3QNGA

Crystal structure analysis of lysozyme-bound fac-[re(co)3(l-serine)]
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Post-protein-binding reactivity and modifications of the fac-[Re(CO)3]+ core
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
molecule tags Hydrolase
total genus 45
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-02-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3qngA00
1GB9A 4WMGA 4GLVA 2Q0MX 3P66A 4OOOA 4QDNA 4XADA 2G4QA 1NHEA 2CWIA 1IO5A 4EOFA 1DPXA 5KJ9A 1HENA 1LCNA 1UIBA 4PGJB 2Z19A 5LA5A 4B4IA 1LSGA 4N5RA 4M4OA 1GPQC 1WQPA 1GFKA 5F9XA 1HEMA 3WYHA 1YKZX 1GFRA 2LZTA 1RCMA 1CJ6A 1GBWA 4NGLA 1LMOA 4Z41A 1LYOA 1Z55A 5II3A 5HMJA 4PPOA 4DDCA 1WVUA 3HBDA 4DD2A 4IATA 1B9OA 5A3ZA 2F30A 3TMXA 1BB6A 1JHLA 4NGIA 1FLUA 1GHLA 1DI3A 4H93A 4HJVA 3WW6A 2DQFC 3ZVQA 2DKVA 2BQBA 1LOZA 1OUBA 1LJEA 4I8SA 1LPIA 1XGTC 2YSSC 3CT0A 1HF4A 1GBZA 3A91A 3LZ2A 1LZAA 2BQHA 207LA 2BQJA 3A92A 5LVIA 3A6CY 1LYZA 1CKHA 1NBYC 1H87A 4MSTA 2BQLA 1IORA 3A95A 4GCDA 4N1CC 1V7SA 1GBYA 4DD7A 1ZV5L 1VDSA 3W6CA 3WUNA 2DQJY 3A94A 1IOCA 4QY9A 4BAFA 2EQLA 2MEBA 4LFPA 4PRUA 1AT5A 1IWZA 1LSNA 3HBHA 3CT5A 1B2KA 1OUIA 1DXJA 4NGKA 5LIOA 1REXA 2DBTA 3A3QA 4B49A 1JTTL 1O23A 2HUBA 2CJLA 2IHLA 5I4XA 4H92A 4LZTA 5IELA 5KKJA 3FE0A 4PRQA 1LHMA 4LT2A 4NGYA 4GN5C 3LYMA 3LHMA 3WXUA 4NFVA 1YKXX 5F9UA 1LZBA 1JWRA 1FKQA 4WLXA 1LJ3A 4LYZA 3OK0A 1GAYA 4LYCA 1WTMA 1DKJA 4BS7A 2YVBA 1FDLY 1JJ3A 4DWXA 4NHPA 4WG1A 5EBHA 2MEAA 1BHZA 2N5ZA 3TXKA 5APFA 2XTHA 4Z3MA 3AYQA 1TDYA 1XGQC 4DD3A 2DQGY 1LZ1A 1W6ZA 4RDSA 2FYDA 3B0KA 9LYZA 1EL1A 4H91A 3TMUA 3WULA 2W1MA 1HC0A 1WQRA 2CDSA 2HEFA 3QE8A 4HPEA 1UIHA 4O34A 4WLTA 3AZ6A 2RSCA 4LFXA 1XEKA 5HLLA 1J1PY 1NDGC 4J0LA 1LHLA 2MECA 1IP4A 1GFUA 3RNXA 1IP3A 5KXWA 3LYOA 1KXYA 2H5ZA 3W6FA 1DZBX 1LJKA 1P2CC 1NQIA 3ZVQB 1ZVHL 3A93A 1XGPC 1JTOL 4ZFPA 1QTKA 5APEA 1IOQA 1GE1A 3A34A 1CJ7A 4G49A 1NBZC 1XFPL 4KL7A 4B4EA 4XJDA 1WQOA 3P65A 5KKIA 3WVYA 3IJUA 1YL1X 2DQEY 1GF4A 4H8YA 2FBBA 1JEFA 4LGKA 1IP2A 1B7SA 3B72A 3FI7A 1YAQA 1IP6A 3AW6A 1B7PA 2WARA 3E3DA 5APCA 4CHXA 1IP7A 1YL0X 135LA 5KY1A 153LA 1WTNA 4FDYA 1LZRA 3LZTA 1D0LA 4D9ZA 5LYTA 1GF0A 1JSFA 4RW1A 5M1YA 5FDJA 1AT6A 5F14A 1LZSA 133LA 1BB5A 1VATA 1LJFA 1FN5A 208LA 1LSDA 4H9CA 4NEBA 3TXEA 1TEWA 2CGIA 2YBNA 1ALCA 1KIPC 4NG8A 4NHSA 2Z12A 1GFGA 4CFPA 1RI8B 1D6QA 4XJBA 1EQEA 1GB0A 1GFTA 5T3FA 1BVKC 1TAYA 1IOSA 1DKKA 1NKHA 1ZVYB 4NSHA 1GB7A 1IWYA 4ANRA 2G4PA 1JKBA 1YAOA 3EBAB 4I0CA 3IJVA 5KXOA 4H9IA 1BGIA 1LHIA 1UICA 3MGWA 1FLQA 3W6EA 5D5CA 1C46A 2BQKA 3CSQA 1B7OA 3TXGA 3RZ4A 1JJ1A 4GLAA 1UCOA 4YEOA 5ILCA 2Z37A 1IWVA 4II8A 1YQVY 2Z2EA 1JKDA 1G7MC 1QSAA 1BB4A 4NIJA 4ETDA 2EKSC 1J1XY 5ILFA 1IIZA 1GDWA 3TXJA 1LSCA 1I56A 1QUTA 5E4PA 2DQHY 1YAPA 1SQ2L 4NGWA 4XJIA 1B5ZA 1JTPL 3K3TA 4DD1A 1REMA 1KXXA 1UBZA 4LYBA 1BWIA 1XGUC 4WL6A 4TSBA 2B5ZA 4NHQA 2D6BA 1GBOA 1YIKA 4KPMA 1B7LA 1SLYA 2MEGA 4WM5A 1F10A 1LMTA 3GXRA 4G9SA 4H9AA 1IP1A 3TXBA 1JISA 4CGEA 1GFAA 6LYZA 4H1PA 3CSRA 5B06A 134LA 2YBMA 1IC7Y 1IWXA 1GF5A 1T6VL 4NWEA 4N8ZA 3WU8A 1JUGA 1HFZA 1E8LA 5DLAA 4M6DA 4DD0A 1INUA 1GF3A 1G7IC 1GF9A 1OUCA 1C43A 2LYOA 1LSMA 5KXYA 2VB1A 4GCFA 2ZIKA 4UWVA 4WLYA 1J1OY 1GEVA 4Z46A 1HMKA 5FEKA 3WPJA 4EMNA 2F4GA 4TX7A 3BKVA 3AZ7A 2D4KA 4YF2A 3N9AA 1WQMA 1IR7A 1T3PA 5B1GA 4LYOA 1LZCA 5HQ1A 3M3UA 1RFPA 3G3AB 2BQMA 1WQNA 4HTKA 1UIEA 4H9EA 4NGZA 4X3BA 4NSJA 8LYZA 5LVKA 5KXXA 1KXWA 4AXTA 1G7HC 5I5QA 2BQFA 1MLCE 3B0OA 3B0IA 5E9RA 1HSWA 1LMPA 1YAMA 1JSEA 2YDGA 4N0JA 4RW2A 5LVGA 4LYTA 2IFFY 3TXHA 4C3WA 4XJFA 4WG7A 2Z18A 2A7FA 3WVXA 1RJCB 5KXLA 1DQJC 2BQEA 1HEOA 4NGOA 1AKIA 1JKAA 1LHHA 2NWDX 2BLXA 2BQGA 1NMMA 4DDAA 2ZIJA 3A96A 2Y8PA 1OP9B 4RLMA 1OUDA 1UA6Y 1VDPA 1FLWA 1C10A 3A3RX 2XBSA 4TWSA 1AZFA 1KIRC 2W1YA 3A8ZA 3CQLA 4HJZA 4HTNA 2AUBA 1LJHA 4TSCA 3LYTA 1HFYA 5L3HA 4H90A 3SP3A 3WU9A 1A2YC 1EQ4A 1HSXA 1MELL 2EIZC 2EPEA 3AGGG 4FJRA 4YOPA 5KXTA 5FELA 3QY4A 3WU7A 3T6UA 1LSPA 1LZ8A 4WM6A 5FSTA 1LZ9A 4LT3A 1OQMA 5HNLA 4XJGA 3WPKA 3M18B 2BQAA 1JIYA 1LSYA 4KT3A 4H94A 4ETEA 1CKFA 1CKDA 4J1BA 4N1EI 1OUFA 1VAUA 1IX0A 1GF8A 3LN2A 1NF5A 5IHGA 4W94A 1GE4A 1LJNA 1IWUA 1LMCA 2A7DA 1NDMC 5KXRA 5I53A 3A6BY 1F6SA 1JPOA 1LZGA 4H9BA 2FYCA 5L9JA 1YILA 2F4AA 1LZ5A 1HEQA 1XGRC 5HNCA 4YM8A 1BWHA 4DC4A 1HHLA 3B6LA 4HP0A 1NWGA 3TXIA 1WQQA 5LAFA 4ET9A 4HJYA 5C6LA 1TCYA 4HV2A 1B5VA 1HERA 1LMQA 3CB7A 3HBEX 4ML7A 4R6CA 154LA 3D3DA 1C7PA 4C5FA 1YANA 2BQNA 1C08C 2DQIY 1IWTA 1IWWA 1IR9A 4GCEA 1IC5Y 2Z39A 1HELA 4WO6A 1B5YA 2MEIA 1GB8A 5LINA 1GD6A 1UC0A 1QQYA 1LKRA 2I25L 4ETAA 1PZYA 3P68A 2BQDA 3WW5A 1JJ0A 1DPWA 2H9JA 1LTMA 1N4FA 1LZDA 5F16A 5KXZA 4ET8A 3WXTA 1LSEA 3TMWA 4PHIA 4DT3A 4G4BA 4A7DA 1IEEA 1VEDA 1GAZA 1HFXA 1GB3A 2HU3A 4HV1A 4OWHA 4WM3A 1B5WA 4LYMA 4R0FA 4H9FA 4L41A 4TUNA 1LZTA 2BQIA 194LA 1QIOA 2HEEA 2D4JA 1C45A 2HEDA 3N9EA 4NGVA 5KXMA 5LXWA 1GDXA 4LT1A 5C6IA 5B07A 1VFBC 4IASA 4ETBA 1EQ5A 2ZQ3A 1I1ZA 1QDRA 1LAAA 3EMSA 4NHIA 3G3BB 2C8OA 4HPIA 1XEIA 1D0KA 1V7TA 2GV0A 2ZYCA 1OUGA 4OWBA 1LJGA 2X0AA 4NSGA 4YEMA 5A3EA 1LMNA 1D6PA 1FBIX 1GE2A 1FKVA 1GB2A 1RE2A 2MEFA 1LZYA 2Z2FA 4WM1A 2MEDA 5LA8A 1GBXA 2BLYA 1BVXA 1PS5A 7LYZA 5KXKA 1HMLA 4H8XA 5DL9A 1LZ4A 2ZWBA 4GCCA 1HNLA 4GCBA 3WL2A 2YBIA 1FLYA 1REZA 1BB7A 1IP5A 2DQCY 2FBDA 2HECA 2I6ZA 5FCPA 1B7MA 2W1LA 3P4ZA 1AM7A 2PC2A 1VDQA 3BKHA 5B59A 1UIGA 2HEAA 1ZMYL 3A90A 1GF6A 4HSFA 5I54A 4NHTA 3N9CA 2W1XA 2BPUA 2F2NA 3VWOA 1GE3A 1XEJA 5FHWA 3W3EA 4OWEA 4G4CA 3W6AA 4ETCA 2HEBA 4MCKA 3EXDA 5KXNA 3ZEKA 4H8ZA 5KXPA 3A67Y 4QGZA 1QTEA 3F6ZA 1BB3A 1UIDA 5APDA 1A4VA 3RT5X 4CJ2A 1KIQC 3J6KA 1LZEA 3WMKA 4BADA 1D0MA 1OUAA 2Z38A 1CKGA 3TMVA 1HEPA 1DI5A 2BQOA 4J1AA 1B0DA 4XN6A 3WH1A 193LA 1F0WA 4B1AA 2ZILA 1WVVA 6LYTA 4UWNA 2MEEA 1OUJA 3AJNA 1GF7A 4MR1A 1LSZA 3TXFA 1TBYA 3IWRA 1UIFA 1LSFA 3OJPA 1REYA 5D5FA 4CFOA 4H9HA 4Z98A 1DI4A 4ZIXA 4WOAA 1GXXA 2D91A 1LZ6A 1CNSA 4KXIA 5LVHA 5DN4A 5LYMA 2LYMA 4OW1A 2DQDY 3AW7A 4IJ4A 4N9RA 4OOTA 1VDTA 1UUZC 5LAGA 1LZNA 4AGAA 3ULRA 3CT1A 1IOTA 1LJJA 4GN3A 1B5XA 4NGJA 5HMVA 1LSBA 1IY3A 3D9AC 2HTXA 4NY5A 4RLNA 4WM2A 5B1FA 2H9KA 3J4GA 1GFHA 1YROA 4OWAA 1QDTA 2DQAA 4OWCA 3CSZA 3W6BA 5LVJA 4W96A 4WLDA 4NG1A 3EO5A 1GB6A 1UACY 2LYZA 4LT0A 5F81A 4DYGA 1GB5A 1IR8A 1BQLY 5DN5A 5I4YA 1IY4A 1D9UA 4WM4A 1F6RA 2ZNWY 2LZ2A 3ATOA 2BQCA 2XBRA 1QUSA 2C8PA 5LYZA 2LHMA 2XJWA 4BAPA 1GWDA 3RU5A 3HFMY 1GFEA 2YBLA 1XSFA 2MEHA 3AGIA 1LMAA 3WUAA 3TXDA 1CKCA 4XENA 1GBSA 3W6DA 1HEWA 1LHKA 1QSWA 1LSAA 1H6MA 5IDDA 5I4WA 1CJ8A 4YENA 4GN4A 1B7RA 2ZNXY 4U3XB 5DM9A 4B4JA 5J7CA 1GFVA 1GEZA 2D4IA 2ZYPA 4ZEEA 4QEQA 5B05A 4P2EA 3KAMA 2YBHA 4UWUA 4WL7A 4TTDA 2ZQ4A 5L3IA 1YKYX 5JENB 3QNGA 3AB6A 2YBJA 1OUEA 1LJIA 5C6JA 4DDBA 4WO9A 1B7NA 3LYZA 1LKSA 1GXV2 2G4NA 1UIAA 1G7LC 2HU1A 1W08A 4J7VA 3AZ4A 4NWHA 1BWJA 1B7QA 3AGHA 5KXSA 3GXKA 4XJHA 3T36A 3WUMA 3ATNA 4NSIA 4XYYA 1GFJA 1GE0A 1JITA 1LYSA 1LJ4A 1LYYA 1G7JC 4G4HA 3P64A 4B0DA 2I26L 3AZ5A 5K7OA 132LA 1IVMA 4PJ2C 1JKCA 5AMYA 3RW8A 1B5UA 1CJ9A 4E3UA 3WPLA 2BAAA 1IC4Y 1I20A 1LHJA 1OUHA 4DD9A 4HTQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3P66A 2B6TA 1L35A 2Z19A 1L98A 1LSGA 1LYEA 5F9XA 3SB5A 3WYHA 4NGLA 4Z41A 1Z55A 4PK0A 4PPOA 3HBDA 4DD2A 3TMXA 120LA 1FLUA 1GHLA 2DQFC 169LA 2DKVA 4I7TA 3HH4A 2YSSC 131LA 3LZ2A 2BQJA 2RBSA 249LA 1IORA 4N1CC 1ZV5L 3W6CA 1D2WA 197LA 1IOCA 212LA 4BAFA 2MEBA 3HBHA 5I4XA 4LZTA 236LA 1P36A 4GN5C 1C6FA 1YKXX 1LZBA 1G0KA 1JWRA 4EPFA 1L61A 3OK0A 1L97A 4LYCA 2HUKA 3HT7A 4BS7A 1C6EA 1JJ3A 242LA 4NHPA 2N5ZA 5APFA 1L13A 1L52A 3PBLA 3AZ6A 4LFXA 1J1PY 1NDGC 1CU3A 1CX6A 3W6FA 1DYGA 1NQIA 1ZVHL 111LA 1JTOL 160LA 4G49A 1GE1A 1CJ7A 1CU6A 4KL7A 2F47A 1WQOA 3P65A 2O79A 3HTBA 1YAQA 3NY8A 2WARA 3E3DA 4CHXA 1L58A 4FDYA 1LZRA 4EKRA 4D9ZA 1L62A 1C6MA 5F14A 1LSDA 4NEBA 3TXEA 1TEWA 1ALCA 1C6HA 4NG8A 1RI8B 1LI6A 1DKKA 4NSHA 1IWYA 2G4PA 4EJ4A 2BQKA 3CSQA 1JJ1A 1UCOA 5ILCA 1L41A 103LA 1C62A 1L49A 1YQVY 2Z2EA 1G7MC 4I7NA 3DN0A 5ILFA 1L74A 1C64A 3C81A 1IIZA 4ARLA 1OVJA 221LA 3SBBC 5E4PA 4XJIA 1T8AA 1JTPL 4DD1A 1REMA 1SX7A 114LA 4LYBA 4TSBA 4NHQA 1YIKA 1B7LA 1SLYA 2ANVA 187LA 3GXRA 1IP1A 238LA 4CGEA 1GFAA 3CSRA 1L77A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1GB9 A;  4WMG A;  4GLV A;  2Q0M X;  3P66 A;  4OOO A;  4QDN A;  4XAD A;  2G4Q A;  1NHE A;  2CWI A;  1IO5 A;  4EOF A;  1DPX A;  5KJ9 A;  1HEN A;  1LCN A;  1UIB A;  4PGJ B;  2Z19 A;  5LA5 A;  4B4I A;  1LSG A;  4N5R A;  4M4O A;  1GPQ C;  1WQP A;  1GFK A;  5F9X A;  1HEM A;  3WYH A;  1YKZ X;  1GFR A;  2LZT A;  1RCM A;  1CJ6 A;  1GBW A;  4NGL A;  1LMO A;  4Z41 A;  1LYO A;  1Z55 A;  5II3 A;  5HMJ A;  4PPO A;  4DDC A;  1WVU A;  3HBD A;  4DD2 A;  4IAT A;  1B9O A;  5A3Z A;  2F30 A;  3TMX A;  1BB6 A;  1JHL A;  4NGI A;  1FLU A;  1GHL A;  1DI3 A;  4H93 A;  4HJV A;  3WW6 A;  2DQF C;  3ZVQ A;  2DKV A;  2BQB A;  1LOZ A;  1OUB A;  1LJE A;  4I8S A;  1LPI A;  1XGT C;  2YSS C;  3CT0 A;  1HF4 A;  1GBZ A;  3A91 A;  3LZ2 A;  1LZA A;  2BQH A;  207L A;  2BQJ A;  3A92 A;  5LVI A;  3A6C Y;  1LYZ A;  1CKH A;  1NBY C;  1H87 A;  4MST A;  2BQL A;  1IOR A;  3A95 A;  4GCD A;  4N1C C;  1V7S A;  1GBY A;  4DD7 A;  1ZV5 L;  1VDS A;  3W6C A;  3WUN A;  2DQJ Y;  3A94 A;  1IOC A;  4QY9 A;  4BAF A;  2EQL A;  2MEB A;  4LFP A;  4PRU A; 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 1GFH A;  1YRO A;  4OWA A;  1QDT A;  2DQA A;  4OWC A;  3CSZ A;  3W6B A;  5LVJ A;  4W96 A;  4WLD A;  4NG1 A;  3EO5 A;  1GB6 A;  1UAC Y;  2LYZ A;  4LT0 A;  5F81 A;  4DYG A;  1GB5 A;  1IR8 A;  1BQL Y;  5DN5 A;  5I4Y A;  1IY4 A;  1D9U A;  4WM4 A;  1F6R A;  2ZNW Y;  2LZ2 A;  3ATO A;  2BQC A;  2XBR A;  1QUS A;  2C8P A;  5LYZ A;  2LHM A;  2XJW A;  4BAP A;  1GWD A;  3RU5 A;  3HFM Y;  1GFE A;  2YBL A;  1XSF A;  2MEH A;  3AGI A;  1LMA A;  3WUA A;  3TXD A;  1CKC A;  4XEN A;  1GBS A;  3W6D A;  1HEW A;  1LHK A;  1QSW A;  1LSA A;  1H6M A;  5IDD A;  5I4W A;  1CJ8 A;  4YEN A;  4GN4 A;  1B7R A;  2ZNX Y;  4U3X B;  5DM9 A;  4B4J A;  5J7C A;  1GFV A;  1GEZ A;  2D4I A;  2ZYP A;  4ZEE A;  4QEQ A;  5B05 A;  4P2E A;  3KAM A;  2YBH A;  4UWU A;  4WL7 A;  4TTD A;  2ZQ4 A;  5L3I A;  1YKY X;  5JEN B;  3QNG A;  3AB6 A;  2YBJ A;  1OUE A;  1LJI A;  5C6J A;  4DDB A;  4WO9 A;  1B7N A;  3LYZ A;  1LKS A;  1GXV 2;  2G4N A;  1UIA A;  1G7L C;  2HU1 A;  1W08 A;  4J7V A;  3AZ4 A;  4NWH A;  1BWJ A;  1B7Q A;  3AGH A;  5KXS A;  3GXK A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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