3QE8A

Crystal structure analysis of lysozyme-bound fac-[re(co)3(h2o)(im)]+
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Post-protein-binding reactivity and modifications of the fac-[Re(CO)3]+ core
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
molecule tags Hydrolase
total genus 47
structure length 129
sequence length 129
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-01-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3qe8A00
4LYTA 2W1XA 5B06A 1GB3A 3P66A 4LYMA 4TTDA 1B7LA 4DT3A 1LZDA 5LA5A 3EO5A 4LT1A 3ZVQA 1IWTA 1VFBC 5LIOA 1DPXA 1UIBA 2DQCY 1NQIA 2ZYCA 3A8ZA 5HNLA 1XFPL 4DYGA 4QDNA 1LMQA 1B2KA 1TEWA 5II3A 2NWDX 4OWCA 4OW1A 3W6BA 4WO6A 1I20A 1LMNA 4CHXA 1GD6A 3GXKA 1A2YC 1GFAA 1IEEA 1GDXA 2F30A 4DD2A 2DKVA 4DD3A 3QY4A 1AM7A 1TBYA 1CKHA 1LZTA 3M18B 1REMA 1ZMYL 4ANRA 4B1AA 1QSWA 2Z39A 3K3TA 2BPUA 4YEOA 1B7NA 1UICA 2I26L 5IELA 154LA 1DXJA 3LYZA 1IP3A 1GEZA 1GFTA 1GFEA 2EQLA 5T3FA 4LFPA 4ZIXA 1LSBA 1CJ7A 4XJFA 4G9SA 4QY9A 1LSFA 4N1EI 4P2EA 1REXA 4GN3A 4H9IA 2Y8PA 4ETBA 1LJGA 1LHLA 2HEFA 3TXDA 1UBZA 4J7VA 1JEFA 1HSWA 1V7SA 1XGRC 1IOTA 3AB6A 4YENA 5AMYA 1GF0A 2WARA 4MR1A 4H9EA 3RNXA 1HERA 1B0DA 4XJDA 1LMCA 1G7MC 5L3HA 2C8OA 2D91A 3TXBA 3RU5A 2Z2FA 3W3EA 2HEBA 1TCYA 1F6SA 1ZV5L 4NFVA 3WPLA 1LZ4A 2FBDA 1LJ3A 4GN5C 4HJZA 4CGEA 2HTXA 4W94A 1LAAA 2DBTA 4NGWA 193LA 1GBSA 3WUMA 5HMJA 4XJIA 3AGHA 1IP6A 2DQAA 4OOTA 2XJWA 1VEDA 1AT5A 1FDLY 2H5ZA 2MEGA 3B72A 4HP0A 3P68A 4LT3A 5KXNA 2YBMA 1GAZA 2BQAA 1NBZC 1QTEA 2F4GA 2Z2EA 4KPMA 4LFXA 1HEWA 1B7RA 1PZYA 1SQ2L 5C6LA 1IORA 2DQFC 1INUA 3G3BB 2Z18A 2MEFA 2MEBA 3N9CA 1HEPA 4DDBA 3P65A 4HV1A 3WVXA 1OQMA 2LYOA 1UCOA 1DI4A 1T3PA 1WQRA 4J1AA 3IWRA 1REZA 4PHIA 4WO9A 5B59A 4H90A 4ML7A 2HUBA 4J1BA 1LZ1A 2BQLA 1EQEA 2CDSA 4LYOA 1WQMA 4M6DA 3WULA 3WH1A 1XEJA 1GFGA 3CSRA 1QUSA 4C3WA 1IWZA 2BQKA 6LYZA 4R0FA 1D0MA 1YANA 1LJKA 3VWOA 2MECA 4PRQA 4YF2A 4Z41A 1IP2A 4W96A 1BVXA 3CB7A 1LZ8A 4II8A 2F4AA 1B7MA 2DQDY 5LYMA 1KIRC 2C8PA 1GF7A 4ETAA 1IC5Y 4ZFPA 2BAAA 5APEA 4OWEA 1NF5A 3A92A 4B4IA 1GFJA 1BWHA 4HJVA 5B1FA 4X3BA 1GFHA 1BB5A 4KT3A 1B7OA 4NHTA 3HBDA 4NGLA 3TXJA 1E8LA 4G4CA 5I53A 4TUNA 3MGWA 1VDTA 4ETEA 1G7HC 3P4ZA 1QTKA 1LSMA 2BQIA 2N5ZA 1CKGA 1HEMA 4XJGA 5APDA 1CKFA 2EIZC 2YSSC 1JISA 1YKZX 4LYBA 3TMXA 1LZNA 4Z3MA 3B0IA 4H1PA 133LA 2Z37A 1CJ8A 2A7DA 1GAYA 3A90A 5KXTA 4CFOA 5I54A 5LA8A 1DI3A 1AKIA 1IVMA 2X0AA 2YBNA 1LSDA 5C6IA 3J6KA 5KXPA 4LYCA 4MSTA 3D3DA 1HC0A 3HFMY 1P2CC 4G49A 1VAUA 1OUFA 4GLVA 5D5FA 5ILCA 1D9UA 1LJFA 3A94A 1O23A 2DQIY 1IWVA 5IHGA 2RSCA 2GV0A 3WYHA 4ET8A 1GE2A 1UIHA 5F14A 4NHQA 1GBWA 3LZTA 3WU7A 3QE8A 4NSIA 3LZ2A 1GPQC 1VDPA 1XEKA 1GDWA 5LAFA 3LN2A 1NWGA 2YVBA 1N4FA 3ULRA 5LYTA 208LA 2BLYA 1YL0X 1MLCE 5EBHA 1EL1A 1LJIA 1LSNA 1UACY 1YAPA 4HJYA 1HENA 3CSQA 4NEBA 1BHZA 1FLUA 5JENB 4XYYA 5LYZA 3WUNA 1LJJA 1QSAA 3A67Y 5LVIA 1IP7A 1BB3A 4WM6A 4O34A 1JKCA 1CJ9A 1JTTL 4DD1A 1LHKA 1LSZA 4TWSA 1LZYA 4HV2A 4H94A 3BKVA 1FLYA 1IWUA 3HBEX 4CJ2A 3EBAB 4GCCA 5B1GA 1GXXA 4B0DA 1DZBX 1OUIA 3AYQA 1LOZA 1JWRA 2CJLA 1JJ3A 4NY5A 4UWVA 4H8YA 1JUGA 2G4PA 3KAMA 4ETCA 4LYZA 1LZSA 1GB5A 4R6CA 5FSTA 4H9BA 4I0CA 1GBOA 1RJCB 4DDAA 4KXIA 5I4WA 1T6VL 1XGUC 3WXTA 2BQCA 2W1YA 1GF3A 4OWHA 1GFRA 134LA 4GN4A 3BKHA 4DD7A 1AT6A 2ZQ3A 1IWWA 4HPIA 3T36A 1LZ5A 1RI8B 2BQMA 3CT1A 5LXWA 4QEQA 5HNCA 4A7DA 1JIYA 1JTOL 1YROA 1GBYA 1IR7A 3FI7A 1TDYA 5E9RA 1VDQA 4ETDA 4NGVA 1FLQA 1GF9A 1LJEA 1WQQA 1YIKA 1IC7Y 1NBYC 1XGPC 3CT0A 3AGGG 4Z98A 1KXXA 4XN6A 4NWHA 5LVJA 1GEVA 5KXOA 1IWXA 1GBXA 1GE3A 4NHSA 3WPKA 2FYCA 1C45A 5B05A 4NSJA 2D4KA 2YBHA 3CT5A 5F9XA 5F9UA 1BB6A 3TXKA 2F2NA 3A6BY 4J0LA 1HELA 1VATA 4HTNA 3TXFA 1GE4A 1OUDA 4BAPA 5KXSA 2FBBA 4H9CA 4NGKA 3TXIA 1LYSA 4XENA 4GCEA 4NGJA 5LINA 1NHEA 1IP1A 2D6BA 1ALCA 4H93A 1QIOA 4NWEA 4RW1A 1OUCA 4DC4A 5LVHA 1LPIA 5B07A 2Q0MX 3QNGA 1LHJA 3W6AA 1B9OA 4N1CC 3WVYA 5KXXA 3B0OA 1C10A 1AZFA 1DI5A 4H9AA 1CNSA 4GLAA 1KIQC 4PGJB 4EMNA 3D9AC 5F16A 2ZYPA 1LZ6A 4WLDA 3W6DA 1F6RA 2YBIA 1BWIA 4WLXA 5KXKA 1XEIA 4CFPA 1IP4A 1GB7A 2I25L 2ZQ4A 4RLNA 3B6LA 1IO5A 1JITA 1LSEA 5I4YA 2B5ZA 2ZIKA 1LJNA 5DL9A 1B7PA 4BAFA 2YDGA 1GFUA 194LA 4I8SA 5HLLA 1C43A 5KY1A 2BQGA 4U3XB 4ZEEA 6LYTA 3WXUA 1BWJA 1FN5A 1RFPA 4N8ZA 1RCMA 4D9ZA 1F10A 4OWAA 4E3UA 1LHIA 1QDRA 2I6ZA 2HEDA 1GB6A 4N9RA 3WU9A 1CJ6A 3IJUA 1TAYA 2BQHA 1YILA 5IDDA 1RE2A 4NGZA 5KXMA 1OUEA 1UIAA 4H9HA 4WG7A 3W6FA 1FLWA 5DN4A 4TSCA 5KXRA 2BLXA 2AUBA 1J1OY 2ZILA 5KXZA 1B5ZA 4M4OA 1DKJA 1HMLA 3A34A 4Z46A 2BQNA 1UIFA 1V7TA 3A3RX 1IIZA 3FE0A 3WL2A 2XBSA 4LT2A 4YOPA 4B49A 5KXWA 1LMOA 1HEOA 1B5XA 1D0KA 1GHLA 1MELL 1OUJA 2BQBA 3AZ4A 3G3AB 4LGKA 4B4EA 1UA6Y 5K7OA 5I5QA 1D6QA 1GFKA 1YAOA 4BS7A 7LYZA 4PJ2C 2HU1A 3TMUA 1I1ZA 1WVVA 4WM5A 4H8ZA 1HMKA 4G4BA 5FEKA 1YL1X 3RW8A 1WTNA 5M1YA 1CKCA 3N9AA 1XGTC 2MEHA 3P64A 5HMVA 3A3QA 4QGZA 2Z12A 2PC2A 2YBJA 3AZ5A 1G7LC 1LZCA 3ZEKA 4UWNA 1JPOA 3LYMA 1REYA 1HFXA 5DM9A 3RT5X 4PRUA 1UIDA 1NMMA 2CWIA 1LSCA 2HECA 2LZ2A 4XADA 5KXYA 3A95A 1YAMA 4NHIA 2BQFA 4GCFA 1FKQA 2D4IA 1GF8A 5L9JA 1JTPL 3A91A 1D0LA 3AGIA 2FYDA 3ATNA 5LVKA 3WPJA 3F6ZA 1OUHA 3J4GA 4H9FA 1IC4Y 1EQ5A 5E4PA 1IP5A 4GCDA 1DKKA 1YQVY 1KXYA 3CQLA 4XJBA 2Z38A 4N0JA 4DD9A 1GE1A 1OUAA 1LYZA 4TSBA 1JKDA 1LMPA 4DWXA 4NG8A 4H91A 1B5WA 1OUBA 1LJ4A 1PS5A 3LYOA 2HEEA 4NIJA 1KIPC 1ZVYB 1OP9B 5A3ZA 1H6MA 1LSYA 2MEEA 3M3UA 5L3IA 1WVUA 2H9JA 4EOFA 3AJNA 1LCNA 2ZWBA 4BADA 1IOQA 1QDTA 5DN5A 4B4JA 1ZVHL 2VB1A 4IJ4A 1FKVA 3ATOA 1J1PY 1GWDA 1SLYA 3LHMA 4NSGA 5LAGA 1NDMC 1LKSA 1UC0A 2CGIA 4WG1A 2DQJY 4WLTA 1BB7A 1YAQA 3RZ4A 3AZ7A 2XBRA 2MEDA 2BQDA 1HF4A 1KXWA 1GFVA 4HTKA 2LHMA 4UWUA 2MEAA 1B5UA 1C46A 4RW2A 1LYOA 3LYTA 4WM3A 4WMGA 4WLYA 3N9EA 4H8XA 4XJHA 1LZGA 4DDCA 1CKDA 1GF4A 2HU3A 1UIGA 1WQNA 4WM4A 2LZTA 1JJ0A 1G7IC 1HHLA 4AXTA 1EQ4A 3WW5A 3GXRA 1A4VA 2BQOA 4N5RA 5FELA 1B5YA 3CSZA 5HQ1A 1C7PA 1B5VA 1IWYA 1B7QA 1GF5A 2DQHY 2G4NA 4NSHA 3ZVQB 1JSFA 1IOCA 1GF6A 1IX0A 5D5CA 4LT0A 2YBLA 1NDGC 4FJRA 3TMVA 3WUAA 2BQJA 4L41A 2G4QA 1GB0A 1IY3A 1NKHA 4IASA 1IR8A 1LYYA 1WQPA 1GB2A 4NHPA 1C08C 3AZ6A 2LYZA 4NGIA 1GBZA 1BGIA 1LJHA 1LZBA 5J7CA 2LYMA 3E3DA 1LHHA 1LZAA 4YM8A 3TXEA 5KXLA 3WU8A 8LYZA 4OOOA 3W6CA 1XGQC 4WL6A 207LA 1LMAA 2H9KA 4NG1A 1JKBA 1LTMA 4G4HA 1F0WA 1QQYA 5APCA 1BVKC 1GE0A 3A96A 2ZNWY 5LVGA 1FBIX 1WQOA 4YEMA 3AW7A 1JKAA 1XSFA 3AW6A 2Z19A 4HTQA 5FDJA 3W6EA 1HNLA 1H87A 1HFZA 9LYZA 3SP3A 4RDSA 4OWBA 4DD0A 1BQLY 5KJ9A 3TXGA 1J1XY 4RLMA 5A3EA 1D6PA 1QUTA 3T6UA 4IATA 2IFFY 1HFYA 5I4XA 1G7JC 2ZNXY 1LSPA 132LA 1WTMA 4NGOA 5F81A 3OK0A 2DQEY 2DQGY 4GCBA 153LA 1I56A 3HBHA 3TMWA 5FHWA 1W6ZA 1JHLA 1JSEA 1GB8A 1YKXX 4KL7A 2A7FA 5C6JA 1YKYX 2D4JA 1OUGA 1LHMA 4FDYA 1LKRA 4LZTA 1LZRA 1IR9A 4PPOA 4ET9A 1BB4A 1LSGA 5DLAA 1B7SA 2ZIJA 3A93A 5FCPA 1IOSA 2EPEA 2IHLA 3A6CY 1LZ9A 2MEIA 3WW6A 4HSFA 2BQEA 2HEAA 1LSAA 2XTHA 3EXDA 1HEQA 1HSXA 3OJPA 4TX7A 1IY4A 3TXHA 1JJ1A 1LZEA 1GXV2 135LA 1DQJC 4NGYA 4WM2A 4WM1A 3IJVA 1W08A 5APFA 1Z55A 1GB9A 1VDSA 3B0KA 4HPEA 4MCKA 4AGAA 4C5FA 5KKJA 5KKIA 2EKSC 4H92A 4WOAA 2W1MA 5ILFA 1UIEA 1LMTA 1DPWA 2W1LA 4WL7A 1UUZC 3EMSA 3WMKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2W1XA 1GB3A 4TTDA 1B7LA 1L70A 1IWTA 2ZYCA 150LA 1XFPL 4QDNA 2B75A 1QT5A 4OWCA 3GXKA 1GDXA 1CKHA 118LA 2RBQA 1ZMYL 1L58A 1L0KA 4YEOA 1L06A 231LA 1GEZA 2EQLA 1L80A 111LA 4XJFA 2RAZX 4N1EI 1UBZA 3C7ZA 3DN2A 1QT6A 4DQJA 4E97A 1HSWA 1V7SA 1GF0A 4MR1A 3TXBA 4I7TA 3RU5A 1L32A 1TCYA 4NFVA 2FBDA 217LA 4HJZA 2HTXA 2Q9DA 193LA 3AGHA 2QB0B 1VEDA 1FDLY 4HP0A 3B72A 3SBBC 259LA 2YBMA 1L27A 4LFXA 2F4GA 1B6IA 1SQ2L 5C6LA 246LA 1IORA 2Z18A 1L91A 229LA 1G0LA 1HEPA 3P65A 4HV1A 4DDBA 1L20A 1L73A 1T3PA 4PHIA 1L76A 4W57A 4I7MA 4ML7A 3RUNA 4J1BA 2BQLA 1L45A 4LYOA 1WQMA 3WULA 4ARMB 1L63A 1P2LA 4Z41A 1T8GA 4W96A 1B7MA 1KIRC 4ETAA 1K28A 1SWYA 1BWHA 1JTNA 1BB5A 3G3XA 2RBNA 4NHTA 1E8LA 4G4CA 2Q9EA 1VDTA 2YSSC 1YKZX 1CVKA 4LYBA 133LA 138LA 2A7DA 1AKIA 1T6HA 3D3DA 1D3JA 1L15A 1P2CC 3HFMY 4G49A 1VAUA 2RH1A 5D5FA 1L13A 1JTMA 215LA 4NHQA 1GBWA 4LZMA 2B7XA 3LZ2A 1XEKA 5LAFA 1NWGA 177LA 3LZMA 258LA 1L98A 1LSNA 1BHZA 170LA 3QAKA 5LYZA 2QARC 4O34A 1LSZA 1LZYA 1OV7A 1FLYA 1QSBA 4CJ2A 5B1GA 2O7AA 1QT4A 4B0DA 1LYDA 1OUIA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4LYT A;  2W1X A;  5B06 A;  1GB3 A;  3P66 A;  4LYM A;  4TTD A;  1B7L A;  4DT3 A;  1LZD A;  5LA5 A;  3EO5 A;  4LT1 A;  3ZVQ A;  1IWT A;  1VFB C;  5LIO A;  1DPX A;  1UIB A;  2DQC Y;  1NQI A;  2ZYC A;  3A8Z A;  5HNL A;  1XFP L;  4DYG A;  4QDN A;  1LMQ A;  1B2K A;  1TEW A;  5II3 A;  2NWD X;  4OWC A;  4OW1 A;  3W6B A;  4WO6 A;  1I20 A;  1LMN A;  4CHX A;  1GD6 A;  3GXK A;  1A2Y C;  1GFA A;  1IEE A;  1GDX A;  2F30 A;  4DD2 A;  2DKV A;  4DD3 A;  3QY4 A;  1AM7 A;  1TBY A;  1CKH A;  1LZT A;  3M18 B;  1REM A;  1ZMY L;  4ANR A;  4B1A A;  1QSW A;  2Z39 A;  3K3T A;  2BPU A;  4YEO A;  1B7N A;  1UIC A;  2I26 L;  5IEL A;  154L A;  1DXJ A;  3LYZ A;  1IP3 A;  1GEZ A;  1GFT A;  1GFE A;  2EQL A;  5T3F A;  4LFP A;  4ZIX A;  1LSB A;  1CJ7 A;  4XJF A;  4G9S A;  4QY9 A;  1LSF A;  4N1E I;  4P2E A;  1REX A;  4GN3 A;  4H9I A;  2Y8P A;  4ETB A;  1LJG A;  1LHL A;  2HEF A;  3TXD A;  1UBZ A;  4J7V A;  1JEF A;  1HSW A;  1V7S A;  1XGR C;  1IOT A;  3AB6 A;  4YEN A;  5AMY A;  1GF0 A;  2WAR A;  4MR1 A;  4H9E A;  3RNX A;  1HER A; 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 3WU8 A;  8LYZ A;  4OOO A;  3W6C A;  1XGQ C;  4WL6 A;  207L A;  1LMA A;  2H9K A;  4NG1 A;  1JKB A;  1LTM A;  4G4H A;  1F0W A;  1QQY A;  5APC A;  1BVK C;  1GE0 A;  3A96 A;  2ZNW Y;  5LVG A;  1FBI X;  1WQO A;  4YEM A;  3AW7 A;  1JKA A;  1XSF A;  3AW6 A;  2Z19 A;  4HTQ A;  5FDJ A;  3W6E A;  1HNL A;  1H87 A;  1HFZ A;  9LYZ A;  3SP3 A;  4RDS A;  4OWB A;  4DD0 A;  1BQL Y;  5KJ9 A;  3TXG A;  1J1X Y;  4RLM A;  5A3E A;  1D6P A;  1QUT A;  3T6U A;  4IAT A;  2IFF Y;  1HFY A;  5I4X A;  1G7J C;  2ZNX Y;  1LSP A;  132L A;  1WTM A;  4NGO A;  5F81 A;  3OK0 A;  2DQE Y;  2DQG Y;  4GCB A;  153L A;  1I56 A;  3HBH A;  3TMW A;  5FHW A;  1W6Z A;  1JHL A;  1JSE A;  1GB8 A;  1YKX X;  4KL7 A;  2A7F A;  5C6J A;  1YKY X;  2D4J A;  1OUG A;  1LHM A;  4FDY A;  1LKR A;  4LZT A;  1LZR A;  1IR9 A;  4PPO A;  4ET9 A;  1BB4 A;  1LSG A;  5DLA A;  1B7S A;  2ZIJ A;  3A93 A;  5FCP A;  1IOS A;  2EPE A;  2IHL A;  3A6C Y;  1LZ9 A;  2MEI A;  3WW6 A;  4HSF A;  2BQE A;  2HEA A;  1LSA A;  2XTH A;  3EXD A;  1HEQ A;  1HSX A;  3OJP A;  4TX7 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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