BQFA 3AW6A 5KXZA 1IO5A 4GLVA 4WO6A 2MEHA 5EBHA 5KXKA 3ATOA 1GE2A 1GE1A 1GWDA 2YBJA 1UICA 4Z3MA 1IIZA 1DI4A 1XGUC 1D6QA 3P66A 4NWEA 3TXKA 5HNLA 2C8OA 4N1CC 4I8SA 1CJ6A 1HERA 3E3DA 4HV1A 1F10A 3WU7A 1LSYA 1OUEA 5D5FA 1GFEA 153LA 1B5WA 1IP6A 4M6DA 1YIKA 1LZ8A 2DQEY 2ZNXY 3B6LA 1LTMA 2H5ZA 1YROA 4YEOA 4BAPA 4DD9A 5K7OA 2XBRA 2A7FA 3A90A 4H94A 3HBDA 4NHIA 4ETCA 2ZYCA 5A3ZA 1VAUA 2G4NA 4WM4A 1XGQC 4CFOA 2ZQ4A 3TMVA 1SQ2L 3AGGG 1BWIA 3MGWA 5L3IA 1JJ1A 1KIPC 1BVXA 3P64A 1LMOA 1TBYA 1W08A 1ZVYB 4UWNA 1I1ZA 4WLDA 1GEVA 4EOFA 1B7LA 3W6EA 3WPLA 1KIRC 5DLAA 5KXOA 1B2KA 1DZBX 3A95A 2HTXA 1FLUA 3GXKA 5KY1A 1GB0A 4Z46A 1UIBA 3A96A 3ZVQA 1UIDA 3N9CA 4H8ZA 4NG1A 4RW2A 5J7CA 1LMTA 2DQAA 3WMKA 2LYZA 4BAFA 5FHWA 2F30A 5KXWA 1NHEA 1OUAA 2DQGY 3AB6A 5F9UA 4NHSA 154LA 2AUBA 4N8ZA 1LMPA 1GB3A 1A4VA 1JKDA 1EQ4A 2HEAA 5I4YA 3TMWA 5IHGA 1AKIA 4KXIA 1H87A 4G49A 4PGJB 4PRQA 2G4QA 3TXIA 1JSFA 1F6SA 1B5YA 1TEWA 1FBIX 1LMQA 132LA 1B7PA 4HJVA 5DL9A 1YKYX 1QTEA 1LYOA 2YBNA 2ZWBA 4NGWA 1EL1A 1IORA 4HP0A 4ZFPA 4J0LA 1GF6A 1JITA 1XSFA 4H92A 4PRUA 4RLMA 3WUNA 2GV0A 1G7LC 4NHQA 2BQCA 4TUNA 1GF3A 2Z38A 5C6IA 4CGEA 5C6JA 3WH1A 5KKIA 4NSIA 1LHKA 4ETDA 5LA5A 1OUGA 5B1GA 2NWDX 4HV2A 2IFFY 1D9UA 1HFYA 1C46A 2MEDA 5APDA 2ZILA 4NG8A 4IATA 3T36A 1GF9A 1QQYA 3CT0A 2G4PA 1YQVY 5F14A 1C45A 1ZMYL 6LYZA 3HFMY 4BADA 1LHJA 1OUBA 5LVIA 2BQKA 2IHLA 1LZBA 5I4WA 1D0KA 1GB9A 1V7SA 1C08C 1RJCB 4XJDA 2CJLA 1B7QA 4XJFA 1B7MA 4II8A 1H6MA 1HNLA 5I54A 1LSPA 4NGYA 1UIAA 5KXMA 4IASA 3WXUA 1LCNA 1YILA 2YVBA 5A3EA 4C5FA 5APEA 4H9FA 4W94A 4B1AA 1WQQA 2MEFA 4MSTA 1ZV5L 1GE3A 4DDAA 4NGZA 1WQNA 2BPUA 3W6BA 4WM3A 2DQJY 1IWXA 1IC7Y 3A93A 1WVUA 4ANRA 5I4XA 4J7VA 1YAPA 5D5CA 1LZTA 3P65A 1B7SA 4X3BA 1IOSA 4H9CA 1IX0A 1NF5A 3SP3A 8LYZA 5KXYA 1GFHA 1FDLY 1LYYA 4W96A 4LT1A 4OOOA 1IP5A 1IC4Y 3B0OA 1J1OY 1WQOA 4LYOA 1T3PA 4OWHA 2LZ2A 2BQEA 2Z2FA 1VDSA 4UWVA 1YKXX 4HSFA 4LT3A 1LYSA 4WM1A 1JHLA 1CKDA 2W1LA 1QUSA 4NWHA 2Z37A 1GFTA 4WMGA 1QSAA 3D9AC 4N1EI 2XJWA 5LAGA 4HTKA 1B7NA 1LZGA 2YBLA 5LVKA 4C3WA 1LOZA 3WW5A 3A94A 1UA6Y 3A3QA 5E9RA 1XGTC 1GB5A 1CKFA 1BB6A 3TMXA 193LA 1B7OA 1LZNA 1LAAA 4KT3A 4CJ2A 1JIYA 1LSDA 2X0AA 4N9RA 1LSNA 1C43A 1DI5A 1J1XY 2WARA 3LZ2A 5FDJA 3KAMA 3WVYA 4OW1A 208LA 4DYGA 4TSCA 3TXBA 1BB4A 1P2CC 1YL0X 4R6CA 2BQAA 3LYZA 3LYMA 4YENA 4CHXA 7LYZA 1W6ZA 1GAZA 2Z12A 5LAFA 1WQMA 1IP2A 1LYZA 3AYQA 3EBAB 4H93A 4M4OA 1I56A 1LSMA 1RI8B 2MEBA 4H8XA 4NGOA 3WL2A 2F4AA 6LYTA 4ML7A 1LHLA 1UUZC 1LSFA 1DPXA 3LYTA 4HPEA 4R0FA 1DKJA 1YAMA 5HMJA 4ZIXA 2ZYPA 1LJ3A 3AZ7A 3EXDA 1B5VA 3IJVA 4ZEEA 4LYBA 1YKZX 2HU1A 2ZIJA 4I0CA 1UIFA 3ZVQB 2H9JA 3BKVA 1GBZA 2DKVA 1GE4A 4TX7A 4GN5C 4NFVA 4WLYA 5B05A 1KIQC 4RW1A 3TMUA 5LIOA 3CSZA 1OQMA 4WM5A 3CSRA 1GD6A 9LYZA 1IP3A 1E8LA 1GFAA 1LZ1A 5B1FA 1GF8A 3EO5A 3M3UA 4NGKA 3N9AA 1CKGA 2BQDA 4OWAA 4QDNA 3B0IA 3A34A 3BKHA 1GAYA 2FBBA 4OWCA 1EQ5A 1XGRC 1T6VL 1IWTA 4NSGA 3TXEA 4DT3A 1LSCA 2HEDA 4A7DA 4Z41A 1ALCA 3RW8A 1TCYA 5LA8A 5DM9A 3LN2A 1IR9A 1RCMA 1JPOA 4DDCA 4ET8A 4GN4A 1LSAA 3CQLA 1WQPA 2HU3A 3AGIA 1LHMA 2EIZC 3K3TA 4OOTA 1GFVA 4QGZA 2BQJA 2BQHA 2YSSC 1NQIA 4LYMA 4U3XB 1PS5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1B7RA 2ZIKA 1REYA 1LYDA 4PPOA 1GB8A 1JTTL 1BB5A 1CKHA 5AMYA 4H9EA 1BVKC 1L74A 1C69A 3L64A 1IC5Y 118LA 188LA 1L22A 1NMMA 3FA0A 1G7IC 4OWEA 1B5UA 1C6HA 220LA 1GF4A 1HENA 3DNAA 1IR8A 207LA 1C6IA 1DYEA 1C65A 4ET9A 1BWJA 1IP1A 1OP9B 4DQ5A 1BB7A 2CWIA 1LPYA 1JEFA 4NHTA 1L16A 1SX2A 3AGHA 1D9WA 1DYCA 1LJIA 2C8PA 4NSJA 8LYZA 1F6RA 2D4KA 1AM7A 5FCPA 4BS7A 2BQLA 2YBIA 1Z55A 3NYAA 4GCBA 4LYCA 4EPFA 3WUMA 1C67A 5E4PA 1KY1A 2A4TA 1LSBA 5KKJA 1QT8A 1FN5A 4WG7A 3P68A 1BGIA 4H1PA 2RBOA 4GCEA 1LPIA 3LYOA 1D3NA 1LZCA 1UIHA 1CJ7A 1LYGA 2Z18A 1GBXA 1LYIA 111LA 2BAAA 1D3MA 1D0MA 2W1YA 2BQBA 139LA 5LXWA 2Y8PA 1L33A 3LZTA 216LA 4DD7A 1IWUA 1LLHA 1JTNA 1UC0A 260LA 4I7MA 3AZ5A 140LA 1G0LA 3C7YA 5FSTA 194LA 1QUGA 3WULA 195LA 2Q0MX 2ANXA 1QUDA 1L41A 5KXNA 4PK0A 1QS9A 5LVGA 1IVMA 1L27A 1NWGA 3FI7A 1TAYA 5KXTA 1P64A 2RBRA 3JR6A 2I26L 4EJ4A 2BLYA 183LA 1G0MA 1QTKA 4D9ZA 2B6YA 4J1AA 1LYHA 1REMA 1LSZA 1QSWA 221LA 5F16A 4WOAA 1L98A 2LZTA 228LA 2DQHY 235LA 3WW6A 3DN4A 1G0PA 5IELA 4I7OA 1L44A 1LKSA 5APFA 3A8ZA 3QE8A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1B7R A;  1KXY A;  2ZIK A;  2RSC A;  1EQE A;  1REY A;  4WM6 A;  2F4G A;  3W6A A;  1LZ9 A;  1XGP C;  1LSG A;  4H9H A;  4PPO A;  1GB8 A;  1JTT L;  1BB5 A;  3WPK A;  4XYY A;  1CKH A;  5AMY A;  4DD0 A;  4NY5 A;  4H9E A;  1BVK C;  5LYT A;  1LHH A;  1GFR A;  5HQ1 A;  1GFJ A;  1IC5 Y;  133L A;  1KXX A;  1VDP A;  4H90 A;  5DN5 A;  3WU9 A;  4XAD A;  1XEI A;  4ETE A;  2FYC A;  1WQR A;  4G9S A;  1DKK A;  1NMM A;  1YAQ A;  5LYM A;  1G7I C;  4OWE A;  1B5U A;  4UWU A;  4WM2 A;  5B07 A;  1LMA A;  2FBD A;  4B4I A;  1GF4 A;  1HEN A;  1HC0 A;  4P2E A;  1CNS A;  3W6D A;  1IR8 A;  4G4B A;  207L A;  1GF5 A;  1HEQ A;  4ET9 A;  4LYT A;  1AT5 A;  1IP1 A;  1BWJ A;  1HEO A;  1OP9 B;  4ETA A;  1BB7 A;  2CWI A;  2DQD Y;  1JEF A;  4NHT A;  2D4J A;  4RDS A;  3P4Z A;  3WVX A;  1GE0 A;  3AGH A;  3GXR A;  4NGL A;  4XEN A;  1N4F A;  5ILF A;  1WVV A;  1C10 A;  1LJI A;  1MEL L;  2C8P A;  5DN4 A;  4N0J A;  3F6Z A;  4NSJ A;  4QEQ A;  1YL1 X;  1HMK A;  2ZNW Y;  1F6R A;  1GFK A;  2D4K A;  1IOQ A;  1IOC A;  1MLC E;  1RFP A;  2MEC A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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